Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039850

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039850
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039850
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCTTCGTTTTTTTTCTCTCTCTCGGGAAGAAGAATCCCCGGCCTGGTAG CACTTCCCTCCTCTTCCCCCCACTCGGTCGGACCACCTCGCCTCCCCCCC TAAATCTCGCCGGATTCCGCCGCCCCGCCGCGTGATTCGGCCGCCCGCGC GCCCCTCGGAGGTGAGCCGGCCTCGGATCCGCGGCCGCCCGCCGCCTGGA GCTCTCCGTTCGGCGTTCGGAGTCAGCGAGGGCTGACTATTCTTCTTTCT TTCGCGTGTCGTTGCAGGTTCGGGGGCTAGCTCGGCGGAGCTCGCGTCGC GTCGCGTCTCCCCCCACCGGTGGCGCGCCCATGGACTACGGGCCGTCCGA CAGTAGCGGTGAGTGGGTTGCTGCTGGGCTACATGCTTCCTCCTCGTGCT AGGGTTTCCAATTCTAGGGTTCTTGCTTGCTTTCTTGAGCTGCTTGCCCG TGGCCGGGGATTGCTCGGGAGGGCGGATGTGGGTTTGTTGCGGAGGGGGG ACGAAAGGCCGAGTTTTTGGTGTGTCTGAGGTGAGGTTTTTGGGCGCAAT TTCTCGCGGCTTGGGAGGCGCGAGCTAGGGTTTGGGATTGCGTGATGGAA GATCATGGTTAGGCCTACCGTGGTCTTGCTTGGGGAAATATTGGACCTTT GCGCGGGGGTAGGGTTTTACGCCGATTTCGGGGGCTCGAGTTGTGGCTCC GGAATGCTCTTATTTATTATGTGGATATATATGGTGGTGAACTTGGTGTG GTTTGCTACAGGTCAGTTTGAGTGTGTTTAGGGGTTTGGCGCCATTCGTC GCAGGCCTGTTTGGTGGCGAGGTGTATTCTCTCGGCTTGCTTGGACAAAC ACCGGAGGTGCGATATGCATTCAATTGCTTGGTGACAACCTTCGGGCTGG ACATAGCTGAATAAGGGAATTATAAAGCTGCGACGCCTTTGTGGATTTGC CCTAGTTAGCTGCTAACCCTTCTTTAGGTTTACCCTAAAGTTGATTATTA ACTATAAGTAGTCTGTCTTGTAAGGGGGTTATTGCAATATGAATTCACTT GAGCCCCAAACCAGTACACGAATATACCCTTCTGCTTCACCTGGTCGGTC ATTTTTCCTGGTCGCTGCACTGCACGCACAAAAGCCCTAACCTCTCTTCT TTATGTTGCATTTATATTTCTAAGAAATGATTTCGTGATTAATGCATCTA ATTGTACTTTGCACATCAAAGTTATTACTATAAAACTACACCGATATGTA CATAGAGATTATGACGAACAAAATGGAGGATAAAGAACACACAACAGGCA CATATCTCATTGAAGTATGTGAAGGTACAAGTTGACGGATGGAATATAGG CCTCTAGTCTATAATATCGTGTTATTTGAATGCAGATGCCCCACATGGTT GTGTAGGGGAACTTGTATGTTACGATAGCATAATTTCAAAAAGTTCTACA GTGTGACAGGAACGCTCTCAAAGTTGCAGATAACAGGTTTACCACGGGAC ACATAGTAATAGAAACATTGCCTATAAAGCATGTGATTGTGGCCACAATC GTATTATGACCTCGTGGATAATCTAGGAAGTAGAGGGTCGTCATAGCATC ACAGTGACAGTGCCTCCAAGGTATCCGCACATACAGGTAATAACACCACG CATCACATCACAGCGTCTATCTGCGTGAGAAGTAGATTGATGGATGGATC AGGTGAACGCTGAAGACTCCCTTGAAGTTATAGAAATGCCCTGGCATCCT TCCAAATACTCCCTCCGATCTATATTAAAGGTCTCAACTTTGTCTAGATA CGAATGCATCTAGTGTGAATACTTAACTAGATACATACAAATCTAGATAA AGTTGAGTCCATTAATATGGACCGGAGGGAGTATGGGTGAAAGAACACGT AGAAGGCTTGTAGTGGGATCGCATATGAAGCCCATGTGCATGTGTTGGGA CTTAACATGGGGCCACCCAGAATAACGAGCAAAAAGATAAATAACTTTAC GAGTCACATGTCAATCAATATTATTGATATTATTCGAGGAACATATTATC CAAAAAAAATAACATGAAGAAATGTAATCATCATCAATCTCTATAACTGC CTCTAGGGAAAGTTACTAACAGTTCATTGGCTTTAGTGAATGGCATGCTT TTCGATTCTGTTTTGTGTTATTTCCTTGAACATCACGGATCAGTTTTACT TGTCCTATTCGCAAAAACAATACGAACCTCTTTCTGCTATTATGTTAGGA AGTGTGGATTTTTTTCTGCTGTGAAGCGGGTATAGGGAGAGCTCTACAAC TTGCACTAATTGGTGGATCCTCAACTTATGTGTGATTTGCAGGAACTGAT GATGATCTTCCACCATCATATCCGAATAATAGGGGTATAAGAGGAAGTGG ACGTGTTAGTGGTAATGGAAGAGCTATTGTTCCTGTCAGTGGTAATGGAA GGGCTATAGCTCCTGCTACTTCATACCCTAGAGCACAAACTGATATGGAA ACACAAATTCAACAGCTTGAGCAAGAAGCTTATTGTTCAGTTCTTCGTGC TTTTAAAGCTCAGTCTGATGCCCTCACATGGGTTGGTAACGCTAAACTTG TGCCTGTTCATTCAGGTGTTTGTGCTATAATTTATATATTGTTTCTCAAC GCTGACCTTCAGTCAACTTTATCCCTTTACAGGAGAAGGAGGGTCTGATA ACCGAACTTAGGAAGGAGCTAAGGGTATCCGACAAAGAACACAGGGAGGT GCTAAACAGGGTCAATGGGGATGATATTATTCGCAGCATAAGGTAGAATA TAGATTAATCTTTTTGCCCGTTCACTGCAATTTTTTCTGTTTCCAGCACC ATAAACTCCTGCCTTTGTTTGAATTAAGGGAATGGAGATCAACAGGAGGC CTCCAGGCAAGCTTACCGAATAATCCTCAGCCTATACATCATGATCCTGC GCCTAGCCCTACCACCTCTGGTCGTAAGAGGCAAAAAACATCCCAATCAG TTCCTCCCTTAGCTGCACCAGCTCCTGTTATGCATTCACAACAGATGGCT ACACCGACACAACCTTCATCCTCAACAGCTAAAAAGGGATTCCCACCAGG CCCTAATAAAGGCAAAAAGACAAAACCAGTAAGCAGATATTTGATGATTT CCTTCTCTTAAGAAACAAATCTTTTCTTTTATTTGTTGACGGAATTTCAT GTGCTTCCAGGGCCAGAAGATACCAGGTGGCTCTGTAGTCAAGTCCATGC CATCTTCAGCAGGTCCTAGCGGAAGGGGGCCGCAGATGAACAGAAACTTT CCTGGTCGCCCTCCTGCTCCTGAACCTTCGCAAGGACAGCATGTCGATCC ATTAATTAACCAAAGAGTCATGACTCGATGGCCCGAAGATAACAGTTTCT ATGAAGCCACTATAACTGATTACAACGCAGAAAAGGTGTGCTTTTAGCTC ATTAGGATTACGGTTTTGTTAATCCAAGTCCTAGCTTTTCTGAGGGATTC CATTGCAGGGCCTTTATGCACTAGTTTATGACATAAATACAGCTAATGAG ACCTGGGAGTGGGTTGATTTTAAAGAGGTACACGACCTTTTTCTATGTGG GCATTCTGATAATTCTTCACAATTTCATACTTCTCGGTGTTTTCTTGCCT TTTTAACATTGGACCTAGAAAAATCGTGTCTAGTTTAAATGTTTTAGGTA CAAGCATGATGGCGAATAAGATTATGTGGTTATGCAGGATTAGCTTTCGA AACAGTTACCGAGGAACATGAAAGGGAACTCTTTATCTCTTGACTCTTTT ATATGAACCAATCCAGCTTTAGTTGATAGTATGTTGCCAAATTGGCCATG TGTGCACACCCACGTCATTCTTGTGTGAAATGGGCCTGTATTAGTGAACT AAGGTAATGAAACTGATCTATTGGGATAAGTAACCAGGTTGTGTTACTGT AGTAAATAGTGCCAACAATATACTTACGGATTTTTTTGACCATTTGATAT AGCATTACTGTGCTGCCAGGAGTACCATCCACTTTGCATTTCACTCCATT TTCTTGCCAAATCGTGGGAGAACATTTTGATTACAGTTTGTGACATCTAT GATTGTCCTTGAGAATCGTGTCAAATTTGTAGAGAACATAGTCTGGTACT CTTATTCAGTCATCAGGACACAGATAGCTAGATTCAGATTCTAAGCAAAT GTTTTCTGTTTGACAAGGGAATCTGTAGGCAACCTTATAGCATTTTACCA TTATTATTGTATTTTGCACATGCTTTACAATGTTTGTGCGTGGAAACACT TGATTACTGACAGTTCCTTGGGCCTTGAGTACAGATGAAACCTGACGATA TAATATGGAAAGACGGTGATCCAGGGTTATTTCCGGGGAGTCGTGGTGCT CAAGGTAGTGGGGGTAAGAAGTCAGCTAGCCGTGGTATGTCCATACCAGG TACAGGTAGGGGAAGAGGATCCCAAAAGACTTTGTCGAGAAAGGACTTTC CACGTTCGCAAAATGGTGTTGGAAAGAGAAGTTCTGATGACATTGATATA CTTCACACTGAGAGCCTCATAAAAGAGGTTAGTTTGAAGAAAGTTTGCTG GGCTCTTTGATCATAAATATCAGCTAACCCCGTACATCTCACATAGGTGG AGAGGGTTTTTAGTGTTAGCCATCCTGATCCTGTGGAGGTAGATAAGGCA AAGAAAGCGCTGAAGGTAAGCTCGAATATACAGATTAATTATTTGATCAG GAAGCCTTTGGTCTCGACTAATAAACAATGTTTGCAGGAGCAAGAGCAAT CGTTGATTGATGCGATAGCAAGGCTTGCCGAGGCATCAGATGGCGAAAGC GGTAAATACTGAATCATTGTTCCTTGACAAAATGGGAGGATCTTTCTGAT GTTCCAGAAAACTCTTAAGCCTATTTTCCAATTTAGGACGATTACCCTGA ACATTGGGAGCAGTTTGAGGTGTCATGGATGTATTCCTTTTTTTCTTTGT ATTCACTACTTGGTATATAATTATACCGACTTTCCACTTTAGAGCGGTAG GATCCTCGCAACACAATTGGACAGTTACCCAGAATATGTCCATTTGTAGA TAATAATGTTCCTCTTATAAGTGGGAGATATGAGGGTCTATCTTTGGCCT AGAGATTAGAAATTCTGCATTGCACACAGCAAAGATCAACTTTTTTTTTT TGAGGGAGCAAAGATCAACTTTACAAGCTATGTCATGAACATTATTAGCT GTGCATGTTTGGCACTCATTTCTTTTGGTGGGAACAGATGAGCGCAACCG TGGCCGAAGGATGGGACCTTATACCGGAGGTCATCATCAAGGGAACTATG CAGATGCTATGGCTGTTGATGGTGACCACATAGGCGCTGCCACATAAAAC AATTGGTTGCTGGAACATGTATACAACAAGTCCGTTAGAGACCTGTCCTG TTGTAAAATCTTATGGCTGATGTTTATTTAAAACTTAGCTCTAGGTTGGA ACCATCTGGTTTTGAGAGAATCGTTTTTTGCCTTTTTTTGGTAGAACCGC TTAACTTGTTGTAAAGCTGCTCTGTGGAGCTATTGTCGCCCTTATTGCAC AAGTGATCTAATGTCAGTGCAATGGTAATTGATTGACTTTTGACATTTAA TTTGTTCCTTCTCAAGTTATTGCTAACTTGTATATTCTGAGATCATATCA TTTTTTTTATGGGAAGCATGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.