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GrainGenes Sequence Report: AA031761

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Sequence
AA031761
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031761
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGGCGTAGTGGCCCCCAACCCAATACGACAGCGCTCCATTATCCATGC
CCCGTTGGTCGTAGCCGCCTTCCTGTTGCGCGGCGGCCGCTCGCTTGGGC
CTTGGCGGAGAAGGATTTCTTCTCCCGCTTCGTCCCGCCCGGGGCCGATG
AACCCGCCGCCGCAGTGCTCTCCCGCCCATGCGATCTTCGGCGCTGGCCG
CTAGGTGCCCGCGGCACATTTCTGTTAGAAATAATGGGGCTAATCCATTT
AGGTCTATGTGTATTTCAGATTTTCCCTAAATCTCAAAGTCCAAATTTGT
GGCAGTCCATATGTGTTTGGGCCCATGTTTGTGGCAGCTCACATGGAAGT
GGAGTGGGAGCTCAAGTTTAGTCCCATATGGAAAGTTGGAGGAGAGTTGC
ACCACCTTATAAGGTGGAGTGTCGCACCACTTTGTAAGTGAGTGGCAATA
AGAGAGATATACACGCGCGCTCCTCCTCCGACGACGACGCCGCTCGCACG
CACGTCTCGTCTCATCACGCGCGCGCGGGGGTTGCGGGTTGCGGGAATCT
CGCCGAGCCGAGCTTTATTTTGTTGCTCACCGACCCGAATGTGCATAACG
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TAAAGTCCTGCGCGGCTACCGCCACAATACCACTGAAAACCAATCTAGGG
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CCTTGTGATCCTGTACGGGAGAGGGCGAATAAGGTTTTTGGGAAGCGCTC
CGCGCGACTGCTTGAGTTCTCCATCACGGGTAGTCTTTCATCCAAGTCAG
GCGATGCTGCCTACCGCCGTCTTCGTCGCCATCTGCTGCGATCACTCTTC
CCCAAAGTTTCTACTACGACAACCGAACGGTACGTGCTACGTGATCCTGT
TTGGTTATTCATCATGTTCTGCGAGTACATGTTAAGCTGCTGTTTGTTTC
CGATCATCCTGTTGTTTAGTATATCTAGTATGTTCAAGTTACATGAGCTA
GTAGCTGGTTTTGTCATGATTTATATTCTGGAATTAATCATGGAAATTAT
GCCTAATAATCCAACAATCCAAAAACCTTATTGTATGCAATTTCCTGAAT
TAACAATGGCTGGTTTTACCGATGCATTGAGGCCGGATAAGTTTACCGGT
GTGCACTTTAAAAGGTGGTAGTACAAGTCTGAGCTTTGGCTGACCACGAT
AAAAGTGTTCCATATCATTAAAGGCAAACCTGAAGGAACTATATCTGACG
AGGATCAGAAGAAGTTCGAGGATGCCAATACTGTCTTTGTGGGATGTATT
CTGAGCATTCTTGCTGACCGTCTGTGTGATTTGTTTATGCACATAAAAGA
CGGGAAGGAGCTCTGGGATGCACTGGATGCCAAGTTTGGTGCTGCAGATG
CTGGCAGTGAACTGTATATCATGGAGAGATTTCATGATTTTAAGATGACT
AAGGACCTTCCTATGGTTCAACAAGCTCATGAGATACAGTGCATTGCCAA
GGAGCTCGAACTCCTTAAGTGTACCTTACCCGACAAGTTTGTGGCGGGAT
GCATTATTGCTAAGTTGCCCCCTTCATGGAGGAACTTTGCCACAACTCTC
AAACACAAGAGACAGGAGATATCAGTTGAAAATCTGATAGCGTCCCTTGA
TGTTGAGGAGAAGGCTCGGTCTAAGGACACTACTGAGAAAGGAGAGGGTC
TTGCTACTTCTAACTTTGTGCAGAAAGGCAAATCCGTAGGCAAGAACAAA
GGGAACTTCAAACCCTCCTTTAACAAGCCTGTAAAGACTACAACCTTCAA
TAAGAAGAAGGCGAACAGGGACAAGAGTGAACTGTCTTGTTACACTTGTG
GAGAGCCCGGCCACTTTTTCAAGGACTGTCCAGAACGCGCAGACCGCAGA
GGGAAAAAGGCCAAGACTGTCAACGTCGTGACCGCTAGCAATACTGATGG
GTATGGTAATTTATTTACTGTTCTTTCAATATTTCAATCACCGTGTTGGT
GGCTTGATACGGGTGCTAATGTTCATGTGTGTGCTGACATCTCTATGTTA
ATTTCTTATCAGGTTGCTCGAGATTCATCCGTCCTAATGGGGAATGGATC
ACATGCTTCTGTTCGTGGTGTTGGCACGGTGAATCTGAAGTTTACTTCCG
GAAAGATCGTGCAGCTGAGGAATGTGCAGCATGTCTCTACTATGAATAAG
AATCTCGTTAGTGGCTCCCTTCTTTGTAGAGATGGGTTTAAGGTTGTCTT
AGAGTCCAATAAAGTCGTTGTTTCGAAACATGGACAATTTATTGGTAAAG
GTTATGAGTTCGGAGGCTTGTTCCGATTTTCACTTTCAGAGTTTTGTAAT
AAATCCGTGAATCATATTTGTGGTGGTGTTAATGATGATACCAGTTTTTA
GCATTCTCGTTTATGTCACATTAATTTTGGTTTGATATCTCGGATGTCCA
GCATGAGTTTAATTCTGAATTTCACTATTGCCAAAGGTTCTAAGTGCCAT
AGTTGTGTGCAATCAAAAGCAACCTCGAAAGCCTCACAAGGTTGCCGAAG
AGAGAAACTTGGCACCTCTAGAACTCATACATTCTGATCTATGCGAGATG
AATGGTGTGTTGACAAAAGGTGAAAAGAGATATTTCATGACGTTAATAGA
TGATGCTACTAAATTCTGCTATGTTTACTTGTTGCAAACTAAAGATGAGG
CTTTAGACTACTTTAAAATCTATAAGGCCGAAGTTGAAAATCAACTAGAG
AGAAAGATCAAGTGTCTTAGGTCGGATCGTGGTGGTGAGTATTTTCCCAA
AATATTTGATGAATTTTGTCAGGAACACAGAATTATTCATGAGAGGACGC
CTCCCTACTCGCCCCAATCAAACGGGGTTGCCGAGAGGAAAAAACGCACG
CTGGCTGACTTGGTGAATTCCATGTTAGACACTGCCGGTTTATCAAAGGC
ATGGTGGGGGGAGGCCTTGTTGACTTCATGTCATGTCCTGAATAGAGTTC
CTAACAAGAATAAAGAAAAGACCCCTTATGAGGAGTGGGTTGGGAGAAAA
CCATCACTTTCGTATCTGCGCACTTGGGGGTGTTTGGCGAAGGTCAACAT
ACCAATCCCTAAGAAACGCAAGCTCGGACCCAAGACAGTGGATTGCATCT
TTCTAGGATATGCTCCACGGAGTGTAGGCTATAGATTTCTAGTGGTTAAA
TCTGAGGTACCTGATATGCATGTTGATACTATAATGGAATCTCGTGATGC
AACATTCTTTGAGAATATTTTTCCTATGAAAGATATGCATAGCATTGGTA
GGATTTCTTCTGAAATACTTCCTGAATCTAGTGCATCTATTGAGAATTCT
GAACAACCACATGAGGAATTTCTTGAGAAGGATGACGATGAACTTCTCAC
GAGGAGTAAGAGATAGAGGGTTGCAAAATCCTTTGGTAATGACTTCATCG
TGTACCTTGTGGATGATACTCCCAGATCCATTACTGAGGCATATGCATCT
CCTGATGCAGATGATTGGAAAGAAGCTGTCCAAAATGAGATGGACTCGAT
TCTTTCTAATGGAACTTGGGAATTATCAGAACGACCCTATGGTTGTAAAC
CTGTGGGATGTAAGTGGGTATTCAAGAAAAATCTAAGGCCTGATGGTACT
ATTGAGAAGTACAAGGTGCGTCTTGTAGCTAAGGGCTACAAACAGAAAGA
AGGCAGAGATTACTTCAACACCTATTAACCTGTCGCTAGACTGACCACCA
TTCGAGTACTACTATCCCTGGCTGCCTCTTATGGTCTTCTCGTTCATCAA
ATGGACGTGAAGACAGCTTTCCTTAATGGAGAGTTGGAAGAGGAGATCTA
TATGGATCAGCCGGATGGGTTTGTGGTAAAAGGTGAAGAGACAAAGGTGT
GTAAGTTATTGAAATCTTTATATGGCCTAAAACAAGCACCTAAGCAATGG
CATGAGAAGTTTGACAGAACTCTACTTTCTGTTGGCTTTGTCATTAACGA
GGCTGATAGGTGTGTTTACTATCGCCATGGTGGGGGCGATAGCGTTATAT
TATGTTTGTACGTGGATGACATTCTGATCTTTGGTACAAACATGAAAGTG
ATAAATGAAGTCAAGTCTTTCCTGTCAAAGAGTTTTGATATGAAAGATCT
GGGAGAGGCTGATGTCATTCTGAACATCAAGCTATTAAGAACGAGAATGG
GATTACTTTAACGCAATCTCATTATGTTGAGAAGGTCTTGAGCCGATTTG
GCTTTAATGATGGCAAGACTTCTCCAACACCTTATGATCCTAGTTTGACA
TTACGAAAGAATAAGAAGGAACCGACAGATCAGCTGAAATATTCACAAGT
TGTTGGTTCTCTCATGTACTTAGCAAGCGCTACAAGACCCGATATCTCTT
TTGCTGTGAGCAAGTTGAGTAGGTTCATGTCTAACCCGGGTATTGATCAT
TGGCATGCACTTGAAAGGGTCATGCGCTATCTATGTGGTACAATGAGCTA
TGGGATTCACTATTCAGGGAATCCTGCTGTGCTTGAAGGATATAGTGATT
CGAATTGGATCTCTGACGTTGATGAACTCTACGCCACGGGCGGGTATGTG
TTTACCCTTGGAGGTGGCGCAGTGTCATGGAGGTCTCGTAGACAAACCAT
ATTGACGAGGTCAACTATGGAAGCAGAACTTACTGCTTTAGACACAGCCA
CTGTTGAGTCAGAATGGCTGCGTGAGCACTTGATGGACTTGCCTGTGGTT
GAGAAACCTGTGCCGGCAATCCTTTTGAATTGTGACAACCAAACTGTTAT
TGTCAAAGTAAACAATTCTAAGGATAACGCGAAGTCATCAAGACACGTGA
AGAGACGTTTGAAATCTGTCAGGAAATTGAGAAACTCCGGAGTAATAACT
GTTACGTATATTCAAACAGACAAAAACCTGGCAGATCCCTTTACAAAGGG
ACTATCACGAAATGTGATAGAAAGTGCATCGAGTGAGATGGGGCTGAGAC
CCATGGATGTCACACCTTAGTGGTAACCCAACCTATGTGATCGGAGATCC
CGTGAATTAGGACCTGGGAAGAACAAGCTAGTGGTTTGACTGAGGAGAGT
ATTTTGTAACCCTCTCTATGTGAAGATGCATAACTCTCATAATCTGTAAG
GCAGGTTGGCAACATGTCTTAATGTGTTTCTGTTGGCTTTAATTAGCAAA
GATGCCGTCCTACAGGGCATTCTTGAAAGAACACACCTATATGAGCTCGA
CTGTAAACGTCGCGGTCTATGAGATTTGGGTGATGTCTAGTAAACTCATG
AAGAGACCAGGGAGTATGGCGCATATGCTCCAACCCGCGGGGTAGGCTAC
TGACAGCCAAGTACTAGTTATGATTTTGAGCGAAATCTATTGGCACCAAA
CTTGCAATTCAAGGTTCGTCCATTGTTCAAGTTGTTGATAGACGTAGTTC
AAGATTCTAGGCGGAAGTTCAACTTAACAGTCTCTACTGAAACACTGGTA
TATAAACAAGTAGCAAGGATTGACAAATCTTCAAATGGGCATTTGAGATC
TGGTGGGGGATTGTTACAAATAATGGGGCTAATCCATTTAGACCCATGTG
TATTTCAGATTTTCCCTAAATCTCAAAGCCCAAGTTTGTGGCAGCCCATA
TGTGTTTGGGCCCATGTTTGTGGCATCTCACATGGAAGTGGAGTGGGAGC
TCAAGTTTAGTCCCACATGGAAAGTTGGAGGAGAGTTGCACCACCTTATA
AGGTGGAGTGTTGCACCACTTTGTAAGTGAGTGGCAATAAGAGAGATACG
CACGCGCGCTCCTCCTCCGACGACGCCGCCGCTCGCACGCACGCACGCTC
GCCTCGCCTCGCCGTGCGTAACGTGGACTCGGCCCACGTTCGCCTCCGTT
AGGGTTTACTGGGCCGCTCTATATAAAGTTCTGCGCGGCTACCGCCATAA
TATGTACGGGAGAGGGCGAATAAGGTTTTTGGAAGCGCTCCGCGCGACTG
CTCGAGTTCTCCATCACGGGTCGTCTTCCATCCAAGTCAGGCGGTGCTGC
CTACCGCCCTCTTCATCGCCATCTGCTGCGATTACTCTTCCCCAAAATTT
CTACTACGACAACCGAACGATACGTGCTACGTGATTCTGTTTGGTTATTC
ATCATGTTCTGCGAGTACATGTTAAGCCGCTGTTGGTTTCCGATCATCCT
GTTGTTTAGTACATCTAATATGTTCGAGTTACATGAGCTAGTAGCTGGTT
TTGTCATGATTTATATTCTGGAATTAATCGTGGAAATTATGCCTAATAAT
CCAACAGTTTCTTGTCCACATCCTCTCTTGATTTTCTTTCGCTGCATCGG
TGAGGTTTGAAGAATAGTTTATCTTCCTGACAAAGGTTCATTTTATCTTT
CTTCCTTGCCTTGATTTTCAAGGACATCTTACGAGATTTTGCTTTGCATT
TATAAACACGGGCGTCTGAAATTTTGTTTCACTTACATCCAAACCAACAC
AGTACTAAATGTTTGTTTAGTTCTCCGATTGGTTGCAACAGGCCTATTGA
TTATGTGATGGCGGCGCATCTTGGGGTGTTGCCCTTTTTATATGCATTAT
CATCATGTCAGTAGGCCATAGCCCATAGGCACGTGAGTGAGATTAACAGA
GAACAAAATTACAAAACACACAGCGCACCTTCATTCAGACAGGTGCATCT
AGGAAACGACGAGGCCTAGCCTAGATTAGATAAACCTGCTAATTCTACAT
TATTAGTTGGTCTGTTCAGACAGCATGACAAGTGACAATGACAGGGATCC
CGTGATTGATTTTGTTACGACCAACACGTCTACAATTTTTGAACTCTTTG
GTAGCAGTGCGGGACCACTCCGAAAATGACATTGTTGTCCTGATCGATCT
TGTCTTACAAACTGTTCCGTCCACTCTTATTCGTCATATACACATGTGTT
GAACTTGGCGGCCAAGCTGCCTCCATTTGTCTCCCATGATTTATTTTACT
CCACTTGACTTGGGCATGCTAAAATTGACTGGTTGAACAATGTTGAACTT
GGCTGCCAAGCTAGTGCCCTCTGTTTCCTCTTGGTTTCCTGACTGAATAA
TATGTCCTATGAGCTATGAGTTGCCGGCCTATGGTAATATTGATGAAGCT
GACTGGCACATTCTTCCACAGACATGATAAATACACCCTCATTTCACTTG
TAAACACCTACTACCCTTTTCAAAAACAAAGTGTGAGGTTTCTGGTATGG
TGCCAAGCAGCATGGAGGAGCCCCTTGTTGGGGGCAGCATTGAGAAGACA
GGAGGGCTGAAAGAGAGCCTGGTAGTGACCGAGATCAAGAAGCAGCTGTA
CCTTGCCGGGCCTCTCATCGCTGGATGCCTCCTGCAGAACGGCATCCAGA
TGATATCCGTCATGTTTGTTGGTCATCTTGGTGAGCTCGCTCTCTCAAGT
GCCTCCGTCGCCACCTCCTTTGCTGGTGTCACTGGCTTCAGCTTGTTGGT
ATATTATGTGAATTTTTTTCTCTTACATAAGCTGGACCTCCTAAAAAATT
AGCTCAGCCTGAATGCCTTTTCTTGTATCTGTTCATAATCAATTTAGGCT
GGCATGGCTAGCAGCTTGGACACACTTTGTGGGCAAGCCTACGGAGCAAA
ACAGTACCATCTTCTAGGCATCTACAAGCAGAGGGCAATCCTTGTCCTTA
CTCTGGTGAGTGTTGTGGTTGCGGCAGTCTGGGCGTACACTGGGCAGATC
CTTCTGCTCATCGGCCAGGACCCGGAGATTGCTATGGGGGCAGGGAGCTA
CATCCGGTGGTTGATTCCAGCACTATTTGTTTACGGGCTGCTGCAGTGCC
ATGTTCGGTTCCTGCAGACGCAGAACATAGTTCTCCCTGTGATGATGAGC
TCAGGTGTCACGGCGCTGAGCCATGTTCTTGTGTGCTGGTTGCTGGTGTA
TAAGCTTGGTCTGGGTAACAAGGGTGCTGCCTTGGCAAATGCCATCTCGT
ACCTAGCCAATGTGTCCATCTTGGCTATCTACATCAGGGTCTCTCCAACG
TGTAAGAATACTTGGACTGGGGTCTCAAAGGAGGCGTTCCGCGAACTTTT
TAGCTTCATGAGGCTTGCCGTTCCATCTGCTCTTATGGTTTGGTGAGTTC
AATATTGTGCCCCTCAAATTGAAGGTAGATACTTTCGTGTTCACCTTCAG
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CCTGGTGCTTCTTTCTGGACTTCTCCCGAATCCTAAGCTCGAAGCGTCAG
TATTGTCCATCTGGTGAGTTGCATTTTGACGGGGTATGTCACAGTCTGTT
TGCCATGTTCTGATAGGAAACATGGAAATTCTTGCAGCCTAAACACAGGT
TCATTAGCATTCATGATCCCTTTCGGGCTTGGGGCAGCCATAAGGTAAGA
CTGAACAACTCAAACTCATAAAGTTTATTATGGATATATTGCAAATTTTA
TCATATAGTTAATTTGGTAATGACATCGTTTATCTTGTATTTTTAGCACC
CGAGTTTCAAACGAGCTTGGTGCTGGGCGGCCACAAGCTGCCCGTCTGGC
TACTCATGTGACCATGGTTCTGGGTCTCGTGACGGGTGTATTGTTAGGGC
TTATTATGATTTTGGTGCGCAATGTATGGGGGTATGCTTACAGCAACGAG
AAGGAAGTCGTGGACTACATTTCCAGAATGATGCCAATTCTGGGCATGGC
ATTTGTTTTCGATGATATGCAATGTGTTCTTTCAGGTATATATATAGATG
ATACTCCAAATGATGCAAGTTTCCCAATTACTTGGAGCCTATTTTCTTAT
TTCCACCTGTGCATATGTTCCTGTCTCGTGGTTCCTGCTATAACAATGCC
TGCTCTTAGTTTTCCTTGGTTCCGATTGTGTGCTTGCATATGGCAATACA
TATGATTTCAGCGAACACTGTTCTCAATGTACTGACTGCAATGTGGTACG
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TTGTGTCAATCTCAGTGCATACTACCTTGTCGGCGTTCCAGCAGCGTTAT
TTTTTGCCTTCTTCTACCATTTTGGCGGAATGGTAATATAAAAATTTACC
ACCCTTATCACATAAAAAAGTTTTAATCTCACTTATATTTCTGATTAGAA
GAAACGTCTAACAAACTGCGGTCTGAACTTCAGGGATTGTGGTTCGGAAT
AATGTGTGGACTCATCGCGCAGATGCTTCTGCTACTGTCCATTACCCTGT
GCACCAACTGGGAGAAAGAAGTAAGCAAATCAACCAAACCTCCTGTCACC
CATCACAGACTCATTATTTTGTTGGCTTCAGAATATCTTGAATTTTCAAT
GTGTGGCCTATAATCTTTCACTGTGCTTCCCTAGGCTTCCAAGGCAAAGG
ACAGAGTTTTCAGTTCTTCCCTCCCTCTAGACATGACGACATGAACATGC
AAGATGCATCTTGGTAAGAACACGGTGCAAAGGAGAGACACGGAACTCAC
GAAGAATTTGTCGCGAAGAAAACTGTCGCGTCTCGATGTCACCAGCAGCA
TGGGCTTCCTTCAGAGACGTCGTCAGACTGTTCTGCTTTGGTGATTTTTT
GCGATGGAGTGGCATAAGATGTACTGGCAAGCAAACGCATTGCCTTGATA
TGATTAGGCCATATGAGAATAATAAATTGTTCTATTGACCAGAAAATCCA
CAGTATGGATGCAACATTTTTCCTTGTAACTTAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.