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GrainGenes Sequence Report: AA048944

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Sequence
AA048944
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA048944
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCCACACCTTTTTTTTTCTCCCCCTTCTTTCTTGCCTTTACGGACCGAA
ACCCTAACCCCCAAATCCATCACTCCCGCCTCCGTCCCCCTCCCATGGCG
ACAGCGGATGCCGATACTTCTGAGGTTGAGCGGCTCTACGAGCTTGGCGA
CCGCCTTTCTTCAGCCAAGGACAAGTCCCAGGTGAGCTTCTCTCCTTCTC
ACCCTAGGTCTCCGTCGGTCTAGGGTTTTGATGTTTTTTTTGTTTGGGGC
CTTGCAGCACGCAGCGGACTACGAGACCATCATAGCTTCGGTGAAGGGGC
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GACTTGACGACAGTTCTGCATGCAGTTTTTTTATGAACTTGCATATTGTC
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ATCTGGAAAAGAAAAAAAGTTAGGAGGTTGGAACGACTCGGCAGCAGGAT
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ACTGTGGATGGATCGGTCTGAATTGGGGACTTTGAGGATTTTGGTGGGCC
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AAGCACTCATGTCCCTTATACGTCAAGATGTTAAAAGTAAGTTTCCAGTC
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GGAAAAATATCAATAAATATAAATTAGTATTCAAATCTGTTTCGATTTTT
GTGAAGTTGATTTATGGGGTTTGGCTCAAGTTATATAAAATCTCTCCATC
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CTACATTCTCTTGACCTTCTCTTATTATATCCCAAGAGATATAGGTGTAG
AATTCACTTTCATGACTCCAAGATCCAGATATTTTCTTGTTCTAGATTGA
GTATTTTGAATTCAAGGCAGCGTGGAGCCTTGGACAACTTGCATGTGCAT
AAGGATTAGCGTCAGACATGCCATTTTGTATGCTGCTGGGTCACTTATAT
TCTTTTGTTGTGTTGGAGTCTAGGTTAGCATAGTAGTATTGTCCTAGGAG
AGTCTAGAGTATTCCAGTAAGTGTTGGAGTCTGAGTTAGTGTAGTAGTAC
TACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTTAGTATAGTAGTAAT
GTCCTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGTGTACGAGTGAAGATGTAAGGCT
AGATTGTGCTATATATAAGAGGGTGTGGAGGTCCAAGGGACTAAGCCCAT
CCAGAAAATTTCCCCCAAAACCAACATGGTATCAGAGCTAGGCTCCTCCT
CCTAACCCTAGCTACCACCGTTTCACCATTGCAACACCCATCCCGGCTCT
TGTTGTCAACAACACCGAGCACATTGTAGTCACCTAAGCGGCGGGAGGCC
GCATCCCGTTGCTCTCTACAGGCAGTAACCAGCTTATGTGTTGCTCTCAT
CACAATGTGTTGTGTGAGGCTTGGTTGCTGCTCTGTACGGAGGTTGCTTA
GTGAGCTAGTTAGAATGGTGCAATTGAGATGTTGATAGGAGGATGACAGG
TTAGCGAGGTTGGATTTGGGGACCAAGAGAAACTGGAGGTGGAGGAGGAC
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AGCTGTGTGGTGCTGGGTTGTGGTCATGGAAGGAGACAACTGGGTGAGGT
CTCCAGTTTGGTCGTTCTTGGCTGAGGGAAGAGGTGAGCTGCAAGGTCTG
GAAGCCTGAAGCAGAGGTACAACCATACAAGGGAGTGCTCCCTGCAGGTG
GTTGCTATGATGTTGCTGGACAAGATTCGGTTTCAGGAGGAAGGTGTTGC
TGCTGTGTTGCAGCAGAGAAAAGAGGAGTCCAGGAGGGGGCAGCTTCTGA
AGCTGGTGTGAGAAGGCGGCTGTGGATGGTGAGGCGGCTGTGGCTCTGTA
GGAGCTGTTGTTGAGGTGAGGCAGCCGTGGTTCCGCGGGAACCGGAGTTG
ATGAAGAGGCAATGACGATGCTCAAGCTAATGAGGGAAGGCGTGTGGTGC
CAGGGTTGTACGCGCCGGTGTGAGAAGGCGCATGAGTTGGAGAGGCAACA
ATGGACCAACGCAAGAAGGATTGGAGGTGTCTAGCTTGATGCAGAGTTGT
TGCATTGTGATGGTGATGGCTCGCACGAGGCGGAGCTTGGATGATCCGAG
TTGATTGGGTGCTTGACGACCGATGGAGCAAGAGCTAGAGTAAAATGCTC
TCATGTGTCTTTGTATGCTGGTAAGCTAGATGTGTAGTGGTCGTAGTAAG
TGTCATGAAGTTGTAGCAAGATGGTCATGGTGACTGACCCATGCCCATCT
TGAGGGGGAGTGTTGGAGTCTAGGTTAGCATAGTAGTATTGTCCTAGGAG
AGTCTAGAGTATTCCAGTAAGTGTTGGAGTCTGAGTTAGTGTAGTAGTAC
TACTCTTGTAGAGTCTAGAGTATTCTAGGGAGTGTTAGTATAGTAGTAAT
GTCCTACTAGAGTCTAGATCATTCCAGTGTACGAGTGAAGATGTAAGGCT
AGATTGTGCTATATATAAGAGGGTGTGGAGGTCCAAGGGACTAAGCCCAT
CCAGAAAATTTCCCCCAAAACCAACATGTTGTCTAAAGCAGCTAAATTCC
TTGCAGTACTCAATGGTAGCATTTCCAAATAAATGACATGTCAGGTTTTT
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TCTAAATAGCTCTTGGCATGTGTTTTCCGTTTAGTAATACTCTCTCCATT
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TTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAACCCACATGAACCTAGACACTAAAAAG
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TTATTGTAATGGTGCTTTATTTTGGCTCTTAAAAATCTGAGTGTTCTGTT
CAATAAATGTTACTATTAATAGCGTGTAAAAGTGTGTTTTGCCCAACTTG
TGATCACTTTGTTCTGAAAAAAAGTTGTAAATCTAATTTTTGCTCATAAT
ACTCCAATTTTCTGAAAATATCCCTTCTGTATTACACTTTACATCGTTGA
CCTCTTTGGGTCTTCACCTTCATTGCCGGTGCTACTGTGTTAGTCAGAAT
TCTGCTAGCTTCTATTGAAAAAGCATAAAGGTAGTAAACACTCAACTATT
TCACATTTCTCATTTCCTTTGAAAAAACACAAAGATAAATACACATGTTC
ATCTTTTTTTGGGGTGAACCAGCAACATGTTCCCATCAGTAATTCTAGTA
AGAGTAACCTTGGGATGATACAGGGAGTTAAACTCTAGAAGTAATGTTCC
AGAATGATTCTTGAACTTGTGTCTAAAGGCTCGTTTTTTTGGCCATCATT
CTTTTGAGTTACTAACAAGATCGCCCCTCCCTACTGCGAGGGCTTCTATT
GTCTTTTGACCACATTTCGTGCAAAGAGTGTAACGCCATGTAAATTGGAA
CGTACAGAATATAGATTAACATGTATGCTGCTAACTTCATCAAGTATTTA
TTGTTGCTTTTATCTTCTTCTGTCCAGATTCCTTGCAGCCCTTGTTTAAG
CATGTGGAGTCAGGATCAGAGATCCGTGAAAAGATCATCTGTTTCCTCCG
AGACAAGGTAAGTAATTACATACATAGATTGCATGATCTCTGGGTTATCA
ACTTTATTTCCTGATTACTAATATTTGATTTTTTTTCAGGTTTTTCCTGT
CAAAGCAGAGCTTCTAAGACCTCAAGCTGAAATGGAAAGATATATAACAG
ATTTGATAAAGAAAGTATGTAGTGGTGCTTTCTTGTTTTTTGTTATTTAG
TTTCCATAAACTTTTCTGCGATACACTTAAACAAAAAAGCTAAAATTCAG
AGTGTACACGATGTTACTGGGTTGGAATTTAAACTATTCATGGATTTCCT
GCGGAGTTTGAGCATATTTGGAGATTCTGCCCCTCGAGAATCATTTCAAG
AACTAATTGAAATCATTCAAGCACAAGCTGATCTTGATGCACAATTCGAT
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TAAAATACCAGAATGTTTCTTACTCAGTCAATAAAAAAAGATTTGGGAGT
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AAGGATAAATGGTATGGCTAATTGTTGTCTACAGCATTATACCTTGGTGG
ATAAGGTGATTTTTTTGCAATCATCGATTAAAGTTGCATTGGTTGGTGGC
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GCCAGTATTGGGACACATGACGATTTAAAGGAAAATGTCATTGCCAGGAA
CAGCCAATTCCTTGCTGCTTTCGTCTTATTGTGCATATTGGATAGAACTA
GGTACAGAAGAATATCAAAATAGAGAAGTTTGTGGCCGGCAGGGAGGGAG
CTGCCATTGCATAGAAATTTATAGGAGAGTGAGGAGGAGGGGGAAGAGAA
GAGGAAGCACCGGAGTACACCTTAATGCTTCTGGAGCCTGAGGACGCTTG
AAGCTTGCTGCTGGAGCTAGAGAGAGGGGGAGGAAGCCAGGAGCACACTG
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GTTTTGTAGTGTGGATGTTATAAAGTTACATAAGACAGCATGCTTAGGGC
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TTACTGAAATGTATATTGTATTGGCTGGTTATGAGCTGATCCGAGACAAA
AGCACCTTTCTTAGAGCATCACTAGCAGGGCCCCTAAAAGGGCAACCCGT
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TTCCATGCGCCCGCTGTACCGACCCGTAAAACAGGGTTTTGGACAAAATT
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GCTTCGGCTTCGGCGCCGGGGTAGGGACGGTGACAGGGTTCACCGCCGGG
ACAACACTGGTGCCCGCCGTAGGTTGGGGAACCAAGTGCGAGTCGGCGCG
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CTACGGCGGCTCGGGGGCAGGAATGGGGAAGCGCTGAAATTTCCTCCCGC
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TAGGTCACATGTTATTAGTGAAGATAAAATCATTTTTGATGTTCTTTTCT
TTGTGTTTGCCTGATCTGCAGAGAGGCGCGTCAAGCAGCAAGTTTCTTAA
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TTTTGTACCTTGCATGCTTTGCTTCATGGTGCAACATATTTAATTGTTGG
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CCATCTGTTGTTCAATTGCTCAAGGTTTACGCATTTCTTGTTTCTGATGT
GTTTCTAAGCCCAACTTGGTGTTATTTTGGTCTACTGGAATATGTGGATG
ATTTTATCTCAGTTACCGTGAATATAGAATCAAAGTATCTAAGTTGATCT
TACGATTGTTGTTTTTCAGAAGTATATGCCCGGGAAGAAGGTAGATGATA
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GCTATGAGAGTAGAAGTCTTCAAATTGGATATGCTGCTGTTGTTCTGGTG
TAGTCCAATTTATAGCCTGAATAAATTCGAGTACTTGGAATGTTTTATCT
GATTTTGGTTCCTTGTAAGAGATACACTATATTAGGTTATTAGTTTGAGA
GAGCTAGTCATCCGTGAGTATAATCCTTAGGGCTAGGGTGGATCATTCAC
ATGATTTAGACATCACTATGTGTGTGAATGTAAGAAGAATCAGAATTGTG
AATGATTGAAAAGTGGGGTACGCACACGATTGGGTGACATGATACCCTAG
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TATGTGTGACATTGTTAACTTGCACAAATCTGTTGATGTTGGATGGAGCA
TGTGGCAATACATTTCAGGCACATATGAAATGCCTTTTTGTGAAACATGA
TTTCTATTATGTTGGCGTGTTTCTGATTGTTACAAATGCACAGGTTAACC
GGGACAGAAGAGACGGTTCGAGCAGCCTCGAAGAGGCTAACCCAGGGAAT
GGCAGATTTCAGCAAGGCATTATCTTCAGCGAAGACGGCAGAAGAGAAAT
CTAAAATTGTGAGTTTTAGATAAGATGCTCGGGTTTACTGGCTCCATTTC
ATGTAATCGTTCTGTAGTCTATGCAATGCTGAACTACCGTTATTACTGCA
TCATAATATTTCTTCGGTAACCTTCTACTGTCATAATCTGCAAGTTTGGT
CCTAGCCAGTTTAATGGCAAACAGATTGTTCACATCTGTTCATCGCAGTT
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AAATCAACAGTGACAATGCGGTCCTATAATAACATATTGGCAATGTCACA
GGTGATTTATTTGTTTTACGCATGAAGAACTTTTGCAGGATTGCAATTTG
ACTTCCTATTCTTATTAGTTCCTTGTTATCCTGCATCACAAACTCTGCTT
GCTGTTGCTGGTGGCCTGCAGACATGCCATTTTCTGGCCCATGTCCACAA
TAACATCAGTTAGCTGCAATCGTGTTTTTATTGAGCATGCTTTGACACCC
TTTGTTGACTTATTGTGGTGTAGTAGATACAACTTTAATGTACGGACCAG
TACTAACTGTTATAATGCAAGGCTAAAATCTGAGGTGTAGGTTATAAACA
TAGCATGTTTAACTTCATTCAAAGCAAATATCATTTGGTAAAAAAGACCC
AGAATAAAAAGACAAATGGTATTAGCCCAACGTGGCACCATATACTCACA
TAATTGTTACTTCCTCCGATTCATATCACTTGTCACTAAAATGGATGTAT
CTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACATCCATTTCAATGACAAGTAATATG
GATCGGAGGGAGTACCTCAAGATTGAAGAGACCATGACAGCCAAACAACG
ACACCATTGTATTTTATTTTGTATTGAAATGCACAAGCAAATATTGTTTT
TTGTCTAAATCCCTTAGACATAAAAACCTTTGTCCACCCGCCAAACACTA
AATAAGCTTAAGGTGGCATAGTAGCTTATTCAAGCTTCAAACTATCAGCT
ATGTTATCTAACTCTGTTTGAGGTGTAAAAAGCAAAATCACAGAACTGCA
ACTAGCTTCTGAAGTCTTGCTATATGAAGTCACGAACCATATTGCTCTCG
TATACTGTCGAAGACTTGTCGATGTGCTTCAGAAGAAACTAATGTGACAT
ATTATTCACTCGAGGTCTACGTTTCCAACTGTAAGTGACATATTATTGTT
TGTTTCAGCCATTGCAAGTGAAATCTCCTTTATTCATTGGTGATAAGAAA
ATTACTCTCTCATGGATGGAACTGCCAAAGAAACCAGCAGCTACAACAGC
AGGGTTAGTTTCAGTTCACCATCAAAATGTTTGATTTGTTAACATTTATT
TGTTTCTCTTTAGACAATTTATTTGCTGATCTTTTAGAGGGAAGAGGACC
CAACCTCCTTCCAATGGGATTGCCCCTGTAAGTAAGAAGGGGCGAGGAGA
GGGAGGAGTGCATAATAATCAGCTTGTGAACAGAGCTTTTGAAGCATTAT
CACGTGGTGGTGGTGGTAGAGGCAGTGGAAGGGGGCGGGGCAGAGGAGGG
CGGGGTAGAGGGTGGGGCTACCGCTGAGATCAGTCAGAAGTCTATATAGT
TATTCCAAGGGAGAAGAGATCAGATTTATGCTTCCATTCGAGAGGAGACA
TTCAAGAGGAGACTTGCTTATTTGGGTTTTCCGTGCTTCACTAGAGTTAA
GCTTTTCTGTATTCAGCAAGGTGCACAAATGCACAAGAAAGCTCGAAAGC
TCATACCAAGGATGTTTTCTGTATCTATTTAGCTTTCAGACCGTTTGTTG
GTTGGCTGAATTTTTTTTGAAGTAGATTATTTGGTTGTTTTGGTGGTCTG
AATAGCACATTTAGTTCTAGAATTTGTCAAGAGTATTTAATTTATCTGAG
ATTGTAGAGGTTCATCCTTTGTTTACACCCATCCTCTAAATCCGTTGGGT
ATCTACTATTTCCTCTGTTTCACAAAATAAGCCTTTTTAACAAACCGTTT
TAGTTTGACAAAAAGGCTTATATTATGGAACAAAGGTAGTAGTTTTTAAC
TAGATTGAAATGTAAGCGCAAGTTGAACTGGGTGGTGAGCTGTCCAACGA
CTATTCATTTGAGCTAAATACATTCTAAAATTGGTTCCTAATACTATATC
CACAGTAAGACATTTTTGAAAATTTTGTGGAAGAGCAAAGTTGTATAAGA
GCCAAACCCAGCCGTGACTAAATCCAGCCGTGAATCTCTGAAAACTGCTT
GTACCTCTCGAGCACCAGTCCTCTCGGTATTTTAAAATTCTCAAATATTG
ACTCCTTGCGTGCAAAATAATTGGAAAAATATACTACGCTGGGGGATCAC
ACAAATTGATCTCGGTATTTTAAAATTTTCAAATACTGACTTCTTGTGTG
CAAAATAATTGGAAAAGGATACTACTCTCCTCGGGGATCGATCCCCCGGG
TACCTTCGCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.