Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA035277

[Submit comment/correction]

Sequence
AA035277
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035277
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACGTCTCCTCTATCTCTCTACTAGCCCTCTTCCTGGCAGAGCCTATTTC
CCCCGGTAGGAAAAAACACGCCGAAAGGCAGAATCTTCGGCGCTCGCTCG
CTCGCTCGCTCGGTTTTCTGCTCTCCGCCGTCCCCCCTCCCCCCTCCCCC
TCCGTCTCGGCGGCGGCGGCGGTCTCCGAGGTTCCTCCCCGAAAAAGGCC
GCGCACGTCACATTGTGCTGGTAAGGGCGATCGTCACGGTCCCTTTTTAG
TAGCTCTGGTTGGGATTTTTTTATTTGTTCCGTTTTGACGCGATCTTGGT
GGTTGTTAGGGTTTTTAAGGTTCACTTGCCGGCGCAACGATGGCGCCGCC
CATCGCTCTACTTAGTTGCATTCTCCTCTCCACCCTCCCCCTATCAAGAT
TTTGGCCTCTCTGCGCTCTATTTCCCCCATGAAAGATCGATTTATTGCTG
CATCTGTTGTTTTCTTTCTTGTAAATCTCCTTTCTTGCATTCTATATGTT
CCAAGTTCTGTATCGATGATTTCTCATATCTAGTCTTTTTTTAAAGAAAT
CAACAAGAGAGAGCTCCGACAAATATAATAATAGCCCAAATTCGTGTTTA
CGCCTGGGAAAATAATAAATTAGAGTCAAAATTTAAGTCAACGATGACTT
AATCATCATTGAAAGAGGTGGCGGGGTTGTATGTGTCCACTCCCCGCTCA
ATCATACTGTGGCGAATAGCCTCGGTTAATTTTGTGATTTACTATTTTCA
GGTTAATTCGTATCCAGTTTTTTTTTTTACAAGGGAATCGACAAGGCAGC
CCCGACAAATATAATATAAATAGGAACCCAAATTCGAATCAAGATGGCGG
GGTTTATGCTTGAGAAAATAATAAATAAGAGTCTGAATTCAAGTCAAAGA
AGAGTGGTGGGGTTGTATCGCTCAATCGTAGATTTGATTCCCACGAATAA
AACTCTTTGTGAGTTCTGATCTTACTGTTTTCAGGTTATTGTGACGCCTG
AGACTTGACGCCACCACAAATTTAAGACAACAATCTTCTGTTGGGTGAAG
GTAAGCACTCACCTCTCATGTGCCCCTGAGATAGGGACTTCGTTCTTGTT
TGGTCTCAACTGCAATTTCTTTTACCTTTTCCCGATTAATTTTACAGTAT
TCTGTAATTAATGATACATATATGCTTGTTTGGCCTCAATTGCAGTTTCT
TTTTTGTTTTCCCAAATAATTACTACTACAGTAGTTGGTAATTAATGACA
CATATTGACGAATGCTTTCTCTGTGCTCCCAATGTAGTGTGGTCACAAAG
TGCACCCTTTCTCTGTTGCTCAACTAACTAAGTTTTGGGGCCTATCGGTG
CTTCCCTTGCTTGACTGGTCTACTTGGGAGACCGAGTGCATGGTGTTGCA
TGTGTGTTGCTAGCCTTGGCGCTCGACGGCAGGACCCATCTTGATTATGC
CCTACGAGGTGTGCACACCTTTTATCTACTTTTCAGTAATTAGGATCCAC
CCCGCCCATCACCTCCCTTCTGCCCCTGCCAAACAATCCACTCAGCTCAG
GTTCAGGTTCCGGCGTGCCCTGGTTCCACAAGCTCGACTTCCCAATATAT
GATGGCTCGGTTGATCCTCTTGGTTGGCTCCATAGGTGCGAGCAGTTTTT
TCGTGGACAGCGCACAAACGAGGCCGACAAGGTTTGGACTGCAGCCTACC
ACCTCACCAATGACGCTCAATTCTGGTACTTACAGCTCGAGCGTCGTTTT
GGCATACCTACGTGGGAGCAGTTCAAGGAGGCTTACCACGTTCAATTTGG
GCCGCCGCTTCGCGCAAATCCCTTGGGCGAGTTGGCGCATTTGCCGTTCA
CTTCCTCAGTCGCCGACTACACCAGCAGGTTGCTAGAGCTCATCTTCCGC
AACAATGAGCCGTTACACCCATGGATCCACCCGTCCCAGCATTCATGCTG
TCGGGTTTAAGTGCCGAAGAGCGAGGTGGGAAATGAGAAGGGCCTGTCAC
CAACACAACACTGGCACTGATGCTGCAGGTTGCTCATTGCTAGTATGGCA
GAAGATGGTCAATCAGTTTAGTTAGTGCATTGAAGATGGGCCATGTCAGC
AGCCCATCATCCTTCTTATGATGTCTTTTCCCTCTACTCTTTCTTCTTCC
AGCTGGTGGCTCCCACCTGCTTTTTCCGAGAAAACACAAAAGCTTACGTC
TCGATGCATTAATGGAAATATATGTTTATATCTTTTAGGCGTGGCCTATA
CAACCTAGACCAGAGGCGCCTACTAGACAGGATGTGTCCACCAACCTAAC
TGGGAAACTTGATACTATCAGATCAGGTTTATAGGATTACCAATGCAGTG
CCCCATTTTGTACCATGACACCTAATTTGTGCACCTCATATCCCAGTCCA
ATTTATCAGTCAATCCGGTATGAGATATCGAACATTGCTTTTACCGGGCA
ATATATTAAGAATAGGGTCTGTGTTTAGATAGTGATGCTTTAGTTGTGGA
TAGTTTTCTGTAAAAACAGCCTATTTGTACAGACCATGTTGGTTTTCAAC
GTCCTAACTGATTATTTCCATACTAATTGTCTTCTTTCTTTGTTTAATTG
TAAAACCTTCTATTCTCGTAAATTCATTGGTATATTTAATATTTATAAAA
ACAACATCGAGCATCCACATAATTTAAGTTATACTTCATTAATTTTTACC
TTCTTTAAATTTGAATGGACATATTATTGTAAAACCTTCTATTCTCTGTT
AAATTAAATTCATTGATATATTTAATATTTATAGAACAAAGTAGAGCATC
AACGTAATTTAAGCTATACTTCATTATTTTTTACCGTCCTCAAATTTGAA
TGCACATATTAGTACCAGTGTATAGATGTTGTTTTTTATAAATATTAAAT
GCTAATTAAACATATTGTTTTTAACATATTATTATCCATTGATATTATTT
TGTACCGTCTTCAAATAATATGTTAAATGCTAATTATTCGGTCGGATAAC
AATCAATCATTTATTATTTGCACCCCTTCCCTCTGAAAAGCGCTACCATA
TTTGCCTTTTTGGACGTGATTCACGTGAGCCAAGATAAATTGGCATAATT
TCCACTAGAGAATTTTGGAGTGAGTACTTATGAATTAAGTTTATTCCTGT
ATTTGTAAAATGGCGGTGATTTAGATCTGTGCTGTCAAATATATATTTTT
TAAGATAGTAACATTTGAAGTGAATTAGCTGTTTTTGTGGTGAATTAGAT
CATTCTTGGTTACATAAATGATGCAAGTATAATCACTGCATTTTATTGGA
ACCAATTTAAATGTGTAAAATTATTAGCAAATTAGGAAAATGTTGTAGAA
TATTAGCTCCGAACTCTTTATATTGTTTACTACTGATAAAAACTGGTCTA
GCAATCTGCGAGTGATGAGTGAATCTAGTTGTGTACCTTATGACAGGATT
GTTAGTCTAAAAAATGGTTGCAGTATAACTCTGGGAAAGGAGAGATTCTG
TGATTCCAGATAGCTTGTACAAAATTAATTGCACACACAAACAGGTATAA
CATTTGGTTGAATCAGTTTGTGGTGTACATCAGTTTGCTGTTCAGACATA
AGGACTGAGGGTCATGCATCTTTTTGGTGTATCCTTGAAATGGACCTGTG
ATTGATCTGCTATATGGTCTAGCAGATGAAGAAGCATTGCAAGAAGCCAT
CAAATAATTTGTAGGAATTGTTAGTAGAAAGACAGCAGAGTGTGAAGAGG
CTAATGGGAGTTTAAGCCATCTAATTTAATCAGATTTTACTGGTAGATAT
CTTCTTTTTGTATTATTTACTTCTGAAATTTAGAGTTTTTATGGTAAATT
CAGACTTTCCTTTCACTTGCTGTACCTTTTAGCTGAATTCGTTCTCAATT
TTACAGCTTGTGGAAGCTTTATTCCAGGAACGGAGGATATTATAACTTCT
CATCTCGTATATGATATAGGGGTGTGTTGTTAGTGTCATCTTGTTTCAGT
AGTTCCAGAATTAATGGGTTCAAACAGGCTACCCTTTGGACTCATTTCTG
GAGGATATAGCTGCAGTGAACAGTATGAGTGGCAGAAGTTAACAGTTCGT
CAGAAAGAACAAGAAACATGGGAGCAACCCCATCATGAGGAAAACGTCAA
CAACCCTGTGCATACACTCGGCAGGTTATTATTTGGATTCTCCCTCCGTT
TCAAAATATAAGGTGTTTTAGCTTTTGTGAAACGGATGTATCTAGTGTCT
AGATACATCCGTTTCACAAAAGCTAAAACATCTTATATTAAGGAACGGAT
GGAGTAGATTCTATGTCATGCTCATCATGTTGTTTAGCTTTGCTAGCTCA
AATGTAGATTTCCTGGAATTTAATGATTTGGAGACAAGGTAGAATATTAG
GTAGCTGTTACAGTAATTTTCATCGAGGGATGCACTTCTCTAAAATTGTT
TCTACTGGTTAAGGGCTTCTTTGTAGTAGGATTTCAATTGACATTTTGGA
GGATTCCAGTACTTGGAAATTTTCCCTATAAAATCCCTTCGGGATCATAA
TATTGAGGTTTTCAAATTACGATGTAATTCTTCGCTGTGATACCAATTTC
ATGCAAAAACCAACATGACCTCAGCTGTCAATTCATTTTTCTTTCGAGAA
GTTCAATGCACCCTCTCTATATCTCTCAGCTGTCATTTAATTCCTCCAAA
AATCATTTATTCATTTCCTATGAACAAACCATCCAAAGACATCTGCTAAG
AAACTCGTATGTTTCGAGACCCTTTAGGAATCCATAGTATGTGACATATC
ATTCCTGTTTTTTTCCTACTCCTATGTTTTCTAGTTTCTGCGACCCAAAG
AGGTGTTAAACTGTTTATATCGTATACTGCAGGACTGAGAGGACTAGCCT
GTCTGTTGATCGCGTTTGTGATCATGCAGAAGGAGCTGATGGACATATCC
AAGCGACGGTAAGCCTTGGCAAGGTTTTTGGGTTTGACCAGGGGAGTAGC
ACTCAAAATGCATCTTATCAAGAGAACCAATACGTGCTAACTTACTCCCC
GGCTAGCCATTTTTCTGAGAAAGATGAAGCACATCATCAGGCCTACATGG
ACAGTATGTGCACTAAAAGTAAACCTGATCACACCTCAGCTGGTCGGTCG
CATCATAGGGATGAAGTAAGCCGGGCTCACATGAAGAAGCCATTCGATAA
ATTGCACACTGTCCGTCCTGCGCAACTTGAGCTTTCTCCGGGTGAGGATT
TTTATAACCGGTTGGACATTAGTCCAAATTGCAAGAGTAAGTATCATAGC
AAGATGTCACAAACAACAAAGGAAAAATGGACTTCTCAGAAAAACAATTC
ATATGGGTCTTGCATTAGTACACATGGGAGAAACCGTCGACAGGCAAGGT
ATAGAGATCAGCTGTCTGAACCGAAAGCTAAGAAGAGTCGCCAGAAAAGG
TATGGCGATCAGCTGTCTGGAGAGAAAGCTAAGAAGCGAATGACTTGTAA
GGAGCAACCTAAAGAATTCTGCTCAATCCGAGAGCAGGATGAGCAGCCAT
ATCTGCATCAGGCGGTACATTGTGGTGGTTCTGATGTGATAAGAAATGAT
AACCGGGAGGGAAAAGCTGAAACAACTGACGAAGCAGGTCATATTGGAAA
AGGTAACTGCCATGTAACGAAGAATATTTTGACAGCTGCTACATGTTATG
GCTCAACAAAGTCCAATGAGAACTCAGATGTGTTAAGTCCTAAGTACAGC
AGCAAAACCATAGCTTCATCAAATGGCCCAAAACGGAGTGAAGGAAGTAG
CAACATGAGACTAGAATATGACCAGCAGTGCAGTGTTGTTGATTGCACAG
GGAACACAGCTGGTGAGGTTTCCACGCATAATCTGCAGCATCTTCCTGCC
ACTCATACGGAGAAGGGTGTGCATATAAAACAATCAGGTAGTACTCAATC
TGAATTACTTCGTGAATGCTTGGATATTTGGAGAAGAACAAGACGATTAA
GGAAGGACACTGGTGCTGAAGCTGAAAGACTAGTACAAACCAACAAAATA
GGTACTGCGAGGTGTCAAAAATCTGCTGATCCTGGTAGCTCAGAAAGTGA
TGATAAAAATATCAATGCATCTGTGAGTCCTTTTGGGAGCTCAGAAAGCA
CGGCTGAAAATGAAACAGCATTTGACAACTCTGAAAAATGTAGAAGTGCT
ACGTCACCTGATGGATTACAAAAGCGTGGTGAAGGAAGAGCCAAGACAAA
TCCAGAGCAGCCCTTCAGATGCCTTAATGGCAGTAATTGCAACCAAATAT
CGGCCAAACAAGGGCTGAAGTGCAATCTGGAGGTTCCGCCAGAACCAAAG
CCAGGTGAAATCACACAGAAAAACGAAGAGACTAAAATTCTGTGCTGCAT
GACTGTTCATCCAAATGCCATGGTACAAACTCGTCAGAACAGCTGTTCTG
ATACTAACCAGATACAACCTAGACAGAACAGGGGTTCAGATACTGGCAAG
GTGGATCAAACAGTTGCTTCGCATCCTGGTAGTAGTGTGCATCAAAAAAT
TTCTCAACACAAAGCATTTAACAATCATTTGGATTTGGATTCTAGGAGAA
AATATAAACTGGGTGCCAGCTGTGAAATTAAAAGGAAAGCAGAAGGCGAT
GGTGCCAAATTTCCTGAGCAAGCAGCCAGCTTGACAACTAGTCCAGCACT
GCTGGATCAAGATATTGTTGCTGTTTGCCGGCCGCATGATGGCAATGTGA
ATGTTCATGGGTCAGAGTATTTCAATCATGGCAGTGAAACTACTCCATTC
AGTGTGTCGAGTTTGGATAAAGGAACCACAAACAATTGCCCAAAGAAACC
TGTTGGTTGCTCCTGTGAAAGTGATTGTAGAGACATAAAAATTTGCCCCA
GGGGAAGTGATTGCAGAGACATGCCACTGGATACAATGAATTGCAAAAGA
AATAAACATATTTCTGCAGAACTGGCAGATTCTCAAACTAATAATTGTCA
GGAAGAAACAGAGTACGATTATGAGTTACCTGAAGTTCTTGAAGTACCGA
TAAATGAACAGATATCCCTCCAATCTGATGCTGAGATAACAAATTCTGGT
GTTGCAAAACCAGCTGATAGGACTACACGTTTGGCAATACCAGACTTGAA
TTGCTTGCCTAGTATGACTGCAGATGAAGAAGGATATGTGGCATCTATGG
AAGTGATTAATCAGGTATCTGGGCACGTTTCTTCGATACCACAGGATACT
AGTGAGAGCTTTCCAGCCTGTAGTGGCACTGCTGCGCCGGAAGAACAGTC
TAAGCAACCCGAAAAGAATGATGAATTTACTGGAGGGCACACTTCGATAC
CACAGGATACTAGTCAGAGCTTTTCAGCCTGTAGTGGCACAGCTGTGCTG
GAAGAACAGCCTAAGCAGCCTGAAAAGAATGAATTTACTGGAGGGCATGT
TTCGATACCACTTGATACCAGTGAGAGGTTTTCAGCCTGTAGTAGCACTG
CTGTTCCGGAAGAACAGTGTAAGCAACCTGAAAAGAAGGAATTTCCTGGA
GGAGCGTGCAAAAAGGAGATTGCAAATGGGTCTCGGATCGCTGAGTCACA
TATTGGGCCACCACAAGCAAGTTGTGTCGACGAAATTAGCACACCAGCTC
ATGCATTCAGATGTGCCCTTGGCGAATTCGTAAAGAACATCTTGAAGCCT
CTGTGGGAACAAGGCCTCTTATCCCGGGATGTCCACAAAATCATAGTGAA
GAAAGCCGTGGATAAAGTGACCCTCACGTTGGGCCAAAAGGTACCTCGGA
CGGAAGCAGCCATCCGTAGATTTTTAAGAGAGGAAGAATGTCAAAGCGTA
GAACTACTCGTTCAGGTGGTTTACCTATTCTCTTTCTATTTAAAGCATGG
ATGGATGTTCTAATAACTGGCCAAAGAAAACCATGACGAATGTGTTGTGT
TGCAGGGTTACTTGGATGTGTACTTGGGAAGGCAAGTTCTTAAGAGAAGT
ATGCCTGGTAGTACCTGACCAGTCCCTGGAAGCCCCAAGTAAAAATACTT
CTGGCCCCAAGTATATTTATTGGTATGGATTCGCATGGTACAGAATTTCA
CTAGCTAACCATAAATATTTTTTTTGTTGCATTTGTTCAGCATTAGGAAA
AGCCATTGTGAAAGAGAAGATCTCTTGGAGTTATCTAATGTAACTAGAAA
CGTCGTGAACATTACCATGGAGCCCAATTTTGGTTTGTAATGTGCAATTA
TCCAATATTTAGATCTCTATAATCTGACGAAGTACAAAGATGTCAGGTGA
AACCGTGTTTAGGGTTTGTAATGCCGGTGCTTCTTGTTTCAGCAAATGAT
CATGATAACCTGCTAAGCTTTCCTTCCCTTGTAATGTGTGAGTGAGATGA
TGATGTGAACGTTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.