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GrainGenes Sequence Report: AA010989

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Sequence
AA010989
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010989
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAATCTGGCCCCACACACGGCGCTCCGCGATTCTCCGTCGGCCCCGAA
CCAAAATCCCTCCCATGTTCTTCTGGTCGCGTTCCTCCTAGAATTTATTT
GTCCCAATTCCAAGTCCAACCCGTAGAAATTTTGACGTCCTTGTCCCCGT
TCCGGCCCTCCCCCCGGGCGATTCCCGCAACCCGAAGGGAAACCACCAAA
AAAATCGATCGAGAGCGCGTGCGGCACGGCAGCTCGCGGAGGGAGGTTCG
CCAATCCAACCAGATCGGACGAACCCCCCGCGCCGCGCCAGCTGTTCCCC
TCGCCCCGAGGCTTCCATGAACGTGGAGCGCCTGCCGGCGGAGCGCCACG
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TTAAACTTTGCTGCAAGTGCTGGGCTACAAAAAGTTAGGAATGCATTTAT
TTTATGAATTGAGTTTTCAGATCAAATTTCTTGAATATGCATTGTTATAT
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TAGTTCACCCAATAAATTCTAATGTTTCATGTCAGTGGCCAGTATGTGGT
TCCTGGACAAAAATGATCAGGGGTTGTTTTGTTGGCTTATTTCTGGCTTT
TGCACTTTGGCTTTTGACTAGACATTGTTGCATGATGGTATAAGCCAAAA
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TTGATGTTGCGATATTTTGATTTGTTACATTACAAATTAACTCTGACTGC
TCACCAGTCTGTCCTTACTCGGTAATTTGGTGCATGATTTAGTGGTCAAC
ATGTTGTGAAAACAGTTTGTGTTCCCTTCCGCATCGCACCGTAACGTGCG
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ACATGACACACTGTATGTATAGGTGCACATGTTCATCCACACACAGACAA
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CTCTTGCTACATCTCATGTATAGTGTGTGACCTGTTGGTAGATAATTTTT
GTGATACATATTCCTCCTAATACATTATCTGATGTTATTATTCCATCAAT
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TTTGAACTGGACCCATTATTCTACCATGCAAAAAAACTGTTGCAATCTCT
TCACTAAGAGGACAAGCAACATAGATACAATCATACAAGAGTCTAGGGCT
GAATAGTCCACTGTCACTGGAAGCGCAAAAACACATGCGAGACAACCAAC
GTTCAAAATGGCTCTAGGTGCTAGGCAGGTGTTTTGTCACCACCTAGCAC
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TGCAGCAATAAGAGGTAATTGGTTGAACAAGTCGTGAAAATGGGAAAAAA
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AGACCCATGTATGCTTCCTAATAATCTAGGAATCTAGGAGGGTTCCCAAT
CCAGCCATCTTTCTCCCTCCGCTTTTCTCCTCCAGTGATGGCCACGGGCT
GGCAGAGCTCGTGTCTCACCAGAGAACCTCGATTCCTCGCTGGAGAAAAC
TACACTGCCTCTCTACCTCCGCCTCTCCCTCGTTCAGTGATGGCGACGGA
TTGGCAAGGCGTTCCTCGCTGTAGGAAGTCACCGGCCAACTTTACCTCTG
CTTTGGCGCCTAGACCTCCACTCATTCAAGGCTTTTGGGCATTTAGTTTG
CACAGGTTGCAATAGTATCCATATGAAATAATCAACAAGTGATAGGAACA
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GGGCAATGGATTAGTTTGTTTGGATTATTCAAGGTTCTATTGAGCGCTAG
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TCACGTTTCCCACATCAAGAGAATGGAGGGTTGACATTGGGCTTGTAAAC
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TAACCTGCTTAATGGATCCAGCTATACATTTTTATCAGTTTTTTTTACAG
CTACATTTTTACCAGCTAATCAGGTTTTGTTTTCTCAAGTTTTATAATAT
GATTCTTAAGTTTTCTAATATGATACTCCAGACAAGGAAGTTATGGTTAC
TTACTCTCACAATAACTTATTTGTGACTACCCCTTCTTCCTCTCTTTAAC
TGAACTATGCCATTTTGAATTGATTAAAACTTGGATAAGTGCTAGTAGTA
TGATGGAAAATAAGGCTACTTCAGTCCTGTAGTACTGAGTTGATTTTTGT
ATACTGTGATTGAAGGTCAAAGAATGGCTCCAAAATTTGGGAATTGGTGA
TAATATGCCGGTAGTACATGATGAAGATGAAGCGGACGATGTAAATGTTC
CCTCACAGCCTGATGAAAGCTCGATCAGAAATAGGTAAATATCTCTATAT
AGTGATGACACTCTAGTGACTGATGTATACATGCTTTGTCAAACCGCAAA
TGTTGATTTAGAGCAGTTGAGTCTCCACATGTTATCCCATGCATGCAGTA
AGCAAGACCTTGAACCTGTTGTGGCAGAAATGTTCCTTCAATTGCTGTTC
TGCCCGTCATTCGACCAGCTCTTGGACGCCAACACTCAATTTCGGATCGA
GCAAAAGTTGCTATGCAAGAATATCTTAACCATTTTTTTGGAAACTTGGA
TATTGTTAACTCACGGGAGGTAAAATGCTTTCTGTGTTCAGTTTATCAGT
TGCAGCAGTTATAAAACATTAAGAAACTAGTCAGAATAACCAATCCCACG
CTGTATCTTCTTAGTTTATGTCTGAGTCTAAAATCTTCCAAAACATACAG
GTTTGCAAATTTTTGGAGGTATCATGTTTGTCATTTTTGCCTGAATACGG
GCCTAAGCTAAAAGAAGACTATGTTTCAGTTGGCCATTTGCCAAAAATTC
AGAAGGGTCGCAAGGAGAAATGTTGTTCATGTGGATTATTTAGCTGTTGC
AAGAGCAGTTGGCAAAAGGTATTGAGCAGATATTTTGCTGTTGAGGTTTG
CTATTTTGTAATCATTATATGCGAGCTGTTAATTCAAATAGTTTTTTCAT
TAGGTCTGGGTTGTCCTGAAGCCAGGATTCTTGGCTTTACTCAAAGATCC
TTTTGATCCAAAGCTTTCTGATGTCATTATTTTTGATGCATTGCCACATA
TGGATATAAATGGAGAAGGTCAAATCTCTCTAGCAAAGGAGATCAAAGAA
CGCAACCCATTGCATTTTGGATTCCAGGTACTGATTCCGTTTTATAATCT
ACTGCTTTCACTTAGCATATTTGTTTGACATGTACACCCGTAATTCCTGT
AGAGTTCATAGAAATTTTGAATCAATATATTCGAAATTTTAGCAGAAGCT
ACTTTACTAGGCTACAAATTCCAATATAAAATGTCTCAGTATCTCAGACC
TACCAAATTTAAAGTTCTCTGCTCTCAAGTATGTCCAGGCAAGTTGCTGC
AAAAATTAGAAGCGGTTGAAGAAGTTAAAATATGGGAATGGTCAGTTGTG
GCCAGTTTGTGTCTGTTGTATCGTGTAGTTCTGCCTTGTGAAATCTAGTT
ACTTACAGAAATATTTACTAAATTATACTTACAATTTTCTGTTATGGGGC
AAGTTGATAAGTTTGGTGAAGGCATGAGATTGTGCCATTGTCGCATAAAG
ACTGCAGAAACTTGTAGCTCTCTTACGGAGTACTTTTATATTCCTAAAAA
GTACCACAAACTCCCAATCGACTTGGTTGTACAAATTTGATTCAGCATTC
TCCCTTCTCCATTTATATTTCTATTCTGTCAAGTCTGAATCTGTTAGTGC
TCTTCACTGGAAAAAGGTATCCTCTGGTGGCCGGACAATTAAATTACGAA
CAAGAAGCTCTTCTAAGGTTAAGGATTGGGTTACTGCAATTAATGCTGCT
AGACAACCTCCGGAAGGCTGGTCTTACCCTCATCGTTTTGGTTCATTTGC
ACCACCAAGGGGCCTGTTGGAAGACGGGAGTATGGCACAGTGGTTTATAG
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TCTGAGGTTTGCTTTCGTTTTCCTACAGTTACTTGCAGGAAGTATCTGTC
ATTTTACATAGGTCTTAAAATAATTAAATTTTGGTTCAGATATTTATTAC
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ATGGGTCATCTAGGCTTGATGCTCTACTGGAAGAAAGAGCTAAGCAGGGT
GTGCAGGTACTCGTTTTCCAGCCAGCAAATTCCAAGAACCTGTTACATGA
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TATGCTGCTTCACAAGTTATCATAAGCATCTGAGGATGCCTCACTTCTCC
TGTATCTTAAAAGTTAATTCTGACCTTATTACGAGGTCAAACAAGAGCAC
AAAAAAGCCCCTACATTGCATTTTATCTTGTTCGATTTCAGTTCATTCTC
GTTCTTACCGTGCACATGCTGTAAATGATGAGCTACCTGATGCCTTTGAT
GTTGAGGCCACAGAAGAGGTGTTGCAATACATAGGGCAAAGGGATCATGT
GAGACATGTTTTGATAGTTTTAACCTATATCTGACATGCAAAATAGTATG
CTACCATGGGTGCTAGCTACCCATGCGTAACGACGTTTGATATCTGTTAG
CACTGCGGTCCTCCCACACCCAAGCTCACCCATTTTTTTTTGGGGAAAAC
GCAATGACATTGCGCTTCTTTTCATTGCATAGAAGAAGTTTAACAGTACA
TAAGCCACCCAGCAGGTGGATTTACAAGAGATGGCCAAAAAAAACTAATC
AGTGAACATCCCAAAAGCTCACCCATTTCCCCCCGCTGTCTCTTTTCTCT
CTCGTCTCTCGTATCAAACCCAACGGCATCAATCCAGATTCCAGAGCCAT
GTCCCTCCTGCATCTTTTTGATCTGCTGGCAAGGAGGCACAGAGGCACGC
TCCACACAGGGAGGAGGCATGGCATGATGGGGCGTCCATCTCCGGTCGTG
ATCGCCGTGGATGGGTTCATCTCCCCCGATCCTGGCCACCGGCAAAGAGT
TCCATGAGCAGCCCCGGCTTCTCCGCCCCGATGCCCTCCGCCATCCCATC
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CGGTTCCAAGGTCGTCCGTGACACTAAGGTTCGTCTGTGGCGATGCCCAC
GCCGGCTCGACGTGCTTGCACGATGGCTCGCTCTTGACGGCCTCGACATC
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GCCGCAGAGCCCTGTGTTGGCGTTGGTGAGTGCCCGTGTCGGCAGCTATG
CGGAACAGGGCGGCGGTGGGGACCCGCAGGAGGACAGCCGCCTTGGTCTC
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GGGTTTGTGGCTCCCACGACCATAAAAAGGAAACGGTTTGGGCAAAAAAT
ACAAAAGAAACGCCGTCATGGCCACTCTCCTCTTTTAAGTCTAGATACAG
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TAGCACCCATGGTAGCAAATCCGTGTTATATTTGACATTAGTACCATCTG
TGTACAGGTCCCATATGTAGATCACTGATGTTCTTTTTTTTTAATGTGTC
CTGTCGAATTGAACAACAAACTAACAGTCAGGGTGCTTTTAAGTCATAAT
ATGGTTGGGTTCTTATGAATTATGTTGACATAATAATAACATATGTATAG
CATTCCATATCGCGTGCCACAGGAAAATATGGTCATTGGATTTTCCTTGA
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ATAAAAAGACAGTCAAAGACTTGCACTGCAGACTAAGAGTTATAAATTAC
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GTTGATTTTTCAGAGACAGTGGGATTACTTATTAAGAAGTCAACTATATA
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GTACAAAGAAGTTGCTCTTGCCTTGAAAATTAACAGCTTGTACAGTAAAA
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CATTTCTCAAGTGGTGTATACTTGTGGTACGTCTCTTTTCAAAAACAATT
TTTGCTATGTTTATCTGAAGTTTATTTAATTTTGACATTTTATCTGTTTT
ATTGACTTTAAGGTCGCATCATGAGAAAATTGTGATTGTTGATAATCAAG
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CTACAACCCTCGGTAACTACCATTCAATATTTTCTCTTTATCATAGGTTT
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CAGCGCTGGAATTATGCAAAGGTTAGTTTTCTCTATTGGTCTGCTCAAGA
GAAAGATATTGCCTGCTTTCATCATTGTAAATTAATTATCACTTTTCAGA
GGAATAAAGCTCCAAATGAGCAGGCAATTCCCTTGCTGATGCCTCATCAC
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GGCTGAGGGTAAACAGAATCATGATGATAATGTTGAGGTTAAAAAGAAAG
CCTCCCTTGCATCCTGTGCATCGTGTCAGGATGTCCCATTACTTCTACCT
CAAGAGCTTGAACCTCAGTCCTTGCCTGGTGGAGATTTAGCGGTAACTGG
CTTTGACATTGACCAGGCAGATAACATAAACAAAACAGGCTTCAAGCAGC
CTTTACTCAACCGGAAGGCAAAAGTCGATGCTTCACGTCAGGATTTACCT
ATGAGAGGATTTGTAGACAATCTCAGTTCCATTGAATCTGCATCGATTAG
GCGTTTTGATTCAGCAAAAGAAGATAGGCATCACATGGATAAGAAATGGT
GGGAAAGGCAGGAGCAAGATCAAGTTGCTTCAGTACTTGACATTGGACAA
GTTGGTCCGAGGGCAAGTTGTCGTTGTCAGGTCAGTATTTTGGTACTATG
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TGCTTTGTTATTGTGTTACTTAATAATCTCATGGTAGGGAGGCATTGATG
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GGACACTCCTCTCCTCTAATGTGGTCTGCCTTAACAGATTTATGTACACA
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ATAAATGATAGAAGCTTGCTTGGATCGAGGGATTCTGAGGTATGCATTTC
TCAGATTCCTTTTCTCTAATACACACTGTATTTTGGCATGCTGCCCTACG
GTCCTTATATTCTGTAATGTAGAGCTGACGCAAGATTTAGAATGGCTATA
AAAGTACACTTCATTTCAGCTCCCTATCAATTTAAAAGTAGTCTTAACTT
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TATAACTAAGTAATGTACAAACCACTTAGAACTAAGTCATGTGTAAATCG
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CCTACGTCTTTCACTCTGGGCGGAGCACCTTGGCCTTCATCGTGGAGAGG
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TTAAAATGGTCTCAAACACAGCCATTTGAGCAATATTTTTCTTCAAACAT
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TGTTAGACCAAAAACTCTGATTTATCTAGAAGTGATTAAGGATGTGCTTT
GATCATGTTGTTTACCACTTTTGTTTCCGTGCCTCCTGGTATATCATGTG
TACTCTCGTCACCTTCTAGGCTCTAACAGTCATTTTAAGTTGCAAGCTTG
TTTCTCTAATGCTTACAGCAAGTATAGGAAGCCTATACAGTACATGTATG
GTGTATGTATAGAATAAAAAGGCAAAACTATCCTGCGCTTGACATCCTTC
ATGTGAGCCAAAATCCACTACCATCTTGGTCAACACCTGGTCAAAGAAAA
TCCACTATCTCATGTTGGTCAACCATCGTTCTTTATTCCACTCCACTCCC
ATGTCTCTCCCCACATACTCCTGCGCCAGGACAGGCAGTAAATCTTGTGA
AATGATGCAGTGAATTGTCACTTTTGGTGCAATAACCCAGTGACATTGTC
AGATGCATTTAACTTGGATGATATCTGCTAACCCCATTTTATTTTGGACT
AAATGGTTTATACGGATCATATTGTCATGTGAAGTTTGTAGGCAGCACAT
CTGCTCTACCCTCTATGTTCAGGCGTAGCATTTGTAAATCTCCGACAAAC
AAAACATGTGGTCTGGATGCGTCTTGTCGATATTCAGTATGCATGATCTG
AACAACATGCTTCGAACAACTTCCAAGGCCCGAAGTCAAGGGCATTTGGC
TTCATATCCTTGAACCTGTGCCAATATAGACTCAACCCCTATGACCCATC
TAGGATGAGTTGGCTTATGCGGTGCAAAGCTTACCTTGTATATTTAGCAT
TTTAACCTCTGGGTAATGGAAATAACTGGAAATTGGTTAAACCTTTTGAT
TTCTTCTTTTAAAGAGAAGAACTAATAACTGCAAGGTGGAGTCTTGGCAT
GAAAGCTTTCCGGATCCCTGGAGGCATGAAACTTTTGCCCAATACCAGAC
CTATTGTCAGTAATCTTGTTGAGTTTGTTCTACCCATCCAGGGACCTTCA
GAGTGGTTTACTAAAATTCGTGTTTACAAGAAGAATGGGGGTAATGGGAA
AAATATTCCATATTGATACTCTTGCACAACTTAATCAATGGCAAAGTTTT
ATAAATTTAGTTGACAAAGTTTCATTTATTTATTGTTTGACCTAGATATG
GAATTTTTTAAATCACAAGTATGCTTGATGAGGTTGTCTTCTCTTTACTG
TAGCAGACATGAATGAAAGTAATATGCATTACTCAAGTTGTTCACAAAAT
ATAATTTTTGCTTCCAGGTTAGCCACATTATGGATCCTATGGATGATTCG
ACATTCAAAAATATCTGGATGGCCACTGCTAAGGTGAGAGAAACAGAAAT
TTGTGCCCTGAAACCATAGTTCACCCAAGCCTAGGCAGTAACACTCAATA
CTCAAATTCGTCCTCGAGACCATCTCAAAATGACTAATCTGATACCTCAT
TTTATATGAAGATGTTGCCTTTTCAATCGTCAATCATTTTATGGAGTACA
CAGTATTTGCAAATTATTTTGTTCATATGCTTCATATTGCAATTGAATTA
ACTGATCATGTCTGGCAGACAAATACCATGATTTACCAGGACGTATTCTC
TTGTGTTCCGAACGATCTCATCCATTCAAGGTATTTAGTAGCTAGTATTC
CATTCCAATATTGTTTCTGCTAAGTCGCCGTGCTCTCTGAAACATAATTT
CGAGAAAACATTCGGGAGAGCTGCTATTCTTGAATTTTCTGTAACACAAT
GACCATGCAGGACCCAGTTTCGGCAAAGCATTGCTCACTGGAGGGAAAAA
ATTGGCCACACTACTATTGATCTTGGTGTTGCCCAAGAGAAGCTAGAAAT
CTACCAGGATGGCGAACTCAAAGGTACCGACCCTATGGACAGGTTGCAGT
TGGTCAGGGGTCACCTTGTATCTTTCCCTTTGGATTTCATGTGCCAAGAG
GACTTGAGACCATATTTCAGTGAAAGCGAGTATTACACATCTCCACAAGT
TTTCCATTAGGTTGATTTTTATGGAGAAGTTGCTCTCGGACGCCTTAGTT
GTACATAATACATGCGCCAGCTTGTAGATGTTTTACGGGAAATGAAGAAA
ATATACGGCCACGACAGTAAGTTTGCAAATATAGCTTATTCGCCAATCAG
CTCTTTCCTTTTGGGCAGATTTACCCCTGCTCAAATTCTTTCTTCTTCAA
AGGAAAGAATATAGGAATATAGTTAGTTCATTGGAGTCACCTTTGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.