Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005730

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005730
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005730
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAACCCCAATCCGATCTTTCTATCCCGCTTCTTGGTCAGCTCTGAATCCC ACCCACCCACCTGCCAACTACTCCCCACCAACGCACAGGCACAGCTGCGA TCGCACCGGCTGCTAGTACCACGACTTCTGAGTTCTTCCTCCCAAAAAAA AGTCCAAACACAAGGCGACGTACGCAGCCACGGCACAGCGCGCCAGTCAA ACCCGAGCCGACGACAAGGAGGGAGGAGGGCGGAGGCAGCAAATGCGCGT GTGATTCCCCAGGGGCGGTGATCCGTGCCGGCGGCGCGGCAATGGGCCGG CGGATCGACCTCTCCGGCGCGGAGATCCGCGGCGGCGACCCCGGGGACGG CGGCCCGCCCATCTTCCTCCCGCGCCAGACCGCCGCCTCCCCGCTCCTCG CCCTCGACATCGGAGGTACTACTAAGCTCGCCGGCGCGCGTCCCCGCTCT TCCTTCCTTCTGCTAAATTTTTGGTGGCTTCGCGCGGTTCTGAACCGGTG AGCTCCGGTCGCAGGGACCCTGGTAAAGCTGGTGTACACGGCGAGTTGCG GCCGCGAGGCGGAGCTGCGGTTCGCCAAGTTCGAGAGGCGGAGGCTGGAC GAGTGCTTCAACTTCATCCGGGCGGAAGGCCTCCTCGGCTGCAACGGTAA CTACCTCGCTGGCTGGCTGCGGGCTGCGGCGCTGAATTCTCTGCTTCTTC TAGACACGGTTAATTACGCATGCAATGTGGAGACTGGGGAATAGGGTGAC CTGCTCCATGGTGGAAATACGTATGACAGGATAGCAAAATGCTACTAGGA TAAACGAGCAGCTGTGATTTGCTCAGGAGCTAGGCTGTTCTTCAGAAACA TTCACAAGTTTGTGTTGTCGACTCTTAGCTCATGATCAATCTTGGAAACA GCTAACGACGCTTGCAAGCGCTCTTTTCTAGTATGATGCAAATGCAGTAT ATTCACCTATGCGATAGAGTTCAGTTTTTTACTGTGTCAGTATTTCATCT TCTGTTGTTATGTGTTCAAGTATTATTTTTTACTGTGGGTTGAACTGTAA CATTTTTATGCAAGGGACAAAGCTTGGGTCAAGCAAAGAAAATATGACAC TGAAGGTATGATTTTTTCTTGTCTTACTATGTAGCGGTGGCTTTATGGCT TTTTTCGATAGAAGGCGCTTTTATTAAACTCGAAACGTCACATCAACCGT ATTTGGCCCTAAATAGATAAATGCAAAAGGATATCATTTATGCAGCTTGC ACTTGGAAGTTCTTCTGTATTTATTTGCAGTAACATGTAAGGCATACTTT ACCTATTCGCTTACCCGAAACTTCAGACGGAACATTCACTGTGCACCACT GCCTTGGATGGTTACTTGGTGTTTGTAATAAATCCATTACCATTTATTAT TGGTAGCTCTAGTCAATATCCGCCAAAATTGTTCTTACTAGTTACTTTCA CTTTTACAAATAGTTCCTGAACTTAATTTTCATGGACTCACACTATTAGG AAATACTCATACAGAGGTTCTGAATAAAGTTATGTCACGAGGCAACAGAT TGTAACAATTTTTGGTGCATTGGGAAACAGAGATTTTGCCTCCTGAGTAG ATACTTGTAGCTGTTCGTACTTGTGGCTGAGGCAAAACCCTTGGCAATCC TGTAACCCGAGCATAAATAATGGCGAACACAGAAATGATGAATGATGTGT ACTTGTGAATTCTGATTGCCACATTGAATGCATATGCAAAGTAATTTAAC TTGGTAATGTGGAGCATACTATAGTCGTTTGCATTGTCCAATGGCTTTAA TGGTTAACACATACCGTTGTCATTTTAGTGTGAGTGTTTGATTGTTAACA GTATTCTTTTAAATGAGATGTCCTGTAAAGTAGGGTGAACAGAATTGACT GTAATGGAGATCATTTGCAGGCTACGGGTGGTGGATCTTTTAAGTTTGGT GATGATTTTCGGGAGAAATTGGGTGTTAGTCTTGACAAGATTGATGAAAT GGATAGTGTTGTTTCTGGAGCAAACTTTTTGTTACAGGTGAGTCCTAAGT CCTTTCACACATCGTAACATGGCTTAAGATAAGGTTTTTCCTGTTAGCGT TCATCTGCCTTCTAGAAATTCTGATATCTAGTTCTCATTTAGCTCCTGTT TTCCACTTTAATGATGCTTCCATGCAGAATGTCCCTGGTGCAGCCTTCAC ACACATGAATGGAAAGAGGAATTCAATAGATATTTCCCCAGATAACTTGT TTCCTTACCTTCTCGTCAACATTGGCTCAGGAGTTAGCATATTAAAGGTT GCACTTCTTCATCGTCATTATACTCATATGGAAATACAGCAGAATGCAGC TCATATAACCATGTGTTATCAAGTATAATGCAGGTCACTGGAAATAGAAA ATTTGAAAGGGTAACTGGGACACATATTGGTGGAGGTACTATGTATGGTT TAGCTAAACTATTAACAGGTTGCAAGAGGTAATATGAATCCTTTTGTGTC ATAAATATCTTTGTTTGCATATTTTTCTCACTAATATATTACATTCTGTT AGTTATGATGAATTCTTGCAATTAAGCCAGAAAGGGGACAATTTTGTACT TGATCTAATTGTGAAGGACATATGCGGAGAACTTGTTTGCCAGAAGGTTT GTTGTCACCTTCCTCTTGTTTTACCTTTGATTATCAAAGTCATTGCTCTT GCTTAGAATTCTGTAAAAACGTTCTGGTGTTTATACTTATATTTATCAGA TTGCCCGGAAAGCAGTATGACAGTTGCGAGCATTGTTTTTTGAATAATTG ATGAAGTAGACTGAAATATTTATCTTGGCCATATTTATATTGTATTAAAT AATTGATCCATCCGCATCTCATGACTTATTTTTTTCCTATAGATGATTGA TTATATTTCTTTTATGTTCCAGCAAGGACTATCAACTTCGACTCTTGCTT CTAGCTTTGGAAAAGTAATTACATCTATGAAAAAGCTAACAGATTACCAA CCTGAAGACATTGCATCAACATTGTTGAGTGCTTTTACCTACAACATTGC ACAAGTGAGTTTATGTTACGTCGTGTTATTGAATTATTATACCTATTACT TCATCTTTGAACTGGAAAGTTACTGAAATCAAACAAAATGAACATTATTG TCTCAGCTACTTCATAGCTATTTACACGTACAACATTCAGCCTCTGTTCA TTGGAAGAAAAGAAAAGAAAAGCTAAGCAGATGCAGTTGTTGATCTGAAG AATAAAACTATACTAGTGTAATGCCTTCTACTAGAGAAAAGAGAAATAGG TTTACTTATTCTATGTTAAGACAATTTGTTTCAGTAGAAACCATTTTCAT TTTGTGTAAGACGTATTGCCATTTTGTGTAAATGACTTCGAGCATGTTGA TATAGTTATGCGTCAGTATTTTTATGGGGTTTAACTTTGACCTATTAGTG TTGCTCTACCTTTTGTATTACCAGATATTGGTTTGATATATGACACTCTA CGTCCCCTGCAGATTTCCTTCCTTGTTGCGTCACTTTTGGGCCTCAGAAG GGTCTTTTTTGGTGGATCATACATACGGGGACACAAAAGCACAATGGAAA ATATTTCTTATGCACTTGACTTCTGGTAAGCATTTGATATTTTCCTGATG CGATCCTCCAGATGAGCATTTGTACTATAAAAAATACGGGAATTTTGTAT ATGTGTATATTTCTTGCTACAGTTTGTGATCCTTAAGAGGATTCTGAAAA AAACTCCTTGTTGTTTTCTCATTTAATGTCTTATCCTTATTTTATCAACC TTGCAAAGAATCTTAATAATTGAGGTATGTCATTCAGGTCGCAGAGTCAA ATGCAAGCTGCATTCTTGCAACATGAAGGGTATTTAGGTGCTCTTGGTGC CTTGATGAGTTACGGGGATCCTAGAGATGAAAACTTGACCCTCGAGGGAT CTAATGAGAAGGTGGGCTCCTAGAATAGTATCCTTCATAAGACTAGTTTA AATATTATGTTTTATGTGGTTAAATGCGTGTGTGCAGTGTGAAAAAATTA CACACATTTTCAAGTAAATCAAAAGTGAAGGACTGACCTGCGCTCCATTC CTATAGTTTTTGTGGCTTGGACGGCACAAAAAATACATGTTATTTTTCGA TGCTTAAGCATGTGATTTACTGTTGATTATTTTCCGTGGGTGATCACTTT TATAGAAGCATCGTGAGCCCATAAGGTCGAATGTAATATATTAACAGATA GTTCTACCTGCACTCTAGAATAATCACGTAGGCAAATAATCTTTTTATTG AGGTTAGTCTGAAGCATGATTGTCGATTTCCCTCATTGCCGTAGGAGAGC ACTCACGAGTCGGCAGCTCCTATTGACGCGACATCAGCAGATGAACATAA TGACAGCAACATATTTCCTTACCTCCTTGTTAATATTGGATCTGGTGTCA GCATGATAGAGGTTTGCCAGTACATTGCTTTTGTCACTTTTCTTGTTTTT GTAATAGCAGTTGTTAACAGTGAAAAACATTGTTATAGGTAATTGGTAAG GGGAAGTTTGAGCGAATTATTGGATCTCATCTGGGTGGTGGTACTATCCT TGGTCTAGCAAGGCTTTTAACTGGCTGTTCCAGGTACATTTTATTTATCT TTTGTGCTTACAAATGTCAGGATTTCTTCATACATGATTAAACATTTGCT ATTAGTTACGAGGAATTCTTGGAGTTGAGCCAGAGGGGAAATAATTTAGC TGTTGATTTGACTGTTGGAGACATATACGGGGAGGATGGTTATCCAAAGG TATTTTATCTATACTTGTGAAGAAGCTTTTTTCTGTGAGTCTACTAATAG AATAATATTAACATCTTATTAAAACAATGAAACTGTCATCTGACCAGCTC TTGTACAGGTATGAAGATTAGTTTTAGGGCTTTGGCATGCTGATCATAAA TATATTGAATCTCCAGCACACCAGGCCATTAGTATGCCCATTAATTTTTC TCTCACTTCACACCAGATTGGTCTTCCAGCATCCACTACTGCGGCGAGCT TTGGAAAAGTGAACTCAAGCAAACTTTCAGATTACAAAGCAGAAGATCTT GCAGCAGCTCTACTAAACTCTTTCACCTACAACATCGGGCAGGTACTTTC TCCAGATATTGGAACTAGCATGTGCCATTCATGAAGTACCCTCTAACCTT GCTCTTATTTCTCTTTTAGATAGCCTACTTTGTGGCTAATCTTTCAGGTC TAAAGAGAATCTTCTTTCGAGGTGCTTATGTCTGTGGTCACGAAAAGACC ATGGACAAGATTTCTCGCTCCCTCAAGTATTGGTAAGGAGTTTCCCATTC AGATACAGTGAAAAATCTCTTGGCAATTTTTCAGAAAATTTAGCTATCCA GAAACATGGGTACAATTGTTCCACTCTGATCAGACAGTTCATAATTGCTT ATCTTCCTTTTTTTGCTCTCAGGTCCAAAGGTGAAGTTCAAACAACATTT CTGTGTCATGAAGGGTTCTTGGGAACCCTAGGTGCATTTTGGAGTTACGA GAACATGGGCATTGACGGTTTGGCATCACACGAAGTCATTAGGGAGGTCT TGCTTGGTGCTCCGTACACCGGGCAGTTCCCAACTTTACCATTGGGTCAA GAGCAGGACATTGTAGGTCTCATGCACTGGCAATCTTCACTTCGAAGTCC AATTCCAGCCTGAACACTTTGTCCTTTTCATTGCCATTTAATCTTGCATG TGATTGTTTCAGGGAGAAAATACGACCGGTGAAGCAGAGGTGGAAAGGCT GCGGCATGAGAACACAGTTCTGAAGTGTGAGCTTGAACGATTACGAAGCG AGAATGCAGAGCTGAAAGCTAAGTTAGCATAATCTGATGGAGCAGTTACC TTGTAAAGCAATAAAACAAGAACACAGTGATGAAGCATGCATCCGTGCTA AAAATAACAAGATGGTGATATGTGGGGGCACAAACAGCCTCTCAAGTTGT TGTAACCTGTAATAGTTCTGGCGACAGTTCAAAGGTTGTTTACAGAGAAA GGATCCACACAGATAGTTGCCCCAAATTAGGGTCACTCATGTTGTATTTT TGTTCTTATTTCCATTTGTATGGTGTAACCTTTATTGTATGGTGTAACCT TTATTGTCTGTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.