Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA029072

[Submit comment/correction]

Sequence
AA029072
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029072
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCTAACAACAACAACGGCATCGCGATCCCCACGGTGGACCTGGC
GCCGTTCTTCGTCGTCGACGACGAGGGAGGCGTCGCCCGAGCCCGTGCCA
CCGCCACCGAGGCGGTGCGCGAGGCGTGCCGGTCGTCGGGGTTCTTCCGC
GTCGTGAACCACGGCGTGCCGCGCGAGCTCATGGCGCGCGCGCTGGAGCT
TCAAGCTTCTTTCTTCGCGCTCCCTGACGAGGAGAAGGCCAAGGTGCGGG
CGGCCGAGGGTACCACCCCGCCCTTCCCGGCAGGGCACGCGCGGCAGCCC
ACGCACTCCGTCGACAAGAACGAGTTGCTGCTCGTCCTCCATCCCGAGCT
CTGGCTCGACCTGTACCCCGCCGAGCCTGCAGGATTCAGGTCACCCTTTG
CAGCTCGTTGCATGTGTTTTGAAACTTTGAACTGCGTAGCTGTTTTGCTT
ATATGTTTGCCAGTTTTGTTTAATACCGACATGATGGGCGTGCAAAGCAC
ACATGCAGTCTACGAGCGTGGATCCAGAGGGCATGCCGAAGTTCACCCTG
TTGAATATATATAAGCAATTTTCATAAGATATATTCTAGAAATATGAAAG
GTAAAACTAACAATGAAAATAATCATGATGATTGGATCGTAAAAAATTGT
GAAATTATAGGTATGTTTTTGGTAAGTAGGATAGGAACAGCATCATCGAT
GGGCATCATTAATAATGAAAATTTAACCCCATAAGGGATAAGAACACATA
TGGTGCAGAGGAAGAAAACCCCCTCACAGTGTTTTGATATAGTCATGTTT
TCATAAGGAAAGTAGCCTTTTGTTGAAAAGTTGAGGAGGATATCAGTAGT
CGGGCGGAAGCGCTCCTAAAAACTTGATAGCCCTCTCCCACACAAGATCA
TAAGAGATAGGGTTTCATATATCTATTGTCTTGTTTGGGTACGCCAAGAG
GTGGGATGGGGAAGACATGAACGGTGGCGCAAAGCTTTAGAACCTTGAGG
GAGTATCATTTGTGTTAGGCATCTTGTTTTTTTGAGGAGCTACCTTTCTT
ATACATAGACCAGTGAGAACTGATCCACTAGGGAGACAAAGAGGAACAAT
CAACAGGGCCAGCCCATAGGACGGGGCAGACGGGCGCACGTACCGGGCTC
CATGAGGTAGGGGACCTCAACGAAAGACTAATTTGTGCATCCATAGTAAT
TTTCTACTCTTGAGGCCTAACAATGTAGAATAATTCTAGAAAATATAGAT
GATCAAACGATAGTCTATCATGCCTCTACTCTCATTCTTCTCGCCTCCGC
TCCCAAATACTCCATCATTTCTGAATATATTTTTAGGTTGCATTTGTGTA
GCCTCTCCAAATGCGCAGACCAAGCCATCATGTGTCTTGACAAGGTTGTA
AGTATTCATTAGTAGAGACTAACAGCACAATCATATAACTATATCATTCT
ATAAGCGGATCTCCTCACGTCCGCATGATTCTACCTATCCCATCATACAT
GTTTGAGAAACAATTTCATCCTCATAATAAACATCATGGCCGGTCTATAT
CATGGGACAGGGGGGAGGCCGCCCTAGGGCCCCCCAAACGCTAGGCCCCG
GACCAATGTACTACATTTGTAGGGTGGTAGGCTAGTGTATATCTCCCTCC
ATTCAATCAATTTCTAATTGTTTGCATTTAATTTCTCAACTCAGTGTGCT
CTTATTTAGGGATGACATGTGTTTTATTTCTTAATACTACTTAAATAGCA
CAAATATAACGTATGAAAGGAGTTTAATATTTTTGTTAATTTGGCTTGGA
AGTATTTCTCTAAATTTTGACTATCTAAGTGAACATGAGAAGGTTCAAGG
CACAAACAAACATGAGAGCTTGTACAAAAATGTAATAATGAAACAGAATT
CGTAATTATTTATCCTTTTTTGATAACTCATTTTGAGATTTTTGCACAAG
TCATTGATATCTTTTATGAAATTTCCCGACACTATGTTTCTACCCAACAT
CTAGACACATGATATTGTATTTATTTTCTCAAAAGTACACACTATTATTC
TGTTAATTTATTTTCTTAAAGTTCAAATTTGAGAATTTTTCTCTATTTGT
TTGAAAAGTTTATTCTATAATGTCGTTGTAATTCTTATATTTTATCTCTT
ATTCCACCATGGATAATTAATAAAATGAGAAATTTTATATGTTATTGAGT
ATTTTTTTGGAAATGTGTGCTTTATTACTAAGAAGTAAGTTTACACCCGG
CCTTTGCATAGCTAGGATGCACACAACCGATCAACCACGCAACAAAACAA
AAGAAAAAGTACGAAAATTACAGATAAAGGAAAACAAAACGTAGTCCTCC
AAACTAGCTATGGGAGGTCTATCCATAGATCATGCTACCATCCATATCGG
AAAAGACATCTCTCGCCATGTCCTTCAATCACGTACAACCCTCTGCAAAC
AAATCGCGAAACTCCATACGTTGGAGAGTAGTTCAAGATCGGAGGATCGC
CGTGACTCGACAGATAATCTGCAGAGAAGACACGATGTTATTAAAAATCT
TATCATTTCTACATAGCCAAAGCGACCATGGCAAGCGCTCTCACCCTTAA
TAAAGTTCCATATTTATCCACAATCCTATTCATCCAGTTGCCAAATACAT
TGACTACCGAAAGTGGAGGGGACAAACCAGAGGCTACTTGGACGATTGAC
CATATAGCACGAGCAAATTTACATTGGAAAAATAAGTGTCATATTGTCTA
ATTATGGTGACAAAACGTATTGTGTACTTCCATGCAATTCCTCTTAACAA
GATTATCTTTTGTGAGAATAACCACTTTACGGAGATACGAAGCGAAGACC
TTTGTTTTAAGGGGTATTTTCATCTTCCAAATTTTACTATTGTCAGCGAC
TGGAATATCAGGTTGGATCAAAGCTATATACATTGAATCAACATAAAAAT
TACCACTATGTGGTAATTTCCATTTGAATTTATCTACACCCTCTGGCGGC
CATATCATGGCTAACCTTAATAAAAGGTTGTTCCAAGACAACAGTCTAGT
GTCTATGAGACTTTTTCTGAAAGACACATTCGGAGGATTAGTTTCTATTA
CCATGGAAAGTGTATTTCCTTTGCGCCTAATGATCAAATATAGAGCCGGA
TATTATTCACGAAGAGAAGTTTGGCCAAGCCATTTATCTTCCCAGAATCT
AATCTCTGATCCATCCTTAATACTGAAAACACCAAATCGGAAGATTTTTT
TGGATGTCATTAGTCCTATCCAAAAGTGTGAATCACCAGGTTTCCAAACT
AGTTGAGATACCACTTTTGAGCCAACATGACTTGTTTGCCAGACCCCTTC
TTCTGAAAGAAGTTTGGAAAGCCATTTACCCAGGAGTGCAGTGCTTTTGA
CTTGCAAGTCATGTATGCTCAGTTCATCGTATTCTTTGGGTCTACAGACT
ACATTCCATTGGGCCAACCGATATTTTTTTATGACTATCCCCTTGCCAAA
AGAATCTTGACCGGAAATAATCCAGTTTCGTCAAGACCCCTTTTGGGAGC
TAGAAAAATGAAATCATATACAGTACCATGTTGGTGAGTACTGAATTTAT
GAGGAGTAGTCTTTCCCCAAGGGATAACAAATTACCTTTCTAGGTATTAA
GACGTTTCTGAAGTCTTTTATCAACGAGTTTCCATTCAGGAATCGTGAGA
CATCGATAGTGTATCGATATTCCTAGATAATTGATTGGAAATTGCCCCTG
GCCGCAACCAAAAAGTTCGGCATAAAGGTGGCTATCGTTGTTAGCCTCGT
CAAAACAATACAAGTTACTCTTGTGAAAGTTAATTTTCAATCCAAAGAGT
TGCTCAAATGCTGATAATATTAATTTCAGATTCTTAGCTTTCTCCAGATC
ATGTTTCATAAATAAGATTGTATCGTCAGCGTATTGAAGAATGGAGAATC
CACCATCAACGAGATGTGAAACTAATCCTTCAATTTGGCCATCAGCTCTT
GCTCTCTCAATAAGGATAGCTAACATATCAGCCACTGTGTTAAATAGTAT
AGGCGATAGTGGATCCCCTTGTCGCAGTTCTTTTTTGGTCTGGAGGTATT
TGCCAAGAGTCATCGTTGACATTTATGGCAACGCTTCCTCCAGACACAAA
AGATTGTATGAGAGCATACCACTCCTCCGAAAAACCTTTTATACGGAGTG
TTTGCTGAAGAAAAGACCAATTAACTTTATCATAAGCCTTCTCAAAGTCA
ATCTTTAACAACACCCTATTTAATTTCTTTGAGTGTAGCTCATGAATCGT
TCCCTGCAAGATTAGTACACCATCTAGGATGTTTATCCCTTGCATGAAAT
CAATTTGAGAAGGGCGAACAACATGATCCGATACCAAGTTTAGTCTAATC
GTAGCAAGTTTTGAAAAAAAACGTTAAGAAGGCAAATAGGACGATACTGT
TGTATGCGTTCTGCATTGTTAACCTTAGGTAGTAAAATTATGTTGCCAAA
GTTAAGCTGAAATGGGTCTAGCTGGCCATCTTGCAAAAACTCAAACAAGT
GCATCAAGTCCATCTTGATAACTTTCCAGAACTTTTGATAAAATTCTGCA
TGAAAGTCATCAGGCCTTGGCGATTTATTATGTTCCATTTGGAAAACAGC
TTTCTTGTCCTCCTATTTAGTGTAAGGAGCAATTAGAAAATTGTTTTTCT
CAACAGAAACCTGAGAAATATCCTCTGTCTCGGACTCATGCAACGAAAAG
GAGTTGTCTGATAGTACCCCAAACAAAGATTTATAATAACTTGAATATAC
GATTTTAGATACTCCTGACCTTCAATCGTACCTTCATCTTGAATTAAAGA
GTGAATAAGTTTCTTTTTATGCTTGACATTGGCAACAACCTGGAAGTATC
TTGTATTCGCATCTCCTTCAAGTATGAATTTAGCATTGAAACGCTGGTAC
CATTTAAGTTCTTACTCACACAAAAGTCTGGCAATTTTCGCATTCGATTG
GTTTTTAAGCTCAATCTCATGTGCAGTCAAAAACCTAACTTCCGTTGAAG
CCTCCAAATCATCAATAATAGCAGATTGCCTCCAAATCATCAATAATAGC
ATAAAGGCGTATTTTTTTCTTTTTTAAGGATTTCAGCAGTATGTCTATCC
CAACCACGAAGAAATTTGCGTATGACACGCATTTTGTTGTTCTATCGTTG
TATAGGTGTTTGACCACTAACTGGTTTTTCTCAAATAGCCTTCGCCAAGT
CGTGGAAACCATCACGATCAATCCATCCAAGTTCAAACTTGAAGTTGCTT
TTGGATTTTCGTGGTGGTATGCCAACAGATAATAATAATAGAGCATGATT
CGACAGAGCCTCAATACGCTCTAGAGCATGAACACTTACCATAGAAAATT
TATCTTCATATTCGGTATCAATAAGCACTCTATCAAGTTTTTCATATGTA
GACTCCGGAAGACTGTTATCCCAGGTGTTGTCTTCCTAACATTGTAACCT
CAGAAAATGGGGAGAATTTCACTTCTCCGGACTCTACACCAACTAGGGAT
GCACACAACCATTAAGCATATGTTATTGAGTGATATATTACAACTTAATA
ACAAAAAATATTATACTTATTTTTCAAAAACAAAGTTAGGTGGTTAATTA
TGTCATTTAATTATAAACAAACAGTTTAGTATAAAACATATTTACTTTTA
TTCACCCCGGATCTTATTTTTGTTTGAACCTGCCATGTTAATCATGTGTC
GAATATGTCTACTCTACTAGTTATCTTTCACACATGCAAATGGATCTGTT
ACTCTCATAATGGTGGTCTATGCTTCATTCTACAAGTACATACACATGTA
CACAAGTAGCAATTGGTAGAAATAAGTATTAGAGTATATAGTAGTTTTTA
AAAAATCACCAAAATTCCAAAGACCATAGATCTATCAAATGTACAAATTA
TTTAATTTGACATTACATTAAACTAATATTTCTCTTGTGGAATACTAAAA
CTATTTAAGTCTTTTGTGAACAAGTCGTGGATCTTGGCAGATATTTGAAA
TGTTTTTAAAGAATTTTCTAGAGTAGGGGGCATTGCCCTGACAGTAGGAA
AACTCTTCCACTTTAATCAAAGAGCCTTTGATGTCGTGTTGCAGTAGAGC
CCGCAAACCTTGGACCGGCCCTAACAATCGGCAACCGTGCAAATACATCT
TACACTTATATAACAGAACATTTAAGCTTCCAACCTTATGTGAGGGACAC
AAGATGTGGTGTAAGTACGCGCGCCACGATCCCTACCAAGTGTTCACGTC
TAATTTATGTGATGATTTTCTTGTGGAAAAAACTATATAAAAAGAATTGT
TATTAATTGGTGTATTTTTTATATCTCATGTACATATGCAGAAACGTGAG
GTTTGCCATTTTTAAATCTGCTAATTGCTGCACGCAAAAAATCCTCTCAA
ATAAATTATTTCAGGAACATTGCTAATGCAACAAAATAAATCTGGCTTAT
GCTAATATGCATCAAAAATATGGATTTATTGCAACATAAAGTGGTACGTT
AGATAAGGAAAGTGAAAGGTATGAGTTGAAAAATGGAAAGAACCTTCTAA
CGTGAACTGAATTTAGTCGAGGGGCCCTTTTACAACTAGGACAAGAGACT
CGGGACCAGGACACGCTGACCACACACGAATCTAGAAGGCTGGTTGGACG
AGTAGGATAGGCCCGACACACGAACGTCCAGGTGGGATTGCTTTTTCGTG
TAATTACGGCTGGCGGAGGAGGTGTGTATATGTTCTCCCCCATGCTCCAT
TCCCAACAGCAATGTGGTTCGTCCCGGCCTTTACCATTTATGAATTGGCC
ATTAGGATTCACACTAGAAAACCCAATAATTTCAATGATCCCCAGTAGAC
TTAGATAGGCAGAGCTTGTATATGATTTTAAAATGTTATTTATATACCCG
GTACTTTGGTGGAAATCATTGAGGTAAACTTCCACCTAAAATTTTATGCA
ACACTTGTTTGCAACTTAAACAATAAACTATCCCTCGAACTGCAAGTAAG
ATAGTTTCACAGTCTTAATTGATATACTTGGTTGTCACAAGGTTTCCTCG
CGGATGAATCTTATACATCTTCAGCGCATTTTCATGAGTTTATTTGAGAG
TGCCTAACAGTCACACTCGTATAAGTGTTCTTCCAAAAATACTCCTCGGG
ACAAAATTTATGCTTAAATAAGTGTCAGTTAGAAGCATCACCGAGTTGTC
ATGCATCCACAGGGAGGCGCTGGTGGAGTGGCACGCCAAGCTCACCGAGT
TGGGTCTCCTCGTCCAGGAAATTCTGAACGAGTCCATGGGCCTGCCACCA
GGCTTCCTCGGGGAGTACAACGACGACCGCACCTTCGACTTCATCTCGGC
GCGGCACTGCTACCCGGCGACGCAGGAGGAGAACTTCGGCGCCCGCCCGC
ACCAGGACGTCAGCTGCATCAGCTTCGTCCTGCAGGACGGCGTCGGGGGC
CTGGAGGTCCTCGGGCCCGAAGGCGACTGGGCCCCCGTGGTCCCCGTCGA
GGACAGCATCGTCGTCAACATCGGCGACGTCGTGCAGGTGCTCACCAACG
GGGAGTTCAGGAGCGTCATGCACCGTGTGGTGAGGAAGCCGGCGGCGCAC
AGGTACTCGCTCATCTTCTTCCTCAACGTCCACGGCGACAAGTGGGTGGA
GCCGCTGCCGCAGTTCGCGGGCGACGTCGGCGAGCCGCCGCGGTACAGGG
GGTTCAAGTACGGCGACTACCTGCAGCTGCGGGCGAGGTACACCAAGATC
TACCAGCTGTCCATGCCCGTGGACGTCCTCGACATCACTCATTACGCGAT
CTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.