Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040797

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040797
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040797
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGTTGCCGTTCACGTGAGCCTGCGTGTGGGCCTGCTCTCTTCTGTCTCT
GCGTGTGCGTGTCGACCTGCGTGATGGGCGATCGATGCGGTGACTCATTT
GCCCACGCGTTGGCTCTTCCCTAATCCCCTTTCTTCTACGGCGACCACCA
CCGGTCTTCTCCACCACCGCTCAACTCTCCCCGGGCGATCTCGTGCCACT
GCTCCGCCCTCCCCTCCGCGCCACCGGCCGAGTCGCTCCATTGAACGCAG
CTGGCTAGCGCATGTCGTGGCCTCGTGGGTGGTGGGTGGATTCCTTTGGC
TTTGACCGCTAGGTTGATTTGGTCTGGATCTCCGGAGGAAGTCATTGCAG
CCACGCATGGTTCGCCGGTGGGGGTGCACGACGGCCTCACAAGAGAAACG
GGAAAATGGCAAACAAACCGGCGACTCACCCTATTGCGGCTCGAGTGCTT
GGCAAGGTCAGGATGACCGGACGATAATGAATCGGTCTACGGCAGCGTCT
GCCGGAGCTTGGGAAGACGAGATTGATTCGCTCGATCTAGGGCTTTGGCG
GGCTGTCTACTTGGAACAGAGGATGTGGACCACACAGTGAGGACGATGCG
GTCTCGGGGCGGCCTCCTTCAACAATCTCGGTGAGGCGACGGCTCCCACG
GCCACGGGCGAGCGTGGAAATAGAGAGGGAGCACACGAGAGCTAGCCGGC
GGGTCATCATTCCCCATTTTCTTCCACCAGATGGCCGAAGGGGGCTGCTA
CCGGAGATGCCGATGCGAGGCACTATCGCGGTCCCAAGCGGGGTCCACCG
ATCCTGTGGACTTCCTCAACTGAGGTTCAGCGCCAAGGTTTTACCCTTCT
CGATTTGATTTCCTTGCTTTGATTTTTGTGAATCCTATGATCTCATCCCA
TATCAATAAATTCAGGTTGTTTACGGGCTGAGAGGCGAGCTGGGAAGATG
GCGTCAGAGGCAACACAGGGAAAAAGCAGCGGCGTGGAGGCCATCCTTCC
TGCCTGCTCTATCCTCTCTGTCTAGATGCATGGCGGCCGGACGCTCGAGC
CGGATCTATTCTGTTCTTAACGGTCTTGCGACGCCACATCCCTCACCCTA
CTCCGTCGCCCACCTTGTGCTTACATATCTCCCCAACCTCCCATTAGCAC
TACTACACTGCCATTCGCCTCCTGCTCAGGCACATCGAGCACAGAAAATG
GCGGCAGCGGTGGTGCGGCGAGCTGAGGAGCTGGTGGGAAAGAAGATGAA
TATGCGGCTTTATTTTTTTTTTGTGTCGTTGGTGTTTGATTGCTCCAGGT
AGAGCTGGCCGCTCTCCTGCAGGACATCAGTAAGTAGCAATTGCCACTTA
CTGCTCTTTTTTTTGTTTCGTTCACTGATTCTCTCGAGCTGATTAGCCTT
TGATGTGAACAACTAATGGGAACGCCCATTTTTTGGCTGCCTCTGTTCTT
GCAGGAGATTACGGGTACACCAAGTAACATTGGTTCTCCTTTGTCCTTTC
CATCTTGAAGAGTGGGAGAAAACCAAAACAGAGTTAGCTAAACCGCCGAT
GGTATTGTTGTTGAGTAATACAATAGGTTATGTAAGTGAATCTGATGACT
ATATCAATAGTGGTTTAGATTTTTTTTACACATTAGTCGGTTCCTTGAGA
TGTGTTAGCATGCTTACATGGCCCTTATTTTGTGTACTAAACTAGACATG
GAGTACTCAATGTTTAGAGCTATTTTCTTTTAATTTTTTTAAAAACTATT
CAGTCATATCCCCAACCACAAGTGGTATGTTATGTGACAGAAATACTTTA
AACGAGTATAAGTCCAAACGAGGAGCCACCATTTTGTTTAAATCATTTGG
TTGCACTCTGTTCTGATAGATATACTTTGCTTGCACTAGCTAATCATATA
ATACACCCTGTTAACTTTGACCACTCCATTATTGGTACATGGGCGAATAC
TATACTTAGATTGCAATTGTCGCGCCACACATTAAAGTACTATATTTGGT
GTATTAGCTTCATTCCTGATAAGTCTGCTCTCATAAAACATTTCTACCTA
TCACAGCAAGATCCTTGTGCTGATTTTGATTTGATAAAAAAAACATAATC
TGGGTAATCATGATGTCATTTTGCCTCTCCCTTATACTTCAGTATTTTCT
TCTTCATTGTGATATACATGACAGGATACATGGAAGTACCAAAGCAGTTG
GATTATTCAGCGCCTCTGATGCTACCGATGTCCTATCTATGATGTCTTCT
TGCACAGATGATGGAGCAGAGTGGGCGCATTGTTGTACTCTTCTCTTCTT
GAATTGATTGTATTCCAGTTCAGCTACACGCCTCCTAGACGAGATGATGC
GTCCTGAAGTGTCACCTTTTTTTATACTGGTACATACCAAGCAGCATGAA
TTATAATACCACATCTTATTTGCGCGAGCGCTCCGTACCTTGTCGGAGAG
CTGCTGGTCCTGCTGCTTACAAGTTAATTTTGCCTTCTTATTATACATGT
ACCAGGATTTGAGGTGATGCTTACCGATGGTACATGTTTCACAATTTGCA
GCCTGTGTACGATTACAGGTGCCCTACTGTCTTTACAAGGGCAGACAATG
TAAGAGGCACTTTGTTCGACCCTGTTTCCCGTGTAGTACAAAGGACTGGA
TATCACAAGAGGACATGTAAGCATGTGTTCATCTCTAATTATGCTTATGG
CTTTATTTTTCTATAGGGATTGTAGATTTTGGTCTGGTAGAATGCTCAAG
ACCTGAATCGTCAAGGAGCCAGTATTCCTTTCTTTTGTTCTGATCCTTTT
TTCCTGCTTACGAAAAAAAACAGCCTGCACACTGAATGCTATAATTGTTA
AAGAGTATGTGGATAAAAAAATGGATAAAAGGGTAGCATATTAGTTTATC
TTTGTTTCGCTCTTTCCTCATTGTTGCCCATACATAGTTACAACAATTCT
AATCTGCTACATAATTCTGAACACATCATTGTAAAATTATTAGTAGAGAT
ATGGCGCCTACAATATGGATGGGGCTGGGTGTGAAATCAAGAATTAGGGC
CTAGGGTAATATATGACGAGCACAAACAAGGTTTCTCATTATTCAAAACG
TTGCAAATCTGATTTTCAGGAAAGGATCCATACTCTTAGGAAAAAGCTAT
TGATGTCTCAGTCTAAGCTTTTACTTCGAATTAGATGTTTGATTCTAAAC
TCTGTATGTGTTTTACATCTAGATTCACGTTTGAGCCATAGAAAACATGC
CAGGAAAATTCCCAGATGCAAAATACACAAAAAGAAGGAAATACCATATA
TTGCAAACTGGAAACATGGAGGCGGGTATGGAATTGTTATCACGGGATAT
TTTGCATTGAAATAAGGTTTGCTGTCTCATCCATCTATCATTTTCTTAAG
TAATACTCTCTCCATTCCATAAAATAAGCCCTATAATTTCTTTTCAAAAG
TCAAACGATGAACTTGGTCAAAGCTTACATCGTTTGAGTTTTCAAAAAAA
TTGTACGGCTTCTATTATAGAATGGAGGGAGTAAGAGGATACCTGAGAAA
TAATCGCTGGCTCCAATTCATGTATACCTATGTTCCATCGCTCACCCTTC
ACATGATAATATACAAGCCTACATATTTTTTTGGAGCAACCAGCAGGAGC
TTTGCCTTTTCATTAAGTAGAGAGAAATTTGTCCAGTTTATAAGGGAAAC
TGGCGAGAACCGTACAACCCAAACACCACACACCGGCCCTGAGGCCACGC
ACCACACGAGCCGACGACACTCCTGCCCCAGCAAGAAGTGGCAGCACTCA
AAACAGAAAGCTCCCGGAGCCGCCGCTCCAACGTCCACACTGGTCCTGAG
ACCGCGCACAATGGCGAGAACCGAAAACAACCCAAACACAACACACCATA
GGAATAATGGACGTTTACCTATGTTATATCCCTTGACAATATCAATCTGA
TATAAATTTTGCCTCAACATTTTGAGGGTTTAGTAGCGGCCATCTTTTGC
AACTGTTTTTTATGCACCAAGATAACCACTATTTATTTCGGTGGGACTAC
ATGTTCTACGTCTATCTCGCAAAATGATCTCTCGCGGTATAATCTCCAGG
CTAGGCCTCACTGTTTATTTAGAAGGAATGTCGTGTTCTGTAATAGATGT
GTGGAACACATGGAGTGAATGTCTTCTTCACATCAGGTTGACAGGCCTCA
TAAAAACTAAAACTGTTGGCAACCTGACAAATAATTATACAGTAGATAGA
GACCAATGCAAATAAAATTGTTTCAGATTCCCACTGTTTTTAGTTTAGTC
AAAGATCAGAAGTTGTTGTGGTCTTGAATCATCTCTCTTTGTTCCTCGAA
AGATAAAAAAATAGAATAGTTTGAAAATTCATGTGACCGTGCATGTCTTT
TCCAATGATCCTAAGTCTAACACTAATTACCCTCTATGATTGTGCAGTTA
TGCAGGCCTAGAAGACTTCATCTAGAGAATACCCCGTCAGCCACACAACC
AACGTCAGGGAAGAACGGAAGAAAGAACAAGGTGGTCTACTGGTCCTAAT
AAAGCGTAGCGATCAAATTTCCAGCGTAGTATAATAGCTTGGTACTGCCA
CTAGCGATGAAGTATGCATGTTGATGCTCTAGAATAGACAGTTTATAAAG
TAGAGTGGCCATGTAGGAGCTTTAAATAAGTCAGCCTTATGTTTTTGTAT
ATAATTTTACCTGGCAAACAATGTCAGTGTAAGTTGACAGTCTACTGCAG
CCGGGGCATAAATTATCTCTGGTTTGAATGAAGTCGGATGTAAATCTTCC
ATGTTTCCTCAATGCTAAAACGAAATCTAACTTAAATGTCATGTAAGAGT
GTAGGGACTTCATGGAAAATGGCATTAAAATTATATTGGCATTATAGAGA
ACAAGAATTAGCTAAAAAACTTCCTTTGTTGGTAAATATCACAAAAATGT
TACAGATAGCCTGTGGCTCAGCTTACAATGCTTCCAACATCCTAAATGAC
AACAAAATCTTCTCTAACAAGGAATCTACAGGAAAATCTGATCAAGTTAG
GTGTTTGTTCATAACTTAAATCATCAATAGCTTCTGTATCTATGTATATA
ATAGCCAGAGGTAACTTAAGAAACTGAACTAAACTATGATATAGTTGAAC
TGCCCAAAATAAGTTCCTTGGAATATCTACTTATTGTCACAACATGAACT
CAATGTTTTCCTGTAGTGGCAGAGCTTCATCTGATGACGCACATAAATCT
TAAGTAATAGGATGAACTTAGTGCAAGCAAGAAGATTTTGGATCTATATG
GCTTAATATGTATTTAACAATATTCTTCTTAGGTGATGTTGTTGTTGTGT
TCTTTCTAGGTCTTAATTATTCTTTCTCATTCTTGATAGTGTTTGTTTTG
GCTGGTGCTCCTTTCTTTACAGAGTTGGTGTCTGGAGGTTGTCTTTCTTC
GTCCCCATTGGTTTTTCCTTCATTGGGTGGTTGAGGATTGGAGCGATGTG
CTTCTTGTGTTCATGGAGGTGAGATGCCTTGGGGTGTTTCTTGGCCGTGG
TGCCTTTTGTGTGCATCTTGGTGTCATTCCATTTTGGTGCGGCTGATTTT
CAGTTCGTGTCGTGCCTTTTGAGTGGTGGGAGGAAACATGTTCCTGACAG
CGACCTATTGTATGGGCCACATGCTCGCCACCCCTACCGTGGAATCTACA
GAAACAAATGAGTTAAATTCTTATGTTATTTTAGATCGAAATTCTTATGT
TATTCTTTCCCTATTATCAATTTTAATTTTATAACATGATCTTATGATTC
GGTACAACCTAGACAAGAAGATGTCCTATCAGGAGCTGTCTTGCCAGCTA
TAGAAGCCTTTTTTATTGAAACGATGTTTTCTTACTCATGTTTACCATCA
GAAACCTCTACAGAAGATCTTTCAGCCATGATGATAACAAAACCCTGCCT
GATGATGCATTTCTTGCGCTCTGTCCAAAGTAACAAGAAAAGGTGAAGAA
CAGATAACCATGGGAACAGTTGTTACTAAGAGGGGTCGTGTACTTACTTG
ACATTTAATTTTCTGTTTTCAGGTAGATAGATCACCGGCTTCAAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.