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GrainGenes Sequence Report: AA042379

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Sequence
AA042379
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042379
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTCGTCTGACGCCAAACGGCATGGTCCCATGTCCCCTCCGCTCCTCCCC
TTCTTCCTCGAGGCAAAGAAAACGCACCCAAAATCTCGAAGCAGCAAAAT
TTTTGCTAGCCTTTCCCCCCTGCTCCGGCTCACAAAATCAAACACCACGC
GCACACGAGACAGATTCACCCCGTGCGCCTCCGCATCGGTCCAAGCATCA
CCGCCGCGTTGCCCCCGTTACGCTCCAGCCCAGAATCTCACCCGTCACCA
CCATGGATGACTCAGCCGCCGCCACTGCCGCCACCGCCGCCGCCAACGCC
ACGGAAGAAGCACCGAAGGAGGATCAGCAGAAGCTACCGAGATGGTGAGT
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GCGGGTCGTCCAGGCGCACACCGACCTCCGCGTCTCCAAGTTCACCGGCG
ACATGGGCGTCGACTTCTGGAGCGCCGCGACCTGGCGCCGGGTGGTGGAA
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GCATTTGCTGTTCAAGGTGTACACAGTTGACAATGAATCAGCTTTATCGG
AATACCTACCATTTGCTACTACGAGGATTGTGCGTTACAATGATTCTAGC
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TGGTATTGAATTAACTAGAATTGATGACACAAATGAATAAAGGGAAATAT
AAACTTAATTCGTCTCCCTAACATTTTAAATTTGAAGTTTTAATGGATGC
TGCTACACTTTATAAACTTCAATACTACATCATTTGGAACTTTTCATTTT
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ACCAATATATTTTGCCTTTGTTATGTCGTAAACAACTACGTATTACTTTG
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TTATATGCACTCTGGCTTTATAATTTAGTTGATAGACAAACTATAATATC
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TCTGTTATTCCTTCCACACCGACCACACCATTAACACAGCAATTTAGTCG
AAGTCCTTCATGGTCAGGGTTTGCCTGTGTCTGGTTGTCCACCAATCAAT
CAGCCAAGGAATCTTGAGCCAAAGGGAAGACATGTCCTTGCCCAGCCAAT
GCAGGATGAGTAGCTACAACTGTCTAGTCCATATGAAGTGCATGAGTGTG
TGCTCCACCGATTTCAGCACCTGGGAGCAAAGAGGGCAGAGATTGTGGCG
CACCAACCTATCTGGTGTCAAGCAGTGATGTTGGAAGTCCAGCCACAAGA
AGTAAAGTGGGCCTTCGTTTTCCAAAGAATTTTGTAGCCCAAGAAGGCAG
TGTGTTCTAGGAAGAGAGCCCTGCACTCCATAGTGCATACACACAGATCA
TTGCAAATTAGGGGTCCAAAGCCAAAGGGTGTCCCCCTCTTGCCTGGCAA
CATGAGGAATTAGGGGTCCAAAGCCAAAGGGTGTCCCCCTCTTGCCTGGC
AACATGAGGAATGTTGCTAATGATCCTAGAGTCCAAATGTCATGCATGCG
TGCCAGGAAGGAAGAACCGGTTGAGTCTCTCCTTGGTGTGCTGCATGGTG
TAGATACGATGCTCCATCGCCAGAGGTAGACATAAAGATTTACTTGGTTG
CTCTTGTGGTGGTGGAGGCAAGGAATTGCCAAACTGATGCCGAGGCACTG
TAGAAGCGTGGTCTAGTCTGAGATGGACAACAGAGCTAGATGATGGTGAA
GCGGTGGAGTGACACGGTTAACGTATATCATACTGCTTGCTTTTCCTATT
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GTAACACTTTCAGTAGCTTACTTAACATGTTTACATTCTCTTAGCATTTA
GAAGTCTTGAAGGCAAATTTACATGGCTCCTCTCTGGAAAATGCGAAGAA
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GAGTATGGCTGGCGGCAAAGGTGTGAGGACATATGATGATGCATGCCTGT
ATTACATTCGTGTAGCCCTGAAATGCCTTAACCTTTTTTTCTTTCAGGCT
GCTGAGGTACAGTCAACAGATAACGAACAACTATTAGCTTTCTGGGGTGA
AGAACTGGATAAAAATGTTGAAGGCTTTGTGAGAAACTATAGTGAAGAAG
TATACAAGGAACTCTCATGTTTTTCCAAAAGAGGTAGACTACTTTGTGAT
TATTTCTTGTTTACTCAGCCTACCATTTTCTAAAACTCAACTTTGTATGA
GTAATTTGGTGTAAGTTTATTCTGCCAATGCTTGTACTGGTAACTCAAAA
TAATTATTCATCGATAAACCATTTTGCTGATTATTTGGCGCAGCACACAC
AGTACATTGTTTTGCTTTTCATGTTGTATCATATCCAGTCGAAAATTCAG
TTCAGAGCTCGAGATACATGGATCTCGTTTTTTTTAAAACACCATTCCAA
AGTTTCAGAAAGATCTGATAAACAATTTTAGATGTAGAAAATGATGTACT
CTACCAACACAAAATCTCAACCTGAAATACCTAATATTCTGGGTGTAACA
AAAATGACAAAATTTGGAGGATTGAATTTTGGCACAGTTCACTACTTTAG
ATGTCAGATTTTGGCATTTTTCTGCAGCCCAAAATACGGGGTATTTTGAG
TTGAGAGTTTTTCAAATTGGTAGAGTACATTATTTTCTACATCTACAAAT
TTTTGGTTAATTTTTTTTGGAACTGCAACTGTCATTTTTGAATGGTTCAA
AAAACAGGCGCTCCATGTCACATCTGGTATCTGTCCATGAAATGTTACAT
GGTTTTGCTTTTCATGTTGTATCATATATTCATATAGCATCTAATATCTA
TCTACCAAACAAAATGTTATAGGATAAGAAATTAGGATCCACTTATGACA
TCCTAACTTGAAATGAAACCATAGGTGACATCCATCTGTTAATGCTCAAA
GTTAACTACCACACTGTTTTTTTGATCCCCTGCTATTTTCATAGGTCGTA
TTGGTGAAGATTTTGTAGCCGATTTGCAAGATGGGCTATTGACACCTAAA
GTTCATTGTCTTGTCCAATTTCTTCTGGAATACAGGTGATAAAATACTCA
GAACTCTATTTAGTTTGCTATGCAAGTTTACATATTTACTCTCTTCAAAA
TTGCATTGGCTTTGCTACAACTGTCATGTGCTCTAAATATCCAATTAGAG
ATTAAGATATTTAAATAAAGGATGAGATCCTTGTAGTTGAGATATATGAT
TACTTGGAAATTGAGATCCAAGTTATCTATCTCCCCATATAAGAGGACTT
GGTCCCAAGTATCAATCAAGCAATGACTTAAGAGTTTATATTACTCCCTC
GTTCACTAATGTAAGACCTTTTAGATATTTTAAAATGGACTAGATACACT
CCAAAATGAGTGAACCCACACACTAAAACATGTCTACATACATGTGTTTT
AGAAAAAGGCTAGAATGTCCTACATTAGTGAATGGAGGGAGTAGTATTTC
TTAGAGTAGTCTAGCCTAGTTATCCTGGTATGATCCAGGATCGTTCCAAT
AACAGACAGATAGAAATGATCTGTATATCCATGATCGTTCCAACAACAGA
CACATACAAATGATTTATAGAGTGTGGTGAACAACAATGTGCTTTAGTCA
ATTAGTATAATTAGTTTATCCCCAAACCATCAACTTTCAGTTTTAGTCTG
GTAAAATGGCCAGTAAAAAGTGGTACATGGGTATAAACTTTTTTTTTTCG
AAATGGGGAGCTCTGCCCCCAGGATTCTAAAAAAAATAAACGTCCAGGAA
AAACACCAGTAAACAGAGATTTTGGAAAAGGGGATGGCTATACTCTTACA
TAAACATGTAACATGGTCACTCTCAATGTGAATAGTTCATTCGTCATGAA
TTCAGTGAGTAAAGAGAAACATTTTTTATGCATGGGTAGTTTCTCATTAA
GCTAATTTACTTTGTTTAATAAATAAATATAACTACTCCCCCCCTTTCTC
TCTCTCAGGCATATGCAAGACTTAAGATGCATTGTATTTGTCGAGAGAGT
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CTGGGCGGATTGTTAAACACATTGCAGGAAACAGATCTTTCTTGCACCAT
CAGAGTAGGAATAAACAAACGGAAATAGTTGACTCCTTTCGAGGAGGAAA
GGTTTGCCATTAACGGTGTTGTCAGTGCTCATACTTTGTTAATGACATAA
TAATGCTCTGATAAGGATGTTGCTGTAGGTACATATAATTATTGCCACAC
AAGTTCTGGAGGAGGGCGTGGATGTGCCAAGTTGTCACTTAGTGATACGT
TTTGATCTGCCAGCAACTGCACGCAGCTTTATACAGTCACGTGGTCGAGC
TAGGATGCCCAACTCTGACTATGTTTTGCTTGCTAGAAGGCATGTCTTTC
AGTTCTGTTCCTATTTTTTCGTTTCAGGTGCAAATTTTGTTTAATTGTTC
ATCTTCATGGAATGTGAAATCTCTATCCACTGTTTTTCCCATTTCATCAG
TTGAACAGCATATGCTGAATAAAGAACCCTTGGTTAGTTCCAGTAAACTG
TTGTTTATGTATATTACTCAGCGTGTTCTCCATTTTCTCAATTGAATTGT
TTATATTGGATTAAGCATACCTGGCTATGTGTTAATGCCAGTGTTCACTT
AATAGTGCAATCTGGCTTGATGTAATTGTCCGTCTGATTACAAATCCTGA
TATGGTGATACATGAAGGAAAGACTACATTTAAAAGCAACTTCTATGCTT
TTTTCGTTAAAATCTAAAATTGACTAGTGCTTCTTGTCAGATCTGTATGG
GAACTGCAGGTAACTATAACATGGTAAGAGTTGGTTCCCAATCGAGATGA
TTATTTAAGTTATTTGTGGAAACCAGCCAGTGCCTATGATTTCTGATTCA
GTAGTTTGTCCAGAGCTGTGAATTCTACTCCTATTGTTCACATTTTCCTA
TTTACTTACAAAATGCGTATTCATTTTACGGTGAAGAAATGCTATACTCA
AGTTGTCTTAAGTTGATTCATTAGTATCTTTTCCCATCCTAAATTGCAGG
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GCTGCATAACATATTGATGCCTGTGTTTCTGTATCAGGGGGGATGCAAAG
GCCAATTCTAAGATAGAAAAGTTTCTTGGAAGCGGGCAAATAATGCGGGA
AGCATCTCTGAGGCTTGCATCTGCCGTATGTCAACCACTTGAAAACACAC
TGTGTGAAAATGATTATTACCGTGTTGAATCTACTGGAGCAATTGTGACT
ATGAACTCCAGCGTCAAGTTCATTTATTTTTTCTGCTCAAAGCTCCCATC
TGATGAGTATGTTTTCTGTTCCTTAAATTATGGTTTCCTTTTGTTTCATA
ATGGAAAGCTTTTTTGACACAAGTATCTTATGTATTCATGTCTGTTAGAT
ATTTTAAACCTCTGCCGAGATTTAGTATTGACGAGACATTGGGTACTTGC
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AGAAGTTTCTGTCCTCAAGAAGGCAGTTTGTCTTAAGGCCTGCCGGGAAC
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CCATGTGAAGAACCTGACATAGGTATGATTAATATTAATGAATTCAACTA
AAACTAACTTACTCATTCGGTCCATTGATTGTATATATATTTATCTCTGA
TGGATTTTGCGGTTGAGGAGTTTACTTTGCAAGTTGTGATGATTCATCAT
CTAGGCGGTTGTGCAAGTTGTGATGGTTGATTGTGCAGGCTGGGCTAGTA
AATTGTGCAAGTGTGATGGTGGTAATTTGTAGTGCTAAAGACTAAAGAGA
CTCTTTCCTGATAGTCTACCATGAAGAGAAGAGGGTCTCAACTGATGACA
GATTTTGTAATGTTGAGTCGATCTAGTTTGTAAAGATTCTGCAGAGTGAG
CTTACTAGGCCTGCTTTGGGTTCTTAAAACTGCTAGACTCAATCTACGCC
AAATGATTTTCCTAGATAGTCATGGTACTCATGTCATGTGGTAGGTTAGG
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CCTGAAATCTGTAGGCTAAGAAGTCAGAATGAAAGTACAAGGTTACTTGT
GGGGAATTTGTTTTCCTTTTCCTTGTGTAGTGTAATTATCTTGTTCAGTA
TGTATATATACATGCTATTTATTGGCCTTGTCCATTAACGTTAACATTAC
TTTGATGGCCCTCATGAAGTTGTTGAGAAATATCAACACGATCAGCCTGA
CTACTTTCCAGAAGAATTTGTGTACAACTGGTTATCTTTTTCTCGTCTTG
GAATATATTATTGCTACAAGATTTCAGTGGAAAGGTGTTTGAAAACAACT
TCTTGTCCAAATGACATACTTTTAGCTGTGAAATGTGAGTTGGGACCAGA
CTTTGTCTGTAGCTCAATTCAATTGTGTGGTGCGCAAGACTATGCTAGTG
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TCTACAGGTAATAATGGCTAGAAGGTTTCAGACTGCTATTCTTTCTTTGA
TCATTAATAAAGGCCATTCTGAGGTCAGTGATGCTATTAAATACTTCCAT
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TGGTAAAGTCGATTGGTGTAGTATCAAGTTCTCAGCCTCGCAAGTTTATG
ATGCTAATAACAAGGATATGAGACATTGCCATTCTTGTAAACAAGTTGAT
ATACTGCAAACAAAAGATGGTCCTGTGTGCAGGTGCATGCTTAAAAATTC
CATTGTCTGTACCCCTCATAATAGCGAATTTTATGCTGTTACCGGGTTCC
TTGACCTAAATGCCAAATCCCTTCTGCATTTACGTGATGGCAGTGTCCCT
ACCTACACAACCTATTTCAAGACTAGGTATAAGTTGGTCATTTAAGTGTT
AATATTTGTGTGTCATACATGTTCCTCTAAGCTATCTACACATGCATCTG
TATGCACTCATTGTTTACTTTTCCAGGCATGGCCTTGATCTAACACATGA
AAATCAACCCCTGTTGGCTGCCAGAAAACCTGTTGAAGTGCGGAACTTCC
TCCAAAAGCGCCATTATAAGAATAAAAAAGGTTAGTTTTGACTCATGGTA
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TTGGTATTATACACTTAATAAGTAAAATAAAGTTTGATCATACTCCAGTT
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TTAATCGTTACAGAATTTTGCAGTTCATGCTTAAGCCCTCCTGAAATAGG
GGCCTTAGGAAGCATGTCTATTTTGCATAACAAACATCAATCGAACATGC
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CCTTCTGTAATGTATCGCATCCAATGTATGCTTCTTTCTGCAAAGTTGAA
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CTGACATGAGAAGGAAACTCTTATTTCCCCTGTTTTTAAGTCTTGGGAAT
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TATGTTATGATTGGAGTGCCTCAATTCCGTAGCCAATATACATGGGACTT
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GCTGTAACAACCAAGGAATGCCAAGAGGAATTTTCACAGGAATCATTAGA
AACTCTTGGCGATTCCTTCCTCAAGTATGTCGTCACACAACATCTCTATG
GAAAATACAAGCTTCATCATGAGGGAACATTAACCAAGATGAAGAAAAAT
TTGATCTCCAATGCAGCTCTATGCCAGCTGGCCTGCAACAACAATCTTGT
GGTATCCAAGATTCTACTTATAATCTGTTTTGTGTAATTTTATTTTTAAG
CTAGTCATCTTTGTTCTGAAGTGTATTTGAGCTTGATAATGTCATGCTGC
ATTGTGGGCCCCAAAATTGGTTAGCATCCATCATTCAAATAATATCCTGT
TTTTTTTCGAAAAGGGGAATCAGGCCCCAGCCTCTGCATCGATTGATGCG
TAAGGTCTTTATTGCATTATTGAAGTTCAAATCTCGAAACAAAGTACAGC
TCATGGATCAGACAAGGTTGATACATAGATCAATCATATTTCAAAAAATC
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CAAAACAAAAACTCAATTGCTGTTTCCAGTCGTAATTTGTAGGCCAAAGG
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TAACAATATGGTCTAGGTAGGATGCAGTTTGGTCCAAATGATATTCACCT
CACTAGCATCGGTCATCCGTAAGGTTTCCTTGATCTGGTCCAGCCTATAT
AAGTTCCTTCTTTCTGGTATGACATGGCTAAGGCCAGGTTGTGCAATGAA
ATACAAATTCCATGCTAATGCAATGAAATATAAAATCCGTGTCAGCATAA
TTTTTCACTGCTAAAGTTGCATACTGTCTTTTTTTCTTTTAGAATAGACC
ATCTAATTTTTTTGGTCATGCTGCACAGAAGTTGGACTTGTATATGATCA
TTATTTTTATAATAGTGCTAGATAACATTAGTCCCCCTTCTGTTTGGATG
CCAGGGTTACATTCAAGGCGCAGAGTTCAACCCAAAAGGTTGGATCATTC
CAGGGCTTGGTTACGCCACGTGTGACAGCAGCAAAACTTTCCGTTTAAGC
TCCAATGATATGTACAGTTTGAAAAAAATGTCTATTAGAAGTAAGAGAAT
AGCGGATACAGTTGAGGCCTTAATCGGAGCCTACCTCAATGCCGCTGGAG
AACAGGCTGCATTTCTTTTCCTAAAATCATTAGGATTGGATATAGAATTT
CACAGCAAAATTCCACTCGAAAGGAAGATTGTAATAAAATATGAAAAGTT
CATAAATGTCAGAAAATTGGAAATAATTCTTGGTTATGAGTTCAAGGATC
CTTCATTGTTGATGGAAGCATTAACACACGGGTCATACCAGATTGCTGGA
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GTAGCTCATGTTTTTTTTCCATAGAACTTCACCAAGTGCAAAGGTCTAAA
CACTGTTGCTATACTAGGTGCTATTTTGCGCAGACAGGTGCCAACTTGGT
GATGCATGAAGTCTACAGAAAATAATATTTTTTTTCATTTTGTATACAAC
GTTCTAGACATGATGTTTGGTCTACTAGATGCACTTAAAATGATTTAGGT
GGGTGGACTGAAACTGGGTGCCAAAAATAGACATGGATGGTTTATGGTAG
TCTACACTTGTACGACTGGGGTGCCAAAAAGTGGACTCCGCAGGTTTAGA
GTAGCCTACACTTCTACACTCTGATGAAAGAATGAGAACTCTTTGTTGTC
TTGTTGACACCACAAAATAGTTTTTTAATTTATACATTTGGTAGTGACTA
GTGAGAACGTGAGACACAACAAAACTGGTAGTTTAGTTGTACATTTCGTA
GTGACCAGTGAGAACGTGAGATTTGATAGAAAATTTCCATTTCTATGTTT
GACGATCTATTGGTTTGCAAATTCAATCGATAGCACTGTGAAGAATATAT
CACTTCAACTGGATTGAAGTCTATATCAAGCTGCAGTAAATAATTTTCTT
ACAGGTTTGTGCCCCTTGTGCAGAGGCTTGAGTTTCTCGGAGATGCTGTG
TTGGACCATCTATTCACCATATATTACTACAATCAGTACCCTGAATGTAC
TCCAGAACTGTTGACAAATCTTAGATCTGCTTCCGTCAACAACTATTGCT
ATGCGCACGCCGCTGCTAAAGCAGGACTAAACAAGCACATTCTTCATTTT
TCATCGGATTTGCATGACAAGATGGCTAACTACCTTGAGAAGTCTAAGCA
GACATTTACCGGTCCATCGCATGGTTGGGAAGCAGGCATTGGTCTACCCA
AGGTGTCTCCTTCTGTTTGATGACTTTGATCTGTATTGTTATTTATTCCG
TGTTTTCTCGCATTTGTGCTTTTGCTTGGTCTAGTATTTGCGTATATTCT
TTCAGAAACCCCTCAAAACATATACCAGTCACACCATGGTTGCAATATGG
GGATACAAAATCGCCAGACTCCAGCTCATTGCAGCCAATGATACAAAACC
CAGAAATGAGAGAAATACTGAACCTAGCCTGGTACTGGTTACTGCCAACT
TCCCTGTTTTAATCAGTGAAATTTTGGGTGCGAATGTAGCCGGACAATTA
CATTCCAAAATTGCCAGTTATCATTGAGCAAATTTAACATTTTTACTTAT
GCAAATGCATATCATTTGAGGCATCATTGCCTAGATAACAAATATTTGAT
TCCATTTATTAAACCACTCTAACAGGGACACGTCGATGATTTATTATCAA
TCTATCATCTCTTCCCTTCAATATGATGTTTGTTCATTAGTTTTGGACTA
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AAGCATATACCACATTTCCGTCACATTGCTGAAGTTTGTACTGCTGCTTA
TTTGCAAACAAAACAGGTTCTCGGTGACGTTATTGAGTCAATAGCTGCTG
CGATATATCTTGACAGCAAGTATGACAAAGGCGTGGTTTGGAGAAGCATG
AAGCAACTACTGGAGCCGCTTGCGACCCCTGACACCGTTGAGTGTGACCC
AGTGAAAGAGCTGCAGGAATTTTGCGCTCGCAGATCTTATAGCAAGTCTT
ACACAAAGACCCACAAGGATGGAGTATCATCCGTGGTTGCAGAGGTTCAG
GTAGAAGGGACTAGCTACACGGCAACTGGAACTGGTCCTGATAAGTCTGT
TGCCAAAAAGTTTGCAGCCAAGAAACTGCTAAAAGATCTGAAGGCTAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.