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GrainGenes Sequence Report: AA004249

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Sequence
AA004249
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004249
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCCAACCAAGCAAGCAGGGGACGAAGCGAAACCCTAGAAACGTTTATAGA
TAAAGAGAAATCTTAAGTTCTTCTCTACCTATTTAATTCCCCCCGAAAGT
GAGAAGTGATCGGTTCCGCGCCGCCGCCTCCATTTGTGCCCTGTGTGGAG
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TTGGCCCGCCTAGCACGCCCCGTAAACAGGCCGGCCCGTATCGCTCGGAT
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CGCCACCGCCATGAGCTGCCGCCGCCAAGCCACAGGCTCCTCCTCCCCAG
CCAAGCGCCGCCGCGAGGAGCTCACGCTCGAGGAAGCGTGGGTCCTCTAC
TGCAAGCTATCCTGGGCCGGCAGTCGCCGCGCCGTCTGGAAATGGGTCGG
GTGGCCGGGGACGATGCCGCGGTCGCTCGTCGACTTCGCGCCCGGCGGCT
GCTACTTCAACATCGACCCGCCGCTGCCGCCGATGACCGGCGACAAATTC
GAGAAGTGCCGGGCACAATGGGAGATGGACCTCGCCAATCTCGCGGCGTG
GCGCTCCAGGCACGCTCCCAACTAGGAGGAGGGGGGCTCGAGCGCCGCGG
CGGGGACGGCGGCCACGGCGGAGGAGGGGGAGGATCCCCTCTTCCTGCAG
GCGGTCGAGGCCTCCAAGCAGGAGGCCGCCGACAGGGCGGCCGCGGATAA
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AGGCTGCCGCCGCCGCCGTCATCGTCATCGATGATGACTAGGCGTACTGC
TGCCGCGGCAGCGACAACCTCGCCGACAAGGAGGTCTCCGGCGAGGTTCT
TTTGTGCAGTTTTAGATTAGGGTTAGCTTAACAAGTCGCGATCTACCGCT
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CGGATACGGGGTCTGCTAGATGGGCGATGAAATCAGTGGGGAATTTCAGA
GCAAAATCGAGTACAGGGCCCTGTACTCGAGTTTTACGGGGCAGAAATTT
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TCAGAGCCACAAACATGCCAAGCCTGGTACTAATACTGACTTGTTGCTAG
TTACGTGAGATCTGTATATACTGGCTGTGGCTCGAGCATGAAGACGGCGG
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AGGCGGCAGGCATGCGGACATGGCTGCGGCGTGCAGCTCGAGCACGGAGG
CGGCAGCGACGCGAACACGGCTGCGTATGGTGGCGCGGGCACGAAGGCGG
CGGACGACGGCAGGCAGCGCGCGGGCACGGAGGCGGCAGACGGCGGCGAC
GCGGACACGGCCGTCGTGCACCAGAATAGGGACACGCACAGATACACCAG
AACAGGGACACGCACGGATACGCGTGGCATACATGTATCCCAAAGTATCC
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ACGCAGGGGATACCTCACAGATACATATATATATATATATATATATGAAT
GAACATGTGCACATACGTGGCATCAAATGAGAGGGAATATTGTGCCAAAA
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CAATACTAGGTTGCTTTTATCTCATAGATATAATTTTGTTACATAATTCA
TCAGGGGCAAAAGAGTCTTTCCCTCTTCATGTTTAACACCGTTAGTGCTC
AAAATGCACTAGAGTGTCATGTTAGGGACAAAATCAAGTTTAGATGTCAA
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CAGTGTCAAATAAGGAATTCTCTCAATTTTCATTGCAAAAGGGCGGAAAA
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GGATGCATCAGCTTAATGAATTACAAGAGCGCGGCGCACCACTGCTCCAC
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AGCGCGCGTCGCCAGAACAAACGCAGGCGTGGGCAGGTGAAGAATAGGTG
GGCGAGGGTCTCCGGCTGACACGGGCAGAAGGGGCATACGTCTGTGTCCA
AGCATCCAATATGTCGCAGGAACGCACGGGTGCGGGTATTGCCATGCCGA
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GGCCCCGGCAGTGAACTGCGGGGCATCGCCCCACGCCAGAGACCGCTCGT
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AACCGAAGCTCTGCCGCAGCGGGGTCGGTCACCCTGTCATGCGTACGGAG
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GCGAGCACTTTGCCCAAGCTCATATAGCATGGGTTTCAGTTAAGTTTTGC
AGGCTATCTTTTGTGTAGTTGCTCATCTCCATTGTGATGCTAAATTGCTC
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GGCAAGCTTACTATTTTCGATACAAAAGTTACTAGTCATTACTAGCCTAA
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CCAGTGACAACCAAATGTGTCCATTTTTGTTCCATTATACTTGTTAATGA
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TAAATTCGAAGACCCCTGCGGTAAGAACAGGACTACGAAATATGTTTTTC
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TGCAAATAGGTAAAATGTTTCTTTAACTCTATACATGAACATCATTGTAT
TTATATCAGCTCTGTTTACGTATGCAGTATGCCATGACACTTGGAAATTT
GCTGAATGGTTATGCAAATCTTTATTTGTTGAGGGCCTGTCAATTCTCTT
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TATTGTACTGCATGAAAGGACATTTGTAGTCTTGTTCTAAATGTGTTTTT
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TTCGTTCTATACCGGTTTGACTGCTACTGAGTTTTTCTTCCATACAATGG
GTGGCAGAGAAGGTCTTGTTGACACAGCGGTATGTGCAAACTTTGATCAT
CTTTTGGTTTCATGCATGCATTTGTTGTATTCTATAGTTTTTCAGCATAA
AAGATTGGATCTTTCGTTATATATAGAATTTGACTCTTTAGTGCATAGTG
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TAATTTGTTCTCTAATTGGGGCAGCCTAACAGCTTAGAGTGTGCAACTTA
AACAATATCTGAACACAACCCTTTAGCTTACTAGTTGATTCAGTATAGAT
AAAGGGTAATCATCCCCATACAAAGGAAAAATTCAGTAAGAAGGCAAAAA
CATCAATAAATGGTGTTTTCCTGACCATTGCTGTTACTGGTCTGTAATTT
TGTTCTCTAACTTGGGCAGCCTAACAGCTTAGTGTGTGCAACTTAAACAA
TATCAGAACACAACCATTTAGCTTTCTAGTTGATTCAGTATAGGGAAAGG
GTATAATCAGCCCCATCAAAAGGCAAAATTCAGTAAGAAGGCAAAAGCAT
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AGCTAATTATAGGCTAACGATGTGAAAGTATTAGATAGACATCTCTTACT
TTTTGCTGGACTGAGGTGGAACCCATGGGGGTGCTGTCAGGTGACTCAAT
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TACCAGCTTATCTTTTCAGTGGTGATCTGATATCTGTTTTCTTCCTTTGT
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CGTAATGCTAGTGGTGGTATAGTTCAGTTCGTCTATGGAGATGATGGCTT
GGATCCTGTAAAGATGGAAGGAAAAGGTGGCAATCCCTTAAATTTGGACC
AGTTGTTTATGAAAGTCATGGTTAGTATAACATACAGGAATACTTTCTTA
GATTTATGAAGGAAAGTGTGCTTTCTGCTCTGACCAGTGACCAATGACGA
CTTAACGTTGTAGGCCACATGTCCTCAAAGGGGGCACGATACATTATCTC
CGGAGGTAATCTCACAAATGTTAAATGATAAGCTCTCTGAACAAGACATC
TCATCTGGTGGTTGTAGCGATAAGTTCAAGGAAATATTAACAAAGTTTCT
TGGGGATCGTATCAAAATGCTGAGAAGCACACGGAGAGCGCTTCACCTAG
ATGAAGATCATGTCGAAAGGAAGGACTCCAGCATTGAAGAGTGCATTGCC
GCTAATATTTCTGGCATTTCTGCAAAGCAACTACAGGTTTGTATCATATT
TTGCATGTACTGATTCATCATTGCTTTTCCAAAGTGCTGTAATCTTAGGC
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TGTCAAGATGAAGTTCTTGTGTTTTTTACTGTCTTATATGAACAAGCAGG
TGGCTTATGCTTGTTTCTTGCCACATAGAATGTCCCTTATTTCCCTATCA
TTTGTCAATATCAAACCAGTACTCTTGTAAGAAAATGTATGAGCCTGTTC
AAGCACTTTAACTGTGATGTGCTCACCAAACACTTCCTAATGCAAAATGT
CCCTAGTTTTTTTTTTGAGAGAAAAGTGAGTGTTTGGTAATACACATTAT
GACAGGTAAGACCATAGTTCTACGTCTACTCCATGGACTGTTGTTGATAG
TTCGTTTGTGCATTTTGTTCATGTGTTGTTCTGCTATATGATATTCTCCT
ATTCCTGGCTCAGGTTTTTCTGGATACTTGTTTATCTCGTTACCACTCAA
AAATAATCGAAGCAGGAGCATCAGTTGGAGCAATTGGGGCTCAGAGTATT
GGAGAGCCTGGGACCCAGATGACACTGAAAACTTTTCATTTTGCAGGAGT
AGCCAGCATGAGTATCCTTTCTTTACTATGCTCTTAAGGAAAATGAAGTG
GGATATTTAGTTTCTTCTCTGAAACTTATTATTTAGGTTGCTTCTTTGTC
ATTTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAA
GTGTATCTAGACTTCTTTTAGTATGTAGATTCACTCTAAACATGAGTGAA
CCTAAATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACA
TCTTATATTTTGAAATGGAGGGAGTATAATTTAATAAATATATCAGGAAA
CTGTCAACATTCTGTGTGAGGAAGTTTTATACCGTCAATATCGATATGGT
ACTGTGTCGTTCTCCAGAAATATAAACACATGATGTTGACTTCAATAGAT
TAATTTCCTTTAATGCTTGTTTCCTTAACGAGCAACCACAAAGATGTCAC
TCTTGGAGTTCCTCGCATCAAGGAAATCATCAATGCTGCTAAAAAGATAA
GCACACCTATTATCACTGCAGAACTTTTGTCTGGCAAGGATGAGTCGTTT
GGTGTAAAAGTGAAGCGTTGTATCGAGAAAGTAGTGCTGGGAGAGGTAAC
TTTTTTGCACATAATTTTATTTGTTTGAATTTTACACTTAATGTAAGTTT
GGCTGCTTGCATTTTGCTCTTGGGTTTTCTAAACATGTTACATGGATGTA
AAAGCCAACATTGATTGTTTGACATTCTCTCAGCAATCAAATTTACAGGC
ACCTTTTCTGAAGGAAACTTTAGGGAGGTCTTGACAGTATATATTTGATA
TAGTATAAAACAATATTTACACAAATATCCCTGGAAAGGACATTCTCAAA
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TTAGGTCACTAGTGGGCTTTGTTATTGCACAAATTATCCTTTTTTTGTTA
GGATGTATTTATGATACTAGTAAATGTAATTATATTTTTATAGAGGTTTT
CTTATCTATATAGAAAATGTGTTAGTTTAATAGCGAAATATTGCATTATT
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GCATGAGCGTGAACATGAAGAAAAGTCTCTGTGTGTCCTTCATGTCCAGT
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ACACAGGAATCTCTTCTGACTCCGTGCAGCTATCAATATTAAAACATCCA
AAACTGAAGTTAAAATCTGAGGTATGAATAGACCTCTGAGTTTGCTGTGA
TGTTGCCCAATATTTTTTCAGAGGTTGTATTTACTGTAGATGGTATTTAC
AGCATGTTCGTGTAATTGATGGAGCCAAGTTGAGAATATATCCAGCAGGA
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TCCAAAAGTGATTGTGAAGGTAAACACGACGTGGAATGTAACTTTGTCTG
CCATCATGTGGACGTTTGCTAACCGTTCTAACTAATCAATTCAGGGTATT
CCAACTGTTGAAAGAGCTGTTGTCAACCCTGTTAGAAGACGTGACAAAAG
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CTATTTTAGCGGCATGCACTTTTCTGAGACTGTTGACTTTACTGGAAGGT
GTTAATCACAATAGTTCCTCTCACAAATACACTTTATGCACTGTTTGTAT
TTTGTTTGAAAGAATTGTCAACCTTCATAATGTTTGTTGAACTATTTTAG
TGAGTTGCCTCTGGAATTTTTTTTATAAGCCTTATTACTTCGAGTTATGT
TCTGAGATGACATATGGTAATCAAATAAGCATGATTTTATTACAGAACAA
ACCTCTTAGCAGTATTGGGTGCTCCAGGAGTTGATGCTATGAAAACAAAA
AGTAACCACATCATGGAAGTGAACCAAACACTTGGAATTGAAGCCGCAAG
GAGATCCATCATCGATGAAATCCAGTATACATTTGAAAGCAACAACATGA
TCATCGATCTGAGACATATGATGCTCCTGGCAGATCTGATGACATACAAG
GTACAGTAATCATCACTTGTGACTTCCATTTTACAGTGATATATCCTTCA
GGACTTGACACGCGCCTGCTGCCTGCAATTGATACTTTGAGCAGGGTGAA
GTTCTCGGCATCACCAGATACGGCATTGCGAAAATGAAGAGCAGCGTGCT
TATGCTGGCCTCTTTCGAGAAAACCTCGGAGCATCTGTTCAACGCTTCGT
ACGCTGGGCGCGAGGATGATATAGATGGAGTCAGTGAATGCATTATCATG
GGCATACCCATGACCCTTGGCACTGGTATCCTCAGAGTCAGGCAAAGGTA
TATATATTTGTAGACCTCTTTTCAGAGTACGTATATTGATGTTATGCGTC
CGCGGGCAACCAGACAAGCATACGACTCATGCTTTCCTTTTCTTGCAGGC
TCGAGAACGTGCCTGAATTTAAGTACCAGCCTGATCCGATTATATCGTGA
TACACACATTCCTGGCCACCGGACGAATTCATCTGAGGCTGGGAGTTGGA
GCATATGTGCATGATAACATAGGACTAGTAGTTTGAGGCAAAACATATAT
ACATCATGATGCCGTGCGAAAGGCAAGAAACTCATTCTTGGAACTAATTT
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TTAGGGCAGCGTAGCCTTAGTTTGTCGGTCAGTTGCTTAGAGAGAAAAAA
AAAATGTTTTTGAGCATGTGCACAGCTTGCATTTATACGAATATCAAGTG
TCGGGATTATCCTATCAATCACCCATAAGATACCGGTTATCGCTTGATTT
ATATTTGTGCTTACGTGTGTGTTAGTTGTGCCGCGTTCCACACAAGCAAA
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AGGCAAGTCCGTATGCATGTTCTCAATCCCAAGCTCAATCATGTGTCCTC
AAACTAACACGATTCCACGACCCAGATAACCCAAAAGCGTGCATGTGAGT
GGGCAGCTCGAATGATGCGCGCCATTCGATCACAAGTTACCTATTGTTGG
ATTCTTCCAAACATAGCCAGCGACAATTCATTTGGAACTAAAGCTGGATT
ACATGATCTGCGAAGCTACAACGTGCATGGACCATCATGGCCATGCCGAT
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CCATCTATATCGGCAGAATGGACAAAAATAACCCAAATTCGAAAGGATTT
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AGCGCCTAACAGCAAGGCGCTACACTGGCCCCACCCGCCGTGTGACGCCC
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GCGCTACACCCTGGGACTTAGCCTGCAGCCCGCAGCCCTCCTCCCCACCC
CTCCCCATTCACTCCCAGCTCGACCCAAGGAAGGAGAACAGCAAGGAGGC
GCCCCCTTCTCCCCCCCCCCTCAAATCTCTCACATTGGAAGCTTTATTTG
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CCCTAGAAATTTGATTTGGAGAGAAATGTTTGGAAATTTGTTAGATTCAT
TGGCCAATGTTGGTTATAAAGATGTGTATGAAGCATTTAGTTAGGTTTAG
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GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.