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GrainGenes Sequence Report: AA032099

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Sequence
AA032099
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032099
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGCAATAACCTCCAAGAGCTTATCTTTCATATTTTTTTTAGGACAAGAG
CTATCTGTTTCCTGAACAAAAATATCAAATCAGAAGAAAAAGAAGATCTA
AAAACAAAGCAACATACAGTATCAACTACCTTAACAGAAAATCCGAAAAA
GAGAAGGGTCCACGCGCTAAAGTCGCGCAGAACTCAGAGCAAGTGAGGTC
ACCCCCTCAATTCTCAAATCCTCGCCTCCACCTCTCATCCGCTCGTTTCC
CCACCACGACCGCCTCCGGCGACCTATCGCCGCCGCCATGGGCTCCGACC
GCGGGGAGCTGGCGCGCCTCTGCAGCGGTCGCAACTGGTCCAAGGCCATC
CGCCTCCTCGACTCCATCCTCGCCCGTTCCCCATCCTCCATCCACGACCT
CTGGTACACTACTTCTCCCTCCCTCCCTCCCCGATCTGCTCCCGCGGGGT
CTCTGATCTAGCAGTCTATGGTTATGACTCTGCGATCCTGAATTTTTCTT
CCTCCCCCTCGCAGCAACCGGGCCTTCTGCTACTCCCAGCTCGAGCTCCA
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ATCCTGTTATTACTTCCTTCCCTGCCGGCGGTGATGATAGTCAGCCCATC
AGATTTTGCTAGTGTGACCTAATGCTTAGAACTCTGTGTTCCCTATGTAG
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TTTGATTAAAAAATCTAAACAATACCTAATGTGATGTGAGCTATGTGTCA
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AGTAAATGCCACCATTAACTTCTACATTATTATTACTATTTTTAATCAGG
CAAGGCACTGTGTGCACTAGGGAAAAACGAGGAAGCTTTGGTTGCTTGGG
AGCAAGGACATGAAGTTGCTGTCCGTGACACAATTGACTTGAAACAGTTA
CTGGAATTGGAAGAATTAGTTTCTTCTGTTAAAATATGTGAGACGGTTGA
GTGTGAAGACGTTGTGGATGCATCACCATGTGATACCAAAGTTGTTATCT
CAGAAGATCGTTTTATCGACACATCATTCACTGCAGCTACAACTGATACA
AAAACTGTTGTTTGCGAAGATAATGTTGGAAATTCTGAAGTTTCATCAAA
TGGTGATACAGTGTTACCTAACAACAGTAAAAACCATAAAGATTCTTGCA
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TAGATCAAGCACTGTTTGCTACGAAAGTATCAAAATCATCCAAATCAATA
AGTTTGGATTTCCGACTTTCCCGAGGCATTGCACAGGTATTTTAGATAGA
GATTCAATATTCACATCTTGAACATTATCACTGAACTGCATCTTTTCAGG
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TTTTGGTCTTTTCTCAGTTTGCTTCTGTTTATCCTCTCTAGTCAGGGAAG
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GGTGCTCAAGCGCCCAAGTTGGACAACTAAGTGCATAAAGCAGGAAAATT
TCCAAGGCGCCTTATTGCCTAAGCATCCTAAGATGGACACCTTAAAAAAC
ATGACTATATGCATATATTGCATTTTAATCCTTTTCTTTTCAGGCTATTG
ACGACTTGACTAAAGCATTGGAATTTGAACCAGATTCTCCTGATATTTTA
CATGAAAGGGGTTAGTTATTTTCTCTACCAATGCTTGAATCTCATTCTCA
TGTGATGTCCCCTAATGCCATTTGTTGTATATATCTTTTGAGGACTCGAG
GATTGTCGGACTTCGTGATCAATTCATGTGATCTTGCAATTTAGTAACAC
AGCGGTATATCTAGGTTGTTAGAGCACACTTTTGAATCCTGATAGCACAT
GCTGGCTAATTGTAGGAATTGTGAACTTCAAATTCAAGGACTACGATTCC
GCAGTCGAAGATCTCTCAACATGTGTGAAGCGTGACAAGAAAAACAGCTC
TGCCCACACTTACTTAGTAAGCAAATGCTATCTTTGATCCCCTATCAATG
AACTTCAAATTCTTTGTTCGAAAATCAAATGGAATACTTCTTTTGTGCAC
CATTTTCTTTGGTTGAAATGAGGGGACTTCCTTTCACTATTTGATCCTAC
TGTTAGGTATAATGTTAGAGTAGTCAGTGGCACTCTTCTGTAAAAACCCT
TTTCTTTGTAATTTACTTCACAATCTGAGATTCGGCCAAGCTACATTCCA
TGTCGGAATCCCCGTATTGGTTGTTTGGATAGCAAATATTAGCGGTCAGT
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CTTTTCTGTCAAGAACAGGGTTACAGGATATCATGTTTGGGTCAGGAAAG
TCTAAACCCTGTATTGTACTGTTCCCCTGCGTTCGTCTTCTCCGTCTCGC
GGACTTTGGAGCCGCGAGTGCACAAGTCTGGCCGTGGCGACAATCGTCGG
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CTCAGCGGCATGGTCAAGTTGTTCACGGACTAATCGAGCTTCTTGAGGTT
CGTGAGGCTACGCGACACATGCCCAGTGAGACGATTCTCATCATCAGGGA
GCGTACAGAAATTTCCTAGACTCTTGCTAATTGTGCCATTGAGTCCGGCC
ATAACTCGGCTGATTGAGCATATTCACCTTCTCTTGGTAGTAGCTCACGC
CCAGCCAGTCCTTGAAGGGATTGTTCCCCGGGAACGAAACCAACCAACCT
CTCCAGGTAACCGACCTCAGCGATAACTGTAACAACGCCATTGCCTCTGG
CGAGCATGCTTCGCCGAGCTTGTATGCGCAGAACTTGTTCCGTGAGAAGG
TGACATACTGACATTTGCCTCCTTGAGTGCCAAAGGAGCTAGGAGATTGT
TGTTGTCTGAGCTTCACGTTCTGGAGCTACGACAGAGTGTTGAGGGCCTG
TGGTACGAGGCCGATGAGCATGTCATGTTGTCTTGTTGAGCCAGAGGCTG
TCGAGCTGCTTGCAGGTGGCGATGCCATTGGTGATGGGGCCGGAGAACTA
GTCGTCGTGCAGCCAGGCCTCATGGAGGTGGTCTCAGCTGGCTGGATCCC
CTTCAAGCGTCCGTCCATCGAAGGTCGCAGAGGTAGACGACTGGGCCGCC
GCACAGTCGCTGCCCAAGTACCTCGAGTTTTGCCTAATCGCGTTTTCACA
AAACGAGGAATAGTAGTTTTTCCCAACACGCACTTTCCTGGGTTTGTGGA
AAGTCGGTTTTGTCTATTTGAGTTTTAGTTGCTGGATCCAAACAGGACTT
TAGTTTGTTAGATGGTTATTCCAGATCACAAAAAACTAGTTCTGTCAAAA
CTGCATATCCAAACAAGGCCTTAGAGTTTAAGTAATAAACAATCTTAAAA
GCCATAAAACCTTGAGCAAATTTCTCTCATGAACTTGTAGTATAGCAGGA
AATTTTTATATTTTGGTCAGTTCTGAGACGACAACTCATATTGCTTACTT
GTGTACTCTTGAGTGGCATGTATGAGAATGCAATTATTTTACGAATTTGA
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TACTACTTTAGAATAATAATCTTCGTATTGCTGCAGGGTCTTACTCTTTC
AGCAGTTGGAGAGTACAAACGTGCTGAAGACGAGCATCTCCTTGGCATAA
AATATGATGGGAGTTTTCTTGACAGTTGGGCTCACCTTTCTCAGGTTTAT
TCCGGGATCTTAGAGACCTGTGTGCTGCCATATCTTCTGTATTCATATCA
AGTTACATATCTATGCACACATTTCCATTTTCTAGGGGTTATAGCTATAC
TGTTTAAGACCGGTACTGGTTGCAGTTGCTTTAGTTCAGTTGTCTGCAAT
GATTGTACTTACATGAAAAGGACTTGCACATGCTAATTTTTTCACATGAA
GACCACTTGGTTTGCATTATCTGATAAGTTGTCGAGCTGCTGGTATCAGA
CTGGCACCTCTGTAGCTTTACAAACTACACAAATTAATGCCTCCTGCCAT
AGGTTCAAAGTGCTATTGAAGAGTATATCAGGTCTCTTAGGTAAAATGCA
GTGATGAATAATGTAATGAAGAGTCTACTCTACTATGTTTCCTGTTTCAG
GAGTATATGCTTGTGTTCCTCTGTATTATGCCAGAAGCACATTTATTCTT
TGGGGAGTTACTGATTAATTGCCACTATGTGATGTCTTCTGTTGTAGCTT
TATCTTGATTTAGCTTATCCAGAGAAGATGTTGGATAACCTTCAGAAAGT
TCTTCAAATTGATTCGAGGTGAATAACGGTGTTCATTATCTTTATTTCTT
TTGCCTAACTGGATTATTTCTTTATTCAGTTGATTTACTTGATTATTCCT
AGGTTTTCAAAAGCGTACCATCTACGTGGAATTCTCTACCATGGAATGGG
CAGGCATAGGTGTTCCCTCTTGCTGATGCCTATGTATTCTATTAATATGT
TAAATAGTTTTGGCGTAGATGCCCTCTCTGTATACCAACATGTGGTGCCG
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CAAGTGTTAACGTTTGATATAAATCTCTTACATTTTTTGTAATTCTTGTT
GTCTGTTTAAGTGATATGTATAGATAGTATAATTCTACTGCCCTATTTCC
ATCATGATCATATGGAACTAAACTTTGGCATATTCAGTTTTGTCTGCGTG
CTTTTGGATGTTAACTGTCGACGACTTGGTGCTAGCCAGTATCCTATCCT
ATGATGAATGTTGCTTTCAATGTGATGGTAGCTTGTAAGGCCTTTGTTCC
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ATGACTCACGGTGTTGGGAGCGAAAGTGGGTTTAGTTAAACAGACACAAC
CATGTTTGATATTCATAGACAATGGTCTATTAGGTTTATCTTCAAATCTG
GACCTCTTACTCTGGTACCATGACAGAACTAGAATTTAAAAAGTAGTGGT
CAACCTTGTACAATTTGCTATAGACATCTTGAAACTTGGCGGCTACTTTG
CTTTATGTTATCTTCTAATACATGAGTGAGCTGTTCCTACAGATAGATTG
TTTTCTCCTGACTACAGTCCTTATCCTAGTTCTTTGTCATCTATAACTGC
TAGCTTGCCAAGTTACCCCTTAACCTAAGGTTTTTGCAGGAGTGCTATTA
AAGAATTATCAATTGCTTTGTCATATGATGGTTCAAGTATTGAGTGCCTA
TACCTGCGTGCCTCTTGCCATCATGCCATTGGAGAATACAAGTCTGCGGT
ATGTGCCTTCGTCTTTGGTGAACTAGTGAATGCTAATTAGCTTTATCAGA
AGTGCTAAGGATCCTGCTGAGCTGACTTCAGCTACATCTTTTTGTTGCCA
TATGCTACAGTTCTCAGCAAATTTAACACTACTTATTGCTTTATTCTTGA
TGTTCACATCTTTTCCTTTGAAGATCAAAGATTATGACGACGTACTCGAT
CTGGAGCTTGATTCCATGGATAAGTTTGTGCTGCAATGTTTGGCCTTCTA
TCAGGTACACACTTTCTTCCTTTTCAGTTCTTTTCCTGTGGAGCTTGTTA
ATTATGTCAGAAGCCAGAACCATATGTTTCTCTGATCTAAAAAATCTCAA
ATCCATGTAAGATGTGAGTGTGCAAAAGAATGAATGTTTTGTGTCCCACT
TCTACAAAAGCTTCAACCCCGTCTTCCATTTTTTAAATCCGCACAAGCTA
CTAGAGTTGTGACCACTAATTTGTGACTTGTGAGACTAAAGAACTAAAGG
ATATAGGACCTCTTTAATTCAGAGGATCATTTTAGGATTTCAGTTCTTAG
GAAGTCTACAAACCTTAGGATTTTTTCTATGGGGCACTTTGCATTCATTT
TCTATGGTTCATGAGTTCCTATGTTTTTCCTATGGTGTAAAGAAACATCT
TTTGTGGCAGTTCCTATGATTAGGATTGAAGAACAAATACCATTGCAATC
CTGCATATCTGGAATCCCGTGAATGAAAGACTGTTGCATCCCGCTTGGAT
GTTGGAATTGGGGGTAGAAATTCGGGAATCGGAATTGTACCTTAGCAATA
TTTGTTGTTTGGATAGCAATTGATTTGGAATCCGGATTGGTGGCCCATTT
CTACAGATTTTCTTGAACTAGAAACAAATATGGAGCTAGACCCTTGGTAT
GGAAATGTTAGTTGCACTTTCCTTGACTCACATACCAGCTCCAATGCAGT
GCTGCCTTCAGCAACTCCTGCGGTGAGCTCCCTCCGGCCCACTGCCTCCA
GAAACTCCTGTCAACACTTCCGTCGACCCACTGCCACCGTTTTACTCCTG
CTGGCCTGTCGCTGCCACCGCCACCGACGAGCTCTCCTGTCTCATTGCCA
TCTCGGAGGTCCTCTTCCTCTCCATCGCCCTCTTCTTCCTCATGACTGGT
GTTGCTGATGCCCCTTCATCTTCCACCCACTGCAGGCAAAACCTCCTCTT
CTTCTTTCTTGGCGCACCAGCCTGTCAGATTCCAAATCAGGGGTTACTGT
ACTCTATCAGCGAGGTCAGAACTTTAGACAAGCACATCTCCAGTTCTCCA
CCTCAGCACCTGTAGAGGTCACATCTGGAGTAAATGAGTGAAGCTCTCAG
TTCCGCATTGTGAAGGCATGTCGTGCGGCAACTGGAATCTTATTTGATTT
GCTGGTATCGGATGCTAGGGCAGCGACAGCCATGGTTGGGAAGAGCATCT
TGGAGAAGATGAGAAGTGAAAAGAAGAGCGTCATAAGTTAGTGATTTTCC
TGTTAAATAAGAGTAGAAAGCAACCAAGCAGGAATGGAAGCAGGCTGTTA
TTGGCTAAGGTGGTTGGTTTCATTTGCAAACAGTAGTTTTTTTCGTAACT
AATCAAAAATATTGAACCATAGTTCATTACCATATAATTTCCAAAGATAA
ATTCAGTTCCAACATCTATACGAACTAGAATCGACTCCCGCAAAGTACAG
TGCTTGTTAAGCCATCACTCATCTTTACAATGTCAAGCCCCTGTTCGTGT
AGACGGTTAATATTTATTTTTTAGGCAGACTTGGCTGCTATTCTGTTGGA
GCAATAGCATGGCTGTTGCGTCAGCTCCAGCAGCTTTTATCTAATGCAAA
CATTTATTTGTCTTGGCTCTTCAGTGGGGTTTTCTGTTTGCTGCCTTTGC
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ATTATTCAAGGTTCAACTTTATCTTTTAAATCCATTACAATATCTTTCTG
GTGCATCAGTTAAACTTCTATATGGACAATAGGAATATTGGTGCAAAAGA
CTGCACCCCAAAAATGTGGCTGAGAAGGTATATCGCCAGCCACCATTACG
GATCTCACTGCGAAGTGGGCGCCTTAACAAGCAAGATTTCAAATTCACAA
AGCACCAAACCAGTCTTCTCCTAGCCGCGGATTCAATTGGGAAGAAAATT
CAGTATAATTGCCGTGGCTTCTTGCCAAATCAACGCCAGGTATCCTTCCT
GGAAGGTCTGCAGATTTGTGAAGTTATCTGAGGCATAGAATAGTCTTGTC
AAGAATATTGGTGGATGCTAGATAGAGCTTGATTATAGAACATGTAATCT
ATGCTATTTTTTTGGGGTTTGTGGAGATAGGCTACATGTGCACCCAATTA
CTTTTGTTTGTGCTGTTTTTATTGGTCAGACTTTATATCTTCAGAGTTCA
GATCAAAGCGCTATCCCTTGTTTCATTGAAGTGGAGTTGTTTGATATTTG
CTTAGATCATTATGTTATATTCCAGCCTATTTTTATAACTTCTATTCAGA
TTTTTTCTTTACTGATCACCTGGTTTAATGAGACTTCATTTTCCTTTTGT
AGTACCGTATGGCTGGTTTAGCTGCTATTGAGATTGCTCAGAAAGTTTCC
AAGGCTTGGCGCTTTCTGAGAAACCCGAAGAACAGTGCAAAGTTAGTTAG
GAGAAGGGATAAGCTTAATATGAGCGTAAACAGGGGAGGCTATTGTAGCA
CCAGTACTTTGTCTGCTGGTTCTCCAACATCTAGTCCAAGTGAGGAAAGA
GTTTCATCTGGGATTTCTCTCTCCTGGCAGGATGTCTATAATATTGCTGT
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TATCCATATTACTTAAGGTTTGTAGACACCCATCATTTTCCTTTGCTGTT
TGGTTATTTGTGGTCAGCCACTAATAGTCCTAGATAAATCTTCTTTTACA
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TCAATAATGCAGAGGATCGTGCAATTTTTCTTACCGATATTGACAAGTTA
AAAAAAGTAAGCCGCTGAATGATCTGTTTGAGTACCATGAGTGCATGATC
ATATCAATTCTATCCTTCATGCCGAGCTTCGTTTCATATTATTTTTAGAA
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AGAACTTAGAAGGCTCCAAGAGAGAAATAAGGTGCTGTAGCTCTAGAAAA
AAAGTGCTATTGCTCCATGACAGCTATATATACCAAATAAGAAAAATAGT
GATAACTGATAAGATCTGAAATCTCAAGGATTGATTTCCTCTTGGATGCG
TTAAATAAGTTACCTAGGACTTGACTGATTTCTCATAGTATGCTTTGCTT
GGCATAACATTGTTCTGCTTCTGATTTTTACTTGAAGCTTACTATATCAT
GTTTGCAAACTAACCAATGTTCTTATGAGAACAAAACCTGCAGATAGAAG
TTGCCTCATCATGCTCGGATTTGTACAACGTAGTTGGTGAGACCTACTGG
GTTGCTACTAGATGCGACAGTACTGCATTTCAGGGGTAATTAACTCTTTA
GCTTGTCTGAATATATATTATTAGTATTCGTGATAGCTCCCATCCAAACT
GCAGCAAAGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTG
AAAAAAGTGTATCTAGACCTCTTTTAGTGTGTAGGTTCGTGTAGATTCGG
AGTGAACCTACACACTAAAAGGGTCTAGATACACTCCTTTCACAAAGCTA
AAACATCTTATATTTTAAAGCGGTGGGAGTACTTCGTAATAGCATTATAG
CATCCTTGTGCTTATATTTAATAATACAACATAACCTTTCTTCCAGGAGG
CGTCTTGAAGGGACAAGAATAACCACTCAAAATGTGTAAGTTCTCTATGC
AACTTTCCTTTTCCCTACCCATTTGGGTCTGGTGCCCATACTCATATGAT
AGATTGTCTCCTTACCCTCCTGCAATCATTCTTACTTTGTGTTCATGGCA
TTACAGGGCCAATGCAGGATTTGACTTCGCAATACGAACTCCTTGTACAT
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CGATTTAGATTTGCTCTTCTTTTTGGTGCCCCTCTTGAGTAATACCTGAT
AGGGCCAGGCTGTAGTCTACACGTGTGAACCTTCGTCTTCCTCCCCTCCT
GTGCTGCCACCCCGACCACCGCCTCACTTCCTCATTCGCTGGCGCCTCGC
CTCCTCTCCACTTCTGCTACGTCCAGATATATCTGCCAATGACGGTGTTG
GCGTCAAGTCGGGGCGCCAGCAGGACCTCAGCCCGGTCAAGCCTTTTTCT
AACCCTATCACTATAAAGACTTAATACCAAATGTCCAGCAGGAAAATTGT
TCGGTACTTCAGTAGCAAATTGCTTCGAAATATGCTGTGATATCCTGCTG
TGTCACAATTTTTGGGAGCCTCGTTTCGTCAAATCAGTTGCAATTGAAAA
GAGTTTAAGTTTTAGTAGACCACCTGTATTTGCACCTAACATCTAGAGTG
AGACAAGCTAATAATTATGTCTGCAGGCCATTTGCGAGGCATATTGTAGT
GACCCGAACCCCACACGGGATTCCAATGCACTTGATGCCGTGAAGGCGGC
AATATTGCGCATGACATATTACTGGTACAGATTGTAACTTTCAACTCTAT
TTCTCTGCCACCGTAAATGGAGTGTGCCAATCAATTTGGGGGAACTTGCA
GGTACAACTTCATGCCACTCTCGAGAGGCTCATCTGTTGTTGGCTATGTG
GTGTTGCTCGGCTTATTCCTCGCGGCAAGCATGGATGTGACAGCAAGTAT
CCCACCAGGGGTTCAGGTCGACTGGGAGGCGATCCTGTCCCCAGACCCCG
GCACGTTCGTCGATGCTGTAAAGCCATGGCTGTACCCATCTGTGAAGATG
AGCAAGAGCCTGAAAGATTACGCGGATGTCAGCGTTGCTTTCGGCACGAC
AGGATCGGTCGTAGCGGCCTTGACTTCTGTCGACCCATAAGTTTATGAAT
GGTTTCGATAAATGTTAGTTTGCTTTGGTTGTTTTTCTTTATTTGACCAA
TAAATTCTCGTGGTTTGCTTTCGATTTGAATTATTATTATTTGTGCTATG
TTGTAAAATGAATAATAAGGTTATTCTTTTTTCATTGGAACAATTGTTCT
TTGTAACTTGTAACAAATAATACAATGAAACATATGTTTGCATAAAGGAT
ATTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.