Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA021061

[Submit comment/correction]

Sequence
AA021061
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021061
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGACAACAACAGATCAGGCCGTTATCGCACTGAAGATGCTGCGGGAAAAC
AGGGACATGTTTGATCTAGTTATCAGTGATGTCCACATGCCATACATGGA
CGGCTTTCAGCTTCTTGAGCGTGTCGGGGCTGAAATGGACCTTCCTGTCG
TTAGTAAGTTCATTTCCATGCAAAGTACAAATACGAGCCTAGGAGGCATG
CACAGTGTATACAAAGATGAATATTCTTTTACATGCAAAGTAGTATAAAT
TCTGCATACAGAATTCTATGATGATAAACTTCTAATTGGGGAATAGGAAA
ATGTTAATGCAAAGTAATTATTTTCTATGCAGTGTTATCTGTGAATGGAG
AGACGAAATCTGTTATGAAGGGGATAACTAGTGGTGCCTGCGACTATCTC
CTAAAACCCGTTCGAATCGAAGAGCTCAAAAATATATGGCAGCATGTTGT
TAGGAGGCGTCGTAAACCCATTACCAATCCTGACAATGTATACAGAGGAG
TTACAAATGACCAAAGTGAGAGGCCTAACAACAAGAGGAAGGAATATGAT
AGCGTGGATGAAGATGAAAATGAAGATATCAATGCTAAAAAGAGGTCACG
AATTGTTTGGTCATATGAAATGCATATGAAATTTGTCACCGCGGTCACCC
AACTTGGAGTTAACAGTGAGTAATCATCAATGATGGCTTTTATGTTTTCT
TACAGCTAATAATGATAACACTACAGTATCCTCCATATTATTTATGGAGA
AGCCGTGCCAAGACGGATTCTTGAGCTCATGGATGTAAAGAACCTCACTA
GGGAAAATGTTGCAAGTCACCTACAGGCAAGACACTTTGCTTACTATATT
GTAGTTGTCCGTACTGTCTATTTTCCATAATGCCGATCGTAAATCTGTAC
CGCAGACAGCTAGGTATTAAAACAGAGTAGCGTCCATAGAACAAGTTAGA
ACTAAGAGAAAATTTTATATTGAATGTGAGTCATATGATATGCTGACTGA
CTAACATTATTAAACATGTTACAAAAGAAATCATTGCCTCGACGGACAAA
TATACAGTACTTTCAATCTCCGAACTAAAGATGAAGGTTGAAAGGACAAC
ATGGTGTTTTCACTATAAAACACTGCAAGTTGATGAATTAAAAGGACATT
TTTTCTATAGGACCTCTCCGTACAGCTATTAACAAGATTCAACAAGAATG
TGTTTGCTAAACTGGAAAATCATCTCTAAAAGGCGCTTTTATTACTTAGA
CAGTAACTTACACCTGGCCTCTGCATATAGATGCACACAGCCAACACCAA
TCCACATGGTCCAAACATAAAATGAAAGATACAGGCGAATTACATATCAA
ACTGAGAAATTGTAAAATGCCTAGGATGCAGAGGGCATGTCTATCCGAAG
ATTATGCTGCCATCCATGTCTGATAAAAAAGTCCCGTACCATATCCTCCA
GCCGCGTGCACACCTCCATGAAAAGATCGCGATATTCTGCACGATGCAAA
CTCGACCAAACCCGAAGGGTATGAGTACACCTGTAGAGAACCTGAAACCT
TATTATTTCTACATAGCCATAGCGACCATATAATGGCTATCGCTCCGACC
CTAAGAAGATTTTTGTACTTGTTATCAATACCATGTAACCAATTTCTAAA
AATGTTGGCAATACTACGTGGTGGATACAAGCCTAAAGCTACTTGGGTGA
TTGGCCATATAGACCGAGCAAAACTATATTGAAAAAATAGGTGTTTGATT
GTCTCATCATGGTGACAGAACACGCATCCAGGATTTCCATGCCAATTTCG
CTTAATAAGGTTGTCTTTTGTAAGGATAATCCCACGACGAAGATACCAAA
CAAATATTTTGTTTTTAAGAGGTATCTTCATCTTTCAGATCATCCTATTA
TGTACCGCCGGAATAGACGGCTGGATTAAAGCATCATACAAAGAGCTAAC
ATAAAGGACCCGTTCTTAGTTAGATTCCATCGGAATTCATCCGGCTCGTC
CCACAGTTGTACATGTTCCAGACAATGTAGCAACATGATTGTCTAGAACC
AATTAGATCCCTTCTGAACGTTATATTTGGCGGGAATGATTCGAGCACTG
TGGCAATCGTTTCCTCCTTATAAAGAACAATAGAATATAACGAAGGATAT
TGTTCTCGAAGGGTAGCATTATCTAGCCATTTATCCTCCCAGAACCTTAT
CTGCGTCCCATTATTAATAGAGAAAGTCCCGAAGCGTAAAAAATATTTTT
TTGACACCATTAGACCATCTCAAAAGTGAGAGTCACCAGGTTTCCAAACC
ATTTGGGACAATGCCTTTGAACCAATATACTTTCTTTAAATAATAGTTTG
CCAAATCCCTTCCTCATTTAATAACTTGGAGAGCCATTTACTAAGGAGGG
CTGTATTTTTAACATGTAGATCATGAATATCGACCCCACCCTCTTCTTTG
GGTCTACACAAAACACTCCATTTATTCGGCATATACTTCTCTTTATCATT
ATCTCCCTGCCAAAAGAATCTTGATCGGAAATAATCCAATCTTTTTAAGA
CACCTTTTGGAATTTGAAAAAAATAAAGCATAAACAAAACCATATTGCTA
AGGACTGAGTTGATGAGCACTAGTCTTCCCCCTATAGAGAGAAGTTTGCC
TTTCCAGCTACTCAAACGTATCTGTAATCTTTCATCGACAAGTTTTCACT
CAGCATTTGTAAGCCTTCGATAGTGTACCGGAATGCCAAATATCTAATCG
GAAAAATGCCGTGACAACAGCCGAAGAGTTCATTATAAAGACCAACCTCC
TCTTGGGCCTCACCGGAACAAAACAATTCACTTCTATAAAAATTAATTTT
TAATCCCGAAAGCTGCTCAAAAGCCGAAAGTATAAGTTTCAGATTCTTGG
CTTGAAACATGTTCCATAAAAATAATTGTATCGTCTGGATATTGAAGTAT
AGATAACCCCATCTAAATTAATTTTTGTATCTCGTTTTGAAATAAACAAA
GTGCTTGATGTGCGTAGAAAGGTTAAATACTGACCATTTGCTTTGGTGTA
CATGCCAGAAGTATAGGCTCCAGCTACGACGGTTAGATACATTGAAATCA
CGACAATCTGGCATCTATGCTGCTTTGGGAGGTAGAGACCCGTTTCTGTG
CATGAATGAATTTCTGCGACTCCAAGGTTATTACCAAGCCATTATCACCT
CTCCTCCAGCTGTATCATCATTCAGTGCACAAGGATTGCTAAATAGTGTT
AGAAACGAGAATCAGTCAGCGGTTGTGGCACAGACTGATGCGAATATGTC
TCATCTCAGCCTACCAGGAAACCAGCATGGAAACCTCGGGCAGGTCCAAC
TGCAACACAAGTGCATGAGTGCAGACGACACCGGTGACCTGTCCACCATC
GTTTCTGGGAAGAACAGCCTGCCTACTGGCACCGTGCAAAGTGTTACATG
CTTCCCATTACTGCCTCAAGATCTCGTGATGGAGTGCACACAAGCAAATA
TGGCCATCCAGCCATCAATAAGAGTTCCCTCTGCAAGTCTAGAACTCCTT
GAAGCTGTCGTAGGTTCTTCTTTTGGCCTGTTGGAGTCCCAGCAGAGTGC
TCTCAGGTTGCCGGTGCATGGTTCATTCAACAGTAATGGTGCAACCAGAT
TGGGTGATACATTCGCCACAAGTGGAAACAGTTTTACAGTACTGAAGGCC
AATGAAAGTAGTGCAAATAGTTTAATCGGTCCCAAGATTACAAAGAGTTC
CTCTCAACTTCCAAGCACTGTTGATGCCCACAATTTCAGCAAGTTTGGTC
AGACAAGTGCAGGTGCCTCACCAGTTGTTCCACACACGAAGATCTCAGGA
GATACTTCGACGCCAAGGATTTGCCTCGGAACCTAGCATTCCAAGTCTGC
CGAGCAAGCTCAGCTCTAGCACCTGCAGTTTAGACAGTCTTTTGGATTCC
ATGATCAAATTCAAAGTGGTAAGGCAGCTAGTTTTCTTCCAATCTAATAT
ATTTTACCCTACTATCATTCATCTTAAGGAACAGAACCAGTAGTCACCTC
AGTTTAGACAGTCTTTTGGAGTAGTTCATACTCGCTCATGGACCATTTAT
GTTTATCATTATCTCGTACGTGGTAAGCAACTAATAAGTTGAACCAAATT
ATCTGACACCAATGTCGTTTGCTTACACAGGATAATGGCGACTCTGCCTC
CAACGATGATCTGTGGTGTGACTTTTATCCATCTGGGACTTGCACGTGAT
CAGAAGCTGTCGCACGTGTGTCCATGTCTCTCTGCAACATCTGTATATTT
ATGTTCGCACAACTGTATCTGTAATCGTGTATGCTATGCGGTGTATTGTA
GCATAGCTAGTACTGCTGATCTTTAGGCCTAGCTCTGCTCTGATTGGGCT
TTATGTAATGTAGTAGCCGTAGTTGCGCCCGACAATATATTCGTTAGCTA
TTCTTCAGTTTGTTCAGTTAGTGGACAGCTGCACTATGCTGTCGTGGGAT
GGCACGACGGAGGCGGAATGTGGCTCAGTTAGTTGAGTCTGTAATCTCTT
ACTCCCTCTCTTAAAATAGATGTTACAGATTTGTAAAAATTTGGATGAAT
CTTAATATTCAAATTTTAATAAATCCGTGATATTTATTTTAAGACGGAGA
GTATTATGTAGGACTAATAAACAGGGGAGAAGATCCCTTTGGACAAGGTA
TGGCATCTGCCCTATCTTTGTAAAATTCCTTGTTTCCATGTTTTACCTTG
TTTCCATTTTGCAAATGTGAGTTACATGTGAAATTCCTAAATTTCGATTC
CATATCAGAATCTATGGATACTATAAATATACAGTATTTGAGTTACATGT
GAAATTCCTATGGATACTATAAATATACAGTATTTGAGTTACATGTGAAA
TTCCTAAATTTCGATTTTGGGCATGATATTTTTGGACTAGCCGTTACTCA
AAATTTATCCTTTTGCTGTGCCTTTTCTTCTTCTGTTCATATTTAATTGG
TATCTCAGTGCTATAGTATGTGCAAATGTGAATTGGGCTTTCAGACCAAT
GGTTATATTTGTGGTGTCTATGGAGTGAGGCACATGGATTAACTTTGCAA
GTCTTCCTATGAGATAATATGATGCACATCCAATCTTTCTTAATGATTTG
TGAAGTAATTGTCACAGTTTTTACAGGCTAATTGCATGAGGGTTTCAGTT
TAATTTATTTTGGTTGTAAATCATGATCGTCTAATTCCTTTCATATGTAG
CAGCAAGAGGACAAGGATTTCCGAACCCACTATCAAGAACAACCTATGTT
ATTTATTATCCATCTGAGTTCAACCTATATGCCACTGCCATGTATAGAAG
TCTGTAGATATACTGTGTTTTAGGGTAACTTTTTGCCTATTCTGCTGATG
TACGTGCAGTCAAGTGTTTCTAGAAGTCCGATTGATGCAATCTAGACGAT
GCACTTCCTGCTTAGGTGTTGCTGATGTGAGTTTCTATGAATCTAATACA
TTAGTTCTTACTAATTTCTATGGATTTCTCAAGTTTGTGCTCGGAAGGGC
TAATTACTTAAAACTCCAGTGCAGGATCGACATGAACAAGAGTTAACTTC
AGGTTTCTATAAACACATGCTACACATGTTCAGCTCCCAGGTCTGTTGAC
AACTGTTGATGCAATTACGGAAGACCGACATGTCTAATTTAGCTTAGGTC
GTCTGTCAGTTTCTATGCGCTCCTTTATTACCACTTGGCTCTGTGTTATG
CTACGAATGGAAATGTCTAATTTAGCTTAGGTCGTTTTACTGTCAGTTTC
TTTGCATTCCTTTATTACCATTTGGCTTCGTGTTATGCTACAAATGGAAG
TATCTGCCATTAATAATAGTTCACATACCATTGGCTCTTCTACATATGTA
GCAATGAATTGATTATGATTTTTTATTCAGTTTCCTACATCAATAGAGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.