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GrainGenes Sequence Report: AA039044

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Sequence
AA039044
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039044
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACAAGTTACCATCCAGAGACAGATCGTGCGTGCCAGGCTGCCTGTGCG
CCCCTCCACCTCCAGCTCCAAATCTCCTCTCCTCTCTCCCAAGTCACAAC
TCGAAGACTCCGTCGACGCCGGCTGCCCCGCCACGCTCAGCTCACCTCAG
CTCAGGCCGCCGCGCTCGGTCGATCGCCTACCCGTCGCCGCGCCAATCTA
GGGGGCAGAGCAGCCCGCCCGACCGACCAGTCCCGAGGTACGCCGGCCGG
ATCCCACCCCGAACCTTAGCTCAGCTGTGCTTGGATCAGTTGGGGGTTCC
GAGTTTCCGACGAGTTGGAACTGGACCTGGCCGCGCGGATGCCGCGCTGC
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TGCAGTTGGGTCATACTTTCTGGTGATCACCGACCGCGATTGTGTGGGAT
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AATTGGCTTTGTATCTCTGCCTCTGATATTCCAGTTCACAGAAGCTATGT
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TCAGATGAATGAACATTATTCTTTTCAGGCAGAACCGAGATTTCTATGGA
ATAGCTACTTGCTGGAACCTCTAATTGAGAACAAAGTAGGAACAATTTTA
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TTTTCCTTCAATTAATGTTACTGATATACATTTTAATATTGGTAAACTTT
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TTTCAGCCACGTGTACTTGAGAGGCACTTTAATGACTTAAAAAAGAAATA
TGGAGCTGTCTTGGCTGTTGATCTTGTCAACACAGTAAGTACTGTGCTCT
TAGACTTCTAACTCAATTTAGTGTTCTGTCCAAACTAAGAGTTATTTGCT
TCAGAAAATAGTATAACATCTGTGTTCTGCTCCCTTTTGAGCTGTCTGTT
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TTTCCATGTAATGTTCATCCTGTACCTTTCTTGATTCCTACTATATGGCT
ATATTCAGAATGGTGGTGAAGGGCGACTCCGTGAAAGATATGCAAAATCC
ATTGAACCTATTCTCAATGATGATTTAAGGTAATACTTTCTTCCGCTGTT
TGTACCCACTGTGGATTTGTCATATCACGTGATACTAGCAAAGTGTGTAT
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TACATTCTTTGGTTGCATATTTTCACTTCCTTTTTTGTGATCAGGGCAAT
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CTCTTTGAGATCTTCCAAGATTGTGCAACTTATATTCAAGGCCAGGATCA
TTTATGCGCTACTAGTTTTGTCTGTCTATCTTACTGTAGCTGCTAATCAG
TTCAGGACGCCTGCTACTAAAATAATGTAATCTGTTTGTGGTGCTTGATT
CTTAGTTTTACAATATAAAAAGCGCTACCATCATATACCCACAATCATGT
GCTCTTCTTAGCAAACAATGATTCTCTTTCTACTGAACTTCTAAGCTTTG
AGTAATTGTTGGAGCCTTGTCTTGTATAGCTGTTCGAGATTTCTGTCTTA
AGGAAAAAAGGAAAAGAAAAATCTGATAGTTTTTGTACTCCCTCCGACCC
ATATTAGTTGACTTGGGATTTGTCTAGATTCGGATGCATCTAGACATGTT
TTAGTGCTAGATACATCCGAATCTATACAAATCCAAGTCAACTAATATGG
GTCGGAGGGAGTACTATATTTTCCCTCATGATTAAGTTTTAGAGACTCTT
ATATGTCTGGATGTTATTGCTGATAATGTTGTGGTAAAGGTACCTCCTAC
TGAATGAGAAAGGCGAGAAAATTCAGGAGCAGGATGGCACTGTCAGAACA
AATTGTATCGACTGTTTAGATCGTACCAATGTCACTCAGGTACATGGTTC
TAACATCCAAGTACAGATTTATGTCTATCATATGGATCTCAAGTTTAACA
AAAAATTGATATCCAATAACAATTACCAGTTAATTTTTTTCATTTGTCAT
GACTCCTGCATTACAGACACATGGGCTTTAGTTTATCGAACCACTGTTTC
ATAATATAAAACGTTTTAGGTAGGCTAAATTAGCCTATCTAAAATGTCTT
ATATTCTAAAACAGAGGTAGTAGTTTCCAATGTGTAGGATCAGAGATGAT
GACAGGAGGGGGTAGTAGTGTGACCGTGTGGATGGGAGACCTTTTAAAAC
CTTCTAGCCAAAACCGGGTGTTGTGAAGAACTGACGAGAATTAATTTTGG
GCAATTCAATTCCCAAATGTCTAGCATATTAGCTAAGTGCATGGTGCGCC
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ATTCCTTCCTAGGCTTACAAGCAAGCAATGAAATTATAGAACACCCCATT
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TCCGGCATTTGGGTGGTTATGGAATCATAGCGTGGAATCTTGTCTGATTT
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CCCGATTGACCCGTGATACAAAGCTTCTTCTCTGGACTCCCAGTTGACTG
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AGCCGGCCAGCACCAAGAAAGGAGCGCCATAGCGAGCGGCTGTGAAAGGT
CTCTGCGCCTCTGTTTCTCTGCTTCCTCCCGCTACCGCCATGCCTGCAGC
AACCCGACGCCCCGCATGCCTCTGGCGACGTCTCTGGCAACGGTGACGCG
GGGGCAGGCCGACTCCTTCACTGACCTCCACTCCCAGCCCAGATCGATGA
GATCCAGAGGCAGACCGTCGCGATGAGTACGAGCTCCGGCCATGTTTCCT
CAGGAACGCCCTGTTGCGATTACACCACAGATTTACATCTGATAGAATGC
TAGAACTCAGTGCCTCTGCTGATAGAACATGAAGCATCATCAGGAAAGCT
TTGAAGTACCAGAGATCACTTGCACGTTGCATGCTTGTGAGGGAAGTGGT
GCAAATTCATGGGCCGTAAATCAGGAAGCAAGAATTAAGTGTCGACGTGT
CGCAACTTGTCGCTGGGGTGGCGACACATTGACTTGTCGTGACAAGTCTC
GACAACTACTAGACTTGTCGATGGGGTGTCAAGCTGTAGCTACTAAAAAA
AATAGTAAGTAACTAGTCTACTCCAAAGTCTTGATCTTTATCCTCTGTCA
TCATTGCCATCATCATCGCTCTCCATGTCACTGTCATTCATTTCTTCTTC
CAGTTCAACCCTCAATTCTGGATCATTGACAATCAGATTTCTAGGGCCCC
TTCCATCAGATTTCTAGGTCTCCTTCCATCAGATTTCAGCCCTCAATAGG
GAGAAAAGTTACCTGCTTCTCCTAATAATTGTTGTACCTCACAAGTCACA
TTAATTTGCTTATCGGAAGTGTCTCTACTCTGGACTACCAAGGCGTTATA
AATATAAGGTAACTTGCCTGGGGGGAAAAGTGACATCCAGCACGGGTCCA
ATAATTTGATCGATACGACCTGCACCCGACGATGGACTGGTGGTGGTGTA
GCCTTGGGAGGTGCTCATGACCCAGGTAGGGAGTGGGAGAGCAGGGGAGA
GGCGGCGGCGGCGGCACCGGCGAGCCGGCGGCGGCCATATGAGAGAAATC
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AAAATTCCTGGCCTCAACTTGTCGCTCGACTAGTTGACAGAGACAAGTCG
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CGGCATCTACTCAGCAAAATCCTGCTACCTTGCCTAGTTCCAGGGATCCA
CAAGCTGCCATGCCTGGAAGCTTATTTGGAAAACTTGAGCACCCCCACGT
GTCAAGTTTTTTCATTGGCTCGCCAACAAAGACAGGTGCTGGACTGCCGA
GAGACTACGGCGACACGGCCTAGATCATCACCCACGTTGCTTGTTCTGCG
ACCAAGAGCCGGAATCTATGCATCACCTGCTCCTGGCCTGCCCCTTCTCG
CGGCAGGTCTGGCATGACATTTTGGCCTGGCTGCGCATCCCCTGTAGGCC
ACCCGAGCTCGAGCCATCTATATGTGATTGGTGGACTGCTGCTGCCCACG
TAACACCCAAACAGATGCGAAAAGGCTTGGCCTCCGCGGCACTCCTGATC
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GGGCTAGAGCTGGTGCAGCCGGCCTGCGCGCCATCATCACTACAGATTGG
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TTGCGTTTTCCCGGAAAAAAAAAGTCAACTTGTCGATCGATAAGTTCAAG
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ATTCTCCTAAGTAGCCTTGGAGATGAGAAATATTAATAATAGCAAACGAT
ATTTCTCATCTCCAAGGCTACGTAGTTGTTAGAAAATCACTCCCTTATCC
CTGCCCGTTTGGTGGTCACGCTGGTTGGCTCAGGGATACCTACCTAGCCA
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AGAGAAAAGAGGAGTCCAGGAGGGGGCAGCTGCTGAAGCTGGTGTGAGAA
GGCGGCTGTGGATGGTGATGTTGATGGTGAGGCGGCTGTGGCTCTGTAGG
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AATGCGAGAAGGATTGGAGGTGGCCAGCTTGATGCAAAGTTTGTGGATGG
TGATGTTGATGGTGAGGCGGCTGTGGCTCTGTAGGAGCTGTTGTTGAGGT
GAGGCAGCCGTGGTTCCGCGGGAACCGGAGTTGATGAAGAGGCAATGACG
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ATCATTCCAGTGTACAAGTGAAGATGTAAGGCTAGATTGTGCTATATATA
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CCCCAAAAAAACCCCAAAAAAACCAACAGTATGTGTTTCTATGTATCAAC
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ATGCAATAAGCATTCAGTACTCCGGAACTCCTGCATTGAAGGGAGATTTT
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TACAATACAAGCCTTGTTTGAGAAAAAGATACTCTTTACTCGTCCATGGT
GCAAACCCTCCATCCTTGTTGGATAAGAATACCCTTTGGATAGTGTTTCT
TTGTTAGCGTCAATACCTATTAATGAAAAAGGTCTTTGTTAGCGTCAATA
CTTCTTAATGAAAAAGGTCCCAAGATAAAACACTAAGAGATTTGCGTGAG
GCTGGTTAATTGATATGCTTCCGTTGTTGAAACTATCTTAAATTATGGCT
GCTAAATTTATGCTCATTTTTATTGTCTATTTGGATACTTGCGAAGAACA
GTGGTGATGATATATCATGTTCTCTATAATTTACATTATCTTTTTTGTCT
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ACCATTGGCACTCTTTTGATTCATGATCTTGATGGTGCCCCTAACATCAA
ATCTCAGTAGTACCTTCACCATTGGCACTCTTTTGATTCATGATCTTGAT
GGGGCCCCTAACATCAAATCTCAGTAGTACCTTTGTAACATTTAACTTCC
ATTTTATATGCTTGAATAGTAGGATTGTATATCTCGATGTGGGGGTGAAA
CCTTTTCGATAAAGGGCGCTTTTATTAGACTTCAATGTTTACATCAACGT
GATACAGTCAAAGAGAGCCACACCCAACCTCTGCATAGCTAGGATGCCGG
GGGGGGGGGGGGGACCTGAGAGCGCTGAAATTATTTATGAGAAGTGGCAA
CTTGCATGGTGTTATCGAGTGGTGAAGATTTTGCACCAGTGCTAGATGAA
CTGATGACATGGCGTGTAGTTTGCCAGACACGTGGAAAATGTATTAAAAA
TGAACTGACATGTTTGAAGAATGCCTTGCTGACCAAAAGGAGCATCCTCA
ATAAAGAAAATTCTTTTCGCTGTAGTTTCCAAAATCTAACAGACCTCATC
CAGGAAACATTGATTGAACTCTCTTCCAACAGAAAAAACGAACTAGAGTG
CTGCCACGCGGGTGTCTCATTTTGTTTACTTGTTGTCTTGTATAGGATGC
AATGGATCTTCTTCAAGGACGTTACATCACATCTGTTAGTCGGGACATGG
CAGCTCCTACCAAAGCAGGATATCTAGAGAGTTATGCGGTGGGTACAATT
TTGCTATAGCTTGCTGTTACAATTCTGAACTTGTTACTGGAAAAGTGGAA
ATGCCTATTTAGTATTCTAGTATTGGTCAGCTCTGGAATATTCATGCATT
TACCTGATATGCACGTGGGCTTGTTGGTGTGTTGCTACTATGGCACACAT
GAATGCAGACACTTGGTACTCACTTTTATATATCGTTATGTATATGGGAG
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TCTCACTTGTGTGATTCCCCTTTTACAGTCTGTCCGTATTGCTTTTGCGC
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AATCATGTCAATTAGCGCTCTCTAAGATTTGCCTGCATGCTGTTAACCAG
CAAATTTTGGTGTCTGTTTTTGTATCTACTCTCCAATGTTTACTTAAGAG
AACTTTTCTGGGGGTGCAACCACACACACAAGGTTTTCCCATAAAATTTC
CAAAGTAGGGAACAAAAAGTCAAAAACCATATACTACATCTTAGCACTAG
TCTTGGTCCCTTCAGGCTTGTTTGTTCACAATGTGGCTTCTCGATTTGCT
ACCTTGGTACTATTCTGTTTGCGCTGCGTAAACATGAGTGTGTTTAGGTT
TTGGTCACAATCGTCCTAAATCCGGTTTGGACAAGTTTCTGTTAGTTATT
TTCATGTTTCGGCAGATCAATAGAAGAATTGTGTTATTACTTCAAAATGT
ATGACCGGCGGGTTCAACTGCCCCACCTGTAAAGATTTTTTTCTCTGGAG
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TAGTGAAGAAAATGCAGACCCATAATACGTAAAATCTAGATTGATGCATG
TGCCAACTGTGTATCAAAATATCGACAGCTCCAACAGATGCTACTGCATT
CATTATATTCCCTATCTTACCTAGTATTTCAGTTTGTAAGTTGTAACTCG
ATTCTCCTGGTTGATTTGAACAAAAATATCTCTTATTCATGGAGAACTGC
ATATACATATAAGTAACAACTCTACTGCAATCTCTTTGCAGCTCGAAATG
ATGCTCGCCATTTATTGCTGTCACTTCTGTGGGCTGGTCTTTGTATTGGC
ATCACACACTTTGTCAGAGCCAATGGCCGCGTGTTCACAAACCGACCTCG
TTTTCACAAGTCACGGGATTGACGGAAGCAAAGAAAACCATTTTGGGTGC
CAAGTATGCTGGCTGACAGATTATTATTCATCAAAAAATGACAGGGCTTT
TTGTGTATGAAGTATCTAATTACCACCCATTCTCGTGAAGGCTCGTATAT
TCTTTATTCCTTGATGTTCATAATGGATTGTTGATCAGTAAGCAGCTGTT
CATAGTTGCCACAAATTACTTTGAATATCGGTAGACGAGCTGATATTTGC
AACTTCTCTTGTTATGCTGAAGTTGGAAAATGATGTTATTCTAGAGGGTC
TGCGCTTCTGCAGTTATGCAGACCGAGATCTCCATTATGTAGGCATTGGT
TAGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.