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GrainGenes Sequence Report: AA008772

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Sequence
AA008772
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008772
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTGTTCGTACTCGTCTCCCCAGGGTATTCCCTGTCCCCAATCCCCCACC
AGCGCGGCTCTAAACTGAAGTATCTCCGTGCCCTAGAGCTGCCGCCGTGC
CCTAGCCTGCCGTTGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCACCGCCG
GCCCCTCCACCTCTCAGGAGCGTCGCCGCCATCGCCGTTACCCTTCGTGT
CCCGGCTGTCTCAGCCCCGTCCGCAGTTTTGGGCATTGGTCCATCTCCAG
AAAATCTGATCCGCCCGCGATGGCGAGCGAGAAGCAGCTCAGGGACTGGG
TATCCGACAAGCTCATGTCCGTCCATGGATTCTCGACGACCGTCCTCGTG
CAGTATGTCATCGGGCTAGGTACGAGCAATATAACTCGGTTTGTTCTGCT
CCTGCCGGCTTCAGTTTTTTTTCCCGGTTCTAATTTGGGCTTGCGCGTGC
GCTCAGCTAAGGAATGCTCTTCTACTGGCGATCTCGTGGGGAAGCTCGTC
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GTGTCTTCTTATGGCTAAATGCTATGCTTTCCTTTGTCACAGGATTACCA
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ACGGCGAGTGCATCCTCTAAGAGTAGGAAGCATTTTAGGAGGAAGGCTGA
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CCCTTTAATCGTGTTGCTTTCATATGCGGTGAACTTAACTCGATAATGCT
GTGTTACAGGAAACAACAGCACATAATTCTGAGAGGAGTGTGCGAAGGCG
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GGAAGAGCAAGAAATTATACGGGATCAACAGGAAAGAGCTCAGCTAGAGA
AGAACATGAGAGAAAGAGATGCAGCACATACTCGAAAGGTGATTATCTTG
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AAATGGCGAAGCCTCTTTTTTCCCCCCGAAATGGACTTCAGGCACCCAAG
TTCTTTTAGCCCAATATCGTCCTCTAAAGGTTGGGGAAGTAATTAGTGTG
AACTACAAATCTCAAAGGGCTTACTTAACCAAAATGAGTTGACCTCCATG
CTGATATACATGTATTAGCATCACTTTATTAGTATTTCCTTGCATCACCT
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ATGTCTTCCAGTTATGTTTTTTAAATCTTGTAAGTTCTTTGAGCTGATGT
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AGAACAAGGTATACTTACCTGGACATGTATGCTAGTCTGCTTCATCATTA
CCATTGCAATTTATTGATTTAAAATTCTTGCCAGAGGAGCTTACCAGAAG
AACACAAGCAATGGACAAGAATGACACTTCAGATCTGAGGTTATTGCTGT
TGCAATATTTGTTCTATTTTTTCACTGTTGTTTTACTTCTATTTCTGTTG
ACATGGCACATGTAATAAATTAGTTCTTTTTGCTCATTATACTGATGAAA
AACCTGTTCAGTTCACATCGTGAACCATATCCAGTCATTATTCAAGAGGA
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CTTAGTGAAGATCTATTAAAATATTTGCCCATCTTTCTGCAAGAGGTTAA
TGGCTTCAGCTTTGGGTGAACTTGTTGTACGGCTCATCAAACTGAGCACA
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TTTGGCATGTTTCTTTTTTATTTGTAGAAAGGAAAATGGAATTAATTGAT
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GTCCTTGATGCTCATACACTGTTGGGAAAGGCTATTTGCAATTGCCCACC
TTTTTCTCTTGCATAGTTTTAAAGATTTTTTCTTGTATCCAAGCAGATGT
CATCATAGAAAAGAGAAATATATAATATAAGGATAAAATTAATTGAATGT
CAACAGATTTTGCCTGGCTTTAGGGGATTGATACTTTTGAGTTTATTATC
GAATATAGGAAGATTTAAGCCATAACATTGAGAATATCTTTCAGGAGTTC
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CAAGCGTACTTGCAAAAGCGAAGGGACAAAAAAATTGATGAGATTCGGTC
AGTACAAGAGAACTTCTAATGCAATCATATTGCTCTTCATGATGTTTTTT
GTAAGGTGAATTGGTACATGCATTAACCTGTTACTGTTTTTGTGGTAACT
GCAGGGACGAAATTATTGATCATGAATACATTTTTCAGGACGTGAAACTG
ACTGAAGCAGAAGAAAATGACTTCAGGTGCTGATCCTAACTGAGCCCAAT
GAAGTTATTCTCTAATGCTAACTTTGTACTGAGGAGTGGCGTTATGTATA
TGTGATGATTAATATAGGCTTGCTTTATCTCCTTTAGTTAGAAACGCACG
TGCATAGGCCACATTTGCAGGTAAAACCTTGACCTAATGGTTACCATGCG
CAGATACAAAAAGAAGATATATGATCTTGTTAAGGACCATGTTAATACGT
CAGATGATGTTGCTGAGGTATGTCCCCCCCTCTCTGAGAATATTGCAGAG
TAATGGTGATACTGTAATGTTTTGATATCAGTGTCATCAATTTGTCAAAT
CACATGAATTTCAGTATAGAATGCCTGAAGCTTATGACATGGGTGAAGGT
GTCAATCAAGAAAAGAGATTCTCGGTAGCAATGCAGCGATACAAGTACGT
GTTATATGAGGCCTTCTGTATGATTCTCCCTGTGTAACTTATTCTGAGTT
TGTTTAACTATATTGATTTTTGAATTTACCGGACAAGCAGAGATCCGGAG
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TCAAATAGGTAATATCATTTACTTGGATTTCGTATCAGTTGTGCTGCATT
ATCGACAGGCTATCAGTATTATCGTCTTACTGTCTTCCTGACGTTATATT
TATTCGCTATGTTCTATATTTAACATGAAACTGACTTGTTTCAGGAAAGT
CGAAACTGCAGTTTGGATCAAAAGATAGAAAGCAGTCTGGTGATGAATAT
CAGTAAGTTTTCTTCTTCTTTTGAATTGTTCATCAGCATTGTTTTCTGCT
GTGTCATTTCTCAGAGTCCATCTTTCTAGTTAGAGCTGTGAGTTTGTGAC
AGTGCCATGTAAGTTAGTTTGTACTTTATTGAGGTACTTCTGGTATTCAG
CTCAAATTTTGTTTGAACTGGAAGATGGATAATGCACAATCCAATTATAT
CAGGATTTTTGGTTAACTTTTTAAACCTCAATCAGCGTAAACTGCATGTC
ATATCCTGAAGATTTTCTGGTCAGAAATTTTGTTTTGAACAAAAAGATCA
CCGTAAGGGATTGCTTAGATTGGAGGTACTTCTTTGTGGATCTTTGGTAT
TCAGTTCAGATTACTGAAGCTCACACAAAAGTACCCCTCATCCAAACCGG
CTCTAATACTGAAACTTAATAAGTTTAACTAAATTTTCTGATTGCATCAC
ACCAATGTATTATTCTCTATAGCCTTTGACTGCACCTTTATTGGACAACC
TTGACCGCACCTTTGTTCAACAGTTGTTTTGTGCTCATATTTCCTTCTGA
ACTTCCTAGGTATATATTTGATGATGATCAAATTGATTTCGTTAAATCAT
CGGTCATAGAAGGGACTCAGGTAATCAGTTAAACATGCACATTTTCTCTC
CTAATTTGATTGTTTTAAGATATTGTTTTACTGAACTTTCTTGTTTATAG
TTTGAAGACGATTCAGACCAAGAGACCATTGATGCAAAAGATATTTTAAA
AAGGGAGCTCCAGGTGTGTGAACAGATTATTTTGAACTTATTTGTTACAA
ACACATACCTACTCATGCTCTTGCTCGTAATTATAGTTCCTAACAGTGTT
TTTTGTCTTTCATTCTGGCTTCCTTTTTGAACTAGGATGAGCGGAAAACC
CTTCCAATATATAAATTCAGAGATGAACTGCTTAAGGCTGTAGATGAATA
TCAGGTTCGCAAACCTTCTGTGATAGTAGTGTTCAATGCGGAACACTTAC
ACCATAATTCAGCAAACAACTATTCATGTTTTCCCAGTGCCTTTTCATTC
TTCCTCAAATTCGAACTATATTGACAAAAGAAACACCTCTCCTCTTTATA
AGGATCTGTGTATGGTCTAATTATGTAGATTTGTTGCTGTGTTGAGTTTC
TGGGGATATGCTTCTTGTAGGTTATTGTCATAGTGGGAGAAACTGGCTCT
GGTAAAACGACTCAAATACCTCAATATCTTCATGAAGCTGGATATACAGC
AAGAGGAAAGGTACGACGCATGCCAGCATTATTATGACCTAGGAAGTTAG
CACGTCATAGAGATGTAGTACTTTCTATTAATGCATATACCGCTTATAGG
AATAGTTGGATTTTTGTAATGCTTCACAGAAATCTGCAAAAAAGAAAAAA
CTCTGTAACATTCTATTGCTATTGTTCTATCAAAAAACGACTTGGTTCAG
CCTTAATGATGTGGTTGAAGTGAATTTATGGGCTCTGTCGACTGTAAACT
CATGGTAATTTTTGAAATTGCAGGTTGCTTGTACGCAACCTCGTCGAGTG
GCAGCCATGAGTGTTGCAGCAAGGGTGTCTCAAGAGATGGGTGTTAAATT
GGGACATGAGGTTAGTTCTTTTCAACTATATAATAGTAACAAATTCTGGA
ATGTGTTTATGTGATAGATCTGCGATCACATTATATGGAATTCTATGATT
ATAACCATGTTTAGTGCCACCCTACAGGTTGGCTACTCCATAAGGTTTGA
GGATTGCACCTCTGAGAAAACAATGATTAAATACATGACCGATGGAATGC
TTTTGAGGGAGTTTCTCGGAGAACCAGATTTGGCTGGCTATAGGTAATCG
TTCAGAGGCCATGTCCTTTATTTGATTTGCACTGTTGAACATACCACTTA
TCTCTGTTTCTCTGTGGTGTAGTGTTGTCATGGTTGATGAAGCTCATGAG
CGTACACTGTCTACTGATATCTTGTTTGGTTTGGTGAAGGTTAGCTGGGT
TGTCTTACACTTTTCCTATGTTTGTCTCCAGACTTATATACACCCACTCA
ATTGGTCATACACGTAATGCTCTGCCTGCAGGACATTGCTAGGTTTCGTC
CAGACCTAAAGTTGCTCATTTCAAGTGCAACCCTAGACGCAGAAAAATTT
AGCGACTACTTCGATTCAGCCCCTATTTTCAAGATTCCTGGGAGACGATA
CCCTGTTGAAGTTCATTATACAAAAGCTCCAGAAGCAGATTACATTGATG
CTGCCATTGTCACTATCTTACAGATACATGTGACACAACCCCCTGGTGAT
ATCCTAGTGTTTCTTACAGGGCAGGAAGAAATTGAAACAGTTGATGAGAT
CCTTAAACACAAAACAAGGGGCTTAGGCACAAAGATTCCAGAACTAAATA
TATGCCCTATTTATGCAAATCTGCCTACTGAACTTCAAGCAAAGATCTTT
GAGACAACCCCTGAGGGTTCTCGAAAGGTGGTCCTGGCCACTAATATAGC
AGAAACTTCATTAACCATTGATGGTATAAAATATGTTATTGACCCTGGTT
TTTGTAAGATCAAGTCATATAACCCCCGTACAGGAATGGAATCCCTGCTT
ATCAATCCAATCTCAAAGGCATCAGCAAACCAGAGGGCAGGAAGGTCTGG
ACGGACAGGGCCAGGAAAATGTTTCCGTCTGTACACAAGTTATAACTACA
TGCATGATCTTGAGGATAACACTGTTCCGGAGATTCAAAGAACCAACCTT
GCGAATGTCGTGCTTACACTCAAGAGTCTTGGTATTCATGACTTGGTTAA
TTTTGATTTTATGGACCCACCTCCTTCAGAGGCCTTGCTGAAGGCCCTGG
AACAACTTTTTGCTCTCAGTGCACTCAACAGCCGTGGAGAGTTGACCAAG
ACTGGAAGACGAATGGCAGAGTTTCCATTAGATCCTATGCTGTCAAAGAT
GATAGTAGCTGCCGAGAAATATAAGTGTTCTGATGAGGTCATCTCCATTG
CATCTATGTTGTCGATTGGCAACTCTATATTCTATCGTCCAAAGGACAAA
CAAGTTCATGCAGATAATGCAAGGTTGAACTTCCATACTGGCAATGTTGG
GGACCATATAGCTTTACTCAATGTATTCTTCGCTGCCCTTGTAATTTATC
AGAATTCATTTTGTTGATTAAATTTAGCTGTACAGGTCTGATTTCTCCAG
GAATATTTCAGGTCTATAACTCATGGAAAGAAACAGATTTCTCAACTCAA
TGGTGCTATGAAAATTATATCCAGGTATGTCTTGTTCTGTAATTTGTAGC
ATGCATTTTGGTGATAAAGTTTTAAGCTATTTTATCGTATCGACATCATC
ATAATAGCAGCATTCTTATATCAAGATATCACCTTCCTTCAGATTTTGTC
AGGTTTTTTGACTTCTGTTGCTACTAATTGTGAGTGTTGCAGTTGCTTTA
TCTGATAGATCTTTGGTATCTATTGTAGGGGATAATATTGAAGGAGATTA
AGTATGCTCATAGGGTCAAAGTAGAATGGCCATGGCAATCTAATCTAATG
GTCCTACATTTGTATGGAAAAATCATGTTTAACCTCCACCATGCCTAGTG
TTACGTACTCTGGAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGTTATGTATTGCAA
ATTGTAGAGCTACAGTATTACAAATTTACAATGATATATAGAACATTTTT
GCACATGAGCATCAGGATGGATGACACTTTTAATGGGCTGCAGAACATAC
AAACATATGCTATTTCTTTTGTGTGTGGGTTACTAGTGCAAAGCTATTTC
ATCCAGTGGATGTTGTTTTAGTCTCTAGCGTAGGGGCATATGGTATAAAG
GGTAATGAACATGGCATTCTTTATTAATACTTCTACATTTTAATACTTGC
CTGGTGTATCTTCAAATTTCACAACACTATAGTTAGCTTCTTTATGTGCT
TTATTATGCAGTAACTGTAATCAGTCTATCATTATTTCCATAAAGTTTAT
GTGATAAAATGCCCTTGCTTAAATCAGGTCCGCAGCATGAAGAGAGCAAG
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GGTACGACACTTGTGTTGATGCAGTTGCTTCATGTGTGCAAGTTACCTGA
GATATATACATCTGGTAAGTGAGTACTTATGGGTTGCAGGTTTCTTCCAC
CATTCTGCACGGTTGCAGAAGAATGGTTCATATAGAACTGTTAAGAACCC
TCAGACCGTCTTTGTCCATCCTAGTTCAGGATTAGCACAGGCAAGTTCAC
TTGGATTTATACCACTTCGTTTTGCCTACATCCATCCTCGGCATTGCATC
CATTGTACTCATGCAAGTTTTGGTTCTAATATTTTGCATTATATGTTTAT
TTGCATAATGCAGCTACTTCCTCGGTGGGTAATATATCACGAACTGGTTC
TCACGACAAAAGAGTACATGCGTCAGGTATGCACAGTTTATTCAGATTCT
AGGGAGTCCTGAAAGAATTGATTTTCCTGACTGATTCCGATTTCTGAAAT
GCTATGAACGATGCAGGTGACGGAACTGAAGCCTGAATGGCTGGTGGAAA
TTGCTCCGCACTACTACCAATTAAAAGATGTGGATGACGGTAAGTGTGGG
ACATGGTGTTATTTTTGGTTCAAGCTTAGTTTGGGAAAGTGATGTATAGT
AGCTTACGAAACGTTTCCCTTCTCTCTGCGCAGCTGGTTCCAAGAAGCTA
CCCAAGGGTCAAGGACGAGCTGCATTGTAGACAGGACTCACCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.