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GrainGenes Sequence Report: AA035109

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Sequence
AA035109
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035109
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAACAACCCGCGGCAACAGCAGAGCCCAATCCCCCGCGCCGATCACATGG
CCTAACCCAAAGCTTCCGTGTCGGGTGCGTCTCTCGTCTCACCACGAGCC
GGACGGAGCGACGAGGAGAGGAGAGAGAATTCATCCCCAAAACCCCAATC
CTCGCAGCCACCACCCCGGCGACGCAACCACCTTCCACCGCCACCTTCCC
CGCCTTTGCTGCCGCCGGAGTCTCGCTTCCCCTCCCCCCGCAGCGCCCGG
GTTCGCCGCTCCTCCAGGTTGCTCCCGTTCTCCCCTCAGAGATTTCCCTC
CCCCTCTCTCCTCGTAACCTCGTTCCTCATCACCGGTCGCGCTCGAGGAT
GCTCGATGCGGCGCGAACCTCCTGCTCCTGCGTTCGCTGCTAGGGAAAGG
CTCGGGGATGGTCCGTGTAGCTCTGGCGTCTTACTATTTCTAGCTCCCAT
CCCATGCCTTTGATGCCTTCGTCGTGGTGAAAATTAGGTTGTGCCGGCAT
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GTCAGGCAGGATGAGCAGCAGAGCACAAGGTGAGAAGGGTTCCGAGCGAG
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GAGAGGCCGGCCTGCTGAAAGCAAAGATGGAAACCATGGTGAAATCAGAG
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AGATGGAACGGTGAACCCGTTCACAATGATAGAATCAAGGAGAGGAGTGA
CATGCTCCGGAATGAGGGAAAGAGAAAAATTCGTGGTTTTGATGATCAAA
GGAGGCCGGATGTTGATCTACCGGCGCTGAAGAAACATGATTCTGCACGA
TTCCAAGTTTCCAGACACTATGACAGAACTGATGGGAGGAGAGAGTATGG
AAAAGCATACGTTGAAGATCCCAGACCAAAAAGGAGAAGGTCAAGAAGCA
GGGAACATGATCAAGGAAGACGTGACAGATCTTTCTCGCTATCCCCAAGG
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AAGGAAGTATGCTGAAAACGACAGACATAGAACATCCGGGAATGGTGGAC
ACGGTGGTGGGTCTTACCAGAGATACGAAAGTCCGCTTGGTGGCTACTCG
CCAAGGAAAAGGAAAACAGTGCTACAAGATGAACAAGTGAGCACCAAGAT
TACTCCTCCAGCTGTTCGATCCCCAGAAAAGAAACCAGCCACGTGGGATC
AGGCTCCTGCAGGAGCAGACCAATCTGATTTCTTCACCACTTTGCAGCCA
ATTGTTAGCCAAACCTCTTCTGTTTCAGTCAGTTTTAGCACACCAAAGCC
GAACCCTGCCAGTAAGCTTGTGACTATATTGTCAGGGAATAGTTCCTCTA
TTGATTCTGTCCAGCTAACACAATCAACGAGGCCACTTAGGAGGTTGCAT
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AACCATGCCTCAGTTGTACGGTGAGTCTACCACTACAACCTCACCTCTTG
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CCTATGTTCCTTCAATGCAGATAAACAAGGAAAAACGCCAGGCATTTGTT
GAATTTCTTACACCAGAGGATGCTACAGCTGCTCTTTCTTTTGATGGAAG
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GGTTTTACCTTTTCATCAGTTTCATTTTTTCCTTCTGATTTTGGAACTTA
TCAGTTCAGAGAATTACAACTTGACAAGGCATTTGCCACTTCTGTTCTAT
ATTAGCGTTCTGTTTATCTTTTTCCTGTAAAAATACTGTATTGTGGGCTG
AAGGAACATCTTAGTATTATACAATTATCAGTATATAATCACCCTTCATA
CTGGGCCATGTGGTGCTGTAATTGCACGACTACGAATCTGGCGATGTACT
GTAAAACATGCTGAACACATTTTTAGGATAGAAGATATCATTTTTTGACA
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CGTATTGGCCAGATACCGATACGCGTATCCGTATTGGCCAGATACCGATA
CATGTATCTGTATCGGTGCCATGTAGGTTGTTGTTCCACTGTTTTTCTTT
ATTTTTTCTGTTTGTGTTGCAGACCTATCCAGCTCCTCATGTAAATGATT
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AGCCTGACTTATTTTATCATCAATATTTCATTATTTCTAAGAACGCTGAA
CTTCTTCTAGGTTATATTTAATTAATGCGATGCCTAATTCCTTCAATTTG
CATTTTAATAGTATTTCAGATGCTTTCTGCATATATGGAATTTATTTTGC
AGCTAAATGACTTGCCTCAACTTGCACATGTTCTTTCCATTTTATGCTTG
GATACTGTTTTTAATGGCTAAGCACTATCACTTAAACCGTCTCTCTTGCA
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GAAAAACTACATCATGCTTACATACGTTATAGTTGCTCTTTGCTTTTTAA
ACATGGTAGTACCTTGTCCATAACTTGTGTAGTATATCTAGGTAGTATGC
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TTTTCATTAGCGTGTTTTCTTGTATCTTTTGCATTCAAACTAGATGAGAG
CAGTTATTTCAGATTTACTCATGTTTGATTAATATGATTATAGCTGCTGT
TTTGGATTTACTCGTGACATATATTTGTATCCTTCGAGAAGTTTTTGTCT
GACGGGCATGTTGGAATCTCTTAAATAGGGTATTTTAATTGGGTGTGTCA
TAATTCACGTTCAGGATCGTGAAGCAAAGGAATTGTAAAGCAGGCTCCCA
GATATAGTTCCTGTATTATGTGACTGCTGGTTCTTCCAAAATCCATTGGT
TGCTGACTACAGTGCTGGCAGAGTGCTTATGGTGGCCAGTTCACAGAAAA
ATAGGAAGACAGTTTGTACAACATCCATTTACGATCTTAATTCATGACAG
TATGAATGCATTGTGGTAGTATGCGCTGTCAATTTTTGAACTACTATCCA
TATAGTTTAATGTGACATTTAAACGTTGGCTTTACTTTCCTCCTGTCCAC
CATATCATGTTCCTGCTCAGTATATTTCATCCACTAGATGACATATTTAG
CCCATCTACTTTGTCTTGGGATTTAATTTGGAATCTTTACTCTCGAGAGG
ACCTGCTAAGTCTCTGTTTATAAAACTGATACAGTTGCTTGTTCTCATAA
TCACAACTGAGAAGTTACATGGCAAACCTGCAACTGAGAGGTGGAAGTGG
TGGGATTATTTATAGGCTTCCATGCAGGTGCAATTTGGCTTTGGCAGTAA
AGAAGGATCTGTCCTAAATTACAGGGATTAAGGTGTCTAGGTGGTCGTTG
GCCTTTTCATTTCTCCTTGATGTCTCTGCTCCTCACCAATATATAAGGCT
TGTCCAACTCTTACAGTGCAAGAAGGGCAGATACAAAAAGAAAACTCCAA
TTTATCTTACATGACATGTAAGCAAGAAGAGCAAGGAAACTAATAAATCC
AGAATATAACTCAACTTCAAGGTTTGAGCACTTGGAAGCATAGGTCGAAT
CACCAACCGATTCTCTCAAGAACTTGACCAACATACTTTAGAGCTTTTCC
TACTCTGCCGCTTAGGGTCACCTTAATTGCAATGATTGGTTGCTCGCGCA
CGGTCTTTCTCCAAGTTAAATTTCGAGGGGCCAAGGAGTCAGCCCAAAGG
TTTTATGGCTAGATGGCAATCGATATGGATTTTTGCCTGTTGAACAGAGT
TGGTTGATTGCAAAACCATATCAGCATTCGTCAAAGCCAGCATGACTCCA
ACTGGAGATACAACATGCAACCATGTGAATAGCCCACACCATCTTTCCCT
CTTAGAATGTGAATTGATGTCTAATAGAAGTGCCAAACATATCCAAGTTA
ATAAGTAACCGATCTATTTGGCCTATGTGAAAATATGGGGATCAAGGTGA
TCCCAGGCCCCAGAGGCAACTAAAGGGACACATTTTGCCATAATCCCGGT
AGTTTTGAATTCAGTTTTAGCTGTCTCATTATTAGAAAACTCGATTAAGA
TGTTGAAAGATGAGTTGATGGATTTTGTGAGGCAAACTTTAAATAGCAAA
CTTTTACCTGCATTCGGTATGATTTTGTGAGGCAAACTTTAAATAGCTGC
ACCAATTTTCTCGTCGTGACTCATCGTTTTGTGTCCAGAGCAGAGGGACT
ACTCTCAATTAATCTTGTTTTCAAATGCACCTTCCTATTATGCCTATGAA
TTATGATAAGTAGAGTTTAATATTGTTAATCAGTTTATTGCTTATAATAC
ATTCACATTTTGAGTTTTTTTTGCCTAAACATTCTTTGGTATACTTGCTG
CTTGCATTTTGTAACCTCCACACCTATCACAAATGCATGGTGATTTTTTT
ATCCATTTGATGCTTTTGAGTATTGGGATGGGCAAAATACCTCTAGTATT
ATTATCAGTCAGTCTTAACTGTCCACAGTGTAATGATGTCATTGCTATCT
GCTCACATATGATATGTTTGCCACTTTATGTACACAGGAATCAAATTTAA
TTAACAATTATTGTGTCAGTTTTAGAATTTGAGTTCCTGCTTTCCTTGTC
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ACCATTTAGTGAGAAATCAACATCTGTGTTTTAGTTGCATGCTATAAACT
GCTATGCTTTGACCATCGTGTTTTTATAATTGACTATTGTATATGATTTT
TACAGCTTTGAAGTAGATTCTACTATTCTAGTTTCCAAAACCTTTGTTTA
TTGCACTTCTAATGCTAAGACATAGCGGTTCTCTGCAGCATGTTGCTCCA
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TTCATCACACAAGGTAATTTGCAGAGTTAGAGAGGTTTTCTTTCTGTTTT
CAGCTCACCAGAATATGGGTGATTATACTCACCAAGAAAAATGTGGCTAA
AAATGTTTATACATTTTTCCTTGTTGATATCACGCTCCCTTCTGAAATAT
TTGATACATGTATTTATAACCAGTATCAGCCATTTTCGAATTCATAGAGC
ACAAGAAGATTTGGCTGGTATTTTTGATAGCTTTTCATGTGCTGGTCTCA
CCTTGTAATTTTGCAGATTTTCATTGCTGGTATTTCTGGTGTTCTTTCAT
CTGAGATGGTAATACAGTTGTGTCCATCAGTATGTGTGCCCCATATGTTA
CTCTGCATAGAGCCGGTCATTGAGACTTATGCTCCTGACATTCAATTGCC
TTTCCCACTATTTCAGCTCGTGGAAATTGTTAGTTCATTTGGCCAGTTGG
CTGCATACCGCTTTGTTTGTAATGAGGATCTTGGTGGGCGATGTGCATTT
CTTGAGGTATGGAACTCCTGTTGCACCCATACTAGTAATTATGATATATG
AATATAAAATCAGCATACCCACCTGTGATCAATTTGATGGAACAGTACAT
CGATCACTCCATCACAAACAAGGCATGTGCTGGCCTGAACGGGATGAAGC
TTGGTGGGTCCATCCTAACCGTTGTCAAGGCGTTTCCTAATTCTCTCGAG
GTACAGCCATTTTCATGCCTCATGTAGTCTCTTTTACCCATCTCATTATT
TGTATCGAGTCATATGCTGCTCCATTGAATTCCAGATTCGCAGTGAGGCT
TCCCCATTTTATGGTATTCCTGACAGTGCCAAAGCACTTCTTGAAGAACC
AACAAAGGTCCTGCAGCTAAAGAATGTGGTATGCCAAAGTTTTATCCCTG
TTTGATTATGGTTTCCTTGTAAACTAAATGACTCAAATCTTTGGTTACCT
ATTTTTCTCCTTACCTGTTATCATACAAACATTTTTTTTTCATCTGTGAG
CTATTCACAATGCCACATTAAAATGATACAGCAGTACTCCGTCCTAACTA
ATCTAGATATTGTAGTAGTTATAAACACAGAATTAACCCACTTTTCATAC
TCTGAAGTTTGCACTTGTGAGTTGTTGACGAACATGCAATATATGTAGTT
TGACCGAGAAGAGTATTTGCTACTTTCAAAGCCTGAGCTGGAGGAAATTT
TGGAAGACGTACGCATGGAGTGTGCAAGGTATGTAACATTCTGTTACTTT
CATGTTTTACTTGCTATTGTGGCTAGTAGCTTACATTATATACGAGATTG
ACAGGTTTGGAGCAGTCAAATCCATAAATATTGTAGAGTATTCTGCTAAC
AGTGACAACATTACTGAGGATATCGAAGTTGAGCCCAAAGATGGACAAGT
CAGGTTTGAGCCTACCGAGTTTTGTGCCAATGATAACTGTGTGGAGACTG
GAACAGTTTGCTCTTTACCAAGTAAGAGCATACCAGTTCCTTCTGCCCCC
ATGGAAATTACTGGTGTAGACTCTATTTCCGAGGGCCAGGATCACAAAGA
GCTTGACACACTTTGTGAGTATGATTCAACTGCAGTTGCAGATCAGTCCA
CCAACCTAGATGACATCCATGCTACAGGTGCTGGCCCCTCATTGGATCAA
CAAATGGAGGCCGTTGATATGGATTCTAAGCAAGCTGATCAAGATGCTGC
TACAGTGGGTGATGTCAATACTAGAGCTGCTGGCCCCACATTGAATCAAC
AAACAGAGTCCGACCTTATGAATTCTACGCAGGCTGATCAAGATGCTACT
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CAGTGGGTGACATCCATGCTGGAGCTGCTGGAGCCACATTGGATCAACAA
TTGGAAACTGCTCATATGGTGGATTCTACACAGGCTGATCACCATGCGAC
TGCAGTGGGTGATGATAGTGCAGTAGGAGAAGGACATGTAGGCTCAAAAA
ATTTGGAGATCTGTACTTCTATTACACCTGGAGATGTGGTGCAGAGATCC
GAAACTGAGAACAGACAACAAAGCGCCAATGATACGAGTGAAAGTGGTGA
GGAAAAATTACGCGTGGCTGAATCCAGAGGAGATGCTCTGGTTTCAGACA
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GCTGCATGCATGGCCGCACATTCTTTACATGGACGGAGTTTTGGCAACAG
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TGTCAGTTAAGTAGCTTTCAGTCAGGATGATGTAGTTGGGAGGAAATTTA
GCAGATCCACCGTGCAAGTCCTTTGGGCGAACTTGCAACGGCTATTTTTT
GTGATCCCTTGTAAACGTAGTTGACTTGGATTATATGGATGTGCAGCCTT
TTCATATAGGCAGTATAATGTTAAAGGAGAACATTTTCTAGGTATATTTT
TACTGATGGCTTTCTTTTCTGAAATTGTTGTTTTTGCTGAATTTATTGTG
TTTTCAGACTTCAGAATACTTCCCCATGTTTGAGAGACAAGGTGCTCATT
GAATTGGCTTATCTGAAGAGTTTTAATATCTCGAGTTCTTAATAGTGGAA
GATATCTACTCATATCACAAGCATTGAAGAGTTTTATGATTGTTGCTGAA
ATGAGCTGGAGGAAGTCTTCTCCATCCCCATTTGTGTCGCATGAAAGTTC
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AGCATTTGCATTGCAGGCTTTAGATGATGGTAATTCTCACTTCCAATCTC
CCTCTCCCTTCCTCACTCACACACTCATACCCACTGGTTAACTTCACAAT
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TGTGAAGTTAATCCTCGCACGTGTGGCTCGATTACACAACCAAAACTCTG
CAGATTCTGCTACTACGGCCTAGTTTCGCAACAAAGTTTCTTTTAAACTA
AAGTAATATCAATACCATAGTATTTTGGTGTCAAGCAAAGCAATACTTCA
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TAAAAAACCAAAGTATTTCCTCAATACTTTAAAAATACTTTGGGTGCCAA
ACGGGGCCTACTGTATTTATAAGTCGTAAAAATATGTCGCTCGCAAGTGT
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TTGTATTACAATATTCAGGATGAGGTTTCTAATGATTCGAAACTCGCAAG
CGGGCAACAACTGCGCTGAAACTATATATAGTCAAACCATTTGATATGTG
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TCATATTAATCATATATTCATAATAACCAATGTTGAGGATATCGTTTATC
GTTAACTTCTCGGTCAGTCCGAAATTAGTGATTTTTGGGTGTATCTGCCA
ATTTATCAGGCGATAAATCGGTTTATCGGGCGATAAATTGATTAATCGTC
TTATCGGTCACCTAGTGATAAGCGATAAATCGACATATCGGACGATTTTT
TGAACAAGGATAATAACTATTGCCATCTATATTGTCTTACATGGAAAAAG
ATTGCTAGCTCATTGAACCAGAATAATACTCCCTATGTTCTAAAATATAA
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GTAGGTTCGGAGCAAAATGAGTGAACCTATACACCCAAAAGCATCTAGAT
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TGTCATTTGTTACTTACATTTCTCAGTGTGAGCTTATATTTTTGAGCCTT
TTGGCATTACTGGATCGAATCCTCTCCCGAATAATTCTCTCTGAATACAT
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TACCAAAACATCTTATATTTAGGAACATAGGTAATAATTCATTATACTAG
GTAGTGATTATTGTCGCTTTACCTTGCGCGTAGCAGTAGATGTGGTTTCA
TTTCCCTATTTCTACATTTGTCTTTGCCTTCTCATTGATTAAGCTCTTCC
ATAAGTTTTCTTCAGTTATTGGATTTCATTTGCTTGCAGGCAACAGAGTT
GGTGGCCGAGGCAGGGGTGCTGAAATGTGAATGCTAAGGTGCTATTTTTG
TTGAACATGTGATGTGGTTTTACCGTTTTTCTATATCGACGTTCACATAT
ATGGATTAGTAGTATTGGAGCTGAACTGGTACTAATCATTAGCAAAAATC
AGTTGGTTATGCTGTTCTTGGACAAGTGAATGATGCTTCTGATTCTATTT
TTATGTTTGTCCAAATTGTACATCATATACGAATGTATGTCTAGAAATCT
TCTTACTGAACTATCTTATTTGTGCTCCGTAGCACACAAGAGCACTATGT
TGCTAGATGCATGTTCTTTTAATAATTTCATCAGCCTTACATACAAGATA
GATTAGTTGCGTTATAGCTGATTGTTTTCTCATTTTCTATTCAGGGTCTT
ATTCACTCATTATGCTGTTACAGTGTACATAACAAAGCAAAACTCTTTAG
ACATGTAACTAATGTTTTAGGAGTTATAAATGCAACATGCTGATTGCTAT
AGTAGAAATATTCATGCACAAACCCACTAATATGCATGCAAGTCCCAAAT
GACTATGCAATATGATTTCAAGCTCAATGCTATTCATTTCTTTCTTGCAG
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GCTAGCTGCTTTATGGAGCTACATTATTGTTCTTTTGACTTGGTGGTGTG
CCACATGCTCGAATTAGTGACATCTCGGAGATGGTTACTACTGAAAATAT
TTCGTTAAAAAAAAATCGTTGTATCTAAGCTTCATCAGTACTGTTCTGTT
GTTGTATGTTCTATTTTTGAGCCTTTTGGCATTACTGGATCGAATCCTCT
CCAGAATAACCCTAAACCCTAAACATGATGATATCCCCACATATTAGTTA
TTTAACTAGTATAGTAACTTGATGGCTACATGCAAGACCACTTGAATTGT
TATGTCAATGTCCTTGCAAGTGTGTACTGTTTCAGTGGAGTAATGAGTGG
AAGTTCCTATCTCTTTCAAATTTGAACTCCTTTGGTCACTGGTTTGTTGG
TTTTGGCTTTTAAAAATGATTAAAAGTTAAACTGATGTTGCTGTAGCTTC
CCTGGTGCTATAACAACTAGCATGTATACTAGAGAATTTATCAATAGTTA
TGCTCTCAAGGAACTGATGATATGGACTTCTCTTTCCACCATTATCTTAG
CTGTAAAATTACACACCGGTTTATTTGCCCGCTCCTATTTTGACTTCCAG
ATACCTACTCTTAGTGGTCTCACTAATTTTCATGTGGATCAGAGAAATGT
TATGGAACTAATTGTTTTTTTAAAGTGGAAGGTGTTCTGTGGGACAAATT
CTACTTTGCTTATGGGTCTTGTGGGTAGAGGTATGGAGCTATCTAATGCC
AACCTAATCTATGCTGAGCCTTCTCCAAAGAGGCCTGCAGAAGATGACTC
GTCATTTGTGAAGTGTAAGCAGCGGTGACGGCATTACTGAGGAGATCGTT
TTTGAGCCCAAAGATGGACCACCGAGCTGGTGAATATTATGCCAATGATA
TATGTGCAGGTACTGGAACTGGAACATATTGCTCCTTACACAAGTTAGAG
CATAGCAGCTCATTCTAACCCTATGGAAATTACAGTTGTAGACCCTATTT
TAGTATTTTTGAGGGTCGGGATCACGAAGAACTTGAAAGGCTTTGGGGTT
GTGATGCGCCTACTGCGGCAGATCAGTATATTGATCTAGATGACTCACCA
TGCTACTGCACTAGGTTGATGACAGTGCAGGCTCAGACTCAGTTGGAGAT
ATGTAGTTCTACTGCACCTGGAGATGTGGTTCAGAGATCCGAAATCAAGA
ACAAACAACAAAGCACTAATGATGTAAGTGGAAGTGGTGTGGGAAAATTA
CCTGTGGCTGACAACAGATACGATGCTCTGGTTTCAGTCACCATCCTGTT
GGACGCCGCGGAAACCGTCTTTGGCACCTGGGCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.