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GrainGenes Sequence Report: AA024225

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Sequence
AA024225
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024225
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCACGCACTCTGCGACAGCCATCCCAGCCGTTCCAATCCAGCCCAGACC
CGACCCACCCCCGGTGCGTCCAAATCAGCTCACAGACCCAGTGTGGTAGC
CCCGACGATGGACCGACCACCGGCAAAAAAGTTAGGACCCATCACGTGCA
CAGCCACAGTCGTCAGATAGAAAGTGCTCACTCCACATTCCACCGGCGAG
AGTGAGACTGAGCTGCCGCCGCCGCTGCTGCTGCTCGCGCTTGCTTGTTG
GAACTGATGAGTGCGGCTGCTCCGTCGGCCCGCGGCCTCCCGCCGCCGCC
GCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGGTCGTCGTCCTGCTCGGCGACGGCGCCC
GCGCCGCGGTGGACACTGGCGGGCTGAGCCGCGCCGCGTTCCCCAAGGGG
TTCGTGTTCGGGACGGCGACGTCGGCGTTCCAGGTCGAGGGCATGGCCAC
CGGAGGCGGCCGCGGGCCCTCCATCTGGGACCCCTTCGTCCACACGCCCG
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TCATGTCTTAATGTTTCTGTCAAAACTGAGCAGGGCTTACTCCTTATGTC
AATCTTAATCACTATGATATCCCTCTCGCGCTTCAGAAGAAGTATGAAGG
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ATATTGGTACTGCGTTGCCATTTGGAGTAATTACATATGGATAATATATA
TGGGACCCTGCCAACATTCTGAATATAGTTAGCCATGAATTCATCACTTA
TAATACATGATATGCAGGGGAACTACATATCTGTATATTAAGAAGAAGAA
AGGTCTTTTCTTCCAAGATTCTATCAGAACCAAAATTATTGGCCACTACT
GAGTTCTCAATTTCCATTGTGAACATAAGATAATTTGAATTATATATATA
TGTAATACTATGTAATTTATATGTATAATTGTTGATACATGTAAGTATGT
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TTTCCATCCTTTTTTGTAGGAACATATTCGCGGACTATGCCGAATTTTGT
TTCAAGACTTATGGAGATCGAATTAAGAACTGGTTCACTTTCAATGAGCC
GAGGATAGTGGCCGCACTTGGCTTTGATACTGGAGCAGACCCCCCTAACA
GGTGTACCAAATGTGCCGCTGGTGGGAACTCAGCAACAGAGCCTTACACC
GTTGTTCATAACATTCTCTTATGTCATGCTACTGCAGTTGCGAGATACCG
CAATAAGTACCAGGTTAGTAACATGGTAGTTTTTTCTTGCGAAAAGTAAC
ATGGTTGTTTGTACGTATGCAAAAATTGGCCCAATTTGTCACAATTTAGT
TTTGGTTTTTTTAATGCATACCCACGTAAACTGAGAGTTCCGATATTTCC
ATATACATTCTGATGGATAACAGCTACGACCGACTATTGATCATATAGTG
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GGAATTCAATTCACTATCCTGTACTAGATACTATCTTACAAAAGTAATGT
TCTCCATGCTATTCCAAGTGAAATTAAGTGTCAGAACTCACTTCACTTGG
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CTGGACTTCAACTGGTATGAACCTCTTACCAACTCAACTGAAGACCAAGC
AGCAGCTCAAAGGGCTAGGGACTTCCATGTTGGTTGGTAAGACCGTGACT
GTAATTTTTCATGAAACCTCGATGTTTTTTTATTTGATACTTACTTAATG
AATTTTGTACCGGAAATTCAGGTTTCTTGATCCACTAATAAATGGTCAAT
ATCCGAAGACCATGCAAGATATAGTAAAAGAGAGGTTACCTAGTTTCACA
CCTGAACAATCCAAGTTAGTCAAGGGCTCCGCAGATTATTTTGGGATAAA
TCAATATACGGCTACCTACATGACAAACAACCCAGCGCTCCAGCAAACAC
CCACAAGCTACTCATCTGATTGGCACGTTCAGTATGTCTGTAAGTTGTCA
ACGTATGATTAAGATTTTATAAACATATATCAATACAGTTACTTAATATA
CATCACTTTTCACCTTTACCCTTTAAAATCTGCAGTTCAGAGAAATGGCG
TTCCAATTGGAAAGCTGGTATGTATAGCTTTTTCGTCTTTCAACTTCAAA
TTGCGGCGTTACAAGATTGACGAGTTCAAAACTAACATGAGAGTCTTGGT
GATGTATCAATGTGTACAGGCAAATTCCAATTGGCTTTACATCGTCCCGA
CTGGCATGTACGGATGTGTGAACTACATAAGGGAGAAGTACAATAATCCC
ACAATCGTTATATCTGAAAACGGTACTTAAAACGACTTATATCTCCTTCT
TTGTAATTTTACCTGCAATGCCCATCAGAATGTAGTACATATATACAAAT
GACGGTGCTATGGTGCCAGGAATGGATCAACCTGGAAACCTGACCCAGGA
AGAGTTCCTGCACGATACCGCGAGGGTTGAGTTCTACAAGAACTACCTCA
ACGAGCTGAAGAAAGCGATCGACGACGGCGCGAACGTGGTCGGCTACTTT
GCCTGGTCTCTTCTCGACAACTTCGAGTGGCTGTCGGGTTACACGTCCAA
GTTCGGCATCGTCTATGTCGACTTCAAGACTCTGAAGCGGTACCCCAAGG
ACTCGGCCAACTGGTTCAAAGACATGCTGTCAGGGGCAGGGGCGAAGGAG
GGTTCAGGCGCTCCTGGCACCACTCAGGCTGGTCCTGGCGCTTCAGGCGG
CAATCTGGCAGCTGGTTCAGCAGCCCCGAGTAGTCCTCGGGTCCTGCTTC
CTCTGTTGGTTTGCTTGTACTTGGTTCTTCCATCCATCTTCATGTTCTCC
TTGTAGAAGTGAAGTTCTTTTTTCTTGATGTACTAGCAAGTAGCAGTACT
TAATAAGCCGTAATAAGTGGCGGACGCCGGCAGCATGTTCAGTTTAAAAA
TGTGCTGCAGTGCAGCAAGGAGTATTTTGGAACAGCCTGATTGAAGGGTC
CTGTTGTTCAGTTTCAGTGTGTTGTTAGTGTGCCAGTAGTGGACGCTATG
ATTCGGAAGAAGATCTGTATGTGTAATGTGCGCGTGGTTATATAATGCGA
TGTATTGATGGCGGAGAGGCTTTAATCATAAAAAAACTATTTATCAGTAA
TTCGGTATCATCTATCATTGGCAGTGGGTTAGCTGCCTGGGGCAAGTTTA
GAAGTATCATCGTACGAACATCCGTTGGTGGATGAATTAGTTAACGATTT
CGATGCAATTACGGGGGCTCCATGCAGCGTGTGATCTAACGAATAAAGAG
GTATGATACCAGGCAGCTAGGGTATTCTTCTTGGGGAAACTTTTGCTCTT
CAATATTCAGCTTGGCTTGAATATTCAGCATGTGATCTAACGAATAAAGG
CTTGAATATTGATGGTGGTGAATTGATGCTTGAGTATGTTAGATATGTGC
CAAGGGTTCCAAGAAATCTATTTTTATTTGGGAAAATTCATTGTAAAGTC
TATGTCTACGATGTGGATATGGACAAGTTGACCATGAGAGTCAAGAAGGA
CAAGAAGCTAGTGATGAAGACTAGAATGACCAAGAATAACCAGTACAAGG
TGTGTGTAATTAATCATCATTCCAAGCATAGCTAAAGAGTAGCAAGACGT
GGCGACATGTTTAGTCAGGGTCGCCGAGTCCGCAAGTGGGCAACAAGGAA
GACTAAGTTCAACATTCGGAGGTGTTCGTGTGAAGACGGTGAGTTTAGTC
AGGCTCGCTAAGTCTTATGAGGACTCGAAGGCTGACTCATGTAAGTGGGC
AACAAGGAAGACCAAGTTCAACATTCATAGGTGCTCGTGCGAAGATGGTG
TCCAACTTAGACTACGTGGTAGGTTAGGTGTTGGAGTCGATCACTTGTGA
TCGGAGCGCATTATATAAATGCTTTGTGGGTAGCCCAGACATACTAGACA
AAACTAGTAGGTTAGACACAAGATTACCAAGGGACGGCCAGTGTCCGTGA
CAGAGGTTGCCAGACCGGCTGTGCCATGGTGGTATAATGTGTCTACTGGC
CTCAACATGTTTGTCTCGATTTTACTATGTTGATTACTAGATGATGATGA
CCACATCATGTTAAGCATGTTCTAGGATATTGGCATTGACCCTTGAACCT
TGTTAACCAATATCGTCTCCCATCTACTTTCTGCAATGATCTAATCATGT
ATAATGCTAACAAGACTCGGTCTCCAACGTCTAAGAATCTCACCTTCGTC
GCGCCATTATTTTTTGCCATAACATCAGCGCCATCAACCCTCTTAGCCAA
TCATCTCACTGTGTTCTTCACGTGTCCGCCTCGACCGGTATGCCGATGAC
TTCACCAAAGGCTTTCCCTATTTCATGAGCTCCAATAATGTCAGTAGGAC
ATGCCCCTTGTGATGTTAAAGCTCAAAATAGTTCATATATACCATATCCA
CGTAAGCACATACACTTGAAACATCACATCCCTGGGTTGCTTCTCTTGTG
CAACACGGGAGAAACCTATTATTTGGATGATAACTGTTAAGTAGTAATCT
TGTAGCTATAGTATAATAACTTGATCATTTTCGCCAAAACATATTAAGAT
AGGGTTTTGTTTTAAAGTTCTCGTCGAGACAAACCTAGGCGTGGATTGAC
ATAGTTGGAATTTATGGTACTTGGAATTTTGAGACGTCAAAAAGCCTTCC
AAACTAGGTTGTTAATAGATGGTCATGGGGTTACAATTTTAATACCGTGA
CTTGACATAGTTGGTGCGTAGTTTCGCCATGGCGAGCTTTGTCATAGTTT
GAACGTCATCAGCTCGACTACCCCTCCATTTGCGGAGGCTGTAGGCCCTA
TACCTACCGTGCATTCTACGCCACTTTCGCCCATCCCAAGTCACCAAATC
ATAAAGATAATCAGATATAAACGAAGGCGATATGATATCATAGGAGATTT
GATTCCATAGCCTTAGGCCATTAGTCATGTTTTTTGTTTTGTTTATCTCA
ACGAAGTCGTTTGGCCAGGCCGATGTACTATATTATACGACTCAAGATGA
ATGCAATCGGTTAAGCTATCTCTAATATGGAGTATGTCTTCACACCTCGC
AACAGAAAGCCTTCTTGAAGTTGACGTACGTCGAATCATCTAAAAAAAAT
AAAGTTGACGTCGAAACCTTGTTGAAACTACAATTGTTCAACTCTGGCGA
GTACACCACGATGACTCATCTCCCAAGAGAGCGTGATTTTGAAGACGACA
TCCTTCTCAAAAGGAAAACAAGAAAAATGACGAAGTGTGATCGGTAAGGA
TTCGACAAGTAATCAACGGCAGCACGAGTTGGGCAAGCGTTCAACAACCA
GTCGAATTGCAGCACGTGTCCGATCTGTACCAACTTACTAATAACCTTCC
CTAGCACATGCAGCACTGCGGAAAACCCTGTTACCGATGCAGGAACCTTT
TTTGTTTTGTTTTGCGAATAGTACCATGTTTAGCGACGCACGAGTTGACA
CGGAACATGAAAGTGCCTACAGTACGCACGATATTCGTCGATGCCAGGTT
CGAGGATGGTGCCTCTGCTACCTGCGCCGGAACCACTCCACGCTCCCGTA
CGTCCCACACAGCCACAGGTCACCACATCACATGCCCCGATTCCCGGCCG
GAGGAAGACCTCGCCAGTCGCCACCCACCCGGCAGGGGTGAACTGGAAAT
CGTTTTGATTGCCGTCGTGATGTCCCTGGGACACCGTGCATGAGCGTGAC
CCACGCGCGCACCGCCAAGTCCGATCGCCGAGCAACCCAATCTCGACGAC
CACGCGCACCGCCGAATCCCGCGTCCAAAAAAGATGCTCCGCTCCACCGC
ACCGGCTAGTATTATTTTGTCGCTGCAATTGCTAGGACCCGCGCCCACAA
ATAGAAGAGAGCAGAGTGGCACCACTCTGGCAGTAGCAGCAGCAGCGGGA
GCCACCAACCATTGGATGCTCAAGCTGGTGAGCAGGGAGATGGCCGCGAC
GAGGTGCGTGCTGCTGCTCGCGCTGGTGGCCGCGTACCATGTCGGAGGCG
GAGCCGCTGCCGCCGCGGGGGCGCCGAGGCCGAACTGGCTGGGCGGGCTG
AGCCGGGAGTCCTTCCCCAAGGGCTTCGTCTTTGGGACGGCCACGTCGGC
GTTCCAGGTCGAGGGCATGGCCAACGGAGGCGGCCGCGGGCCCTCCACCT
GGGACGCTTTCGCGCACACCCCAGGTACGTCATCCGTTTCCTGCTTAATC
AGCTAGCTCTTCACTCTTCACTTCGCCTGTGAGTGCTGCCCCCACTCTGC
TTCCAAAACCGGTACTGCCTGCTTACAACAGTCCGATTTATTTTATTTCT
GATAAGGATTTGATTGGTACTACTAGTACTAGTTGCTTGATGGTGATAAA
CACTTGTGCATACATTTTTGCTCGTCCACATAATTAAACTGACAGCTAAG
CTAAGCTAAACGTTCGATTTCAAATTTAACCTGAGATTCCAACTGTATCC
TTCTTCTTCCTTCGATCTCATCCACCCACACTACTAACATTTCCTTACTT
CCTGCCGCAATGAACAGGAAACATTGCAGGAAATGCAACCGCAGATGTCG
CGACAGATCAATATCATCTCTACAAGGTGGTACTACTATATTCCTGCATA
TATCCAAACGATATCCGCTCGGGAACAATTGTCGGCAAAGCGCTCCGACG
CATCACGTTTAATAATAATCCTCTTATGCTGGCACAGGAAGATGTTGATC
TCATGAAAGGACTGAACTTCGATGCCTACCGCTTTTCCATCTCGTGGTCC
AGAATCTTCCCAGGTATATATACATACCGAATTTGACTGCGCGCGGTTTT
AGCATGCTAGTGCATGACTCCGATGGTTCTCTGAATGAGCGCGATGAGTT
AACACCACTGATCCATCTTTGATTTCTGAAGATGGTGAAGGAAAAGTTAA
CGAAGAAGGTGTAGCGTATTACAACAACCTGATAGACTACCTCCTTCAGA
AAGGTACAGCCATAACCAAGCATATATTTCGATCTCTGAAACTTTCATGG
GAACCTGAATAGGTCGTTCATATCTGATGTTTCTGCGGAAACTATGCAGG
CATTACTCCTTATGTTACTCTTTACCACTCTGATCTCCCTCTTGCACTTG
AGAAGAAATATGGAGGATGGTTAAATGCAAAGATGGTGTAAGTCAAACTA
ATATTTAGTATTTCTATCTACTTATGTGTTAGACCTGCCTTCCAGTTTCA
CGGTTATATATTGGAGACTTATAATTTGGAATTCGAATCATACATGTGAA
AACTAAAGGTTTGGACAAATTACCAGTTATTCTCTGCATAATTTATTCGT
TTCTGAAAGTGACTTCACTTGTTGATACTTGTTGAAAGTGACTTCCAGTA
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ATTATACTACCTCTGACGTGACGATATTTTTGTTTTGTTTTGTAGGGAAC
TATTCACAAACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTTTGGGAATCGAGTA
AAGCACTGGTTTACGTTCAATGAACCACGGCTAGTTGCGTTCCTTGGTTA
TGATGTAGGGAGCATCCCCCCTCAAAGGTGCACCAAATGCGCTGCCGGTG
GGAACTCAGCAACAGAACCTTACATTGTTGCTCATAATTTGCTGCTAGCA
CATGGTTATGCAGCTGCAAGATACCGGAATAATTATCAGGTATTTTCTTA
CTTGAACTATTAAGAGCCCAAGCATGCTCATATTATAATATGATCATCAT
TCGGGAGTGTAGTTCGGAGTATTTTTTTTCCTTACAAAATCAAGTTTGAC
AAGATCAATGTATAGTAATTGCGGAACAATGCCGTCCAACATGATTTCTT
TTTTATTATTGTCTATATCCACGAATGTATTAGCATTATTTCCCTAATCC
ATTGGACATGTAAGTGGCAAGTAATCTTGAGATGTTAGATATGTAAGACC
TGTCATAAACTGGCCATACTTCGGCACACCCTCTTTAGAAACTTTGTAAA
GCGCAATTTATTCAGTTGTATTTATTAAACACTCTTTTGGGGACCTAATC
GAATTAAGTTTGGATAATGTATGCCTTAAGAAGCCCATGAATGCTTAGAC
ATTAAAAAATTGTAGGTTTCTCAGCAAGGGAAGGTTGGAATAGTTCTGGA
CTTCAATTGGTACGAGGCTCTTACCAACTCAATTGAAGATGAGGCAGCAG
CTCAAAGAGCAAGAGATTTCCATGTTGGCTGGTAAGGCCAGCCATACTGC
TAGTACTCTCTGACAAAGCGTTTCATCAGACTAAAAAAGAGAGTATGAAA
GCTAATATCATGAACGCTTGTATTGGATGCAGGTTTGCTGATCCAGTAAT
AAATGGACATTACCCACAGACAATGCAAGACCTCGTGAAAGACAGGTTGC
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GCAGCAAACGCCCACTAGCTACTCCGCCGATTGGCAGGTTGATTATGCAT
GTGAGTTTCTTTCCTTAAGCTCTAGGTTTCACATCAATGATTTACATATG
ATAAATTGTGCCAATTCATCTTTCGTGGCCTAATTCTCCAGTTGCGCGTA
ATGGCGTACCAATTGGACCTAAGGTACTCTTAGCTACACCTTTATAAGTT
TTGTTTACTTTGACCACTCCATTTCCGCATTCGTTAAGTTCAAAATTATC
ATATGACGAATCTCTGTCGATGCGTGAATTGTTACTACAGGCAAATTCTG
ATTGGCTTTACATCACGCCGTTTGGGATGTACGGATGTGTGAACTACATC
AAGCAGAAGTATGGAAATCCAGCTGTCTTCATAACTGAAAACGGTAATGG
ATACAGCTCCATATATATCTCTTTATCGGGTTTTCAACTTCATACCTCAC
AATCATGTTATCAAGCGTGTACTAATCTTGTCAACACTCCAACAGGAATG
GACCAACCTGGGAACCTCACCCGTGATGAGTACTTGCGCGATACCACGAG
GGTTCGGTTCTACCGGAGCTACCTCAACGAGCTGAAGAGAGGCATCGACG
ACGGCGCAAATGTGCTTGGCTACTTTGCGTGGTCTCTCCTCGACAACTTC
GAGTGGGGCTCTGGCTACACCTCCAAGTTCGGCATCGTGTATGTGGACTT
CAACACCCTGGAACGTCGTCCCAAGGCGTCGGCCTACTGGTTCAGAGACC
TGCTGCAAGGCAAACACTGATGTAGCTCGCGTGAATTTACATGCAATGTC
TATCATCATCTGTGGAGTTCCCACTATCATTGTTCGGGTGGCACCATAAT
TCACAGAATGCTCTATTCTTTCGAGCTACCAAAAGGAAATAAAATGGAAT
AAAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.