Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA005762

[Submit comment/correction]

Sequence	AA005762
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA005762
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGTAAGAGATTGATCCATCTATTGTCAATTATTCCTTGGATTCAATAT ATTTGGTGCAGTAAGTGGTGATTTTTCTAAAATTTCAGATCACGCTCACA GGATTTATGTTTCTACTTACATCAGCACTGCTTAGCTATGTGAGTGTCTT GATTTATTTTGTTCACCTTACGGTGCATTACACCTTAATAGGTAATGTCT TCTTTCCCACTTATAACTCTATTTTCACAGATTTATTCACCCCGCCTTGA CACAGCTCCCCCTCGGTGGGTCCATCTTGCCCATGGATTACTTCTCTTCT TGTACCAGGTGTGTGAGATCAAGCTTGAGATTCTAAATGGATAACTATTC CTTGTTCCAAATCTGTATAAATTTTCCTGTTTGGTTACCAAAGTGCATCG TTATATTGCTTAAGCAAGAGTAGTCAATGTGATAGTTTCTGTAAGTACTT GTTATTTTTGACTGTCTGCTGGTTTAACTTCTTACTGTGACATGTCATGT ACAATCTTCGGGAAACAAGGTTTGTGAGTTGTCCGTATTACAGTTCAGTA TTTGTGGCTGGTTTTCTAGAAAAAAGCCATAGACACCTAATAATATAAGT AACATTTCGTTAAGTGGTTGAATCTAGAGCTATATGCCAACTACCCTGGT ACAGTTGAGCTTACACCCCTTATTTAATGTAGCATAATGAGGGAACCACT CCTAGCGGGCAGTTCTGATTTGAATTAAGCGTGTCATTTCCCTGTAAAAG AATTATTTGCTCTAAAGATATGCATACAAATATATGTTGGTGAAAGTTTG AAGTATGTGGTTCTGAACTGGTTTATCCAACCGATGCAATTGTTCGAAAC ATACCCTTAGTGCCAAAGTTTAAACAATCTGCTTGATATTTAGAACATTT TCAACTTACCCGAGATATGTTCTTCTGCCATAATGCCATGTGTTTCTTTA CCCCCTTGTATGCATTAATCTACATGTCTAGGTAAACTGGATATTATCAT GACATCTAGTTCATTGATTTTAGTTGATAAATTGTATTGTACCTGCTAGA CTTTTGATGCTGTTGATGGTAAACAAGCGAGGCGCACCAGCTCATCAAGT CCTCTAGGAGAACTTTTTGATCATGGTATTTTTTTTTCTTCTCTCTCTCT TATATTTATCTCCCTCTCTCTCTCTCAATGTCACAACCTTACACTATGCT AATTTGTCAATTGGCAGGATGTGATGCCCTTGCCTGTGCTGTAAGGATTT TTTAAGACCTCTCACCTTGTCACCCTCCACCAAAGAGATATATGTTTAAT TTATCTTGACTGTGTTCGTCTTTATACTGTGGTTAGTTTGAAGCCTTGGC ACTTGGAAGCACCTTGATGTGTGGAAGGTTGACACTCTGTTACTGGGTGG TTGCTGCTGTCCCGTTTTATCTGGCAACATGGGAACAGTAAGGCCCTTGG AACTCATTTGTTGTGTGGATATTCCATGAATCTCAAAAAATTGCTCTGTT TGTCCAAAAGGTCCTTTTTTTGGCCATCGCCATTTCATTATGATCTTGCA TTCTTCCTTCTGTAATAATGCGTTTAGGCTCTGTACATGCTGCAGCATGA AGATTGATTTTCCGGGACGACACAGATGAATCTTATCTGTGTGAACTTTT GTATATCAGTATATGCCACCTAATGTATGAGTGACTTATTGCTAATTTTC GCCACACCTGAGTTATGAATTGGCACATTACATGCATCCATGTGCTTAAC ACTCAGTTTATTCTAATATTTCTTTCTAGTTCTGTCTATTCTTCTGGTGA CCACTGGTTGCACCTAAGAAACTTAGCAGCCAAGCTCAGCATTTGCTTCA TGAACTATCAAACTGCTGTCTTTATGTTTGGTTTTACATCAAGCTTGCTA TTGAAGCTCTGTTGTCTGTTTATTGACACTTGCATTTCTCATGCTGCCAG CTTCTTTACAAATACGCTCATACTTCCTATAATAAATGGACCAACGGAAG GCCTGATGCTGATCTATGTCTCCCACCTTTTTACCTTTTTTGTTGGTAAT TTTCCTAAGCAAGACTTGATGTTCACGTAACTTTCTGTTTCATTGTGCTA GTACATTTTTCTTAGATATGCACTTCTATTCCAAAATCTAGGTGCTGAAT GGTGGGCGCAAGATTTTCGGAAATCTCTCCCCCTAATTAGTTTGGTTCCA CTTCCATTTGTTCCAGGTATGTTGCTTTAGGAACAATCAAAGGCCTTTCC ATATATGTATGTACAATTTGCTTTATTACTCTTTTGCAGGAGACTTACTA CTTACACTGGCTGGTGGTATTGCCAACATAGTATACAAATACCCAACATG ACTATTAACAGAAACCGCTTCTGATTTTTTTTTCCTTTTACTTCAGAAAT CCCCTTGTATGTTATCGTGCTGATTCTTATGATCCTATTTGCTGTAATCC CAACAGTTGGATCCAAGTAAGTTCAAATCCCTCTCTATTTTATGCTCCGG CTAACGTTTTTCATAGCTCCATAGCATGAAGTTAACAAATGACTATTCGT ATACCTATTGTGCAATCCCCATACTGGACTGCTTTGAAATTGCTTGCAGA TAATTGATTCTTCCTGTTTCACGAATTAGTGCCCTTGCAAGCCATGTGTT TGTGGCATTTAGCGCATGTTCACACAAGCTTATAAACAGCACCGTGCTAC ATATGTATTACTGATATTTACATGATTGATTCTCCTGTCACACAGTATCG GCAATGTCCAAAAAGTAGTTGATGCACGAAAAGGAAGCATGGGACTAGCA TTAGCAATGGTAAGTCCATGGAACTCCTGTATGTAAAATATTTAAAATAT TTTAATATTTGAAGTTGTAGAAACTGTCTTGGGCTAGGTGCTTTTGCAGA GTATAGGCTATCCATCCATTTGAAACTTTAAGAAGCAAACAATAACTTGA ATATTAGATATGTCATATGTATAGTATTGAGCCTGTGTATTTGTGCATAT GAATAGTTTTCTTGTCGCACACAGCAAAATTACAGATGCTTAAATTCTCT GCGCACAAACAACTAGTTTCAAAGCTTAAAAATGGAAAATTCAGGTTTTA GCTGTTAGGTTTAATTTCATAGGCATTGTTGTATTTTGGACAGCTGACCA AACTTTACAAATAGTCCGCATTTGGACAATCCAAGTTGCATGTGATTATT TATTAATATTTGAGTCAACTTGGAACCTGGTTTACAAGAAAAAAATACTC CCTCCGACCCATATTAGTTGACTTCAATTTGGATGTATCTATCACAAAAA CATGTGTAGATACATCCAAATTGAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAG TACAATATTTTTGCTTTATCACGCTACACTACAGTCTGTGCACACTTAAT TCTTGTGTCTTACGTATGGCTTGCAGCTCCTTCCGTTTATCACACTGTTA GCTGGAGTGGCTGTCTGGTATGGGATCAGAAATTCCATTTATTGTATACT GTACAGAATATAACTCTCTGAATAGGACACTAATTTTATTCATCTCTTTG TGCAGGTGTTATCTTTCTCCTTCAGATATCATGAAGAACCAGCCACATCT GCTCGTGATCGGAACTGGTTCTGCTTTTGGATATTTGGTTGTAAGTTCCA TTTTTCTTCTTGTGTTCTTTGACTCTGATTTTCTGAATAGTCATTGGCAT GGATTTAACTAAACTAACTAAGCACTCAAACAGCCAAACTAACTTACTGT TTACGTGTTGATCTGACTCTTCCCTAGATCCAACTTTTATCTGGTAGTTC TTGTTACTATTGGAAGTAGACCCTGACACCTTCAGCACCTGCCACCGAGT GCAATCTCATTTGTGTTCTGGTTGAATATAAACTATATATCTGTGTAAAC CAGACATATGTTTCAATTTAATCTTCTGCTGCATATTTTAACCATATGAT TGGTATAAGAATGTCTGTATTCAGCAATAGTTTCTGTAAGATATTTATTT ATATAGATATGATGTGGCATAACTTAATCTGACCCTTATTGCTTTCAAAA ACACCCATGGTGTGCAAGTCGAGTTATGTGAGGGAAATTGGATAGTTCCA GTGGCGGACCCAGGAATTAGCCGAAGCCTGGGCATGCCGCAAGTCAATGA AAATTATTTTTGGATAAATATAAGCATTACATGTAGCAAAATTTTCTTTA CAACAGTTCAAATGCATTCACATGGTATTCATTGATTTGTTTTCTAAGAG CGGGATCAGACACACTATTTCATCCGGAGTAAACACATCCTTCACCTTAT GCTCCTCTTCCTCATTTTTCACATTTTTTACGGCAGTGGTTGTTGATAAG CTTCTTGTAGCAACCATATAAACCACCCAATTCTTAAGGTCTTGTTTACT TCTCTTATTTTTACCCACTAGAGTTTTGGGGATATGCGGGGATTTAGTGT TCACAAATCTTCTCCAATCCCCTAAAATACTCTTCCCCAAAAAATACTCT ACCTTAGAGGAGAGTTTTCAATCTAGACAAAAAGGATTTGTGGGGATATC CCGGGATTATCCCGGCCAAACCCGGCATGGTAAATGGACTACGGGGATTT GGGGGGAATTGGAATAATCCCCTTTGATCTCGGCGAATACACTAGCGAAC AGTATTTCAGTAGTAGTGATTTTTTTTCATTTCTAGTCTTGCCTAAGCGT TTAACTTTTCTCTAAGAAGCTGAACCATGTCCGAGGACAGAAAGTAGCAA CAGTAATCCCCTAGGAGAAACCCACGCGGCAAAAGAAATAGCTAGGAAGA AGAAAAAAGCAGCAATCAGACGCAAACAATATAGTCTTAGCTAGTCACAA CTTCCATATACGCATGCCGATTTAAATATGCTACTCCCTGTTGCCCAGGA ACCTTTTCCCCAGAATGAATCAGAGTAGCTAGCTCGCTACATGCGCGACA GTTCAAAGCCGGCCCATCACACAATGATTTTGCCCCTGGTCGATCGGGTT CGTGGCTGAAATCATTCTCGTGCCTGAGGCGCGCTGCAGCGAAGCCCAGG CAAGCGCCAGGCAATAGGGGCTCTGCATCCGCCCGTCAATAGTTCCATTA TGCACCTGAACATATGGAATCTGTGAGTAAAGCACCTAATGAGATGGTTA TGACTCACATGGACAAGTGAATCACCTCAGAACTAACATGCGCCACAGAA GTACTGATGTACTGTATGCAGTGGCACCATTTTTTCTTAATAGGAATTTA ATGACACTCAAGTCCTCGATGTTATTTGTGCCATTGCATGTTGCTTTTCA GTGGCAAAGCAGCTTGTTTTATGGATTGACTTAAAAGTGGGGTGTAGCGC ATAAATTACTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGTTTTTGT GAAACTAATGTATCTAGACGCATTTAGTATGTAGGTTCGGAGTGAATCTA CACACTAAAAAGGATCTAGATACATTCGTTTTACAAAAGCTAAAACATCT TATATTTTGAAACAGAGGGAGTAGTTTTTAAAGTGAATGATCATCCTTTT TTTTCTGGAATTGCTACTTGTTTTTGCATATTATGAATTGAATTTCATGC ATGGACAGGGGAGGATGATACTTGCCCATTTATGTGACGAGCCAAAAGGT CTAAAAACTGGAATGTGCATGGTATGTCTATACCCATTACTGCCATATGT TTGTTTTGCTACATAGACCAAGTGCAAGAGTAATACGGAACAATGACTTA ACTCTTATTTCAGTCTCTGGTGTTTCTTCCATTCGCGATAGCGAATGCTC TCGCCGCAAAGATTAACAGTGGGTAAGGTCCTTTATGTCTCTCACCTGGT AATGCTAATATTGCACCTGTACCTGCATGCAGTGAAGCTAAACGATGCAT CGTTACTATTGACAGGACTCCTTTAGCTGATGAGCTTCTGGTTCTTCTCA TGTATACTGCGTACACAGGTGAAGTACTCCACTTCAACGTTTAGTTTGAA ATGTCTAAAGCTGAAGCGTTTGGCTCTCAGTTGGATACCTCTGCCTGTGT GTGTCTTGCAACCTAGTGCAACATATACACTTCTAGTCTACATACCACTT GCTTGCATATGCCGTTGCGACAGACGCTTAACCCAACGTCTTGTTTCTTT GTGACAGTGGGTCTTTACTTGCATCTTGCCTTTTCTGTTTGCCGTGAAAT CAAGGAGGCTCTTGGAATCTACTGCTTCAGGTCTGCAAACCTCTCAACAT CATCTTAACTATTCTTGAAAGTACCGTAGTCCCAACACCCTTCTTGCTGT TTGACAGGATAACCAGAAAAGAGGCTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.