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GrainGenes Sequence Report: AA045138

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Sequence
AA045138
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045138
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGACAATGTAATTTCTTGGTTGTCCTTTTCCCCCACCGGTAGCGACGTGC
CGACGATGCAGCCACAATTCCTACTGGCTCCTGGGCTCCTACCTGTCCAA
CAAAGAAGCGAGAAGTGTATACCAAACCCGAGTGGACACACCAAGCAGGA
ATCCGATACGAATCCGATGGCCGCGCTACAAACGCCATCCCCATTCGCCG
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TATGCACATTGTTTACTACTTTACTTGTAGTTTCATGCATGCATAGTTTT
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AAGCAAACAATCTACCAGTCCTACTATTTTTTTCTCTGCATGGAGTGTGT
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ACAGGTCATACAATATTGGAACCAGGGTCATTCTGTATCTTATTCGGGAA
GCTTGCCAGATTATGTGTCTTTCAAATAGACAAGAAAATGGCTCTAATCC
AATAGTAACTAGAGTCTTTCCTTGCTTTCTGAATGTGTTCAACTACCTAC
CCAACATTTTTTTTACATCCCCATCAAAGACACACCTTGCCACGTTCCAG
ACAAACAATGCTATTGAGCAGGTAAAATGTAGGTGTTTAATAGTTTGCTC
CTAACCACGAAAATGTCACTATTTATCCCCAATTCCCCATGCCAGCCTGC
TTTCATTAAAACATCTTTGGCAAGACTGCTTCCCTTTAACACAGTCACAT
GATTATCAAAACTTTTGAATGGACTTTTTATCTTTCATAAACAAACTTAT
GTGGAAAGTAAAACTTTCAGTTTTTATTTAAAACAGTTTTCAGAGTTTTA
TAAAAGGGAACTGACTGTAAGCACTTAGTGCTAAGCATCCAAATTAGTGG
ATTATCCCTATATGCAATGCCAACACTTCTACTTTGAACTTGTCCATACT
TGCTAAGTTTTCAAAACATATATACTATAGTCTTGGAATATTTTTGTGCT
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TCTTTCGAAAGGAGGTTGAGAACCCCGGCACCTACGTTGAAAAGATGAAT
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GCTCCGGGGGCATCACCGAGTCACCCTATGGCGAACCGGGAGCACACATC
TGGTCCAGCAGACCCTCAGTGCGCACCGCGTGCTCACACTCCACAAGCTG
CCACCTCGGCCGTATCGACGACCATCTTCAGGGCAGAGATCTGCATAATC
CTTGCCAGGCCTGCCATCAATGCCGCCACGGTGCCAGACGACGCCACGCC
CTACGCGCGTCCATCATCACGCGTCCACCGCAGAGACCCAGTACTTACTA
ATTACTCTGTAGCTGAAGGTTGTTTGAGCTTTTCTTAGGATTATGACATG
GGCCATTTGGGTACTATAAGGTACATCAATACATGCTGACTGGCATGAAT
CTCATGAGAAGCAATGTCGTACCTGATGCTATGTTTTGTATTTGGGCAAT
GGCTTGAAAAAAAGGTTCTTAGGTCATGTCTATAATTTTTCCTCTTACCT
ATTTACCCACAAAAAATTGTACCTTATGTCCTTTAACTTATTGGCATCTC
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ACCATTCTTTCTGGCCATCAGCATAGGTCTTGGTAATCAGCGAATGAATC
TTGTGGAGGAGACCTAGGAAGTAACAGAATGTCTTAATAGATAACATAAC
CAAGCAAGCAAACATAATGACTATAGCAGATAGCTATTTTAAAAACAAAT
AAAACAAATACTCTGCAAGGACATCTTAGTTTCTAAATATATTGACCCTT
ATCCTCTGCCATGCACAGTTCTATTCTGCTTCATTTACTGGAGATCTTCG
TCAAGTAGTCGAGCATGTTTTGGCCCGCTACCCTGAATGTAATATCTATG
CGGCTGGCTGGTCACTTGGAGCAAATATTCTCGTGCGATACCTTGGCGAG
GTGAGGTCTGTACTCAGTGATATAGAAGTTCTGCATTTCTACTCAACATC
AGAATATTTTTACGTCGTCTATTGTCATATTCAATAAACTTATACTTCAC
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TGCACCACTTGTCTTTGAGGCCATCAATGTTAATTAAAGTGACTAGCATT
GCAACAGCTCCTTTTTATCCCTGTATAAAATTGATCTAAACGATTTATTT
CCTTTGCCTGTCCATAACGTAACTCAATAATTCTGTGTTTCCAGGAGATT
GATAAGTGCCATCTTTCTGGAGCAGTGTCCCTGTGCAATCCGTTTGACTT
GGTAATTGCAGATGAAGATTTCCACAAAGGGTTCAACAACGTCTATGACA
GAGCACTTGCTAACTCTCTGAGGACCATATTTAAGAAGTAGACCTTTTTG
TTCATCTTTCCTCGAACCTAAAAAATATTTTGCACGCCCCTTTTCAAGCA
CCTGATATTTTTGGAACTTTGTCAGGCATGCACTGCTTTTTGAAGGACTG
GGCGGTGAATATAACATACCAAAGGCAGCCCATGCAAAAACTGTTAGAGA
TTTTGATGAAGGGCTAACCCGAGGTTTGCAGTGACCTGAAGCTGAAATGT
TACATATTTTACCTTTTGCCATTGGCACACCACATTTAAAAGACATTTCA
ATTGTGGGCAGTTTCATTTGGTTTCAAGTCAGTGGATGATTATTACTCCA
ACTCAAGCAGCTCAGATTCCATCAAGAATGTTTCCATACCCTTATTGTGC
ATACAGGTGAAGATAACAGTTCTTTATGCTGCACTAGTGCATTCGGAAAC
AGCAGATATCTAAGTACTTAGGTTAAGAGCATGCCACTATGCTATGACTT
AGAACTATGACTTAAGATTTACCTGAATCTGTTAAAATGGTAAAGTAAGA
AATTGCAACACACACACTAATTTATGACCTTCCGGCATTATAATCGAAAT
GGAAGCTGGACATGCACATACTTGAACCCGCCCCGCGTCGCCCTCCCGGC
AACACGGGGAGAACCCTAGCCGCCGCCGGTCGGCGGTCCCCTCCCGTGTC
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GCTGTCGGCGGGAGTTGGCGACGGTGCTGCGGCCGGACGTCGTGGCAGTG
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GGCTGCGCGGCGGGCCTGGCGTGGCGGTGGTGTGCGGCCGGGCCGGATCT
GGGACGCGCGGGCCGACGGCGGGCAAGGAGTGGCGGCGCGGCTTGGTGCG
TCACCGGAGCAGGATGGAGCTGCTGGGGGTCGCGACCTTGGAGGTTTGCG
CGGCCAATTGTTGCTGGCATGGCGTGGAGGCGCGACAGGGTTGGATCTGG
GCCTCGCGGAGGTTGGCGCAGCGGTGGTGCCTGTGATGATCGGCGGTGGT
CGGTGGAGTTGCTTCGGGTGGCCGCGGTGGTGCTGCCTGTGGTGGTCGGC
GGTGCGGCGACTGTCAGCGCAGTGCTGGCCATGGACCTGGGCGTGTGGTC
GGAGGGCTCGTCATGGCGGCGCGGGCTCGTCCGGGGTTTGATCTGGGCCA
TCAGGGAGGTGGTTTTGTGGCGGCGATCTTCTGTCCTTTTCGTGGTGGCG
GCTGCCCAGGTTCGCTCTGGTTGTTTTTGGCAACTATCTCGCGGGCAGTG
GTGATGATCCGGACGGCGGCGTTCGTCGCGGCGACGGGGAGTCTAGGCGT
GGCAGCGGGAGTGATACTTGTTGATCGTCGGGAGCTTGGAGAAGGAGGGG
AGGGAAGCTGTGGTGGTTTGTGCCGGTCCTTGTTTGGGCGGGCGTGAGGT
TTTGGAACTCTTCGCTAGGCGAAAGCCTTGTCCTGGCGGCTGGCCGGGAC
CGACGACGGTGACGCCCGTGGCGCCGCATCCTTGTTGAAGTCGTCATCGA
AGCGGGTGTTTCATGCTCCTTCATCCGGGCTCTCCGGGGGAAACCCTAGA
TTCCTCGCGGGATCGGGCGTGTGCGGTGCTCTTGTGTCGCTTTGCCTCTT
GGGGCCTCGCTTTGGACGTCCACCGGACAATGGGACTTGTGGAGTGTTTT
TGTGTTTTGGCGGAGGCGGCTTTCGTCTTCGGCCAGGCGGGGCGCGGCCC
TGGGCCGGCGTGGTAGTTGGAGCGGTGGCTCCGGTCTTTCGCCTCCGCCT
GTTGTGTTGAGGTGGTTGTCGACCTGGTTGGTCGTCGACCTGTGTGGAGC
GCAGCCTCGGGCTGGTGTTGTGTTGTATCGGTTTTTCGGCCAGTTTTCCT
TATAAACGAGCCAGCTCTTTTCTTCTATATCAATGAAAGGCAAAGCTTTT
GCCTCGTTTCAAAAAAGAAAAGAAATGGATGCTGGAGATACATTTGATAT
GCTTTCCAATGTCTTGCAATCTGAAAAATGTTAAAAGTTTAAATATATCA
GAGTTAGTACTTCAGCTGTTGGGAAATCAAAAGAATAGTTCTAGTCTCTA
GAAAGCACCAGACATGATATTTCACTCCTTAAGCTGCATATTTTGCTTCC
AGTTGACACTTTGAAATTCATGGAAGACCTAATTCACATTCATGGACTTC
TCAGTTACTTTAAAATTACTGCCATCTGTTTTGTACTTCCATAAGCATGC
TGAAAAACAAGTCCATTAGCTTCTCTAAAGCACCACTACTTATTCATGTC
AAGTCACCAGGAAAAAATGCCATACATGGATATATTGGAAATGCTTGGTT
TGCACTTTTGTACTATAACTTTAATGCTAGCTTAATCATGTGCAGGCAGA
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AGCATGCTGAAAAACAAGTCCATCAGATTCTCTAAAGCACCACTACTTAT
TCATGTCAAGTCAACAAGAAAAAATACCATACATGGATATATTGGAAACG
GTTGGTTTGCACTTCTGTACTATAACTGTAATGCTAACTTAATCATGTGC
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ATCAAGGTATTCCAGTACACTCCCCCTTTTCACCTATTGGTATCTCGCAT
GACCGACTAAGGGCAACATGCCAACATGTCCACTCTAATTCATAATCTAC
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TGGATGTCCTTGGACTGATCCCATAGTAATGGAGTTTCTAGAACACGTTC
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TGAGTTTCTGTTCTACAGCTGAAATGTGCTATATTGCTGATTGCTCCACC
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TTCCCTCTGCGTGCTTTACCTGGTGCAGGTTCTGAACATCTAAATTTATG
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ATATATTATTTCAACAGCATTATGTATGAGCTCTCCCTTGTATGTGTCGC
CATACCAACCTCATGGAAATAGACAGACAGTAGGTCTCTTCAGCCAATCC
ACACGCCCACACAAGGGATTGAACACTTTAACTACAAGAAGCGAGGATAG
CACCGAGGAAGATGTGAGTCTTGGTGGAGGGGTCGTTTGCATGAGGGACC
TTGTCCTCATGGACACGCAAAAGGGTGTGTCAATGGGACATCTTAGGACC
AACTGTGAGGGCTGCGTCGCTTCCTTTGTCCACTGTTTTAAAATGGAGAC
ATTATGAAACTGGCAACTTAAAAGTAGAGACATTGCGAGACTAGTAAGCT
AAAACCTGACACTGAAAACATTCCTAAAACTTTCATGTCAAATATTGACT
TATAAAGTATGTACCTACTTTATAACATTCCTAAAATTTCTACCGATTTT
GATCCAACTAGTGACTAGCAACATTTGCTTCACGATACACCTCGGACACA
TTCATTGACAAAGTTGGCAATTATTATATAGGGTTTGCTTCACGATCCGG
CGTTGAACGTATCTCCCGGGGTTGGCGGAGGGCTTCCGATGTCCGCCGAT
GTCGTGAACTTTGTCGCCATCACCAACACCAAGAAGAGGAAGCGGGAGGG
TACGCACCTCATCCCGCAACCAGGAGCTGCACCGGCCCCTGTCCCTGCAC
CGGCGCCGAAGCCGAAGAGGGCGTCACGCACAAAATCGCAGTTGTCGGGC
CGAAGGGGGTGAAGCAGAAGAGAATGGTCCAGTGCAGAGCCCTCCCGCCG
GTCACTGCCTCCTCGTCGGCGTCTGCCCCTGCGCCGCCCCTGCCCCGCAC
GTGCTCGACGAGTTGTCTCAAAGGTATGTCAATTTTTACTCCGAGTCTCA
TGAATCCCACTTCGCATTACTGTGACATTTATCTCCGATTTTAGCAACAA
TGGACATGCTTCGTTCATGGATCTCTTGAATGAGACAAGTGTCAACACCT
CCGATCCACCACTCGCTCCATTTGCCTAAAATCCTCTTTTACGGACCAGG
AAACCGCCAGCACAAATCAAAGCCCTTATTTGCATTTACTGGTTGTGAAT
AAGCGCACTGATCTGCATCGGCGTCTGAAACTTGTTTATCGCGAGTACAG
AATCCTGTACTAACGATTTAAGGGTCGAGCGTTTATGGGCGTCGTTAGTC
ATGCTCTTAACATAGTGCACTCTAGAGGCAGGTATTGACGTATTTGGTGT
ATAGCTTGCTTGATCAGCTCCACAGCTTTGGCGCAATCTATTTCCACACT
GAGGTTCATGGTCGTCCAATTTTGCGCCAAAGCCGGTCCTTCCTCGATAG
CGGCCAGCTCTGCCTCAAGGGCATTCACACAGTTTCACAATTGACGCGCC
ACCGCCAGTAAATATCATGGTATTGCCTTGATGATCTCGCAACACCTTGC
CCGCACCCTGTATCATTAGAACTAACAAAGGAGCCGTCAGTTTTGAAATA
TATTGCCTAGCACTTTTCATCAATTCAGACTGTTGTTGTGTTGGCTAGTG
CATGTAATTCAATATGGTATCAGTGTTGAAATATATTGCCTAGTCATTTT
CATCAGTTCGAACTATTGGTTGTGTTGGTTAGTGCATGCAATTCAATAAT
CAGAATTCAGTTTAATTGTACCTTCATTCGGTGCTATGCCTCCTTTCTTT
GTCCTATAGCCGAGGGTTTTGTAATTTCTTGCGCCACCTTCGCAGTGCCT
TCCGGTTGTTCAAAAAATGGCAAATCACAAAGTCGTAAGCTTGACTGGTG
CAAGAGATAGTTCACCTCAACCTACTCCTGGACATAATGACTTGTTCTAT
TTGTACGACAGTTTCATACTACCAATAATAAGAAAATTTTAGCAGACCGA
TCTGTCATGTTTGAATTTGAATTTGAATTGATGAATGATTGCAATTGATT
CATTCATTTTAACAGGTCACAAACTGCCAATCTGCCATGCTAACCTAGAA
CAAGAGATCAGCTCGCTCTCAAATCAACACCGAGTTGACATCACCTTATG
ATCTTGATTCTTGGTATGGAAACACTAGTATCAAATCTACTGAAATTGTC
TACTTGACCTAGGCATGCCAATCATCCCTTGAATAATTCCGAGATATCTC
TTTAATTAAATATCTGCATGCTTCATATTTTCAGGTAAGACTGGCTTTGA
GGTAGGGAAGAAAATTGATCAGTGAACAGAATATGACGGTGATATTGTAC
CCATAGATCTCCTGAAGTTTTAATGCATGATAGGCTGATACTGTAAAGAT
CGTTGCTAGTGTGTAGTCAATCATCTCTGCGAGAGGGTTGAACCAGTGGA
TCTAGACGTCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.