Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA007462

[Submit comment/correction]

Sequence
AA007462
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007462
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCAAGTGGGTGGCGATGTGGGACCCTAAAGCGGCCAAGCGCAGAGA
TGAGTGGATCGAGGAGAACTTGAAGGCCATGGATCTGGTGGACATTGATC
CTATCGAGGACCTGTCTAACGACTGGGAGGCCATCCAAGCCAAGAGATTC
TACAAATTCTGGGAATTTTCATGGGCTGGATCCATTTGAGATCTCTCCAA
AAGATACGATCGAGTTACTCATTCGAGAGTCCCTCTTGATAGTATGTCTA
TCTATCCTAAACCCGGTCTCCCAACTAACGACCTGAGACCGACAAAAGGG
AAAACCTTTACCTTGAGCATTCCATTTGAGCTTGATGTAGGCGATCTTGT
CCTTCTCAATATGGAACAACTTTCTTTATTGCTCTTGCTCGCGCTTGCTT
GATGAAGACTTGCGACTTGCTCCCCATACACCATGGGTAAACCTCTTCTT
TGATGTTGTCTTCATCGATCCATGATCATCGAGGATGACAAGCTTCAATC
ATGTGATCTTCTATATATGGCGAATCTTGATCTTGCACAACTTCATTTCT
TCTTGAGTATTGGCCATTCTTCGTCTTGATCAACCTTGAACCATCTTCTT
TATTCAACATAATTTCGCTAGGCCCAAAGCCCTTGGACATTGCTTCTTGT
TCATTTCTTCTACCTTAAAGCTAACGCATGGTCCAAGCGATGCCAATGGA
TAAATTCTACAAGTGTAACTCAAGCAAACATTAGTCCATAGAGATTACCA
CTAATTCCCAAAACCACATACGGTGGCACACATGCTATTTTACCCGCCGT
TGCACTAGTACTATCATTAATTACCAAAACCACATACTGTGGCACACATG
CTATTTTACCCGGCGCTGCACTAGTACAATGGACCGGTAGAGGAGGATGA
AGCCGTCTGTATGGAAGGAAGGCCTCAAAGGAGGAGGTCGACCTCGCGGA
GCTGTCCAGGTGGACCGACCATTGGACGGGAGCAACAACTATTTCTACAA
GATGAATGGAAGAAGACACCTGGGGCGACCCAGCGGGTCTGTCGATGCCA
GCTCCACTGACCCAAAATACATTCGAGGCTGATTCGTCCCACCCAATGAC
CTCGAAAATTCGGGTCGGGTCAGTGACCCAGTGGGCCAACCCGGCACATT
CCCATCTTGAATGTGGATTACTAAAATAAGCATCATCTGGACCATCTGGT
ACCACTAAAATAAGCAGCACCTGGTATTAAAGTAAGCTAATTTAGTATAC
TACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTCGTGAAGAAAATG
TATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCATTCCAAACTTGAGTGAACCT
AGATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGTTAAAACATCT
TATATTTTGAAAACGGAGGGAGTAGTAGAAACAATGTTAAACTAATTCAC
AACAACACACAGCCCCATGAGCAACACACTGGCAGGCATCAGCTGCTAAT
TGAACTACTTGAGCAGTGGAGAGCACACACATCAGTTACTAACTGAAATA
CATAGCAGAAGTGAGAAACGAGGACAACTGCAAGTCAGCAAACTAGCGGG
GAAGAAGAGGAGAAGGTCGGCGACTATGGGGAAGAAGAGAAGCTAGTGGG
GAAGAAGGCGATGCATACCTGACAGCGAGGAAGATCTGGACGCACCGGAG
CTCGGCAGGACAGGGGGTCGCGGGAAGAGGCGCCGGCGCTGCCAGGTTCT
CCCATTCCTCTCAGTCCCCCCTCGGATTTGTTCCGCTCCAGTCTCCCGTT
CCTCTCGATTGAGTCGATTCCCCTTCGATTTATTCCGCTCGGGCCTTCGT
CCAGGCTCGCGGGAGAAGCTAATCAGGTAATCCCCTGTTTTTTCCCCTGT
ATTTTGATAAGTCGAGCATTTGCTTGAAAAGTACATAAACCATGTGTTCA
AGCAATCTGCTTTGAGTTTCAGTGTAGATCTTCCTTGTTTCTAAGGAGCC
ATTAATAACATTGTGCACAAATTCACACCTAGAACCAATATATGCACTTT
TGTCTGAAAAGAAAAAAAACACTATTATTACGTTGTATTTGGTCTTATTT
GGGTGGTTATCTTTGAATCATAGAGATGGATGATACAGCTGAACTGGAAG
CCCTGGAGCACATAATAAGTAACGAATCTGCAGAGCCGATCAAGCTGTCG
TACGGTCTTATGAGATCCATTACGGACAACTTTTCTAACGAAATTGGTCG
TGGCGGATTTGGAGTTGTTTACAAGGTATGGCCTGTTCTCGCAGATGCTA
ACCTTCCTTTTTTTATTTACAAAATTCCCTGTAAATGCTAATTCCATGAA
TGAAACAGGGAGTTCTTCGAAACGGAGATGTTGCTGTGAAGAAACTATCT
AATCCGCACGCTTTATCTGATAAGCAACTCTTGGATGAGATCACGTGTTT
AAAAAAGGCAAAGCATGAGAATATAGTGAGATTTCTGGGCTACTGTTCGG
AAACACAGGGGGAAGTGCTTGAATTCAATGGTGCAATTATAATGGCTGAG
GTGCTGAATAAGTTGCTCTGCTTTGAGTATGTCCCGAATGGGAATATTCA
GCATTATCTTCAACAAGGTATAGGGGGCTAACAACCACATTTTTATTAAA
ACAATGATTATTTGTTAAGTTTCTTGGAGTTGTTGCTTCCCAAGGAAATT
ACCAGATGTTTCTTCCTTTTGTCGGAAACATCATTATTCTTTTCTTGAAT
TGATCAGCTATATAAGTAGTATCCATTTCAATACACATCTCGATGCATAT
AAATTTTACTAGTGCATGATAAATTATCCTGACACTGACAATTACACTAA
TTTAGCTCAAATGGTCTTTATAAGTTCATGGAAAAAGGTGATCCCCATTA
AATCAATATGTGAATAGCAGCTAAGAGCATTTAGTACAACTTTTGAAGTT
GAGATTTGAAAATTTTCAACTAGAAGTCCAATTGTCTTGCTTCAAAATTT
GAAACCTTGATATGAAAGATGTTTTTCTATGTCTTTTGAATTTAGTTTAC
GTGTTTTAGGAGGCGGGCCAAAATAAAGCGAATATAGCCACGTGTTATCA
TACGGCTGTCCAGGGGTAGGGTGGGTAAGGGTAGGGTAGAGATAGGGAAG
TGTGAAGCTATTTGTTTTATGCCTATTTATGGTCTCGTGTACAACAGACG
ACTTCTGATATCTTTTTCTAGCTTGATCATTTTATCGTGTGAAACTCATA
GTGCAACCATGAATGACGAATATGTTATAAAGTCTGAACAACCTTTTGTT
CCCTTTTCCAGAGAAACCTCATGGAGACAGCTGGCATGTACGATACAAAA
TGATTAGAGGAATTTGTCAAGGGCTGCAATATCTTCATGACCAAAACATC
AACCATCTAGATTTGAAACCTGAAAATGTTATGCTGGACGCTAACATGAA
TCCAAAAATTACCGACTTTGGTTTGTCAAGATGCTTAGACCAAGGACAGT
CCAAACATATTACTCAACACATACTTGGAACACCGTAGGCTAAGCCAGCC
CATTGACATATTTGTTTGTTTATTTTTCTCTGTCCAAAGATACTTTGAAT
TAACTATCACCTTATTAATGTAGGCGATATATTGCACCAGAAGTCATAGA
CAAAGGAGAAATATCGTTGAAGACAGACATATACGCTCTGGGTATTATTA
TCATAGAACTATTAACAGGGATCAACAAGATAGGCCTTGAGAATGTAAGA
AGAATTTAACTTACATGTTGGATCGTAAACTTGTGTTTAACTCTACACAT
CTGTATCATTATATAAAATAAAGAGTATATTCTGTTTTTTACTGTAGTTG
TGACAGTTTGGTAACATTTTGATGGCTTTTATCTTGTTTATATTTTTTTC
CCAAACTATCAAACTATACCCACTTGTTAGGATAATATTGAGCTGACTGT
AGATAACGCTTGTGCTTATTTGTTGGGGACTAGTCTATATTATGCCAAGA
AATTTGAACTATCAACTAGACCCACTTGTTAGGAAAATGTTGCAGCTGAC
TGCGTGGATAACTCTCATGCTTATTCATTGGGGACTTATCGATATTATAA
CAAGAAATTTGAACTATCATTTTGAATCAGGTTAAATCATATGAAACCAT
GTTGAATTCTACTGAATAGATGCCACTAGTCACATTGCAAAGCCTGTAGA
AATTTTCAGTCTAAAAAAAGTCACACTACAATACTTGCCACGTCGAATAT
GCCCTGACTGAATATTAGTTTGAGTTTTCCACTCAACAATGTCATGGTGA
CATGTAGGTCTATCTTGTCATGCATGGTGTTTACCATATATCTCGTCGGT
GTTTCATTTGCCCACTGGAGATGATCCTCTCGTGATTGATGAATGTATTT
CCCTTGTATTTGTTGTATTAGGGGTGAAATGTATATATATTTAAAACCTA
ACAACAGTTGTCAAGTGAAACATGGAGTGACAAATGTTTGCATACCTGTG
TTGCATATATTGCTTTTGTGTTCCAATATATCAGGGAAGGTGCTGCCATC
TTTACTGTATGTTTAAACTTAATTTGCAGTGGGATGAATCATTAGAGGTG
GACTGTCCCCGAGTGAGGAGGTGCAGCGAAATGGCTCGGAAATGCATAGA
CCCTGATAAACGTAACCGACCTACCATACAAAAAATAGTTAGAGAGCTTG
ATGAATTGGAGGGCATGATTCCATGGTATTCCATGAACCAGGTAAGTAGG
ATTAATTCAAGGCTACATTGTTTTATATCTTGGGTTTATCAGTGCAAATT
CCACCGTTACAACATTATCCATAATCCTCCCTAATCAATCTACCTATTTA
GGATTATGATGTTAGAAGTGATGCTTACATATATGCATACTTTTTGTACG
GGTTGTGCATATATAACCATGGGATATATTTCTTGCCATTTTGGTGGATG
TTAATGTACAGACACTTACAAGCAATTAATGTAGGAGATGTGTCACTTTA
ATTTTTCTTCATCCATCATTAACCTGACTGAGTTTACAGTTTTAGAGCCT
ATTTGGTTCAAGGTAATTTCATAGTATTTTGGGGGATTGTAAGGAATTTT
TTTCTTATGGAGATTTTTTCGTTATAGCATTGGAAACCACAGGAACTTCT
TTACATTATCTGTTTGTAAGAGTGAAAACCAGAGCTATGTCAGTCATAAC
CTTCAACCAGAAATAAAGTTCGAAATTGTGGTCAAGAATGTGGATCTTCT
TTTGGTTTATAGCATTGGAAACATACGCACTCAACTATATATACTTTGTA
CATGCAGGTCACCTGCACTGTGTTCCCTGTGACAGAGCTGGTTGATGTGC
ACCCCCTCCAGCTCAAGTTCTCCTTCGTGCCAGACAAGGAGATGCATTGT
CACCTGAGCCTTACTAACAAGACAAATTGTGGAATCTATTGCATTATTAT
ATCAGAAGTTCCGGATAGGTACAAAGGATTATTCAAAGGCTTTATGTCAC
CAATGCTCACATCAGCTTTTACATTGCGTAGAGAAGCGGAAAAAGAGCTT
CCTTTAGACATGGATGAGTTGGAGATACATGTGTTTAACATGGAACGTCC
AACAAGATTCGGTGGAAATGTCCTTCAGAAACTAGTAAAGCTATCAAGGG
AAAACATCGAGCCCTCTATAGATACATCCAAGAAAGTCCATGAGCTGTTG
GGTGGTGAGGTGCACCGGGTGATGTTGAAAGTTGTTGTCATCTCCAAGCT
GGATGATGGTCGAGTTGTAAGTATGTCCCATGCATGCATATATAATATCA
TTAGTTTTTCCAAGCTACTAAAGTTATTTAGTTTGCCAAAACGTTCTACA
TTATGGAACAGAGGTAGTAGATTTTATTATTGATTATGTGGTTGTATCAT
TTAGTGGTGGATGCTCCTGGCAGAAGAAATAAGTTAGTGGTGGGTACCAG
ACCAGTAAAAACAAAGTTTTCGTGGGATACTAGAGACCCAAAATTTATGA
GTATTACTTCCATGGATGTGCATCCCACAGAGCCATGGTGAGTGAGTTGT
CCCCTACGCGTTTACATGGACAACAACATTAGTATATCTCCAATACTTCA
TCTCTCCGTAATATTTTCTTGTAGGGTATTGATCATTTCAGATACAGACA
TTGTGTACATTTGGAATTGGCAGACTGATGAGAAATTAGGAGAATGTATG
TACCCTGGAGGGGTTCGTTATGACCGTCCGGTGGCTAAATCTATCGCTCT
GAAGCAATGGGTTGTAGTTGGGGACCAGGAAGGATCCATCTGTGTGCACA
CGTGTCCCTCGATGGACAAAATAAAGGAATTCGAAGCTCACCGTTATGAC
ATAACTTCATTGGATGTTCACCCGACTCGTCCATTCCTACTGTCATGCAG
TATACCAACTTTTTCGCTAAAGCTTTGGGACTGGAACCGTGACTGGTGTT
GTACCCAAATATTTGAAATCACTGGAATTGTCTCACAAGTCATGTTTCAC
CCCAAGTACACCAATAGTTTTGCTGTACTTCATGATGATGGGATAGTCAA
GGTTTGTCTTCCCTGATCAACAGTTTTTTATTTGTAATCTATTCTCTTAT
TATAGTACCATCATTGAGAATTTAACTAGTTAGTTCCTTTTTGTCATGTA
ACATAAATCTGACTTTGATTCTACATTTATGAAATATATGTAGATGTGGA
GAATTGATCATCCCAATCCTATCGCCACAACACAAGAACTGAGATGTTGC
AGGACTAGCAATCTTTTCACCTACATTGGTGATCGGCATTTCATTGCTAC
TTTTAAAAATAATACTGCATGTGTAAGGGGCATGCATTGCATACCAAATT
TATCAAAGAATATAATATTATATATGTACATACATGACACTAACCTTTGT
ACGCATTTCTTTTCATTTTTTATTATGGTGAATCAGATATGCAATCTGCA
GAAGGAAAAACATGTCCACTCAATCGCTATTGTACAAAATGAGAACATCG
ATGTTGTTGTTTGCCACCCAACAAATCTGGTATTCGTTACAGCTTCAGAC
AATGGAAATATTAATGTGTGGAACTCCACTACCTACAAGTATGTAATACT
TGTGTATGTATTTTCTTATTCAAAGGATAAAATCAGTCCATGTGTCTTTG
TGTTGTCGACATGCATCCAGTACGTTCACAATTTAGTCCCGAGCCATACT
TGATTCAACTTAATTTCAATTTTCCTCCCAATTATTCCTTACTAGCTACC
TACAAAACAAACTGCAATGTAGTAGGATTGCCAATTTTCACCCAAGAATT
GTTTATGTCGGAATATAACATGTAAGAGCCAGAAAAATACTATGAAAGGA
ATATATTGATTTTGACCAGTATCTAAGTGATTTTCTCCTTTACTAACTAC
TTCCTCAGTCCCATAATATAAGATGTTATTACATCAAATATACTTGGGTC
TTACATGAGAATAAATAAAATCAGTCCATGTGTATTTGTGTCTTTATATG
ACAGAGGGGGTATTATTTAGCCTTATATTTCCTTGTTGTAAAAATAAATC
AATAATGCTCCATATATCAAGTTGTGATTTAACACTCTAGCTGCCAGGGT
TATTTTCTTCTTGTTTATGGAACACCTTATCTTCTTGTTTATGTACAACC
AGCAAACATGTGCACACTCTCACATATATATTATGCTTCAATGATACAGT
ATTATGCTAGAAGATGAAACTAACCGTGGGCGTCCATCGTTTACAGGCTT
ATAAAGACATATTTGAATTTGCCAAAGCATCCTATACATATTGGATTTTC
AGATTCAAGAAGGTAATGGATTTTCTTTTGATATCTTTGTACCTTGTAAA
CAACAATGCTTTTTAGCATAATGAAAATTTATGTACAAATAAAGGGACAC
TAAGGTTGGCAAAACTTACTTTGTGTCAAATCAGATATCGACTATCCTTT
CCAATGTTTCCGCCCGAATATATTTATCCTATGAACACATATTTTAGAGT
AGATATTTCAATTCTCATGAATTTGGTAAGTTAATGTAATAGGCATATAA
TAATGCCTAAATAGGTGTAGTTTAGGTTTGTAGAATTATTAAACGTCATT
TAGTAAATCACATGAATGGATCGGATCAAAAAATCGTAACAGACCTTATA
GTTTTCAGCTATTTTATTTGTGGTACTAATTTTTGCACTCTTCAAACCTT
TAACCTAGAACATCTGAATTATGTAGGCTCGTGATCGGATACGAAAAGGG
AATAGCGGTCATAGATATTGACCTAGAATAGGCTGGAGTTCAAGGTTGCC
TTCACAAAGTGTTCCCAGTTGGTTTATATATCTCTCGCATCACTCATTTT
CAAATTTTTAATAAGTGTATCACTGCAATATACTTGGTTGATTACTGTGA
AACTGCTACGACTCAGGTTTTATTTACACCAACTAGCTCAATGCGAGGGC
CACATCTTTATTGTGTTGAAAGTGCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.