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GrainGenes Sequence Report: AA006991

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Sequence
AA006991
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006991
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTGAGATCGCACGCTCCCGTGCCTGTTCCCCCGACCCCCATCTCGTATCC
CTCTCCCGGCCCCGCCTCTCCCTCTCGCGAAACTAGGGTTGGGCGCCCCA
CCCGCCGCCCTCGTCGACGGCGACCTCTCGCGTCGCTGCCGGCAGCCTCC
TCCTCTTCCCCGCCTCCCTAGAACCTTTCTCCGCCGCCCTCTCCATCCAC
AGGACCTCGACCACGACGACCAGACGCCGCGGGACCTCGACCACGACGCG
TTTCCTCCCCCGACCTTGGCCATCCTCCCCGACTGCCGGCGCCACCCTCC
GCGACTGCCGGCGCCACCCGCTGAGGTATAGCAATGCGCACCATCTTGAT
GTTCTGATTTCAACATTGTACCTGTGAGATTTTCTGAATAAATGGTGATG
GTCAGATTCATGTATGTCTATTCTAGCATGAGTTGGATGATTCATGTTGG
CTTATTCTCAAATCTCAGTTCAAGTTCATGTTTGTATGCTCCTAATACCA
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TGATGTAGTGTAGTTCTTTTGTAAAAGTTATGGGACTGGATGTACTCATA
TGATTCATGTAAACTCGATTGCTCCCGCAGGGGCATCTGCCGTGTCTAGG
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GTCCATAGACCATAGTCATTGAAGCGGTAAATACACACCATTACCATAAT
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TATGGACTTCAAGCCAGTGGAGGATTTTTCCTGCACTGCTGTTAGAAATC
CTGCTTTGTTACACATTGTATTGGCAGATCAGCACTTGCCAAAGAAATGC
TGATGGATCCTCCTGTTATGCAAGCTGATTGCCAGTTACAGAATGATGTG
GAGAAAATATCATCTATTGCTTATGATAAGAAACATACCTTATCACATGA
TAATTATGGGTGGCAAGGCCCTGATGTTCATCTAACAAATGATGCCCATA
ACCCTGTTGAAGTTAACAATTCTTCTCGAACAGGCACAAATGAGAAATTA
GATGGTTCCTCTGAAAAGTCTTCTGTCATTTTGGATGGTTTACCTCATGT
GAATTTTTTCGCACCACATAAAGAAAAGAATGGCCAGGATGCTTACTTCA
ATGATGTAAGATTTCAGTTGAACGTAAATACGGACAATGATGGCTCCCCA
GGCGAGGATATCAACTGCAATAAACACTGCATTGGTAAGGAGGATTTGCA
TCATTCTCAGGAAGAGCTGCATGCACCTGCTGGTAGAGTGACAGGACTTA
GGTCATGCCAGTCAAACGGAGATTCCCTAGGCAAGAAAATGATAGAACAA
ATCAAACATAATTTCAATGTTGATGCAGAAAGTAAGGAAGTCAGGACTGA
TGTGGTAGGTTCTCACGCAGTGCAAAAGGAATTACATCACACAGTTAAAG
ATCTTTCAGAAATAGAAAACGGCTTTGGGTTTGTACGTAAAGAATCTCAG
GAAGAGAATGAATCATCTGTCTCACCTAGAAACTGCATGGATCTCCTTGT
TCATAACAACAGTTGTAATGGTAATACTAATGATACTGGCGGAGAGATGG
ATACAGAAAATATTGAAGATCATACTGCTGCAGTTTGGGTAAAGGTATGT
TTGTTTATGTTGAGCTGCATGATACACAACTCTGTATTCTTTCCAAATTC
TGTATTTTTAAGATGTATTGGTGCATCCTATTTTTCCTAATTTCCTGTAT
AATAGTTAGTACAGCATGTGTACACCATGTCACAAGGTTTTCAGTTTGTT
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GGGTCTTCTGCGAAGACCTTGAAATTAAGAAACTCTTAATTTCTAAGTAC
TACCAATTTTTTGTTTACATTTAGCGAATTTTCAGCCTTGTAGAACCTAG
TCTGTGCACAAGTATAATAATGTTTTTGCAAGGTTGTTTGTAGGTGCTCC
CTCTGTCCCAATGCATATGGTGCCCTCGTTTTGCGTGTTTAAACTTTGAC
CACTGATTTAACCAATAATACATGTGTTGCTTGTTATAAAATTGTACCAT
TAGAAAAATTATTTAAATTCAATTTCAATGGTATAACATGCATGGAAAAA
AATCATGTTTACTTGTTTAGTTGGTCCACTCAATGGACAAACTCAGACCT
AAAACCTTGACCATATAAATTTAGAAAATAGCCCTAGAGGTAGGCGCTAA
AAGTCACTGATATTTTTCAACAGCCCCGCCCCCACAATTATTTGACCTTA
CATCCCTATCCTCCGACCTTGTATTTATATGAGTGATACATTAGAAACAC
CATCAAAATCTTATCAAACAAGCGTAGTGTGTGCTTCAATTCTCTTAGTT
TAAATGTAGTACTATTTCTACTAGATACCTGTATAAACTACACAAAGGCG
TTTGTTTCCTATCACAGTTTTTATGGCTTTGTCTATGTTTTGTAATGCAT
AACTCACATTAAAGTTTCTAAACAGTTAACTTTTGCTCTGTTTACTCTAT
TTATTTACTGCACCATTTAAGTCCATAATGGGGTTTCCTATGATTGAAAT
GACTATGTTGGCTGCATATGAAGTTATAGCTATAATGGGGTTCTACCTTT
TATGCATGTGAATCGCTTCCGGTATCTCCAATTGCTTAACCCTGAACTAT
CATTTTTTTTGGTCTGTAAACAGTGGAGAGGAAAATGGCAAACAGGAATT
CAATGCTGTAGAGTAGACTATCCTTTGTCCACTCTCAAGGCAAAACCAAC
AATTGATAGAAAGAGCTATATTGTTGTTTTCTTCCCACGAACTAGAACTT
ATTCTTGGGTAGACATGCTACTTGTTCTTCCAATCGATGAATATCCTGTG
CCACTCGTGAATGGAACTCATCACAAATGGCGAAAGCTGGTGAAGGATTT
GAGTGTTCCTCGGCAATTCATCATGCAGAAACTTGCTATCTCAATGTTAA
ATTTTAGTGATGAACTTCACACTGAGGTATGCTATTTCCTTTAAGTATTA
TTGTAGTCATATAGCATCATTGTTGCTCTTGACACAGTTTATATGTTCAT
TAGGCCATAACTGTGAATGCCCGGAAGGCGACTGTTTGGAAAGAATTTGC
TCAGGAAGCATCGTGCTGTAGAGATTATACTGTGCTTGGAAAAATGCTTG
TCAAACTTCAAAACGTAATGACCCTTTTCCTTACTCGTATATCATGTTGG
CTCGTATGCAGGTTTAATGCTCTTCTATTGAGCCAAATCTTACGCATTTT
TCCTCTCATTTGTATTGTATAATGGAAAGGTATCAGTAACTTAATAACTT
TTATGTGTGTATATTCCTTTATCGCCTTATGTGTCAGATATCTTTGACAG
TGATTTGGCAGTATTTCTATAGACATTTTTGTACGGTAAATAGCTTTGTC
TGCTGTTCCTGGATAAGAAACACTCATGTGTGCACCTTGATACCTTCTCT
GTTCTATCTAGGAGTGGCATGAATAGTTGCTATAATGTAATTGCCACAAC
TATGTCAGGTCTTGAAAATAGCTTTCTGTGCAGCAGCATTAGGCTATTAC
TTTACAACCTTAACACAAAATGTTAAAATCTCCGTTATCGGAAATTGATT
TGGAGATTGTTCAAGATGTAAGGACATGTTTGAGAGTACTGGTAGAAGAC
ATATATGTGGTACATTGCTCAAGGTCCAAGGCCAGCTGATCATATAAAAG
AGGATATACAAAAATAGTTTTTGGCCGCATTAGGCCAATACATCCTCCTG
TTTATCGGCGAAGAATTCTAAGAGCACAGCTGAGCAGTAAGATGTTCATT
ATGACCATCTCTGCTTCATCCAACATACACTGCTGATGCTGCAAAAATAA
GAAAAACGTTTTGATTCTTTAATACTAACATCGGAGCAGCCTCATCCTGG
CATTTCTTGGCATTGTTTCACCTTAGTTGTTTAATTTCAGATGATTCTTC
CAGACTACACAAGCTCTCATTGGCTGCAAAATTCTTTTGACTTGTGGGTC
CAGAAGTGTAATGTTGCTCATGATGCTGAGACTATTGAAATCCTAGCCGA
GGTAATATGGATTCCGTTCTCCTTTAGGTAGCACTTTTGTTTTGGAATAG
GTGATTTAGTTTGTATGAAATAATTACCAAGCTGTTTTGTTTAGTTTGTG
AAGTTGCATGCTCACAAAATATGATGTTACATGTTTCCTTATATCCATTT
CTCTTTTCACCATGAAATCGAATATCTTAATATGATTGTACACATATCAA
TATGGATACGGTGCTAACCTCGATCTTGGGTTATGATTTTTTTGGAGAAC
ATATTTTTGTTTTAAGATTAGACATATGGCTAAGCTCTTGAGTTCCTTGG
ACAAGCTACATATATCTAGATTATTGAAGATCATAAATAATCCTGTTTAG
GTATGCGCTACCTAGCCCAGTTCTACTCTTGCAATACAGGCTGCTTCTGT
GGCTTACAGTTAAACTTTCTGCCTTTTATTCGGCCAACGCATTTATGAGT
GTGTCCATGGGTCAGCTATATGGGTTTCAATTTATTTAAAATCGAGTTTT
TTTAAGTTGCAAATCCAGCTGACTTGCCACTGTATGATTAGCTGTCTAGT
TAGTCCTGATATGACTGGCTAGTATTTGTTGCTCACCACAAGGATATCCT
GACAACATGTACCTTGTTGGATAAAGTGGATGAAACGGTGCAAGATGGAT
ACACACCGTAGGGAAGTGTTTTCTCATTTAGATATTTTTTGAAAGACTAA
TTCACTTTCATGTAATTGCGTAGAGCTTGATAATTTTGTTTAATTTACTC
CATACCTTCTCTTTTCACTACATTGTCATCAGCTTGGCCTACGGACAGTC
AATGAACACTGAATCTGAGATATGGTTATGAGAAATGGCATACAATACCC
CTAACGACATGTACAACCACTTGACCTGTTTAAAAGCATCAGTTACACTC
ATTTGTGGCGGAACAGGGGTTTGTTCACGTGCATGGATGAGTGCGTGTGT
GTGTCGACATGGAGAAATGCCCACTCTTTTTAAAATCAGGTAGATCAATA
TGGCCTGAAGAGTGGATCGTAATAAAAGAATAGAAGCCTGAAAATTTCAA
CTTGTAACTTGAAATTTGTGTGGCATGAAGTTTGTCAATGATGCCGTTGG
TGTTACAAATCAAACTCTGTAGCCCTATCTCTAGGTCGCCAATGTTGCCT
TACTGATGATTATGCATATTGCATAATTGCACATGTAAGATTTTTATGCA
CTATCTTTTCTTTTTGGCATATATAGATTATTCCCTTTATTAGTTTTGAC
TCATCATACAATTTCTAAAGCTGGTTAAACTTCAGCTACCTTTCTAATGT
TATCTTTTTAACGCAGGAACTTAGGCAATCTATTCTTTGGGACAAGGTTG
ATGAATTGTGGAATGCACCAATGCAGCCTGAATTAGTACCAGAGTGGAAA
ACATGGAAACAAGAAGTCATGAAACAGTTCTTTTCATCACATGCTGTAGG
TAACACGGGCAACTTTGAACAAAGCAATAGCTATGATGATCCAGGTATGG
ATCAACAAACTCGCAGAAAGCGTCCCAAACTTGAAGTTCGCCGAGGAGAA
ACACATTTTTCTCACATAGATGATGCTAACTGCAGCACTCTAAGCGAGGA
CCCAAACTGTAATAACCTCCCTAGTAGACCTATCACTGATGGAACTATAG
AAGCATCAGCGTCAACAGATCAGAATAACACTGTCACCTTCCTCAGTAAT
TCTGAGCCCCGTGAGATTGCAGAATCATGCAGCATCAACCCGCCTTTACA
GAATGCCAGACATGAGTTTGATTCCTTCAAGAATTCTAGGCAGTGTTCTG
CATACATAGAAACAAAGGGAAGACAGTGTGGCAGGTGGGCAAATGATGGT
GATATTTACTGCTGTGTGCATCAAAGTATGCATTTTGCTGACCATTCATC
TAGGGAGGACAAGGCGCTAACTAGTGATACTGTAGTTTGCAGTGGTATGA
CTAATCAGGGTAGACAATGCAAGCATCGAGCCCAAAATGGTTCTACTTTC
TGCAAAAAACACCGCTTTCAGACAAACCTGGATACAATAAGCTCAGATAA
TTTATTCAGTTCAGCTGAGGGTCTTCATAAGAGGGAAGAGTCTTCAAATA
AAGGGATGGCCAGTGGTTCCCAAGTTTCAGTTCAAGTTAAATTGATCCCG
ACCATGGCTGAGGAGATTTCTGGTGATAAAGCTCGTGGATTGGAGAGCAC
TGATTTGCTCTACCCCATGTCAACTTCCATGGCAACAGCTAATTTAGATG
TCCACATTTGCATTGGAATTCTTTCTCATGACAACATTGTTGAATGCCAG
GATTATGCTAGGCGTCACACACTTTACTGTGAGAAGCACCTTCCAAAGTT
CCTTAAACGTGCCAGGAATGGAAAGAGTCGACTCGTCTCTAAAGATGTCT
TTATCAATCTGTTGAAATGTTGTGCATCAAGAAAAGAAAAATTATGTTTA
CATCGAGCATGTGAGTTTCTTTATTGGTTCTTGAGAAACAACATTTCTCG
TCAACAGTCTGGTCTTGATAGGGACTATATGCCTCAGATACTAGCTGAAG
TTTCTAAAGATCCAGATGTTGTAGATTGGTTGTTAAAGTTGATACCTAGT
GAAAGAGAAAAACTCGCAAATCTTTGGGGCTTTGGTGCAAATGAATCTAA
CCAAATATTAACTGATAACCAAGAGGGTTCTATGATGGTGCTACAAGAAG
AAATAACTAATCCTTCCGCTGGTCTGAAGTGCAAAATATGTTTCAGAGAT
TTCTCTGATGATCAATGCCTTGGGTTACATTGGACAGAAGTTCACAGAAA
GGAAACTCGATGGCTATTCAGAGGGTATTCCTGTGCTGTTTGCATGGAAC
CATTTACGAACAGAAAAGTTCTTGAAAAACATGTGCAGCAAAGTCATGGT
GCTCAATTCCTCCAATATTCAATTCTCTTCCGGTGCATGTCATGTAACAG
CAACTTCTTGAACATGGATCTTTTGTGGCAACACATTGTTTCAGATCATA
CCCACGAGTTCAGGCTTCTCGATGCCCCTCAACGACCGAAAGGTCAATCT
GTAAAAAGAACAGAAGGGACAAGTATCAAAGCCCTTTATGATAACCATAA
CCTTGGGAAGGATGATGGCTCTCAGAAGTTGACTTGTAGACTATGTGGAT
TGAAATTCGATATACTGCCAGATCTTGGACGCCACCATCAAGTTGCTCAT
ATGGACCAAGGTTCCGTTGGCCACATGCCACCAGGACGTGGGAAGTACCA
ACTCAATCGTGGTCGACACTACTATTCTGCCTTCAAGAAATCCTTACGGC
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AAGATTTCAAGCTCTGATTTATCTATGATAACATCACAAATGGTGGAATC
TGAAACAGCAAACCTTGGTAAGTTGCTGGATTTCCAATGCTCAGATCTAG
CGCAGACTCTGTTTTCAAAGATACAAAAGACAAGATCCCATCCAAGTAAT
CTTGATATTTTATCTGTGGCCCGTTCTGTATGCTGTAAGACAAGTCTTCT
TGCTGCATTGGAAGTTAAATATGGAACCATGCCCGAGAACATATATGTGA
AAGCTGCAAAGCTTTGTAGCGACATTGGCATCCAAATCGATTGGCATCAA
GAGGAGTTCATTTGCCCTAACGGTTGCAAATCTGGGTATAATTCGAATAC
CCTGCCACCTTTGCAGCCTACCCAAGTTGATCTTCTCGTAGTTCCTTCTG
TGACGAATCCTCCAGATATTGATGGAACGGGGGGTATGGAAGAATATCAT
TATGTTCTTGATTCAGAGGACTTCAGGTGGAAGCTTAAAAATGAAAGGGT
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GTGCCGTTGATGTTGATGCAAAAGAATTTCTCCGTACGAAACCTGAAGAA
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AGCTCGTTTGATGGACTCATCCCTTGTTGATTCAGAGGTACTCTTGGAAA
TAAATTATCATCAATACATAAAAGCATATATGTTCTATAAAAGTGGCTTG
TTCTTGGTTCTTGTCTATGTAAATTTTTTTTATCTTCATCAAAGTTTTTT
AATAAATTATTATGTGTCTGCAGAATTGTGTAGTCGGCTGTGCATGTTCT
CATGCCCATTGCTCTCCTGGGAAATGCGATCATGTGAACCTCTTTGACAC
TCTCCATGAGAACCCAGTGGATATCTATGGTACACCCATGCAAGGGAGAT
TTGCATATGATGAAAATAGCAAAGTAATTTTGCAGGTAATAATTGTTTCC
ATTTGCACATCTTTCCTCTAGATGTTTTTACAAGTCTGCCATCATTCATG
GAATTTATAATAATGAAAGATATGAAAAAAATGTGGACCAAACAAGTGAA
CAGCTGTCCTTAACTATTGAATGTTTGTGGGAGTAAAAATTCTTCTTCTG
CACTTAGTATGCTGTTGATAGCGTGGTTGATATCAAGATAAGCAACCAGC
AGGTTATGTAATTTACTAGTAATTTTTTATCTTTATGAGTCTAGAAAGGT
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GTATCCTCTGTTACATATGGTTGTTAACTGTATCAGGACCCAATAGTCTA
ATTTCGCCATTCTACATTGTGAGTTGCACAAACAATAATATACAGGCCCT
CTAACCAGCATTTACTGTTTTTTACATCCATGGTGACTATTTTTGAACCA
TGAGAGTATATCAGCTCATGCCCTCTTTAAAATCTAGAAACTCTAAATAG
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TGTTGTACTTGTGTGCTTATATTTTGTTAAACTTGCAGGAAGGGTATCCG
ATATATGAGTGCAATTCTTTATGTACCTGTGAAGCATCCTGTCCAAACAA
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ATAAGGTGAAATACTCATAACCGCAGTTTGGTTTCCATCAATCCTGCTTG
CGGGCCATTGCACGATAGAACTTGTTGCACAGATTGTAATGTTTTTCTAG
TGCTGCAGGGTTGGGCTGTTAGAGCGGCAGAACCTATCCCACGGGGCACT
TTTGTGTGTGAGTATGTTGGGGAGGTTGTGAAGGATGATGATGCCACAAG
AAACGTAGAAAGGTTTGCTAATCCTTTTTCATGCCTTTCTGTTTAAGCTA
AAACTTACTGAAGTTTTAAGAAGTACAGAACACAGGCATCATTGAAATTT
TCATGTTTAATTTGATGACCATTTTTTGAATTAGAAACTTTGAGGAGACC
CCAACAGTAAAATATTATAAAAGTTGGAATACTTGCAATATATAGACAGG
ACATGCACAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGACAGGGGT
ACACACGTTGACTAAGCAAGCTGGTCAGGCCTATCTTTCAAGGAGATGCA
AGCTCTTCCTTCCTAGAATGAAAGAATAATTATATCCTTTTTAAAGAGAA
AAGACCAAGATGCTAGACTAGGATTCACATTGTAAAGAAAAACCATGTTT
CGAAATATACCATGCTGCCATGACGAAGGCCCCATAAAGTGCTTGACATC
ACAACTTACAGGCCCAACCTTTGTCCAATCTTGCATCCAATTGGTATTTT
CATCTAACGTTTCTATCACTTAATTGCTGGGCGAGTTTGAGCTATTCGTT
GTGGTGTCATATGTGAGATTTGCATGGTTGTGATTCTGTTGTCCTGGTGG
GGCACATACTGTTGAATTTTCATCCCCCGAAATTCTTTTCCTGCATTGCA
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TGCTCGCCAAACTGACATCAGAGTTGTTCCATTTCAGTGATACAAAAAGT
GTGTGCAGCTACTTGTTTGACATGGCTTCACATATTGACCGGGGAAGAGT
TGAGACTTCAGGGACTTGCCCGTACATGATTGATGCCACAAGATATGGGA
ATGTGTCCCGGTTTATTAATCATAGGTAACAGGCCTGTTTTAATGTACTT
TAGGAGCAAATCGATTTTGTGACTAAGTTTATTTGTGTGTTTCTTGATGA
CAGTTGTTGGCCTAACCTGAGCACCCGTTTAGTTGTGGTAGAGAGCCGGC
TAGCTCATGTTGGCTTGTTTGCTAATCTAGATGTAAGCATGTTTTTAACT
GTAGTATTCCAGTTACATACATAAACGTTGACAACCTGATTGTTTTTCCT
AATTGCTGCTACGCTATCCTACAGATTGCTGCTGGAGAGGAATTGTCCTA
CGACTATCGACGGAAGCTGCTACCAGGCGCTGGCTGCCCCTGCCATTGTG
GAGCTCGCAATTGCCGAGGCCGTGTTTACTGAATTTGCAGCTTATCTTGA
GAATGGTAGCAATTGTTTTTGTTTTAGTTTTCCTAGAGCTAGAATCTGAC
TCTTAGGGCAGGGGTAGCAACCAATTGAATGCAGAGGCATTCATGCAAGC
AATAGTGTTTGTGACACAGCAGTGGCACCATAGCAGTAGTTTTAGTCATG
CTTAACTGATGATTTGTTAGAAGCAAAGCCTGGAATTAGCGGCTGCGTTT
GTTTGTTTGTAGGCGAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.