Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA019262

[Submit comment/correction]

Sequence	AA019262
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA019262
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCAGCGCGCAGCAGAGTCGACAAACTGACGGCGGGCGGCGGCGGCCAGGG TTAGGTATGTCATGTGGTCGCATTTCTGCCTTTACATGGCATCATATCCC TCCTAGCTTAGTTGCCAATTTGCATAGTGGCTCCATGACTCCATCTAGTA CGATCTTGTTATAGTGGAAGAACTCCGGTAGTGATTTGATTTGGTGAATA TATAATCCCGCAGCCTTGCAAGACGGATTGGGGAATATAAGAATGTTTAA GCAGACCACTTGTTTTAGGATTTGCTTAGTACAGACCTTAATGTACGACC AAGACCTCTCACATGGAAGAGAGTAAATTGCAAAAAACCACCACAATTGG AGAAAAGTTATCAACCCTTCAAAAAAAAAACACACTAGAAAACATGCATT TTGGTGGGTGTTTGATGACTTTGTCCCAATTGTGGTGGTTTTTTGCAATT CACTCCATGGAAGAGGATGCTTCATGGCTGAAAACTGCTTGACCTAATGC CGAAGCTCACACAAAAAAATACCCCTCACCCAAACAACCCCTTGGAGTAG TGAAAGCAAAATTTCTATACGCCTACTCTCCCTCTATAATTAGAGATGCA AAATATTAAAAAAAAGCAAAGTAAGGATGCCATAGTACAGAAGCAAGATT AAAAATTGAAAATTATTAAATTGGAGTTTACAGACAATCAATGTCAAGGC AGTTGAACAAATTACCAAACTTGTACAAGAATATGCAACAATAAATCTAG TGATTTTTTTTCACCTTCCAGAAAACATGCTTATTTCTGATACCTCACCG GTATAACCAGACTGGAAGGAGCCCCCTCATTGCTTATCATCAATTGAAAC TGCTTTGGAATTTCAGTTTCCGTGGAATTCTTAAATCGGGGAGTCCCAGA AACAGACTGCTTTTCGCTTGAAACTGCTGGCAACCACACTTTGAGCCTTG AAACAACCTCGGTCATGGCCGGCCTGTTGATGGATGCGTTTTCGACGCAG TTCATGGCAAGATCTACCACACCTTGCAGGGAATCCGCATCGTACTGATC CATCAACCTTTTGTCAACAATATCGTGAATGCTGCCCGTAGCTATCTTTT GGCGCACCCAGTTTGGCAGGTGGACGGTTTGAGGGTCCATGAATACCGGG GGTTGGCCGGTGATGATCTCCAACAACACGATGCCGAAGCTGTAAACATC TGTCTTGATAGTGAGTTGGAAAGTTGCGTGATACTCTGGGTCGAGATAGC CAAGAGTGCCAGCAGCAACAGTTGATATGTGTGTGTGAGCATCGTTAAAA GCCCGCGAAAGCCCAAAATCAGATATTATCCCCACTAGATTCTTGTCTAG AAGGATGTTAGGGGTCTTCACATCTCTGTGCACTATTGAGGGGGTGCATA ACTCATGTAGATACCACAGCCCTATAGTTCATTAAATTTCTTACTTTGTC GGCACACATATATACATACATGGCCAAAGGGCAGCAACAACAACAACAAC TGAAATGCGAACCTTGTGCTGCATCAAATGCAATATGAAGTCGTTGTTCC CAGTTCAAATTATATCCCTCCCCTGCATCAGTACATATCAAATTAATGTA AGTGCTATTTGGTACATGCATGGGAGAATAATTGCTAGTTTTTGTAATTT GTGCACATATTTAAGCTAATAAATGCGATAGTTACACATACAATGGTTAA CTAATGGGGTAGTACGTGTCAACTCATAATCATTTCGTGGTGTGAACTAC ACACATAGGCTATGTGGGGTTTGTAGTGTGAACAACACACATATGTTGTG TGTTGGTTATAGTGTGAACATGGCATATGAGTTGGTGTTATCTGTGCGTG AACAGTGCACATAGGCTGTGCGCTAAATAGATAGGCATGCTGCAGTGTGT TTGCAGTTGCCTGCAAGTTGGGCTTGTTAGGTTTGCAGGCTGTGAACTGA TAAGAGTAGGTACCACAAGCTGAGTTTGAATTGCTCCCCAATCCGTTTGT GTCAAATCGGTTTGTGCATCATGCTAAATGTGTATAAATAGGTTCTAGCA TAGGCTGGCTAAGTTTCTGATTTGTGTTGCATTTGTTGCTGGAAAAGATA ATAGAAAAGGAAGACATATGTTTGTGTGTGCTCCTCTGTAGTTTTAGTCC TCTGTTTTCTACATTTGCTCAAGAGAGAGAACAGAGAGGGAATAATAACA GTAATATCTAAGAAAAACACACACACTTTGATCTTCGAAAGATCACTACT TTTCCTTTTCTTTATCAGAGCATTTCTGAAATACAGTCCAATTAATAAAC AATCTAAGCTTCTGAAATATTATATGAATACAATACCTCTCTAGTTGCTT TGTTCATTGCTAACATGAAAGATATACAATTTTAGAGTTTGTTACTGTCA TAACATGGCTATGACGTACGACTCTAAGAATGTAATAGTGGCATGCCCAA TCTGTTAGCCAAATACTTATGACCATTTCATGTTAGGACATTAAGAATAC GCAACTCTAAGAAAGCATTTACGATGGTCTCACATGTTAGTCCGATATAT GTACAGAGTAAATTACGTCTACAGACTCAATTATATTTGACTAGCAACAG CAACAGTTACGTAATCAACTACACCTTTAACAGGGAAATTCAACTTAACA CGAAAGTCACGACTACACTACTATGTCAATGGTAGAGTAGTTTGTTTGTC GAGTTTATTTATTTTGAACTTAAGAAGGAGATCCGCTTAATAAGCATAGA AAATTTTATGTTATGATGTGAAGCACAATATATTACTCCGTAGTAAAATT TGGAAAGTGCGTCATTTCCAAATATTTAATGCAAGTTGCTGGCAGAACCC GGAATTGGTCAACTTATTTTTAAGATAAAAGATATTTTAGGTTTAAATTG AATCATTCATTTTATTGATCAAGCTAAATTACATATTCTCTAAATACCAT CAAAATAAATGTCAGCATAATAACTAACTGCAAGTTGGACTTGTTGTACC TACGCGAGCTATTCCAGATAGAAACATTAATAAAGTTATAAGAGAGAAAC CTTCTCTTAAAAGCTGTTGAAGATTTCCTCTCGGCATGAAGTCATAAACG AGTGCTAGGCACTTCTTGTTCTGGCAATATCCTTGCAAAGTCACAAGATT CTTGTGATGAACTTTGGACAAGGTTTGCACCTGTGTAATATATATAGTTA CCAAACTTTCTAGAGCTGAAGATAGTTGCATCATTTTAGTGAACTAGCAT TGTGGCCCTCGCAAATGTGAGGGCATCATTTTTAATGTGCTAAATATGTT AAAATAATAATAATGGGTTTGTGGACATTCAAATTATACGAATGAAGAAA ATATGATCATGTCTATAGCAAGTGTTGGTGTTGTGTTACATAGCAGGTTT TTAATGTGTAATGTGTTCTGTGTGGCGACCGACCCCCTTCATAACATTAC AACACATATGGCAAATGGCGAGATGACATCATAAACCTAACTTAAATTAG TAAGACAAGACAGTTATGTCACAACTTTAACTTAGTATGGCCACAAATTT AACTCATAATCACTAGCAAATTAAATCACAACATAAAACCTAACTTGTAT GACCCACTGCATACACATAAAAAGGAGCCACAGAGAATCCTAGCCATCTT AAATTTATAGCATATATGGATTGTGGAAATGGTTTTATATGTCTTGCAAA CTTAACTTTTTGTTGAAGAAATAATTGATGTGGCTAGTAGGTTTCACATT GTACCTCAGGGAGGAAGTCTGTTGACTCTGCTATTGATGTCTCCATAAGC ACCTTAACAGCTACTTCATCACCATTTTCTAGTATGCCATGATAAACAAT ACCAAATCCTCCTTTTCCAATGATTGACTGGAAGTTGTTTGTTATGAGCT TCAGCTCTGCATATGTGAACCGTCTGATGTCAATATGTAGGGGAGTTTCC TCTTCATACATAGCATAATCCTCATTGTCTCCTGACTTCTCTGCAAAATG AGGAGGGTTTGTTTTACATGGAAGCCTGCATGTCTGGAATTGCTGCCTAA TGTCTACCACCCTTGCACTGATTGAAAGAAACTTAAAGCGCATAGTTTTT TTACCTTTCCAGTATAGCTTCCAGAATATGCACATGCCTACTAGGAGAGA TATCAATACCACAGGAACTATCACTGCGATGAGCAAGATAGGTGTGGTGT TCCTCCTCTTCTTCTTATCTGAGCAGTATGTATCTTTATTGTTTGCGCAT ATAGGATTGCCTACTAAGCTTGTGACACAATTAAAAAACATACATAAAAA ATCAGCTCAAAATATTCCAGCTGCTCTACAACGTTTTGATTATCACATGC CTATATTTTCTAGCACCCATAGCTTGCTAATAGTTCTTCTAAAGAACTCT ATCCTTAAATGAGCAAAATACATGGTTTCTGAATGACATGCAATTACTAA TAGGTCCTTACCTTCCTTCCATTTTAAATGCCCTGGATGATGAAGCATTT ATGCTTATTAGATGCTAGGTCATGTAATTTAGGGCATGTTTGGATCGATA AAATGCATGCTAAGGTACTTCACACACTTTTGGTGCACCCAAATTTCCCA CCACAACATAGTGAAAATTGCTAATAATTTATGTATTTGAAAAGTGGGAT TGTTGTGGCATTGCGGTAGAATGGCGCACCGCAAGTATGATAACAAAACA GTGGCAAAGAAAGGCAAACTAATGCACTTATGGTATATGGACAAATATTT TCTTCTCCGCACGTTTTTTGTGGAAGCTAAATTGGCAACCAAAATTTCAG CAATTTGATAAGAGTTTATATATATGAAAAGTGGGTCTGCTTTGGCATGG TGCTAGAAAAGTGGGGCATGCGATAAGCATCACGCTAAACAAACAGTAGC CAAATAATGTCAAACTCAGATGCATAATGTAGTTCCGCTATATATGCAAA GATTGTTGCTAAGCCTTGATTTTTTTCTATGATCCCTTTAGGCGTAGTTG TTTAGTTTGATACAAAATAATCAAGAAATTGTGCAACGGGCATTCCATAC CTTAGTTCCAGCAGGCCGGCTTGAACTCTTTGAAGAACAGAATCAGGGAT TGGTCCATCTATCTTATTATTTGACAAGTTGCTGAAAAATATTAGGTAAA ATTATTCATCTAAATTTGGTAGCATCAACCACAAATGTATTCACTGCAGA GACTTACAGAACTTTAAGTGACTTCTGTTGATAGTCTGGAATAGCTCCCG TCAAATTGTTATGTGATAAATCCCTATATATGTTTTGTTTGTAGGGTCAC AAAATATGTCGACATAATATCTTTATCCATCAATACTATGTGGTAAGGTG ACACTTACAAGTTTTCTAGTGATGTCATGTTCATGAATGATATAGAAAAT CCACCTCCCAGTCCACTGGTTGACAGATTTCTGCAAAAAAAAAGAGGTTT AATACACCTCATCTTAATTAAGATATACTAGCATATACCTAACATGTCTT TTCAAGATTATGTAAATATGTTTCTGATGTTCAGATTTATACCAAATTAC CTGGGCTTTCAAGATTTCAACTAAACTATATATCTGTGCTCTTATGAAGC ATTATTTCAGTTTAGTGTTGAGGTGACGTGCTTCAAAGGAATAAAAAATT GAGTTGCAATGTTTAGATCTCAAAATGTATATGATATAATTCCAGGTTAC GTTCTTACACTGTGACAATCCTCGGATTCTGGTTGCTCGAGTGGTCGCAA GACAAACCTTCCCAGGAATACTCTATTGGGGAGCATGGATCTCCATTCCA GCTTATTCGTGAAAAATTGTAGTGCGCCTTAATTTGTTTCATGTAATTGA CTACAACAGCAGAAGACAAGGGAAACAATTATGGACGGTATAAGGTAGCC GTATAAGTTGGATATGAGGGTTTATATGTATTTAAAAGATGAAAAGATTA GCTTAAGAAGTTGCAGCATCATTGCACATATATATGCAACTATTATTTCA TCACAGAACTGATTAAATTGTACTACTAATTCGTTATCAACTATGGTCTT CCCATGACAAATTGCCATTAGTATGTAACTGAATCAGGTGGTTGGTAAAC TAGATCCTAGTATTACTTTAGTTAAGATTTGACAATGTCAAATGGAGTCA GCAATCTTCAGGGGTCTAGCTAGTGAGACCTCGGTCATTAGCATTGGCAA GTACATGATTATCATGTGAATCTGCTACATACATGAAAAATGTGAAATGC AAGTGCAGTATAACATTAATCTTACCATCGTCTGTGTTAGTGGTGAGGTT CTCCATTCTAACAAGAGAGTACACCTCGAACGCGTTAATGAGCGGGGGAA GACTCGAGCTGGCCGTCTTGTTCAAGGGGAAGTATGCATCGGGGTTTTTC AGGAACTGGCCGCCCTTGTAAAGGCTGTCCACCTGGAATCGTGATGGGGA GAAGTCCGCAAACAGCAAATCTTCCGCGCTGTAGATGTTGAACCTCCTGT TCGGGCTGCTCCTGTTGATCTCGGAGAAGTGAAAAATTGGGAGAAGTTGT AGATTCGTGGTATCTAGATTGGGACCAGTTGCCGCGGGGAGGATCATGTA GGAGTAGTTGGTATCTAGGGTCGAGGCCTGCTGGAAGATGGCCGAAGGAA TGTTGAAGGCGTCGGTGCCGGGGAGGCTCTCCACTTTATCGGTAGTGTTC AGGCTGATCCAGGGGTAGGTGTAGTCGATGGTCCCAGACCAGCTCTCCCA GAACCGGTCATAAGGGTCTGTTGGATATCTTCATCACAATACAAAGATGA ACGGAAATAGGTTAACAGTTTGCACACTATACCAGCGGTTGCTCTGTTAA ATTTGTTTGCATATACATGAAAAATTTTAGTGGATGCCAGTCTCATCTTA CCTTGTGATAAAGTCAGTGATGTTGCCAAATCTGTACCGTGTAAAGTAGC TGACTGACACAGAAGTATTGACAAAAGGGTACATCGTATCTTGTAGTGGC CTCAGCTCCAACGAAGATATGAATGGAGTCCCTGAACCGAAGTTTATCAG GCAGACGGACAGAGAGTTGCCTGGAGCAACGGTGAGCACCTCCTTCCATA CCGTGATTGTTGGATCCCAATTTGTCAAGTTCACCGCCTCCCAGAAATTG ACGCCGATATGGAGCCCAAACAGAAACAGCGACCCGTCCAGAGTCTTGTT CAACCTATCGTAGTTGCCGTAAGTAAACATGGCCCTCAATAGATACTTCT TACCAGCGGTGGATGGCAGTGTATAGCAATTCCTTGTGCCATCAAGGAAG CTCCTCAGGGTTTTTTGTTGTTCATTGCCTGCAGGAGCCCTGAACTGTAG TAAAACCTCGTAGTTCACACCGCCCTGGACGAAATTGTCATCAACACTGT ACGGTATTCCTGTGATCTCGTCGGTGTAGGTATCGTTGTTTCTCCATCCA CAGTCGATGCTTACGAACTCTGCACAATGGAGTGTATGTATCAGCTTCAT GAGTTTCAGGTTTATGCAGTGATCATGACATTTGGCACTAGATATGCAGT AGCTCATTATTTGTTGATTTCTAAGATTTCGGTGTTGTGATATTTATTAA GTTTTACGTCGAAGTAAACTGAACTGTGCGCACGGATGGAGCAGAGCTTA AAGAGCCACAGGATTTAGAGTGGGAAAAGCTAGCCAGGAGGATATTGCTT GCATTACCTGGAGGAGACTGGCCGTGGATTTGAATCGTCGTGACCGTGAT GAGCAGCAACGCCAAGATCCATGTCAGTTTTGTACTTGCCGAGCAATAGA AGCTGATCACCATGGTACTCTCCGGTTCTTGCAATGTTTGGAAGCGAGAA ATAGCATCCTATCTGCTACGAACGATTTGTGCACTTATATATCAGAGGAA AACAACTACCACAACCACAGGTTACTATTGGGTTTTTTTTTGTAGAAGTT TCTTTTGTATTCGGTTTGATTTGGCATGATACTCGATGGTATTATGAAGC AGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.