Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA038573

[Submit comment/correction]

Sequence	AA038573
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA038573
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAACAAGGTGGACAAAGAGACTCGGTCATGGAGGATGAGGATGAAGAA GATGAGGATTATGAGCTTGAAGAAGATATTGATGATCAGCACACTAGTGA ACCAAACAAATGCAGTTTCTCAAGGATGGAAGTTTAGATCCAAGTCTTGG CGAGAATTTGTGCCGATACAAGTTGATGGGGAAGTTACACAAGGAGAGTG CAAGCATTGTAGTGCAGTAATTAGTGCAAGGCGAGGACATGGAACAAGCG GATTGCGCAATCACTTGCAAAGATGCAAAGCTAGGGCAAAAGTGGCTGAA GCTTTGAATCAGATGAATGCTTCCCTCATGACACCAGATGGAGTCAGCCA TGTGTGGAAGTGGGACCCTGATGTTGCAAGAAAAATGCTAGTGAGGATGG TTGTCCTCCATGAGTTTCCTTTGTCCATCGTTGAGTATGATGGTTTTCGG AAGTTTGTCTCTAGTTTGAATCCATCCTTTCACATGATAACAAGAAAGAC TTTCAGGAATGATATCAAGAAAGACTTTGACGAGTACAAAAAATCTTTGA AGGAACTATTTGGTGTTGCTAACTCCACGATATCATTGACCATGGACTTA TGGACTTCAAATCAGACTATTGGGTACATGGTCATTACGGCACACTTCAT CAATGATTGCTGGAAGTTGGAAAAAAGAATAATCAAGTTCAATACCTTGG AAACACCCCACACAAGATTATCCATGTTCAATATGGTTCTAAAATGCATC CGTGAATTGAACTTGGAGGACAAGTTGTTTTCAATAACGTTGGACAATGC TTCTAACAATTTTAGAATGGTGAAGATGTTGAGGGAAAATTTGTTTGCCA GGAATATGATAATGGGGAAGGGAAAAATGTTTCATCAACGATGCGTAGCC CATATCCTCAATTTGGTATGCCAAGTAGGGATTGACTATTTGGATCCAGT CTTGACAAATATCCGTGAGTCTGCTAAGTTCATAAGAGTTACTGCAAATC GGAAAGAAGCATTTGCGGACATTTTTACACAAGAGGGAATTTCTTGTGAA AAGAGTCTCTGTCTTGATGTTCCCACAAGATGGAACTCAACCTTCACAAT GATAAATATATCATTAAGGTATAGAAGAGCATTTGATGCCTTAGAAAGGC AAGATCCCCAGTATACATATGCACCTTCTGCTGCAGAATGGGATGAGGAA AAAGCTATATGCAAGTTGCTCAGAGTGTTTTATGAAGCTACAAAGGTGAT ATCTGGTTCAAAGTATCCCATAGAAAATCTCTATTTTCATCAAATGTGGC AAGCTAAGGAAGCATTGGACAAGGAGGCATCTCGGGAGGGCTCTCCATTT CCTGAAATGATCAAGCCCATGCAAAAAAAACTTGACAAATACCGGAAACT GTCTTGGTTTGCACTTTCCATACTTGTCATCCTTGATCCGAGGTTCAAGT TCACTTATCTTGAGATTCGGTTTCCTCAGGTGCTTGGGAGTAGTGCTGTG ACTAAGCTCGCTAGAGTGAAGGAGATATTTAAAGAGTTGTTTGAGGAGTA TGCTAAGTTGAACCACTCAGAAACTACACAAACACAACAAGGAGGTGATG TTCTAGACATGGAGATGGAGAGTAATGACCCATTGTTAGATTGGGACCGC GATATTAGTTCTCGGATCAGTTCAACACGTGTCGGATCTTCTGAGCTTGA TGCTTACTGGTTAAAGCCTCCAATAGCTCAAACAGAAAACTTTGATATAC TAGGTTGGTGGAAAAACAATTCAGGAGAGTATCCCATACTTGCTAGCATG GCTAGAGATGCCTTAGCTGTTCCCCCTTCTACCGTTGCATCAGAGTCGGC ATTCAGCACAGGCCGTAGAGTTATATCTGATTTTAGAAGCCGGTTGACTC CCGACACATCTGAATCTCTTATCTGTCTACAAGATTGGTTTCGCACATCA AGTAAGAACTTTCACATTCTAGTCTTTCGCACATCAAGTAAGAACTTTTG CATTCAAGATTGGTTATATAATGTCTCAAGTTTACAAGTGAAACTCTTGT TGTACCATTGTTTCCTATGTAGGCACAACTAGTCTTAGCACGACAAGTGT CTATGACATCCTTGGTGAGGAAGGCCTTTCAATTTCACAAGGTATGTGTT TGTAATATGCATCCGTTACTACTGGGTAGAAAGAGTCAAACCACTATAGG AGTTAGTTACCCAGGCTCAATGTTAGTACCTAAATCATGAGGAGTTAGTG CCCCATGCTCTGATAGTACCTAAATCATGAATATTATAGAAACATCTAAT GAAATATTCTTGTCAATTGTAACCTACTGGTATCACACTCTGTCTGATGA TATATTCCTGTCAATTGTAAACATATGATGCTTGAATGATATACTTCCAA TTAAAAGAGATGCTTAGACCGTATTGTGCACAAACAACTAATATTTCTAT TTTTTGATACAGATAAAAGTTGAAAAGTTTTGGCACTGTTTTCATGGGCA TTCTCCACGATGAAACTATGAAGGGCTGGTTCTTTCTGCTGAATTGTCCA TGTTATTGTTAAAACGACTGGTTATTTTTGTTGAATTGTCCATGTTATTG TTAAAAGGGTCGGTTCTTTTTGCTGAATTGTCCACGTTATTGTTAAATTC AGACATTGTACACTGTTTATTGTTAAATTCAGACATTGTTGCTAGACTTT AATATTACTAGTTCATTACAGCCTTTAATGGCCATTTGTTTCTTGTGTAT ACTCATTAAATATGCCGGTGAATGTGAAATTTTGAATATGTGACATTGTT TCTTCAGTATACCCATTTATCTTGTGAACTTTTTCTTGTGTATTCACCAT CGTACAGATATAAGTGGTTCGTCCCTTAATAACCAACGGTTAACCATTTA TGACCCTAATAACCTAATGGTTAACCTAATTTCCCTTCTACAGAAAATGG TTCAATAGGTTTCTATCCAAAAGATAAATGGTTAACCAAATCCCAACCAT ACCTGCACACATCATACACAAAAGGAAAACGTGTGTGCATGGTATAGAAA TACATCATCCATCATGACATATCTCTTCTTGTGCACATCACCATTATGTT AATCAAGTATGAAATAAATGCATGGTGAGTATGCAAGTGGGGAACATGCT TATCATGGCAATCATCAAAATATCCAAAAGTTGAGAAAGCTATGGGGGCT ATCTCATATAATACATCTGATAAGTATTGTTGCAAGAAAAACAATTGATA GACAAATTATTCAACTTATTGCAAGCAAAGGGAGAAATTGGATAACTACC ATGGAAAAGCATGTCCAAAGCAATTGGAGGATACACAAAAGATGTATAGC ATGGCATGTGTATGGAAATGGTATCGCAATCAAACAATTCCACATGATCA ATATTATGCAAAGGAAAAGCATCACATGGGAATATGAATGAAGCATATGT AATGTCACAAGTATCATCAATAACATGCATATCCTCACAATTCATCATGT CCACTAGTGGGATCATGGCATCATCAACACCCTTATTTTTACCTTGTTTA TACCTCTCATATGAAGTGGGTTATGTGGTAGTAGTGGCCTCCTTGTGGAC GACTTCGTCTTCTTGATGTATCCATGGCGTAGCATCATCTTCGTCCACCA TGTACATATTCTCCATTCGAGGCATCATTGCTTAATGGCTTGGCGCGTCT TCATCCATGGAAGCTAGCACAACATAAGAGAACACACAAGAGGTGGAGGG TAAGTCGTTAGAAATCGAAATGGTCTCACTTGACCTATCAACTACCACTC TCAACTCACTCGGTGTATCACTCATGACCTTAAAGTGGAAACACTCAATA TCACATAAGGTGGAGTGACTCTATCTCACACTTGTTCTCACTCAAGTGGG CTAAGTGGCTCTAATACCAGATGATAGGGGTTAACCTCTTGGGTGACCCG ATCTTCACGGACCTGTGGTCAAATCGATGGGAAAGTGAGGGGAAAGGGAG AAGGTAGCGGAAGCGAACACACACATCACGAACAACACGATGAACACACG CAAAACTCCCACGATACAAGGCCGATTGCTCCTAAACGGCGGCCACCGGT CCGATAGAATCCTCATAAGGAAAGATCGGTCAACGTTCTCCCTCAAATCC ACATCGGAGAGGGAAGAACACCTTGGGGAGGGTCTTGACAACTTGGAGAC GAGACACTGACTCCAAGGCCTTGTTCAACGATGGATGCATGATGCAAAGG CCAATCGAGGTTGGTGAGGATAGTCGGTCCCCTTTGTAAAGGGGATGAGG CAAAACTAGAGATTCCATAATGGGGGTTGTCTTTAGTCTATCACCTAGTC CTAAGGGATACATGAGGGGTGGGGGCTCTATTTATAGGCCATCCACTTAC ATAGGGTTAGTTTGGGAATAGAACTAGGGTTGCATCATAATAAGGGGGTA CATGGTCCGTGGCCTAGATGTGGTGCACGTAGGCACTATCTGATGAAGGG GTTAACCTCTTGGGTGGCCCGATCTTCACGGATCTCGTGGTCAAATCGAT GGGAAAACGAGGGGGAAGGGAGAAGGTAGTGGAAAGGGACACACACCTCG TGAAGAACACGATGAACACACGCAAAACTCACACGATACAAGGCCGATTG CTCCCGAACGGCGGACACCGGTCCGATAGAATCCTCGCAAGGAAAGATCG GTCAACGTGCTCCCTCAAATCCACATCAGAGAGGGAAGAACACCTTCAGG AGGGTCTTGACAACTTGGAGATGAGACAACGAACTCCAAGGACTTGTTCA ACGATGGATGCGTGATGCAAAGTCCAATCGAGGTTGGCGACGATAGTCGG TCCCCTTGGTAAAGGGGATGAGGCAAAACGAGAGATTACACACAAGGGGG TTGTCTTTAGTATATCATCTATGCCTAAGGGATACATGAAGGGGTGGGGG CTCTATTTATAGGCCAGCCACATAAACAGGGGTAGTTTAGGGATAAAACT AGGGTTTGGATGAGCTAGAGGGGTACATGGGCCGAGGGCCCAGCTGGCGG CGTGCAGGCCCATCACGCAGGCCGGAGACTCCGGTGTAGGGGCCGGAGAC TCCGGTCAGGGCCGGAGATTCCGGTCAGTCTCCGGTGTCGTCTCCGGAGT GGTGTACTGACTGTCCCCGGGTCGGTTGCTGGGGTCGGTCCGGAGGTCGG TCCAGAGACTCCGGTGCGCAGGACTGGAGACTCCGGTGTAGCAGGACCGG AGACTCCGGTGTAGCAGGACCGGAGACTCCGGTGTAGGCCGAAGACTCTC GTGGTTCAGCTGTGGCTTCTTCCGTCTCCTCTTCCAAGCATCCGTCTTGT CGGGCTTGATGTTCCGGGCTTCCTCCCTTGCCTCCGTACTTGTTGGTGTG AACCTATCATGAATATGTGATGGAGTATGAAGTAGCATAGCATTCAATAG GGTAGGAAGTGGGCTCTCATAGATGAACGGATTCACCTTTGGAGTCCATG ACGACTTGGCGTAAGTTGGAGACCATGATGTGGTAACGACCGTAGGTCGG GCTACATCAGCTCCCCCCTTCAAAAAGAGTCGTCCTCGACTCTACATGCT CATCACAAAGTAGAAGAGGTCGAGAGACCTTATTGATCCTAGGGTTCACC ATATAGTCGTACTCGGGAAGATTGACTTGACAAAACTTCAATGTTCCTTC ACCTTCAATGAAGCCTACAAAGCTCACAAAAAAGCGAAGCAACACTCAAA GCATAGCCAATTCATGAAGATTATAGCACGAGTCCTCAAGTAGAAGGAAG TCACCTTAGCTTGTAGAGATAGCTCGATAAAGGGTAACCATAGGTAACTC TCTTCAGTTATTCTGGTCAACATATAGTCCATAGAGGTTGACGTGTATGC ATTTGTACCTTCACACAACAAAGACAAAGCAAAATATTTTCGTGCGTGAT AGAGGAGCATGTCATTTGTGGCATGTCCATTCTTGTTCGCAACACTATTA GCACAATACAAGGATAGCAAATGGAATGCATATGCAAGGTCAAAGTGCAT GGAAATCGTACGAACATCATCCAAATGTGGAAACTCAAAAACTCCATATA ACATAGTAGGGTGGCACGCAAAGCAATTGACTAAATATATCAACATCTTT GATGCAAGAATAGGCGAATTTGGCAAAAACACACGAGGAAGCATATCCAA AACAAAAGCATTATGTGTGCAAACCAACCATTGGAAAGAGAAATTGCTCA AGATGTTGGATTCGATACACATATCATCAAAATCAAATATCATGGGAATA TGAATATCCCAAGCGGAAGCAAAATCAACAAGTTTGCAAACAAACCATAT GAAAGAGAAAGTGGTCCTTATGTTTGTTGCAACAAAACGATGAGATACTT GGGAGCTCTCATGACAATACATGCTCTTAATGGCATTATGGTTGCACACA AAACATCGGAAAGATAAATTGTTCAACATTTTTGTTGCAACACACAAATC ATCAATATCCAATAGCAAAGAAACATGAATGTCACAAGGAGAGATAATAC CATTAACATGCTTGCAAGTAAATTATAGGAAAGAACAATTTGTCAACATG AAAGATGCAAAGCATGCCAAAGGTATCAGAGCTAGGTTCGATCTTGAACT CACTTGTGGGATGCTCTCAAGAGATCTTTTTGTCAACTCGTGCTCAACCG AGGTTGACATGATAGTGCGGGTACCTACACACATCATACACAAAAGGAAG AACGTGTGTGCATGGTAGAGATACACATCATCCATCCTGACGTATCTCTT TTTGTGCACATCACCATTAATGTCAATCAAGTATGAAATAGGTGCATGGT GAGTATGCAAGTGGGGAACATGCTTATCATGGCAATCATCAAAATCTCCA AAAATTGAGAAAGCTATGGGGGCCATCTCATTATAATGCATGTGATCAAT ATTTTTGCAAGCAAAACAAGTGAAATAGCAATCATTAATTTATTGCAAGC AATGGGAGAAATTGAATGGCTAGCATGACAACGCATGTCTAAAGCAATTG GAGGATAGACACAAGATGCATAGCATGGCATGTTTATGGCAATGTTATCG CACTCAAACAATTCCACATGATCAATATTATGCAAAGGCAAAGCATCACA TGGGAATATGAGTGAAGCATATGTAATGTCACTAGTATCATCCATAACAT GCATATTCTCACAATTCATCATGTCCACTAGTGGGATCATGGCATCATCA ACACCCTTAATGTTACTTTGGTCATACCTCTCATATGAACTGGGTGTTGT GGTAGTAGTGGCCTCCTTGTGGCCGACTTCGTCTTCTTATTGTAGCCATG GTGTAGCATCATCTTCATCCACCATGTACATCTTCTCCATTCGAGGCATC ATTGCTTCATGGCTTTGCGCGTCTTCATCCATGGAACCTAGCACAACACA AGAGAACACACTAGAGGTAGAGGGTAAGTTGTTAGAAATCGAAATGGTCT CACTTGACCTATCAACTACCACTCTCAACTCACTCGGTGTATCACTCATG CCCTCAAAGTGGAGGAACTCAATCTCACATAAGGTGGAGTCACTCATCTC ACACTTGTTCTCACTCAAGTGGGCTAAGTTGCCCTCATACTCACATGGGG TTGGTACCACATCATCATTCAAGCATATAGGGGTAGGCTCGGGTTTCTCA ACTACATGTGCCTCCTTTGGTGAAGGGAAAATCCTATGCTCACCATTGTT GACCTTGTCATCTTCAAGGTTGTATGCCATAAGATGGGCATCATCGTGTA ATACCTCGAAATTCTACAGACGTTAATTTTAATATTTTCTCTATAGTTGA CCAAAATTTGACTTTTTGAGTCATTAGCTGTATGGAAAATCCAAGACCAT GATTAGGTTTCTCTCATCGAGCTGGTCAAAAGGGACTAAAATTTTATATA CATCGGAGCTCAGATGAATATTTGGAGATTCGGAAATTTTGGATTTAAAA TATACGAATTTGTTTCTGAGTAGGAAAAAATAAATAAATATAAATAATAA AAGAAAACCCTTGAACTAGACCTAGTCCTCATCCTGAACCAAAATGTTTC CAATCTCCGGACGCGACCGCAATGCCGCTATTGCCATAATCCGCCGCTGA AAGCTGCTCCAGTGCGGGAGTTGTGGTCGCAGTGGCCTGCATCTATTTGG CCTCTTCGATCTGTCGTCGTGGCCTGCATCTACTTGACCTATTCCATCCG TCACTGCCTCGTTGCCAGGTACGTAGATCCTTCTTCTAGGAGCAACGTGT GTTGGTGGGTTGATTTCTAGTCTAGTCTGCACCAATCTCAATTGCTGAAT ACGAGTTTTGCCGCTGGCCACACTAGATTGGAAATTAGCTTAGTAGCTCC ATAATAGTAGATGCAACTATTAACTGGATTCCACTACGGATGCAAGTACG TGTTAGTTATGTTGTAATTAACAACAATCAGATTAGCAAAAGTAGTTCTG CTCCTTTTTAGTTTGATACCCGAGAACTGTTTGGTCAGTTTGATGGATTC TACGAAAATTTATTGGTCAGTATCAGCTATAGACAGTTACCACATATAGG TCCGGTTATGTCTGCTTCGTTATAAGGATTAAATCTGGAACAATACTACA CGCTGTAGTTTAGATTATTTTTCCTATGGGGATAGTTTCTAAAAAATTTC TACCTACAGGATTTGGAGCTACGGGTACTTAGGGTGGTTCTTCATTTTGA TCGCCGTTCTAAGGAAAGTGCATGACGACTCCTTTGTGTTATGTTTGCCA TCTTAAATTATTGGCTGCATGATATTGGTTCTTTCTTTGGTGTCATGCTT TGAGTTCTTGTCGAAAAGTTTACTTTAAGCCAGGACGGTGAATAAGTTAC AAGTAACTATTCCGGAGCGGATGGTGATATAAGTTATTATGTAACAACTC CGGTGAGCTTGGGATAGGTCGGTGATAATTTGCCTGTTTAACTATTCCAC GAGGTCGGTGAGGAAGTTAATAGTCAATATTCCGGAATGTCCGTATCGTA AAACAAAATATGCTTAATGGTGTTTCTGGATATCATTTGGAATGGGTATT GGATTTTGTATGTTGTTGATTGGGTTCTAAACTTGTGCTTGCTGAGTATT TTTTTACTCACCCTTGTGTTTTCTTTGGTTTTTATTGGATTTCAGGTACT TGGCGTAGCGACATGCATGGGAGGGAGTAGATCGCCACCACTTTGGCGCA CACATCCATTCTACATATCATAGAACATCGATCACACATAATTCTTAGTT TATCATTATTCCTTTGACTTAATTCGCGGAGTCGTTTGCATGTTCTCGTG AGCCTTTGGTCGCTCCACCGTTAGTACTCGTGTCATGGAATGATTATACA CTATGTGAACTGCATGGATTGCTTAGTTATATGGTCTTTACTGTCTTTAT CCATTATATTGTGTTTTGCCTATCGTGGATGTCCTTTGAAACAAAGGAGG TGCTGCCAAAATTTTGAATTGTAGTTAGTTTCGATCATAATTTAAGAAGT GTGGTAACACCGCCAGCTAGGTATAAATCTGGGGTGGTACAGTTGGTATT AAATCCTAGGCTTTAGATCTCTGGCGTAATAAGTTAGGATAAGGTTAAAA AAACATCTAAAACTTGAGTTAAGACCAACCAAAAAAAATGACACAGTGCA CTATAGGATGGGGTTTATGGGACATGCATCTCATTTGCGTTTCTGTTGGT TTAATTTTGCTTTTTTATCTTATGCATTTTAGTAAGGATGGAAATTATTT GATCTTATGTTTTTTGCTTACTGATTATTGATAATGGATTTTATAGTTAT GGCGCCGAATCTTAGGGGTCGGGCTCGTGGCCGTGCTGGCCGCAATGGTC GTGCAGAGGGGTCAGATGAGGAAGTGAGCCAATCTAGGAATAGTGATGGA CATCATGCGGCGAACATGACGCTCACCAAATGGATGGATATGAAATTGGA CAAGTTTGATGGATCAGGGACACAAATGGATGCTGCAAGTTGGCTTCGCA CCATGGATAAATACATGGATGCATCAGTGATGACGCCAGAGGACAGAGTT GTGTATGTAGCTTTTCAACTAAAGGGTCTGGCTGATGTTTGGTGGGACGG AGTCCGTGCAGCTTGGACACCGGCTCATGGACCTCCTACATGGGATGTTT TTGTTACACAATTCATTGCTAAGACTACCCGGCTTCATTCAAGGATAAGA TGGATGTTGCCCTCAGGAATAACAAGTAAGGAAACAAGACGGTGGATGAG TATGATGTTGAGTTTAGTAAGATGGTTCATTTTGTAGACCATATTAATCA GAATGAGCCAGAGAAAGCAAGGAGGTTCTTCGAGGGACTTAATTCGCGAT ATCGACATGTGATGGGAGTGAATCGCCCATCGAGCTATTTCGCTATGGTT GAGCAGGCTAGGGGTTTGGAGTTACAATATCAACTCACAGAGGCAGAGAA AACTCGTACAAATGGTGCCAACAACAATGGTGGGGGGCATAAGAGGAACT ACCAGGATGGGAGTGGGTCTAGCCAGCGATCCGACTTCAAGAAGTTCAAA TCAGATCAGCGGTCTCAGCAGTCATTCAAGCCCAGGCAGTTTGGGGCTTA G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.