Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009780

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009780
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009780
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGATGCCAAGGATGCGCTGCATGACAATAATGATCTCGGAGACGAAGG TGACCTTCCTGTTCTCTCCGTCTCTCCCTTTTGTCAGTGAAGAGTTGTAG ACACTAACTACTGTCCTTTTTCTCTTAAGATTCTCTATGTAACATTCTGG CCCTTAGGAAAGGAAGGGTCAGGGTCACTAATAAATCCGTGGGATCTGCG GGGAGCATGGAGTCCATGGATGGTAGAGACATGATCGTGAACGTGGCCCG CTCTGTTGTGAACGTATCAGCCACTGAACCTGGTAAAAATTTGACTAAAC CCTTAGTGTGATTCTCCGGACTAATTTTTCCTACACTCCCTACGTCCAAA AATAACTACCGTCCTTTTCTCTTAAGATTTTTCAAACGTATCTAGATGTA TTTTAGTGTATAGATATATTTATATATAGATAAACTGAAATCAGTTATTT CTAAACGGAGGGAGTAGTTGCTAATAGTAAGTACCCGTCTCCTTGTTTGC AGATGGGAAGATTTTATACTCTACGGGCATCATTATTGAGTATGATGAGG TTGGTAAGCGCGCTAAGATCTTGTCTTCGTCCAGCATCATGTGCACCAAG GAGGGCAAGCTGCGGGACCCAAATCAGAAGGTAACAAACTGCACCTGTTA GTTCTTTCATGCCTTGTCCAGTTGTAAACCGAATCATTGAGTGTTTACCC CGTAGGTGAGAGGAGCTTGCGTTTTATATACTTCTTCTGACCCATATTAA TTGACTCAAATTTGTCTAGATGTAATTAAAATTTGATTAGATACGTTCGT ATCTAAATAAATCTAAAATCAACTAATATAGATCGGAGGGAGTAGTTTCT TATTACTAGTATATGGTACCCATGCTCTGCACGAAACAATAATAGAGTAT CTCTAGATATTGATCCAAAGATACTCCCTCCGTCTAGAAATAACTGACTT GGATTTGCGTCTAGATACATTTGAATATAGACAAACACAAGTCAATTATT TGTGTACGGAGGGAATAGTTCTATATCTCGAACATGAGCATCAAATATGG CTCTTCTCTGCCTCATGGGAAATACCAACCCAATGAGCTCTTGCTTCTAC TACTTCTCTGCAACCGCACCTTTATCTTTGTCGCCACGCATATCTCCAAT CCAAGTCGTTCTGAATTGCATGTTGTCTTCTCCAACCCAATGAACCCCAA GTGCGTTGCCGGCCCATTAGATGCCTCACCTTCATATGTCACTGAGAGGA AGACATTCAATATTCATCCCCGGAAAACGAAAGCAGGCACAACAGGTTTT CACAGGGCGACTTTGCTTCTGACGCTGCTCTGCCAGCTGCCATTGCGAGA TGGTCGCGCTCCAGCAGATGTTAGTGACCATGGTTCTTTGACTTCTTTCT AGATTTGAGCTCCTGTAGAAAAGTTACAGGGAGAAGCCTCTATTTCGTTT TCAAGAACTAATACATCATAATGGAAAAACAAAATTATAAGATCAAAATT GTCTATGGGAAAGAAGAAAATTGACACCCTGGAAATAGCAGTTTGGACTT TAGACCATGTTTCAGATGTATACTTCAGTGCAAATGCATGGTTCAGATTT TTGGTCCTTCGGATCCCAGGTTTTTGCTCACTAAATTGTCAACATATATA GAGAAGTGGTAATCGTATTACACTTTTTTAGTAGGTACTGTTATTACACT AAAATTAGACGTTCCAAGTTTGAATGGAAATTTATTTCGCTTTTACACTT TACTCAATTCTGCAGAAACGTTTTTCCAAATACCTCTTGGTCATTGACTA ATTTCATAAGCAATAGCTCATTTTTTTTGCTCGAAAAGTTCCTCGTAGCA GGACCCTGAAAGCTTCATCATATTTGGATATCCAACAACCTTCACAAAAA TGTTTCTTCGGCTGCAATATAAGTAATAAAGAAGTTATATATTCAGGAAC TCCCATAGGATGAACCAACAACAACATGAGGTTGGTGTGTGCGCACAAAG TTAAGATAAATACATAAATGTTAAGCCACATGATTCACTCATGCAATAAT TAGAAGCAATATAATTTGTTTTCTGATTCAACGAATCATATTCTAGATTA TGGCCAAAATATTATGAACTGATTGATGGAAATTCTCCCAATCAACTTGC TAGCAAGATCTATTCCCCAAGGACACAAATCTGTCTTTCCTAATGTTTGA AGGACAAGAATTGAGACCCATGCTGAGATTCCCAACAAACCTCTTAACAA GAAAAACTTCTATTACAATTACAAACCATATGACACGTAGAGGCATATAA TTTCCATACACTAGTACACAAGTGAATGGTGTACTGAGCATTCCATGGAC ACAAAATGTGATAGCTGATATTTCATAACAGAAATGCAGGCATTTACTGT ATCCAGACAAGTTCCGTCTATAATTCCTTAGCCTATGTAGTGCCAAACAA GCTTTTGCTACAACCCTTGCCTCTTCCTTCACACACAAACACTATGTGAA GACAAACTGGATGACAAATAACATTAACTCTAACCGATTATTAAAAAAGG GAAATTGGTTATTTACTCAAAAGTTCACCAGCCTTGGATCATCTACCCAA AGTTGGCTGTATATTGGTAAAATACCCAATAGGGACTTGAAATTAAAGCA CAATTATAGCAGGATCCTTTTCTTTTCGAGAATGACGGGGGGAAGAGGAT TCCCCACTGTTTGTGTAAAACTCGAGGCGCCCCAACGAGTGGGCAAGAGA ATTGTTCTTTTACATCAAACGGAGAGGTACGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG GGGGGGGGGGGGTGGGTGGGTGGGTGGGTGTTAGAGATGAGAGAAAGCAA AGGAAAATTACATAGAGCACTGAATTAAGTAGATACGAACATCATCAACT TGCATGTGATCAGCAGCCTTGAGTCGGTGGCTCCCAAGAGTAAGGTCGTC AATGGCTTTGCGCAGCACATCAGAGGCGGTGGAGGTTTTGGTGTTGAAGA CGACATCGTTCCGGGCTTTCCACAGGTGCCAGAGAACAGCGGCAATACCA ACATGCCAAGCACTATCATCACAAGAGATGGGGGATGCAATGTCCCAGAT TGTGTCACAGGAGGTTGTGGTTCTGATGCTGGTCATGAAAGGACCCTAAT GAGATCTGGTCATGAAAGGATCGATGGGTCAACTTCATCATAGATTAGAT CGAAACCCTCATCGCCAGTTTCACACATGCGCGTGCACCTCCATCCGTCG CTGCTCCTGACAGGAGATCAACCACCGTAGCGTCAACCTGTGAGCTACCC CATCTGTCTTCGTCAACGTATCCCTCTCGGGACCGCTGCACCGTTTCCGC CGACCACCGGCCGCATGTACGTCTTGTGCCTGATCTATCCATCTTACCTC CTCCAGCCAATATCTCCTAATAGTCTTGCATGTTGGTCCGTACAAGTGAG CACTTGATCAGTATTGCTCCAGCTTGAGGTAGTTACTATTTAATAATTCA TATAAAAAGGCGTCACAGACTTAAATAATCTGGAGCAGAACAACTGGATC AAGAAACTACTAGTGCATTGTACTACTCTAGCGGTAATGAATGGCAAGAA CCGACCGGGTTTTTTATCTAATCGGTGATGAAGATGACCCATTGATCCTT TCACGATCAGCATTAATTAGGACCCCTGCTAAAATTGCGTTTTAGTTTCA GGTTCCTATTGGGTATTTTACAGATGTGAAGCCAATTTTGGGTAGATGAT CTAAGGCTGACTAAGATTTCGGTAAATAACCAATTTTCCCATTAAAATAA TATGGATCACACGGACCTGTAATTAGTTAATATCTCAAGTCTAGCTTAAC AACAAGCCATAATGCCATGTGTATAACGAGAAGGCCATAATAATTTAAGG AGCTCATATTCATCAACAATTTAACCTGCACATGCGGATCAAATATTTAA ATAGCCATGACATAGAAAAAAAATGCTTTCCTAGAGAGAAGAAACAAGTA AAACCTCCATTGGTACTATAATTATTTCTCATGCCTAATAACTCTACCAA GTTAACCCAAATAGGGTAACATTGAACAATGAAAATGAACATTAGTTTTT TAAGGCAGATGACTGCATTTGCTAGTATTAAGTACTTTAGATAAGTTGTT GACATAACAATTAGGCTAGCCATGCAATAGTGCTTCTACAACTTAGTCAT TATTTCAAACACATCATGCATAACATGCATATACAATAATTTATAATGCT AATAGATCGAGATGGAAAGAAAAGAATAGCTAAAGAAGGTGTAAAACCGG GAGGTTATAGACCTTAATATATGATAGTTTCAATAAAGAAGATACATATC TATACCTCAATTAGTCGTGAGCACAGTAATCTCATCAGGGTATGCAGCTA CCATCATACATTTCCATCATTTTCTTGGTACCATAGCTGACGTTATATCT ACATATAAAAAGAGGAGATGTGTAATTAGGAGAGGGATTCTAGTTTCTAC AATCAACAAACAGGGTCAGCAAACAAGAGAGTAGCCATACGCGACGAGTA AGTTTTTCTCACTAGCCCACTGCAATCAGCTGAGCCACCTTCCTCGAGTG TGGATTCGACAAGTGAGCCACCAGAGTGGGTTGGCGCTTGTGGAACACTG TTGTTGCAAGTTCTACATCACCTTACCGCTGTGAAGGGAGTGAATTGGCA GGGTTGGAGCATTATGGCTAGGGTTTGATTGCAAACAAAGAGGTTTTATT TGACTTTGGCCAGGAACGACTGATGAGACGGGAATCGTCCGTTTGGTGGG TGCCTGAAAGTTGTCCAGGGTTATTTATCCACCCAACCCTGGACACGCAC TCACGAATATACTAGCTTCTTATATGTGTGCTTTTTCTTAGAAGCAATCT GTTAAATGATTTAAATATGTAGTGTCAAAGTCTTGTCATGTAACTTATCA TTAGATAATAATTATAACAAGTATTTCCTTCGATTTGAAGTCTTAAGTAT TTTTATGTTCTTGTGATCAAAGAATTGGCAGGGTTGGAGCATTATCATGT AACTATCATTAGCAACTATAAAGTATAGTCGGATTATGATTAATCTAGAA AATGCAAAGCTAATCCATGTAGCAGTGGCCAAGTTGAGTTTGTGGTAAAC AATGTTATTGTTGCTAATCTACTGAAAATTTCCCCTTTTAGGTATCAGTT CACCTATCAAAGGATACTGTTGTGGATGCACGGGTGATATTCTTCAACGG CCATTATGGAATATTGCTTTTGGAAATGAGTGCAGTGTTCTCTTTGGTTC CAGCTTCTTTGGGATCTGCACCGTGTTATGGAAAGAATGTATCTGTATTG GATAGAGAAGTAGACTATGCACTGGTTGTTAGCCATGGCTCGATACAGTG CTTAGAGTATCCTTTTTTCGAGAGGAATCATTATATGTTTGCGAGCTACT TTAGCCACCTGGTAAAAAACACATTCCAATGTTATGTATTTCAGTATTTC ATAGTTTTGTTTTGTTATCATATTCAATTCACTTATATTTCTTATGCAGA TTTGCACAGGTGGGCCAGTAATTAACAGCAGTGGCGAGGTCATCGGCCTG GTTGTCAAACATATCCCGCAAGCCGCTATTGTGTCGACATCTATAGTGAG AAAGTGTATTCAGATGTGGAATGAATTTGGGTAGGTTTTCTACATTTTTA GTGTTTATATTAAAATCCTATATTTAGGAAATACTTTTAGTTAGATAAAC ATGGTAATTATTGTTTGAGAGTTCCTTGGCGCTAGTAGGTTGATTGGTCT GTGGAACTGGGTGAAAGGTAGAAGGATATTGATTTGGTTAGGTTGCTTAC TACGTATACCATGTGATAAAGGTAGAAGGATATGTTCAAAGCATGGATGC AAAGAATCGCCCCCCTAGACTTTGGTTTGGCTTATCCTGTCTAGAACAGG GAGGTTCTAATCTTTTTCTTACTTCTATTGTCTGTTGGAATTATGTGCTA GACTGTTGTGGCGTCAATGGTATAGATGGTAGCAGTTGGCACTAGTAGCT TCCATAATTAGAGTCCAGGTCAATTGCTACAGCAGTCTAGCCGGATTGAA TAGGGTAATATGAGTTATTTTGTGTCAGAGTCAGAGATGAGTCCTAGTTC AATACTGCTACTAGTCCCAGTAGGTTTGCATCAGGCCTCCTGGCATTGGT CCTCCTATAAGAGGATGTGTATCCCGTGTGTTTTGGGTCAGGCAGTAATA ACCCTCAATCTTCCAATTGCTAATCCCTACGTCTCTAGTTTCTCTCATAT ATCCCTGTTATCTTCTCAACACGCCGGTCACGGCACCAAACCACAGGCGA CGCTCTCTCCCGACAGTGAACCATCTCTATAATCTACGCAGCAGAGGCGT TCACAACATAGCCCTACAGACCAAGCATATTGGCAACTTGACTAGTACAT ATACTAGACTAGATGCTGGCTAGAAACATGACTCAGACTGCAATATTGAC GCTTGATGGGGACCCAACTAGTTCTAAGCCTATTCGGGTGTTACATGATT CCTAGTCCTTCTCTGATACATGTTCGCCCCAAAGGAATTGACAACAACCT AGGACTGCAAGGAAAAATATTGGTCCGATAACACTTCAAAATTGAGCAAA AATTGAACGGATGAACAATTTGGAGCGTTTACCTGCAAACTGGTGGTAAT TTTAAGTTTGATCATTTGAAAATGTATGAATCTACAATATGTAAAACATT TGACCTGTGTAGCCGGATCGCTCATCCTATTCATCACCTTGAGTTGACGA CGGTGCGAATGCTGGAGATGGTTTATCGAGATGAGCTTTGGGCCCGCCAT GATATCAGTAGTGGTTTTATTGTAGCTGAGGTATCCTCAAACACACATAT CTTTTTCATAATTGTGAACCTTTTTCCTTACCAAATTTCTTCCATTTCTC GAAAACTAGATACAAAATAGAATTCTAACTTTTTTATCTGCTTAGGTGTG TCCTGACTCTACAGCTGAGAAGATTGGCATTCGAAGAGGAGATGTGATTG AATTGATCGACTTGGATCATATTTCTACTGTAGTTGAGGTGCTAAATTAT TGGTATTGTAGGTAAGTTAGTTTAGTTGTATTCAGAGCTAATGTGGCCAA ATTTGCGTTGTAGCTTGAAGAGTTTCTTCTTGGTCTTGCTTCAGACTTTT TGGAGAAAAAACTTGACTTGTCCTCGACGGTAGATATTAAGGTATATTAA CAAAGAATCCAAGTTTTAGTTCGTGAAAAAAAAAACATATCATATCCTAA ATGTTTTTGTTTGTCTGTTGCAGATACGAGTTCATGACATTCGTGCAAAA ACAAGTGTCTGCACTATTTTGCCCATGGGATTCAGCGATGCTGCAGTGCA ATCATACTATTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.