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GrainGenes Sequence Report: AA008906

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Sequence
AA008906
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008906
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGGCAGATTGGAGCAGCAGCAGCAGACGCGACTCATCCCAACGGCC
TGTCGGCGGCGCATCTGAGGGGGAATTGAGGAAAGCGACCGGTGGTTGGA
AGGAGCAACTACGGCATCGGGGTGGGTTGTGGCGTCGCTTGGGAAGGGAG
AAGGTGTCGGCAGCGTCCTGGGGAGCGGATGACCACCTATGGGCTGGGCT
GGACCACGACCTCGAGCTGCAGGTAGAGGAGGGGCGCTTGTCTAGGCCGA
TGCGCGCCTATGCTAAATTATGTAGGCAATTTAGAACAAGTAGGCAAATT
ATGTGAATAGGCATGCATCAGTAACCCTTCTATAAGGATGCATGAGCATT
ATCCATAAGGATGTAGATGGGGCACTTTATTGATGCCGAGATGTTTATTA
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ATGGGTGTGATCCTGAAGCGACTAAGTTTATGGCGAATCTTTATGGATTC
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CATGAAGGGGAGGGCTGATGATGACTTCATGCGTGCTTGGATCACCCTAA
TGGTCAACTGTTTTCTATGCCCTACCACTGGCCTGACCATCAGCCCTCGA
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AAAGTTTGTAGTTGACCAAATAATGAAAGATGTTAGCGAAATGGGAACTA
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AGTCCCTAGTATAGCCTCTATACTTCACTAGCTTGTTGGTTGATAGATGA
TTGTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGATGTTATCAACAACAAGATCAT
ATCGTTAGGAGAATGATATGGTGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCA
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TAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTACCGG
ATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGTTATAA
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TTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGATCCGGGA
TATCACGAGGTGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAA
AGTCCCGTTTCGGAGTTCGGGAATGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATGT
TCTAGAAGGTTCCGGAATGTCCGGCACTCCGGGGGGGGAGGGTACATGAA
TGTGTCATTACATGTTGGAATGATTGCATCATGTACTAAGTGTCATCGCT
GTCCGAAATAAAGGGTTAACTCAAATCCTAGTTTGAAAAGTCAAACGGCT
AGTTTGAAAAGTCAAACTGCCAGTTTTCGGAAAGAGGAGAAGGAGGATTG
GTGGAGGCCGAATTGGGGGAGGGTTCCTCCCTTGGCCGGCGCACCACCAA
GCCGACTTGGGGAGGGACTCCCTCCCCTGGCGCGCCAGCCCCCTCCCACC
TATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCCTCCTAGACACACAACTTTCACCTCT
AGATCTCCGGTTTAGAGCCGTTTTGGATTAGAGCTTCTAATTGCTTTAGC
CAACGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTGTGTC
TAATTACTAGACCACTAATAGCCTCTCTCATAAGCTCCACCATACTCGCA
CCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATTTCCCCTCTACTTCCGGTACCAC
GCCGTTGTGCTGCCGGAATCACGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCT
GCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCG
ACTGCGGAAGCGCTGCCGGAACGTGGCGCCGGAAGGATCGTCTACACGAT
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TTAAACGCTTTGGAATCTTCGAGGGTAAGTTATACCATCGACTCGTTGCT
ACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTTGTTTGTTTGTATGCGATAGAAAAT
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ATGTAGATCTGTTGCACGAGTAGAACACAATGGTCATTGTGGGCGTTGAT
GCTTTTATTGTCGATTGCTTATTGTGTACTTTGCATCTTGCGGTATGTTG
GGATGAAGCGGCCCGGGCTAACCTTACATGACATCGTTCATGAGACTTGC
TCCACGCTTGACATGCAACTTGTATTGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCT
GTTTCTCCTAGCATAGTAAAGATCCAATACACAACGGGTGATTAACAATA
CTTGTGTCAACGTTGTGGTTCATGTTCGTAAGTTAGAACGACACTTATTG
ACAGCCCCAAACCACGTAAAATATGCAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTT
TGTTTTGCAGGGGTGTGCAGTGATGTGATATGGCCATGATTGTGATTATA
TTTGATGTATGCAATGTTCCTTATTGTAAGTCGGCAACCGGCAGGAGCCA
TATGGTTGTCTTTAATTTATGTTAAGACCCGCGTGTCTATTCAAAGTAGT
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TTGATGCAATGCCGGTGATGATGGAGATCATGTTCGTGCTTGAAGATGGA
GATCAAAGCACAAAGAAGAAAGGCCATATCATATCACATATATATTGAAT
TGCATGTGATGTTAATCCTTTATGCATCTTGTATTGCTTAGTAGACGACG
GTAGCATTATAAGATGATCCCTCATGCACATGAATTTCAAGTCATAAAGT
GTTCACCCTTAGTTAGCACCGTTGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCA
CGTGATGATCGGGTGTGTTAGATTCCGCAAGTGTATACAACGTGGGCAAG
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GTACAGACATGGTCTCGGAACACGGATCACCGAAAGGTAAAGCATGAATC
ATATAGTAGATATGATGAACATGACGATTGTTCGCCATTGAAACTATATC
AACTCTCGTGATGATCGGTGTTTATGTAGTGGATTTGGTTCGTGTGATCA
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TTACATTAATTAATTTGAACTCAATTTATCATAAACTTAGTCTAAACTAT
TGCAAATATGTTGTAGATCAATGGCAGCCCCTACCATCAATTTTAATGCG
TTCCTAGAGAAAGAAAAGTTGAAAAACAATGGAAGCAACTTCGCGGATTG
GTTCCGCAATTTGAGGATTGTCCTCACAGCTGGTAATTTGACCTATGTGC
TGGATGCACCGCTGGGTGACCCACCTGCAGCTGATGCTCCCGATGAAGTA
AAGAATGTTTACCTCGCTCGGAAGAATCAGTACTCCATAGTTCAGTGTGC
TATCTTGTATGGTTTGGAATCGGAGCTTCAGAAAAGGTTTGAGGATTCAG
ACCCATATGATATTGTCGAGGATCTCAAATTGATTTTTGAGACTCATGCG
GCAATTGAAAGCTATGAGGCTTCTGAAAAGTTCTTTAACTGCAAGATGGA
AGAAGGCAGCTCCGTCAGTGAGCATGTGCTTAAGATGTCAGGGCACGCAA
ACAAACTTCAAAGCTTGGGTATAGTGATTCCTAATGCTTTGGGGATTTAC
CGTGTCCTCCAATCACTACCACCAAGTTACAAGAACTTTGTGATGAACTA
CAACATGCAGAACATGAACAAGACGTTGCCAGAACTCTTTGCCATGTTGA
AATCTGCAGAAGTGGAGATTAAGAAAGAGCACCAAGTGTTGTTGGTCAAT
AAGACCACCAAATTCAAGAAAGGCAAGTCTAAGCAAAAGGGACACTTCAA
GAAGGGTGGTAAGAAAGCTACCACGCCGATGAAGAAGACCAGGGCTGGAC
CTAAGCCTGATACTGAGTGCTTTTACTGCAAGGGAGAAGGTCACTGGAAG
CGGAATTGCCCAAAGTACTTGGCGGATTTGAAGAACGGCAACATCAAGAA
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TCGAAACAGGTGCTGCAGAATAAACGGAAGCTAGCGAAGAACGAGGTGAC
GATGCGCGTGGGAAACGGATCAAAGGTTGATGTGATCGCGGTCGGCACGC
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TTGGTGCCTGCGTTGAGCATGAACATTATATCGGGATCTTGTTTATTGCG
AGACGGTTACTTGTTTAAATCCGAGAATAATGGTTGTTCTATTTATATGA
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TCGGAGTGAAACGTATGAAGAAACTCCATTCCGATGGACTTCTTGAATCA
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GGTTATCGTTATGTTCTTACCTTCACGGATGACTTGAGTAGATATGGGTA
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TCTGATCGTGGAGGTGAATATCTAAGTTACGAGTTTGGCGAGCATTTGAA
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AACATCCGCATTCACTTTAAATAGGGCACCGTCTAAATCCGTTGAAACGA
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GGATCCTTTCTAGAGAAGGAATTTCTCTCGAAAGAATTGACTGGAAGGAA
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TCATGGTGGTGGACAACACCGATGACCCCGAGACATATGAGGAAGCGATG
ATGAGCCCAGATTCCAATAAATGGCAAGAAGCCATGAAATCCGAGATTGG
ATCCATGTACGAAAACCAAGTATGGACTTTGGTGGACTTACCGGATGGCC
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TGGCAGATGGATGTCAAAACAGCATTCCTCAATGGAGACATTGATGAAGA
GTTGTATATGATGTAACCCAAAGGTTTTGTCGATCCTAAAGATGCTAACA
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AACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAGTGAGTGGGAGCTCTGTAG
CGTTCTTAATACTATATGTGGATGACATATTGTTGATTGGGAATGATGTA
GACCTTCTTAATAGTGTCAAGGAATATTTGAATAATAGTTTTTCAATGAA
GGATCTTGGCGAAGCAGCTTACATATTAGGCATAAAGATTTATAGAGATA
GATCGAAACGCCAAATATCATTGTCACAGAGTACATATTTGGACAAAGTT
CTAAAGAGGTTTGGAATGGAAGAAAGCAAGAAAGGGTTCTTGCCCATGTT
GCCCAATACGACCTTGAGTAAAACTCAAAGTCCGACATCGGCAGAAGATA
GAGAAAGGTTGAGTAAAACTCCCTATGCCTCAGCCATAGGATCTCTAATG
TATGCCATGCTATGTACTAGACCCGACATTGCATATGCTGTTAATTTAAC
TAGCAGATATCAAAGTGATCCAGGGGTGGATCATTGGACAGCGGTCAAAA
ACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGATATGGTTCTTTCTTATGGA
GGTGATGAACAGCTCGTTGTTAATGGTTACACCGATGCTAGTTGGAACAC
AGATCCGGATGATTCTAAATCGCAATCCGGATACGTATTTATTTTGAATG
GTGCAGCAGTTAGCTGGAGGAGTGCAAAGCAAAGCGTTGTGGCGAGATCT
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ATGGATGAAAGAGTTCATTACAGAGCTGGGTGTGGTTCCTAGTGCGCTGG
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GAACCAAGGTCACACAAGAAGCTGAAGCATATCAAGCTGCGTTTTCACGC
TATTCGAGAACATATCCAGGATGGGGATATAAAGATTTGCAAAGTACACA
CAGATCTGAATGTGGCGGATCCGTTGACTAAACCTCTCCCGAGGGCAAAA
CATGACCAACACCAAACTGCCATGGGTGTTCGGTATATTACCATGTAATC
TAGATTAGATGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCCTA
GAGGCAATAATAAATGTGGTTATTATTATATCTTTGTGTTTATGATAAAT
GTTTACATTCATGCTATAATAGTATTAACAAGGAAACATTGATACTTGTG
TGATTTGTAAACTTAATTTGAAGTCCCTAGTATAGCCTCTATACTTCACT
AGCTTGTTGGTTGATAGATGATTGTGGTTTCCCTATCATGAACATTGAGA
TGTTATCAACAACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGATATGGTGGACATA
CTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTCATTAGTTCAAT
TGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGAT
CATGCATATCACCTTTACCGGATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCAC
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GTTGAGACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCACATGACGGATA
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ATGTGACTTGGTCACAAGGGATCACATATCACGGGAACGAGAAAAGAGTA
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CATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGAC
GTTGTTTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGG
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CGGTGTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAATGTCCGGCACTC
CGGGGGGGGAGGGGTACATGAATGTGTCATTACATGTTGGAATGATTGCA
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TAGTTTGAAAAGTCAAACGGCTAGTTTGAAAAGTCAAACTGCCAGTTTTC
GGAAAGAGGAGAAGGAGGATTGGTGGAGGCCGAATTGGGGGAGGGTTCCT
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GGCGCGCCAGCCCCCTCCCACCTATATAAGGAGGGGCAGGGCTCCCCTCC
TAGACACACAACTTTCACCTCTAGATCTCCGGTTTAGAGCCGTTTTGGAT
TAGAGCTTCTAATTGCTTTAGCCAACGGTTTAGAGCCTTCTAATTGGTTT
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CATAAGCTCCACCATACTCGCACCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATT
TCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAATCACGAGGAG
AGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCG
TCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGAAGCGCTGCCGGAACGTGGCG
CCGGAAGGATCGTCTACACGATCTTGAGATCGGAAAGAGTACGACTACAT
CACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACGCTTTGGAATCTTCGAGGGTAA
GTTATACCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTTGT
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AATCTGTCGTGTGTTGTGTACACCATCTAGTGGTAAGATAGTATCCCCTG
CTTTAACCTGGGGTTTTTTGTTCTTTTTATTGTTTCACTCACAGATTGTT
TCATTTTTTATGGGTTATTTCTATGGAAAACAGGTTAAATATGTAGATTC
ACTGGTCGTTGAAATGCTTGTTACAAATTGCAAAGTTCAGGCGGAGGCTT
GGGACAGCAAGCTCATAGGCAAGGTAGTTAAAGCTGACAAGAAGCCAGGT
GGTGGGTTCGGGCATCTCAAAGTGAAGCCTAGCGTCTTGCAAAAACCTGG
CGGTGAACTATTTGTGGGTTATGAAGAGACCGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.