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GrainGenes Sequence Report: AA017143

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Sequence
AA017143
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017143
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAAGATGGTTGGTGGAGGGGGAGGACGAGGACCGCTGCGGCGGGTGGG
GAAATACGAGGTGGGCCGGACAATCGGGGAGGGGACGTTCGCCAAGGTTA
AGTTCGCGCAGAACACGGAGACCGGGGAGAGCGTCGCCATGAAGGTGCTC
GACCGCTCCTCCATCCTCAAACACAATATGGTGGATCAGGTGAGGACGGT
TTTGGTCTCCTACTTCGACTGGATTCCGTTAGATTCCCTATCGTTCCCGA
GCTGTTGGCTGGATTGAGTCTGCTGATCGACGTTTGGGAGTTCTCTGCGT
ATGCCGTTCCTCCCAAGTGCTCGTGATCTATTTGACCTCTAATCCCGGGA
TCAGCAGATACGGATTGGTTGGCGTTTGGAGGAGGTCTGGTGTGGAGAGA
TGCTTAATCTTCTGAATATAGCTGATCTTTCAAAGTAAAAAATTGCCTAA
GTCTAATCCTCCTATTACACGGCCAAGGAGTCCCTTCTCGTTCTGTCTGA
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GAACTTTGAATTGGATCAAAACCTTTGAGGCCTTGTTTACTTCTCTCGTA
TTCACTAGTGTATTTACGGGGATCAGAGGGGATTATCCCAAATCCTGCAA
AATCCCCGCAGTCCGTTTACCATGCTGGGTTTGGATGGGATAATCCCGAG
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ATCATTACTGGCCATTGTGTTTATGTGCAGGTTTTGGCAAGCCGAAAGAA
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TTGTAAGATTCCTCTCTTCTTAGCGATGCCTCCCATTGTCTGACTTCAAG
ATTGATAATTAGACCTAATTCTTCTGTTTGTAGCTTGGATATCTGACTTA
TTCCCTCTGGGATGTATAAAAATGATTTTTCAAACTTCATTCTGTTGATT
CTGAGTGTTTTGCTTAAGAAAAGTATGTTTAGAAAGGTGTGAAATATTTT
GAACCCTGTAGCGCTAGCAAGACGCCACATATTTTCACTAGGCTAATCAC
ATTTTGTATGTTTGTGAGGATGTATGTGATTATATACTGCTCTAGGGCTA
CGTTCTCTGGATGGTGGTTACTTCTATTACTTAAATTTGAATTGACACAA
GTGTCCTTACTTCATCTTCTTCCTCATGTTCAAGTTCGAGTATATGCTGA
TATGAAAAGGGAACCTAACAGTGCTGTATAAACAACAATTTTTAGATTCG
CCATGGGAGACTTGGTGAAGCCGATGCACGTAAATACTTTCAGCAGCTTA
TTGATGGTGTTGATTTTTTCCATAGCAAAGGAGTCTACCATCGAGATTTA
AAGGTAATACTTGAAAATGAAAAATGTTCTGTGGTTCAGAATTTGTGGGG
TTGTTGGACTTATTCTGCATGTTGAGTGCAGCCTGAAAATCTTCTCCTTG
ACTCCCAAGGAAATCTTAAAATTTCGGACTTCGGACTCAGTGCGTGGCCT
GCACAGGTGCATACCTTTCCGAAGCTTTGTCGATGCATTACTGAATTTAT
TTCACTTTTCAATTTACTTATTCGGTGCCGTGCAGGGAGCTGCCCTTCTA
CGTACTACATGTGGAACCCCAAACTATGTTGCCCCAGAGGTACATCCTCT
GAATAACATGGATTGGGTTCTTCTAGTTATGCATCATTATACCTGTCCGT
TGCAAGGAAGGGCGGATTTAAGATTTACATTCCATTTTAATGCGTTAGTT
TTTGTTGGCAGTATTTGGATATCAAATTGTAGTAGGTACTTTGGGTGAAG
TTCCTTCTCATGGATTTGCTGTGTTCTTTTTTCAAGCTTTGAGTCTTGAT
ATATTGATAGATAGGAAAAAATGTTTACAAGCGTACAAGTAACATGCACC
CCACCTAAGCGCTAAGCTCTGCGGTAGTGACTCCTGGAGGTTGTCCGCCC
TGCTGTAGCCCACAAGCCTGCTTCCGCTTAGACGGTGTCGAGCAGTAAAC
TGGTGTTGTCCCTTTCACTGTTGAAGATGATGACATTTCTCCGCTTTCAA
GTCTATCACACTGTTAACTTCTTATTCTCGGTCAGGCATATAGCTACTGA
TGTGTTTTACCTGCCAAATATTTGTTAACTGTAATGTAGAATTTTAATTT
ATGTTATGAAACAGGTCCTCAGTCATAAGGGATATGATGGAGCACTTGCT
GATACATGGTCATGTGGTGTTATTCTGTATGTCCTGTTAGCAGGTTATCT
TCCATTCGATGAAGTGGATTTGACTACACTTTATGGGAAGGTCTGTTTCT
TAATAAGCTTATGACCACATTACTACAAGTCAACCTCCTTCCCCGTGTTA
TCTAAATATAGGTCGTTCTGGGATCCTTTTTTTCCCCGAAAGCGCAAAAG
CCTTGCGTTTCGATGCATTGATAGAAAAAGAAGATTCATGTACAAATCCG
CAGAAGCGGAAGAACACCCACGCCGTACAACTCAACCCAAGACATCTAGA
CTAAGGGAGTAGTTGGCGCAGCCCTCGAGCTTCAGCCTCCGCCCACGCCT
TAGCTTCTGCTTTGATCGTGTCCACGAGGGGAGCCACCGAAGGGCGCTCG
TTATTGAAGGTTACCGCATTCCTTGTGGTCAACCAATTGAAATTTTGATT
GTTAGCATGTGCGAAATTATAATATTTGACTACATAAGAGCAATGTCAAG
CGTTTTATCAACACACCAAGCGTGGCCGTGGCTTCAGCCACCTCAACCAG
GCGCTTCTCATGCTTTTGCCCAAGCGCCCAGACGCTGCCGCCATCGGCGA
CTTCCGCCCAATCCGCCTAATAGACCTGCTGGCCAAGATGTTCGCTAAGA
CTCTGTCGCTTCACCTCGCGCCCAAACTAGACAGCCTCGTCAGCTCAAAT
TAGAATGAGTTGATCGCCGACCTCACCTTGCACGACAACCTCGTGCTCTC
ACGACAATTAGGACGTGTTGGAGACTGTCATAGGAGAGCCTGGAATATTC
CAGTAAGTGTTAGTATAGTAGTGCTGTCCTAGGACTGCCTGGAACATTCC
CGTGAATGTAGAGTCTAAGTTAGTGTCCTACTAGATTCTAGAGTATTCTG
GTGTACTAGTAAAGGTGTACATAAGTTCAGCTATATATATTAGAGGGTGT
GGAGGTCCAAAGGACCAGCCCATCCAGAAATTTCCCCCCAGAACCAACAT
GGTATCAGAGCACAAGGTGGAGGTGCTGCTGGTTCCTGGAGGTGGCCGAC
AGTGAATCACCAAGTGCTGGAGCTCGTGTATGTGGAGGTGCCCTGCTGGA
GACACGGCGGTGGAGCAGGGGGGCGAGCTGTAGGTGAGGCTCAGTGGTGA
CTCTAGGAAGAGGAAAAGGCTAGACCGGTGGCCAGCAGTGCGCGTGTGGC
GAGGAGAACTAGCGGCGCTGCAGCAAGTTGGAAACAACAGAGGATTAGTG
AGGAGGACGCAATTGAAGCCATCGGCGGCTTGGTGGCTTGGTGCAGAGAA
GTAAACCCTGCCCTTGGACGTGGTTGACTTGGTGTTGCAGGGAGAGTTGC
TGCTACAACAGGGAAGAGAGGAGAAGGAGCCAGAGCAGCTGTAGATAGTT
TAGCAGCAGTTGCAAGGAGTGGACTGGAGGCTCACAAAGCAGTCCAAAAG
AGTTCGTGCTAAGGAGAAGCAGAGTTCGTGCAGCAAGACACATAATAAAG
GGAGAACAAGAGGGCATAGCAGTGCTCCAAGAATGGGAGAGAATCGAGAT
ATTGAGCAATTGCTCGATAAATTGGCTGAACTGTTCAAGGCAAAAGACAA
GGACACGTTGATTTTGACTGCCAAGGGATCAGGGGAGGTGCTTGAATTCT
CGACCAAAGATCTGGAGACATTGAGAAAAACAAATAGGAGCGCGGAAAGA
GCCAATCAAAGTGGGAAAACAACAGTTCTTGGCAATTTTGTCAATCTTGC
ACAAATTGAAGGTATCTCAAATCAGGCTCCTACGTTAGATGAAACTTCTC
ATTCAAATTGGATACTAGACTCAGGAGCAACTACACATGTCACGGGTAGG
TGGAGTGAGTTTGCATCATATGCTCCACATCCACCCATGCATAAAGAGAC
CATCCAAACAGCTGATGGAACTTATCAACCTGTCAAAGGTGTCGGCACAG
TGAAATGCACTCCGTCAATTACATTGTCTTCGGTCTTATATGCTCCATCA
TTTCCGGTGAGTTTGGTGTCTATGAGCTCCTTGGTTGATGATATTGATTG
TCGAATCATCGTTGATCGATACAATTGCATAATTGAGGAGAGGAAGACCA
GAAGGAGGCTTGGGATCGGAGTGAGACATAAGGGACTATGGTACTTAGAT
AGACAAGAAAGTGATGGAGCATTGTGCACCGCTCTGACAGTTGCAAGTAA
TGATGAGGCAAGGGTGATACTCCAACATTGTCGATTGGGCCATATGTCCT
TTGATACTATGAGTAAGGTATTTCCTGAAGAGATGAAGAAGATGGATAAA
GACAAGCTTGTGTGTGATGCATGTGAGTATGGAAAACACACAAGGACATC
ATATGTGAGTCGTGGACTCCGGAGCACATCGCCCTTTGTGCTGATTCACT
CTGGACGTCTCCTGTGGTCTCTGTTAGTGGAATGAAGTATTTTGTCACAT
TCATTGATTGTTACTCTCGGATGACTTGGATATATCTCATGAAACAAAAA
AGTGAGGTGTTCGCATGTTTCAGGGAATTCTATGCATATATCCAAAATCG
TTTCAACATTGGTGTTCAAATTATCAGGACTGACAATGTGACAGAGTATG
TGAACCATGAATTTGGCAATTTTCTTTCAGAAAAGGGAGTACTTCATCAA
ACTTCGTGCCCTGATACTTCTCCACAAAACGGAGTAGCTGAGAGGAAGAT
TCGACATCTGCTAGAGGTAGCTCGATCACTTATGTTTACTATGAATGTGC
CTAAATTCTTATGGAGTGAAGCAGTTATGACTGCTACTTATCTAATCAAT
CGGATGCCATCAAAAGTTCTTAGGATGAAGACTCCGTATGAAATGATCTA
TGGGAAAAATGAGTTCATTGTTCCTCCAAAGGTATTTGGATGTACATGCT
TTGTTAGGGACCACAGACCTTCAGTGGGAAAATTAGATCCACGTGCTGTG
AAGTGCATCTTCATTGGATACCCATCTGGACAAAAGGGCTACAAGTGTTG
GAGTCCTAGTGAGCGGAGAACATTTGTGAGCATGGATATGACATTCAGAG
AGTCTGAGCCGTTCTATGGAGAGAAGACGGATCTCAGCTCATTATTTGAC
TTTGACTCTCCTAGCACAAGTAATGCTAGTCGAGAGGGGGAGAGTGAACC
ACTCAGGACAAGGGAAGATGAACCATCGAGATTTGTGCTTGATTCAATTC
CATGTCCTATGAGTGAAGAGAGATGGATAAAGCCAAATGAGGAACAAAAT
TTGAGGGTGTATACAAGAAGACAACCTATGGATAAAGAGAGATGGAGAAA
ACCAAATGAGGAAGAAAATTTAAGGGTGTATACGAGGAGGCAACCGCATC
AACAACAAGGTCAAACAAATGGTGAGATCCAGCTGCAGGGGGAGCAACAT
CAACAACAAATTCTAGGGGTCGATGAAGTTGACTCATCTGAGAGTGTGCC
ATGTGTCACTGATGATTCATTGGATCTACCCATTGCCTTAAGAAAAGGAA
CCCGAGCTGGAGCTAGAAAACCTCCAAATTGGTACCGGGAGGAGCATGAC
ATAGCTAATTATGTATCATATACATCCCTATCTACGAACTACATGGCCTT
CATCGCATCATTGCAATCTGTGGTGATTCCAAGAGACTGGAGAGTAGCAA
AGCAAGACCCGAAGTGGCGTGAGGCCATGATAGAGGAGTTAAATGCTCTC
GAAAGGAATAAAACTTGGGAACTTGTACATCTTCCAGCAGGAAAGAGAGC
TGTTGGGTGTAAATGGATCTACACCGTGAAACAGAATCCAGAAGGGAAAA
TTGAAAGGTACAAGGCAAGACTAGTTGCGAGAGGATATAGTGAAATATAT
GGGATTGACTATGATGAGACATTTGCGCCGGTGGCAAAGATGAACACGGT
GAGGATCCTAATCTCATGTGCAGCTAACTTCGGGTGGCCTTTGCATCAGT
TGGATGTCAAGAATGCATTCTTGCATGGAGATTTACATGAGGAGGTATAC
ATGGAGATCCCACCTGGTTTCTCCACTCCTAGAACATCAGGGAAGGTATG
CAGGTTGAGAAAATCTCTATACGGCCTCAAGCAATCTCCGCGGGCATGGT
TTGATAGATTTAGACGAGTTGTATGCGGTGTGGGATATAAGCAGTGTAAT
GGGGATCATACGGTGTTCTATCGGCACTCAAATAGCCAGATTACAATCCT
TGTCGTATATGTTGATGATATCATAATCACCGGAGATGATGAGGTGGAGA
TATCACGGTTGAAAGATAGCCTACGCAAAGAATTTGAGGTGAAGGACCTT
GGCCAACTCAAGTACTTTCTTGGCATAGAAATTGCTAGATCTCCCAAAGG
GGTTGTTCTCTCCCAGCGAAAGTACGTATTGGACTTGCTTAGTGACACAG
GCATGCTTGGGTGTCGGGTTGCATCAACACCTATCAATCAAAACCACAAA
TTATGTGCCGAATCTGGAGAACCAGTGGATAAGGAGAGGTACCAAAAGCT
TGTTGGAAGGCTCATCTATCTGTCACACAAGACCTGATATTTCATATGCA
GTGAGTGTAGTGAGCAGATACATGCATGATCCTAGGAGCGGACACTTGGA
TGCGGTCAATCAAATCCTCCGGTATTTGAAGGGTAGTCCAGGAAAGGGAC
TATTGTTCAAAAGGAATGGTCATCTAAATGTGGATGGGTATTGTGATGCT
GACTGGGCAAGTTGCTTGGATGGTAGGAGATCCACATCTGGTTATTGTGT
ATTTGTCGGGGGAAATTTAGTGTCATGGCGAAGTAAGAAGCAGCTGGTGG
TTTCTAAGTCAACAACTGAAGCTGAATATAGAGCTATGTCACAAGGTTTG
AGTGAGATGTTATGGGTGAGGAATCTTCTTTCAGAACTGAAAGTGTTGAG
AAAAGGCCCTTTAAATTTGTGGTGTGACAACAAGTCGGCGATCAACATCG
CAAACAACCCTGTTCAACATGATCGAACCAAGCATGTGGAGATTGATCGC
TTCTTCATAAAGGAGAAGTTGGATGACGGTATAATTAGGATAAATCATGT
AACCTCTAGCGAGTAAATTGCAGATTGTTTAACTAAAGGATTAGGAAATA
AAGAGTGCAGTTCAGCTTGTAACAAGATGGGAATGATAGATATCTATCAC
CCATCTTGAGGGGGGAGTGTTGGAGACTGTCATAGGAGAGCCTGGAATAT
TCCAGTAAGTGTTAGTATAGTAGTGCTGTCCTAGGACTGCCTGGAACATT
CCAGTGAATGTAGAGTCTAAGTTAGTGTCCTACTAGATTCTAGAGTATTC
TGGTGTACTAGTAAAGGTGTACATAAGTTCAGCTATATATTTTAGAGGGT
GTGGAGGTCCAAGGGACCAGCCCATCCAGAAATTTCCCCCCAGAACCAAC
AGGACGCCTTCTGCACCAACTACGAGAGCCCTGAATGCTGCTCAAGCTCG
ACCTTGCCCGCGCTTTCGATTCTATATTGTGGCCGTTCTTGTTCGAGTTC
TTGCGGTGTTATGGATTTGGCGGCAGATTCCTTGATTGACACGCGATCTT
GTTGAGCTCCGCCAGCACCAGGATTCTTCTCAAAGGCTAGCCTAGACCTC
CCATTTGGCACCGACGCAGGCTCCGACAAGGCGAACCCTTATCGCCCTAG
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ATCGCCGGACATCCTGCAACAACTCCACCCTCGCCGTCACGTCTCGCAGA
TCTCTCCCTACACGGACGACGTTCTAATGTTCTGCCACCTAACCCCGAGC
GACACGCTAGCGGTGAAGGCCATTCTGGAACTCTTTGGCCACTCGTCAGG
GCTGGCCGTGAACTTTGCCAAGTGTTCCATTGTGCTCGTAAACTGCACCC
CTGATGACGCCGCTGCAGTCTCTGATGGCCTCGGTTGTCCATGTGTTGAT
CTACCCATCACCTACCTAGGCATCCCATTGACAATCTGACGTCCGACGAC
CGCACAACTAATGCCATTGATAGATGGCATGGCAGCCAAGCTCCCCACGT
GGATGGCCGGACTCATAAATAAAGCTGTACGGTTGTAAATTGGTTTATAA
GGTAAAGCGTAAGGCTGATGGTACTGTTGACAGGTACAAGGCTAGACTTG
TTGCAAAGAGGTTCAAGCAACGCTATGGTATTGACTATGAGGACACTTTT
AGTCTGTGGTTAAGGTTGCTACTATTGGGCTGGTTTTGTCCTTGGCAGTG
TCGCGGAATTGGAAGCTCAGGCAACTTGATGTGAAGAACGCGTTCTTACA
TGATGTTCTGGAAGAAGAGGTCTATATGCAACAACCCCTTGGATATATTG
ACGCTTCACACTCTAGAGTATATTTATAAGCTTGATAAAGCCCTTTATGG
CCTAAAGCAGGCTCCGCGGGCATGGTATGCTCGACTTAGCTCTAAACTTC
AGCAGCTTGGTTTTTTGCATCATAGGCTGATACTTCGTTATTTTTCTACA
ACAAAGGGGGAGTAACTATCTATATGCTTACCTATGTTGTTGACATTATT
GTAGTTAGCTCCTCAGACACATGATCTTGGTATGGATTTTGCATTGAAGG
ATTTAGGAGAATTGCACTTCTTGGGAATAGAAGTTAAGAAAGTTCATGAT
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AGTTGTCCTTGACTAGTGGTGAAGTATTGAGTAGTAAAGATTCTACTCGT
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TATTGCCTATTCTGTCAATAAGTTATGTCAGTTTCTACATGCACCTATTA
CAGTGGCTATCTCTGCCGGCTTGAGATTAAGTAAGTCTAAGTCTATTCTT
GTCAGTGCATTCTCTGATGCTGATTGGGTAGGTTGTCCAGATGATCAAAG
ATCTACCGATGGTTTTGCTGTATTCTTTGGATCTAATTTGATCTCGTGGA
GTGCGAGGAAACAAGCTACTGTTTCTTGCTCAAGCATAGAGGCCGAGTAT
AAAACCCTAGCAAATGCTACTGTTGAGGTAATTTGGATACAAACCTTGTT
AAAGGAGCTGGGAGTACCACCGATGAGATCTGCATGTTTATGGTGTGATA
ATATTGGAGATACGCATCTTTCTGCTAATCCTGTGTTTCATGTAAGGACA
AAGCACGTAGAGGTGGATTATCACTTTGTTCGTGAGAGAGTAGCTTTTGG
ACATACGGTATATACCTTTAGGAGATCAATTAGCAGACGGATTTACTAAG
GCACTCTACTAGTCGATTAGAAGATTTTAAACGCAATCTTAAATTAGATA
AGTTATGATTAAGGGGGAGTGTTAAACAATACCGGTTTGTATAGAGTCCG
GTATGGTTGTAGAGTCCAACCTGTGTGCAAAGTTCTTGTCGTTAACGACA
AGGCAGTGTAATTTACTGTATGTCTTGCAATCAATATAACACACACGCAA
GGACTAAGTTGTGGTACCGCTGCAGCACGTATGTAATTTTTCATAGGCAC
AATCGCGAAGTTTTTGGAAGATCGATGGATCAACGGCTAGGCCCCGCAGC
TTTATGCCTGCATCCCAAAGCGCCACTGGAAACAGAGAACCGTTGGGGAA
GGGCTAAAGGCGAATGCTTGGGTGCGAGACATCCAAGGCATCGTCGGCAT
ACAAGAAATCGGCCAATACCTGCTGCTTTGGCGTGCAATTGAGCAAACCC
AGCTCAATGACCAAGTAGATTAGCTGATCTAGAAAGTGGACACCAAGTGT
CTCCTACACAGCGAGCTCCTGCTACCTGGCCTTGTTTCGGAGATCCACAA
GGTGGGATGCTTGGAAGAGGATCTGGAAATGCCAGGCCCCACCCACGCGT
CAAGTTTTTCCCATTGGCTCGCCAACCAAGATCGATAATGGACGACTGAG
CGACTGTGGCGTTGACGGCTGTAGCACCACCCACGCTGCCTCCTATGCGA
TCAGGACATGGAGACCATGGCACACCTGCTCAGGGCGTGCCCCTTCTTCC
GCCATGTCTGGCATGAGGTGCTCGGCTGGCTATGCTTCAAGCACGACCTG
CCCGATGGCCAATCGCTCTTGGAATGGTGGACCACAAGCAGGAAACCACG
AAGACCACGCGCAAGGGACTCACCACCTCCACGCACTTGATCCCCCGGAT
GATATGGAAGCAACACAAAGAATGTGCATTCAATTGCGGTCACCCCTCCG
TCGCTACTCTTGTCGCCAGAATCAAGGATTAAGCGAAACTTTGGGCACGC
GGGGGTGCGACAGGACAGAGGCTTTGCCTGCCACTGGGATGTACACTAGG
AACCAGCCTTTTTTGTTGCTGGGACGTACAAATATAGCGTTGATAGTGTT
AATGGGCCAAATTCGTAGCCCATATTGAATTAGCTACTATTCATGATTTG
CCTTTTTTTAACAGAGTTATGTTTCGGATTTGGATTTGAATTTTTATGAC
ATGATTGATGTATTATTGCCAGTTTTTATGACTTCTAGGATGTGGGTTTT
AAATTTGAGAGTCCACTGACTATGTGGACACTATTCCAACAAGGAAAATC
TTAGGCGAAGTAAATGATCCTCAATAGCATTAGGTGCAAACTACATAACT
GTAATATTTGATAGGAGGTGTAATCTCTGATATGGATAGACGAGACAAGC
ACAACTGCAGGGAAGGCATGACCTAGCAACCTTAATGATCTGTTAGTTGG
AGGGAAGTATAGCATCTATGATCTAGTAGAGATGCCGCAAACACATCTGT
TCATATTTAAGAGCTTTTTCTATCACCTGTTCGGGTCCTGCGGCGGAGCT
AAATACATTCGATATTTGTAGTCATCAGTCAATGGCATATGTGTTCTTTG
TGGGCAGAACATTCTTTCCTTAGATACGGTTTTTTTGTGGAAAGTATAGT
TTCTATATCTTGAATTTTTCTCCTTTTTTCTGACAGTTGGAATTTTCTCC
TTGATGCAGATTGAGAGTGCAGATTATTCATTCCCAGTTGTGTTTCCAAG
CAGTGTTAAGTCATTGATACATAGAATTCTTGATCCTAACCCAGATACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.