Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034772

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034772
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034772
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCGACGGCGGCGACCGCCTACGAGCGCCGCCTGCTCGCTGCCGCAGA CCTCGTCCTCTCCTCCGACGGAGGCCGACAGCCTCCGCGCTTCTCTTCTG CCGACCTCGGAGTCACCGCCGACCTCAAGCCGCACCAGCTTGACGGCGTC GACTGGCTCATCCGCCGCTACCACCTCGGCGTCAACGTCCTGCTCGGTCC GTACTACCCATCCTCATCCTCCGACCTACATCTCAACTCCTCCAGCAGTG CTCTATTGTTTTGATCGATTAATTCAGTTCCGGTCCCTTTTCGCTTTGCA GGCGATGAGGTAGATGAGATACCGTATCTACAATTTGGGCACGAACAGCG GTTGCTGCATATTGCAACTGGGCACTTGCGCTTTCAGAACAATGTTTGCT TCCGTGGCTGTTGATGTTTATGCATGTCTGACCATATGTGCAGATGGGAC TGGGGAAGACTCTGCAAGCAATTTCTCTGCTGAGCTACCTGAAGATGAAA TCCATTGCACCTGGACCGTTTCGTGTGTACTTTTTACCCTGCTTAATCTC ATTTATCTATGAGAGAACCCATTTCTCTAGCAGTTCCATTTGATCTCATA AGGATGCTGCTCTTCTTTCAGTGGTGTTATGTCCTCTTAGTGTGACAGAT GGCTGGCTCTCAGAATTCGGTAAATTCTGCCCTACCTTGAAGGTCATCCA GTATGTCGGTGATAAGGTGCATCGTCGTAATCTGCGAAGGATGATGCATG AAGATGTCCAGAAATCCTCAGCATCGTCTGCTTCAAATGTATGCTGTTTT CTTACAAGTCTGTGTACCTTATTTCTAAATCTTCTTCAATGTGGGCAAGA CCTGTTGGCTGTTGTATCTGTTCTTCTTACATGTTCTGGAACAGCCTTGT TGTGCTTGTCTTGGAGCATTTTTTCTTATACTACTGCAGTTATTTTGGTG CAAAGTCTTTACCGTCTTTATTTTTTCATCAATGCAAATTAGGAATTGCC ATTTGATGTGTTGCTGACAAGCTATGACATAGCCTTGATGGACCAAGACT TCCTTTCACAAATTCCATGGCTCTGCGTGGTCATTGATGAGGCCCAGCGT CTCAAAAATCCATCCAGTGTATGTAAAACTGCTCCTTCACTATGAGTTGC AGGGCTCTGATTGTAACACTTTTTTCTGCAATTTTCCAGGTATTGTATAA TGTCCTCGAAGAACGTTTTATCATGCCAAGGCGTCTACTACTGACAGGCA CTCCTGTCCAGAACAACCTTTCTGAACTATGGGCGTTGATGCACTTCTGC ATGCCTTCAATTTTTGGCCCCCTTGACGAATTTCTTTCTACTTTTAAGGA AGCTGGGAATTTGCTAGCAGGTATTTTCCTTAACAATATGTAGGATTCAT CTTTAGGTCTATCCAGTTGCCTAGTAACAATTTTTGTTCAGTCGGAAAGA GCAGTTATGCAACTCAGCAGTGAGCACTATATGCCTCATGTACCATCTGT TCTATTGTTTTTCATTGAGCAGCACTTTGGGTACTAGCAGCTGTGTAGTC TCTTCTTGCCTCATGTCGTATTTTATTTAGGTAGGTCCTTGGCCATGGGA TAGTCAAATACTATTACTCTTTGATCAATGGCCTTGTTATTTTTTGGAGA ACACATAAAAGTAGAGCACATATTATACGGATTTTTTTGGTTAGTTCGAT GACAATGATTTGAATGGCAATCCTCTCTTCATGGCAACAGAAAGTATTTG TCCATCTAAAAAGAGAAAATTATCCCAGTCCAAAGAGGTACAGATTGGAG AATACATCCAGTGTAACAGTGGGGCCTAGGCCACATGTCATTGATACCTT AGATGATATTTCCCAGTTCCCTGATAATGGGTATGGCAATGAGCAATACT GCCCTTAAATATTTGAGATGGTGATACAGTCACTAGTATCATCTTAAGGA TCACAACAAAGTAACAGACAACATGTTCAAATCTCGGGAAATCATAGTGG GAAATCCGCAGGAATAACCAAACCAACCGTCTTTGAATGGGAACTGGAAA TTGAACTTTGGTTACCAGGTAGTGAGATGAGGTACCCTAATGTTTGACTT TGTAATGGTTGTCAATGCTTTTATGTTTAAGACCAGTTCTTTCTAATATT TCAAAGCATTTATGTTCACATCATTCAATCATCTGTGGCGTTTCTTTGAT TGTCTGGTCTTTTCGTTTTGTTCCTCTGAAATGTTCACATAAGCACAAGG TACCTGCTCTGCTGGGGTGCCCTTTCTGCAAAAATGTGAACATGCACCGT TCCTTGAATAATATATCTAATTTTTTGACATGAAGTCAGCTTCTTCAGTT TTCAAAATATCAATATGTTCCTCAACAGGAAATCGAGCTCATGAAGCAAA CAGACAATTCAAGATCCTTAAACATATACTCAGAGCATTTATGCTGCGAC GAACAAAAGCTTTGCTGATTGAGAGAGGAATTCTGGAAATACCTCCATTA ACTGAGCTGACAGTGTCAGTATGACAGTATTTAAGCTTCACCATAATGTT CTTGCATTTTGCCCCTTTACCTTTTTAAAAGTTCATTGATCTTTACAGGA TGGTACCTCTGACACCTGTTCAGAAGAAGATATACTTATCAGTATTGAGA AAAGAGCTGCAAACACTTCTTTCATTCGCTGGTGGATCTTCTCGTCATCA ATATTTGCAAAACATTGTAATGGTTTTCTTTTTCTGCCTAGCAGCATCTC GTATATATGCTCAACCCCACAATATGAAATTGTGTAGATTTTATATATAT TTTCATGTGTATTGCTTTTATTGATGAAATTAGCTTGTTTGATGTTAGTT GGATGAGTTTTAGAGTTCATTATGCTTTGCATTGTGGCTATCTTTGTGAA CTCATTATTTATTAACTATTTGTCTTCTTCTGGCAAAAAAAGTATTGTAC TCCCTCTGGTCCATAATAAGTGTCGGTGATTTAGTACTGTTTTAGTACAA AGTTTGTGCTACATCTCCGACACTTATTTTGGATCGGAGGGAGTATAAAA AATGTCATACCAAATGAGATCACATCTCAGTAAAAATGTACTACGATGTA TCTTTTACATACCATTTACAGTTCAATATTTTTGTCAGAGTAAGACTTGG GTTTTATTAGTTCATATCAGAGTGCTGGGATGTGGGTCTTCCACTTTTTA TCAAGTCATGTTTTCATGATATCTCATTTTGACCTTGTTTTTCCCTTGTG CAGTTATGCACATTAGAAGCTCTGTACCAATTTAAGTTCCATCTCTTATT TCTGTAAATTCTATCAGGTAGTACAACTACGGAAAGCTTGCAGCCATCCA TATCTTTTCAGTGGGATTGAGCCTGAGCCTTATGAGGAGGGGGAGCATTT GGTTCAGGTCAGTTCAACTTGATTTAGAAACAGGGCACTAAGAGCATGTT TAGATTTTGCCCGATTCATGCTGCGGGAATAATTTGCAAACGTGAAATTA GGACATGTGACTTTTTGGGATTATGCCGACAAGTTATTTAACAATATTTT ATATAATATTTATTCAGGCTAGTGGAAAGCTTCTTGTGCTAGATCTCGTT CTTAAGAAGCTCCACATGTTAGGTCATCGTGTTGTGCTATTTGCTCAGAT GACTCAGACACTGGACATTCTGCAGGTTTTGTTTTCTTGAACCATGCTTG CATATGATGTCTTATTTATCTTATGGTTACACATGTTGGTTCACTGTAAA TAATTATTTTGTTTTACCTCTTAAACAGGATTTCCTAGAACTGCGTAATT ACACATATGAGCGCCTTGATGGTTCAGTACGTGCCGAGGAGCGGTTTGCG GCAATAAGAAATTTCAGCTCTCAACCTACCAAAGGTGTTATGGGAGATGA CAACAATCCAAGTGGACCTTTTGTTTTCATGATATCAACTAGAGCAGGGG GTGTTGGGCTTAATCTCATTGGTGCTGATACTGTGAGTCTAACTCAAGTT GAAACTATAGCTAATCAAATCCAGTTCCCTAATCTGCGCATTCCAGTGAT GGTTTCTTTATTCTAAATGTATATTTAGTGCCCAGCAGACAGTTCCAGAT TAATGATCATTCAGCTTTTTGAGAACTTCATGCCATTGATCATTTTGTTG CTAATTGAAATGATTGGCTGCAGGTTATTTTTTATGAACAAGACTGGAAT CCTCAAGCTGACAAACAGGCTTTGCAGCGTACTCACCGCATTGGACAGTT GAATCATGTATTATCAATAAATTTGGTATCACAGCGCACAATTGAAGAGG TCAAAACTCTGACTCCCGTTACTATTACTTCCTCAATTAAGTTGCTCCTG AGATTTTTCTTTTTTATTTGAAATGGTGCAGGTCATCATGCGAAGAGCAG AGAGAAAACTTGAGCTTAGCAACAATATTTTTGGAGATAATGATACAACT GATGGGGAAAGGAAAGATGTCGGAAATGAAGCGAGTGACATGCGTTCAAT TATATTTGGCTTACACCAATTTGACCCCACTGATACAGTTGCAGAAACAA TCAATGAGGAGACACTGGCAAAATTGGAATCGGTGGCAGAAAATGTTGTA AAGATGCGTACTCATGAACCTTCAGAAAAGGATGGCCGAGCATTTGAAAT CAATCCGAATTCAACTGACGGTAGTGGGGCCGTGATTACGAGAGCTTATG ATTCTATTAAAATTGATCCTGGGGTTGATGAAGCTGCATACCTCTCCTGG GTGGAAAAGTTTAAGGAGGCTTCACATTCTATTGAAAATGCCACAGTTGA ACTAGAAAGTCAAAGAACAGCACCTGAAGAAAGGGAGTTGAAACGTGAAG CTAATAAGAAAAAAGCTGAAGAGAAGAGATTAGCCAAGTGGAAAGATTTG GGATACGAGACATTAGCGGTCAAACATCCTGATAACATGCCAAATCAGAA TATTTCTGACTCAGGATCCGTCCAACTTGTATATGGAGATTGCACTAATC CATCAAAAGTTTGCGCTGCAAAGCCTGCCATTATATTCAGGTAACTTTTT CAGGGAAGAAGTGTGACTACATTATTTACCAAAAGTCCACTACTTCTGAC TAAAATCTTGAAGGAATCGTAGCGTGTTATACAATATTCCATTAGAAGGC CATGACATTTTAGATCATGTTTAAACTGCTTAGCTTGAAAAAGGGTGTAC CCAGTGGCTGAAAGCTCCCACAGAATGTGGGGTCGATTTGTGCAATTTGA ATTCCTTCCAACATTTTTTTTCTGAACCACATTTTGTACTAAACAAATCA ATTGCTGGTGCAGTTGTGTAGATAATTCTGGGACATGGGGACGTGGAGGA ATGTTTGATGCTTTGGCTGGTCTCTCGACACACATTCCAGATGCTTATAA GCGTGCTTCTGAATTTGACGATCTTCACATGGGGGATCTTCACTTGATTG AGCTAGATGGTTCGTTTTTACACTTGCTCCATTATTTTCACTTTAAGAGA AAAACATGATATTTAAGTGGTACCCGAGCCCAAAAATATCTTCGATACTG CTGTTGTTTGCTCACTCTGATGATGCGCAATTGTCTTCCTTCATCCTCAT CCATCATTGCCAAGCTAACCTTTTCAGGAGAGCTAATGCGAATCGAATTC AAGTCAATATTGTTTCCTATATGAAAATCATCATTCATAGCGACTACTCC CTCCGTTCACTAATATAAGACATTTAGCTTTTCTCTAACATGTATGTATG TAGACATGTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCATTTTAGAATGAATCTAGTCC ACTTTAAAATACCTAAAATGTCTTATATTAGTGAACGGAGGGAGTAGTTA CTAATTAACCATCACAGATTTCGCATATGTCTCTATTCATATGAATATTT TCAAGTGACAGCCCTTTGGAGTCGATGTTAGTGCTGTATATGTTCTCGGA TACAAGAACAAATCAGATACTGCAGTGTTCCTGTCCGCAATAGATCACAT ATCAAGTAACCAATTTATCAGTTATCACCATAGATAAATTATATGATCCA AGGACAGGATCGTGTTCTGTTCCTTTTCATGTGACTAGTCTAGAAGTCCA TTCTAGGTGGTTCACATTGACAGAATAATGATACAACCCTGTAAAGCTAT ATCACTGTAGCCTGCAGTTGGACTTTCGATGTATTTGCTGTCAACAAAGA TTTTTTTATGGGGAGTGTGCCATAGGCATGAGCAGGTCATGTTCTTGTAC TAAATCTGAGTTCATTCATTTTCATTTGAATATGAGTTTAGATTATAGTG ATCTGCTTGGTATCTTACATCTGTTTAAATTTCACTGCTATATTATGTGC CTCTTACAGTAGGCTGTGCATCTATGGAAGCCTCATCTCTGTTAGTGTAT AAATAAAATTTAGTCTACAGTTACTCCAGCTGCTTTTCAAGCACTGCATT TGTATCCTCTTTGCAGAACTTATGTTAATGTTATAGATGATAGCCTACAC TTTGTGCGTAGCCCAAATCATTGTATTTCACTGCATTTGTATCCACTCTG CAGAAGCCAACTGTAGCCGGAGTTTGGATGCACCTCTTTGGGTGGCACTA GCTGTTGTCCAGTCTTATAGTCCGAAGCGTAAAATTCCAAGAAGTGGAAT CTCAATATCTGATTTGGAGCTGTGTTTATCAAAGGCAGCCTTCTCAGCTG CTCAGCGTTCTGGTATCAGTCCCTTCCTCGCCTATTGGTGCATTTGAAAC TTGGAGTGCATCTGTAAATCTTGACATTGGATTCGTGTGTTCTCACCCGT TCATGTTCTCCGTTACCTATTCAATAGTTTTTTTTTTAAATTATATATTC AATAATTTGAACGGTTGCTATGCAACAGGAGTGTCATCATAGAGTCCTGT TATAAAATGTCTATGGTGTGAATTTAGTTCAGTTCTAAAACCAGCTCGAT TTAGTTGCTCATGAGGTGGTGCGCGTGTGCCTATGGTGATAGTAGACTAA TAGTTACAGGATTTTTGTATCGATTAATTAACACAACTTTACATTTGCTT TTTCCAATGTGATTTATTGCTAATTTATTAGTCTGGCCTTGATTTCTTTC CATGTATTTACCTGAAGCGAGTATCCATATGCCCCGGATTGGTCAGCAGA GTGGCTCACAGCGATCAGAGTGGTATACCATAGAACGCCTGCTCAGGAAA TACGCATCACTTCATGGCGTCGACATTTTTGTGTATGCCACAGGCTTCCT TTCAATCTTGTTATTACTTCTTTGTTGGTAAATACTTAGTACTTGCTAAT GAATAATCCTCTCTGTTTCCTCGAAACAGGTACTACTTTCGGCGATCACC CAAGCAACAGCAAGATTCAGATTAATCCATGTGCACTTTAACAACTCAAC CTAGCTATGTGTAGACGTGTAGGGATTTACATGTTGTAACCTGGCCACTA GAAGGATCAGAAACCATGGATGTACCATACTACCATGTAACTTTTGCTTT TCCTGTATCCTGATCGGCTATGGATAGCTGAACCGAAAGAACCTGCTACA CAATTTTAGCGAACCCTAGAATGCACGAGTACCTTCAGACGTGTCTCTTG TGTATGATGTAAATATGAAACTTTCCACTTTAATTTGCAGCAGACGTCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.