Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA030248

[Submit comment/correction]

Sequence	AA030248
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA030248
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTCACTCCTCCGCAGCTAGACTTTTCCTCTCTACCCTCCCGCACCTTTC CTCTCCCTCCCCGATCCCTTCCTCGCCCACGCTGCTCTCATGCTCTGCCC TACCCAATCTCTCCTATAGTCCACCATCGCCGTGCTCCCCCAACAGCCCC GCCGCTGACGCGCGTCGCCGTCGTCTTCTGTCGGGTTCCTGCCTCATCGC GTCCTGCTGTCTCCGTCCCGTTCGTAGTACCAGAACTTCTCTCCCTTTCT TCTCTCTTCCCCCCCGAGTCCCAACCTACAGCCGCCGCGCTGCTGTACCG TACAGTCGTCGCCGACGCCCCAATCCCACGCCCCACGGCCCCCCCCCACC CCCGGCTCCGAACACCCCCGCCTCTCGCGCGCCGCCGCCACCGCCGTTCC TGTTTTTCCTCGTCGGGACATTCGAGATCCTGCTGTCTCCACCTCGGCCG CAAGTCTCCGGTGAGTTCTTTCTGATCCAGCGATTAGTTAAATCCCACTG ATGTTCACGACTTCTGGGTGTGCCGCTGCGCACCCGGCACGCCATCTAGA TCCACCCCTGATGACAAGCAATGCGCACTTCCCACCTATATCCCTGTTAT ATTTGTTCTGTTTTTCTTTCGTTGCAGATTATTTAATCATACCAACCATT TCACACGGCATTGGTGCCATGATGTGCCATTCACTTATTAAGCTGTATCA AAGTCTTCACCCATTCCGATGTTCTTAAGGTCCTGGTTAAAACAAAAGAG ATGGAAGGAACTGAGCTAGACAATCCAACTTCCAGAAACCCATCTCAGAA GTCCAGCCGCCGTTCTAGCAGTCGGCGTTCTCAGAAGTCAGCCGGACAAC AGTCTTCCCCCACTGTATTTCCAGAGAAAAGGGGCAAATCTAGATCTTTG AGGCAGAAGCATGCGGCTGTTGACAGTAAAGATGGCAAAAGGGGTAAAAA CCATGAGCTTAGACCCGACGTGGTGGATGAGATGTCCAATTTTGTAGGTT TCGAAGTCTATGCTGGGAAACTGTTTTTCGACAGGAAAAACAAAAGTAAA GTAGTGGATGATCACAGGAAAGCTGATGCAACGGATGCAAGGCTCACAAG TAAAGCCCTGATTTGGGGTTCCACTGTACTCAGCCTTGAGGATGTCATGT CTGTAAGTTTCAGTGACCAAGATGCACTTCAATTGTAGTTTGGCCTAGCT TGACAATCCAGTGATTTTGTGTGCTGTGTTTATATGTTCACAGGTGTCTT ATAATTCTGGCGCCCAACATTTTACTTTGCATGCATATCCTGCTAAGAGC TCTTTATTCGGAAAGACACATAGAGTTCGGAAGGACTTCCGGTTTATAGC CTCTACACTAGATGAGGCCATTTTGTGGGTAACATGCTTTGCTGAACAGA ACATATACATTAATGTACTACCACATCCTTCAGCAGACCAAGACGCAGAT GCCCCCCTTGGTGGGGTTTTATTTGATTATCCGCCCATCAAATCTAGAAC TCCGCAGAGAGTACTTGTTATACTGAACCCTCGATCTGGACATGGTAGAT CAAGCAAAGTTTTCCATGAAAAAGCAGAACCTATATTTAAGGTAACTTTT GATGCTTTAACTGCCAAACTTCAACCATTTGCACCACATTTATAAGAGAT ATTGTAAATAGCTGTATGTATCTGTTTGGCAATAAACTTGCTTCGTGAAG CATCGTTTTGACCATTTGGTTTTTAGCCTTATGGAAACCTTATGAAGAAA CTATGTTATTTCTTAATTTATATTATTCGCCTTTTAGCATATTTGGTGTG TAACTTGACCCTTACTTTTCAGTAGTTTATGTAATATTAATATAAATTAT AATTAGCACAAAAGTACTTTTAACATCAAATCTACTGATGTAATTTTAAT TTGGATAATCTAGGTACTCTTAAAAATATTGTTGGTTAAGTGTGAGCACA GAGCAGACATATTCTGAATTAACACTGAAAAAAGGAGGGGGTATTACAGC TTCTCATTAATTTCTACCTGTAATAGTAAAGGTTGAAAAAAATGGAATGC AGCAATTGAACTGGACTGAATAGCTGTGTTAAATACATGTAAACAATTTT AGCAAGATGATTAGCGTTTTAATTCATCTCCCCTTGCAGCATGGCTGAAA TTGGCTGTTGTAGTCTTGTAGAATTCACATGAGCTCACTTTGAAATGAAC TAAGTCTGTTGCTGCGAATCTTGTTCTCCTGTAGATTATTTAGAAGATTG TTTCATAAGCTGAGATTTCTAAGCTCCTCTTACGACAAGAGGTTGGCAAT TTTTGGCGTACTGAGTTTGATTTACTATCCAATATAAACACTTCACACTC TTATGCTTAAACGTATTGGTTCTGTATTGTTTACTACCAGCAACTAATCC CATGTGATCTGTGATGTGGTGTAGCTTGCAGGTTTCCACATGGAAGTGGT TAAAACTACTCATGCTGGTCATGCAAAATCGCTCGCGTCTTCATTTGATT TCTACGCGTTCCCTGATGGTATAAACTTTGCACATGCAGCTATAGTTTAT CTAGGCCCCAAGATAGAGGCAAACATTTCAGCTGGTCTTATTAATACCTT GATTTTTGTTCTATATTGTAGGGATTGTGTGTGTGGGCGGTGATGGAATT GTGAATGAGGTTTGCACATCTTGTTCATATCACAATAATATGACAGAGTA ATTTATACGTTAGCTCAGCTCTTATAATTCTGCAGGTGTTCAACGGTCTT CTCAGCAGAAGTGATAGAACAGAAGCTGTATCAATTCCAGTTGGAATAAT CCCTGCAGGATCTGACAATTCACTTATTTGGACTGTTCTGGGTGTTAAAG ATCCTGTTTCCGCGTCATTATTAATTGTTAAGGTATGCTAAATTTACCAT TCTCTTGCATGTTGAGAAGAATCTTAGAATTATTATTATATTCTCACCTT TTCCTTATCCGAAATTAGATTATCACTTTTAAACTTTTCTCATGAGAACT ATCCCTTTGTAACAGGGTGGCTTTACAACACTAGACGTATTGGCTGTTGA GTGGCTCCAATCAGGGCTAATACAGTTCGGCACAACTGTTTCATACTATG GTTTTGTTAGTGATGGTAATTTCAAATGAGTTATTACATTTACTTTGTTC CACTACTTAAATCCTGTTTAATCTGATGTACTCCTCCAGTTCCCTCAAAC TTTTCGTTTTGGACTTTAGCCAAGTCGAATTTAGAAAATCAGACTACTTT GTCTTGATTGTTACTATCATGATATATAGTTTTGTTGGGTTTTATACAGT ATTACAATAGATATTAGCTAGGTGTAAAACGGCAAGAGTAATACTGTATC TGTATGCCATATTTCCTCCGGTCGTGAATAAATGACTTCCTAGAACTAGA AAGCATGCAACAAACTTTTGTATTTTAGTACTTATAGATACAGAAACAGT TAGATTGGTAAGGTGAAAATAGCAGCATTAGAATTGCCATGAAAACTATT TTCATGACATAATTGTTTTCTACTAGCATGCAACTGCAAAAGCTAATGGT GCAACATACAGTACTTGTTAAGCTGTTTCTTTTTTTACTTCTGTATTAGA TCTAAACCTCTCTGAGCAAATGGTGTAGCTACTTTATTTCTCATAAGTAT ATTCTCAATGTTTTTCTAGATCTGGGTATGGTTTAATGACTGTAAATTAA CTAGCATAGCATAGCACTGAAAACTTGAAAAGATTAATAAGCTGAAAAAC TATTATAACTTTGCTGCAGTCCTGGAACTTTCCGACAAATACCAGAAGAA ATTTGGCCCTCTTCGATATTTTGTGGCTGGAGTACACAAATTTTTGTGTC TACCAAGCTATTTCTATGAGTTAGAATATCTTCCTATGTCAAAGGAGATG TCTGGGCATGGAAATGGTACAAAACAAGATAAGGTTGAATTGTCTGATGT CTATACAGATGTAATGCGCAGCCGATCAAAAAGAGAAGGAATTACGCGAG CTTCCAGTTTTTCAAGTATTGACTCTATCATGACTCCAAGTAGGATGTCA CTAGGGGACTTTGATACATCAGGAGGTACAGCGGCAAGCAGTGAACCATC AGAGTATGTTCGTGCTCTTGATCCAAGAGCAAAACGGTTGTCTCTGGGCA GAAGCAACATTGTTTCAGAACCAGAAGAAGTCCTGCGCCCTCAACCACAT CATGCATCATACTGGCCAAGAACGAGGTCCAAAGCAAGGACCGACAGAAA TTCAGTTGGTGCCACGGCTGCTAATGATACACGGACATCCTGGCAATCCC AATCAATGCATGACAAGGAGGACATTTCCTCGACAATATCAGACCCAGGA CCTATTTGGGATAATGAACCGAAGTGGGATACTGGGCCAAGATGGGACAC AGAGCCAACTTGGGAGCCTGATCACCCAATCGAACTTCCTGGACCACCAG AAGATTTTGCAGTATCAAAGGAACTTGTGCCAAATTTGGATGAGAAATGG GTTGTCAGGAAGGGGCACTTTCTTGGTGTCCTAGTATGTAACCACTCGTG CAAAACGGTTCAAAGTTCACAGATTGTTGCGCCAAATGCAAGCCATGATG ACAACAGTTTAGACTTGCTCTTAGTTGGCGGAAGGGGGAGATGGAAGCTG TTGAGATTTTTCATACTACTACAATTTGGCCGTCATCTTTCTTTACCCTA TGTGGAATATGTAAAGGTATCATGCAACTTCTGTCTTTGCCAAGTTTTTC TTTCTGCCTGCCCAGTTTGCGCTTTTCATGGAGCTTTCATTTCACTATGT GCAGCAAATCTAATATCTAAAATGCACTTCATTTCTGGTCATCTGCTTCT TTGAGGTTCTAAAAAACATGGTCTTACATTAATGGCAGATACTACATTCT TTGCATCACCTTGTGCATGTTCAAATGAACTCTGATAATGCATCTCTTCT AATATCTTTATGATCGTCTTTTCCTGGGAAAGATACTATCATATGTTCAC TTGTCTCGATTAAACTATTCTGATTTGGTGATTTCTATTTCATCTTGGGT TTCTTCTTTGTTATTCTTGGTTTATAAAAGTTTGTTTGCAGGTTACAAAA ATCTCAATATGTATGTTTATCACCTGTTTTCATCTTTTAATTTGAGATCT CTCTTCCTGGAAGTTGCAGTGTGGTTCATACGTACTATATATTTTTTTCA TTTCCATAGTATTGTGGGAATCAGTTTGTCAGACAGAAAACAACATGGTC TTGCATTTGGTATGAGTAGTTGTTTCTGCATTTTATGCATTTAGACTAGC TCTGGTCATGGATGACTGAAGTCTCCTAAACAATAAGATTCCAGTTCATC AAAGCAAGCCTGGTTCCTTTTTTTTCTACAGAAATATTACTTCCTCTTCC ACAATATAATAATTTCCTTCTAGTAAGAACAATGACTCGGTCCTAACTGC TGATCTGACATTGACAGGTGAAATCGGTCAAGGTTAAACCTGGTGCAAAC ACCCACAACGGCTGCGGAATAGACGGCGAGCTTTGCCGTGTCAAGGGACA GGTGGTCTGCTCCCTGCTGCCGGAGCAATGCAGACTGATTGGCCGGCAGT GTAAACAACCAATCTAAGCACACTGTAAATCTGTTGAGCTTCACGGAGTT TTTGAGGCGCTGTATGATGATGTGTTGTCACTTGTAACAATTGATTTTGA GTTGTCTATATATATCGTTTACTTGCTAATGAGGGTGTGTGTGTGAGGGG TGCAGAACGGCGTTGTTCCTGGAGAGTTGGGACTGGGCAGACAATGTTGT GATGTTTCTGTATATTTGAGTGATAATAGAGGGATATCTCCGTTGTTTTT GTTGATATTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.