Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043119

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043119
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043119
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCGTAGCCGGATACAGAGGCCGGAGCCATATCTCCTTTTAGAAAAATA
AATATCCCAGAGCGGCAGAGGGGAGATTAGCCAGTTTTTTTTTTAGATTA
GCCAGTTGGTAAGGAAGGTTGGTGAGGCCGGGTGACTGCGACAGTTCGAC
TGGGAGGTGACGGGCATGGTTTAAACACGAAGAAAACGCAGCTGGAGCCT
GGAGGGGAAGCGCGCGGCTGGTTGTGTTGCAGTCGGCAAAGCCTTGCGGT
TGCTGGCGCAGAAAGGGGAGAGGGAAAGCAGCGCCGCGGCGCGCTCCGTC
CCTCGAACCGCGACATGCTGCCGCGCTCCCACTCCCACACGGCGAGGCGG
CGCTCCGGCCTCGGTCCGCAGCTCTGCGCCATCGCCGCGGCGCTCCTCCT
GCTCCTCTCACTCGCCGTCCTCCACTCCCGCCTCTCCTCCTCCTCGCCCT
TCCCCCTCTCTTCCTCCCGCTCTTCCACCTCCGACCCCGCCGTCACCAAC
TCCACCGCTCTCCTGGCGGACGACGACGACGACGCCGTGGCCACCGCGCT
CGACCCCGACCTCACCCTTACCACCGTGACCACCACTGTCGCCACCGAGG
GGGCCGCTACTATCAACCCCGACGACGACCGCATCGACGAGCTGGACGTG
CTCGACGAGGACGACTCCTCTGCCGTCACCGAGTCAGCGGACGACGTGTC
CGCCTCGGCGACCGCAGGGTCCCTCCTCTGGGACCACGCTGCCGGCGTCG
CCCGCCAGCCCTTCCGCCTCCCCACGGCTGGGGACGCCCTGCCCGTAGGG
GTACCCCACTTGGATTCGCCGCGTCGGATCGCCGCCGCCGCCTTCGGATC
CGACGACGAGCCCGTGGATCTGGAGCTGCGGGTGGAGATCTCGTCCATCA
CCGGGGTTGAAGACGCGCTACTCCTCAAGCCCGGCCCCGGCCGTAGCGAG
ACGCGGCTCCGCTCCGGTTGGGCGCAGTGGCTGGAGGGCAAGGCGGACTA
CCTCCGGCGCGATCGGATGCTCCGGTCCAACTTGGAGCTCCTCAATCCTC
GCAACCACCCCTTGCTCCAGGACCCGGACAGTCCCGGCCTCACTTCACTC
ACCCGGGGCGACCGCATGGTGCAGCGGATGCTACACGCAGAGATTGAGAA
AGACCCCTCCATGAATTTTGGGAGGCGGAGCCTCCAGTCGGCAGACATTG
AGCATGGAACGGGAGCTACTGTGGAGGAACCAAAAAAGGGTAGGAGGTGG
GGATACTTTCCAGGAGTTGATCCACATTTGGGGTTCTCGGACTTCATGGA
GAAGTTCTTTGAGTACGGGAAGTGCTCCATGAGGGTGTTCATTGTGTGGA
ACAGCCCGCAGTGGGCATACGGTGTTCGTCACCAGCGTGGCCTCGAGAGC
CTGCTCCTGCAGCACCCTGACGCATGTGTGGTCATGCTATCGGAGACACT
GGAACTGGAGGCCTTCCAGGAGTTTGTGAAGGAAGGGTATGTTTCCTACC
CTGCTCATTTGATGGTGCTTATAGTTTCATTTGGTTTTGTGAATCACAGA
TGGAGTGATTCAAGTTTCTAGTGTCCTGATTTATACACTGACACAAAATA
CAGAAATATCATACCTCCAACATTAAACCATGAAGGAACTAAATTAGAAC
CATTTGGTGCTACAGATCTTTCTTCCTTTCTAATATGTTTACCAGTTGTT
GAGGAATTTGTTGGATACAGTCACCTATGTATGTCAAAGAAAGGAACACC
AAGTTTTAAGACTATTGCATGCATAAATACACATATACTACTCTTACTGA
GTAGCAACTTCGTTCAAGGGAATGCAATCTCTACTGTTGCATTTCTAATC
CCATCCTTGACTGTCATCTCTTTTCATTAAAGATGGCATAGTTCTGTTCG
GTATTGCAATCACACCTCTTCAGAATATTGTGTTCACTGGTTTACTTCTT
AGGATATAGAAGCCTATTGTGTTCTGGTCCTCCACTATTCCAGAGGAATG
AGAACAAATTACTTGCTGAACCCAGAACCCCAAATCTTCGAATAGAATAT
CCAACAGTAGGACATGGGATGAAATGGTAGTTTCTTGTGCCTGGGTGTAC
AGATTTGGTTAGTGCCACACAAGATTATAATTTAGTGTCTAAATAATCAC
ATTCAGTTTCTGTACTGTAACGTTGCCTCGATTAGTTGCAACATGAAAAA
GGCCCCCGTCTCTTATATTATCGCTTTTCAGCTCTGGATTCAGCTTACAT
GAAGTTATGCCAGAGCGAGTTATGGGTGGATGATACACATATGGCCCCAT
TTAAGTTACTTAGCTTTCTAGAATATTACAAATGATGCACCTAGGTACTT
CCGTACTTGCTTAATCTGCGCTGTTTGCTGCAATTTTCTCATTTTCTGAA
TTCATCCCCTTCAAAAGGTAAACTGATGGTTGTAGTCCGTATGTTTAGTT
CAGCAAGATTCATTCTCTACAAGTCAATACATAATCGATGGTCTGGAGTC
CCAGGAAGCGTCCTAAAGAGCAACATACAACTAACATATGCATGTTCATT
CTAGAGATTCTGCCGCAGCATTTATTAAATCATGCATACAATATGTGACG
AATTTCCGTGCTAATATATTGGAAGCTCTTTTGATGAACCGTTTATTAGG
AAACTTGTTTTCTTTTTGTACTGATGGATTGTTTCATATATGTACAACTG
AATACCCAATAACTAAAAATAGCATCGAGTACCGAGTCATCTAAAATTAT
GTACAATCTGAAGTTCCCTACCTTTTGTTTCAATGAATGGTGTCTTTTGG
TGACTTGTTCCTTGATTATCAAACTGACGTCTGAGATCTTCAAAATATTC
ATTGCATGTTATAACATTTTGAACTCAAATTTGGTAATCTTTCATGACAT
ACCATATGCTTTCTTTAATTCTTATCGTCGATGGATATAAGTGTCTTTTG
AGCTGAAATGATACCAATCTAAGATCGCATCTATACATGTGCTGTAAACA
TGTGAAACATCAGCTACAATAGATATGATTCACAGGAACATTGGCATGAT
GCTGTAGCCGCAACGATTATTCAGAATTCAGTAGACATGTTCAAGTAGTT
TCGATAGAATTCTTTTCGTATTCCGTCTTTATTTCTGTTGTGGACTTGCG
TTTCTCCAGTCATATGGAAACAGGCAAGCAATCCTATGCCAGCAACATGC
GAGCAGAAAGTCCACACTTGCACGCTAGGTTGATTAGTAGTTTCCTTTTA
TCCGCAGTTAGAATCCATATTTTATTTTATTTTCTTCAGGTCCAACGGAG
GCCACCAGAAGCACCGGTTAATATTGGGGTTCTAAGGGGTATCGATAATG
TAAAAAGGGGTAGAGGACGACCAAAGTTGACATGGGTGGAGGCAGTTAAA
AAGGGACCTGAAAGGCTGGAATGTACCTAGAGATTTGGAGTTTTGGTAGG
GCGGCATGGAAATCAGCAATCCATGTGCCCGAACCTTGATTTACTCTTTT
GCTCTTTTATTTACTTGCACTTTCCACTAGTTTCTGCCTGGCTTGCGCTT
TTCTCTAGGTGCTGCTTGTCTTGCACTTTTCACTAGTTTCTGTTTGGGTT
TCATATCTAGCCTACCCCAAGCTTGGTTGTTGTTGTTATTGTAGGGCCAG
TTGCTATAATAGGGTACAAAGTTCTGTTGTGTTCTTCCTTGACCATTTTA
GACCGGTTTCTCTCTTGGCCGGTGCCCTCCTTCTAGCTCCATCCAGCTTC
AATGTGTCTTTGTACGACCTCCCGCTACCTGTTTACAGGGAGACCCTGAA
CCAAGCACTTTTTTTTGTTCCCCTCCCCACAGAGTTTTCCCTCCATGTAG
TCTGTCCATAATATCCTCTTACACTGTAAGAATGCACACATGCTTCATCT
TGCTCTGTACCCCTCTGCACCATCTTTATATGATTGCCTACAGTCAAGCG
ATAGATATACTGAGCTCTTCGACAACTTGCTGATTTACTATGGCTTATGT
GCACCATACACCATCATGATTAGCACCTTACTCCTACAAAAACATCTTCT
CTGCTTGTTTATAATACTCCTGTAAATTTTGTAACTTGAAGATCCTTTTA
GTTATCTCTTCCTTTTCTACCACTAGTATTTTTCGTGGTAGTTAGGCACT
GCTATTTGTAGATACAGGAACATCATCAGATTTGTGTTGTTAGTAACTTA
GTATCTACCAGGTGCTGGAGACAAATCATGCACCCTCAGTTGACCCGTAG
TAAATTACAGAATCATGAGCTCTGAAATTTTGCATGTTGAACACTTCGCC
TTTCATGTTGTTGACCTTACTTAGAATTGTTTTTACAGTTCTGCCTGCAT
TATTATTCATAGTCTATTTTCTTCTTTGCAGATACAAAGTTGCAGTTGCA
CTGCCAAATCTTGATGAACTTTTGGAGGGCACACCAACTCACATTTTTGC
ATCCGTGTGGTATGAATGGCGAAAAACAGTAAATTACCCCTTGCATTACA
GTGAGCTAGTACGCCTTGCTGCCCTTTACAGGTAAGGCAATACAATAATT
ACAGGCTAGTGCCAAATCTTATTTAGTTATGTGCATAATCTACTTTACAG
TCTTTTAAAACAATCTAGTCAGACAATCAAAATTTTATGCTATTCAGAAG
GTAATGGACCCATGCAGAGTGTATACCACACCTGCAATGTATAGTCAAGT
AAAACACACCTATGGATGCAGGCGGACGTCCGCCAAGCACTCCAGGCATG
TCCGCCTCCTTTCCAAATACTGATTCATCTCCTAATTATGTATCATTACC
TAAATTTGCATGCAGTCATTTTGGCATTGGCGGATTGTCCGTCCAGTCCA
TTGGACTGTCCACTTGCATCCCTAAACACACCATCAGTGAATAATTAAAC
AGAATACACCAGTAACAGTAACACTCTACTGATGAATAGTCAGGTAAAAC
AGTCAAGTTAAGAAAGTGCCTTTCATTTGGAAGCAGATGACTCGCAATAC
CATCGAAAGTTGATGATCAGCTAGTTGTTAAATCAAACAATACTCTCCCT
CAAAAAATAAAGGTAAATATAACAACACTCCAGATCAGTTAAAACTTAAA
AGTACAAGTGAACAGCTGATATGAGAAAACAGCAGAACTTAAATAGCCAT
AAATTGTATAACATAATTGTTTCTAAATTGTAGAAGATCAAGCATCTCAA
ACTGCCAAAAACAGCACAAAAACAGAACGAAGTTCATACTGAGTTGTCAT
AATCAATCTTAATTTACCTGAAACCCCATTTCTACTGTCCTAACCAGATA
AATATTTTGCTCATCTCTTTCAGCAATGAACAGATAATAAAGGCATATGA
GATTAAAATGATGCATTTTACATAATTAACATTCTCTTGATCTTAGCAAA
TGAAATAACTATTCATCAATTTTTATGTGAGACATCTCTGATTACTGGAC
CAAAAATATGAGATATCTGTATACTTGAATGTTAAGATGTCAGATACCAT
CACAAGTGCTTTTATTTTGTGAAGAAAACTGATTAATTCTCTATGTGCTG
TATATGCAGATATGGTGGTATATACCTTGACTCAGATGTTATTGTACTCA
AACCTTTGAAATCCTTCCGGAATTCAGTTGGTACTGTAAAGCAAGTTTCT
AAAGATTCCAGTTTCAGTGGTGCTGTATTAGTATTTGAAAAACAGAGGTA
ACAATAGTTTTCTGTCATCTTCTCTACAAGCATTTCCCTTTTTTCTTTAT
GCTCTGGACATCTCAAATCATGTGCATTGTATTTATGCATTACAAATTAG
GCATTGATTTTGATTGGTTACCTGTCAAGGTCATAGTTCTTGTTGTCTTG
GTATGTAATGTCAAATCACGTGCCTTGTATTTATGCATCACGTGCCACAG
AACTTGCAGATGGCCGGTCAAAGGACAAAATTTCACGTACACAAATAGCA
AATTCACACGAAATGTCCAATGTAATATGTTAGAATTCCATTGTATGGGT
AGCGTGTCTTTATAAGGTTACTTGGACAGACCCGGTGCCATCTTTTTTTT
TCACGAAAACGCAAAGCATTGCGCTTATATGCATTGATAAATATAGGTTT
ATGTACAAGTCTGAGTCCGGACCAACACCTCACCATACAACTCAACCCAA
GCCAAGCTAGGCGATCTAGGGAGCAATTGGCAAAGGCTTATAACCCCTGT
GTCTGCCTATGAACGTGCCTCGGCTTGAAGTGTGTCAAACAAGGTGTCTA
CAGAAGGCCAAGCATTGTCGAAGATGACTGTGTTGGGATAAACCAGTACC
GTCAATCATGTTATTTGAAAAAGAACCTTCAAATTCGCCCTGTGAGGCCA
GAAACTCCCACATTAATAGGAGAAAATAGAGATTTGTCTAGACAGCTTAT
CTTAGTGGGTGTAGATTATAAGGTGCAGATCAATAAACATTGCTACGTTT
GTAGGAGAAATATAGTTATATTTACAGTGATAAGCATTTAGAGTTGTATA
ATATATACAACTAAATTCAAATATAAATGCATTATAGGAGTGGCATCTAG
CCGTTTTGCTTTGATGGGTAATTTTGTTTGTTGAATTAAAATCAGAGAGC
TAATTCTATCCTACCAAATGCATAACTTTGGAGCTTCCGTCAAAAGGCAG
TGTCAGCTTGAAAATGCTACTCCCTCTGATCCAAATTAATTGACTCAACT
TTGTCTAGATACGCATGCATCTAGTCTATATACTCAACTAGATACATACG
AATCTAGAAAAAGTTGAGTCAATTAATATGGATCAAAGGGAGTATGTTTT
ATTGTAGCAAAAACTGTTATAAGTGGGCATGTGGCCAGGTGTCAAATACA
GGCTGTTTTAACTCGTGATGTTCTCAAGCTCTTCTATCATCATGACTACT
GCTAGCCCATGCATGCGGTTTCACACCTTACTTGTGCTGACTGCAGTCCA
TTCTTGGCGGAGTGCCTGAAGGAATGGTATTCAACATATGATGATACTCT
GATGCAGTGGAATGGTGCTGAGCTTATGACAAGAGTAATAAGAAATCATT
CTGATAGTGATCAAATCAGGCAGCATCTTGAGATAAAGTTGGAACCCTCA
TTTACATTTTACCCTATAAGTTCTACAGATATATTGAGGTATGTAGTTTC
TGCGTCAATAAAGTGTTTGCATGTCCACCTTGTTCAGTTTTTACTATTTG
GATGTAATATTCTGCAGTAAGATTTACGACTGTTAGTCTGTGCATCAAAG
TTTGACCTCAACAAGCCATACAAACTTTTCAAACTAGAATATTTACACTT
AATATTGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAA
GAAAATGTATCTAGACTTCTTTTAGTGTCTAGATTCACTCTAAACCTGAG
TGAACCTACATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAA
AACATCTTATATTTTGAAAAGGAGGGAGTAGTAATTTTTGCTCTGTCTGG
ATTTCCAACACCCATTTGTTAAAATGCAGGTATCAAATTTGTCTACTGTT
ACTACTACCACTAGGAAATAGCATAACTTTTTCATGGCTGATGCTTTTAT
AAGTTGTAACTGCATCTATGTTTGTAAACTATGCTTCCTGATCCTGAACA
TTTATTTTCTTCATTTGCATTTAGTATGATCCTCAGCTAATCTTTGGATT
TGATCCAGTCGAACATCCTGAAAGTTTAGTATGCACCCCTGCAGAAGAAT
TTACTATTTGCATATAAACTTGTTAAAAGTATTGTGTAAAGAACAAAGTA
ATTGTTGTTTCTTCAGATGTTCGCCTAGAAGCTTAGTACTACTAGTTAAA
TTTGCTGTATCACTATATGGACACTGACTGTGGTATTGATGTACTGCAGT
TACTTCTCAAAACCAGACAATGATGCTGAAAGGGCAGAACATGATGCTCT
GTTTTCCAGGATTGTGAACGAGTCCACCACTTTCCACCTCTGGAACAGCA
TTACATCTTCTCTGGTTCCTGAATCTAACAGTCTTGTTGAGAGAATCCTT
AACCATTACTGTCTCCATTGCCTTGATGTTCTATAGTTGATAGCTACCTG
AAGTTCGCACAACGAGCTTCGTTTTGGTGTAGATTACATATACAGAAGAA
ATTCACCAGCTTAATGGGTGCAAAAAAGGCCAGCATTTCATTATTGGAAT
CGCCTTGAAAACTGAAATGAGGAAAACTATATGCTGACATTGTAGATACG
GAGTATATATTCTTGTCAGCAGGCTTACGGTGGTGGTGCTACAGGCAACT
TCCAAGTGTGTTGACACCTATTTTTCCGTTGTCAGTGTTGATAGTAAATC
CGCTCACTGCAATATTGGATGCAGCAACTTAGGCATTTGGCACAGAGGTT
TGAGTAAATGAGTAGCTAATATTCAACTTTTGTTGTTGTACTAATATCTT
ATTTGTAATCTGTGCAAATCATTTGTAAGCGACCATTTATGTTAATATTT
GGGATGCTGAAGTAATGTTGCAAACACTGAGGTTATTGAAATAACTGTCT
CGTCAAATCTGCAGAACTATTTCATTGAATTTGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.