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GrainGenes Sequence Report: AA043892

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Sequence
AA043892
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043892
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAGGTCACCGCGCCCAGGCCAGGAGGACAGACACGCAGGCGGGAGAAGA
GAAGGGATTTCGTCCGATCGAGAACCCAACACGACACACTTCAAGCCTCC
CCGTCCGATTCCACCGGCGGAAACCCCGATCGCCTCCGCCACACGGCACG
CCCCTCCGCAGTGCCAAACCCCCCCCCTCCCCCCTCCCCCTGGCCCCGGC
CCGCCCCCTGCCCTGCGTCCGCCAATGTCACCACCCCTACTTTTTTTTTT
GGAAATGAACGCTTTATATTACTTAACAGTAAGTTTATACCCGGCCTCTG
CATAGCTAGGATACACACAGCCGATCAATCACACAGTCTCGGACCAAGAC
AATAAAACAGGATTATAAAATAATGTAAATGAAGACACAGTTCTCCAAAC
TAGCTAAGGAAGATCTATCCGCAACGATTGCTGCCATCCATGTCGGGAGA
AGATATCTCGCGCCGTATTCTCCAACCGCCTACATCCCTTCGCAAACAAG
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ATAAATAAAGTCCCATATTTATCCTCAATCTCATTCATCCAGTTGCCAAA
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GAGCTGGATATTGTTCACGAAGAGAATTTTGGCCAAGCCATTTATCTTTT
CAGAACCTAATTTGTGAACCATCCTTAATATTAAAATTGCCAAAACGGAA
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GTTTCCAAACCAGTTTAGACACCGCTTTTGAGCCAACATATTTCCTCCAT
ATAATGGTTTGCCATACCCCTTCTTCGGTAAGAAGTTTGTATAACCATTT
ACCCAGTAAAGCGGTGTTTTTGACTTTTAAATCATGTATGCCCAATCCAC
CATATTCTTTGGGTCGGCAAACAACATTCCATTTGGCCAGTCGATATTTC
TTTTTCTCACTATCCCCCTGCCAAAAGAATCTTGAGCGAAAATAGGCCAC
TTTTGACAAGACACCTTTTGGTAACTGGAAGAATGAGATCATATACAGTA
CCATGTTGGTGAGTACTTAATTAATAATGAAGTCTGAAGTCTTTTTTGGA
AGAATGAGATCATATAGGCCACCGAGGGATAGCAATTTACCTTTCCAACT
ATTAAGATGTTTCTGAAGTCTTTTCTCGACGAGTTTCCATTCAGCAATCG
TGAGACGCCGATAATGTATCGGTATTCCTAGATAATTGATTGGAAAATGC
CCCTGACCACAACCAAAGAGATCGGCATACAGGCGGGCCTCGTCTTTAGC
CTCGCCAAAAAAATACAAGTCACTCTTATGGAAGTTTATTTTCAATCCAG
AGAGATGCTCAAATGCTGGTAATATTAATTTTATATTCTTGACTTTCTCC
TGATCATGTTTCATAAATAGTATTGTATCATCGGCATATTGAAAAAAATA
GATAGTCCACCACCCCCTACCTACCGTTCCTCCTCCGCGCGTCATCCTAC
TACCCCAGCCCTCTCGTAGGCACGCGCCCGTCCTGCCGTGCCCTGACTGC
CCTCTCCTCCGCGCGCTTCCGCCCGCCCGCCTCCTCCGGGCACCTCGTAC
GGCTTCCCAAAGCCCTTCTCTCCGGTGAGTACCCCCTCCCCCCATGCCTC
TTCCCCTCCTAGGGTTTCCCGGCCACCGCCGGCATCCACCTCCGCCCTCC
GATCTGGTTATTTGGAGCGGTAGAGGCAGTGACCTCCTCATGTCCTCCCT
TCTCCGGTACTCCGGTCTGGAAACAACGCCTTCTACCACATGATCGGCAG
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CGTCTGTTTCCTTATGCCCAGGAGCTGCACAGCGCAATTTTTTTTCCTGT
TTAGAGTGTGGACTCCTTGCCAGTAAATTACTGTTTGGAGAGATTCTGCT
CGTAGTGGTAGGACTCGGCCATACAGCTGACCAAGACAAAGATATGTATA
TCCGGTTTCAGAACACGCGTCAGGTTCTGCTGAGCACATGTAATCTTTTC
AACTGCATGTTACTTCACCTAAAAACCTTAAGAAACAATTCCAGCTCTTG
CCTGAAATCTTCTATCCTATGCTATTAATCTGTTTGATCAAAGTAACTTT
ATATTTAATACCAAAGTATATCTACATTTATACACAAGTAGCCAAATTTT
GAGCCATAAGTAGCTTCTGTGTATCCAAGTAACTCTATATTTGAGCCAAA
AAGTAGCTTTTACATTTTCTAGTTAAGGATAGAAGAAGTGGAGAATTCAA
GATGCAGACCATACATGTGGTTTTTAGGATATAGCAGTGCTTGTTCATGT
AGTTCTGATTTATATTTATACTTCAGACACGCAGGCGCGGACGCGGCCAG
GGGAGAAGAGGATTTCGTCCGATCGAGAGCCCAACACGACACACTTCAAG
CCTCCCCGTCCGATTCCACCGGCGGAAACCCCGATCGCCTCCGCCACACG
CCACGCCCCTCCGCAGTGCCCGCGCCCAGAAGCAAAACCCCCCACCCCAT
CCCACCCCACCCCGGCGGCGAGCCAGCCGCCCCCCTCCACCGCGACGGCG
GCGCGGTAGGAGCGCCGCGGCGGAGAGGATGGGGAACAAGATCGCGCGGA
CGACGCAGGCCTCGGCCACGGAGTACTACCTGCACGACCTGCCCTCCACC
TACAACCTCGTGCTCCTCGACGTCCTCTCCCGCGGCCGCTTCCTCAAGTC
CGTCATCTGCAAGCACGACGAGGGCCTCCTCCTCGTCAAGGTCTACTTCA
AGCGAGCCGGAGAGCCCCTAGACCTCAAGGTAACATCATACATCCTCCCC
CCTTCTCCGATTTGGGCGGGAATAATCGCGTCCTGAGATCTGTGTGCCTG
CTACTCTTGTGTGTCCCGCAGGAGCATGAGCGGAGGCTGGAGCGGATCCG
GAGGGCGTTCCAGGGGCTCGAGGGCTCCCACGTCTTGCCCTTCCAGGTGA
CCACTCTCTCCTATGCTGTTTCAACTTGTGTATTAAGGAAACATTACTAC
TCGCTGTTTGTTAGTGTTTTATTTTGTGGCATTTAGCGAGGCTTAGTAAT
TTTGTCATGTCATGTGTACTATTATCATCTCTATTTGGCTTCGGCGGGGA
TTGTATAGTGTGTGTATTCAACAGAGACAGCAAGGTTGGATTTATTAGAG
TAAACTGGTTTTAGGGGTTTCTGCTTCGGGGACTATGATGCCAGGTTAAA
TTCTGGTTTTCAGGTTATCCTTTAGCTGTTTAGGAGTATGCTCACTTTGA
TGTTTTCGCATTTGGCATATGCCATTACATATCAATGTGGAAAGACAGGC
TTCGTTACGCAGACGAGCCTTTTCTCTCCCTTGGTTGACACAACTTTGTA
TGTTTTCAGGTCTGGTTTCAAACAGACAAGGCAGCATATCTCCTGAGGCA
GTACTTCTACAGCAATCTGCACGATAGACTTAGCACACGCCCTTTTCTCA
GTCAAATTGAGAAGAAATGGCTTGCTTTTCAGGTGAGCCCTCGTCCTTTT
TATCGCTGCTGTAGGGTGGTCATTAATATTATAAAGCTGAAGGAATCAAT
CATACTGGTGACAGTAGGAAGTTATACAGCCCCTCTGTTAAGTGTAGATA
TAAATCATGCATCTCAAATTAGTAGGACATATGTAAGAGTCATTATTTAT
TTCTTTCCTTTCCAGATATGGTTGTCGACTTAGCTCATTTGGTTGTGCAG
TTAATCCATGCCGTGGAGCAGAGCCATAGTAAGGGAGTTTGCCATGGTGA
GAAGGTTTTCTCCAAGTTATATTGGCAGAGGAGTTTTTATTCCATTTATA
TTTACACTGTTTTATCTGTTAGGTGACATAAAATGTGAGAATGTACTCGT
TACCTCATGGAATTGGCTGTACCTCACGGACTTTGCGTCTTTTAAGCCAA
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GGAGGAAGGCGGAGATGCTATCTAGCACCTGAGGTTTGTCCCTTCACCAA
AATTAGTCAAAATTTCTATGCTCTTTTATCCACTGTATCACACTTTGCCT
GCTCTCATTGGTGGAATTGCTACATGTTTATTAATGGATGCTCTTCATCA
AAATGCTTGCTCTAACTGTATCTTCATCATTCAAAATAAAGGAGGGCACA
ATAGGAAATACACACTTTTTTTTTGAAAAGGGAAATATACACTTAATAAT
TGCTTTACGCCGAATGAAAAAATGAACCAAAAACTTTGGCCCTGTAATAT
GGCATGGAGCAAATAGAAGAATATGGCAGTCGGAAGATCTGTGTAATTAT
GCCTTACAAAAGTTTAATATTATTACAGTGGGTGGAAGTACTCACTTATT
TGAGCATTCATTGATCGAGCCTGACATTGCTACTGAAGATGTAATAGCAT
CCATAGCATGTTTGTGATGTACTGATTTATAAGGACTTAAGGAGAGACTC
TGTACGTTGATTTTGAAGGCAGTCCTTGTATATATATTTTATAATGCGCT
GTACTTTTATGCCATATCTTTGATCGCCTAGAACTTCTCTGGCACATGTT
TTATTTGTACTTTGAAAATAAACTAAATTCCATCTTTTGACCAGAGATTC
CATGAACACGGTGGTGAGTCCCAAGTTTCAGCAGATGCACCTTTGCAACG
TTCTATGGACATGTTTTCTCTCGGGTATGCAGTATTGTCTTGTGTAAGAT
CTTTGCTAATTTGGCCGAGAGTTGTGTTATTTCAGTTCTATATTTCTTCT
TTCCATTCACATTTTAATGATAGATACCTCATCACTATCTTTTGCACTCA
CATATTAATGATAGATACCTCATCGCATATTAAAATATAAACTGAACTAA
TAGATTTCTTATTTTATTTTTCACCAATGGTATATACTATTTGCCTTATT
TCCAGGTGTGTTCTTGCTGAACTTTTCCTGGAAGGTCAGCCCCTCTTTGA
GCTCTCACAAATTCTCGCTTATCGGCGTGGCCAGTATGACCCTGTGCATA
CCCTAGAAAAGGTTTTTCCGTTATTTCTTGCTCTTTGAAATACTTTCTCT
GTTTTTTTCAGAATTATTTTGCAGTTGTTGCTAACCTAATATATAACTTG
AGGTTGACATGTCTGGCATTCACTTCTGAGCAACTGTATACCCTGGTAGC
TCCATGGGTGCTTGCAGAAATACTTCTTGTTTTAGGGCCAGTAATATTTG
TTTCTGGTGAAGTAGGACCAACAATTCCTTTAAACATGTTCTTTAGAGTG
TACTTGATATTGAATTTTTGTGACCAAAACACATGACTGCTTGGATATTC
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CTAGATAACAACACGAGTAGAATAGGAGAATTGTGAATGTATGTACTATA
TGATGCATAACTCTGGGTATCTGCCCAAATATTGGTCCTGAACTGAACTG
TTCATACCTCTTGGACTGTGCCTTAGAGTAGTAGCTACTACTACTGCCTA
TCGGAGCATGACATGTTTTTCTGAAGCCCCAAATACGGGCAATTTTAAGT
TGATGATCCATTGCAGATTTAGTGCAATCTAGAGCTTCAATTGGTAATAA
AATTTCCATTGTCTGAATTCTCACTAACTGAGTAAACAATGGAAGTGCTT
GGTATTCATCAAGCTAATCAACTTGCATATAATCAATCAATCAAAGGGTC
TGAATGGTCTTTCATGTAAAATATATATTTTCTGTGTGGACCTAAATCAA
TTAAAACGAACTTGACAAGTCTGTAGGTACACATTCTTTATTTGAATTCA
ATTTTGAAACTTATATGTACTACAAATGCATGGTGTAGGGAGTAAACTTA
CATGCTTGCATACGAACCTGCTTGTATTTGTGCGCAATGTGCCACTGATT
CTGGTGCTATGTGATGATGTCACCTAACATTAGGATTGGTACATTGCTTC
GATATATACCAGCAACTACTTATGTCTGTTGTTCCATGTATCACAAGACA
AAGTTATCAATATTAATTTGTGCTTTCAGATACAAGATGCTGGTATCCAA
GACATGGTACTTCACATGATTCAGTTAGACCCCAAAGAAAGGCTATCATG
TAAAAGCTATCTGCAAAAATATGAAACTGTTGTTTTTCCAACATATTTTT
CAAGATTGCACAAGTTCTTCTCGGATATTGTTCCACTTGGCTCAGATGCT
AGGGTAAGGATTGTTCAAGTTCGTGTTCATTTTCTGGTCCATCCACTTTT
CACCATGAACATGCTAACATAGTTTACTTAATATATACAGGTTGAGAAGA
CACAAGAAAATTTCGAAAGGATACATGATATGATGCTAAGTGGCTTAATA
GGTGAACAAAATCAAGTATCTGGGGAGGAAGGCATTGGAGGACAAGTTAC
AAATTCACCAAGAGAATCTGCCAAAAGCACATCCTTAGTTAAGAGAAATA
TTCCTGGAGACCACCATCAGATTGCCGGAGACCTCAATCTCCTTCTCAAG
GAAGTGGAGCAAAGGAACAACCATGGAGACACAAAGGCCATGCAGTACAC
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TGCAGCAGGTTAATCAAACTCAAAGTCAAACTGCAAGTGTCTTGGCGGTC
AAGAACAATGATGCATCTCATGTGCACAAGATATCCAAGAGTAACTTACT
TGCTTTAGTGTCTGGTTATAATGCCCAATCGGATACCTATAGTTTTGACA
TTTTCCAGCAGACACATTCCAAGGTGAGCTGTGAAGGCATGGTCTTGCTT
GCCTCGTTAATCTGCTCGTCCATACGAAGTGTCAAAAAACCAGAACTGAG
AAGGACCGGTCTCATTCTTCTGAAGATTTCTTCCACATACATAGATGATG
ATAGTCGCTTACAGCTGGTTATTCCCTATGTTATTGCAATGCTTTCAGAT
CCAGCTGCCATAGTTCGCTGTGCTGCTTTGGAAACCTTGTCTGACGTTCT
CTGTCTTGTTCAAGACTTTCCTATCAGCGATGCAATGATATTTCCTGAGT
ACATCCTGCCAATGCTCTCTTTGCTACCAGATGATACAGAGGAGAGTGTT
AGAGTTTGCTATGCTAGTAACATTTATAAACTAGCTTTAACAGCTTATAG
GTTCCTGCTTCGTTGTCGGAGCATAGCTGATGCTGGGCCTCTAGACAAAT
CAGCGGTAGCTGCTGTATCACAGTTTGCAGATGCACCAGTGAAGAAGCTG
GACGATAAAATTGATCGGCAACTTGCACGTCTGAGGAGAAATATTTATGA
TATAGTGCAAGAGTTGGTAATGGGACCAAAGCAGACACCTAATGTCCGCA
GAGCTCTCCTGCAAGACATAGGTTACCTATGTTACTTTTTTGGGCACAGA
CAAAGTAATGATTTTCTTCTTCCTATACTTCCAGCATTTCTAAATGACCA
TGATGAGCAGCTCCGTGCAGTTTATTTTGGTCAAATTGTCGTTGTTTGCT
ACTTCATTGGTTCAAGAAGTGTCGAGGAATATCTCTTGCCCTATCTTGAA
CAGGCACTAAGTGATGATATGGAGGCTGTGGTTGTAAACGTACTGGACTG
CTTAACCATGATGTGCAAAAGCAGTTATTTGAGGAAAAGGGTAATCGTTG
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TGTAGATACTTATGTGTACCTTTCTCCACATCTAAGGCATTTTCTGCACA
GGGAGCCACCTTCATTGTCTGAAACTGCTCTTCTTGCATGTCTTAAGCCT
CCAGTCTCAAAATCAGTCTTATACCAAGCTTTAGAGGTTGCCAAGGACAC
AGGAGACATTTTACTGAAGGGTGATGGTAAAAAGGAACAGACATTACATG
GTGGAAAAATTCCTGCTACAACACAAAGTGGGCCCTCGGCCACTCTGGAA
GATGCTGTCAGGTTGAGAACATCTAATTTGTCAGGCAACATGTCTTTGGA
CATCAAAGATTCAAATTCTTCGGATAAGTCGTTATATTATGGCTACGCTC
CACATGCATCTACTGTGAATAGTTCATTTTATGATGGATTATCTAAAGGA
ATACCATCATATTCGGTTACTACTGATAAGCGTGGTTTAGGGGAAATATA
TATGCCCTGGGAATCCAACCGGCATCCAGGTTTATCAAGTTCAGTTCAAG
GCCTCCAGACTAGAGAGAATCATTTCAGTAGCAGGCATGGTGATTTAAGC
ATCAGCGACTCAATGAAGAGCAGCTCGTCTGTCACAGGTGATGGAATTTC
CAACTCCGAGACTGCAGTATCGCCCTCCTTCTCCAGATCAGCAGTGGCTC
TGGAGACAGGTTGGAAGCCTCGTGGAGTTCTAGTTGCACATCTCCAGGAA
CATCGGTTGTCTGTCAATGATATTGCGGTGTCAGATGACAACGCCTTCTT
TGTGACGGCTTCAGATGACTCAAGTGTCAGGATATGGGATACACGAAAGT
TGGAAAAGGACATCGCCTTCAGATCAAGGTTAACCTATAGCCTGGGTAGT
AGCCGAGCTCTGTGTACAACAATGCTTTGTGGCAGTTCACAGGTTGTTGT
TGGTGCTAGCGATGGCGCATTGCACTTGTTTTCTGTTGACTGCGCACGTG
GTGTTGGGAGTGTTACAGAGAGGTATTCTGGCATTGTTAATGCAAAAAGG
AAAGATCTGAAAGAAGGTGCGATTCTCAGTGTTGTAAATTGTTCATCGGA
CAGCTTTAGCCCAACCATCCTTTTCAGCACTGAACATTGTGACATCCATA
AATGGGATACAAGGACCAATTCAGAATCTTGGTCATTTAAATCCTCACCG
GAGGAGGGTTATGTCTCGGCACTTGTGATGGGCCAGTGTGGAAATTGGTT
CATCTCAGGGTCTTCAAGAGGTGTTCTTACATTGTGGGATCATAGGTTTT
TGCTGCCTGTTAACTCATGGAACTATTCCACAGTAAGCCCTATTGAGAAA
TTATGCTTGCTTATACCACCACACAACTCAATATCTTCTGCTGGAAGACC
ACTGGTTTTTGTGGCCGCAGGCTGCAATGAAGTTTCTTTATGGAATGCTG
AGAATGGTAGCTGCCACCAGGTAATTAAATACTAGCTTTCTTGTACAGTA
TTCTCTTGATAGCATATCTCATTTATTCGACTTTGAGACATCACTGATGC
CACACCCTCATAAATGAAAGACTATTCTTTCCTGATTTAGAAGCTCCCGA
TGCTACTTCACATGATTTAGAATGTGAAATCCCTGCTCTCTTTTCAGTGT
TTTATGAGCTTCATAGCATTTTGTACAAGTGTCAAACTGTCAGCACTTCT
GAAAGATGGATATATCTAATACTATGGTCAGTATCTGACACATTGAACAC
ACTGTACAGATGTTCAGGACGGCAAGCACCGAGAACGAGTCTGTTATGCC
AAAGACACCATCAAGGCCTGTTAACAAGACGAGCAACAAAGATATTAGGC
GAGTAGGAGGCTACAAATACAGAATCGAGGAATTGAGTGATCTGCCTCCA
CGCCTTCCAGGCATCCGTTGCTTGCTTCCTTTGCCAGGGGGAGATCTGTT
GACTGGAGGAACAGATTTGAAGATACGCTACTGGGACCAGGCCAGGTTGA
ATACTGCTACACATGCTCTCCCTTGCTTCTTGCATGTTTTTTCTTTCACC
ACCTGTAATATAATATGATGTATTTTTATGTCTGATTAAATATAACGTAC
TTGTATGTTTGATTATTTTGAAGGCCCGAGCAAAGCTTCTGCATCGCTGG
TCCTTCAGCGAAAGGAGTTGGAAATGACGAGTGTTATGATATAAAATCCA
GCTACGGTGTGCAGGTTGTACAGGTAAGTTTGCAGAAACAGTATCCATTT
GTTTTATTTCTGTTGCCTATATTCTGGAGTTACACAGTAGCAATTCATCC
ACGATTATTTGATGGTTATAATTCATCCGTGATTATTTGATTGCATCAGA
TCAGTTGTCGTGCTAGTAAACAGCAGGGGGCAGTCTCTGTGAATCTCACC
TGATGCTAACAGAATACTAACGTGTTGTGTGCAGGAAACGTGCAAACAGC
CTACGCCAGCGTCCAGGCTGACGCACAAGACGCAGCTCGCGATGGCCGCG
GCCGATTCCGCCGGCTGCCACCGGGACGCGATCCTCGCGCTGGCATCCGT
CAACCTGTCGAGCCAGAGGCTGATATCGGGCAGCAGAGACGGTGCCGTCA
AAGTGTGGAAATAGCTAGTAATTCATTCCATTCCAGATGGGGATAAACCA
TCGGAAGCTGACAAAGCCCTTTTTTGGTGTACATATTTAGCTCCATGACA
CTCACAGTACATATATATCATGACTCACTGTTGTAGTTTGATGGAGACTC
ACTCACTGTTGTACAGTTGATGATGCCAGATTGCCAGTCAATACGAAATG
AAAAAGTTGCCGTGTATGTATCACTGCCCATTTGGACCAGCACTGCATGA
CCAGTTGTTTGTTGGTAAAGACATGTTGTTGTTGTGCATTCGTGCTGTGC
TTTTGGTTTCGGCATTAGAAACAGTGTATAACTGAGTTAGTATTTGCTGA
TCAATTCTTTTTGGGTGGTTCATCATCTTCAAATGTTTAAATCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.