Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA022643

[Submit comment/correction]

Sequence	AA022643
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA022643
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGAGATCTATCTCTCTCACTTCGCCTCCGGAAAAAAAGAGCGACGTAG TAGATCTCTGCGCGCGCGTTCGTCTAGAAACGAGTTTTTTTTAATGAATC TGGTCAAATTCGAAGCAGTTTTGTGCAAACACTCCATCGTCTCTCTCCGC GGCTCTCCCACGCGATAGACATTCCATTTCCCCTCTGCTCCGCCACTCCG GCCTCCCCCACCTACCCTTCCCAGCAGCGCCAGCAAACCCCCCGACCGAT GGACGCACCCGGGCGCCGCCTCCGCGCTGTCTCCGCTCACCTCCAGCCGC CCGCAACCGCCGCCCGCCGCAGCTCCGACAGCATAGCCGCCAATCCCACC GCCGGGGAGTACGCCCACGGTACGCACGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTTTCTCTTTTCTCCCCTGCTTGCCGT GCCCGCGCACGGCACTGCCGCAGTACCCCCCAGGCGAGCAAGCAGGGGAG CACGTTGCACGCCCCAATTTTGGACCCTTCCCCGCATCTAGCTAGTTTTT TTTTTTTGCATTCACGAGAGGCGACAAGGGGTTTTGCCTGCTATTTGTTC CAAAAATAGCTTAGCGAGAACAAACTATAATCAAAAACTCACGGCACATA GTCTCTCCAGTGCTAGGCTACAGCGCCGTCCTCCCTGAGAAGCTGAAGAC TGGGAAGTGGAACGTGTACCGGTATGCTATCGAGATATAATGTTATGATG ATGATGCATTTTGCTTGTACCGTGGCTCGTAATTTCTCGCCTCATCCTTT TGCAGATCTGCACTGTCACCCATAAGCCTGGTAAATAGGTTTCCAGACAA TCCGGACATTGGGACGCTGCATGATAATTTCGTGTAAGAGTCCTCACCAA TATCTCTTGATCACAAGCTTGGTCAAACACTTCTGCTGTTTGTAAAAGAA TGAAATAAATAAAATGAATGGGCGGCTACGACGAACTAGCCGACCGGTTA AACAAAGCAGGAGTAGGATTTCTATCCAGGCAGGCTAGCTCAGCACCCAT TGTGCTACCCGGTAGAACTGTGGCCGTTATTTACTTCAGTTATTTATCAC TACAGTTGATGTATTTTCATGCGCTTCGTAGAAAATGGTCTTACAGTGAC ACCTGGCGACATAGAGCTCACACAAAGCATACAACCCAGAAGTGCCATCG AAGTTATTCTCATGCGCTTGTTTTGTAATGAGTAGCAAATCTATGAGTTT GGCACAACCAATGCAAGTTGAAACTCTCTTTTTCCTTGCTTTCCGAATTT CGTTGCCAGGAGGGAATCCTGCCAAGACCTAATAGTCTAGTTTTATGAAA CAACTGCTGCTGTACAAATCAAGATCTGTAAAGTAACTTGAACGTAACAC AGAAGCTTTCATCTGATGGTTTTGTTTAGCACTGGCAAGTTAAAGACTTG ATGCAGCCTAAGTGTTTGATAAGAAAATAAATATTCACAGAATGAGAAGA TATTTTTAGCCGTACATGTTTCTGCAAACGTTGGGAAGCTGAGATGGTTG GCTAAACTGACTTTCAGTAGGGATAATCCGTGTCATCATCATCATCATCA AAGCCTTTGTCCCAAGCAAGTTGGGGTGGCTAGATATGAAACCCAACAGA AACGTATGGAAACCAAAAAGAGAAAGAGAGAAAGGGATAATCAGTGTGCT ATGCCAAAAATTTATACACGGATAGCTAGACCAACAACTATTCCTAATTT TTCTATATGGTCGTATTCAATATCATTCCAGTCATAGTACTGTAACAATC TCCTAATTCTAGTGTCCTTGGTATATCTAATTGAACAGGTATGCAGTTGA GACTTTCAGAGATAATCGATACCTAGGTACAAGAGTCCATGCAGATGGAA CAGTTGGAGAGTAAGGATTTATTTTCTGATGTATGCCTTAGGGTTGCCTC TTGTAGTGTTGTCTATCTTAACCTTGAGTGACAAATAACACTGCAGCTAC AAATGGATGACATATGGAGAAGCTGGTACAAGCAGGACTGCAATAGGTTC TGGTCTTATCTGTCATGGAATACCTGAGGTGAGTCATCAGGGTCTGAAAA AAAGGCACTTGTCCTTTTCTTTCTGTTCATCCATAAACTGATAAATCTCT AGATATTTCTTTATTGAAATGACACTTACATTGAGTATTCTTTTGATCTG ATTCAGGGCGCACGTGTTGGTCTGTACTTTATAAACAGACCTGAGTGGAT CATAGTTGACAATGCTTGTTCTGCATATTCATATGTTTCTGTGCCACTTT ATGATACTCTTGGTATGTCTACGGTGCAGAATGATCATCGTTCTCTCTCT AACCATTACTGACTGATTTTATCTGACATTATGTAGGTCCAGATGCAGTT CAGTTCATTGTGAACCATGCAACAGTAGAAGCTATTTTCTGTGTTCCTCA AACTCTAAGCACTGTGAGTTTCAATTGCTTATCCCAACCTAGAAAATTCC TAGTCTATACAATACATTAAAATAGCACTGAAAGGAGAGCACTGAGTAAC CTGTAACATTACCATGTAATTGTCATATTGGTAGAAAGTGAGCCTAGCTC ACTTGAGGGAGTAGATGTACAGTCCCACCACCTTGGTTCAAGGCATTATG GAAACTGGAGAGGCTTCCCTTACAGTTTCCTTCGATCTTTTATCATACTG GTCCTTTTTCCATTGGAAGGAGAACAACAAGACGGCACAGATTATAACTG AAGCAGAGACGAAAAAAATAAAGGCATAAAGAGAAGAAAGATCCAAGTAC AAGATAAACCAGCTAAACTGAGCTAACTACCAAAAAGACAGGTAGGACGG CAAAAACTCCCCTCCCTGGATCAGGCCACCACCACCACGTCTGGAGGCCT AGCATGCAGTCATAGCAGGCGAAGCGCCTTAGCAGGAGCTAGCTAGTAGG GTTTGCAACTGGCCAGCAATCTCCTGGCAAGAAAATTGAGTCTTGCTTGT AGTGTTGATGTCATCCTAATCAGGTCTTTATTTATAGGCTTATAGCTCTA ATGACTCTTAGTAGTCAAATGCTGTTAGTTCTGGACCATATCCACATACA CAGCATTGATGTGGTGGGTATAGGGGTCGGTCTTGCAATTGATTTGGCAT GGGCTTTGATTCTAATTTAATTCTGGTATATTATATAAGATGAATCATTG TAGACAACATCTTGTATTCGACTTTACGTTGCACCATGAGATATATCTGA TAAGGTCATATGAATCGAAACTTATTTTTCTTATATTTGTCTGCTCATTT CAGCTTCTAAGCTTTATAACTCAAATGCCTTGTGTTCGCCTTATAGTGGT AAGTATAGATCATTTATAGTTAAGATATGTAATTTGGGAAACTCACGATT GTTAAAAATCTCTGTTCTTATTATTGTGCCCTTTTTGTATAGGTAGTTGG TGGAATTGATGAGAATTTGCCATCTTCATCCGCAACTGCTGGAATGGAAA TCATAACCTACTCCAAACTACACAGCCAGGTGGGCTTTCTGAATAATCAT TTGAATTTTCCTGTACAAACCTTTGTCCTTGGATGTGATGATGCGTTCTT AACACTATACAGGTCACTTTTCATGAAATGTTGTAAGTCAACATGATACT ATTTAAACTAGTTGGTAAATCATTTTATATGTCTGTGGCCTTAATACATA TTAATGTTATAGGCATTAGTGCTGACATCAATCTGGAATTGTCTAAGTTG ACTTTTGTTTGGAATCACTTCACAAATAGGTGCAAAACTTATACAATGTC TAACTAATGATTATGTTAGGATATGCAATTATTATGCACTTAGGTTGCTT TTATGCATTTGAGATTTTTGACTGGTACCTTATTAAACCTTGCAATTAGC ACATGATATGTGATATTGTGTTGGCCTCAACCATAATGTGCAATTTATAT CCCGAGTAAACTCGCGTAACATAATATGTAAGTGTGTGCAAACTGCAAAC ACATTGACTCTTACTTACATTTTGTATGTAGTACACATGGCTGCATGAGT GTATAGTACAATCTTGCATGACTACAAATTGTGGTGGGTATGTATATTAA TTCCACTGCGGACAGAGTTATATGTCTATGGCAAGTGGTAACTGTAAGAT GCATTATTCTTTTAAACATTCATGGATGTTATCTGTGCATGCTGGACTTG TTAACTTCATTTAAGTGTGAAATGCGAAATGCGAAACCTATGTGTAAAAA ATATCCATACATTATCTTTAGTTGCTTCGATTTTTGAATAAAGGGTATCA CCTCTTCTAATTTTCTGTTCATCTCTATCACTGTGCCCCATTTTTATTTT TGTGAAACTTCTTTTATTTTTGTTACTCAGGGACTTATGAGTCCCCAACC CTTTCGGCCTCCAAAACCTGAAGATGCTGCCACTATCTGCTATACTAGTG GAACTACTGGCACACCAAAGGTAAGCATTCATTCCTCTGATTATTTGGTG CTCCATGTTTGGGACTCTTGTACCTTTATCTTTCAGATCTGTAAAGCTGG TGGTCAATCTTTTTTCTCAGGGAGCTGTTCTTTCTCATGCGAATTTCATT GCAAATGTAGCAGGATCAGACTTTGGAATTAAGTTTTACCCCTCGGATGT GTGAGATTTTCAATTTCATTTATAACTGTTGCTTTCCTATATAGCTTTCA ATTTACACCAATTCATTTTTGACAATACTACTCGTCACTCAGGTACATCT CATATCTACCTTTGGCACACATCTACGAGAGAACTAACCAAATATGGCTG CTTAATCGCGGTGTTGCCATTGGATTCTACCAAGGGGTATGCAGATCTGG AATACTTAGGATAATATGTTTATGAATTGCTTTGTATAATCATTTGAATA ACTGCATAACATGTAGAAAAATTATGATAGTTCTTCTATAAGTCATTGCC AGATTTATGATAGGATTGGATCATCCAGTTTAATGTTTCACATTTGAGTA GTTTCTAGTTTTGATAGTTTATTATGCCAAACTTCTTGGTCATTCAATTA TTAACTGAAGACCATCAATTAATCCTAAGGAGGATCATTTGTCTTCAATA TAATACTGTAGTTGTACCTTGAATGCTGGCTGCTACATCACCATCTCCAT GTTGAAAAAGATTCTTATTTCAAACCGTTACCCAGTGCCGATCTCCCTTG TCTGCACCAATCAACTGAAACCACGTGGGCCAGTCTGTAAGGCGTGAGGA TTTTTGTTGGAGTTACAGATGTAATAATCTTATTACCTTTAAACATGCTT ATGAGTAATTTTCATTAATTCCAGGATAGTTTGAAGTTGATGGATGATCT TGCTACTCTGAGACCAACAATATTCGCAAGTGTTCCCCGGTTATATAACA GAATTTATGCTGCGTAATACAACTGTACCAGTAACTTCCTTTTTTGTTTT TTCCCTCTTTGGTATCATAGTGATAGTACCCTCACATATTTTTCTGGCTT ATTTATGTAGAATCACAAATGCTGTGAAGGAGTCCGGTGGGTTGAAAGAA CGATTATTTAATGCTGCATATAATGCCAAGAGGCAAGCTATTATTAATGG TAAGGAACTGGTTACAAAAAAATTTGGTCCTCGCATCTATAAAGCTTAAA CGTGCCCCCTTCAATCATCCATTATCAGGTTAGACTTTAGTTAACCGATC ATCAGGGAGTTTGCTGATAACCCCCTACCAAATACCTGTGTCAGTGGTCA TTTTCAGCATCAAGTCACACTAAAGTCAGTAATTCAGGATTTCTACTCTC TCTGTCAAAATTAACTTCCAGATGACACAGCTGTAATGATTATGTGATTG TTAAAATAAATTTGTCATGTAGAAACATGGAAGGTGCTGCCATCCATTTG GACTCTGATGTACAAATGTTCTCCATGTAGGTTGGCTTTTATAAGAATTT CAAAGTTTCCTAACATACATGACATATTATTAACTTTATTAACTGATACA CGGAAGTTTGAGCTAGTAATCCTCTTGGGTTAGTCTACTTCTTTGGTTAC AATATCTGAATTAGCAAAGATGTTTTTACTGTACAGGAAGATGCATTTTC TCATCTACATGACAGCATTTAATCAAATTTTCTTATCACAAAATGAATGA ATATTTTACTCTTTGATGTCATCAGGAAGGAATCCATCCCCGGTGTGGGA TAAGCTGGTATTTAACAAAATAAAAGCTAGGCTCGGTGGCCGAGTAAGAC TTATGTCTTCAGGTGCTTCTCCATTGTCACCAGACGTAATGGAATTCCTG AGAATGTAAGCTAACTTCCTCTGCCCTCCTTTAGTTCTGCATGATGATTA TTTAGAACCTGGCTTTCTTAATCATAAAACTTGCTTCTATAGATGCTTTG GTGGTGAAATTCTTGAAGGCTATGGAATGACAGAAACATCTTGTGTCATT ACTACAATGAATGTTGGTGATAAATTAATTGGTCATGTTGGATCTCCAAA TCCTGCTTGTGGTAAGCTCCATTTTGCAGGGACAGAATCAGATATGCTCG GCTAAACCTTATACTGATCCTAATTGCTCAGAGATCAGCTTAATGTTATA ATAGTAAACAGAGAAGCCACCCTGAAGTAATGACACATTAACATGGATTT GATTATTTGGGATGCCTCTTCCCTTAGTTATTAATATTGAATGATGGTTG TATTTTGAAATCTGGGTTACTAAAAATAGCTCCGTATCATCTTCTATTTT ATAGTTTATGGTCCACATTTGTTTTGGAGTTAATTTTAAGTTCTTCAATT TGTTTGGTTCTGCCATTAAGCAAGACACATGCAAGCTGACTGGATGATGT TCTTTGGGAATAAAATTAGTTTAACTGTTTTCAAAGATGTCAATATTCTT ACTCTTCTGTAACAAATGAAGCTATGTTCAATCTTTGTTTCGTAATATTT CACTGTACCTCACATGCTTTGATGATGCAAATCATGTTTTCATTTTCAGA GGTTAAACTTGTGGATGTCCCTGAAATGAACTACACATCTGAGGATCAAC CACATCCCCGTGGAGAAATTTGTGTTCGGGGACCTATAATATTCCACGGT TACTATAAAGATGAAGTTCAAACGTAACTTGATATCCTCTCACTTCTATT TTTTGCGTTTTTAAGTAAGATTTGATAAATGCATCATGTAGCTTGTCAAT TCATATGTAACTACTGTGTTCTGTAAAATGCAGAAGAGAGGTCATCGATG CGGATGGCTGGCTTCATACTGGGGACATAGGTTTGTGGCTGCCTGGAGGG CGCCTAAAGATTATAGATAGGTAAAACTGAAAGATACACTCCATATTCCG TGATGCTTTTCTTTTGTAACCAAGATGACAATGTCTGCTCTGTGCTTTCT ATTTGGAGTGCTATATCTGTTGCATCTTACCTGTCTGTTCCTTCGGTATT CCACATAATACCAACCAAAATTATCACAGAAGTATACATAGTTTTGTAAA AGCTGGAATGGAATGTATCCACTATCTAGCAAACTTTCAACTTTACTTGC ACAATACATGGTGAAAAAGGAACCAGTGCATTTCATTTGATATATATTGC TCCTGGACTCGGTTTGGTCTTTATAGTTCTCTGGCTTCTCTTCCTAATTT ACTGGAGTAATTTTTATATGTCCCTTCCTCAAGGAAAAAGAACATTTTCA AGTTAGCTCAAGGAGAATACATAGCTCCAGAGAAGATCGAGAATGTTTAT GCCAAGTGCAAGTTCATTGCCCAGTGCTTTGTATATGGTAATATCATGAT TTTCTATTTTCTGTAACTATCAATATTGGCCATGCATATTTTAATATGTT GGTTTTGATGCAGGTGATAGCTTTAATTCTTCTCTAGTTGCCGTTGTAGC AGTCGAGCCAGAGGTGTTGAAGGCTTGGGCTGCATCAGAAGGAATCCATG TAATATTCTTTTGATCGTTGCATGCATCATTTTCTCTTCATCTCTTGAAA ACACATAATAAGATGAACCCTAACTAGAAAATACCGATAACAGGGAAATG TAAAGCAAAAATCACCAGCAGCACCCAAGCATCAGTGCACCCATTTTTCA CAAAAAATGAAAAACATATTTCCCGGACTCCAAAAAAAGTCTGAAAACAA GAATACGCATACATATACACATTCCGAAGGTACCCCAGAAGTTTCGGGAA AATACGCTGCATTTTGGGCTACACAAAAAGTCAATTTTTGGACAAAAATA AGTTTTTAATTCCCTATATACAGCCTCAATTTTTTTCTGTAGCTCAAAAT ACAATGCAATTTCTACCGAAACTTCAGAAAAGTATCTAGGCATGTTCAAG TATTCACTGATTTTTTTTGATATTTTGAAACTCAAAAATACAGTTTTAAT TTTTTTCAAAAACCAGGCACACTGGTGCCCGGGTGCTGCAAATCTGCACT CAATGTAAACCGTCTATATGTTTTTTCCCTCGTATGTTCTGTTAGGCAAA CCGATTAGTTATTATTCGGTTATATCCTTCCATATATAGCGCGTGTATCT TTGCATATAACTCAGGCCATTATGGTTAGGATTGTTAGGGATTGCTTCCG TGTATACTTGTGTAATCAGCCTATAAATACAAGATACCGAAGACCCACGA TTGTGTGGTCAATTCTCCCAATTCCTCTTTCTATCATGGTATTAGATACA CGTTCCGCTCTCTACTACCGCCGCCGCGCTTGGGTTCCCTCCTTCAGCCG CCGCACCCCCTCCTCCACCACTTCCTTGGTCTCGCTGTCCGCCGCGACTC CACCGGGATGTTCCTCTCTCAGACGTAGTATGCTCTCGAGATTCTCGAGC GTGCTGGCATGAGCTCTTGTCACCCCGCCTCGACGCCCGTGGATACATCA CCTAAGCTGGCTGCTGCGGCCGGGGTCCACCCGTCGCTGATCCTTCCACG TATCGGAGTTTGGCTGGTGATCTTCAGTACTTGACCTTCACTTGCCCGGA CATCGCCTACGCCGTACAGCAGATCTGCCTTCACATGCATCCCTGTGACC AGCATTTGACCTTGGTCAAATGAGTTCTGCGCTACGTCAAGGGCACCCTG CATCATGGTCTTCAGTTCACTGCCTCGACCACGGATCGCCTTGTCGCTTA CACTGATGCCGACTGGGCTGGATGTCCTGACACTCGACGCTCGACATCCG GCTACTGCGTGTTCCTCGGCGACAACCTCGTCTCATGGTCCTCTAAGCGA CAACACACCGTCTCCCGCTCCAGCGCTGAAGTGGAGTACCGAGCCATCGC CAACGCCGTCGCTGAAGCTAGTTGGCTTCGCCAACTTCTTCAGGAGCTAC ACCGACCGCTTGCCACTGCCACGGTTGTCTTCTGTGACAACGTCAGTGCA GTCTACATGTCCACGAACCCCGTGCAGTATCAGCGTATCAAACACATTGA GATCGATCTTCACTTCGTTCGTGATCATATTGCGCTTGGGCACATTCGAG TTCTTCATGTGCCTTCTTCTCGGCAGTTCGCGGACATCTTCACCAAAGGC CTACCATTGCCACTGTTCTTGGATTTTCGGTCTAGTCTCAGCGGGGGGAT GTTAGGCAAACCGAATAGTTATTATTCGGTTATATCCTTCCATATATAGC GCCTGTATCTTTGCATATAACTCAGGACATTATGGTTAGGATTGTTAGAG ATTGCTTCTGTGTATACTTGTGTAATCAGCCTATAAATACAAGATACTGA AGACCCACGATTGTGTGGTCAATTCTCCCAATCCTCTTTCTATCATGTTC GAATCATGAATTCCGTAATGGTGAAAATTATGTCTAATCCAGAAAATACT GAATTCTATTTAGAACTACAAATAAGATTAAATACTCCCTCTGTCCAAGA ATAGATGTCTTAGGTATTTCAAATCTTGAATGAATCCATATACTAAATAG TGTCTAGATTCATCCACATTTTGACAAATTTGATACATCTATTTTAGGAC AGAGGGAGTATTTGCATTGCATGTTTATGCTCTAATCCATCCGTGCTAAC CTGTAGTCTGAGGACTTAAGACAACTCTGTGCTGATCCTAGAGCAAGGGC TGCTGTGCTGGCTGACATGGATTCTATTGGGAACGAAGCACAGGTTTATC TCTTAACTGCTGATGTTGCATGCTCTCTCTACTAGTAAAATTCTCTACCG TGTATGTGATCGAATGATTCCTAATGATACTTTTATGTTTATTGTTGTAC CAGCTAAGAGGTTTTGAGTTTGTCAAAGCTATTGCTCTCGTGGCTGAACC ATTCACACTAGAAAATGGTCTCCTCACCCCAACATTCAAGGTAGGCCCGT TGATTCGGTTAGAGGGGATTGCAATACAGGACCCCTGAGACTTCATTTGC ATAATTTTGTAGGTCAAAAGACCGCAAGCAAAGGTGTATTTTGCAAAAGA AATCAAAGATATGTATGAAGAACTCCGTGATGCACAGTCAGTCAGGTCCA AGTTGTAATTAGTCAAGTAATGATCAAATACGCTGTTAATCAAGGTAGGA GATTACACTTCACAATCATTCACTCCATATCATGAAATAAGTGGTTGCCT TCTACTTACACATCAAGCAATTGAAGACATCCTCCCACGTGCAGGAACAA AAACTTAATCTTTTTCCAATCAAAGAGCCTGAGGCAGTGCTTTGTGCAGT TAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.