Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025436

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025436
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025436
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGACCACAACGGTACTACCGGATGACCTGGTGGTGGACATCCTCTCTCG GCTGCCGCTGAAGTCCTTTTGCCGCTTCAAATGTGTCTGCAAGTCATGTC TAGCCTTCTCATCTGATCCACACTACCGCCAGAAGTTCCCAAGAACTCCC TCTGGTCTCTTGTACCAAGAACAAGAATGTGAACATGGCACTGCTATCCA TCTTGCCAGACTTCCCTCAAGTGATAGGGATATTGACACAACACTTAGCT TTGTGCCATGTTCTGAGTATCCCTTGGAGATTAAGGATGTCAGCAATGGC CTGCTTCTTTCTTATCGTGGAGGTAATACACATGCAGAAATTTCCAACGC CATTGTGTGCAATCCGGCAACTGAAGAGTGGATGGCACTTCCATATACTC AACCAGGACCAACCGTCACCCATAGTCACCTCAAGCTGTGTTTTGATCCA CTATGGTCCCAACACTTTTATGTGTTCCACTTTCAGGAGAGCTATATCTC AGGTGATGATCGAGTATCAACTTGAAGTGAAGGTATTTTTCTCCGAGAAT TCTACATGGTCTAGTCGTCTTTGGGAATCTGGCGATCCATGTTGGTGTGG TTCAGTCTTCGTAAATGGAGTACTGTATGTGCAGAACACATTGTCGCATG ATCTTTTGGCGCTCGATGCACCTGACACATGCACGCAGTTGCTCCATGAT AGGACCATTCGGCTTCTAGGATTTCCATGTGGACGAGATCAGGGGTTTGG CTGTTGGAATGGATGTGTTCTTCAGTCATGTGGGGTCTTATGCTTTGCAC AACAAGAATTGGAAGGTCGTGTGATGCGGATCTGGAGTTTGGATGGCTCT GATAGCTGGGTGGTGAAGCATCGTCTAAGTATTAACAACGTACTTGGGAG AGATATAGTGCTCCGTACTAATACTTTCGGATCATGGTATTTCGATTATG ACATACTGGCTTTTGACTTGGAGAGGGAGCTAGTTATCCTTGTTGACCGT ATTGCTAACGCACTACGGGAATAACTAAATAGGCCGACGGCCTTTTTATA CGTCGACGGCAAAATGTCGGGGCCGTCGGCGTATCTTGATGGGCCGTCGG CCCAGTTTGGCCGTCGGTGTAGAATAAATAGGCCGACGGCCGCCGTCGGC GTAAACATGACCGTCGGCGTAGCCTATTGAGCTAACGGCAGAGAAACGGC GCCAAGTCTACGCCGACGGCAAGACCTATGCCGACGGCAAAGTAGCTATT TTTCTTTTTTTTGCCACATTAATCTTAGAAAAATCATAACTAAATCATTT AAATTTAGAAAAATACATATAATATATCAAAATTTGCAGAAAAATAAGAT ATATCTATATAAATTCAAATATTATATATTTTTATTCAAAAAAATACATA AAAAAATACAAATACTTTCGTATAACATATTTTTCATTTTCCAAGTGCAA AAAAGGGGTGTTTTGTGAAGCAACCACCAAAAGAAAGTTTCAAAATGATA ATACCATATTTTTCAAAAATACTAGACCATATTGAATGGACAATTTCCTA ACCTAGGAATCTCAAACCTTTCCGTTCACCTCTCGTGAAAAAGACAAATT CCTGCTGAATCGATAGGAAATGAGTTAGATTTGAACTACATGTACATGAT ATATTGCTCATGATTTTTTATAAAAATCATTTTTAGGTTCACAATATGCT ATTTCATCAGAGATCTAATGCAAGTTTAGTGAGACTCGTCCCCGAGCTAA GAATCATCATGCCCCTCGATTTAGGAAGTTTGACGATAGTTTGAAATGGA CATAAAAAATTAAAAAACGATCGAAACAATGCAAAACCTTCGCGTGGTGT CATATTATATGACATAGTTACATGGAAAAATACCAGACTTGGTATATTCA TTGAGTCATAAAAAAACCTTCACAAAATGACCTATCTCAATCGAGGTTTT CTGGATTTCAGGTCAAATGATCAATGTTATTGCTATAATCGCGGTATAGT TTGCGATAATGTGTCCATATTGTGCACACATGTGTATCATGAGATGGTGA ACAATGTTGCAGGAGGAAGTTTTCCTTTTCGTCGCACCGAAAAGCCATTT TTTATTTTCCGAGTGCAAAAAACGGGGTGCTTTTGTGAAGCAACCACCAA ATTAAAGTTCAAAATGATAATACTACATTTTTAAAAATACTAGACCATAT TGAATGGACAATTTCCCAACCTAGGAATCTCAAACCTTTCCGTTCACCTC TCGTGAAAAAGACAAATTCCTGCTGAATCTGTAGAAAATGAGTTATATTT GAACTACAGGTACATGATATATTGCTCATGATTTTTTGTAAAAATCATTT TTAGGTTCACAATATGTTATTTTATCAGAGATCTAATGCAAGTTTAGTAA GACTCGTCCCCGAGCTAAGAATCATCATGCCCCTCGATTTAGGAAGTTTG ACGATAGGTTGAAATGGGCATAAAAAATTAAAAAAAGATCGAAACAATGC AAAACCTTCGCGTGGTGTCATATTATATGACATAGTTCCATGGAAAAATA TCAGACTTGGTATATTCATTGAGTCTTAAAAAAACCTTCACAAAATGGCC TATCTCAATCGAGATTTTCTGGATTTCAGGTCAAATGACCAATGTTATTG CTATAATCGCGGTATAGTTTGCGATAATGTGTCCATATTGTGCACACATG TGTATCATGGAATGGTGAACAATGTTGCAAGAGAAAGTTTTCCTTTTCGT CGCACCGAAAAGCCATTTTTCATTTTCCGAATGTAAAAAACGGGGTGTTT TTGTGAAGCAACCACCAAATGAAAGTTTCAAAATGATAATACCACATTTT TTAAAAATACAAGACCATAGTGAATGGACAATTTCCCAACCTAGGAATCT CAAACCTTTCCGTTCACCTCTCGTGAAAAAGACAAATTCCTGCTGAATCA GGAGGAAATGAGTTAGATTTGAACTACAGGTACATGATATATTGCTCATG ATTTTTTGTAAAAATCATTTTTAGGTTCACAATATGCTATTTTATCAGAG ATCTAATACAAGTTTAGTGAGACTCGTCCCCGAGCTAAGAATCATCATGC CCCTCGATTTAGAAAGTTTGACGATAGTTTGAAATGGGCATAAAAAATTA AAAAAACGATCGAAACAATGCAAAACCTTCGCGTGGTGTCATATTATATG ACATAGTTCCATGGAAAAATACCAGACTTGGTATATTCATTGAGTCTTAA AAAAAACCTTCACAAAATAGCCTATCTCAATCGAGGTTTTCTGGATTTCA GGTCAAATTACCAATGTTATTGCTATAATCGTGGTATATTTGCGATAATG GACAGTGCACACATGTGTATCATGGGATGGCGAACAATGTTGCAGGAGGA AGTTTTCCTTTTCGTCGGACAAAAAAGCCATTTTTTATTTTTCGAGTGCC AAAAACGGGGTGTTTCATGAATCTTGACATAGTTTCAGTTGGTCTAATAT TTAAAATTTATGATATATAATTAAATAGATGATAGGGATGTCATATTTGG ATTCCTCTCATTTTTCTCATCGATTTGGATATATTATTTGTCGAATTGTG ATTTACGGATTTGTAGATATGAATTATTCAAATTTAATAAAAAAAGCAAA ATAAATAAAATTTATTTTATTTTTATTTGAATTCAAGATTATTATTACTT ATTTATTGTTGTTTACTCAAAAAATTGTATGGCACCCTCGGCGTAGTGGC GGCCCTCGGCGTAGCAAGCGGACGCGTGGCACATGCAGGCCAACACGGAC GGCGCGCTAACGGTGTCGTCCGTTAGGCCGACGACGACCCTCGACTTAGT ATACGCCGACGGCGACCCTCGGCGTACCAGCAACGTACGTCGACGGTCAC CCTCGGCGTAGCCTTCTGTATTTTTCATTTATTTTATATTTCTATCAATT ATTTATATTTTTTATTAATTGTATAATTTCGTACCCTCTCAATAGCAGTC TACACGTCCACATGAAATGTCGTTGCGAATCTTCTCACACCCCGATAAAT TTCTATATGTTTGTAAGTGTTATTATCGCATGTGGTTCTGAATAGCACTC ACCACGCCCACATGAAGTGCTTGCATGTGTCCCCCCTCGCATGCATGCGC TCTAACCTAGAGGCGAAGGTTCCGTACCCGTATAAGGGGGGAATCTCCCC GTTTAGGTGAAACCGGGTAGGATAGTGCCCCAACTTGTGAACCAACATGG TTTTACATCTCCCCGTTTAAGTGGGAATGGGCTGCCCACGGGGCCGCCAA CCCATCCCACCTCTTTTCGCTTAGTGGAGACCCATTAGTTAGAGGAGAAA ACATTAGGGATCCCACGGTTTCTCCACTACCGCCGCCGCGCCGCCAGGAG ATGGCCTCCATGGCGATGGAGTCTACCTCCATGCCGGGAGGAGCCACCCT GCCGTCCCCGCTTCCTTCCCCTGCTCACCCCCGCACGTCCCCTCGCACTA TTAGCCACACAGCCAACACCGCGCCGCCTGAGATCCCGCTCCGCCAGTCC ACTCCTCCCATCGGCAGCGGCATCACGTCCATGCTTAGGACCATAGAGCA AGGAGGGCAGGTGAACGGCGATTTGCAGGCAGGTCTTGTCCGTGTGAAGC TGGAGGCTGCCGCTGGCGATGTGCCTAGATCAGGGCCTTCCTCCAAGAAG AAGGGGAAAAAGGTAGCTCTCTCCCTTTTGCTTGATCTATTACTGGTCTA GATCTCGTGCCCTTTAGTTCATAGAATCCTATTGTTTTTATCTCTAATAG ATGTGATGTCGAAGATGCTGAGCATATAACGACCAGCCCACTGTATTTTT CTACATTGGTTTCTGGAAGAAGGTTCATACCAGCTCATCAAGAGATAGTC TAAAAAAGAATCGAGCGGTCTAGCAATGAGTCGATAGTTCTTGCCAGATC AATGTTCTTTATTTTGTATTTTGAACGAAGACTATACAAGATCATTGTTT TCTGTTTTATTGAACAGTGGTTTATACCAGATCATCTCCTGCTATTTGTT TTGAGCTGGTAGCCGAACTTGTCTTCTCCTGCTATATCTGGGTCTGGAAA ATCCTGACGCCGACTGCCTTTCTTCGTCTATCTTACGCGAGTGCAATTTT AGTAAAGATAACTACCAGTTTCAATAACTATATTATTATGCTACTTCTTC ATGAAAAGTATGCTTCTACTTATCTTACAATAGTTCATACTATTTACATG TATGTTATCCCCAGAAGTATGGTGAGGCATCATGTGGAAAAGTGCAACCT GCTGACGATGCACATGTTGAACAACAAATTACCAACGACACCCGTGTGGA GCAGCGAGACGGTAGTGAGGTCCCTATCTCTACAACTGTAGGAGGCAAAA GGTCACTATCTCATGCTAGTGAAAGCTCAAGAGCAAGAAAGGTTGCAAAA TCTATTAGTTCAAAAGTAAGTTTGTGTTTGTTCCTGTTACACTATATAAC AATATCTCATGATAATTTACAGAAGTTTGATTCTGCTTATACTGACCATA AGATGCTAATAATATAATCATTTTGTTCTATATGCAGGTTATCATGTCAA AATTGCAGAACCCCAAAACTGCGGGAAGAAAATTGCCTCCTATTGTTTCT AGGTCTCCTGTAATGAACATGTATGCAAGAAAAAAAGCACACTCACATGT AAGGTCCCCTAGTTCGCATGCAAGGTCTCCAATTCCTGCTGAAACTTTGA AGTCTCCAAATTTGCATGATCTTTCACCTACTCCTGTACACGGTAGTCCA ACTAATTCGCATGATCTATCACCTTGTGCTACTAATGGTAAGTTCTAACT TCTATCACATGCTCTCAAGTATGACCGCTAATACTTGAGAGCATGTGATA GGATAGTGCCCCAACTTGTGAACCAACATGGTTTTACATCTCCCCGTTTA AGTGGGAATGGGCTGCCCACGGGGCCGCCAACCCATCCCACCTCTTTTCG CTTAGTGGAGACCCATTAGTTAGAGGAGAAAACATTAGGGATCCCACGGT TTCTCCACTACCGCCGCCGCGCCGCCAGGAGATGGCCTCCATGGCGATGG AGTCTACCTCCATGCCGGGAGGAGCCACCCTGCCGTCCCCGCTTCCTTCC CCTGCTCACCCCCGCACGTCCCCTCGCACTATTATCCACACAGCCAACAC CGCGCCGCCTGAGATCCCGCTCCGCCAGTCCACTCCTCCCATCGGCAGCG GCATCACGTCCATGCTTAGGACCATAGAGCAAGGAGGGCAGGTGAACGGC GATTTGCAGGCAGGTCTTGTCCGTGTGAAGCTGGAGGCTGCCGCTGGCGA TGTGCCTAGATCAGGGCCTTCCTCCAAGAAGAAGGGGAAAAAGGTAGCTC TCTCCCTTTTGCTTGATCTATTACTGGTCTAGATCTCGTGCCCTTTAGTT CATAGAATCCTATTGTTTTTATCTCTAATAGATGTGATGTCGAAGATGCT GAGCATATAACGACCAGCCCACTGTATTTTTCTACATTGGTTTCTGGAAG AAGGTTCATACCAGCTCATCAAGAGATAGTCTAAAAAAGAATCGAGCGGT CTAGCAATGAGTCGATAGTTCTTGCCAGATCAATGTTCTTTATTTTGTAT TTTGAACGAAGACTATACAAGATCATTGTTTTCTGTTTTATTGAACAGTG GTTTATACCAGATCATCTCCTGCTATTTGTTTTGAGCTGGTAGCCGAACT TGTCTTCTCCTGCTATATCTGGGTCTGGAAAATCCTGACGCCGACTGCCT TTCTTCGTCTATCTTACGCGAGTGCAATTTTAGTAAATATAACTACCAGT TTCAATAACTATATTATTATGCTACTTCTTCATGAAAAGTATGCTTCTAC TTATCTTACAATAGTTCATACTATTTACATGTATGTTATCCCCAGAAGTA TGGTGAGGCATCATGTGGAAAAGTGCAACCTGCTGACGATGCACATGTTG AACAACAAATTACCAATGACACCCGTGTGGAGCAGCGAGACGGTAGTGAG GTCCCTATCTCTACAACTGTAGGAGGCAAAAGGTCACTATCTCATGCTAG TGAAAGCTCAAGAGCAAGAAAGGTTGCAAAATCTATTAGTTCAAAAGTAA GTTTGTGTTTGTTCCTGTTACACTATATAACAATATCTCATGATAATTTA CAGAAGTTTGATTCTGCTTATACTGACCATAAGATGCTAATAATATAATC ATTTTGTTCTATATGCAGGTTATCATGTCAAAATTGCAGAACCCCAAAAC TGCGGGAAGAAAATTGCCTCCTATTGTTTCTAGGTCTCCTGTAATGAACA TGTATGCAAGAAAAAAAGCACACTCACATGTAAGGTCCCCTAGTTCGCAT GCAAGGTCTCCAATTCCTGCTGAAACTTTGAAGTCTCCAAATTTGCATGA TCTTTCACCTACTCCTGTACACGGTAGTCCAACTAATTCGCATGATCTAT CACCTTGTGCTACTAATGGTAAGTTCTAACTTCTATCACATGCTCTCAAG TATGACCGCTAATACCACTATAGATGCCATAATTTGAAAACTTCCATACT TGTAGGGTCCAAACACAGACCACGGAAGTTAACCTCCATCGTTTGGAAAG AGGCTGAGCCAATATACATTGATGGATTTCTAATGCAAGGCCGATGCAAG TATTGCAACACTATTTTTCCAGCATCAAAGGTCTCCGGTAGCAGTCAACT TGCTAGACATTTGAAGGTATGTGAGGTCAAATGTTCAATGGATGGGGTGA TTCAGCAAATTAGAACCTCTGATGAAATAGACCCTGACTAGAAATTTGAC CAAGAAGCAGCAAGGCTTGAACTAGTTAAGTTAATTGTGTTGCATGGGTT GCCATTTTCGTTTGTCGAGTATGCTGGTTTTAGGAAATTCTGTGCATCGT TGAATCCCTGGTTCAAGTCAGTTAATAGAGTTACTATCCAAAATGATTGC ATGGAGGCTTACTATAGCTATAAATATAATTATGAAAGTTTCTTCATGAA TTGCAATCATAGAGTATCACTAACCGGAGATATGTGGACCTCTAATCAGA AACTAGGTTACCTATGCATTACATGTCATTGGATTGACAGTAATTGGAGA ATTAAGCATAGGATTATAAGGTTTTGCCTAGTTCAAACACCCCATGATGC TTGGAATATGTTTGATGTGATACTCAAGTGCCTTGGTGATTGGAACATTG AGGATAAAATCTTTAGCTTCACAATGGATAATGCAGAAGTTAACACCAAA ATGATTAGTCATCTTAGAAAAAACCTTGTTGATCGAGGCCTTATCCATCA TGAAGGGATACTCTTACACGTTCGCTGTGCATGTCATGTTCTAAACCTAA TAGTGCAAGATGGATTGAAAGTTAAAGAGATGAAGTCTGTTGTGGACAAT ACTAGAGAGAGCGTAAAATACATTAGGAGTTCCCAGGGCAGAAAAGAACA ATTTGCCAAGATGGTTGCACAGGCTGGAATAAAATGCAAACACCAACCTA CACCAGATGTCTCTTCAAGATGGAACTCAACATACCTTATGCTTGAGTCC ATATTGCCATTTCGGAAAGTATTTGACACCTTACAAGAACAAGAACCAAG TTATACATTTGGTCCTTCAGCCGATGAGTGGAAGATGGTTGAAGACATTT GTAAGCTTCTTAAAGTATTCTGTCATGCCACCAATGTCATTTCAGGATCA AACTACCCCACATCAAACCGGTATTTCTTTGAAATTTGGGGTGTGAAACT TATCCTAGATAAACAAGCAAAGAGTAGTAATCCTATAATCAAAATCATGG TGAAAGAAATGAAGAATAAGTTTCACAAGTACTTTATGGAGTCATACTTG ACAAACTGCATACCGGTGATACTCGATCCAAGATTTAAAATGGAACTGGT TGAGCTTCGATTGGAGACATATTTTGGAGTTGATGCGCCGAAGCATATCC AAGAAGTTCGGACAGCTATCAATGCCCTGTTTAGAGAGTATGCTACTGAA TTGGAAGTTGATGTCAATTTAGCATCACAAGAAGAAAGGAATGAAGAGGG AGTTTCTTTGGCGGATGACCTTTCAGACTGGGATGATCATGTCAAGCTTA AGAAAGCAAGAAGCCGCAATGAGCTGCAGCGATACCTAGAGGATGACTTC CATCCTCGTACAATAGAATTTGACATTCTTAAGTGGTGGGATGTGAATTC TGCAAGGTACCCAACGCTTGGCAGAATTGCCCGTGATGTGTTGGCTATTC CGGCATCGTCAGTTGCCTCTGAATCTGCATTTAGCACATGTGGTAGAGTT ATTACAGACCACAGGAGTAGCCTAGCACCTGAAACGGTTGAGGCTTTGAT GTGCTATGGAGACTGGATTAAACCTGACAGTAAGTACCTATTTGATCTTG TAGTTGTTGCATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.