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GrainGenes Sequence Report: AA026312

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Sequence
AA026312
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026312
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TTATGGGAGAAGCATCCATACACTGCTCGTGAACCATCAACGGTGCAAGG
CGCATTAGTACGCCAGATGTATCCGGAGCCAATTGGTCCAGCTGGTGATC
AGAAACCGGTATTGTGTTGGGAGGACTACAAGTGGTCCCCTGGTGCAGGA
GTAAGAACAGCAGCTTCCAGAATTGTGGAAGAATTTTGGGCAAGTATATC
CACCTATCAGTATGGTTTGCATAGATGCTTTGAGATTTCTAAAATAGGTC
AATGGGTAATAGTAGTTCCACTTGTTTGCTTTGTTCATATCCATGCATAA
AGCAATTCCTCCATCCACTGATCCTCTGAGAATTGTAATCTTTTGCTTAA
AGTAAAATGACCATGTTCTAGAATATTTACAACATCACAAGATCTTGGCT
TACTAAATTGTTTTAATTGCATGGAACCGAAGTTCATCTTGTAATGTCAC
TTGATCATATAATAGGCTCGCATGGTATATTAGGAGGGGGTGCATCATTG
ATTTTTTATAGGTGGGGTCTGCAAATATTTGACTGTTCTCAAATACTCCT
ATGTTTACTCCCACAAAAAGAGCTAATATTTTGCGTGTTGTCTCGCAGTG
GCGTTTCAAGTGTGACCCATTAAATCAAGAACAAGCAAATGCTGCCTTGG
AGGAGAACTTTACTAATAAAGTTAGGCAGATGCTACACGAGGAAAAGGCT
GCAGCCATCAAAAGATTAAATAAGAAGGGACATATGCCTACGGAAGTGGA
TGAGGAGGGTAACCGCTGGCCAACCAAGGAAGCTTTAATTTCTGCTAAGC
CACCTGGTTTTGGTACTGTTATTGGTTGGCGTTTACTTTGCGAACATTGG
AGTACTGCTGCATTTAGAAAGATATGTTTGACCAACTCGAAGAACAGACT
GGCTCATGGGGCAACAGTCTTCCATTGTAGTGGTGCGAGAAGTGTCGTCT
CTACACGTCAACATCTGGTACTCTTCTTTCATGATTTTCTTTATTGTTTT
TCATGCACATCTTCATTATTACTTTTGAGGAAGAATGGACCATTTATATT
GGATGATGTTTATCATTCTTAAATCGTAGAAACTCAAAACCGGTAGAGAC
CCTGGAATTACCGGTGCATGGCATCACACACATAATTTGCATCGCGGGAC
TGATCAAGAGAAGCTATGCAGCCAGAGAATTTCTAAACGTTGGGTTAGTA
TAATCTTTGTAGCTTATGTAATTTTATTCATAATGAGAATAATGTTCAAA
GGTAAACCATAATATTTCAGGAAGATTTTGATGACGCAATGACAAATGCC
CATGGAGAAAACTGGGAAGAGGAGCACCCAGAATTAGATGCACAAATCAT
CTACGATGCAGCAGGTAGAATGCCACATGGTAGGCTGGGAATAGCCAATG
AGTTATTTACCAAAACAGAGAAGTCCAAGATTAAGTCTAGAAGGATGTCA
GTCTCACAGCCGATGCGGTCAGCTAGGGAAGATCGTCTAGAAAGAGATAA
TGACCGTCTAATGCGAGAAAACAAGCGTCTTCGAGGCATTGATCTAGTTG
TGCGGGTAATGTTTCATTCACTTGTAAATTGTAGTCTATGAGTGAATGGG
ATTATGCTGACTTGTTTATATTTATAGTCTTTGGCTGAGAAAGGAAGAGT
GGACTATGATGGAATAATGCAATCAGTTGCATCTGACTTGGTAAGTATAA
CACATCACAATGCTAGACTTGCAACTACAAAATAGAGTAATGTATATTTA
TGATTGATATATAGGCCACATCAGATTCTGAAGTCGGATTTGAAAGAGAA
AGAGATGCTGGCCATCAACATGAAACTGAAAAGGTTAGTTCTTCAAAAAA
TAAATCAATTATTACTAGCTAACAAGTCATTAGTGTCCTAGTACAAATCT
AGGCAAGTGCCACTCGAGCAAAGACATGCTAAGAGAATAATCCAAAACTA
ATTTTAACACAAAACAAGATTCAGTCAAAATGTCGTATGGTCCATGTATA
CAACTATCTGTGGACTCTGTCCTATTCATAGAAATATACCCCGAATGGAA
AAAAATAGCCACTTCACATTCAAATTAAAATATATTGCATGAGGAGTAAA
AGATACTTGCCTTCAATCTTGCAGCGCTGCACCATTGTTGCTCCAAGTAT
CATTGCACTCTTAGAGTGCTAGTTTCTGTTCTAATTTTTCTTGGTGCATA
CTACTATGTTTAACACATACTTGTGAGCATATATATAGTTCAAACTTGTA
AGCCACTCAACTACCTGACCTTTATTTTCCTAGATCTTGTCGCTTATGTG
CATATAATATATACAAGCAAAAGTTACTTGATGTGCACAGAGCACTGTTA
ATATATGAGCGGGGATCCTTAATATTGTTGCATTTCTATACTGTGATGAT
CATGTTATATAAATCCTGCTAAATTCACTCTGATTATTATACATATAGTC
AGTGATGATTCTACACTAGTGTACTATGCATTTGTTTAAACTATACGCCA
TGTTTCATCTATAATGCATTGTTTTTTCATTTTTCTTACGATTTGTCTTA
TCATTCTTAGGGAATGGGAAGTAACACCAGAGGAAGTCCTAGTCGTGAGA
AGGATCGTGATGATGATGTGGATGACATCTATGATGATGGCTATGGTTAT
GGTTATGGCGAGGGTGGTGATGATGGCTATGGCGATGGTGATGATCATTA
TGGAAATGGGCGAGGTGATGAAGATGATGAAGATTGGGCCAATTTCTAAA
GTATTCAGTTCACTTTACTTTTCAGAAATGATTGGACAATTATATTTTAG
TTAAAATTTTCTTTTGCGCTCGACCTTTTTAAATGGATCATGTACCCTGT
GAGGTTATTATTAATCCCAAACATGTTTTATTGAGTGTTCTTTATGTGAA
GTGTCCAGTTGATAGTTATGAGATATCTTTAAATGTCAATATTATGTAAT
ATGGTTGATCAGAAACATATTTTGTGATGCATAACAATGACCGACTACCT
AGCTCTCAGCTATACCATATACCGATGGGACTATACTCCCGTTGTTAAAT
TCCTAAAATGACGGTGTGGGTGACCTCTCAAATACAATCATCCCTGATGG
GATAATGCACAGTCAATTACATTGAAAACTGACGGGATCTAGCAACCGTC
AGATGCTAAACACCCGACAGGGCACCGTTGGTTGTAAGTATTTCCGAGAG
GTGGTAGAGCGGGTGGTGGCCTGAACCTGGTCGACGGCACCCCGTCAGAT
TATCCCCGTGGGCAAACTAATTACCTGACAGTACCGTCGGCTACTTGAGT
AATGGCCGACCGAGCAAGGCCGACGGGACATAACCGACGGTACACTGTCG
AATTTAAGGTTAGCCCACGGTAAACAAAAATAACCGACGGTAATGTCACC
CTCGGATAAAAGGTGATATCTAGTAGTGATATCCAGGTGCATTGGGACAA
GTATTCGCTTCTCACCAGACTTTTCCCACACCACTGATGCATCCGCTGGA
AATCAAAGTTGCCTGAACTCCGCGGCAGAAACTAAAGGCTTTTGAGTATA
TCAAGGTTACATACCACACAGTGGTTGTACATGTTTAGAAACTCCTGCCA
TGCTGAATGCATAGAGTGAAAGACGAGAGGGACTTCCATGTTGATCGCCA
ACCACCTGACTACTTAGCTAGAGTGCCTAATTGTTGCTCTTTTAATTGTG
TTGAAATTATTGTACAATTTGTAATTCACCAGAGGGGCCTGCTGAGCGTC
CCTCGGGGGATGGCACGCCCCGGTCCCTCGTCTCCGGAGCCGTACGATAG
GAGGCTGCTGAACCGCTCGATGGACCTCTTCCCATTCGTCGCTGCCTCGT
TTCCCATCAGAATCTCTATGTCGTCCCTACGAAGGTGTTCCGTTTCTGCC
TTAGCACTACGTCGTCCCTTCGTCGCTCCTTCGTCCGTTCTATGTCGCGT
TGCCCTTTTGCATTTACACCCCCTCGGTCCATAGGAGAAAAGAGGGACCG
TACAACCCGCAGTCAACGCCGTGACGCCTCCCTCTAATGTCGCCTCCTCC
CTTCCCCCAGCGCCGCCTGCCCCAGGTGCCTGCGACCTAGCCACCCGCGC
CGCCTCCACCGTGCTCACATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCT
CCATCACTGCCGAGAACGCATGCCCTCGTCGCCGCCCAGTTCCAACTCCG
AGCCCCTACCGTATAGTCTACAGATCCACGCTATGTGGCCTCTCCCCTTC
CAGCAAGCCGCCAACAAACTCTCCCCAGGCGCAGTTTCGGTATGTAAGCA
TGTATATTCTATTGGTTTGATTTGATCTGCAGCTTTTACTACTAGAAATT
GTCGCTTGGGAGAACAGAGTAGTGGATTGCATCTTAGTATGGATTTATGT
CCTTTTACCTCGTACAACAGAACCTGGTAATTACAGTCCGTAAATGGTTG
CGTCTCTGGTGGGCAGAACTAAACTAAGAGCAAATTGTTTGGCTGAGCGT
TTTGTTGGTCTAGACGAATTGTAGGTGCACTCCATTATTTTGAAACCTTT
GTATCTCAAGGTTCTCTTTCTATGCAATTTTTACTGAATATGTAATTGGG
CAAAGTTTTCACACTGGCTTGGCTAAGAATCTTATCGATGCTATGACAGA
GAAGGATACTCTAACCTGGACCACTGACATTTCTATATTTATCCTGTATC
AAAACTAACGAAGTACCATTTCAGCTATGCAAATTGTGCCGCATGTGCAG
ACCCATACGTCGCAACGAGGTTTTTTGTTTCTTTAGCTGAATCCTAAATG
GAATAAAGCTTGTGGGCACAGGCTCAAGTGTTGTATTATCTATGGAGTGT
GTAGTAATTGTATCCCTCTTTTGCTTTCCTTTCTCTAGACTAGAACTCTA
GGTACCTAATCAACTTGAGGACAAGGATCATGCGTCAACACCAAGCTCTA
TTGTGCAGTTTACTGAACATTTACTAGGATTGAACATTTACGCGGTCGAC
ATGTCAGTTTATGTTGTGAAGGTCACATATGTTCTCCTTCATGCGTCGGA
TTTGGCACAACATTGTGGGGATTTTTGCACTTTTTCAAGTTGATGTGTGG
TGTTGCGGATGCGGTGGCAGATGATCAGGGAGAGCTCACACTTGTGGTGG
ACCATTGTGGGTCTAAGAAGTGGAGGAGGTCGGTCAACCCTGGCCGTCGG
GTCTCCGCGGGGGCCTGCTTCACCCCAAGTCGTGCTCCATGCCCATGGTC
ACCATCCCCTGCTTCTCTTGGTAATATACCTTCCCCATTTTTTGTATTTG
CCTGATGCTGATGATGTCGTTGTTTCTGTTTGTTTGTCTCAGGGTGTGAT
TGTTCTGATGGCCTACTTCAACAGCGGCTCAAGTGTATCTCAGACTTTCA
GTGTCGACACATGTTTTTTGTTCAGTTGGTGTGTAGATTGCTACTGCAAC
AATAACGTGAAGCAGCTCAGCTTCTTGTTCTGATGTTTTCTGCGCTGGTT
TCAACTTACTTTATCAAGTAGCAACTCAAACCCTAACTTTCATAGTAGGG
TGCACGTAACATACCTGATTTTTACTGTGATAATTAGTGTATAGTAGGAT
TGGACTGCATTGTACGTGCCGTTATAGATTATTCTTTCATACACACTTCA
TTGAAAATAATCAGCTCCGGTTTCAACCGACCTTTTAGTAACAACTCAAT
TCATAATTGGCGAGTGGTGTGAAAATAAACTGAATTCAAACAGTACTCGG
GGCCGAGACTCTATTTGGGAATATAGTTTGTTGATTTGAAGTTACTGAGT
CATCATAATTGTTATGCTAATATTTTTTTGAAGCCTCCAATAGTATTCCA
CTGTGTATATGTTTTACAGGATGGTAATCACGCCAAATGCATAGCTATTG
AATCCATTCTCAAACATGAATGTTTATTTCTACGGAAGATCATAAGCATC
CATGGTTATTGTTATTCTCACCGTATATCAGATAATGGACAGTGCTACAT
ATCTTCAGTGCTATTTTTATTTATTAACATATCTGTTTATGGGACAGGTC
GAGAATGTATAGAGCGGATGATTGATATGGTCATGCCTGTGAAAGTAGTT
TATTCATGCAACAAATGAGATTTGCTAGAGTGTCTTATTTTAGCTGTTTC
TTATTCTGTTTTCAGATTCTTGCTGTTTCTTGATCCGTGTATTGAAAATC
ATGAGATTGGGAAGCATGCATCATAATTGTAATGCTAATATTTTTTGAAG
CCTTCAATAGTGTTCCACTATGTATATGTTGTACAGGATGGTAATCACGC
CAAATGCATAGCAAGAGAATCCATTCTCAAAACATGAATGTTTGTTTGTG
TAGAAGATCATAAGCACCCGTGGTTATTGTTGTCCTCACCGTCACACAAG
TATCAGATAATTGACACTGCTACATATCTTCAGGGCTGTTTTTATTTATT
AACATATCTGTTTATGGGACAAGTCAAGAATCTACAGAGCAGATGATTGA
TATGGTCATGCTTGTGAAGGTAACAAATGTTGTTCTGCTTGAGAATGTAG
CACTAGACTGTTATGACTTGCATCTGATGGTTATGCCTTGGATCATGGAA
ATAAGAGTGCATTCTAGCTTCATGGTACTTAGTTTGGCTCAGCTTCTGCT
GGAGATTGATTGAACACAGTTTTTCCTAAATGTGAAATCAACAATTGTGT
ATCTGTAACTTCAGTGCCCCGTGACCACCTTAATGTAATGAAGATTGGGA
CGATTTTCACCTTATTGTGTACGCTACCCTGTTCGTTTTTTTTCTTTAGA
CTCCTTTGTTCGTTTTTTCTCTTTTTTCCAGAAGGATGGGTCTATCCCTG
TGCCGCCCATTTCAGTCTCGCTGGTCTCAAGTTGGACCAAAAGATGGGCG
GCAAGTTTGCCAGTTTCATGCTATTGAAGGGTGAATTCCTGCTGAAAGGT
GTTATGCATCTTACTGACCATATCAAATTACTGCTAAGATACCCTAATCT
CAGTGGTAGTTATAACATTGCAAACTTCGGAATCAATTTTAAATATGGAC
TTCAGGTTGCACTTATAAATCAAATTCTTTTAGGTTCTTTTAAGAATAGC
GAATTCTGGTTCGATGTAGACTGAGATACCGACCTTTTGTCAAAAAAGAA
ACTTGAGCATATTTAGTGTCTGCAGTTTGCGACCATCTTTTTCTAGAGTC
CTATCAAATTTTGACTGCTATTTGTATAGTTACAGCTATGGTTGTAACTA
AGGATTAGCTTGATGTGTATTAATTTGGGAAATTATACTCCAAATTTCTA
TGATTCTGTGATGGCTTTCTCGGTTTAACTGCAACTTTAATGACTCATGG
GATTTTTTTTCAACAGGCATGGGATCTTACTGAAGTTTGACCTCAAACAA
ATAAGAGTTGCATGTTGTATGGGAGCTTAGGGCGAAAATCGTTCATGGTA
AGATGGATGATTTCCCATCAAAAGACTTTGGAGTTTCAGCCTACTCTTCA
TGTTTTTACAAGATCATATGGAATACCATAGAGCAATATATGTTTGGGAC
TTGGAACTTCTTTCAATAAAATAAAAATCTTTCTTAAATGATTCTGAATT
GATATTCTAAATGGCTTCTTTTTATTTATCTCTCACTGCCATGTCAAAAC
CTCGGTGGATGCTATAGAAATCTTTTGCGGTGCTACTCCTACTTCACAAA
ATTAGGCATATCCAGTAGGCGGATACCATGTAGCTGATGCAGCCCATGTT
AAGATGATCAACTAAAAGCATTACCAGGTCCAAAAAATAGGATCACGAAG
TTCTTTATCTCGATAATAACTACTACTGGATGCCAAACAGGTCAAACCTC
AAATTATCATGCTTCCATACATAGTGTTCACGTCACGATGTGAGAATATA
GTGTATTCATGGGGTATATTCTTCTTCCTATAGTTGAGATTCACTTCGGG
TTCTTCCATCAAATTGAGTACTATTTCTTACTTGATTAGTAAGTTTTAAC
CTCATTATATGCGGACTTAAAGCACAATTCTGTTTTTCTAGCCAAAGCAT
CAAACTATATCTTTGCCTTATTCTCCACCTTTTGAGTGGTTTGTTTCTCT
TATATTATGTCATGGCTAGCTTGTCCAGGGATGTCCATTAACAGAATGCA
TTTGATCTGTACGGGAGGCTGGTAGTAACTCAAAAAAGAAGGTGAGCCCT
CCTTCCAATTTACTATTTGCTATGTTATGTATCTTGTTGCTTGCACTTTA
GTTGCTCGCATTTTGAAATATGTGCATGCTGAAACATTGAGAAGTTTGGT
ATTTGGCAGATTGAGTACTATTGCTTACTTGATTAGTAAGTTTTAACCTC
ATTATGTGCGGACTTAAAGCACAATGCTGTTTTTCTAGCCGAAGCATCAA
ACTGTATCTTTGCCTTATTCTCCACCTTTTGAGTGGTTTGTTTCTCTTAT
ATTCTGCCATGGCTAGCTTGTCCAGGAACGTCCCTTAACAGGTTGCATTT
GAGCTGTATGGGAGGCTGATAGTAACTCAAAAAAGAAGGTGAGCCCTCCT
CCCGATTTACTATTTACTATGTGATGTATCTTGTTGCTTGCACTTTAGTT
TCTCGCATTTTAAATATGTGCATGCTGAAACATTGAGAGGTTTGGGATTT
GCAAACGCCAAATAAACACAAATTTACTCAGTAACTCAGTGTCTCTGTTT
ATCCTGAATGGATTTGAGATTGAGTTTCAGTCTGTTCATGACTAGGGATA
GCTCACGGAGCTAAATATAGTGCATACATTTATTTTCTGAATTATTGTGT
CACTTTTTGCTGCTTCGAAAGTTGTGCGTTGAAATATTTTGTTAGTAATC
TTTACTACTCCCTCCGTCCAAGAATAGATGTCTTAGGTTTTTCAAATTTT
AAATGAATCTATATACTAAATAGAGTCTAGATTCATTCAAATTTTGACAA
ATTTGAGACATCTATTTTGGGACGGAGGGAGTATTTGACTTCCCTTATTG
AGTGTTATTACTGTAAATAGGACTAGGCTACTGTCAGTCGTTAAGTATTC
AACTGGAGCGGGTTATTAGTTTGTGGTTCTCCAGTATACTGATTGATGAT
CCCTAATCAATGTTCAATTCAGAGTGTTGGATACACATAATTTCCTGAGT
TGGGAGAAGATCCTAGAGCAGTCACGGGAACACAGGCGAAAATCGTGCCA
AAGGTTAGCAGTCATCGGTTAAAGAATTTAGGGAAAAAAGTTGTATTTCA
TAGGCGAAAATCGTGCCAAAGGTTAGTTGAGAGCCCTGCAATCAGTAATA
CCTACAAAGAATTTCGTGTTCTGTCGTTGACCATCTCGCGATATGTCGTC
ATGTTGTCCTTTTGCATTCTAACCCACAGTCCACGTTCATTAAGATCAAA
ACCACCTCCGTCCACACTGGCGCCTTCCCCGAATCGTGCGCCGCTACTAT
GGCCCCTGGGTTCGTCATTGGCACCGGCACCACCGAGAGCATCGACCGGG
CCACACCCTCTCCCCTTCCGGCCTCGTGCTCGCTGGCCGCAACTCGGACA
AGTTCGACGCCATCTCCGATAGTCGACTTTGATGGCTACCCTATCCACCC
ATTTCCACCCGCCGCCCTGGATCCCTTACTTTGAATTCAATGCCGTTGAA
AATCCTCTAGCACTCCCACACCGATCTCACCTGCTCCATCAAAATAGAAG
GACATATCATAAGAGGAAAACATACCCAGATGGAATATAAATTTAAGGGA
CAAAAACAACTCTATTTTGCGTGTGTTCAGTAAGTTGTCCATTGTGCAGT
ATTAACTCTACAAGTTGCGTGTTTTCTCAGTATTAACTTTGTTCATATGT
TAATGCTCACAGATACAAGATTCAGAAAGTCATTGGAAAATGGAGTTGCG
GTTTCCTTTGTTTAGCTCTTAGCTAAAATGGCGATAAAGTTGGAATCAGG
AGAATGCACAGTATCTTCGTTCAGATGCTTTCCGAATCCTCGATGATATC
AATTTGCTCTGGCTATTGAGACATCCTGATATAGTTTACATAGGGCATAT
AATTTTACCTCCATCGGAAAGGGGCTTCAAGGATATTTGTGTTGTCTTTG
AGCTAATGGACACAAGCCTCCCCATGTCATCAATGCCAATTATGACTTAA
GGTAAAGAGTATCGTCAAGTGTTTGTTGTCAGATGCTTCGTGCACTGAAG
TATATTAGTACCGGTATGCTAATTTTTTTCTCAATTTGAAACCCAAGTTA
GTATACGGTTTTACATTATTGTGTTATAATCTTTCTTAATTATCTTGGTG
TAGTTCTTTTTGTAAGACTCTATCCACACTTGAGTATTGATGCTTTACTG
CGCTCCAACAAACATAGACTATTTTTCTTCCGATAATCATTGTTTTCCAT
GTGTCATCTTTAAATTGCTGCATTTTATTGTCTTTTTCTGACAATGCCCG
TTGGCCAAGAAAAGAAAGTGAGTTAAATATTGTGTTCCTTATTTTGAGTG
TTTATTATCTTTTTCTTTGCCGACTGCTGCCTTCATTATGTGTGTGGTTC
ATCGTAGGATTTTTGTCTATGACTCTAAATTTGGCCAGTCGAAAGGTGTC
CTGATGCCTCTCACATGACCACTGTGACAATTGGATAATTTTACGTTTTA
ATGGGAGCAAGGATATGATTTCATCTGAAATGTCAAGAGCGTTGATCTTG
ATATGGTAATTTCTCAGCTTATTTCATTTGTCAGCTAATACTGACATGTA
TGGTTGATATGCCTGTCACACAGTACAATTCTTGTTATGTCACCTGATGA
TAGCATGGTGGGTGTTATGCAAATAAGGGCAGCCACATGCCATATGAAAC
GTTCTGACCATCATGTTTTTCTGCTAGGAAATGAATCCATTGGATAACTG
ACGACCGTTTTTCTGAAGGCAGTTTTCTTCATTTAGAATTCTGAAATGTT
CTAACCATCATGGTTTTCTACTAGGTAATGAATCCATTGGATAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.