Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002873

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002873
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002873
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GACCAGTCGCCGGATAGGGTGCGTCATCAGAGCTTCTTCGTCTTCATCAT
CTCTTTCTCGGTTGGTGTTTGTTACTCGCTCCGGGAGAACACACGAGTCT
TTGCTTAGCGCTAGCTCTTCCTGCAATTCGATCGAATCATGAGCGACCAG
CAGAGCAACGCCGCGTACCCTCCCCAGGGCCAGCAGCAGGCCTACGTCGC
GCCGCCTCCGCCGGCCGGCTACCCGATGAAGGCCGACGCCGACCAGCAGT
ATCCCGCTGCCGGCGGCGCTGCCGACACCACCAGCCACGGCGGCCACCAC
GGCCACCACCACCACCATCACCACCACCACAACGGTGGCGGCGGCGGCGG
CGGCGGCGGCTTCTTGAGAGGGTGGTAAGTTCTCTTCTTTTCCGTTCAGA
GTTCTCGCTCTGCTTCATCGATCCTGGTCTCGTACCTTCGTGATGGAACC
GCTGATGATTGTGTGTGTTTTGTTTCAGCTGCGCGGCTCTCTGCTGCTGC
TGCCTCCTCGACGCCTGCTTCTGATCGATCATGTCCTATCTCACGTTGAC
GCTCTTCGTCCTCATTGTTGATCGCTCTTCTTCTTTTCACGTGGAAAAAA
GTCTACTTAACCCCCCTATCTATTAGGTTTGGATCACTAATCCTCCTATG
TATCAAATGGGTCAGTTAGCCCCCCTAAGTATCTAAAACCGGGCAAATTA
CCCCCCAGGTGGCGATGGACTGTTTTAGAGGATGGTTTACACACGATGGA
CACTGGTTTTGTCCACGCAGGATCCAGGTGGGCATCTGCGTATTTCTAGT
CTAAATAAACCCCCTTTTGACTTATCCCCATTCCTCTTCTTCTTCTCACT
CCCGTCCGTCCCCGACCACTCACTCCCATCCGTCCCGACCGCCTCACTCC
GGCCGCCTCGCTCCCGACCGCCTCACTCTGGCCCTAATCCGGCTGCCTCC
TCTTCCCACTCAACCATAGGCCAGCCGCCGTCTCCTCCTCCTCCCACACC
AACCTGTCGCAGGAGATGATTGTGCCAAGGTCCAGGGATGCGAGCTGAGG
GGATACGAGCTCATGGTGCAAAGGAGTAGGGAGTCGCTGAGGGGAGGAGA
CGGTGTCGCTGGAGGGGAGGAGCCCCGGTTGTCTCGTTTTGATCTCGCCA
TCTTCAAATAGCATGGTCCGTCTCTAAGAGCGCTTGGTCTTGTACATAAG
ATTATCAGTGGTGGATATTCTGTGGCTTCGGCCAGTATTTCAATTTTCTC
TTTATCAAATTTCCATAGCTGCTTGGGAATTTTGCTAAAAAGAAGAGCAG
GGAGCAGCAAATCCATCAGCTCACGTTTGCATCGCATGCGCGCATGGACT
GCGTTCACTGTTCCTATTCGTTTGCTAAATATAATGTTTGTTTCTCTCCA
GCCCTCGACGAGATAACTTCTAGATAAAGCTCAATCAATTTATCAAAGGT
TATTCAGATGGTCACTAGAGTGAAGATGGCAAGTTAATGATGCTGAAATT
GAAAGAGTGGCCCCCAACGAGACTTCCATTTGTTGATTTTATTCATTCAG
AGTGGGGTTTCATTAATCTTGCTGCTAAGTTACCCCTAGATACCCTACAG
TCTGAAGTAGGCCTAAAGCTGGTTATTGCATATGGAAGGCAGCAAGGGCG
ATTCAGTGACAATTCTGTTGATTAAGATGGGTGATGTGGTAAGTTGGTCT
TCTTCTATATATCTGAACTTCAATTTTCTTTTCATTTCATTGAAAAAAAA
CATTTGTTTTACTAGAGAAAAATGGCTAATGTCGTAACCTGGCCTTCTGA
TCTTTTTGGCAACTTGCTAAATGAATAAAGTACTCCCTCCGTTGCTGAAT
AAATATTTAGCTTCTAACTGGCAAGAACTTACAGTAGCTTTATGCATGTC
ACACATACCATTGGAATAGAAAAATAACCTTACAAGTTTTGTCATCAAAC
ATACAGGTTGGAAAAAATCTCTTTATATGCAGCAAGTTCTGTTGTAAGAG
AAATTCATAAAATAACCCTCGATCCCAAGTAGGTGAACTTATACTTGTTC
ACATCTTCCAACGTTGAATTATTGAGCATTATCACCTTATTATTTTAAAT
AAAAAACCATGTACCTTTAGTTGATTTATGCAGCTTATAACCAGTATCAT
GTGCCTTTCTCAGGTTAAATCTAGATGTCATATTTGAGGATCAAAACCTA
ACCTGGGCAGTTCCGGAGAACTTGTCCAGAGTCACTAAACAATGGAAGGT
GTCTTATGGTTAAGAGATTGGCTCTATTTTACTCGAATTAGTTTGAAATT
CGTCCGGCGTGATCTGGACATTGGATGAGTCATATCTATGTTATGCAAAA
ATCTGGTAAGTTCCTACTCCGACATCTCTTCCAGATAATGTATTTGTCTA
TATCTCTTCAAAATAAAGTATGTGTTTGGCAACATGGCAAAACCGACAAT
GACTGATATGGTAAAAGAAAGTATTATAGCTAACATGTCTCTGAAAAAAC
AACAATGACTGAAATAGCTAAGCACATTTTGTACTACTGTGATCCATCGT
GTCCACCATGCTTCTTTTTTTCTCCCAATAACCACTTCATCCTCCCATAT
TTGGGCACTTCTTCTGTCACAACCTTGGACATTGGAATGGTCTGTATTGC
ATTATTGTGAGTAAATTATTAACATAGTTGAAGCAATATGGATTGACACA
ATTATTAAATAAAACTGTAGTACAAATATATATTTACCTCGGTTTCTCTT
CTTGGCATTCTTGGAATGTGTAGTCCAGAAGAAGATTGACTATCTAGTTG
AGTAGATGCTCTAGAACTTGACTGGCCAGTACCATCGGATCCATGCATTT
TTCTTTTCTTAGGTGGAATAAATGGCCTATGTGCAGGAGTTTGTGGCAAG
GTTGTAGATTTCTTTCTAGGTCTAGCTTTCTTCTCATAGTACAAAACATG
TTTCTCTTGCTGTTGGCCTTCTTGTGCAGTAGTAGAATTACATTCCTGTA
GCAGACATTTTATGACTCAAATTGTGTATCAACAGTTAAATAGAAGCAAT
ATAAAATAGTGGCAGCATAATAATATAATAACCTTGTTAGCTTTTCTCCT
AGCAGTATTAGATTGTTTCTTCTTGTGGGCATGTTCTCCCACAACATCTG
GATTACTTGTGCACTTTCTTTTGTTATGGCCTCCACCTCCACATGCTGAG
CATTTGCCACTAACACCCTTTCTAGATAATTTATTTCCCTTTGGTTTTTC
TTGCTCTTCTCTTATTCTCTCTTTCTTTGGACTGCCTGGCATTTTCTTTC
TAGAGCTGTCATGGTTTTCCCCTTCAACTGTAGCCCATGCAATTGGGTAC
ATTTGGTTGTTTGGGTCTCGTCCAATTGCGCACAAAATCTGGCCACAAAC
TGCACCTTTCAGGAAACATCCATCAAGGCCAACAACTCTCCTACAACCAG
CAAGAAATCCTCTCTTGCAACCTTCTAGGCAAACATATATTCTTTCAAAC
ACAGGCCTATCGGTTACATCAGGATTTAAAGTTACTGAAACTGTGCTTCC
AGGATTGCTTCTGACCAGTTCCAGATGGTAGTCGTACACTCTAGAAAACT
CACCATTTGTTCCATCAACAATCCTCTCCATAACAATTCTTTTTGCTCGT
TTGCATTTTGATTCACTGACATCAGCACATAAATCCTCAAGCACTCTCTC
CTGCATCTTCTCAATCCTCTAACCAGAATTATCCTTGATCTCTTTAAAAT
ACTTCTCCGCTATCACTGTGCTAGTGACTAGCTTGTTGCTCCTCATTGCA
ACACAATGGTGCACATTGTTGTACCTGCTAACTGTGAACCAAGGTGACCT
GTTGGGGACTAATGAGCCATATATGCTCCAGTTGCAACCAATCCAGCTGC
ATTTGGCCAAGACTCGTGTCCTCTCATCCTTGGGAAATATTATGTGTTTC
AAATTTTTTAAGCCATAATTGACTAGTGCTTGTTTGAATTGTCTGCTATC
ATGGAAAGCCTGCCCAACCTCAAACTCTTGCACCTCAGCACTCTCATCAT
ACACTCTGTGTTTTGTCTTCCTTGTTCTCACACTTCCATCACTGTCTTCA
TCATATGACAGTTCTTCTTCACTGTCAAAGCAATCACTTCCATCTTCTTG
CTCTTCCTTAAGATTTTCTGGAACAATGAATTCTTCTGGTACTCTGGTTG
CTCTCTGCTCATCCTCTCCAAGCATTTGTATCTTCACTCTCTTCTTCAGT
TCTTGTGCTTGTTTTCTGTAACAAATGGCCTCTTCATCTTCACCACTACT
ATCAGCACTATCTAATTCATGGACATCCTCATAATCACTGTCTGAACTAT
CTTCACCAACATCTTCTTCATGTTCCTCTTGTATCTCCTTGCCTTTATCA
CGCTTTGTTGCCCTAACAACTGACAATTTCCTTGCTACATTTGGTTGCTC
TTGGTGCTGGTCATATTCAACTTGCTGCTCCACTTGATGCTGCTCTTCGT
GCTGCTCATGCTCAACTTGATGCTGCTGTTGGTGCTGCTCTTGGTGCCAA
AACGGGTGCTGATCTTCATGCCAAATTGGGTGTTGCTCATGCTCTACTTG
GTGCTGCTCTTGGTGCTGCTCTTGCTCAGTTTGGTGCTGCTCATGTCCTA
TTTTCTGCTGCCCATGCTCAACTTGGTGTTGCTCATGTCCTATTTGTCGT
TGCCCATGCTCAACTTGGTAACGAACTGGAAATTCTTCATGTTCTTCGTC
TGAACTGGCTACATGTGGGTGCTTTGCAAAGATCTCAACAAAACCATCAG
CTACTCTTGTCACATACCTAGACATGCTGTTCACACTTGTATTGTCATCA
AGACAACACATGAAATTGTTCTCCTTCTCGATTAATCTCCAACTTAGCCT
TATCTCCAGCAAATCTTCATCTGAAAGCACCATGTAATCACACAAGTGCC
TCTTCAAATCTGCCAGAGTCAGCTTTGTAATGGGCACAGTTGACATGGCA
CTCCTTCCCCCGACATACTTCCATTCCTTATTAATGTATTCCAACCTCCC
ACGGTAATGGAAACGAACACACAACGAATCCATCCTACAGAAAGGAACAA
GAAAAAAATTAAATTTTAGCATACTATAAATGGTAATTACAAAAGGACAA
GTTTACAAATTACAGTTTAGAAGCAACATTTAGATAAGCATCGTGAGCAT
AGTCCTTGCTAGTCTTGTCTGCTGCATTCAATTTAGAAAAAAAGAAGTAT
ACATACCCCCCATACCTTTCATGTTTTGGACAGAGAAATATAACCCCCAT
TAGTTTGCAAAACCAGACATGCATTGTGCCTTGTTTCTTTATTCTCTTCC
TCTATTGGGTTAACCACCACACCTTTGCTGCTTTGTAAGTTGTGACTACT
GATGAGAACTAGCTAGCTAGTGTACCAGTCTAGGGTTAGTTAGTCTTGTT
TAATCATTACGTTGACATTTTTGAGTAGAACTACTCTGATATTGCAATTT
GAGTAGAACTTATCTACTGTGGTATGTAGATATTTGAGTATTACTAATAA
TTTGTTAAGTGCTAACTAGGGCAACCACTGAAGCAGATCTATTTGTGTTG
AAACTGACAGTACATGCCCATGGTTTCCTGCTTAAACTTCTGAATTCTAA
AAACCACTCTTAAAACTCACTCTTTGAATTCAGGTACAAAGCTATGAGTC
AGGGACCAAACCTGCTATTCGATGATGCACTGCAATCAACAGATCATGCC
ATATATCCTCCGGCGTCACGAGCCTGGTGAGCAGGAGCACGCTGTCGCCG
CTGTCACGGAAGTATGGGTAAGACTGTGAGGAGGAGGGGACAACAGAGAG
GAAGAGAAGAGAAGATCGACAAGCACCTGCCGTCGCCGACGTCGCGAGTG
TGATCAGGTGGAGCCGCCGCGAGCGAGATTAGGGGAGTCGCGAGCCGTCC
TGATCGTGCCTCATCCCATCACCACCTGGGAGCATGATTAGGGGAGTCAC
GAGCCTGATCGTGCCTCCAACAGGTGCAGGATGTGATCCCATCATGATTT
GGGTTTTTATTTTAAGTCCATAATCCAACGTGGACAAAACCAGTGTCCAT
CGTGTGTAAACCATCCTCTAAAACAGGCCATCGCCACCTGGGGGGTAATT
TGCCCGGTTTTAGATACTTAGGGGGGCTAATTGACCCATTTGATACATAG
GGGGGGTTAGTGATCCAAACCCAATAGATAGGGGGGTTAAGTAGACTTTT
TTCTTTCATGTCTTGATTGATGCCACTGGCTTGTCGTTTGTTGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.