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GrainGenes Sequence Report: AA044060

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Sequence
AA044060
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044060
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAGCACGGCCGAACAGAGTCCCCCCGGCCGCCGCCGCCATACCCCGCCA
CCGTTCGCCCATCCAGCTCCGCCGTCCCACCCCTCCTACGCCGCCGCTGA
CTCTTTTCCACGCAGCGCGTCGTTCTTCCTCTACTGCTGGCGCAACACGC
CCGGCCCTTGCCATTCTTATCCTCGCCGGCGACCGTGTACCCCGACCTGC
TGCTCCCAGGCGAGGCGACCGGCCGGATGAGTCGGTGCAGCTGGGATACG
TGCGGACGCTTGGTATGCTTCCGCAAGTCTGGACACGCCATGGGATGCAG
CTGGGATTGAGTGCTCCAGGCCGAGATGAAGCCGGCCGCCGTGCGCGCGC
TCTTTGCCCTCTCCACCGACACCAAGCGGGACATCATCCCCGGCGGAGGC
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TGCTTTGCAACGAGCTGCGCAATTGCTCAGCTTCAGATTTGCACCGAACA
GGGTTCGATTCATCACTTTGAAAGCAAATTTAGCCATTTTAGTTAAGTCT
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CTGTATGTGCAATTGATTTTTCAGTGTGAGGATGGACTTCGCCATCAACG
CGACACAGTGGGCGGTGGGCAAGGCGCTCGCCCCTGTCACGGATGGCTTG
CTGGAGTCGTGGGCAGCCAGCACCGAGCTTGGTCACAACATGGACGCCCT
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GGGACGTTCGCAGCGTTGCGCTCAAGGAGCTGCTGCACAAGCTGCGAATT
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GCCAACAAACTCAAGCCTACCTCATGCTCCTGTGCTAATAGCCGTGGCAT
GTTGGAGCATTCCGACATGCCAGGATGTGGAGGGCGATTCCTGTGCGGTG
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CTGAAGTTTGATAGGGTGGAAATGTCCACAAGAATTGTGGAAATCATAGA
GCAGTTGAAGCCTGTATGTGCTAAGGTTTCCACAATTCTTAACCTAGAGC
TGTTGGGTTCCAGCCGTACTACTTCCCAAGAAATTGCTACCAATAGACCC
AAAACCACCCCAGAGATTATAGAACCTAAATTATATGGGAGGGATGAACA
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GGAGAACGTATTGAACAAAGACTAAAATCTAAGAGTTTCTTACTTGTCTT
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ATTCCGGAGGTAGCAAAGATGGTTGGGACAAAAGATTGTTTAGAACAATT
GGGAAATCTAGATTTTAAAAGTAGTATGTCTTTCTTCGAAGCATGTGTAT
TTGGCAAGGAAATACCGTGGAAAAATCATCCTGGTTTTTTTGATATTGGG
AAACAAATTGTGCCCCATTTGAAGGGTTCCCCTCTCGCCATTAAAACTGT
AGGTAGACTACTAAGGAACAAACTTACTTTGGAACACTGGAATAGAGTTC
TAGAAAGCAAAGAATGGGAACTAAAAACAAGTGACAATGATATTATGCCA
GCTCTAAGACTTAGCTATGATCATCTCCCTTTCCATCTGCAAAAGTGTTT
TTCCTATTGTGGTTTGTTCCCGGAGGATTATGAATTTGATAGCAAAGAGT
TAGTTCGCTTGTGGATAGGACTAGGTATTTTGCATTCATGTGATCCGAAC
ACCAGGATTGAAGATGTTGGACTGTGCTATTTAGACGAGTTGGTCAACCA
TGGTTTTTTCAAGAAGAGTGAAAAAGAAGATGGTAGTACCCGCTATGTTA
TCCATGATTTGTTGCACAACTTGGCTGTCAAGGTTTCTTCACAAGAATGT
CTTAGCATAAATAGTTCTAATGTGAGGTCCGTACAAATTCCCCGATCTGT
ACGCCACTTGTCTATCTTTGTAGACGATAAAGATGTTAAGGACAGAATGA
CTTTTCTGGAGTACAGTAGGGATCTGCGTGCACTAGGTAAAATTTTGAAT
GTTGAAAGCCTACACACTTTGATGTTATTTGGACAATACCATGGAAGCTT
TGCCAAGACATTTGGTGATTTGTTTAGTGAAGCTAAAGCCTTTCGTACCA
TTCTTTTGTTCGAAGCATCATGTTCTGTCGAGGATATTTTGCGCAATTTT
TCAAAAACTATCCATCTTCGCTACCTTAGGATCAAGACAGTGCATTATAA
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TAGATTTAGGAACATGGCAAGGCCCTTTTGATACAATAAGAGATATGAGT
AACCTTGTAAAATTGCGTTACTTTGTTGTGGGAAATGACAAACTACATTC
TGAAATATCTGAGGTGGGAAAACTCAAATTACTATTGGAATTGAGGGGTT
TTGAAGTTGGAAAACGTAGTGCCGGTTTTGAACTAAGTCAGCTAGATGAA
TTAACAGAGCTTGGAGGATCACTTAGCATTTGTAATCTTGAAAGGGGGCA
AGAAAAAGATATAAATGGAACTAAACCAATACACAGAAACCACTTACAGA
GGCTATCATTAGAATGGGCTGTTGACCGATCTGACAAGAATCCCACAAGA
GAAGATAACGTTCTTGATTGTCTTTTACCACAAAGTAATCTTCGTCACCT
GCGCATTAGAGGGCACGGAGGCACTAGTTGCCCAACATGGCTAGGTTCGG
ACCTTTTTTTGAAAAATTTGGAATCTCTTAGTTTGGATGATGTATCTTGG
AGAACTTTCCCACCATTAGGGGAGCTGTGGTTAGTTGATGATCTCGGAAT
TGAGTGGCAGGGTTGCGTCACAAGCCAAGGCTTTCACAATTTGAAAAGGT
TGGAGTTAGTTAAGATACCAAAATTGACAAAGTGGGTTGGAACTAAAAGT
TGTCAATTGTTCTGTCATTTAGAAGGTCTCATTATTATAGGCTGCCCTGA
ACTTATGGAGCTGCAGTTTTCATGTTCTACTTGCTATCAGCCAGAGCAAG
GAGTAGGAAAGATGATTTGGCTCCCTAGACTAAGGAAGCTCATGATTGTA
GATTGCCCAAAACTGGCGTCAATGCCGCCTGTTCCTTGGACCCGTGCTCT
GCGCTCCATAGAGATAGCAAGAACGGGCTTAAGGTTCAAGGAGCTAGGTT
ATTCAGAAAGTCGAGAACGGGGATTAACTTTGGTAATTAACGGTGTGGGT
GGCATAGATAGCTTGTTTTGGAACGAGTTGGATTTCTGTAATTTGAGCGT
TCTAAAATCTATGAGTATAGAGAATTGCCCCCCTTTAAGTTTGGACCGCA
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AATTGAACGAGTCAGCATTCAGAAAAATGGTGCTAGCGGGAAAGAATTGA
CTCAACTGCTTTCCCGTTGCACGAGGCTCACCCACCTGACTATACGAAAT
TATGAGAAGGTAACAGAACTTGGTGTGGTAGAGCAAGAGATGACAAGAGA
AGGAGTGGAAGCAGAAGGACGGCTGCTCTTGCCTACCCAACTAGAGGAGT
TGTACGTCTATGATTGCCCTGAGCTGAGCATAGCCCCCAGCCCCAGCCCC
AGCTCAGGGTCAACAGGAGGAATTCTCCAGCGTCTCTACTCCCTCCGCAA
GGTGGACATACGGTCTTGCCCCAAGTTTCTTTCCTCTTATGCGTGCTGCT
CATACTTGTCTTGTTTCCCGACCTCACTTGAAAAACTCAATCTATGGAAC
CTGGAGGGCATGGAGACGTTGGAGACACTCTCGAACCTCACCTCTCTCAC
TGAATTAATGATATCGAATTGTGGAGATGTGAGAGGCGAGGGCGTCTGGC
CCCTCACCGCCCAAGGTCATCTCACCGACCTATACGTCATCGGTACTCCC
AAATTCTTCGTTGGCCAACCACCACAAGAGTCAGTTCATTCCTCAAAACT
ACAGTTCCTCCGCGTCGCTGGCCCTGCAGCAGTTCTGCCGGTGCCCATCT
GCCGCCTCCTCTCTTCCTCCCTCACTCGCTTGAGCATTATGGGCAGCAAA
GAGGTGGAGCCCATCTCCGATGAGGCCCTCCAGCTCCTCACCTCTCTCCA
AAAACTCCAATTTTCTCGCTGCGACAACTTGCAGTTCCTCCCAGCAACGC
TACATACACTTTCCAGACTCGAGAAATTAGAGATCAGCCATTGTCCATCC
ATCCGGTCGCTGCCCAAGGACGGCTTCCCGAGTTCTCTGCAGGAATTAGA
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TCTCTGCCCAAGGACGGCCTTCCGAGTTCTCTGCAGAAATTAGAGATCTC
CGTTTGCCGTGCCATCAAATCGCTGCCCAAGGACTGCCTTCCCAGTTCTC
TGCAGGAATTAAAGATCTCCGCTTGTCCTGCCATCAAATCGCTGCCCATG
GACAGCCTCCCAAGTTCCCTGCGACTACTGGATGTCTGTCGTTGGAACAA
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CGATCATTCTCATATATTCCGTTTGGCTCGTAGAAATTGCATCTTTTTAT
ATGACTGGCCCACTAATTTTAATTAATCTTCTGTGCAGAGCTATTTTTGT
AAATCATTTTGATTGGTACATCACCAGCCTCATATAGAATTCAATGTCTC
AAGTGTAGTTCGTTATCTGGCTCCCAGTTGCCAGCAGCGAAAGCAGCTAG
TCCACATTCTGTATATTACATCTCTAATATACATAATCTGGTTAGTACAT
GCATAACCCAACGATTTCAAGCTCGATTTAGAAATTTCAACTACAGTATG
TTTATCCACATCCTGCTGTTTTTTGGTTTCCTAGCCGCTTTTCCTCTCAT
GTGAACAAATAATTCAATATTATGCAATTTAACCTGTCCCGCTTTACTCT
TTCCGGATCACACACAATCAGAACATTTATCTGCTTTCGATTACCTTGTT
AATGTATAATCTGAATAGCTTTATGTTTCCATCTACTCTGCAGTATCTTC
TTTTTACAGCCACAAGTTCAGAGGGACAATTTTAGTGGTGAAAATCTGAC
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TCCTCTTAGCCTTTTTCTAACCTCATAAGCATCAAAACCATTCAACTTAT
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ATGCCAACAAATATATATTTTTGTATCTTTCCCCAATTACCTTGTTTTTT
TTCTTCTGATTTATACATGTGAAAACAATTTTTTTAGTTTTGTTTGCCTC
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TGGACCTGTACAGGTTTGTACCCTTGTATAACTCACACTGCCCCCCATCC
TCCACAGTTCTCACAAGACATCCTATCCTCTGCCTGTAAATGAGTCTGGT
CAGTATGTACATTTGACCTTTAGATCATTTTTTCTGTTTGGTTTGCCACA
TACTGCATATTCTGAAAGCTGTTCTGTTATTAATTGTGCAGGGCTATATC
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CTGTACGTGGATCTGGTAAGTACATGTAAAATAAAACATTATGCCTGCTC
TACCATATCGATACCTAGATGATTTCAGAAAATAAAAATGATAGTTTCCT
GGATATGTTAAGCAAACTTTTTAAGGTTCACATTCAAGAGGTTAATGTCA
TATAAGTCATTCCCAAACTTGAAGAAGTTGGCGCATGTCTTATTCCTTTC
TTTATTTCAAAAAATAGAAATATCTTAGTTTTCTAGGAAGCCAAAAGTTT
CTACAACCAAGCTATATGTGGAAGCCTGTAAATTATCCTAAGACTTTTTT
TTCCGGGAAAATGCAATGACATTGCGTTTCTTTTCATTGCAAAGAAGAGT
TTAGGTTACAGATCCACCAAGCAGGTGTTGACAAGTTACAAGCATGCAAC
TAATTAATGTACATCCCAGTCTGTAGGGATCAGGACTCGGAGGCCAGTAG
CTCCAGCTCTCGCCCAGAGCACCGCTTCTTCTCTGATCAACCTGTTCAGC
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GAGGCTGAGGCGAGGCTTGGGTGTTGCTTGTCTGGCCGCCACCCACCAAT
CGTGGAGAGAGGGCTCGTTCTCCGGCGGTCTGCATGGAATCCTCAGCCAC
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GTGCTGCATGGACTCCGGCTCTTGGTTGCAAAGTAGGCAGCGCGCATGGT
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TTGGCGAGTCATAGAAAAAACATGACCCGCCGCGGCGCCCAGGTTTTCCA
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AGCATGACTTCGCAGAGTAGGTGCCATTTGAGCTCCACTTCCAAATGAGT
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GCCATTGAGCCAGCGGTCCTCCCAGAATTTGCCGCTGCGCCCGTCGCCAA
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TGCATATCCAGTCCATGCCAAGGGCGTCCAGTGTTGGTCTTGCTCAGCCA
AAGTCAGCGCAGGCGTAGGGCTAGGCCGGTGCGCTCGATGTCGTGGATGC
CAAGACCACCATGGGACAGGGCCGGCAGACCGCGCGCCAGTTCACGTGGC
AGTGCCCACCATTGGCTTCGGCACGCCCCTCCCAGAGGAAGCCTCGCTCA
ATCTTCTCGAACATCCTGATGGTTTTCTTGTGTGGGGCAAGGACCATAAA
CTGATGGATTGGAATGGCGTTTAGGACTGATTTACTAGTGCCAGCCTGCC
CGCCTTGTTCATCAGTCGAGATTTCCAAGTGGGTAGTTTGTTGGCTGCCC
TGTTGATCACTGGCTGTAGCTGGCAGTGGTGGGTCGCCTGATCGCCAACG
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TTTTTATCTTCATACTAAGGTCTGGTTTTCTTTAGAACCAGATGCAAGCT
TTGGAATATGATTTACATCAGCAATAGGAAGACTCGCGAATTCACCACCT
GCCATTTTGAAGATGTTCTGAAGTTTCCTTAATACAGCTCTGATGTTTTA
TTGAACGACGGAAGGTTCTGAACCAGTCAGCAGTAAGTAACTTGTGCAAA
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TCTGATCAGCCAACATTAAATTGGGATGTCACTTGTCCAGATGGTTTACA
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GATTCAGTAAGATATGGTTCTCTTTGTAAGCAAGTTGTCATGACATGATA
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TTCCATCCTGTCCATAATCTGGTTAGTACATGCTTAATAATCCTGTACTT
CAATAGTTAATCCACATCCACTTCTCCCTTCGTGTGGACCAATGCTTCCT
TGCTTGTATCTGTCCCCACTTAACCTTGCTTTTTCCTGGTCCCACACACG
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GTTGTCTATTTTCATACACTGTACAGGGTGCTCTATCTTGGAGTAGTACA
TTTTCCTGGTCCGTCCGTGCATTGTTCTCACATTACGGTCCTGTCTGGTA
TCTTCTTCCTGCACATAAATCTGGTAAATGCATTTGATTTGCAAGTTTAA
ACTCTTACTATTATTCTAACATCTTACTCAGTTTGTTCCCAAGCATACGA
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TGAAACGAATTTTACATTCAGTTTTCCTTTTTTGGTTCTGAAGAAAAATA
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CAAGTTGACAAATCAGTAAATGGCATTTCATTGTTTTTTTTTCTTTTTTG
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AAATACTTTGCATTTAAAGCTTGGTGCTCACTCATCAAGACATGTTGGTG
CACTTACTTGTTCAGAAATAAATGAGCTATCGTAGATTGTTTTTGGAATT
CACTATGCTTCGACAACCTTTCTATACAGTGAACATTTTCAGGTTTGCAC
TTCATCATGACAAGTTGTTCTCCAAGCCGATCATTTGTTTATCTTTTGTT
GCTGGCCTCATCTGTACATGGCATTGCATTTCCTACATTGGGATCTAGCA
TACTCCGCCAGTACATCCAAACCCCTTGTGGAGTTTCTCATTAGGAAAAG
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TGAGAGAAAAAAAAAAAAGAACAAATTGCCTGAAAGCAAGATTGGCACAA
AAATAAATAAAGAGAAACTCCCGAAAAGCCACTTGAGTTTTCCAATGAGT
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CATATTAGCCATTTCTAGTGTTGGATATGATGAAATTTTCCTGCCATTTA
ATGCCTCACTGGTATTTTCATATATTAGAGTTTTTATCAGCATCTCTCGA
CCTTCTCTAGGACAGGAAAAAGACAAAAACAAAAAAGGAAAAAAAATAAG
AAAAGAAAGAAAGAAAGGACGTAGAAAGAAATGAGTAAAGTAGAGTAAGG
AGGTGCCATGTTTTCTCTGTATCAAGCTCTCAGCCGTCATTTATAGCGAG
ATAAGTCTTATTGCTTTGGCGGATGCTTTATCAATTTGCTTACTACCCAT
TTATTCATCATATAGAGCTTAGCGCTCATGGCTAGTTGCTTCATACTTGG
CAAATATCCATTGTGCATACCTTAGCAAATCCCTACTTCCCATGTAGCAT
CGAAACCGAGGACATTGCTTGTGTCTTGGGGTCACTCTGCGTTACATGGG
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TGATCCATGCTTCCCAAGACATCAAATGGTTTGTACTATTAAAAATTAAC
TCTTGGTTCTGCGATCATGATACGGACTTGTCAATTAATTGCGACGTTAT
TTGTGTTTGAGCAGGGAGCTCAAGGTTGGTTCAATCCTTGGAATGATCTG
GCCAGAAAGACTTTGTATCATGTGATGAGGCTCCCTTTTAATAGAAGGTA
CTGGAGCTGGAGTTTTGAGTTGTCACGGGCCACTAAAGAGTCAACTTTCT
CAATGTTAGTCAAACGCTATTTCAACTTTATTTTGGTTTCTACTGCTCTG
TTTTTAACTTTATCTTGATTTCTACTGCTCTGTTTTTTTTTACTCGGAGA
ATTTCCATGTAACTATTATACCAAACTCGGTTCCAATAAGGAAATAAGTG
TAGGCATATGGCCTGACTAAATTAGTGACGGTGTGCTTGTGCAAATGCAG
GTGCACAAACCTCCGATGGACCAACCAAAAGCTTCGAGGAATCGGTTTGA
CCAGAACCATCGATGATTTATTTACGCTATGATGTGACGACGATGCGGCC
CTCAGTCGCTCGCTAATAACCAACCTGAGTTGCTGTTTCCTGGAGGGTCT
GAAGCTATGTGTTCTTTGTACCCCTGTTCATCAGAATATTTATTCCTGAT
ACCAACAATTGGCCCTCCAATGTGACTATGCAATGCACCATGTCTATGAG
AAATGTAATTATGCCCATGTGTATCTGCTGGCGTTGGTCTTCTGTTCAAA
GAAGGTTTTCCTTTTGGCAATTCTATGTCTTATTCTCTTGTCAAAACTTC
AAGTTTTTGGTTGGGTGATATATATGTATCTGATGGATGGGGGCAGGCAG
CTTGGTTTCTATGAAACGCTGAAGTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.