Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022342

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022342
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022342
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AGAGCCCCCGCCACACTCCACTCACTCCCTCCACCTCCCAGCCAGAAATA ATTTCAAAACCCTCGTCTCCGGCGACGTCGGCGGCGGCGCCATGAACATA TTCGCCGGTGTCAGCGGCCGCGCGGGCGCGGGGGAGGGGGCGAAGGAGGC GGGATCCACAGGAGGTGAGGCGCTACTGGAGCTGACGCCGCACAGGATGG CGGTGTGCCACCTCGTGCAGGTCTTCGCGCCGCCGGCCCAGCAGGAGGGC TCCGGCACGCCGCCGTTCCCCTTCGCGTCCGTCGCCCATCACAACCGCCT CGGGCTGTTCCTCTTCTCCCTCACCCGGGTACGCACGCGCGGACGCTTCT TCTCGCTCCTGGTTCTGTCTGTCTGCTACCATTTGGCGATGTCTCTGATA TCGTGTTCCACATTCAGTGCGGCTTGCCTTTAATCATGCGGAAATTAGCA TTACCATTCTCTCTAAACCCCGTTGCGTACAGTAATTAGCGTCTAAATGT AGAATGATGAGCTGCTTAACTTCTGGGTGTGAAGTAGTATCCATGCGCGG TGTCCAGCAATCCAGCATAGACAGAGAAGTAGTGATTCCCTATCTGCTAT TCAGTAAAACATCAGTTGTTTATATTTGCAATTGCAGCATTGTTTATATT TGCAATTCGGACTTGGCTCAAGAGGATGCTCGTTTATACATTTATGATTG ATCATTTGCGTGTAATTTGTCCACCTGTTTTGATTTGTACGACGAGATGT TGTGAAGTTTGTGTCATGTGTGTATTGCATTGCAGCTTTCATTTTCACTC ATATATGTCTTAAGTCTTTACCTTATTGGTCTTATAGTCATGTGAGGATT TTCTGGAACCGCCACTGGAAGAGCTTTTAAGGCAGTTGAAGGTGGTAGAT GATTTAGTTAATGGTTGGCTCTGTGAGCAGTTGACAACTACACTGTCAGG GCTTAACTCACCAGACGATCTGTTCAATTTCTTTGATAAGCTACGAGGTG AGATTATCAAAATGGATGGATTTTCGAGTCCTTGATATTTCCTGCTTAAT ATAAGGCTCCCAAATAGACAACTTAACTTCTAATGGTTTCTGCCAGGTGT GCTCACTTCACCGGATGGTGCAAGTGTGGAAGATGAATTTCTGGATCCTA ACAGTCAGCTTGGAGTTTATCTTCGTTGCTGTATACTTGCCTTCAATTCA ATGACTTTCGAGGTGCTACAAGTAGAATATGGCATTCACAGCCCCTGTTT TTTGATACTTTTATGCCCTTCTCTTTTCTTATTTAGCGTTAGGTTACTAA GTGTGCTCGCTGAAAATTCTTGTAGGGTGTCTGCCATCTGTTGGCAAATC TCGTGGCGTACTGCAACTCTGCTGACACTTCATATGATATGGCAGAAGAT GAGGATTTTAACAGTGAAATGGAAATGAGTGACCTGATGGATGCAGATAT AGGTGTTAGAGCTGGAGTATTTGATAAATACGGTCAAGGTTATGCCTCTG AGAGCCATATGGGGGAGAGCTCTACGTCTTTTATCCATGCACCAATTTCA CTCCATGATTTTGATGAAGGTAAACTGAACCCTAAACCCTTTAACCTTTT CATTTTGATGGGACTGGATTTTTTGTAAGAAGCCATGGAAGAAAGAATAC AAGGCACACCAGAATTTTCTGAATTAATCACAGCTGATTAGGAAAACAGA ATGCAACGAGCACAACATGGAAGAAAACCTAGCATTTAGTCTTTTTTATT GTGTACTGTCATATGCAATCATGAAAAGAGCTATCCATAACCTGAATTTG TACTGATATTAATGTTAGAAACAGTATCTAATATAAGGACATTTTTTACT CCAAGCTTGTAATGTTTGCTGCCTAAGATGCCATCTTGACATCTTATAAT AGAAAAATGCATGCAACCATGATACCAATTTCCTCCCAACACGTATTTGA ATAATGTAACTATCTAGCTGGGTCACAATTGCTGCACTTGCTTTTTTGTG GCATAATGTTTTTGGTTATAGACTTATAGTAATACCAGCCTTTGTGGCAA AACATCCATGCTGCTTCTCATGCCATTTGTGTGCTGAAAGGTGGACCAAA TATATGCAATCTATTTGTGGGAATTAATTTTTGTTTTTCCAGACAGGCAA ACCTATTTATATGAAGTATTTATGTCTTTTTTTGCCAGCCAATATTTTCA AAGCAGATGATAATCCGACTTGTCTGAGATCAAGGTGGCAATTAGAGGCA TATCTTAACCAGCAAGCTGACATTCTTGAGAAGTGAGTGTCGCTTCTTAC ATTTAATCAGCTAATACCACCATGAACTTGTAGTGCTTACTGAAAACTAA AGGATATGTGCAGTTTCTTTAACAGCAGCCTTTTTGCTGCAGGAATCCCA GCTCGGTGCCTTTGAATTCATTTAATGCAACTATGACACAGCTTCAGACA TTAGCTCCGGAGCTTCATCGTGTAAGTTATGCACAGTATAATACATCTCA TTATTGACTATGCAGGGCAGTGAACAGCTCCCAGTACTTTTGGTTTATTT TTCTGCCTTTATTGTACCTGCCAGGTCCAATTCTTGCAATACTTGAATGC TCTGAGCCATGATGATTATGTTGCATCATTAGACAATCTTCACCGCTATT TTGATTACAGGTCAGTCCTAGAACCCTGACCATACTGTGGGAAGTGCTCA ATATTTTGACCGCCTTTCTATGATTGAATGCTACGTTTAGCAAGTCACCA GATCTTTTCTGTGATTGATTGACGTTTTGACACCTGTTCTGTCCATTTAA ACAAATACCTGATGGCGAGGCCTGACAACATTTTTGTTAATTTAATCAAT GCCTTTAAGGAATACAATAACTAACATGTTCTCTGTCTACAAGGGCCTTT GTCGTTGTTTGAGAATTTGGATTTCTAGTTATCAAGACTGAATTATGCTA ATGCAGCATGTTCATAAATTAACCTACTGTTGAAGCATATATACGAAGTA AAACTACCAAAAGACTAATTTGTTTACCAGTGTGCCACTTTTATTACCCT AGTTTTAGTGTTGTCTTTTGTCCACAAGATAAGAGTTGATAATGATATGT TGCATATACTACATGTTAATATTTTGCAAATATGTTCTTAACTGGTTATA CTTTATGATGGTATAGTGCAGGAATGCCAGGACTTTTTAGTCGATCATTG TCTCCGAACCAAGATATTATCGTTGGAAAGTATGAGAGTGCCCTGCTCTG CTTAGGTAACTTGCATTGTTACTTTGGACATCCGAAGAAAGCCCTAGAGG TAATATAAGGTATTGGTTTTTTCTTGTTTTCTTTGAGCAGCCTATCTCTT CATTGGCTTATTTGCACATTGCTTACTGTTCTCTTGGGTTGCTTTCTTCC AGGCATTCACAGAAGCAGTACGTGTTTCTCAAATGGTTAGTTACTGAACT GGTCTATTTCTCAAATACAATTCTATGCAATTATTTCGGCATACATATCA CATTTTCTGGAGATATGTAAATATAATGCAAGCTGCTCTTCAGTTTGCTA CTTAACAGATGCTATAATTTGTTTTTCCAGAACAATGATGATTCCTGCCT TGCATATATATTAGGAGCCATTTCCAATCTACTATCAAAGATAGGCATAT CAAGCACAGTTGGAATAATTGGTTCTCCATATTCACTTGGAAACAATATT GGACTAGGCATGCCGCTGTCCATTCAGCAGCAGTTGCTTGTTCTTTTGAA ACGATCACTTAAGAGAGCTGATATGTTGAAACTTACAAGCTTACTATCCT TTGATCACATCTCGCTTGCAAAATTTGATCTGAAGGTAAGATCTCGGTAT GATAATATTTGACATCAATTTTTAACGTACATTGTAGTTGTGGATTTATT TAGCTCTGTGTCAGGCATACGTTGTTTGATCTTGACCAGGCTAGAGGACT TTTAGCATGTGTTCTAATTTGGTGTGTCCTTGTTGATATGAATTTTTTCT GACTGTAAACGTTGGCTTACCAGCATGTTCAAAGGCCATTGGTGTCGTTT GGCCCTAATGCTTCTACAAAGCTTAGAACATGTCCTGCAGATGTCTGCAA GGTATGTCACACTTATCCTGTACTCAATAATACATTAATACCACAGTCAA GTCACCCATCCTCAATATAGAGGATGTATATGTTTGGTTATAAATTAATT ACTTTTTTATCTTATATTGCAGAACTTAAGATTAAGTTCCCACGTGTTGT CCGACTTTGGCGCAGATGGCTTAGAAACTTCACATGATAATGGTAGTTTC AGCACCTCGTGGCTTAGGAATCTGTCCGCTGCTTCCAGTTCTTGGTGTAG CAGCTCGACAAAGCCAAGAACATTAATTGCAAATGACTTCGATAATTTCC ACTTCAATGCACAACCCAGTCCAATACCTACATCAGTATTACAATTAGCT GGCTCAGCATATTTGATGAGGGCCACTGCCTGGGAGCATTATGGAAGGTA CTTAACTGTTCTCTGTAAATGTTTACTGTAAAAATGCATTTTCATAGCAG AAATTGCAGGTTGTATACTGATTGTTCTAGCTTGGCACAGTATTGTGGAT GTGTGGGGGAAAGGGAGCAGAGTGCTTGGATAAGAAATTACCAAGGGTCC CAACTTAGAAACTGCAACTACTTAGGTCGGATGCTGTTGGTTTATCGATT GATACTGCTAAATATTAGTCCTACTTTTAATACTACAAACATAGGGATAT TGGCCCTGCTCTTTGTTCTATACTTATTCAATATGCATAAGACCTTTTAG AAAATCTTGGTTTTACGTAGCTCGTAGCTTTAATTTAACCCTGTGATTTA TTTCAGACTCTTGCTACGTTAAACATTTCATCGTCTCCTTTGTTGCCAAG TTTCCACTGATGTTTTTTTCCATTCTATTGTTACTTGAAGACTAGTCATA ATGAATCATATTTTGGAATGAACTCCAACTTGTCTCCTTTCTTGCCTACT TGTTATCTGCATCCTTTATAGAAAACTGATGTTGGTTAACCCTCTCGATA GTGCTCCGATGGTTCGGATGAATACTTTGGTCTATGCAACCTGCTTTGCT GATGCTGCAAGGTATAACAAATGAAACTCTAGCAATTATATTTCTTCAAC ACTCACAACTTTATTTACATTATTTTCCTGTTACCTGTAAGCTGTATCTT GTAAATCATCTTATGTTTTGCTAATCTGTATATGTGATAATATTGTATGT TCTTTTACAGTTCACCAGAGCTGTCGCTAGCATACGTCAAGCTAATTCAA CAGTTAGTAGTCTTCAAAGGATATTCTGGTTAGTTACCATATGACCGAAA TATATGTGCTGTAACCTCCAAGAGGTATGTAAGTTTCCGTAGTTTCTTGT AGCCTGACATTATGCGATTGTTCTGCAGCGGCATTTGGTGCTCTAAAGCT TGCCGAAGAGAAGTTCCCATCCTCGACGAATTCACATATCCAGCTTCTCA AACTGCAATTGCTACATGATCGTGCCCTGCATCGGTACAAAGCTGTTCCT TGACTTCTTTGATCAACTGCATTCTGTGTCCACAATCTTATCTGTTAATA TTTGGTGTAAAATTGATCTATGTAGAGGACACCTAAGAGTTGCACAACAA ATCTGCGATGAATTTGGGGTGCTCTCATCTTCTGTCAGTGGAGTAGACAT TGACCTGAAGACTGAAGCTAGTCTACGTCGTGCCCGCACCCTACTTGCTG CAAAACAGTTTAGCCAGGTTTCGAGTTTACTTGCCTTGTAGTTTACCAAT CATGTGTTAGTCATCTTATTATTGGTCCTTTTTACCTTTCATCTGTGCAA GTGGATTAATATATTTCAAACACATCAAGTCCTTTCCATATTCAAATGTC TTTTCCTCTTTACTTTCTTTCACACTTGCTGGTCTATGAGCATCTCAACC ATGTTGGCCCAACAATTCAAGGAAAATATCTATTCCCTAACACTTGAGTG CCCTATGTACAGGCAGCAGTTGTGGTGAACTCTCTTTTCTCTACATGCTA CAAATACAACATGCAAGTAGAGAATGCAAGCGTTCTTCTATTACTTGCTG AAATACATAAAGTAAGACAAATGATTTTTTGTTGAGGCTACTAGAACTTA ATTATTACTGCAATATCATTCAGAGAGAACTAATATTTCCTGTCTTTCCC ACCAGAAGTCCGACAATGCAGTCCTTGGCCTCCCTTACGCATTAGCCAGC CAATCGTTCTGCAAATCATTTAACTTGGATCTGCTTGAAGCTTCTGCCAC TCTTACTCTCGCTGAACTTTGGCTAGCTCTTGGATCAAGCCATGCGAAGA GGGCCTTGAGTCTTGTTTATCAAAGTCTTCCCATGATTCTTGGTCACGGT GGTCTTGAGCTGCGTGCTCGAGCTCATATAGTCTTGGCAAAATGTCATTT AACTAATCCAGAATTTCCAGGTATATCCAGATGATGCTTTCGTGTTAACG TCCTTCTAACTTTAAGCTTTGTTGCTTCATGGTGCTTTCATTATTATGAC AGTTTCTGAAGATCCTTGTGCTGTTCTGGATCCTCTAAACCAGGCGGCCG AAGATCTGCAGGTTTTAGAGGTGAGCTGATAATTCCATCTCATTCATTCT TCCTGGAACATGAGACATTACAGGGATCAAGTCCAAAAAATGCATGAAAA GGATCTAACATCTCACACTTAAATCCGTTGTGATATGCAGTACCACGAGA TGGCGGCAGAGGTCTACTACCTGAAGGCAATGACGTATAACCATCTGGGC AAGGAACAAGAGAGGGAGGAAGCGGCAGCTTGTTTCAAGGAGCATGTCAC TGCCCTCGAGAACCCATGCGATGAGGAGGCTTCACTCGCTTACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.