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GrainGenes Sequence Report: AA036353

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Sequence
AA036353
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA036353
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGGCCCTTCCTGCCGTCTCTTCTTCCCCCTGCACCCGCAACTCGTCGT
CGTCTTCCCACGCACGCCTCCAACCCTAGCAACCCTTCATCGGTATCCTC
TCCACAAGCGGCGGCTGCTCCGGCGGCCGTTCCGTCTGTGAAGATGTCGG
GAGGCTTCTTCCGGGTAAGCGGTTACCAATCGACGTATCGATCTAGCTTG
GCAACCTCGCTTTGTATTTCTGGTTCGTCGGATCTGTGAGAGGTGCGCTG
ATTCGCCGTGGTTTCGCAGGGGACGTCGGCCGACCAGGATACCCGTTTCT
CCAACAAGCATGCCAAGCTGCTCAAGACGCAGAAGTTTGCGTCCGAGCTT
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GGCCGACGAGAGTCCAGAGGGGAACTATCTGCTGTTGGTTCAGCGGAAAC
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ACTGTATTACCACTATATTTATAGGGCATACTTCGGGCATGTTGTTTTCA
GTTAACTCATAAGCTAGAATTCACACATAAGAAATTCAACTAGATTTGCT
TGCCTTATCGTACTTTGCTTCCATCAGGAAACATCAATTAGTCATATGAC
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CCTTTTGTTCAACTGTATTATAACTATATTCCTGTGATGTATGTTAGATA
TGTTATCAGTAATCCTTTGAAAATATAAAGCGTATAGTGTTATGAACCTT
TGTTCACAACAGATTAGTTAGTAGTGTGCGTGTTGGAAAACCGGGGATAG
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CATTACACATTTGTTCTATATAGGACAACTGACTGGTTCCACAAGTTTGA
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GATTAAGCTCCTAAACTGAGGACTCTCAAATCTTAATTAGAAATAACCCA
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GTACATTTTCAGTCCTCAGTATGTCCGGCCTGCTGGCTAACCCTCCATGT
TCAAGGATTACTTCTATGCCTTAACAATATAAGGCCTGCATCCAAATCTG
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ATGCCATGTATAGCAATGTCATTTCCCCCCATTCTCTTGGTTTTATGACT
TGCTGATTCATCCAACTAACAAAAATTGCCTTGTACTTTGTAACACATGG
AGTAATTAATAAGTTAGAATACAACCGTCAGAGATATTCAGCTAGGCACC
TACATTATAGTATTGTAATTTTTGTTATTTTGTCTTGACAGAAGAAAGCA
ATCTGTCATTATGGTTGAAGCCGTGGACAACCTTATTTTTTCTTGGACAT
TGCACATAGAACAATAAAATGTCAAATATGTCAATATTGTTCAGTAAAAT
TTTGTTTTTGTATTCTTACTGGTAAAATATTCTGCAATTAAAATTTGTGG
ACTTATTACATTTCTCTGCGATGTGATTTCTGGAAAACGACTGTACTTTA
TTTTGGCATTTGGTATTTCTGTCTTGTTCAGTGAACTTGGTATTTTACAA
CTCATGGAGTTGCATGCGGGGCTTAAACTACAGAAAGAGATATTTCTTAA
TCCATCCATCTTCTGTTCAGGTGGAAGAGGCTAGAATTGCCCAGGAAATC
CAGAAGAAACGAGAGAAAGATGGAAGGGACACAGAACTGGATAAACGCAA
AATGATGGTGAGTTAATTCCTTCTGAACAGTTTCCTTGAATAACTTGTTC
TATGGTTATCTTGTGACCTCTTGTGTTTCTGATGACACTCAGATAGCTTC
CCCGATTATATCGGTTCATATCGTTCTTTACCTCAACTACTGTAGGACGG
GGATACCAGTAATTCGAGAGCTTATGGTGATTCACTTGGCTCTGCTTTAA
ATAATCCTGATGTCAATGCCGAGAGAGAAAAGGGATTGGACTCGAAGCAT
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ACTACTCTTTAATGCATGCCACCAGATTGGATAATATTTATAGAATCCCA
CCTTCGAGACCCCTTGATTATTTTCTTACCAGGAGAACCCCTTGATTATT
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ATTTTTTCTCAGACCATGCATGAATCAAACTTGTATTTTCTTGCCCAATG
ATATTATCATCTTTGTGTGTTTTTCTTTGCTTTTATTCAGCTTGTACAAT
AATTCTTCTCTTCCTCCAATTATTTATTGTTATGTTCTGGCGATGACCTG
AACAGCTGTCCAGGAAAAGAAATGTCACGTCACAAATGGGCATTGCCAAA
TTGACAAACTCAATTCTGTTCCTTCATATAGTTAGCTATTTGTTTGCACT
CTTTAATAAGGTTTTTATTTCTGTGTCTGAACAACACCAGTAATACTCTG
GAATAATTGTAGTCTCCATTTGTACCTTATACACAAGCATAGATGTAAAG
ATGAAGGGGTATTTCTTTGTATTTACAACTTTCCAGCAAGCTCATTAATA
AGGGGTGTTTCCAAAACCTTGTAGTTTTGTCATGTTTGTGTTGATAACTA
TTTTTGAAAGATAATGTGATTTGAGTCTGCGAGGACTTGAACCCAGGTGG
TGGGATTGTACATCCACTCCCAACCTAACTGAGCTCACTTCCTAATGTGA
TTAATTGTTGAACTGTTTCATGCATAATTCTTTCACATTTGTATCTTCTT
TTGAGTATCCTTATCTTGGTCCCATGTTAGCTTTTTAATTTACTCAAAGG
ACAGTTCTTTGTAGGCAGTTGCCTTTTACTGACACCTTTCAATTAGTTAA
ACAGTAAGGCCCTGTGATGCCCCAAACCCTTGATAAGAGAATATGCACCG
GTGTGACATTCAACCTTTCTGATAAACTGAGCGACCTAATTAGTGAAGAA
TAAACATGATGTCTCGTGCAACACTATCTGTAGTGGTTTAACCTCGAGTT
CTTTTTACCTTGTCATGGTGTTTGTATTGTCAGCTGTCCTCTCTATTACT
AGTTATACTAGACATGCCAAGTACAGGTTCTGCCAGTCTCAACAGTAACA
ATTGCTCACTTGCAGTACTATTTGACTTTTCATTCCAGGGAACATCGCAG
ACCTAGGAGCACATCTATGTCACCCCGTGGTAGGCAACGGTCTATTTCTC
CGAGGAGGCGTTCTCCATCCCCTTCTAGGCAAAGATCATCACGACGTTCA
GTTTCACCTAGACGTTCTGTTTCTCCACGAAGGCATTCTCCAAGAGTTGC
TCCTTCAGTATTTAGGCGGAGGTCACCGTACGCCAGGAGATCACCTTCAG
TACCGAGATCCCCATCACCTCGGGGGAGATTTCATATTCGGAGAAGATCT
CCACCTTCAGGGCGACGTAGATCACCATCTCCCTATCGCCGCCGGTCCCC
AGCTCGTCCACCTAGGAGATCACCATCTCCTGCACGCCGCAGATCACCTG
CTCGGCGCAGATTGCCAGCCGACAGACACTGGTCCCCGTCTCCAGGAAGG
CGTAGGCCACGGTCCCCATCACCTGGAAGACGCAGGCTACGATCTCCATC
TCCAAGAAGAAATAGGGCACGGTCTCCAGTAAAAGGGCAGTCACCGTCAC
CTCATCGCTCACCCCAACTGAGGTCACCAAAACGCCTGAGAAAATCCCCA
ATTTCTAGTAGAACACTTTCCGCAAATCGTCGAGTCTCTCCCCAGCGGAG
AAGGTATGCTGCTCTCTGATTTTCTTTGCACCTGATGTTGTCTTTCTGCA
TTAAATACTCTTTTGTTTTGAATATATTTGCGCCGATGCTTACAGGAGTA
TCAGTCCATACAGCAGGAGCCCAGATCGTTCCCGTAGGAGTCAGAGTAGA
GACACCGAAAATGGAACAAATGGTAATCCCTCCACCAAAGATAGGGATGT
GGCTCAAAGGTAATACCATAATGCAGGCATATTTTGCTATTGTTATTCTG
GAAGTCATTGTCTTACTTCCAGTATTGCCGCAGGAACCAAGGAAGGAAAT
CATATGTCGATGGCAGCAATGATAGAGAAATGGGTGGTCATCGTTCACCT
GGGTCTGAACAACATAAGCTCACAAATTCCTTGAGGTCTCGTACAAATGC
AGAAAGAGTCTCCACACGTGATAGGTGTGTAATTGTTTATATTGATCTGT
ACTCTGTCAGTTTTATTTTATACATAACACTGTCCAAACTGAAATGTCAA
GTACTCAAGTTCCTCACCATATTTTGACAGTCCTTTGAAGAACACTGGGA
AACAGTTACCCAGTCAAGACAGCACAGATAACAGCGATGAGGAAGAAGGG
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AATATCTGGCTCGCTGTCGATGTATATAAATTTCTTCTCTTTTACACTCA
GAGAGAATGCACGGAAGGCCAATTCATCACGCATGAAATCTAAGGATTTT
CCAGCTGATCTACAACTAAAGGAAGTGGACGTTGATAAGTCAAGCCCTGG
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TCGCGTATGAGGAGAGGTCAAGACGACCATTGACCCAGTTTATAAGGAAA
ACCGGGCCCAACCATACAGATCGACCCTGTTTATGAGGAAAACCGGGTCA
ATAAAACCGCACAAACAACGGAGTCTCGCCGCCCACGCGACACAAGACCA
CCGTCGCACCTAACACACAACTGTATCCGGAGCCGTTGCTCCGACATCCT
CCGCTCGGTCACGAGCCGCAACACAGCACAGGTGAAACGCCTTGTAGCCC
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TCCGGGGCCGCCGCCCCGACATGCCAGCCAGACCGACCCACCGATCGCGT
CGACCGGGCCGACGGACTTGCTACCCACATAGCACCAGCACACCACCCTT
GCCTTGCTAGGCCAACACCCCTTGAAGCCATCGCTGCAAAGTCGTCTGAG
GCTGCCGCCTTGGCACACATCCATCATCCGGGTCCGTTGCCCCGGCGTCC
ACCATCCTTGGCCACAAGGTAGCGTCCACCACCCTTGGCCACAAGGTAAC
CATACCTAGCTCTCGCACACTTGCCACGCCACGAGTGTAGAGGACTCCAA
GGCAACGCCTTCAAGAAGGTAGCGGCATAGTTGTTGCTGTCGCCCGCTCT
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CATCTCATCTCAGCCGTCGGGACCCACCTGGAAGCGTGGGCAGCAGGGCG
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ATGCAGGAGCCATGGCCCCTCCGGCCATCAGCCACCGCAGCACCGAGAAT
CTGGTCCGCGATGACTCCAGGCCTTAGGCCCGCAGAAGCCCAGATCGGGC
CCGCCCTCGACCGCGCGAAGCAAGGCCGCAGCCCCACGCGCCGAACCTGC
ATCCAGGTGCGCAAGGTTCACCGCCGCCCGTGCCTTGCCATCCGCCATCC
CCCTGGCCTAGAGCCGCCGCCGATGCCCAACCGCTAGATCTGCAGCGTCC
ACGCCCGCAGCACGCAACCAGTAAAGTCCTGCCGGCGTTGGAAGCCACAC
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TGTTCTCGAGGCTCAGGTCATGATGCCCCATGACGCTCGGTTGGGTATCT
CCGTATACTCTCCATTGTGTATTTTTTGTGCACTTTTGTTCTTTTGCTAG
ATTATGGTTCACTGCATCTTTTACTTATTTCTTATTCTAATATAAAATAT
TAAAGACCCTTCTTTCTGGCACGACAACTGGTCTCCTCAGTGCCCTATTC
GCCTCTTTGCCCCGGATCTCTTCGAAATTGCCACGAGAAAGAACCGGAGT
GTGGCTAAAGAGCTATCCAACGGCAACTGGATACGTTCAATCGCCCGTTT
GAGCACGCCTGCGCAACTATCTCAATACCTCCTGGTCTGGGACGTGGTGG
AAAGCACGCAACTAGTGCCTGGACAAGCCGATGCCATTGCCTGGACTCTG
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TGGCAGCCACCCCAAATTCACTTCCAAGAAAATTTGGACTGCCCACACCG
AGCCAAAATGCAAGCTTTTCGCCTGGCTTGCCATGCACGACAAGCTGCTG
ACGGCTGACAATCTTGCCACGAGGGGATGGACGCATGACCCCATCTGCGC
ACTTTGTCGCGGAGCCCCTGAGACGGCTGGCCACTTATGCAAAGACTGCC
CCTTCACGTCTGCATTATGGAACCAAACTCAACTCTGGAATGATGCCGGG
AATGGACCACCGGGGATTGGGTTCCCCTCCATATCGGATTGGTGGGATAA
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AAGGAAAGAAACAGAAGAATTTTCACTAATCAACACCTTACCATTGTGGA
GGTTGCCGAGATCGCCAGGGAGGACATGCTCCAACGTGCGCGTGCTTTCA
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CTCCCTCTGTCCAAGAATAACTGACTTGGGTTTGTCTAGATTCGAATGTA
TCTATACACTAAAATGCGTCTAGATATATTTGAATCTAGATAATCTCAAG
TCAGTTATTTCTGGATGGAGAGAGTATTTTCTTTTGGTAAAACCCTTGAC
AGTTTCTTTCTATTCTAGCAGCAGCAAGGATATGTCCAAGAAATATGACA
ATGAACCATCAGATTCATCAGATGATGCACGTGATGGTAGTGGAATGAAA
CGGCCGTTTTATTCTCCTGATGGTTCTCCTGTGAAACGGCGGTCCCCTGC
AAGGGACGCGATTAACAATGAGCGTGCCAAGACAGATTCACATTATGCTA
ATTTAGCAAAGAAATATTCTGGTAAAGTTGATGAAGCTTCCCAATCGGAT
GTTGGAAGTCCTCTTCAAAAAGCTAAAACAACAACATATGACAGTAATCA
CATTGAGCATCACAGTTCAGGCTCAGAAGAATCTGAGAAACACAGATCCC
ATTCTGAGAAGCAAAGGCATAAGAAGGGTCACAAGCATAAAAGGCGTCAT
GATGATAGTTCCGAGTCTGATTCCGACTCAGATGGGAAGGAGTCCAAGAA
GAGGAGGAGAGAAGAGAAAAGGCTGCGGAAAGAGGAAAGGCGCCATAGGC
GTGAAGAACGACACCGCAGAAGGGCAGACCGTCATGCCAGTAAACAAAAA
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TTTAGTGCAAAGAAGTCAAAGCTTGTGGTTATTCCGTCTTCAGATGTTGA
GAAGGATACTGAATCTAACTCGGATGCTGATGTTAGGAAGAGAATTTCAT
AGGCTGGGTGGGAAGGATCTGATCAAAACCAACTTGAAGATGAGCTTCAG
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CTGAGGACTCTCGCAATGCGTTTGCATGTTTCCATTTTTTGAAGTGCATA
CCTTATGTTATTGAAGTGTGCTTATATGATACATGTTTAATGTTTTGTGT
GTTTATGTGGCAGTTGCTCTGAGTAATTGACGATTCCTGAGCTGTTTCCT
TGTTGCAGCTGCTTTCAGGCTTAGCTGCTTTTATCTGGTAATGTTTGCTT
TAACATGTTTGTAAGAACCATAACTCTGAGAAGGAAATATTTATATTTTG
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AATTCACCATTAGTCAACTATTTCTGTTAGACAATTTATTAAAAAGATGC
TAATTAGTCCTAGACAATAATGTACTACATGCTACTTATATCTTACTAGA
TGAGAATGTTGTATCAGCTAAATTGTGTCGCCTCATAGATGATTTTGTCC
TATCAAATACCTGGTATCTGATATGTTCCAAAAATATCAACAAAAAGCTG
TAGATTTGTGATGGTAGCATGCTTATTTAGCAGTGGCACCACACTTCATT
AATGTGAACTGCGTCATTTTGTTGATTTAAGTTTGGATTGTTGGCAGATT
AGCACCATGCGAACAAGCTTTTTTGTGTACCAGAGATATAACCCACACCT
CAGCACCATCCAAGTTGGTAACTCCTTTGATGATATTGTGAAACTTTCAC
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TGGCATGTCACGCTTTATCTGTGAAAAAGATAACGCATGGTGCTAGCCTG
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TAGTGTTCTATAATGTGTTCTGCTTGCTTTGGAAAAATGTTTTTGAGTAT
TCTTTTTGAATCTTCTATAGCAGATTTTCGTTTTTTCATGCTTTTCAGTC
TTGTTTTTATGGGCAATACTATCATGCGTTCTCATTTGTGACCATATTGC
CAGTTTTTTGGTACTAGATCTCCATTCATTGTGCATCATCACTACTACAT
TTGTAATGTCATCAGTGGCAAGCTGTACCTTTTTCTGGTGCAGTTCTCAT
TTGACACAGCAACATCGCCACACTTTTTAATTTGTCCAATGTTTTGCTTA
CGAGTAGAACCGTGTGAGGTCATTACGCTATCTAGGATCCTTCATATGAT
TGCTGTTAACGACCAAGTCACTTCTTTTGCTATTTGTTCAAATGGCATCA
AAAGAATAAGAGATTTAGTGGCAGTGTAATGTCCAAACAACCATGACTAG
CACGGCCGGTGAGTTTGGTTGGCTAAACAGCTTTTACAGTACACGCTTAG
ATTTAGTCTTCACCCATGACTTGCTTTTATACATGTTTCTTCACATGTTT
TTCATTCGTTTTTTGTTTGATGATAGTCAGAACAAATAGTTCGCCGGTCC
TTGCTTTTATACATGATTTAGTTGCTTGCAGGTCCTGAACTCTTTATCGA
ATTCTTCTTCAACTTGTTCCTGCGCACTGTTACGACTGCCACCCAAATTA
GACCGACGACGGTGGCCACGTTGTCAATTCGAAAGCTGGGAACTAGATCG
TCGGTTGGTGGGCGATCCTGGAAAAGGTCGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.