Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA029574

[Submit comment/correction]

Sequence	AA029574
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA029574
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCGCACGAGAGTTGGCGAGCAGAGAGCGCTCGACAGGAAGGCGGCGCC GGCGGCTGCTCCGGTGAGTCTCCCCTTCGTCTCCTCTTCCCATCCCTAGT CCTGCCCTCTTGTTTTCCTTCCCGCACCCGTAGAGCTTGCTGGCGGCGGC CATGGCGTCTGCCCCTCCACTTCCCCGCCCCAAACCCTAGATCGAGCAAG GAAGCATCGGTCGGAGGGGAAAGCGGAGGGAGGACAATGGCGGCAGTAGG GCAACGGCCATGGATTTCTCCCCCCTCCACTTCCTTGCCCTCTTGTTTTC CTCCCCAAGCTGAGCTGCTCCCGATTGTGGGTAGGGAGTACTGTGGATTT TTCTTTGAAATTGTGGCTCACGGGATGTTCTTCGAAATTGCAGATGTGAA AGACTGAAAGGTTAAAAATCAATTTCTGTCTCTATGATTTGAGATATACA TCAAATATACACAACTATTTGTATATGTAGACAAGGTCGTATTGCCAAAA CTGAACAAAATTTTCAATTCCATGGCCTGCACATCCAAACAGGATTTAGA ATTGGGTGCTAGCCTATGATTCCGAGCAAAAATTTCATATGCATCCAAAC ACCAGAAGTGGAATTGTAGTCCATTTCCTTTCCAACATGGATTTGGAATT TCTAGACCAATTTAATTCCAAGCTAAAATTCATACATCCAAACACAGTGT TACCTTTTGCCACTGTTCTTTTTTTTTTTTTTGAAAATTGCTTATTTTGT CCCACGCTGGCCCAATTCTGTTCCCACCTCTTAGCTAGAATAGGTAGACT ACGCTCACACTACTGATGATATGGGCCGGGCCTAACTGGCCTTTTACTTT TCTTTTGTTTGTTTTCGAAAATTTTCCTGGCTTTGTTGTACTATTTTTCT TCTGTTGTCTTTGGCTTTGTTATTTTTTATTCTTGTTATTTTCCATTTTA ATATAGTACTTCCTCGCTTAAGCCTTATATTTTTTTTAAAAATTCAATCC ACGAAAAGTTTGACCAAACTTTTAGAAAAAAACTATCAAGAACTATTATA TTATATAGATATCGTGTGAAAATATGTTTCATGATATATAAAAGGGTATG GATTACGTATTATAAATATTAATATTTTTCTCTAAAAACTTGGTCAAACT TGAGATAGTTTGACTTTTGAACAAAAATATAGGCCTTAAGACTTGGGACG GAGGTAGTATTTGTTTTCTACCTTTTACGTTTTTTCATCCATAAAACCTG GATAGAAGTTTTTTACAATGCTCTCTATACTTACTTTTTTGCTTCATCGT ACATACTTTATTCATGATATTATTTTTGAGCCAAAAAATAGTGAAAATCA CTGATCTTTATGCAAAGCTTGCAAGCCTAGCTAGGAGGTGCACATGCGTG GGGGCTCAAGAAATTCCTCTCTCGGGTACCAAATCAATATCAATAGATAC ATCGTGAAATACATTTGTGCCCGTGTGCTTATTTGGCATTATACATGTTA TTATTTTTCTATAAACTGGGGAAACCTAGATATTCTTACTTAGGAGAAAA CTTTTATGTTTTTCATTTTTGAAAGTATTAAGCATATTCAAAATAAGTAT CTCGATACTAACCAGTTACCACTACGAATATATAGCAGGCTAGACAACGT GAGTTTGAATCCTTTTACACTTATATACATCCTCTTTAAATTTGTAAGGG GGATCTCCCTCTTTGACTTCTAAAGTTATATTTTCTGAACAAAAAGATCA TTATTTGTCCCCAACCATTTTCATTAAGTAGATTTGATTTTGGACTTCAA AATTCGACTAATTTCGTCAATTTGTTCTAGTATTAAATAGATATATGGTC CCTTGCCTCTAGTTAAAGCAACAGAGCCAATAATGTGGCAGCCCACCCAT CATAGATGGAATTTGAAGAGAAATGTTGAGGTGGTAACCTAACAACATGT GCTTATTTTTTTAGGAAATTTGAGTATTATTTGATATCTAAATTGTATTA TAAGAATATATTTTTAGGGTAGGAGGGGACATGGCTCACATTGGGAATAT GGAAGCTCCTCCATATTGTCTTGCAAAACAACATGAAAGAAATACTACTA CAGTACTTGAAGATTTACAAAAACAAAATATAGAAAAGAGATGGAGAAAT AAAACAAAATTCTCGGAGAAACGTAAATATTTAGTGACAAAATGTGGAAT TTAAATGTGAAAAGAAAATCTAGGCAACTAAACATAGGAAAAGATTTCTA GAGCAATTTTTTTACATTTCATGACCTTTCCTAAATCATTTGAGAGTTTA CTATTTTCTACTTCTTCAAAGTGCTTCTATTTTTTCATTTTCTATTTTAG AAATCTTTCACTTTAAAATCCCCTACTATCTTAACCAAATAAGCACTCAA GTTTGGACCCACAAGGACATGAGCCTTTTTTATGAATAGTTTGGGACCTT CTATTTCCTTCCTTTTCTAACTAATTTTCTTGTGTGCGAGCCACCACCAT ATTATCTATCCATTTTTTAAAGAGTAAATTGCAGTTTGGACATAGTAAAA TGGTTTGATTGGACATTGTGCCAGGTAACAATTGTTGCACATAGCATGCA GTAGGGTGTCTTGCACTATTTTGCACTTTGGACCTGGTAAGAGTGGTTTG AATGAAACCAGTCTTTTGACTAGAGAAAAGATGTCCACCCTAAACCACTA GTTTGTGTCATCCCAAATATGATGTTTTATTCTTTCCTCCTGTCCTAAAA AGTAACAAGTAGAACGCCATATCTAGTGGGGGAACATGAGGATGACTCCT AAAACATAGGAGCAATTGAACATCTCATATTTCTCTCTCTCCTATGACAT GTGTCCTGCCACCTAATTTCACTTCCCTATTTGAAACATGTCATTCATAT CGCACTGCCATGAAACACATCGATCATGGCGCCACCATGATTGGCTTGTG TCGTGCGTGAGGCCAAAAAGAAAAATGGCAGAGGACAAACATGGATTTAT AGTCAAACATTTCTGGTGCTTTGAGTTAGAGTAAATAATTGCATGGTCCT TTAACTTGCATGATGCGGTCACTTTAATCCATCTTATCACAAAATGCACA AAAAGCTCCCTAAATTGTGTAAAGAGGTCATAAGGGTCTTAATCTGTATT TCATGTCAATTTTTAACCCGTGTCAAAATTAAATGAGTGATTTCCAAATG TATTAAGTTTATTAATGAGTGTTGTGCTAATTTATTTGTGACACATATCT CATTTTCTTGATAGTAGTAAATGTTGAGGGGATGTTTGAAGAAACAGATG CATGCCTGCAAAACATGGTATGTACTTCTCAAATCCTTTTCTCGGTCGAA TATTTGAGTCACTTATTTTCATATGTGTATTTCTCAACTAAATTAGGAAT GGAAGGCAAGGATAAAGAAGCAGCTCCGGGAACCCAGATTGTTCCCATCT GCGTACGACACGGCATGGGTGGCTATGGTGCCCTCGTTAGGATCATATGA GGTTCCGTGCTTCCCATTATGTGTTGAATGGGTACTGCAAAACCAACAGA GCAATGGATCTTGGGGTATTGCTCAAACTGACTCCTTAGTCAACAAGGAT GTCTTATCATCCACACTAGCTTGTGTTCTTGCACTTAAGAGATGGAATTT CGGCAGGGAACATATTAGAAGAGGTATGAACATAGATGAATTTACTTTAT ATTAATATTGTTTTTCTTACTTATATTAACAAGTTTTTAATGTCTTGATG CGATAAAAATGATACTTACAGGGTTACATTTTATTGGAAGAAACATTTCT ATTGCCATGGACAAGCAGATTGCTGCTCCTATAGGCTTCGATATTATTTT TTCGGGTATGCTTAGTCTCGCCATTGATATGGGCTTGCAGTTTCCGATTA GAAAAACTGACGTTGATGAGATTCGTCACCTCCGAGAGATGGAAATGAAA AGGTTTGTCAGTGATAATCCTAGCACAGATTCCTAAAAGACAATTTTAGC ATGAAAATTGTTTTGTATTTCATGTCCGATCATGTCTGTACTCTAGGGAA AGATGGTTTTGAAATTTAACTTGTAGTGTTTCTTTTTTTTAATCAGAATT TGAGTATCACATGTATTACCTTTTAGTAATACTTTGAAACTCCTCACATA TTCACTTAATACAGACTTGCTGGGGATAAATCTTTTGGGAGAGAAGCATA TATTGCTTATGTTGTCGAAGGACTAGGAAACATGTTGGATTGGGGTGAAG TTATGAAGTTCCAGAGGAAGAACGGATCGTTGTTCAATTCTCCTTCCGCA ACTGCTGCTGCATTAATCCAAAATTATGATGAGAAAGCTCTCCAATACCT AAATTTAACTGTCAATAAGTTTGATGGCTCAGGTGAGTGTCTGTTCCTTT CCTTGCAAAAAGCATTTGCAAGCGTGTAGACTACTGTTCAATACCTAATG ACATTAGAGTTCTACAGTACCAACAGTATATCCAGCAAATACATATTGTC AGCTTTCAATGGTGGATTCTCTTGAAAATACTGGGATATCTCAGTATTTT TCTAGCGAGATAAATAACATCCTGGACATGACCTACAGGTAGTGGGCATG AATAAACAATTGACATTTATCTTTTAAATTTTGTAAACTTGACTCTCTCT ACTTTGTAGTTTATGGTTACAACGAGATGATGAGATCATGTTGGATGCAT CAACATGCGCAATGGCATTTCGCATTTTACGGATGAATGGATATAATGTT TCCTCAGGTACTTCTTGGAAAACAATACATGGCTTCTTCATTATGACATT AGTATTTTTATTATTATAATTGACTCATTAGTTTTAATTGTAGATGAGAT GTCTCATGTAGATGAAGCCTCCGATTTCCACAACTCACTTCAAGGATATT TAAATGATACGAAATCTATATTGGAATTATACAAGGCTTCAAGAGTCTGC CTATCGGAAAATGAATTTATTCTAGATAACATAGCCTACTGGTCAGGAAA CTTATTGAGGGAAAAGTTGTTCTACGACGGAGTGCAAAGTAGAACGATCT TTGGAGAGGTGCTTGCATGAAATTCACAAGTCAGAAATATAACTGATTTT AGATTTAGGAAGGATCCAGTTTATGTTTACTTGTATGCTTTTATCATTTC AGGTGGAGCATGTTCTTAAATTTCCCTTCTATGCCACAATGGAACGTCTA GATCATAAGAGGAACATCGAAAACTTTGATGTGAGGGGTTCACAAGTCTT AAAGACAGAGCACTTGTAAGAGTTCTATTTCTCGCAAATACATGTATGCC GCATCATTCAATATAGACGTTGCGTGCCAAAACTAATCATTTTGCTGAAT CAGGCCATGTTGTGTCAACCCAGATATTTTAGCTTTGGCCGTTGAAGATT TTACCCATTCTCAATTTGTTTACCAGAACGAACTCCAACTTCTTGAAAGG TAATCAAATATTTATGCTTTCTTTTCCTATTGACTTTATTTCTTATAGAA ATTGTAAAATTTTGTCATGACAGTTGGGTGAAGGAGAACAGGCTAGACCA ACTACTATTTGCACGGCAGAGGATGGCATATTGTTATCTCGCGACTGCGG CTACCATGTTCCCTCCTGAACTATCTGATGCTCGCATTTCATGGGCCAAA AATTCTGTGCTCATAAATGTTGTTGATGACTTCTTCGATGTCGCTGGGTC AAGAGAAGAATTAGAAAACCTTGTAGCGCTAGTTGAAATGTACGATTTCT TACCTTGATCTCACAATCATGCAACCCTCGTGTATCCTCTATATGCTTCA TCCTCAATTTCATAAGTATTGTTGGTGTATCTTATTGCATATTACTAACA ATTAAATTTCCCTTATTTGATATTTTTTTATTAGGTGGGATGAGCACTCC AAAGACGAGTTCTACTCTGAAGAAATTAAAATATTATTTTGTGCCGTTTA TAGTACAACGAACCAGCTTGGAGCAATTGCTTCTACTGTACAAAACCGCG ACGTTCGAAAGCATCTGATAGAATTAGTGAGTTTCTTGCGTGTTTCCCTG ATTTTGAATTTTCTTGTATCCAGCATTGAAACATTGCAATTTCATCTACA GTGGCAAGAACTATTGAGGTCTATGATGACCGAGGCAGACTGGCGAATGA GGCAATATGTGCCAACGATTGAAGAATACATGGAAAATGCAGTTGTGTCG TTCACACTGGCTCCCATTCTGTTCCCTGCTTCGTATTTTGTCGGACAAAA ACTCTTTGGGTGCGTTGTCAGCAATAAGGAGTACAAAGAGTTATTCAGGC TCATGGGCACTTGTTGCCGCCTGCTCAATGACATCCAAGGTTTTGAGGTA TTTGGGCCAAATTTCTGCCTTTCGAGATTTGCATAAAAGAGTCAGCATAT GATTTGTTTTATTTTTTCGATTTTTTGATTTGGTTTACATATGGCTTCAC ATATCACTAAATGTTAATTCTTAGTACATACAAATGTTTGGTGAGACTAG AGGCACTATAGTAATCCTCACAAAAACCTGGAGTTGCAATCATTACTGGT ATTATTAAGAGTCTTGTTTCCTCTTGAAGTTAGAACGCAGGTCGTTTTTG TGTATCTCATACTCCCTGTTGCAGTCATTTGATAAAGGGGCAGTCATTAC TCATCTATGTCAGGCAGTTTAGATATGTTAGTTATAATTGGGCTATTCTG ACTAACTTTTTAACCTACTATTGTTATAGAGGGAGAGCAGCGAGGGCAAG CTCGATAGTGTTTCACTACTTATTCTTCATAGTGACGGTTCTATATCTGT TGATGAGGCTAAAGAGTCACTAAGGAGGTCCATAGCCTCATGTCGAAAAG ACTTGCTAAGGTTGGTCCTTAAGGAAGACAGTGTTGTCCCTAGGGCATGC AGGGAGCTGTTCTGGAAGATGTGCAAGATATGCCACTTGTTCTACTCTCA CACTGATGCATTTACCTCGCCATGTGAGATGGTCAGTACAGTGCATGCAG TTATCCACGAGCCACTCAAACTCCAGACTAGCAATCCATCTTTCGCTGCA CAATCAGAAGTATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.