Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA016807

[Submit comment/correction]

Sequence	AA016807
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA016807
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTCCACACGCCGGAGAGCCCAAAGCGCCTACCCGCCGGACCCAACCACC TCCATCGTCAACGTGTTCTATTCCATCTCCCTCATAGCACCACGCCGAGC CTAGCCATCTACCGCCTTCAACCCAAGGGAAAACTACTCCTCCAGCTGTT TCCGCCGCACCTACGCCCTCTTTCGGAGCCGTCGGAGCCAGTAAACAGAA GCCGCAGGAGAAGGGGAGAGGGCCGGGGTGCGTACTGGGCGGCCGGCAGC CCAAGGTCCCCTCGCCTCTTCGGACGAACGGCGCACCTCCCCCCAGCCCG GCGGCCAGTTCCCTATCGTCAGAGCGATGCAGGGCGGAGGCGTCTCCGGA TTCCGTAAGCTCTAACCCCCGTCCCCCCGTCCCCCCCGTCCTCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAATCATCCCTTTCCGCTTGAATT GTTAGGTTCTGATCATCTGATCGTAATGGCCCCGTTCCCGTTTTCCGGTT GGTTGTAGAGAACGCGCCGGTGACGCGAGCCATCGTCCTCGCCAGCGGCC TCCTCTCCATCGTCTTCAGCGCGAACCGCCGCGCCCGCGCCCTTGGGCTC TCATACCAGGTCAGTAGCCTCAGGCAGCCGCCGAATCTTGACTCAGTCCT TGCCCGTGATGACGCGCGATGTGGTGCCCATGGAAGTGAATCGTTTGGTT AGGTCTCTTCCGAGTTTGAGCTGTCGCGGCCAGTGGAGTGGCTAGTTGCT TCCTGGTGTTGTCCGCCTACATCGTTCATCTGGGTGTCTAATCGTCGTAA TTGTAGGTGTTGACGTGCCTGTGCTATTTGGCTTAATCTGTGGCATGTGA GAATGGGTTTATAAAATCTGCTAGGATGCTGTCTGGACTGATTGTAGGGT TTCAGATTCTGGTTGGTTCTGGGGTGTGAGGACTGAGGAGAGACCGGGGC TCACAGGTGCTGGCTGGCTCGTGCTGTTAGGGATGATTTGGCTTTGGAAG TAGAGAAGAAATCTGTGAAATGGCCTCTTTGATTCGCAGGATAAAGAAAA ATACAGGAATAGGGAAACTCAGGATTGCAATTCCATGCTCATTCAATCTA CAGAACATGATTTTTTTTGTCCTAAAATTTGTTTGATTGCACCATACAAA AAATAAAACATTCTTGGCAAGAGGTTTGAGTAGATTGCAATATTTCCTAT GAAATGTAGTGCAAAGTTTCATACTACAAATAAAGAAACCCACATAGGAA AAAATCTACAGGATTCCAATCTTCCAAAATTTCTATATAAAAAAAAATCC TTTGAACCAAAGAGGCCGGACCTCAAATGTTTGTGCCTAACCAGTAGGAC TAGATGATGCTCCTAGATTATGGAAGGTCATCAACCAAGATATGTTCCCT CTTCATTGTTCTCGGGTCTACTCCCCTGCCTCCCTATCACCTTATTAGAC TTCTGAGAGGCTTGTGTTATGTGCACCACTGTCACATGAATCCCTAGTGG GCTGGGCTCCCTGCCAACCCGTACCTTTTTTAATGACAATAAAGTTGGTG TGTATTGCCATGTCTGTACCGACGTCGATACCACATACTGACATGGCTGC TGCTACACATCAGCAGAATCATCGGCGCTCTAGAGACATCTCATCTTGGT ACACCTGTTAAGGCCCTGTTTGGACACGACAATTCAAAAATGCAGGAACA TGAAAGGGTGGTAATTGGGTTGTCGTGTACCCTAGAATTCTACTGGAACC GAAAACACATGAAAACTTCGGATGTATTGTGTTGACTTCACACTGCAATT CTAGATATAAAATATGCGGTGAGACCCCATGTTAGTTTTTCCTCCAGAAA GCCCTATGTAATAGCCATTTGGTAGGAATTTCATACGTATCCTTATAAGC TATTTCCCTTGTTCAAAACAGCATGGCAGGAAGGACTCCTATAGAGGGAA TTTCATTCAAGTACACTTATTAAACTGCGCAAGGATCTAAGGAAGTTTGT TAAATTAGTTGTATTAACTATTAATTGATGATGACCAAGGTGTGACTTCT TTTCCTGGAATCTGGACATGTATCCTCCAAATTTGGATCTGAACACTTCA GGTTCAAAATTTACATAACAAGTAACCTTATAGGTTAACTATGTTAGTAC ACAGGTATGTAGGAAGGTAATTTATTGTGGCTGCAAAGCTACTGCAGTTC TCCTAAGCAAGGATTACTCTTACAAACTAATCGTATGGATAATGGTTAGA AATTAATTTTATGTATGGAAACAAGTTGGCCAATATGACCTATGGAGTGC ACCATGCAAGTTCGTGTGTCCATCTTGAAGCTTGGTATAAGGAGTGCCTA AGTTGTAGAATGTATTTGTTGTGTGTGCATCTAAACACATAGCTGTCAGT GCTGTTCAGTTATGTGTCCGGTTATTTGTCTTTGAGCCTCTAGGTACTTC AAACCAAAACATGTGGTCAACTGCATCTGTTTTTTTGTTTGGAGATTCAT TATATATATGTATGGAATCTGAAGAATTATTTCTATTATTCTTGCAGGAC ATTGTCAAAAACTTTCGAGTATGGAGGATATTTGCATCTGGTTTTGCCTT TCAGTCAACACCAGAGTTGATGTTTGGACTATACCTTCTGTATTACTTCC GTGTGTTTGAGAGGCAGATAGGCTCTAACAAATACTCGGTGAGTGCTTTT TTTTGCAATTCTCTCTTGTATTGAATGTAGAGGAGATGAATAAACAACAC TAGTAATGCGGTCGAAATAGAACTATATTGCACTACCATGGTTGGAGTTG GGAACTTAACATCTGTTGAAGTGTATAAGTGGATTGCACTAGCCCTTTCT ATCAGTTTGAACTTTTGGTTGCGTTGGCTAGTGCATGAAGTTTGACATGG TATCAGAGCCTAAGGTCTCGAGTTCGAGTCCTGGCTTTCGCGATTAATCC TAAAATTGTTGTTGCCCCCTCGGTGTCCATGTATATGTCTCTTGAGTCAT ACGTGAGTTTCGCGCACCGTCGCTCTCTTCCGGTTGCATGTGCTGACTTC TCCCCGTCACACGTGAGAGGGGGTGTTGAAGTGTATAAGTGGATCGCACT AGCCCTTTCCATCAGTTCGAACTTTTGGTTGTGTTGGCTAGTGCATGAAG TTTGACAACATCCAGGGGCATGAACTTTTAAATGGTTCAATCCTATTCTG TATACCTCAAATGTTAAGTTGTCAAGTTAATGAGGCTAAGAGTAAAATCC ATAGAGGTTTGGGTCCATATGATGCAATTTGTGCAAGAAGCATATTTGAT TGTATATGTTTGTGTAGTTGAGGAAATATTTACAATTATTAGTAAGAGAA TTAGGACATGAGTGCTTACACTTTTCAATCTACTGTGCAGGTGTTTAGTT TATTCACAATCACAGTATCATTCCTTCTTGAGATTCTATCTTTGGTTCTT CTGAAAGGTATGCTATTGAATTGCTGAGAGCATTATCTGTTGTCTCTTCA GAGGAGTATTTTTTGGAAAGAAATAAAAGGAGAGCATCATTGATGGCCTA TGAGCTCTGCCTATTTTATTACATTGTTTTGGTTCTCACCTGAAACTTCT ATAGTTGAGATATTCTGGAATTGGCTTGCTGTAGCTGCTTAAAATTTACA AGGCAATATTTAAACACAGAACTGTTGAAATATAGTTTACCTGATATCCT ATTTTTTATAAGATGTCAGTAGATCAATTAGCAATTTAAAGCATCATTTT GCTGCAACTAGTAGATTTATCTTGGCGAGACAGCATTTTCCTAGAACATA TCAACTGTGCTTGTTAAATCTCAAATTTGGTCTTTGTTTGGCTGGACTAT GCTTTGCTGTTGCATGCTGTGAAATAGCTTACGGTGAACCTTTTGTAGAG ATATTGGTTGCATGCGATCATGCAGTAAGGCAAATTGATTTCTTCCGGAA CATATATTTCTCAACAGTAACGCTAGGAGGTTTCACAAAAGTGCTATATG CCAATTAGTTGTGTAATCATGAGTATTACTTTGTTTTCCCAGCAGCTGCA GTTTTGATAAGTTCTACATTAATCAGTGCCATGTTGACCTTCCGCACTTG TTGAGCCCTCTATTGTTCAGTTATGATATATTTAGATATTTCCTCTCATT TTTTTGTTTGCAGATACAAACTACATCAGTGCTCTTGCATCTGGACCTTA TGGCCTTATATTTGCCTCGTTTATTCCTTTCTTCCTCGACATTCCCGTCA CATCACGATTTCGTGTTTTTGGTGTTAATTTCAGCGACAAATCATTCATA TACCTTGCTGGCCTGCAGGTTAGTTGCTTATCAGAACTGAACCATTTCTC TGTCATTTACATTTAAATATTACATGCTTAATCTTTCCTATTTCTCGTCA CAGCTTCTTTTATCTTCTTGGAAGCGTTCCTTTATTCCTGGTATCTGTGG TCTGATTGCTGGTTCGCTCTATCGTCTCAATGTGCTTGGCATTCGCCGGA TGAAGGTTATAAGAGCTCCGTCTTCCTTTTATACTTCAATAACTCAATGT AGACTTGTTACATCTTTCTTTGTGCAATTGACTCCGGTCGAAAATTGACC TTTATCTTTTCTGTTGTCATTTTTATTGGGTGGTTTTCCTGTCGAGTTGT CTGGCTTGCCTGAAATAATGTGCCATATCATATTAGCACTTTGGTAGTCT TAGTTCTTTTTCATCTAAAGAAAGAAGTTAGATGCCCCATGGATGAAACT TTTGGCTGGCCATACAATACAACTTCCTAAATTACTAGATTTGGAATCTG CCAAACCAAGCAATATTAGGTTGTTGGCGTCAGACACTGGTGTTATTATC ATGTAATTAATTAAATATATAAGACAGCCTGTATGGTCCATGGTAGCTAA TGGTAGTTGGTAGTGGGCTATATATTTTACCAGATCCTGTATCTAGTGTT GATTTTTATTCTGTTTTGTTTATTAGAGGGTTTACCAATATATTTATGAT TGCTTGCTTGTATTTTTGTGTTGCAACCGCCATTTAACACCAGGTTATTG GCGTTAGGATGATGCTAACTTTTACTCCCTCCGTTCCATAATTCTTGTCG TGGTTTTAGTTCAAATTTGAACTACAATCACGCCAAGAATTATGGAACGG ATGGAGTAGTTTATTTCTTTTAATGTCTGGTCATATGCTCAGATTCATTA AAACCATCTGTGTTTCTTGAATTATTTTCATAGAGACCCTTGTAGATGCG CTATTCTTCCTGTTTGTCTTCTAATATATTTCTTCCCGTTTGTACAGCTG CCACCGATGATTGCAGCATTTTTCACAAGATTTTTTGCATCTCCTTCTGG AAGTTCATCTCGGCCCTCAAGAAGTCTTGTTGGAAACATGCCTTCGCATA CAGGCCGTGCTGTTCAGGTTAGTTTGTAAAAAGCTGATTCATAAGTTTGA TTTCAGAGTGCATTGATTCTTTTTAGACTCTGTTTATGTGAATTTCAGCT GCCCACTATAGCACCGCTGTAAAGGCACAAATTGCCTAACTACATATTAA CAAGTTCAAATAATACCTGCTATAATGCAAAATTTCTTGGAAGCTTGATA TTAGTGTTGGTCGTTCTAGATTCTGAACTTGTGGTGGTTTCATAGTCAAG TTCTCTGTTCACGTCAAGTACAGCTGCCCCACTTAAGCACATTTATTTTT GAGACGAGGCAAAAGCTTTGCCTATTCTATTGATTAAGAAGATAGTTGGC CAGTTAATAAACGGAAAACCAGGCAAAAACCGATACAAAAGGAGCCGAGC CTGCACGAACCCCAGCACAACCAGGGCCAAGCCTAAACACCAGTCCACTA AAAACGGATGACTGCCCATCAGAGCTGAAGAGAAGACACTGTGACTGCTA TGGGAGGAGCAAGACTTAAGCACATTATAACAGACAAATGTAATTGATCT AGATTCTGGATATTATATTTGTGGTACCATTCCATCTTATATGTACTCTA GTGAAAATCCATATCCACTGGAACGAACAAATAATCTGCCGTTATGCGTC AACAAGGTTTAAAAGTACGCACTTATAAAAACAAAACTCGCCTTTCCGGA TTCCGTTGATACTGGTTTTAGATCTCACTACTGGTAGTTCACATCTAAAA TAGGTTACTAGGTCTCATTTGCTACTATTCTGTTTTTTTCTACTCCTGGT ACCTCTGGCACCTGTTGGCCTCAAGTTACAATGCGTTAAAATTATCAATG TTGAATTTCTCTGCTCTTCACAAAAGAAAACTGACGGCTTGATGCTATTT AAGTTGACTAATCTGTTGCTCCGGTTCCTTTTTCAAACAGAATCAGCCGT CTACTGGATTTGTTCCTCTTGTGGAGCCCCCAGAGTCCTCCATTGCTATG CTGGTTTCGATGGGCTTTGACAGCAATGCTGCGAGACAGGCACTTGTCCG AGCCAGGAACGATATAAATGTAGCCACAAACATCCTACTTGAAGCACAGT CTCACTGAGCTAACTCAACGCAACTTTACTGGGAACCATTGCAGGCATAA TTGGTTAGATTTGAACTTGAATGATTGTTCCCTGCAGATTTGTTAACAGA TCGGTGAACTCATAGTGCTATGTTGAATTTATTCACTTGCCGCTGCCATG GTTTAGAGAAGTTCAACGTATTCCTTCCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.