Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016875

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016875
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016875
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGGCATTTTTTCCATTCCATCACCCAAATTTGGCACCAACCCGCTCGTC
TCTCCCAAAATCGCGTCCCGGCCCCATTCCAACGACCCAAACGGAAGACT
CCCGAGCCCGTAAAGGAGTCTTCTCCAAGCTCCCCACCGCCAGCTTTCGC
CTCGCCGCCCTCCGCCCCAAATCCGACGCGCCCCACCCATGGCTCCGACC
GTCCACTAGCCGCCTGCACCTACTCCATGTCGGCCGAGCGCCCGCTCATC
GACGCCGCCTCTCTGCACCCTGCGGCGTCGCAGCTCCCGCCGCCGCAGCC
GGAGCCTCCCCTCCGCGCCGACCACCTGGGATTCTCCGTCGAGGTCCCGG
ACCCCTTCCGCCCCTCCCGCCGCGACCGCGACAACGAGCAGACCGATCCG
TCCGCGTCGCAGCGGGAGCTCCAACAGGAGGGGGGCGAGTCCCGCGCCGT
CGCCGTCGGGGAGCCCTCGGCGGAGTTCGCCGGCAACGCCATCCGGACAG
CAAAGTACTCCGCGCTCACCTTCCTTCCGCGCAACCTGTTCGAGCAGTTC
CGCCGGCTGTCGTACGTCTACTTCCTCGCCATCACCGTGCTCAACCAGCT
CCCCCAGGTCGCCGTCTTCGGCCGCGGCGCGTCCGTGCTCCCGCTGGCCT
TCGTTCTCTTCGTCACCGCCGTCAAGGACGCCTACGAGGACTTCCGCCGA
CACCGCTCCGACCGCAGGGAGAACAACCGCCTCGCCGCGGTCCTCGCGCC
GCACACCGCCGGCGAGTTCCCGCCCAAGAAATGGAAGCACATACGCGTCG
GGGACGTCGTGCGCGTCGCGTCCAGCGAGACGCTCCCCGCCGACATAATG
CTCCTCGCCACTAGTGACCCCACCGGCGTCGCGCACGTCCAGACCGTCAA
TCTTGACGGGGAGACCAATCTCAAGACCAGGTATGCCAAGCAGGAGACGC
ACTTGAAATTCTCCCACGACGGTGCCATAGGTGGTGTCCTGCATTGCGAG
CGGCCCAACAGGAACATCTATGGTTTCCAGGCGAATTTGGAGATTGATGG
CAAGCGTGTCCCACTCGGACCGTCCAACATTGTGCTCCGTGGCTGTGAGC
TCAAGAACACCACATGGGCAATAGGGGTCGTGGTCTATGCTGGCAAGGAT
ACTAAGGTCATGCTCAATAACTCTGGGCCGCCATCCAAGCGAAGCCGCTT
GGAGACACAGTTGAATCGGGAGACAGTCATATTGTCCATTATGCTCATTG
GGATGTGCACCACAGCATCAGTGCTTGCTGGGATTTGGCTGCTCAATCAC
CGGGGGGAGCTGGAGTTCACCCAATTCTTTAGGGAGAAGGATTACACAAC
TGGGAAGAACTACAATTACTATGGCATCGGAATGCAGCTATTCATTACCT
TCCTCATGGCTGTGATAGTGTATCAGGTCATCATTCCTATCTCATTATAT
ATATCCATGGAATTGGTACGGCTTGGGCAAGCATACTTCATGGGGGCCGA
CATAGACTTGTATGACAAATCCTCAAGGTCGAAGTTCCAGTGCAGGGCTC
TGAATATAAATGAGGATTTGGGGCAGATTAAGTATGTCTTTTCTGATAAG
ACAGGCACACTGACAGAAAACAAGATGGAGTTCCAGTGTGCATCAATTCA
CGGCGTTGATTACAGCTCTGGCAAAGATACGTTAGGATACTCAGTTGTAG
GTATGACGGTTTTAATGCATATTCCTTCTTTGATGTTGCTGTTTCCTAAT
AAGACCTCTCATTTGCTTGTTTTGGTCAGTCGATGATCTTCTGTGGACAC
CAAAAATGGCAGTTAGGACTGATCCTCAGCTTCTGAAGATGTTGAGGAAT
GGTGGCACAGATGAGGAAGCAAAGCTTGTCCTTGACTTCTTCCTTGTTCT
TGCTACCTGTAATACCATTGTGCCACTTGTCCTGGACACTAGAGACCCTA
GGCAAAAGTTGATTGATTATCAGGGTGAGTCCCCTGATGAGCAGGCTCTA
GCTTATGCTGCAGCGTCCTATGGCATCATGCTTGTTGAGCGAACATCTGG
TTATGTAATGATCGATGTCCTTGGTGACAGACAGAGGTAAGATAGCTCTC
ACCATTTGAGTGTTTACATTATATTTAGTACCAGCTGTTTTATTTGAAAG
TACAAAATCTGGTGATATCAGACATGATTATGTGACTCGGAGCAGATGAA
TGCTACCTGACCTGTGATCTTTAGTTCTTTACATACTCTAGAAAGCCATA
AACAAATAAAATTTCTGCAGCAGTTGGTAGCACAAGTTTTTATACCTTTT
GCTTTCTAGTGTTTGTTCATGCCATCGTCAACTATTATTAATGTTTGGTG
GTGCAAATGCTAACGTCGAATGTTGTCTTCCTAATGTGTCTACCTATGTT
GCCTTCTGCAATTGGTAAATGATGCTATTAATCATTATAACTTCTTTGAA
AAAGGTCCTCATAACATATTTTGCCATTGCCAATGTGTACTATAAAGGGT
TAGCTTCACATCTACTCGAATGTAATGTTGGTATCAGCATCAGTTGGTTC
TTGGTTGATCTTCACATCTGCTCCACATTAATAATTCATATAACTTCATG
AGCATATTAATGTGAACATTTGGACTTGTAACACACTGTAATTGTGGTAT
TTCGAATTTGGACAGTGGTGGGTAGGAAGTCCTTTTGTAATTTAAAAAAA
ATATCCAAAATGTGTAGAACCATTGGCAAAAGAATCTGAATTTTTAGTTC
ATCTAATTTTGCATTTTCCCGTTCTTCTGCATTTGTCGGTTGTCAATCCT
TTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGTAACAGGGGCAAAAGTTTTGCCCCAAT
CTATTAATTAAGAAGAGAGTTGCCCAGTTAATTAACGGAAAACCAGGCTA
AAACCGTTACAACAAAAATACAAGTGAATAGCTCCCAAAGTATGCAACTT
CTCAACCGATTAGACAAACGAACAAACTATCTCAACCTACAACCATTTGT
CGATTATCAAATTGAACTGTGCATTTGATATGACATTGACCAAGTCAGTG
TGTCAATTTTTTTTTCAATATGTCATACGTTAGTTTCCTATTTGGCTCAG
ATTTTATAATATGTTCAACTTAAATTCTCAATAATCTCAAGCAGTATCCT
ACGTGATAAAACATGCTTAACATGCCAGGCATGTGAATTTTCTTTGTCTT
TGTGTTATCCACTGGCTAGTATATGTAGTTGATGTCTTATTTGTGTTAAT
TTGGTTTTTTCTTTGGTAGTACTCCTAATTTACTATGCTGACTCCTTTAC
ATCCCCATTCCATTGCATCATTTTTTTCTTGTCAGTTTAGTTTCAATAGA
TCATTAGCACGATTGATTTACAGTTCTGATGAATCTTGCTTGTATGGCAT
GTGCAGATTTGATATATTAGGACTTCATGAGTTTGATAGTGATCGTAAGA
GGATGTCTGTCATTGTCGGCTGCCCTGATAAGACTGTTAAGCTATATGTC
AAAGGTGCAGATAGTTCAATGTTTGGAATTACCAACAAAGAGCTGGACAA
TGTCCGTGCTACAGAGGTACATCTCCACAAATATTCATCACTTGGCCTAA
GAACACTTCTTGTTGGTATGCGTGAATTGAGTCGGCCTGAATTTGAGGAT
TGGCAGTCGGCATATGAGAATGCTAGCACAGCAGTACTTGGCAGGGGAAA
TTTACTTCGATCAGTTGCAACCAATATAGAGTGCAATATCCACATACTAG
GGGCCACTGGGATTGAAGACAAGCTTCAAGACGGGGTGCCAGAAGCGATA
GAATCTCTTCGGCAAGCAGGCATGAAGGTTTGGGTTTTAACAGGGGATAA
GCAGGAGACAGCAATTTCTATTGGCTTCTCTTGTAAGCTACTGACCAATG
ACATGACACAGATTGTCATAAATAACTGTTCTAAGGAGTCTTGCAAGAAA
AGTCTTGAGGAAGCAGTTGCAACGAGTAAGGAGCTCAGGGTTGCTTCTTC
AATTGGCACACTGAATCCAGAATCTTCTGGTGTAATTCTTGCATTGATTG
TAGATGGTACAAGCCTTGTTTACATACTCGAGACGGAGTTGCAAGAAGAG
GTACTCATCCATATGTTATTCTATCATTACTGTACTAATTTCCTTTTGTC
CTCGATACTAAGATCATCTTATTAAGATGTCGCAAATGACACGTGGTCTG
TCTTCTTTTGTTTGTGGTAGCTTTTCAAAGTAGCCACAGAATGTAGCGTT
GTCTTATGTTGTCGAGTGGCTCCTCTACAAAAGGCAGGGATAGTTGCACT
TATCAAAAACAGGACGGATGATATGACCTTAGCAATTGGTGATGGTATTC
CTTCCTGCTTCTTCTGTTGTATTATATTTCTTTTATCTAAGAGGCAATGT
GCACAATTGATATTTTACTTCAGGAGCAAATGATGTTTCAATGATTCAAA
TGGCGGATGTTGGGGTTGGCATCAGTGGCCAAGAAGGAGGACAAGCTGTC
ATGGCATCAGATTTTTCTATGGGACAATTCAGATTCTTGGTTCCTCTTCT
GTTAGTTCACGGTCACTGGAATTATCAAAGGATGGGTTACATGATTCTTT
ACAACTTTTATAAGAATGCTACATTTGTATTGGTTCTTTTCTGGTAAGAT
TTTTTTAAAGAGGATAGCTATTTTATTACCTGGGAAATATTACTACTATT
TATTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGGGGGGGGAGGGGGAGTTAGAGGCCATTCAACTCCTCCATATA
ATCCAGTTGAGAAAATGGGGAGAGTTGTTCATTTTTCTAGTGTCCACGGC
GTTATATATAAGATGTATACCTTGCGCTATAAATTTATGACTGTAATTCC
TAGTTATATCCAATTGAATTGCCTGACATTTGTTAAGGATCACCTCCCTA
TTTTTCATATATTTGCATGGACAATTACTAAAAATAATATGCTTACGGTG
TGATCACAGGTATGTGTTGTATACAGCATTCACTTTGACAACTGCTATCA
CTGAATGGAGTAGCCTCTTGTACACTGTGCTTTATACATCCCTTCCGACA
ATCGTTGTTGGCATTCTTGACAAGGATCTTAGCAAGTCAACACTGCTAGC
TTACCCAAAGCTATATGGAACTGGACAAAGGAATGAGAAGTATAATGTGA
ATTTGTTTGTCCTCAATATGCTTGAAGCACTTTGGCAGAGTTTGGTTGTT
TTCTACATACCGTATTTTGCATATAGACAAAGTACAATAGATATGTCTAG
TCTCGGAGATTTGTGGGCACTTGCAGCTGTCATCATTGTAAATATGCAAT
TGGCCATGGACATCATTCGGTGGAATTGGGTTATACATGCATTTGTATGG
GGCACTATAGCAGCAACAGCGATTTGCCTCTTTGTGATAGATTCCATATG
GTTTCTTCCTGGTTATGGGTAAGTACAATCTCCAGTATCTTGTTACTCGT
ATGAATCCCCTGCCACATTTCTGTATTCCATGCAATAGCTGTGATCTTGA
TATTGCTAGAACTTGTGATGGTATTCAAACTCTTTTCTCCATTGTACATA
TAAGAAGAGTGCAAGTTTCCTGCAATATGTATTTGCATTTCATCTAGGAA
TCGATTTAAGAAACAAATTAAGTTTTGGGCTGTTTTAACTGCAATTGGGA
GGTTGAGTTTGTGATCTGTAGTTTCTGAGTTCAAGATGTCTGTCTCTAAT
CTGATAATAAAGCAAAAAGCAACATCATACCTGAGTGCTCATTCCTTGCT
CTTTTTTTTTCATCCGTGCATGACATTTCTTATGTTTCTTTTGCACTATA
TATTTTTTACTGCACATAGATTAAACACGCTGTTTTTTTGCAAGCTTCTC
TGCGCTTCTTACAAGTAGAATGAGTAGTAGGATTTAGTGCGACCTTTTTC
AATTGCTTGTGATTATGTGTGCATGCAACAAACTGACAGCCAAACAATAA
TTTCAGGGCCATCTTTCATATAATGGGGACAGGTTTGTTTTGGTTCCTGC
TGCTTATCATTATTGTTGCAGCAATGGTCCCGCATTTTGTAGTCAAGGCT
TTCACGGAGCATGTTAGTCCTAGTGATATTCAAATTGCCCGAGAGATGGA
GAAGTTTGAGGCTTTTAATCAGGTGAACCGTTCAGAAATTCCAATGAGAA
CGTTTTCATGACGCTAGAAGGAAATTGTATAGCTTTCCAATATTTTCATT
TCTCTTGTTCTTTTCGGCCTTCCACTGTGCATATGGGTCATTCATTTATT
AACTGTAAGGTGGTAGTTTTGCCTCCAGAGGTGTATGTAAGTATATATGT
CCGTCTTGCCCTTGTGTCAGCCGCTATGGTGAATATTGTAATGTTATCAT
CCCTCATGAAATTATATTGTTGCTCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.