Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA033244

[Submit comment/correction]

Sequence	AA033244
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA033244
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAAAAGGTTATCTTTCTTCCCTCCCATCGACGCCGGTGATGCTCCTCCT CTCCAGCCGCCCCTTCCCCTCTCCATGCCTCCCACTTCGCCGCCTCCTAC GATGCTGCTGCACCTATTCCCCCGCATCCCCCTCTATTGCCCCGTATCAC CAATCCTTCGCCCGTCGCATGGCCCTCGCCGGCATCCACCCCCACCACCG CATTGGTACGCCGCTTCTACTCGCTATTCTTTAGTGCTTCCTAGGCTCCT TACTTACCTCAGACCCCTGTTTTCTTGCAGCTGTTGGGGTCTCTGGCGGG CCGGACTCTATGGCTCTGTGCGTGCTCGCGGCGGCTTGGAAGAAGGCGGT GGAGGGCGGCCCTGGGAGGAAGTCTGAGGAAGCGGGATCCGTCGCTCCAG GGTTCGTGGAAGGGCTCCTCGGGGTCGTGGTCGACCATGGGCTGCGGCTC GAGAGCGCCCAGGAGGCGCAGCTAGTGCGTGACAGGGTGCACGGCATGGG TAAGCTAATGGCATACAACTTCCCCAAGTTACTCCATATTTTTGAATGAA AACTGGCTTACAAGAACCAGCCTACATTGCAAATGAGCGTGAGAGCATCT CCTCTCAGGCCGAAATCCAGAGCTAAAAATCGCCCGATGGATGTAACTTT CGGCTTGGGAATGGCCGAATTCCCAATCGTGTTCCCAGGTGACATGCGAT TTTTTGGCAAAGTTGGCGATATTTCACCACAATTCGGCTCAAAATCACAC AAACATAATTTTGATCACATAGTTCGGCACGAGACAGCGATGAGCTTGGC GACGGTGACGAGCTTGGCGATGATCCGCACCGGCCAAGCCCGCGCCGAGC TCCGTCTGTCAGGCCCGCGCACGCCGGTCACCCGGCCAAGCCCGCACCGA GCTCTGCCCGCTAGGCCCGCGCATCGCCGGTCAGCCGGCCAAGCCCACGC CGAGCTCCGCCGGCCAGGCCCGCGTGTGGGTACGGGGGAGAGAGAAGGTG GGCGTGTGGGAGGAGAGAGAACACTTTCCTCACTGGCGCGTTGGGTTCGG CCTGGGAACGCCGGATAAAAAAGGCCCAAATCCGGACAAAATCGGCATCC GGATGTAAAAGTTGCCGAAAAGTGGCCTCCTGGGAACGCTAGTGGAGATG CTCTGATAAGAGAACTGGTGACGCTTGGAGCTGGAATTTTGACTTGGGCT GCATTTGCACAAGCCTTGAAATATGATGTAGAATCTTGATGTGTGACTAC TTTGTTGTAGGTGTCATGTGCGAAATTGCTACATGTGAGTGGCCAAATGG GCGGCCAAATCTAGGGCATCTGCAAGAGGCAGCCCGTGAAATGAGGTACT TGTGTTGTGTCTGTCCTGTTTTGCCTGTCGTCGATATCAGAAAATTTTAA CCAGGTGCAAACTCTTTATTTGTAGTTATTTATGTATTTGAAACATTGTA ATTAGATTTAGTTCCGCTTTTTTTCTTTGAGCATGCAATGGCGGGCGAGG GCCCCATCTGAATTCTGAAGTTCAATCCGATATTTTACTTTTCCATGTAA TGTTTCGTGTTCTTTGTCAACGGCATCCAGATATGCACATACATGCGTGC TACAGAAGCATGAGATCTGTAGAATATTCACCACATAAGTACTTTTTAGT ATAAAACCCTATGTTCGCCAATTAGTATCGAGTTGTGGCTTGTGCTAAGA CACAATACTTTTACTCAACATCTCCTAGCTGTAATAGGATCACACTATTT ATTAAGGTATATATGTAACTAAGTTTTCTTCAGCATCAGTGTTATAGCGC TGTAGTGGCTAAGTGGCTGTCCTGACTAAGGTCACATGTGTCCTCTTACC AAGAAAGCTTTGAAGTACTAAAGAGTGACATGTTGCACACTCACCATTAA AATATGTAAATCTGTTAGTATACCGACGCGATGGAGATCATTGTTGTGTT CTTTGTGGAATATTTACCTATATCTACCTTAGTGTACTGTGTGCTCTTTC AATTCTATGTGCCAGTTTATCCGCAAATGCAGAACATCTTAGCCCATTTT AATAAAGCCTCATGTAACACGTTCTTATAAATTCAGGTACCAAAAACTAT TGGACATTTGTATAAAGCAACAAATAGGAGTCTTGCTTATTGCACATCAC TCTGATGACCAGGTCTGTTAAGACGAAGATGTGTTCATTTTTTGTTTGGA TGGGGAAGATGTCAACATTCACAAGGAGTTAATTCTTAGTATTAATGAAC ATCAAACTTAATGACACTTGTTGATATAATCCAATGCGTAGAACAATTTC GGAGTTTCCGTTTATGCTAGTAAGTCGTGCTAGGATTTGTATATAGTGAG TTAGAGTTGCTATTGTGCATTCATGTACTACTGTATCTTGATTACACTTA ATTTCCGGGTTAAATATACATGGATACTTGATTGAATGGATGAATGGTTT GAGCCAAGACATAATAGTCCCTCAGTTTTACATTTTAACAATATTCATTT TGATGTCTGAAGATCAATTAATCTCATTCTCATGTATGATTGCATATTTC CGTTTTATGATCTACTTGTTATTCGTTGTCACTGCAGATTATATATTTCT ATCTGAATGAATTCATCTTCTAACTGCAGGCAGAGCTCTTCGTTCTGAGA CTATCTCGCAATAGCGGAGTTTTAGGGCTTGCTGGCACAGCCTTTGTCTC CCAGTTGTTTGCACCTAATTTGAAGTATGATGGACATAATTTTTGTCGTT ATGGAATCCTTCTTGTTCGACCCATGCTTGAATTTTCGAAAAACGACATG TATAAGGTAAGCTTTTGATCTCATCTCATGCTGTTGGAATCAGGAATTCA TTTAGTCAGAGTCAATAAATTTGTATAAATGAAGGTCCAATTCACATTCT TACAGTAACTAGGGATGCCATGACACTTAAGCTAAATCAAACTTTAATCA TATGATGACATTTCAAACAGATGAAACTTTTTTAGATTTTAAGTTGATAA TTTGATGAAGCTTTTCACATGCCATTGGACAGATCGAAAAGTCCTAGCTT TTTTGACACGACATTGGACAGACTGATGGGTTCTAGTTAGTATTATTGAT CAAACCCATGGTCAAATTGTAGGTTAAGTAGGATTCAAAAGTGTCATACG ATTATGGTAATCAAATATATTTAGGACTTTGTTTGCCTAGGAGGTTTAAT TGTGAAGTTTACCAACTCAAGTACAACAACAACAACCAAGCCTTTTGTCC CAAGCAAGTTGGGGTAGATTAGATATGAAACCCAAACAGAAACTAGTGAA GAGTGCAAGTCAAGCAGAAACTAGTGAAATGTGCAAGTTAAGCAGAAACT AGTGAATGTGCAAGTTAAGCAGAAACTACTGGAAAGTACAAGTAAACAAA AGAGCAAAAGAATAATTCAAGGTTCGGGCACATGGATCACTGATTTCCAT GCAGCCCTATCAAAAGCCAAATCTCTAGGTACATTCCAGTCCTCCAGGTC TCTCTTAACTGCCTCCTCCCATTTCTACTTTGGTCGCCCTCTACCCCTCC TTGCATTTTCGATACCCCTTTAGAATCCATTGTTGACCGGTGCTACTGGT GGCCTCCCTTGGACATGCCCAAACCACCTTAATCTGTGTTGAACACGCTT CTCTTCAATTAGCGCCACCCCTACTGTGGCGTGTATCACTTCATTCCTAA TCCGGCCTTTTCTTCTGTGGCCACACATTTGTTGGATGTGTTGCCTCTTA GTGGGCCAACATTCTGCTCCATAAAGCATGGTAGGTCTGATTGTCGTCCT ATAAAACTTACCTTTTTGCTTTTGTGGGACCTTCTTGTCAAATAGGATTC CAGATGCTTGCCGCCGTTTCATCCACCTTGCCATGATCCTGTGGCTAACA TCCTCATTGATACCACACCACCATTGCTTTGCAGCATTGATCCAAAGTAT CGGAAGGTGTCCCTTTTAGGCACTACTTGCCCTCCTAGACTAACCCCTCC GTCCTCGTATCTAACGCCGCTAAAGTCACACCACATATACTCCGTCTTTG TCCTACTAAGTCTAAACCCCTTGGGCTCCACAGTCTGCCTCCACAACTCT AGTTTTCTATTGACGCCCACCTTACTCTCATCTACGAGTACCACATCATC AGCAAACAACATACACCATGGAATATCTCCTTGTATGTCCATAGTGATCT CATCCATTCACCAAGTCAAAAATGTATGGGCTCAAAGCTGAACCTTTGAT GCAGTCCTATTGTAATTGGGAAGGTATCAGTCTCACTATCTCCTGCATGA GCACTTGTCACAACATTAGCGTACATCTTTGATGAGGGAAATGTGCTTTG TTGGGACTTTGTGTTTCTCTAATGCCCACCACGTGACCATCCTTGGTATC CCGTCATATGCCTTCTCCTAGTCAATGAAAACCATATGTAGGTCCTTTCT GCTCCCTATATCTCTCCATAAGCTGGCGAAGCAAGAAAATCGCCTTTGTA GTTGATCTCCCAGGCATAAAGCCAAATTGATTGTTAGTGACATTTGTCAC TCTCCTCGAGCGATGCTCGATCACTCTCTCCCATGGCTTCATAGTATGGC TCATAAGCTTAATTCCCTTCTAATTAGTACAACTTTGGGTATCCCTTTAT TCTTGAAGATGGGTACTAATTTACTTTTCCTCCTCTCATCAGGCATCTTG TTTGACCGAAATATGTGGTTCAAAAGTTTAGCTAGCCATACTATCGCTAG TTCTCCAAGGCATCTCCGCACTTCAATGGGAGCATCATCGGGACCCATGG CCTTCCCTCCTTTCATCCTTTTCATGACTTCCTTAACCTCAGTCTCTTGG ATCCTCCAGATGAATCGCCTGTTGGTGTCGTCAAAGGAATCATCCAGCTC GGGTGTAATGCTCTCGCTCCCATCATTGAACAGCCCGCCAAAATAATCTC TCCATCGCTTCTTGATCTCCTTATTTTTCACTAGAACTCGATCGGCCTTG TCCTTGATGCACTTCACTTGGTTGAGGTCCCTTGTTTTCTCTCGCAATTT TTTGCCATCTTGTAGATGCCCGTTTTGCCTTCCTTTGTACCTAGTTTCTC ATATAGCTCATCATAGGCCTTCCCTCTAGCTCCGCTCACGGCTCGCTTTG CGTTCTTCTTGGCTTCTTTGTACTTCTCCATGTTGCTTGTGCTTCTATCT TGATACCAAGTCTTGTAGCACTCCTTCTCCTTGATAGCCTTTTGGACATC CTCATTCAAACTCAAGTAAGTAACACGAAAGCACAAATTCAGGGGCCTAT AGGCACACTTTATTCAGAAAGATCAAACTCAATTTTTCACCTTTAGACAG GCATTATACTAAACCATCTTTTTTCAGAGCTCATTTACTCAGCCTATCTT GACTGAGTTGTATTATTACACACATTGCGGAAACATTCTAAAGAGAATGA GGACTTGATAATTTTTTGTATGGGAATTAAAGCTTCCTCCCCGCTTTTGA GAATAAAGCTTTTTTTAGAAAAAAATAGATGTGCATCTCAAGTGATTTGA GCTGTCAGTTGTTTTATATAGCAATTTTATGTGGTGTTACTAATTGGTAA TTCATTCTCCACAGATATGTCAAGGAAGTAATCATTTGTGGGTTGAAGAT CCAACAAATAATAGTATGCAGTATGCTAGGAACCGAATTCGGGCATCTTT GAGATGTTTATCCCCAGATGGTTAGCAGTTGCTGCCACTCGTGTTTCGTG TTTATAGTCCCTGTGTTTTTTTCATGATCCTTTGTTCCTATCTTATTATC AAAATGACACTTTGATGCTTGTCATCAGATGTACATCTCATTTTTGTATC AACAACTATATGATTGACTCACGCTGCCTGCAAACATTTGATAAATGGAG TTTGGCTGGGCATTCATCCTCTCTTACATTTTAGACTTGGTAAATTCCAC CTGAGTTTTGAGTCCTATGTTTCCGCACAATAAACTATGATTAAGTATCG TGCTTGGCTACTGGAACAAACTTGATCCATTGCTCATCCGCAATTGTGTA ATCCCCTTGAATAGTTGAATAATAATGCTCACTGAATGGAGTTACATTGT CTCCTTGAATCAGGATAAAATTTGCTATGTGATTTTTAATGTCTCTTGCC TGGGTCTGATCTCCGAAAACTAAATCAAAATATTTTATAGTGAAGTTTGT CGGTATCTCGGTGACACAAAAAATATGGACTTTAACCAGGAGAACAAGTT ACTTGAGCTAATCTTGCCTGTTTAAGATGGTTATAGAATCTGTAGTTCAA ACTTCAAACAATAGCATAGTTATATTTGCATGGTGTCAGATTCATGACAG AGTTGTCTTTGCTCACAACATTCCTTCGGAGTAGTAATATAGGTTTATTT TAGGCCGACCACGATAATTAAGAGAATGAAATGAGCAAATGGCATTGTTA CCTTTTAATCATTTCCACATCATCAAACTTTTGAACTTCCACAATCTCTC GAGCATGCAACATCGTTTGCATTAGTACCATTCCTATTTTTAGTTAGAAG TTAGGGTGAACTATATGGGAATGGAGTAGAGCTATTAATCAGAAGCATAA CAGGAAAAAAGGGTACAAGATGCTTCAAATTTCAGAACGCCTTCAGTTGG GAGCAGAGTTAGTAAGGCTAGCATGATTAACATCAAGATCCACCACTAGT GCCTGATCTACCTGCTTGCAGACCTGTTTCACATATGCCTTGTTATAGAA ATGCAAAGATATACATTCATCTGACTAGCACTTTTTTTTATCTTTAGGTG CCTTTCAATCAGAACTTCAGAAACTGATATATGCATGCCGGTTGACACGA GTGTGTGTCGGCAATGCCTGCAATACGGCCATCAAGCAGTCTGTCACAAT AGCGGAGGTTTGCGTTTCTTTTATACCTGGATTTGAAGTGTCCTAGTACC ATGTGATTATTAAATTCCTTAGACTCGCTATTTTGCCCTTAAAATTCTTT TGTTGTGATGCAGTATGGGTACGCTGTCATTGACCTTGAAAAACTTGACC CACAAAATGTTGATGATCTTTGTCTTTCACAATATTTGGCATGCGTATTA CAGGTACACGTTAGATTCATCATAGTTTGTTCGCATTTAGTTCTAACACA TACCATCTAAATGTTTTCCATTATAGTTTTTCATTGATCAGATTTTTTGT GGGATGGGATACTGATATTCAGTTATTTGTAGTTTGTTTCACAGAGACAC AGGCCAATCCGTGGAAGAGCTGCTCGATTGTTCATGGACTACATCCGTAA TACACCTTGCAAGGTTCTTTCTTCTTGCATATTTTAGTATCGTCTTGCAA ACTTTTGGAATGAGGCTGGCCCTAGTGGTAGTATCATAAGGTGTATCATG CATGCCACCTTGACAAAATGATGATTTGGCACCACAATTAATGAAGAGAG AGGTGCTAGTGGTATCATAATATGATACGGTATCATAGCACATACAACAA GAAAATTTAATGTCAAATACATCTTGTACATCAAATTGCATTGAGATTCT ACAAATAATTAAATGCCATGAGACTATGATACAACTAGATGATACTAAGC ACTATGGGGGTAGTATCATACACTAGTATCATATGCATGATACTAGTAAT ATGATACTCCCACTATGACCAGCCTGAGCCACATATGTTAATTTTTACCA TGTGTTGTTTAATGATCAAGTTTAAAACAATTAGTGCTAAAGTAGTGCAT AAGAATTGTCCCGAAATGGTGGGCCATCAAGTAGGAAGGTTTATCTTCAA CTACTATTATTTTTTGTGTGAACTAGGAAGGGTGAGTTGAGACTTGTGAA AGAAGTGATCTTGGCTTGGTCCGCGCATGGTCTCCCTTGATAAAAAGTTG AGACTTGTGATCCTGACAGGGCTATCCTATGTATATCTAAGAATTTGTAA CATCCCAACTTTCTCGACTTCTAAAAACTTCTAAAAAAACCTTCTGAGTT AAGTTTGAAAAAATAAGCTTAACTTGATGTTTCAGAATTTCGGATTTAAT TTTAATCAAATCAAACCTAAATTATATATTTGGTTTTTGAATTTTAGGGG TCAAGTCCCCACTCAAAATATTCGTCTTAAATGTTTCATCTTTTCCGTAA AGAAAATATAGGAGGATATTTTGAGTGGGGACTTCACCCCTAAAATTTAA AATCAAATATTTAATTAAATCAAACTTCTAAAGCATCAAGTGAAGCTTAT TTAATTCAAGTTTCAAAATTCTAAAGCATCAAGTGAAGCTTATTATTCAA ATTTAATGGAGCAACTTTTTTAGAAGGTTTTATTTTTCTAAAGTTTTAAA AGTCGAGAAAATTGGGATGTTACAAGATTTAATCAAGGTTCCAATATTTT CTAACAAAATGAATTATTCGGTGGTAGACAACGCAGAATAAATTCTCTTT GGAACACCATTGGGCTCAATGTGCCTCTCTGGTGCATAATTAATTCATCT TGCTAGCATAAGAATACCCTGTCAATTCATCAATTAATACTTTAATCTCA TGCAGGGTGCTCTCTCTGTAGCTGGTTGTTACCTTTGTGCTTTTCCGAGG TCTAAAGGTACAAAAGTACTAGTCTGTTGCTCTGCTGACTTGATGGAGTC ATTCTCTATTGAGATGTCCTACAAGTGTTCCTATGAAGAACAGCCACCAC CGGTACCTGAGATTGATCATGTAGTACTTGAAGCGCACTTACACTCTAAC CAATTTCTACCGTGCTCAAGTATACCATTTGTGAGTTATAAATCTTCTGC TGATGTTCTGAATAGAGCAAAGGATCTCAATATAATAGGTGATTTTTCGT TAGAGAAACTCCTCAGCCTGCAAGCAGAAGAAAATCAGAAATTTACAACA GAACATAAACATGAAGAGCAATACTTGGAGAAAACAAGCTTTCCTGATGT GAAAGTTTTCTGTCTCTGGCCTGGTGAAACATGTCATTTTATGAGCAGAT TCTTGATTACATGGAATGCTTTGGAAGCTGTTCCAAATGGAATATGTTCA TATGACAGTAAAAAAAGCATATGCCAACATTGTGCAGTGAATCAAGATGG AAGTATTGCAGTTCGTCATATGTTTGATACCGATTGGTTGTTCCTTGCTG AAATTTCTAGAGTTCACTCAGTGGAAGAAAACCAGAATGTCTCAAAAGTT TCCAGTAAGAAATTGGATGATGAACTCCTAGAGCACTCTAGATATTTGCA GTTATCAGCAACTAAAGCTCTTGATGTCCTGAGATCTATTCCAGCTTCTG CAAGACGAGCACTGCCAGTGCTGACCAATTCTCAAGGGGACATACTGAGC ATACCGGTAAGTGTCCACTCAAAATCCAAATACTTGTCTCCTTGCCTGTA A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.