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GrainGenes Sequence Report: AA034352

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Sequence
AA034352
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034352
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTGGCTTTCCGCGCCACCGTATTGGCAGGCCGCGCCCAGGATGTTCG
TCGAAATGCCGACCCGTATGTAGTTTCTTGTACCTGCGGACCGTGGTCGT
CAGGAAGCTGGGTCTGGCTTGTATACCAGGCTTGGGATGCGTTTTGCAGT
GCAAGGCCCGTTGTTGGACATGATACCTAGGTGCTTCAGGTAGCCATTCC
TCTCATGTTCTATCAGTGGCTGCGCACTGAGTTATATTAATTTGAAATAT
GGTAAGTAGTCATATTACATTCTCAGTTTTCTCACTCTATTACATTCGAC
GCTTGGGTCTACCATTTGTTGTATCTAGTAATTGTGTAGTTCACCTCCAA
CTCTGGTGGGTTTCTAAAATCAGCTTATCCGGAGCAAACACCTGATAGCA
ATAATATCTGCATTTGAATGGAAACGGTTTTCAACCATTCACCAGAAGAC
AAAAATTTCACATATTTATAATATCCCCCAAGTTTGTGAAACTTAAGCAT
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CAATCTGTTTACACTCAGACCTCATCTGTAGAACCCATGGGACTAGTTCT
TTTGACGTGGATAGGACTGAAACAGGTCGCATTCCAGTGAGTAGCTCAAG
CAGGACTACTCCGAAACTGTATATATCGCCTCTCAGTGTAGCAACCCATG
ATTGCCCATACTCGGGGGGAATGTAACCCATAGTGCCGACCAGCTCAGTT
GTGACATGGGTTTGGTTGGGAAGTATCAATCTGGCTAGCCCAAAATCTGC
AACATAAGCTTTAAATTCTTTATCGAGTAGGATGTTGCTGGATTTGATGT
CACGGTGGACAATATGAGGCTTGCAAATATCATGGATATAAGAAAGGCCC
AAGCTTGCTCCTTGTGCGATCTTGAGCCTCTTCGGCCAATCAAAGAATGA
GCTGGAACCATCATCCCTGTTATGAAGCCAATCGTCCAGGCTGCCATTCT
CCATGTAGGAATATATGAGGAGCCTGGAGTTTCCGTGGATGCTGTAACCC
CACAGTGGTACAAGATTTTCATGTTGTGCCATGGAGAGTGTGTCAACCTC
TGCTCTGAACTCCCTTTCCATTAGACACATTTCACTGTTGAGCTTTTTGA
TTGCCAACTTGGATCCACCAGGTAGCTCTGCCTTGTAGACTAATCCATAA
CCTCCACATCCAATGATGTTCTCCTTGTCAAAGTTGTTCGTAGCTTTCAA
AATGTCAGTGAATTTGAGCTCGTTTTCTGCTCCTTTGCCTCTTGACATTA
CCACCAATGTTTGCTCTGAACTGGAGTTGAATGAAGTTGCTTCAACATTT
TCATTGTTCTTCTCCCTTGTACTTTTGGCTGCAATACCGTTGACCCTGAT
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ACACAGCTTTGGATTCCCATCGAAGCTAGAATTTTGAAATGTATTAAACT
GGCCTCCAGATGGAATAGGCCCTTCTAGGTCATTGTTCGAAATGTTGAAT
TCTGAAAGGAAGTGCAGGTTGTTCAATGCAGCTGGGATAGGACCTGTGAG
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ATTGTGGGATCTGTCCTGTCAAGTCATTAAAGCTGAAATTGAGTGAACGG
AGGGATTTCAACTATCCAATCTCCCATGATATCTCACCAGTGAATTTATT
TTTACTTAGATCTAGCACTTTAGGGAAAGCCATTTGTACACGGTATTGAA
GTGATGGAGATAAATAAATTGGTAACTCAAAGAATCTGGGGTCCAGACGG
GTTGCAGTATTCTCTGATCTTAGCATGGGCATCTGCATTAAGGCTGACGA
GATTTCCCCTGTCATGCTGTTATTTGATATGTCTAGATAGAAGAGGAGTT
TTAGGCTGCTGATCCAATCAGGAATCTGTCCTGTTAGTTGATTGTTTTCT
AAAAATAACATCTCCAAATTTGTTAACTGTGATAACCAATGAGGTATTTT
TCCTGACAATGCGCAATCTGTTATTGCTAGAACCTGAAGATTCTCAAAAC
CGGCAATGTATTCGTCATCTGGCATGGTCTCGTTCATAAAGTTGAGCCCA
ATAAGAAGGGTGGTGAGATTTTTGGACCTCCTAAGTATATGAAGTACGCT
TGCGATATCCGTAAGAGTGCAGTTAACAAGTGATAGGAACGAAAGGGACT
TCAGATTTCCTATATTTTCTGACAGCTGCCCGTGGAAATTATTGAAAGAT
AGCCGAAGTGCAGTTACATTTCTGCACAAGTAGATGCTTTCTGGAAATTT
TCCACTGAAGTTGTTCCACCCAACATCTAATGTTTTTAGATCGGGTAGAT
TGGAGAAGTTGATCTTGCTAAGCTCTCCAGAGAACATGTTCATCTTGAGA
TCGATGGTTTTGAGATTTGTACAGTTGCTCAGAGTTGATGGCAGATCCCC
AGACATGTTATTGTTGTTCAAATGGAGCTCCTCTAGTCTCTGAAGCTGAC
CTATAGATTCTGGAATCTTGTCACTGAAATTGTTCTCTCCAAGATCAAGG
ATTACCAGATTACTGAGTTTGACAATGTGTGCATCTTCAAGTGTTCCTTG
TAAAGTATTCTTGGGGAAAGAGAGGTACTCCAATGCGTTAGCATTAAAAA
GTTCATCTGGGAGAGGCCCACTGAGGTTGTTGTGGCCAACCTTGAGCACT
CTGAGCTTGGAACAATTCCCGAGTCCAGATGGAATTCTACCACTGAATTG
GTTGTAGCAGAGATCAAGCACAGCGAACGATGGCGAGCTGGTGCAGAAGA
GAGTTGGTAGCTTCCCAGTAAAGCTGTTATTACTGGCATTGAGTGCGACC
AGATTTTCCATCACCTCCCATGTGGAGGAAAGAAACTGTCCCGTAAACAA
ATTGCTGGAGATGTTCAGTACCTTCAGTGGACGGGGAGGAGTTGAAGATG
ACAACTCGTGCAGATCTCCGTCAAGGCGGTTAAAGCTGACGTCTATGACC
ATGAGGCTGCCAGATGACACCAATTCCTGTGGTAGGCCACCGGATAGAAG
ATTGTTTGACAGGTTGAGGCGCAGCAATCCAGTGAGGTTCCCAAGAGAAG
GTGTGATATACCCCTGAAGACTCCTGGAAGCCAGCAAGACATCGGTAACA
ATCTTATCTCTGCTACATGTGATACCTTCCCACTGGCAGCAATCGGTGCC
ATGCTGCCAGGACGCAGCGAGGCCACCATGTTGTGAGAGCCCGGCGAGGA
ACTGGAGGAGGGAGCCCTCCTCCTGCTCCGTGCAGGAACTGGTAGGAGAT
GCCAAGGAGATCAGCAGCACAAGAGCAAGACCAAGGGAAGGTAGGTGCAA
TTTGCTGCTGCATGTCTTGTGTGAAAAATGGAGTGACTGCATGTTTTGTG
ATGTAACTAGCATTGAAACCAGAGCTTAAGTTTCGCTCTGACTGGGTGAA
ACATCAATGGTCTAATCAGGAAGGTTGAGAGAAATATGCTGCTCCTGCTT
CCATTTTGTTTTGTCCTTTCTAGTCGTAGTCACCACAAAGAAAACTAGGG
TCAAGAGAATTGGATTTTACACCACTGCCCCCAGCCCACCAGCAGCTTCC
TAGTTCACACGCTGACATTTCAGTGTTCCACTATGGGCTTCCAGCTATAG
TCAATTTCCCAATTTCTTTAATACTGACCATACAGTTATCTTTCGTAGTC
ATCCTTGACTATTCTTGTTGAGTTTTAACAACATGCCTTAATTTACTTGA
CCTGACATCACATATTTTAACGGTTTCACTGAACAAACAAAACCTCTTCC
CACTAACACTTAAAAAATAATTATATCCTGATGCATCGTTTTTCCCTTTG
GTGAACAGGAAACATTATTTGAGAAAGAACAGATTTACAAGGACTCAATT
TGCGACATAGTTCACGGGAAGATCATTTCGAAAGGGGCTTGCAATCGAGA
GCATTCATCGTGTCTCAGTCACTGTGTGGACAAGGCCAAGTGGAGGGAAA
TAAGAATTTCAACTTTCTAGCTTAATTAATGGATGTGGTGGAGCGGGTGA
TATGTGGTCTCTTCCATCTCCTTGACCTGAGAGCGTTTGCTTCCTCTTGT
CAGTTATCATGCGGCATCGTCCGACAGGTACGTTTACTCAATTACTCTTT
TTCATTCTCCTGGCTCCATCCACTGGAGCACTATTAAGGACAGTGATGCT
TTTGGCTATCATGAATTTAGGAAGCGGTTCAAGTAAACTGGGGTTGAGGT
TCAAGTAAACTGGGGTGGCCCTTGGTTCTGATAATCTGATGCTTGTGTAC
ATAGAGTCCGGTCAGACATGGTTGCTTGTTAATTAATTAGTCCAACTGAG
TAGTTCTTTAAATATTTTCGAGGAATGGTATCTTTGGATGATGCTGTTTT
GATGCTCGTTTAGTAGGTGTAGATGTACTCTAGTTTTCTTTCCCGTCGTT
CTAGGATCCTGTCACTGAAATATTGCACAGGTGACCAATGATATTCATGT
TCCCGACTTGTTTTTGATATAACTGTTCTGATTGAGAGAAATGTAGCAAG
AGGCTGGCACTCTTTTTCTTAGGATTGACACCCTAATCAGCATTTTTTTT
ACAACAATAGAAAAATAAGAAGTTTTTTCTATTAGAAAACTCAGTTAGTT
TGAAGGAAATTCTGGGATCAGAAAACGTACTAACAATTGCAGAAAGTTAA
AAACATACCAGCTACAGTCACACGCTGACGTTTCAGTGTTCCACTATGGG
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TATCTTTCGTAGTCATCCTTGACTCTAGCCTTGTTGAGTTTTACCAACAT
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AAACAAAACATCTTCCCACTAACACTGAAAAAATGTACTATTTAGATGAA
TCTAGATACTATTTAGTATATAGATATATCCAAATTTTGATAAAATTTCG
ACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTACTTGTTTTTAGTACCACCTCGGTA
CTTCAGGTTAATACCGGGCTGGCTAAAATGTGACGCTCGCGAGCCGAATC
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GCGATAAGGATTCTCTCCGTAAGGTAACTACTGCACTCTATGATTCAAAT
AGCGGCCCAGTTGATTAAATTGTGAAGCTAACTGTTACAAGCCCGTCGTC
CTTGCAGGGGGCGCTTTTTTGTTTTGGCACTTGCCTACGGTATAATGGGC
GTATGTGTCGTCAGCAGCGCACCCAGGCCGTTCGGCAATATGCCGACCCG
GTGCCGTTTCTTCCACTGCGGCCGTGGCCGGCGAGAATCTGGGTCGGGCT
CACAGATCAGGTTTGGGCACCTAGCCTTTCCACCGCCTTCTGCTTTTCGC
ACTACCGTTATAGCTCCTCGCGGCCGGCGAGTCGCAACTCCGTCTCCACC
GCCGGGGTTGCCTCCTCCTCTGGTGCCACCGTACTCCCGCCGCATCCTCG
CTTCCAAGACCACGCCATTTCACGCGCACGCTCCGGCATCTACTCTCCGA
TGTAATGTCGGGCTTCTGTACTAGGGGCCGGCCGTGTCGGCAGCAGCGCG
CCCAGGCCGTTCGGCGAAATGCTGATCCGGATGTCGATTCTTGAACCATG
GCCGTGCTCGGGAAGCTGGCTCCAGCCTTTAGACCAGGCTTGCTACGCGT
TTTGAAGCTGTCAGTGAAATATGTAGTATTGTGCCTGATGGTAATCGTAC
TCCATTTAGTTTGACGCTTGAACCAATCAAACAATCTCATTCTTTATATC
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AGAAGCACTAGATCTAGTGAATCTAAGATAGTTTTGTTTACATCATGTAC
GAAAACACAAGTTTATCTATGATGTGTAGTTCGTTCCATATTGGCTGATA
TTTGCATCTACAGGTCAGCGTCTATACTGACCAGGCAGGAAACTACTTCC
ATGATAGTTGGCCTCATGAACTGATTGCAGTCGACACATTTGCAAGCGGC
TTCAAGCACCATCAGCATTTGCTCTTCACATCCAGTGCCTCGAAGCGTTG
GATCCAGGACCTCAACTTGTTTTCCCTCAGACCTCATCTCCAGCACCCAT
GGGACTAGTTCTTTTGATGTAGATAGGACTGGAACAGGTCGCATTCCAGT
GAGCAGCTCAAGCAGGACTACTCCGAAACTGTACATATCGCCTCTCAGTG
TAGCAACCCATGCTTGCCCATACTCAGGGGGAATGTAACCCATAGTGCCG
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CCCAAAATCTGCAACATAAGCTTTAAATTCTTTGTCCAGTAGGATATTAC
TGGATTTGATGTCTCGATGGATAATTTGAGGGTTGCATACATCATGGATG
TAAGAAAGGCCGAGGCTTGCTCCTTGTGCGATCTTAAGCCGAGTAGGCCA
GTCAAGAAATGGGCTAGCATCATCGTATCTGTTATGAAGCCAATCATCCA
GACTGCCATTCTCCATGTAGGAATATACGAGAAACCTCGAGTTTCCCTGG
ACGCAGTAACCCCACAGTGGTACAAGATTTTCATGTTGTGCCGTGGAGAG
AGTGTCAACCTCTGCACTGAACTCCCTTTCCATCAGACACATTTCACTAT
TGAGCTTTTTGATTGCCAGCTTGGAGCCATCAGGTAGCTCTGCTTTGTAG
ACTAATCCGTAACCTCCACATCCAATGACATTCTCCTTGTCAAAGTTATT
TGTAGCTTTCAAAATGTCTGCAAATTTGAGCTTTTTTTCGTCTCCCTTGC
CCAGTGGCATCCTCATCATCACTAATGTTTGCTCTGAACTGGAGTAAAAT
GAAGTTGTGTCAACATCTTCGTTGTTTTCCCTTTTATCTTTTGCTGTCAA
ACCCCTCATCTTGACTGAGACAAGGAGAAGCCCCAGCAACAAAAGAATAG
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TCTCGTTGTGTCAGGGAGGACGGAGGTATTGAGGATGGACCACATTTTTT
AATTAGCATAGAGCCACACAGCTTTGGATTCCCATCATAACTAGAATTCG
AAAATGTATTAAACTGGTCTCCAGATGGAATGGGCCCTTCAAGGTCATTG
TAAGAAATGTTGAATGCCGAAAGGAAGTGCAGGCTATTTAATGCAGCTGG
GATTGCACCTGTGAGATCATTGCTAGACATGTCCAGCACCTGTAGGCCTG
TGAGATCGCATATTGATTGTGGGATCTGGCCTGTCAAGCTGTTGAAGCTG
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ACCAGTCAATTTGTTATTGCTTAGATCCAGCACTTTAGGGAAAGCAATGG
GTACACGATATTGAAGAGATGGAGATATATAAACAGGCAGCTCAAAGACC
CTTGGGTCTAAATGGGCTTCGGTCTTCTGTGACTTCAGCATTGGCATATC
CAGCAGTATTGTTGGAATTACCCCTGTGATATTGTTACTTGATATATCTA
GATATAATAGTTTTCTCAGGGTTTGAATCCATGCTGGTATTGATCCAACG
AGTTGATTGTTTGATAAGATTAACACCTCTAAACTTGCAAGCTTTGATAT
CCAAAGAGGAATTTTGCCGAGCAAGTTACATCCATCGATACCCAAAACGT
GAAGATTCTCAAAACCATCAATTGTATCATCCTCTGGTATGATCTCATGC
TTGAAGTTGTGACCAATAAAAAGGGTGGTGAGATTCTTGAAGCCCCTAAG
TATGCGAAGAGCCCTTGTGATATCTGTAAGAGAGCAATTAGCAAGTGATA
GGAATGACAGGGACTTCAGACTGCCTATTCTTTCTGACAACTGGCCATGG
AAATTATTATAAGATAGCCTCAGTGCAGTTACATTGCTGCAAAAATAGAT
GCTTTCTGGAACTGTTCCTGTGAGGTTGTTCCACCCAAGATCTAAAGTTT
TTAGATTGGGTAGACTGGAGAAGTTGACATTAAAAAGTTCACCACTGAAA
CTATTGCTCTTGAGGTCAATTGTGACGAGATTTGTGCAGTTGCTCAGAGT
TGATGGCAGCTCCCCAGACATGTTATTGTTGTTCAAATGGAGCTCCTCCA
ATCTCTGAAGGTGGCCTATAGATTCCCAAATCTTTCCACTGAAGTTGTTC
TCTCCAAGATCAAGGATTCTCAGATTGTTCAGTTTGGCAATATGTGCACC
TTCAAGTGTTCCTTGTAATCCATTCTTGGAAAAAGAGAGGCACTCCAGCG
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GCATTCAGTGCTATAAGGTTCTCCATTGCCTTCCATGTGGTGGATGGAAA
AGGTCCTGTAAGTAAGTTGCTTGAGATATTCAGTACCTGCAGAGGCCGAG
CAGGGGATGAAGCTGGCAGCTCCTGCAAGTCTCCGTCAAGTTGATTAAAG
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GCCACCGGATAGAAGATTGTTTGACAGGTTGAGCCGCAGCAATCCAGTGA
GGTTCCCAAGAGAAGGTGTGATGTGGCCCTGAAGACCCCTACAAGCCAGC
AAGACATCGGTAACAATATTATCTCTGCTACATGTGATACCTTCCCAGTG
GCAGCAATCTGTGCCATGCTGCCAGGACGCAACGAGGCCACCGTGTTGTG
AGAGCCCCGCGAGGAACTGGAGGAGGGAGGCCTTCTCCTGCTTCGTGCAG
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GAAAGGTAATTTTCTGTTGTACTTCATGCATGAAAAGTGGAGTGGCTGCA
TGGTTTTCTGATAATGAAGCTAGCATTGAAGCCAGAGATTAAGTTTTGCT
CTGACTGGGCGAAACATCAATGATCTAATCACGAAAGAGCACGGGTTGAG
AGAAATATGCTGCTCCTGCTCCTGCTTCCATTTATTTTCTTCCTTGTAGT
CGTAATCACCACAAAGAAAACTGGGGTCAAGAGAATTGAATTTTACACCA
CTGCCCCCAGCCCACCAGCAGCTTCCTAGTTCACACGCTGACGTTTCGGT
GTTCCACTATGGGCTTGCCAGCTATAGTCAATTGCACAATTTCCTTAATA
CTGACTGTACATACCGGAAAATCTTTCATAGTCATCCTTGAATCTATTCT
TGTTGAGTTTAACAACATGCCTACTTTGTTTACTTGACCTGATATCACTT
CTTTTAACGGTTTCACTAAACAAGCCAAACCTCTTCCCACGAACACTGGC
AAAATATATATTTCCTGATGCATACCTTTTCCCTTTGGTGAACAGGAAAG
AGCACGTTTTGATAAAGAGAAGATTTGCAAGGACTCGATGCGTGACATAG
TTCACGGGAAGATCATTCCGAAAGGCGCTTGCGATCAAGAGCACTCATCA
GTGTCATAGTCAGTGTGTGGACAAGGCCAAGTGGAGGGAAATAAGAGGTG
CAATCCTCTAGCTTAATGGACGTGGTGGAGTGGGTGGGTGACCTGGTGAT
CAGATCTGTGCTCTCTTGTCTCTTCCATCTCCTTGACCTGAGGCGTTTAC
TAGTACGTATATGTTTGCTGTTGTATTCCATTTCCCCGGCTCCACTGGCG
AACTATTGTAGGGATTGTGATTCTGTGGTTATCATCTCTATGCGGGAGCG
GCTCAAAGTAAACTGCTTGGCTGGGATTTGATTCTTGTGGGGATGCTTTT
GTTATGTGGACATGGTCTTTGGAACAGGACCATGAGGTGATGGGATCATT
AATTGGGTTTTGCTTCGGTTGAATAATTGGTGTTCAGAATCAGATATCTT
TCTTGGTGCAGGTTTGGTTTAACTTTTGGATGATGTTTTACTGATGCTAG
CTGCACTGTATCATTGATCATCATACATGTAGCTATATTTAGAGGATATC
AAAATACATGTGGTTAATAATATTTGTGTTGTGATTGAGAAAAAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.