Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA019127

[Submit comment/correction]

Sequence
AA019127
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019127
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGAGTAGTACTGGAGGAGGAGAAAAAAAAGCGACAGAGGGGAGACATGT
CGACCGGTGGTGCAGAGGCTGCTGCGGCGGCGGAGGCGATGGCGTCGGAG
GCGTATCTGGCGGGCGAGCCCGTGAGGGAGGCGCGGGAGCTGGTGGCGGA
GCTCTGCCGGCACTTCTACCTGCAGGGGTGGGTCACCGGCACCGGCGGCA
GCATCACCGTCAAGGCCAACGACCCCGCCGTGCCCCTCGCGCAGCAGCTC
ATCGTCATGTCCCCGTCCGGTAGCTAACTCCCCTGCTCTCCCTCTTCCGT
TCCCTGCTTGCATCCGTTATAGCTTGGCCTGACGGTGAACGAGCCCCACC
TGTTCGATGAATTGTTAAACTGGGTTGCGAGTTCCCATTCGCCGAAGGAA
TTTATGAGTATGCGATCATTCAACTGATGTGCTTTCTTGTTTTCACTGAC
ATGGGGTTTGCATATGCTCACTTGAAACACAAAATTTCTTTGGTGGATTT
CTCCCGATTAGCTGTTCAAGCTGCATATCGGAAGTTCAATTGATTTTATA
TTTCTATCGTCCTTGACATGCTTAGAGTAGTCGTAACATACAACGGTATT
ATTGTGTTATAACTTGAGTTGGCCATAGAAATGATATGTAGTATTGTAGT
TCTAGAAGAAGCATGATTTTGTACCGGATAATCTGCTTGTACTGAGCCTG
ACACTGGAGGTTAATTTGTTGAGCTAAGAAATATAAGTGACAAGCTGACA
GCATGAGTTTTTTATCGGGTTTAGGGGTGCAGAAGGAGAGGATGGTGGCA
GATGACATGTACGTGATGTCAGCAGATGGCAAGGTTCTATCTGCACCAGT
AGCAAAGCCATGGCCACACAAGCATCCAAAGTGTTCAGATTGTGCACCTC
TGTTCATGAAGGTTGTTAGGTTTTACTTTGTTTTATTTGCTCTGTTGTTT
CAGATTCCTTTACATGTTGTCTAATTTCCTTGATGTTTTGCAGTCTTATC
TAATGCGAGGAGCTGGGGCTGTGATTCATAGCCATGGCATGGAGACTTGC
ATGGCAACAATGCTTGTTCCTGGTGCAAAGGAGTTCAGGGTGAGTCCTAG
TATTTTTGTACATTTCCCATGAAATATAGCTAATGCATAAAGCCTCCTTT
GTGTTTCCAATATGATGTCCTGCTGCTCTGTGCAATGATTCAAGAAAATG
GACTTTGTTTTTGCCCCACATTTCTTTCGAGTCATGCAGAACATAACACC
CAAAAAATCATGAACACTAGCACATGGTGCATAAATTTTATAGATTTGCT
CTAACAGCGACATACAGATTTGCATCCGCTGTTTGGATCAGTGATCCAGA
CTGTGATGTATACAGATCCTCTAAAGTTGTCCATGCCGGGAAGTCAAACA
TTTTGAAATGTTTATGGTTGGTACATTGATTGGAAACACTTATGGTGGAG
TGTGTGATATGCTTTGTCATATATATAGAATGCGGATGGTACATGCAACA
CAATATTTTATATGATTTTGAGCTCCAATATATGTTCCTTGAAAGTTAAT
TAGGAGTAATAAAGAATAGGGGCGACATGCTATCATGTCTTAATTTTATA
CATATGTAGTACCATACATGTTGCATGGTGCTATATCAAGTTATTAACCC
CACACCCATTGTATCGGTCTTGATGTTCACAACTGTATCCGAGTAAAACT
TAAATGACAGAGTTACCAAATACCAGTGACATGTGCGCTACTGATAGGTA
ACTGTAACACAAATAACACTGAATTTTCCAAACTTTATCCGTGTGTGGCC
ACGGTTTACAGCTCACATTGGTAGTTAATCCTGTTTTAGCATATCTTTCA
GCTAATTAAGTCCATCTCTATCTTCTACTAAATCAATTGCTGTGTGGGTA
TTCCTTATGTGACCATATACTGCTCTGCTGCTGATCTTACTGCAGATGAC
ACATATGGAAATGATTAAAGGAATCAAAGGTCATGGCTACAGAGATGAAT
TGGTGATTCCCATAATTGAGAATACTCCTTTTGAGTATGAACTCACAGAT
TCTTTGGCTGAGGCGGTATGGTACTAGTGTCCTTTGTTTCAAGATTCCAT
AATTCAGTTTTTAAGCAATCCAGTCTAAAGGTTCAAATACATGCTTCAGT
TATATGTAGTTTTATTTCTCATGCATTTATACTGATAGAAATTAGATGAT
TCCAGCAATGAGATTAGGCAACTTGTAGGCAGCAAAATAATGAGTAGCAC
CATCTCATTCATCTGATCATTTAGTCTTTACCTATAATCAGTAGCACCAC
CTCATTCCTTTGTATTATGGAGAGTTTGAGAAACTACCAAAGAATATTTT
GTTACAACGATGTTAGATTATGAACAATATTTTGGTTGGATCTAGCAGTA
CCTGACACGGAGTTATTGCAGATCAAAGCATACCCGAAGGCAACTGCTGT
GCTTGTACGGAACCATGGAATTTATGTTTGGGGTGACTCCTGGATCAATG
CCAAGACACAGGTATTTTTTATTTCCATGACCTAGGTTCTTGCATCAGTT
TTCAGGTTGGGGTTCTTATTGCTGTCTAACGTTCTTCTCATCTCCTCTCA
CAGTCATTGTCTCTTCATTTTATCTTATCAGTTAATTTGATAGAAATTCT
TAGATCTATCTCCAGATGCTACCTCCTCTTTTAGTTTTAATGGTCATTTG
CAATTTGCATCCAAATTTTCTGAAATTTAATAAACAGTATGTTTTATCCA
ATCTAGGTTTTAATTTTTTGTGTGGGTAATCTAGTCTGTACATATGAAAG
CTATATTAGTAGAGGGATAGTTTAGCCTTCTATTTAACGAGAGTTTGTGA
CATAGGTTAAGTGGGCTCTGTTGAGGAATAATTCTTATGGTTCCTGGAAT
TTATGCAAGGGCAGATATTCACTAAATTGCTATGGCCTTGCTTTTCAGGC
TGAATGCTATCATTATCTTCTTGATGCTGCCATCAAGATGTATCAGTTAG
GGATTGACTGGACGACTCCTGAGCATGGTCCAATAAACAGTGCCAAAAGA
TTGCGTAGTGTTATAAGTCCTGGCGTTCCTAATGGATGTCATGCAGCCAA
ATCATCAAAGGTCAGTTCCTTGTTCCTAGTGATTTGTGAATTCAACAGCC
TTTATAGTACTTGTAGATTAATATCATTGGCAACTTCTGTTATAACATCA
TGTTTTCTCTAAGTTATTTTTTCATTTGCAAGGATGTTACTTAGTGCAAA
AGTAGTCCCATTTATTTTATTGAATTAATTCAAAATGTTTGAGTTAAATT
TGGATTATGTAATTTGATCTCAGTCCTATTGAAATAATGCCTTGGAGATA
TTGAGTTGGGTTCTGCGTAGTACTTTTGGCTTGTGTGAATTTTGTTAAAG
TTTTAGGAGTTCAGTTCGTATTTTTCTCAACCATTGGCATTTTGATCTTC
TTTAGCCCACCATCACTCAAGCAACTAGCCTAGCCATCTTCTTGCCCAAG
CTTCAGCTCGTCTGTAATTCTCTTTATCTGACATGCACCTGTAGCATCTG
TGTCAGATTTCTTCAACTTCCAGCAAACACACATATCAGCATTAAACTGT
TGCATTTCCTCCGTTGGTTCACCACCCACTCCCTTCTCTCTCAATTTCCA
GTGGAGAATTAATCGCTATCACCTGAGATACTCATCCCTTGCTGTCCCAT
CCGATTTCCTTGTTTATTATCTACCAAAAAACAGTTACCATTAATGGGTT
CGCTCTCAGTTTGTATTAGTACTTGGATCCCAGTTGGAGGTGTCGCTGTA
ATGGTTTTATGTTGTGGCGATATTCCAGCAATCTGGAGAGGAAGGCGGTG
ATGGAATTGCCCTTGTGATGGTGTTGTGAGGAGAGTGACACGGTCTAGCG
TCCTAGAACACCCGTTGTGGTTGTGGTGAGCCAAGCTGTTTGTGATGCCT
TAGTAGGCGTGCGACCTAAGAGTCTTGTAGATTTTGTGGATAAGAGCACC
ATGTAGATAGGTTGTTGAGAAGCTGATAGTGGAAGGAGTTGGACTCAAAG
CTACTTGTGGAGCAGGCGGTCCAGTGAATTATGCGGCAGCCGCAGGGAAA
GCAGCATCAGTGCAAACTCTTTTGTGGGCATCGTATTGGCTTCATATAGA
GAAACAGAGAGGAGAGGTGTGTTAACTGATTGCTTTCCTTGTATTGACTT
CATATAGAGCAAGGATGGAGATCAAGAGATGGCATGGGTCATGTGCGCTA
ATGGTTGCCGTTTCTGGTTAAGATTAAACAAGGAAAAAATATGAGATAAA
AGGGGTGAGTGGCTGGTGATAGGGATTTAATTTGCACTTGAAATAGAAGA
GAGTGGGAAGTGGGAACATGAACCTATGGAGGATCCGTTGCAATTTCCTG
ATGCTGTGCTACTCCATGTGTTTAAAAAACGTGGCACAGGGGCAACTTGC
AAGTGAGAGAAAGGGAATTAGAGATTGGGCTGCAATTTGCTATCACTCCT
ATGAGATGGCTAGCTCCCAACTCCCGATACATTCTTTAGAGTCGACTAAA
GGACTCAGGGCTACAAGATGAGGGGGCGTTGGTTGCTTTGGTGGTGGGCT
GAAGGAAAATAGAATGGACCAAGGAGGTGGGTTCCAGCCTAGCCCAGTCG
ATTTATGAGAAATGAAAATAGTTTTCAGAATTATCCCCAACGCATATCTC
TATCGATATTTTTCCAATATATGGACTTAACACAAATCACATAGCTTATT
AATTCAAACACGTTGCATGAAACACATGTGACAGCTTCTGCACCAAGTCA
CATACTTGCAACTGAAGTTTTTCGTAGAACCCTCTGAGAAAGTAGAATGT
TACAGCGGATATTATTGCTTGTGTGTTTTCTTAGCTGGTTTAAGTTTGCT
ATATCTGGGCAACTTAACCATCGACTTAGTTGTTGAATGCCAGTACTCAC
ACTTTTTTGTCATTGCAGCATTGTGTTGTACTTGACATCGAAGGAACAAC
AACTCCAATATCATTTGTGACTGATGTTATGTTTCCTTATGCCCGTGATA
ATGTGCGGAAGCATCTGATTTCTACGTATGATTCTGAAGAAACCAAAGAA
GACATGAAACTGTTGCGTATCCAAGTAAGTTATAGTAAAGGAATTTTAGT
GTCCTGTGAAGCTAGATCTTGAAGCATCTAAAAATCAAAATTAATCATAC
TAGTATATTATATTTGACTGCTCTTGCACAAATTACTTTTTTTTATTCAA
GTTCAACAGACTATTGACCAATTATGCAGGTTGAAGAAGACCTGAGAAAT
GGAGTTGTTGGGGCTGTTCCAGTTGCACCCAGTGATGCTGACAAAGAAGA
GGTTATCGGTTCGTTAGTCGCTAATGTCGAGTCCATGATCAAAGCAGACC
GTAAGATTACATCACTGAAACAACTTCAGGTACCTTTCATATTCCTTCCC
AAAGCTGGAACCATATATCTTTTTGTTTGATGGAGGTCTGTTCTAATGGC
TAATTCCAGGGTCATATATGGAGGACTGGATTTGAAAGCAAAGAACTGCA
AGGAGTTGTTTTTGAGGATGTTCCCGAGGCACTGAAGGACTGGCAATCTC
ACGGTGTGATGGTAAATATTTGGTCTAACTCTTCTGAAGAAATAAAATTT
AGACTTTTGAGGCATAAATTTGGATTGTCAATCGGATCTTTTTAGTGTTC
ATACTTTGTAACTGAGTTATTTAGGTCAGAGAGTTGACTCCTGAGCTAGT
GTTGTGACAATACCCATTACAGAACTCGTAAATCACTCTGTTGTGTACTA
GGGTTGCAGGGAGGTAGGGGAAATGCTGTACTCGCAGGAGCAAGATAGAA
GTATTCTTCTAGTTCTTGCTTTTTTGTTTCTCATAGGGAGCCCTCTTTAT
ATAGAGGACTAACAATCATATCTAAGTAACAAAACATAGATTTTATTTGT
AATTGGCGTACGGCCCAAGCTAAAAGATATCTTCGTAATTTAAAGGATAG
AATTCCTAATTGAAAAAATCATAGGGATTTCTCCCTAACTTGCTGCTGGG
TGGGCTATGTACTATACGCACACAACTCATTCACAGAAAAATAGTTTACT
TTGGTACCGTGCTCAACCATTGCGATGATCATAAAAAATCAGTTGCTTTT
CTGTTTGTCTGTTCTACTTTCATATGCAGGACTGATGCATGTAAGCATCA
TGTATTTAAATAAAGCAGAACGATTCTACAGTCTTAAATAAACTGAGAAA
AAAATATTGGCTGGAGTAAAACATGTAGATAACCACAGGAAAATGGTTTC
TGATAGAACAAAAGGATGCTAAACATTCATTGCATTAACTGAACACGGTT
GATGTAACTGAGCTGCGTTGAACTTAAAAAAGAATAATGTTAAAAGGAGT
AAACAAGAAATGATGATAATAACTATAAGTTGGTTTAGTAATGTGATGTG
GTCGTAAAATATGAATGGTAGTTAAGGTATCACTATAACTGTAGTTTCAA
GTGTGTAGTCTTCTGTATGTATTCCTGGATTTGTGAAATGTCCAGTCGCT
TTATATAAAGATCATATGCTTGCCAATAGGTTTACATATACTCAAGTGGC
AGTAGAGAGGCACAGAGGCTACTATTCGGCAACTCAACCTATGGTGATCT
GCGACAATACTTGTGTGGTTTTTTTGACACCACAACCGGGTGAGTTTTCC
ATTTCTTGGTCTCTTTGTCCTTTCAAAAGTGAATATGGAATTATGACTCT
CCCTCGTTGTTACTCCGACGCTGACACTCGTATACACAGAAACAAAAGAG
AAGCAAGGAGTTACTCCGAGATCACAAAATCGCTTGGGGTGGATAATCCA
TCCCAAATCTTATTTATCACAGATGTGTTCGAAGAAGCGGTTGCTGCAAA
GAGTGCAGGTAACCCTGCGCTAGTTCCATTCTAGTAGTATAATATTAGGA
TATTTGTAGAAATCATGTAAATATAATGTTTACGTCCTATGGAGTGTCAC
ACTTTTTGGCTTGCGTGCACACTTGCAAGCTAAGATACTATGTTCATTAT
TGTATATATGCTTCTCTTAGTACAGTATCTTCTCTTGTCTCTTGGGAGAA
CACTTGGATTTCACTGTTTATATCTAACACTGTTTCTCTTCAGGTCTCGA
GGTAATAATCTCCATTCGCCCTGGGAATGCACCACTTCCTGCGAATCATG
GTTTCAGGACAATCAGTTCTTTCAGCGAGATCTGACAAATGTGCAAGAGA
AAAGCATGCCGGAGAATCGCCTTTGGATGGGCCCCTGGATCAGTCCTTGT
ACAAGCATGGCATCAGATTGCAATAAAACGAGAGAATAAAAAAAGGGGGA
AGGATTGTAAGAAAAAGAGAAAGCTGTGAAGAGCGTACGAGTTTGTTCAT
GTTCCTGTGTTGGTGAATATGCGTGCTTGTACGTCGTACATTTTGGTTTT
GTAGCTCACTGGATCCGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.