Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016370

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016370
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016370
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATCTCGGCGACGAGCGGTGGTTGTCTCTGGAGAGAGGGAGGGAGGG GCCTCATGAGGGAGGGGGCGTTACTGTTTGCCTTGCTTGCTTTTTTGTCT GTGGGGTCTTGTCAGTGTATCCAGCTGTGCATGGGCCTCTCGGGACTCGC GCTCCAACTCTGTGCCTCTTTGCTACCTCTATATTTCATGTCGCCAAAAA AAAAAAGAGTAAAGCTTCGAGTTTCAGTCTGTAGCGAGGTCGACCTGGAC TGGAGGAGTGCACAGCTTTGCTTCCTCGGCGGCGTGTGTTCTTGGCAAGA AACGCACACTTATTTCTAGCTTGATATCTTTGGCAAGAAACGCGTATATC TTGTGCTGCATGCGTGTTTGCTTGCGTATATACGCCTTGCGTCCATACGC GTAGGGTTGCACTCATTAATTGCTATAGCTTTGCTTCGTCTGGCTTCGGT CTGTAATGTTTACCAGCGTCGTGTCGTGTTGTTCTCCATATTCCATGAGC TGGATGTGTTTGCTTACATGCGTGGACCTGACTTTTGTGTTTTTCCCTTC TTTGTTTCAGGTTTCCAACCTAGCTGCTATCTGTCTCTTGAGATTGTGTA TTCAGAGCTAGCTTGATCCAAGGTGCGACCTACTTCGGTTTTTGAGGTGG TTCTTCCTGTTCTCTACATTCCATGAGCTCAGTGTGTTTCCTTCCATGCG TGTTGACCTGACTTGTGTGTGTTTTTCCCTTCTTTCTTTCAGGCTTTCAA CCTAGCTAGCTATCTCTCTTGCGAGATGCACATTCAGAGTTCTGTATGAT CCAAGATTGGTCGTGTGTGCTCCGGAGTTTGAGTTCGGTTGCAAACATCA CTGGGCTGACGGGCAGCAGGAAGGGTACGTGTGCTGGGTTGTGCAAGTTG CAATGGAGGAGAGCGATGGGGGTGGTACGGGCAAGCCTCTCGGAGGAGCC AGTGAGGCACCAGCTGAACTACTGAAGCCTGCACACGCAGTAGTCGATGA AATTGGCAGCACATCAGCCGAGCAGCAGCCATGCGAGCATTTCTCCATGA GGTAATCTTCTTGGTGTTCAGATACTGGCACGTAGTATTACCTCGTTAAC TGTCCTATCATGCCATATAGCACTGTTTGACCGGTCAGCACACACTTTTG CACAATCATCTCTTACATACCCAGCTATGTGTGCCAGCATTCTGTGGCAT GTATATTGGGATTTGGCTGTCTGTTTAATGTAAGATGATTCCACTAACTC AATAAGTGCATTCCATTAGTCTTGGTAATTAGCATTGCTTCTGGCAAACT GCTTTGCTATATTTTTGGTGCTTCATGTATCCTGTGTACTCTATTCTCCA CTGAACTCTTCAGTATGGATGCATCTGAGCACATGATCATTAGTGCTACA AAAATGCATGTTTCTCACTGCAAGTCTTTATTTGTTGATTAATTATTACT GTGTCTTTTTTTCCACATATTTCTTGTTTGTGTGGGTACATGCATTATTC TTGAAGTGACTCGTATCCCTTTACGTATCTAACATTTTTATAGAACCAGC AGATGAGTGAAATATAAACCTAGATAATTTAGTAATTAGTATTAGTAAAT AGTATTATTGATCCTTGCAAACTACTTTGCTATATTTTTGGTGCTTCATG TATCCTGTGTACTTTATTGTCCACTGAAGTCTTCAGTATGGATGCATCTG AGCACATCATCACTGCTACACAAATGCATGTTTTTGACTGTAGGTCTATA TTTGTTGATTAATTATTACTGTGTCTTTTTTTTCACATTTTTCTTGTTTG TGTGGGGGCATGCATTATTCTCGCAGTGACTTGTATCTGTTTACGTATCT GACATTTTCATAGAACTAGCCGATGAGTGAAAAATAAACCTAGATAATTT GGTAATTAGTCTTAGCAAATATCATTGATTCTTGCAAACCACTTTGCTAT ATATTTGGTGCTTCATGTATCCTGTGTACTCTGTTGTCCACTGAAGTCTT CAGTATGGATGCATCTAAGCACATGATCAGTGCTACACAAATGCATGTTT TTTACTGTAAGTCTATATTTGTTGATTAATTATTATTGTGTCTTTTTTTC ACATTTTTCTTGTTTGTGTGGGTGCATGCATAATTCTTGCATTCACTTGT ATCTGTGTACGTATTTGACATTTTCATAGAACTAGCTGATGAGTGAAAAA TAAACCTAGATAATTTGGTAATTAGTCTTTTCTGACTGTAAGTCTATATT TGTTGATTAATTATTAGTGTGTCTTTATTTCACATTTTTCTTGTTTGTGT GGGTGCATGCATAATTCTTGCATTGACCTGTATCTGTGTACGTATTTGAC ATTTTCATAGAACCAGCTGATGAGTGAAAAATAAACCTAGATAATTTGGT AATTAGTCTTAGTAAATAACATTGATTCTTGCAAACTACTTTGCTATATT TTTGGTGCTTCATGTATCCTGCATACTCTTGTCCACTGAAGTCTTCAGTA TGGATGCATCTGAGCACATGATCATCAGTGCTACACAAATGCATGTTTCT CACTGTAAGTCTATATTTGTTGATTAATTATTACTGTGTCTTTTTTCACA CTTTTCTTGTTTGTGTGGGTGCATACATTATTCTCGCATTGACTTGTATA TGTGTACGTCTCTCACATTTTCATAGAACTAGCTGATAAGTGAAAAACAA ACCTAGATAATTTGGATATTTTCATTAGAGTGGGGCCCTAACTTTTTTCC ATTTTTCTTATGCCTTGTGTCAGTACATAACTTGTCAGATTTGCATGTAC TGGGATGGTTAGAAGCTAGAATATGTTGCTTCTCCAAATTTGCATTTTCT TCAAAGGCTTCCCTTTCTAGTCATCTCAGTGTCCAGAGATTCTAGAGTTC ATATTCATCATCCATTCAACCCTTTCAGGTTGCTGCAACTAACTATCTTG TCCTTCGTTAGTCAACTCCTTTTTGCTGATATACAAGTTTTGCCTCATTA ATATATTTGTTCTGCTGTGCTGCCATGTCTTTTTTTCAGAAAAAAAGGAA CTTTTTTATTTGCTCCTTGTCTTCTTGATGAGAAAACCAGTTGTATTCTA GTTGGCTTCAAAACTATTCCATCTCTTTCATTCAATGGATCTTGTAGACA TGCATGTCTTCTCGTGCTACCTCCTTTTTCATTCTTTGTGACTAGCATAC ATCCATGACCTAATTCTATCTGAAATGACTCAATTTGGTCCCATTTTAAC ATTGCCATTAATAAACTCGGTTAGTTTTAGTCATATGCATCAATAGTTCA TTTAGATACCAGTTCAAATTTGTCATATTTATGTGCACTTAGATCCATTA AACAAATTAAACTACAAATATATCGACATACGTCTTTCATATACTCTCAT ATCAGAACAGGTTACTGTTTCTCATTGTGTTAGTTACGCATGTCAATAAA GTCCTTTTGCATTAACAAGGTTTTTGGTCCAAGCTCTGAATGAATATCTC TACACTTGGGGTTGAATTGGTTTTGAATTTTGTAGGCCTTATATGAGTTT AGAGGGGAGCTTTCTGAGATGGGGTGCACCTATATTCTCACTTCTTTTAG ATATTCTCTTTGTACTAATTTGTTTTTTAAGAAACTACACATTGTAGTAC AAAAGTTATATTTCACATATATTTGCTACCACTTGTTATTTTTGTATAAG CTACTTTCTATAATTGTTTCCTCCGATTACTTTTGTGACATTGTATAATG TTGTACTATACTTGTGATTTTTCTTAGATTTTTTGGTACAGTTGTATTGT CAAAAATAATTCAGTTAGTATTGTGTAGCTACACCCAGCTCAATTACAAC TTTCTCATGGGTTTATCATGTGTATTCATTGAAGCAAACATATGTGCTAT TTCATATGATGTGCATCTTATTGATGATTATTTTTTGTCCCAGACGGTAT GTGGCTCTTCAGAAGATGGATGCAACGTTTTGTTCTCTGTCTCAGATATT TAATGGCCAGAAGGAGCTTGAAAAACGACATGAAAGTTTGTACCCTTTTT TGGTGCCAATGTTTAAACGATGGGATTGCTCAAAGTGCTTGCACAAGGCC AAAATCTTAGATGACACAACATCTAGAAGTGTTTCTATGGGGAAGAATGT TTCAAGGGATGGTTGCTCTATTAGATTTGTTCGAAGTACTAAATTGCCCA CTAGTGTTGATTTCAGAAGCTTATTTCCTTGTGTACAACAAATAGTTCAA GGGAAGAATGCTGATAGATCAACACATTTAAAGAGTACCCCAGAAAGCAA TTCCAAATGCAACTCACCTAATGAGGTGAATACTGATCCACCCATGAAAG GTATGCATGGTAGAGCTTTATAAATTTCTAACTAGGATTTTTTTGTATGA CATTAGCTGATGTAGCTGTTGTATCCTCAGATTTACAGGGTTCATCCAGT AATCAAGTTACAACCGCAAATCTGACAGATAATGCTTCTGCTGATGTCAT TCCTTTACCTGAAGATTCCCAGATTAGAGCAAATAGAGAAGGATTTGACA TCACAATCCCATCCAGTCCAAAACTTTCTGAAGCAACTATGAAACCAAAT GCAGAAGACACTCGAAAAAACAAGGAGGTTCTGAATGTTAACCACACTAT TCCCAATGTTCCTAAACCAGTATCTGGGCAGACAGCTGATCAGGTCTGCA ACAGAGGTCCATGTGAAGAAGCAGCTCCAAAAAGAAGTGCTGGATCTACT TGTAAGAAGAAGAAAGGCAAACCCAATGCACAGCTTGGCAGTTCAGATGT GAAAGTAGGTCGGAGAAAGCAAATTAAGCTTCGACTGCTATCAGAAATCA TTAATACTGAGCCAGCAGGTGGTTCTAGAACTGATATTGAAGTTAATGCT GAAAAAGTCGCTGATCCCTGCGAGGATGATAGAAATACGGATGATGATAT TTCTGTTAGTCATAAGGCAGTTGGAGAAATCTGGCCGAATGCTACTGAGA TAAAGGAAAAAGAGAAAGAGGCCGTAGATGATGAATCTTCACTTATGGAC TGGATGGAGAAAATCCCTAAGAAATTAAGAACTGCGAAGAAAGATTCAGA ACACAAGGATTTCGATTCTTTTGCTTCAAAAACTACTGCAGATTTATTTT CCTCAAAGGATATGCATCACGATTTTCCATCATCAGGTTGGAGATTGAGT AAGAAAAATGCCCTACCTACTATCAGTACACATCAAGATGATGAAAATGT TCAGAATAATAATCTGGAGAGAAATACATACAGTGGAGATCACATGAGCA AAATGGAAGCTGAGAACTCCACTGATAGGTCCTTGCTAAAGGTTAAAACC ATTAATTTGAGTAAGAGGAAAATGCCTTCAACTGCCAGTGTCCAGCATGA TGGTGTTGTTCCTGTTAGCCGACAGGCAGTGGGCGTGATCTCGTCAAAAC ATGAGAAGAAGACAAAATACAAAGGAGTTGATGTTGTAGATGGCGATGAG GGATCTTCACTTATGAACTGGATAAAAAAAATCCCCAAGAAATTAAGAAC TGAGAAAAAGGATACAGAACACAAGGATCTTGATTCTTGTGCTGCTAACT CAGAATATATTCTAGATAGTGTTGCCTCCAAAGATGTCCATGACGGTTTT GTATCTTCAGTTCACAAACTGAGCCAGAGAAAAATACTAGGTGCTACCAG TTCTGGGGAAGGTGATGAATATATTCAGAATGATAATCTGGAGAGGAATG TGGATAACACAGATGACCAAGATGGCATGTCCCAAATGGAATCTGAGAAC TGTAGACAGAGGTCCATCTCAAAGGTAAAAAAGGTGAGTTTGAGTAAGAG GAACATTCCTTCAACTGTTGATGCCCAACATGGTGTTCTAAGCACTGAAA ACGCTACTGGAAAGACATCTATGCTCAGGACAGATGATCGATGCCAAATG GAACCAAGAAAGCCTGTGCAGCGGCGCCTGGCAAAGGTGAGAACTAAGAA CCTTCTCTTTTGTTATGGGTACATAACCAGACTTTCCCTGTACCCATTTT CTGTGAATAATGAGTCATTTTGTTCTATTCAAATTAGTAGTAAAATGTTT TGATCCTGAAGGACATAAAACCTCCTATAGAACTATGACAAGCAAGATGC ATACTATGCTGAATGTACCCACCTACCCCCTTGTTTGTGCTTTCATGATC TTAGGTTAATATGGAATTTTCCAATCTTCAGTTTAGATAATGTATTAATT ATTTTACAGTGGTGCAATATTCGTGTTAACACAATGAAATAGGCTTATCT GCTAGATATCCATAGAAGAATAACATTTTGTCTCATTTATCTTCTCAGAT TTCTCTGGATAAGCGTGGTAGGAATGTGAATGCTCTTGAGAAGAAAATAC CTAAGAGAAAGAAGCAAAAGCAACAACTGATGCCAGAAAAACCGGCCATA ACTGATGACATCCCAATGGACATTGTTGAACTGCTTGCGAGAAATCAGGA TGAGAGACAACTGGTAACTGAGACTGATTCTTCTGATATTAGTCATAGTA AATCCAAGTTAGCAGAAGATGAAGATTGTACTGTAATAGCTGCCGAGGAT GGTCCAAATGTTGCATCAAATGTGCTTGACACTACTTGCCAGAAGAAAAC TTTGGTGCCAGATAGTTACCAGAAAGCATTACATGATCGTGTAGCACCCA CCACACAGGCTAGCGATATGCATGCTCTCAGATTACAGACTCCTGGCCAT TTGAATTCCACCCAGGAACCACAGACACCCAGGAGCATGGGCGAATTAGT GACTATTGCTGCGACCTCGCCACTATTATCACGACATAAGGATCACTCTA TTGCTGAAGCACCAGCTGACTGCTGGAGCAATAAGGGAGCAAAGAAGTTG ACGTGGGACTCTTTCGAGGCAGCTCCAAGGGATTCATCTACCTCAACATG TGGTGCTCAGTTCAGATCTAGCACTGATACGGTTGATTTAACCTCCACTC ATGTTGCCGGACCCTCTAATCATTACTATCCCACTCACCAGCCAATAATT TCAGCACTTGACCACTATACAGATAGATCAGTTAACCCAGTTCAGGGAAG AAGTTTTCCAAGTGCAATGCAAACCATGGAAGCTGGTAACCTGTGTGCTC GAAGAAATGCTGGACAGTCAGGTTTTTATCCAAGAGAAACCCTGCCTGAT ACTCATCTGAGACTCACCGAGCCACAAATGTTAGCCGACTTTCCAAACTA TGAAATGTCTAGCAGAAACCAGATGGAATTTCAACTTCGGAATTCGTACT ATGCACATAATCAGTATATAGGATCAGCTAGCACATCGTATGGAGCACAG AATCAGTACATGGGATCAGCTAGCACATTGTATGGAAGTAACCTAAATGG CATAGGATCAGCTAGCACCTCGTATGGAGCACACAATCAGTTTGTAAGAT CAGCTAGCACATCATATGGAAGTCACCTAAATGGCATAGGATCAGCTAGC GCATCGTACGGAAGTAACCTAAATGGAAAGGTTCCATTGACATTGGATGA TTTAACACGACCTCAGCTCCAGCAAAATTTACACAAACCGTTACGTCCAC ATCCTAGGGTTGGTGTGCTCAGCTCCTTGCTGCAGAAGGAAATTGCCAAT TTGCCAGAGAGCTGTGGGACACAGTCTGGTCACAGAATAGGGGTGTCCAA AGGGATAGCATCATCATTTGATATAAACAGAAGGGTAAATGTTGAGACCT TGAACCCAGGAATGTATTCAGGGGCATGGAATGTGCTGCAGTTGGGTTCT GTTAGTTCCAGTCCAGGAGTTTCTTCAGCAAGGAACGGTTCAGCTCAATC CTTGACCAGGAATCAAGGGAGAATGATCAATCCCTTGGATAAGCTCGTAA GACAGGATATCTGTGTAACCAACAGAAATCCAACTGATTTTACTACAATT AGTGATGACAATGAATATTTAAGGGAGGACATATGAAGCAGACAGCGGTG TGCATACATTGCAAAACATTTACAATCATACAAGGTAAAGCTCATTATTT TCTTGTAAAAGAATCACCTTGATGGAAATGATCAAATACTTACTTTAGTA ATTTGATGTTGCAAGCAGGCTCCTTGTAAGAGATGGATGCTCTCTTTTAC TGGATGGAAAGGTTACAGTTACTATGGGCTCTCAAATGCAGCCCGCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAGCTTATGTATGTAATGTAATAGGCG AAGAAGAAATTACCCTCCCGACGGTGTGCGCAAGCTGATGAACTATCCTT GCGCCGCACTTGTTTTGTACAATAGAGAATGTGTCGGCTTTTGTTCTTCG AGTGGCTTGCGCATTGTGTGATTAGCATAATTTTTTTTACCATATGTTGC AACTGATTTAAAGGATGGTTGGTTAGTGATAATGTCAGCATATTAGTTCT AGCTGCCAGATGTTGTAAACTACCAAACTATGGTTCACCATTGGTAGTAT TGGTGTATTAGTTATAGCTGCCAGATGTTGTAAACTACCAAATTGCCGGT GTTTTGCTTTTACAGATGATGGTGCAATACCAATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.