Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA005124

[Submit comment/correction]

Sequence
AA005124
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005124
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTTCCAGTCTCTCTGCACCAGCCGCACCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCG
GGTATCGGCGCCGTCAAATTCCCCAAACCCGCCGCCGCCCTCCGCCATCG
CCACCGCCACCGCCACCGCTCGCGCCGCTGCACGCCGAATTCTTTCGTGC
CCCGTCCTCCGCTCCACCCGATTGGCGCGGCGTGTGGAGATCGACCCATC
CGCCCACCCCCGCGGATTCTCTCTTCTTGGTAACGAAGACCTAATTCCTT
GTGATTCTCAAATTCGTCTCTACTGCTTTCGTTCATGAGAGCAGCCGAAT
CTTAGCACTATCAGGGCTGTGAATTCATGGTCGTTAAATTTTATTAGCGC
TACTGGGGGGACTGCTCTGGAAAATTCCTCGTGACAGTGGTGGTGATGGT
TCGTTCATGCTGTCTGATTAACCGTTGTGGTGCTTTCTGTGTGTGCCTGT
GCAGGGTTGATCCATGTCTCATCAGCACCAAGAGCACAATGCGGAGGCGA
TGGAGGAGGACGACTACGACATGGACGACGACACAGACGGCGAGGAGTTC
CTCGAGCCAGGGGCCAGGGATGACTCCGACTCCGATGGGGACGAAGAGGA
GGACGAGTATGCTCAGGGGGTGTGTGCCTCTCGGTTCTATTAAATTTGAT
TCTAGGGTTTTATGTTTTTAACTAATTTTTACTCAGGTTGTTGGCTCGTG
ACTGCGTGTTAAGCAGTGGAGGGATAGATAGGCAGTTGGGAATGTTGACT
TAGTGCTATGTTAAGTTGGGAGATAATAGAAGGATTACCCAAGCTTTTGC
AATTTGTTAGGGTACGTATCAGTGCCGTCCAGTGAGGTAGAATGAAAACA
AAGGGCGTACCCAGTGCCGAAAGCTCCCACACATTGTGGGGTCTGGGGAA
GGGAATTTTTAGGCAGCCTTTCCCTTGCTTTTTTATGCAAATAGGCTGAT
TTGAACATAGGTAGAATAAAAAAAAATCCAGTAGTTTTTACCTTTTCAGT
TCTTATTTACATTTTGAACCGCAAGAGTCAAGATAAATATGGTATCATTT
TGTGTCTGCATAAAGCTCTGTTTGACTGCTGCTTGTATAGTCACTCGAAT
GCTCTAAAGAAATAATTGTTTCTTTAGGATCACAAGGCGTCCGACACGTC
ATCTGAAGAGGCAAGACGTGGAAAAGATATTCAAGGAATACCATGGGTTC
GCCTGTCTACTACCAGAGAAAAATACAGGGAGAGAAGATTAGTCCAGTAC
AAAAACTATGAGAACATACCTGATTCTGCAGAGGCAGCAATGAAGGTATG
TCTTCTAGATTAGTTATGTTGTGTGGGAGAAAATATTCTTACATTGTGAT
TGGCACTTCCGCAAAACAGGTCTGCAAGTCCACTGAGAAAGGCGGAACAT
ATTATGAGTTCAGGCGAAATACTAGAAAAGTAAAATCAACTATCCTACAC
TTTCAGGTGAGTGCCTCTACGTCCTTGTGTCGAAAGTCACATATTACATC
GTGCTTTTATAAAGATGGCTTGCTATAGAAGCATTATTACCAGGGAAATA
GTTATGTTAAGGATTCAACTATCAGGACACCAGAAACTTTCTCCAAAGCT
GAATTTGTGTATTCTTTCAGTTGCAATGTTTTTCTAGTTTTATGGGAAGT
TGTAGTACTGTAAGAATATATTATACCTAACCTAACTACTGCAGCACTAC
ACAACAATCTCCCAGCAGCCAGAAATCAGATCTATAGTTGCCTCTGTAAT
TATCTGTTTATCTTTTAGATGGCTATCAAGAGGCTATCTATACACTTCCT
AGAGTCTAACACAGCCTGCTTTCTACTTCTCTTCAGTTCTCTATGATCAC
TTGTGATGTATGTGCAGTGTTTTGTCCCTCAGTTTAGCTCGTAAATGTGC
ATTTGTTTTTCTACCATACATATTTCTGTTAGAAATTGGAACTGGTCAGT
TCTGTTACTCTTTAGGGGCTTACTATATTCTAACAGATGTCAGAGGCCAG
GGAAGTGGGGCAGGGCCGCTCCTGAGATTTCTGGGGCCTGGGGCGAAACA
AGAATTTGGTGCCCTAGCAACGTCAAAATAGTAAAATATATTTTGATGTC
ATTAGCATGTACTTAAAATGCATAAAAAACGCCATATTGATATGAAATAG
TACAGATGTATTGTCTTCGAATTTTCTTCTAACATTTCTAGATGCAAAGT
CACTCACGATGGTATGCCGATGTACCCTAGAACCGCATCGTCATGGTTGT
CATGGGCAAAGTGTGGCCTTCTCTCGATGACTCGACTTCCCACCTCTCAG
CGTGGTTGTGTGGGAGTTGGCGATGGGTCATCTCTAGCTCATGTACAGGA
ACAATCGAATGGTCCGCACGTGACAATCAGCCATGGCCTTGCACTTTCGT
GCTTGTCAATGATAAAAGGAATCTACGCGTGATGGAAAAGAAAATGAGTC
GATTGTATGCGACATTTCCTATGTGAATATTTTGGCCATGGTCGAGCCTA
CCGGCCCCACTTCACTTTTGTAGGTTAATCGTCACCACTAAAGTAATTTC
CAAAAATAAGTTCACATGATCCCAACACCCCATGACGGATTAACTTGCCA
AAATGCCAAGTATGGCGATCTACGTGGGAGCTTCAAGCAAGCCTATGTCA
CTATGTGCTTCATTTGACGCTCGCTTCTCATTCCTGAATGTGATATCTTC
AAATTCTGCAATTCTCAAATCGATCTCGTTTTTTTTTTGTTGAGATTCTC
AAATCAATCTCGTGTGTGATGTGCATATAGGTCCCATTGACCTATACCAG
CGAATAGGCCCCAGCCCACTTAATCCTTTGATAGTAACTCAAGCTAACCA
AGGAAAAAGTAAAGGAGCCCAAGCCAAAGGAGAAAGGCCCATGTTCCACT
CCAATAGGAAAGAAGCATACCGCTTCGTAGTCGCTTCCATCGTACGAGAA
AACTCACAACCTTCTGCAATGGCGCCGCCACAGGAGTTCCGCCGCCGCCC
GCCGGTGCGTATACCTTAGCTATTTGGGAATCGGGCTCCCCTTGGTTCCC
GGCCCCCAGAGCGGCCGCCCCTCCCGCCTGCCTGAAGGGGGGACAGACCT
ACCAGTTATCTGCCACTGCATGGTAGCACTTGGTAGCCATCTTTATGGCC
ATGCTGGCCTCTGATTGTCGATATCTATTCGTTTATAAACAATTAATTGT
AGGGATACCTAGTGTATCTTAAGTTATTACTGTATTATTCTTAATATGCC
TATGATTGTATTTTCTATTCCATGATTGATTGGCTCTGAAAATAAATTAC
ACCGAGAACTAGAAATTGTAGACTCTGTTTGGCTTGGTTACATCAGTTTG
TTTGTCACCCTTATTAATTTGAGTAAAGTTCCCGAAGTAATGTAATGACC
TGTTCAAGGGATTGTCTGTTTTTAATTTTCTTCAGTTGGTCAAATAGAAT
ATGGAGGATGCTCAGTCTTGGTTGATCCTCCTTTATTTTTCTTCTGATGC
ATTGATTTTAAATAAGAAACTAATTGATTTAATTTATGTGCAGCTGAGAA
ATTTAGTATGGGCTACATCAAAGCATGATGTCTACCTAATATCACATTAC
TCGGTGCGACACTGGTCAGCCTTGAGTAGTGTGGACAGAGAAATTATGAA
TGTGGAAGGGCATGTTGCACCAAGTGAGGTTGGTCTCTATAGCTGCTAAA
TTTTCATGCTAGTTTACACTTCCATATGTACTCTACCTCTATTAATGATA
TTTCATTTAATTTATTGCAGAAACATGCAGGAAGTCTATTAGAAGGGTTT
TCTCAGACTCAAGTTAGTACAATGGCAGTCAAGGATAATTTGCTAGTAGC
TGGTGGTTTCCAAGGAGAGCTAATATGCAAAGTAAGGTCTTTGTATTACT
TTGATTTTGCACTCACCCTAAAACTTTTGGGTAGCACTTATAGCTTGAAA
AATGATTGGGAAAACCCAAACTTGTGGATTCCTGCATCTTGTCGCAACAA
TGAGCTCACCCTGGCCCACTCCAGAGTACTAGTGACCATCGCCTGTGTTT
CTCCTACCTCACCCACCCACTCGACAATCTCCCTAACCCACCGGCCCACC
TTTGATGTGGCCAATTGGCCATCGCTAGCACCTTTGTCACCTTAGAGCTT
CCGCATACCCGCCTCATGTTAACTTGCTTCACGATCTCGGCACCGACCTC
TCCCACATGTGCGTAATTCTTGCGAAGCTGAAGGCGCCCAACGCGAACCT
CTTTGTGCAATCTGAAGGTCTGCGTGACCCCTATTGCTGATCCAAGGGCT
TGCATTTTGTGCATATGAATTGTCCACAAACATTCATCTTTTATAAGTGT
CACTATCTTCTGCTAGTTTTATATCTGAACCCACTATATTAAGCTTAAGC
TTGTTACATGGCGAGAATTCCATTTCTCTTACAGTAACATGTCGGGGCTC
CATTGCCTTTCTTGTTTGCTACTGGGGATCTGCACATATGTGTCGTTAGC
TATTTTATTGCCTAGTTTGCAGTGCACCCCTTATTTAAGTTAATCGATTG
TGTGCAATTGCACATTCTGTGAAGTAACTATATATATTACATTTATTTTG
AACTTGGGTATGCTGAAATCTGTTTGTGATCACTTGATGCTGATATTTTG
CCGATGTTGATTTTGTTAATGTGTTGCAGAACCTCAACCAAGAAGGAATA
AGCTATTGCTGTAGGACAACATATGATGAGAATGCAATTACCAATGCAGT
GGAGATATTCAATACTTCTAGGTAAGTTTTAGGCTTGACTGTTAAAAGAT
TCACCTTGTAGAACATTCTTAAAAGATCAAGAAAACTAGCTGGGTTGTAG
CCAAAAGATTTTCCCTGGAACTTGTTTCATCAGAAATAGAATGCTGGGAA
ACCAGCTCATATTAACTGCTGCCAAAGTTTTTTTTAAGTGACAATAATAT
TAATGGTTTTCTGTGGTCCATAATTTTTTCAGTGGCGCTGTTCACTTCAT
CGCAGCTATTAATGACTCCGGTGTAAGAGAATATGATATGGAAAGATACC
AGTTATATAAGCATTTCCGCTTTGAATGGCCAGTGAATGTAAGTTCTGTT
CTGCATTGCTATTTACTCTTGTATTTCAGTACTTTTTCTAAAGCATCGCT
TCCCTATTATTTTTTTCTAACAATCCTCCCATCCTTTTTGTGTCTTCACA
AGTAATTTTCTAAACCAAACCTTGTATGATTTGTAAGCTAAATATTATGA
TGATGTTTTTTGAAATCATCATAGTAAATCATATTTATCATTCAATTTTG
TTTTCTGGTGTTGACAAGCCTATAAAACCATGGAAACATAATAATTGATG
GTAGCAAATTAACCCTGTGCTTCCATCCTTGTTCAGTGCATCCTTGTTAC
ATTTTGTTCCATGCTTTGTCAATATTTAAGGGACGTAGTCACATAGAGGT
GTTTGGTTTTTCTTGTTTTCGCGAGGTGCTGGACAGCTCCAGGAGGAGTT
CGAGACGAAGATCTTTTCGACCTGGCCCTCTCTCCTGCAAGCTGCACGCT
CAGCTGCCGAGAGCATGGAATCAATTTCTCTGGCTTTTGAACACCTTTGG
GTGGTCCCTCTCTGTAGAGTTCTAGTAACTTTGACAGTTGGTAGGTCGCT
CCAAACCATTAAAGATCGGATTAGGGACAAAAAGTACATGGTTTTAAAAC
TCGGGGTACTAATTTTACGTAGTAGTTCTCATCTCTAATCCTTGGTGCCG
AATGTGCTCCTTCCATTACTGTCTCTTCTTGCTCACCGCACCCTAAGGTC
CATGTCATAGCCTTGGCCCTGTATAAGATGGTGATTGACTCTGGAATTCA
TCTGTGTTATCCAGTTTCATGATCAACTGCTAAATCATTATTTCGTTTGG
CTCCTTGTTAATATTACTATTATCTGGATACTCTTGAATTTCTTGTGTTT
TAGCATTCAGCAAAGCAGTCGAATTTATTTAATTTTTGCAGTATAGTATC
AGTAACTGATTCTTCTATTTGTGCAGCACACATCTCTGAGCCCTGATGGA
AAGCTTATTGTTGTTGTCGGGGACGACCCAGATGGTTTGCTTATTGATGC
AAATTCAGGAAAGGTAAATCAACATGCATAGTTGTCAGGTGAAAGCATCT
TGTTGGTCTGTCCATGCATCTTAAGTTGATACTGAATGTTTTATATCTCG
ATGCAGACTATCAATTCTATGAAAGGCCACTTGGATTTCTCATTTGCATC
GGCTTGGAGCCCTGATGGCCGGACATTTGCCACCGGCAATCAAGACAGGA
CATGCCGGGTTTGGGACGTGAGAAACCTCTCGCAGTCCCTCCATGTCCTG
GGAAGTAACATCGGTGCTATAAGATCTATCCGCTTCACGTCTGATGGCCA
GTTTCTGGCAACGGCGGAGCCGGCAGACTTTGTTCACATCTTTGACGTAA
AAAGCAATTATAACAAGAGGCAAGAGCTGGATTTCTTTGGCGAGATATCT
GGTATGTCCTTCAGCCCCGACACGGACACGCTTTTTGTTGGTGTCTGGGA
TAGGACCTATGGCAGCCTACTTGAGTATGGCCGCCTCTATAATCGCTCAT
ACCTCGACGCTCTATGTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.