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GrainGenes Sequence Report: AA039715

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Sequence
AA039715
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039715
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCGAACTGGAAGCACGAGCGGCGGCCGGAGGGGGAGGGGGAGGAGA
TGTGATGGGCGTCACCTGTTCCGCGGCGGCGGCGGAGGCTGCCCCCGCCT
CCGATGGTGAGAGACACAGCCTGCGCGTGGTTCTACCATGCATTGGGGTT
TTCGCTCTGGGTTTCTTCTCGATTCGGTGTTAGCGCGCGGCTACGTGGTT
TTACCATTGGGGTTTCTGGGTTCTACCATCGTGGTTACTGCTGATTAGGA
TGCCATCAGAAGCTTCCAGAACTTCCGGGCGGCGCTGGTCTCGGCCGCGT
CCACTCCGGTGTTTCTGCTTTACTGGGGTTTATTGGGGGTTAAGCATTCC
ACTTTTTTCGGTCTCCCCTTCACGAGTTACCGATTCTTTCTGTTCTAATC
GGCGAGGCTAGATTGGGTTACCATTGACCTCGTTTGCCAAACTGTCGCTG
GATTTGGCCATTTTTTTCTTAAACAAAACTGTCGTTGGATTTGCAGTTAA
CATGAACCCTCTGAAGAGGTCGTTGTTGGAGTCATCTGCTCAAGAAGATG
AACCAGACATGCATAAACGGCAGCGCCAAGCCTTCGTTCCCAGAGGGTAT
TTGTTTTTTATCTTGTTTTCACGATCACTATTCGTATCAGATCTGAAACA
CAAGTGTTGTTCCCTGACGGTGCTTCGTGGTACTAAAATCTCGGTCAGGT
ACCAGCTCAATGTCTGCGAGGTTGCCAAGCAACGAAACACGATCGCGATG
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ATTTGGGAGGGAGATTGACAAATCCAAGGACGGTTGGAAGATCACCATCT
TCCTTGCACCAAAAGTTCGGCTTGTCGAACAGGTTTTGTGTACTAACAAC
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AAAAAAATTGCTATAGCAATGCGAGGTGATTAAAACCAAAACAGATTTTG
AGGTGGGAATCTTTTGTGGATCCAAGGGAGTTAATGAATGGACGGTTAAT
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TGTTCGTGCCTTCTCATTTCGATCGTGGTCTGTGTATTTGCCTTCTCATT
TATTTTTTTCTGTACATTGACTGTACCGCTTAATTTATTGATGCATTGCA
CTGGTAGATAGGCCTTTACACCATCCTTAAATGTTGATAAAAAAATTGTT
TATGTAGATTCTTTAGTCACTTAATTCGAAGCACCTTCCAAAAATTGCAG
GTCATGGTGATGACACCAGATGTGTTGCTTAACGCTTTACGCAAAGCTTT
CCTGAGTTTGAACAAGGTTAATCTTGTGATATTTGATGAGTGCCATAATG
CAACCGGCAAGCATCCTTATTCGATGATAATGGAGGTAATGTGAAACACC
AGATCACCTTTTTGTTGGGCTCAACACTTCCTTTTTGTATAATCCTTCTG
AAACTGTTGTGTTCGCCATCTCCATGTTCTGAGCAGGAGTTCTATCACCA
GTCAGAATACAAGCCTAAGGTGTTCGGTATGACGGCATCACCTGTTATAA
AAAAAGGCAAGCATTCGCAAAGATATAGAGAACTCTTTCGTTTTGCTACA
TTGAACAAAACAACACTAGACACTCTGAATTGTCTCTACTTACATGTCAG
ATATGTATGAAATAAACTAATGGACCTCGTGTCAGATACATAATTCAAGT
TTAACAAATGACTGCTAAACATGAATACAATGACATGGATGAACTTGATT
GAAAACTATGACGAAAGGTGTTGAAGTGGTGATAGGAGAGCTCCCAGTAT
CCACCAATTCAATATGGCTGACAAAACTATAGGTCGAATAACTTCACTGT
TACACTCTTATTAACATTTAGCATATAGGTACTGAGCTAAATTACTAAGC
ATGACCTGTGACGGCCAAGTGAAAATAACATGAACCCAGAGAAGTAAGAC
TGGAAGGGCATAATCTTCAGTTGTTCATCTTCCATGGACTGTCCATATTT
CTGGAGTCCCTTTGCTTCGTAGTTTCTACCATAGATTTGATTTGGTCTCT
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AAGCTTCTAAATGCTAAGGTAAATCCTATTTTTCTGGTTGCACATGTTCC
GTAAAATTATGCAGGATATTCTATTTGTGATCACGGAAACACTCTTTTTC
CGTATATTGAACTGCAAAGGGATATCCATATCCAGATAAGTTTCCAGACT
GTGGTTTTGAACATATGTGTTCATGATTTGCTTGAACAGATCTACACAGT
GGATGATAGAGAAGAGATAGAGCTTTGTGCCCCTCCTCCAGAATATGTGA
ACATATACTATGACCAGAAAACCGTTTCTTTCAATGGTTTGCGTAAAGAG
TTGGGACTTTTGCTTTCCCAGGTTTTACATTTTAGTTTTCCCTCTCTGTT
TTTTCAAGCATGTTACAAAAGTTTTGTGGCTCAAAATTTTATATCTAAGG
ACAGTTCATTTCTGTCTGTGCAGTATGATGCATTAATAACAGCTTTGCAG
AATAAAGCCAACTACCAGAATCAAGAAGCCTATGGAATAGCAAAAAAATC
CAAAAGGTGCCTATCTGGTTATTCACAAAGAATATTGTATTGCCTCGATG
ATGTTGGTCTTCTTTGTGCTAGTGAGGTATCTCTTAGACCAATTGATTCT
ACTGTCATGTACAAGACCTTTGTTGCAATTTTTATCTTATTATTGTATCA
TCATTTGACCTTTAGAGCTTCATGGTATAGTTAACTAATTTCTCTTGTAG
GCCACCAAAATCTGCAGAGGTTGGCTGAAAAATTCTGATGCCACAAATAT
TCAGAGTGATGGAAATAGCTCATCCCTTCATGCAGAAATATCCCTTCATT
TGAAGTTCTTGGATGATGTGTCACGTGTGTTAGACCTAGCTACTAGCTCT
TACCCAGGTCTCACCCTTTCTAAACAGATGAGCTTCACACACCTTCCTCT
CTTTCTCTTGGTATATATATGTTAGTATCATAAGAAATGAAGCTATATTT
ATTTTTCTCAATGAGTACTAGCTTGGTTTTCTTACAAAGGTGATACATTC
TTATATAGGATTTCCATTACTGTTCATTGCAGTACTCCAATTTGCAACTG
TTGGAAACTATTACAAAACTGTTCCTTTACATGGCTATTCAAAAATGACT
TCAACACGAAGATTTAGGACTTCTATTTCTATTAGGACTTCTGCATACCC
TAGATACTTCAAAACTAGGGTATGCAAAAGTCCTAATAGAAATAGAAGTC
CTAAATCTTCATGTTCAAGTCAGTTTTGAATAGTCCTCTAAATGAGCAGT
TCTGTAAGAGTTTGTAGTTGTTACAAGCTAGGGTTACACTAACATACCTA
CTGACTTATATAAAGATTTAGGAAACCAAGCTTGTACTGCATTGAGAAGA
ATAGATATGGCATCATCTAACAACCAACTGGGCGGATCTACCACCCCTTT
AGCCCAGGCCGCGTGACGCCTTATATTTTCTGACTTTCTATACTGATTTT
ATTTATAAAAAATTGTGTTTTAGACATGTTTTCCCAGGCTTACAAAAGTT
TCGCGATCCGCCACTGCTCTTAGACAAACCACAACCATGGATATAATGTT
GGCAATAACTTTTCATCATCATATCCATAGTTGTGGTGTATCCAAGAGAA
TCTAGTCGGATGTTACATGTATATAGTATGTACTATATACTGTAACCGAG
TGAACAACAACCGACCTAGAAAGTCTAATTAACATAAGGATGTGTATCCT
TTGTGAAAAAAAGCAAGCCTGTACTGCAATGAGAAGAAAAAATATAGCTT
CATGTAACATCCAACTAGATTCTCTTGGATACACCACAACTATGGATATG
ATGATGAAAAGTTATTGCCAACTTATATCCATGGTTGTAGTTTATCTAAG
AGAATCTAGTTGGCTATTAGATGATGTTATATCCATTCTTCTCAATGCAG
TACAAGTTTGGTTTTATTACAAAGGGGATGCATCTTTATACAAGCTGCAG
CTAGGTGGTTCCTGCCAGCGGCGGGCAGACCAGAGTTGGCCGGGAAGCGG
CAGCGACCACCGCGTGGTGAACGAGATAAGAGAGGGGGAAAAGGGTTTTT
TTGTTTTTCTAATTTCCTCACCCAGCGTAACCCACGTTTTGGTGCCACGC
CATTCTGACGGGTGGAACCTATTGTCAGTTTAGTGCACATTGCAGAAAAT
AGATCAGAAAATGGTGGTTTTTGCGATCCAGACGTAAATTTAAGCAGAAA
AGTGGTGGTTTTATGCTACATGCTCATAAAAAAATGGATCCTTTACAAAG
CGATTAAAAAATGACTGTATTCTCTTAGATACACCACACCTATGGATATG
ATGATGATAAGATCACTGCCAACATTCTCCCCCTTAATCTTTCCATGTCA
ACTGTATCCACTAACCTTGTGATGGCCTCACACCATGTCCATGTCTAGCA
ACGACTTCACACCATGCTTGTCATCCTTGCACCAACTCCATATAAGATGG
CATCACATCACCTATGTCAGTCTCACATAGACTCCTCCACTTGACAATGG
CATCACACCACCGTCATCTGCTTCGCACCAACCTTTTTGTTGACCATGGC
ATCACACCATAGTGGTCGGCCTCAAACCGACACTCTCTACAACGATGTTA
TCACACAACCGCCTTTGCACGGTCTCCAACAGTATCACATTTTTGGGGCA
TGCACTTTCAACACCCATCTCACAGGAGTGTTAGCTTAGCGTCTTCACAA
AGATCTGTAGCAAGGAATGCTTTGTTTTTCTTCACTTGACACTCGTAAGG
ATAATGTCCAAATTAAGGACAGTTGTAACAAAATTGCTCTTTGTGAGCAT
AGGGCATGGAATGGAAATAACTCTCATTTATCCATGCATCATTTTGGCTA
ACACAATGTAGCTTTGCTACCAATTTAGAGCTAGCTACTATCTCTCGCAC
AGGTCTCACCTTTCTAAACAGATGAGCTCCACACACACCTTCCTCTATTT
CTCTTGGTATGTCATCAGTCATCACACACTCACACACACAAGAGGTGAAG
CTATATTTATTCTTCTCAATGCAGTACAAGCTTGATTTTTTTACAAAGGG
GATATCCTTATATAGGCTTTCTAGGTTGGTTACTGTTAAAAATTATTCTC
TTAGAGTGGATACTTCAATACTAAGCTAGATACATCTAACAACCAACTGG
ATTCTCTTAGAGAAACTAGATGAAGTATGATATACCATCTGTTTGATGAA
TTCTCGTTTCAGGTAACATGCTTCTAAATTCTGAGAGTGGATGTTTAGAA
GCAAGAAATATGGGTTATATTTCACCAAAGCTTTATGAACTCATCCAAAT
ATTTAACTCTTTCAGGTAGAATGCTGTTTTTACCTGACATGACATAAGTC
TGCTTCTTTACACTAACAAGGCATTATTCTGTTCCTAACAGTAACTCTGA
CCATGTCCGATGCCTCGTTTTTGTGGACCGAAAGATCACTGCTAGAGTCA
TTGAACGGACGATGAAGAAAATTGAAAATCTCTCACATCTTACAGTTTCT
TTTCTTACTGGAGGCAGTTCTTCAGTGGATTCTCTAACCCCTAAAATGCA
AAAGGACACACTGGATTTGTTTCGCTCCGGAAAGGTTCTTAAAATCTGTC
AACATTCAGAGAAAGAGAAACAAAGCCTCGTGTTCTAACACCTTTTTGTC
TTCCCATTATTAACTAAAATGTAGGTGAATATACTATTTACTACAGACGT
TGCGGAAGAGGGTATTGATGTTCCAGACTGTTCATGTGTAATAAAATTTG
ATTTGCCAAAGACAACACGTAGTTTTGTGCAGTCACGTGGACGAGCACGC
CAGAAGGATTCTCAGTACATACTAATGATTGAGCGGTAAATTCTACACTT
TGTCATCCATTCTAAACGTTTTATGCTTGTGGTGATAAAATACTTGCAGA
AAGGAACAATAAAAAGGGAAAACAAGAAGCCACAATTTTCATGTTTTTTG
CAGCGAAAATTTGAAACACTATACGTTGGTATCTACCATTCTAAGAAGCA
AGACCTCCATGGATGAGACTGCTTTGAACAGAGATTCTGAGGATCTACTC
CCTGTTTTCTTCTCCGTTGGAGAAACAAATGAATACCTTGTAGGCACAAC
AGGCACAAAAGTAACTGCCGATTATAGCATTAATGTTATCATCCAATACT
GTAACAAGCTTCCAAAAGACAAGTATGGTGATCGCATTTCAATTTTTTTG
TCTACACATATAGCAGACCTACTGGTATAGCTGATTCTAGCATTGCTATA
CCAGTTTGTTTATATTTTTGTGTGGAGACTGAAATTCATGTTCTTTTATT
TGCACTCATGTCACAGGTACTACACCACAAGGCCCTCCTTTGAGTCCATT
GATCACGGTGATGGTTTTGTGTGTATATTAACACTACCATGTAGTGAGGT
GTTGGCACCTTTGCAGTGTCCGAAAGCAAGAAGCAAGCAGAAGGCAAAAC
AACTTGTTTGTCTTGAGGCATGTAAGAAGCTGCATCGACTGGGTGTACTT
GATGACCTCCTTTGTCCATCTGTTGAAAAGCTACCGCCAGGAATTTCGAC
AGAAACAACCGTTCACTCACCTAGTGATGGTGTAGGTATGTGATTGCTAA
GCTGTAAAAATATGTCAAACATAGAAGAGCTGGTTTTCGCAATATTATTT
TGTAAGAAGTAACCGAAATTTCTGATGTCAATCTTTTTGTCTTCTCGCAG
GTACAACCAAACTAAAGGAACTGCATGATACAACTGGAGTACGTGCCTTG
TCTGGTACCTGGGCATTCGAGAAAACTGTTGTTAAGCTTCGAGGCTATAA
GTTGAACTTTTTTTGTGATAAAGTTGGTCAGAGATATTCTGATTTTGTTC
TGCTAATTGACACAACTATAGCAAATGAAGCTGCTAATTTAGTTGTTGAT
CTGTATCTTCATGACAAGATGGTAAAAGCTTCAGTCTCTCCTTGCGGCCT
TCTTGAGTTGGATGTTCAACAGGTCTGCTCAAGTTTGAGTTTTTTCTTGC
TACGTTTGTTGCTTCTTCTTTGATTTTGTTTAATATGAAACGTTCATTCT
GTTTTTCTTGGTTAGATGGAGCAAGCAAAGCTATTTCAAGCACTTATGTT
CAATGCTTTGTTTGGAAAGTTGTTCACTCGATCAGAATCGTCCAATGTTC
CGAGAGAGTTTATTCTCAATAAAAATGATGCATTTATCTGGAATAATGCA
AAGATGTATCTGATCTTACCTACTGATCCTACTCCAGAGCCTCGTGACAA
TTCTTGCATTAACTGGAGAGTGATCAATGAAGCCGTTACAGCTGTCAAAC
TAATGAGAAAGATTTATTCTGAAGACAAAATGAACATACCAGGAATACTT
GATTTCGACCAAAATGATACAGATCTGATTCATTTAGCTAACACTTCATG
TGAGGCTCATGACCTTAGAAATGTGGTGGTTCTGGCAGTTCACACAGGGA
GGATATATACTGCTCTTCATGTCGCTGATTTATCTTCCAATAGCACATTT
GATGGTGTATCAGATAAGAAAGAAAGAAAGTTCGACACCTTTACAGAATA
CTTTGAAAAAACGTATGTTTGATGTTGTGCACAATTATGTTCTTTCTCAA
GCATAGACATGCTAATCATTTTGAATTAATGTATTTCATGTGCAGGCATG
GCATAGTTCTTCGTCATCCTTCACAGCCATTACTAGCGCTGAAACCCAAT
CATAAACCTCACAACCTTCTTTCCTCAAAGTTCAGACATGAAGGTACTTT
GTCTTTCCCTCTGTAGCTAGTTCCAATTTCAAGCACTTCGTAGTTCTCTG
AAGAATTAAAACATAAAGCATCTTCATTTTTTATATGTCAAACATGATTG
AAAATAAGCTCATTATAAGACAGGTGGATTTCTTACATAGCCTATCCGTG
TTCTTCATGTTTGATCCTGTTCCAATTATTTGTGTTTGCTTGTTGCTTTC
TAGGTAACCATGCGAAGATAAATGGTGGCACAACACATGTTAATAAGGCG
GACAGCTGTGTTCACATGCCTCCAGAGTTGCTTATTCCCCTTAATTTATC
ACAGGACATTCTGAGAGCATTTTATTTGTTCCCCTCTTTGATGCATCGTA
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GATCCAAATATATCAAGCTTTCTGGTAAGAAAATGACATTAGTATTTCTT
TTTGTTCAATTCTATGCATGCATTTGTTATTTTCTTCAAATGGACATAAT
CAATTTGCGCACGATCTGTAGATTCTAGAAGCTATTACAACACTTCGGTG
CTCTGAAGACTTCTCCATGGAGCGTCTGGAATTACTGGGAGATTCTGTGC
TGAAGTATGCCGTGAGTTGTCACCTTTTCCTGAAATATCCTGATAAGGAC
GAGGGGCATTTATCATCCAGTAGGTCTGATATAATATCTAATGCTGCACT
TTATGGGTTTGGAACTGAACACAAAATACAGGTAAATTGCATATCATCCT
GGGAAATCTATACAAATGTCGCATTTGTTCAATTGATCTTAACATCATCA
CAGACTAATCCCATAACTGGTGGCATCCATGTGATTCATAGGGTTACATA
CGTGATGCTGCATTTGATCCTCGCCGGTGGCTTGCACCGGGACAGCTCTC
GATTCACCCTGTTCCTTGTAATTGCCCAGTAGATTCCAAGGTTTTAACTG
AGGATATTCATGTTGTTGATGACAAATCTATTGTTAAAATTGGCCAGGCG
TGTGATAAGGGACACAGATGGATGTGTTCCAAAACAATCTCTGATTGTGT
TGAAGCCGTAATCGGTGCATATTATGTACAAGGTGGCTTAAGAGCAGCTC
TGGCTGTTCTCAAATGGTTTGATGCTGATGTTGAAATCGAGGAAGAATTG
ATTAGTCAGACAATCTTGAGTGCACCAGTGAGGATTCCAAAAATCAATGT
AATTGAAATGCTTGAAGCAAAACTAGGCTATGTATTTTCAATGAAGGGTC
TTCTGCTAGAAGCTCTCACCCACCCATCACAGCAGGAATCGGCAGAAAGA
TACTCCTACCAGGTATTGGTTGATGTTATCCTAGAACTTTGTTTAGCATG
TTAGTCATACTGCATGTCTTCTAATCTTTACTATGGGATTTCTCTACCAG
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CGATGAGGGGGAGTTGACAGATCTACGGTCTGCATCAGTAAGCAATGAAA
ATTTTGCACAAGTCGCAGTAAAGCATAAGCTCCATGAGTTTCTCCAGCAT
TCCTGTGGAAGTCTATCAGACCAAATTACTGAATACGTGAATAGTTTGGA
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GCCCTAAAGTATGCTTTTCTTCCTTTATCTTTGATGTGTGTGATTTACTC
AAGATGTCCAGATAGATTATTAGTCACATTTTCAATTTACCATTGTTTCA
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ACCTATCTGTATGAATATATCATAGTTTACTTGTGTTTCGCCATGCAGGT
TCTAGGCGACATCGTAGAAAGCATTGTGGGTGCAATTCTTATAGATTCCA
AACTTGATTTGGATGTAGTTTGGCGCGTCTTCAAACCTCTTCTTTCCCCT
ATTGTCACGCCCGCAAACCTGGAGCTACCTCCTTTCAGAGAGCTTCTCGA
ATGGTGCAGCAAAAATGGGTACTCTTTAGAAACTAACTTTACATATGGAG
AGGAAGTAGTGGCTACTCTGAATGTCCAACTCAAGGAGAAGCTCCTTGTC
AGGAAAAGGTGTGGCAAGAACAAAAAAGAGGCTAAAGCACACGCAGCTTC
CATGTTACTCAAGGACCTTGAGGTATCCTTTTCTCTTTTTTTATGCTTCA
CTATTTTCACATCGCTTAGTTATGGCAGTTGCTTAATATCCAGCAGTTCG
ACCCCTCAGACGTTAAATTTTCTTTGGCAGGAAGAAGGGCTTCTAATCCC
CAAGAATGCAAGCAGGACGCAACAATTACAGAAGCGAGGTGGTAGGGAAA
ATCGTTGTAACAACTTGTTTGATCCAATATATACACAACTTCCAACACCA
ACCAGCGAAAAGAAACCAGATTGTTTATATACGCAACTTCCAACACCAAC
CAGTGAAAAGAAACCAGATACACAAGTTCCAACACCAACCAGTGAAAAGA
AACCAGAATGTTTAAAGATAGCTGCTAGCCTTGACAAACCAGGTAAGTAT
GTTTTTCAGTTCTCGGCAGTTCAGTTTCGTTTTGTTTCGTTTGTTATCCC
AAGTCTGGACCTCATATATATGGGATATCTCACCTACGCAGTGCACGTGC
CGGTGAAAGCGGGCAAAGGAGGACCTCGCGCAGCGCTGTATGAGCTATGC
AGCAAGTTGCAATGGCCAGCGCCTTATTTTGATTCTGTGAAAGTAGAACC
AAGGTAGTGCTTTTGCCTCAAAACTTATTTCTGGCTGTGATAACTGACGA
TTATCACAAGTCGGGTAACTTGTGCCGACCTGTAAACTAACCAGCTCACT
AATCTTCTTCCCTTTTTTGCCGAGATAGCTGTGCGAAGGCTACGCCTCAG
GGGTTCTCCTTCGCTTCGACGGTAACACTGAAGATACCAAACAGTGATGT
GATCAGCCTCACAGGAGACAGTTTTGCGGATAAGAAGAGCGCGATGGATT
CCGCCGCGCTGCTCGTGCTCCACGAGCTTCAGAGGCGAGGTAGATTGCAA
GTCCAGGAGGCATGACTGAAGCAGCCCCCAGCCCACCACCACAAGCGCCA
GCTGTGTGTGATTCCCATTGACTCAGCTGTGTGTGATTCCGGTCCATGCT
AGAAGTCGTTAACCGCATGTTGAATGATGGATTACGTTAACTGGTTCATG
TTGAAAGTGCTCAACTGTATGATGGGTGCTGGAAGTGGGTGCATGGTGAA
CGATGAGTGATGTCGACTGGTTGGATCATTTGAAAGCGGCTGATTGTATG
GTGTATGATGTCAACTGATTGATGCTGCGGAGGGAATTGAGGAGAATATA
GGTGTTCAAGAAATGGGTGGGGGGGTATAGTGTCGTTGCCAGCAATGGCG
GATTAAATCCCACGAAACGAACACGCCCTCAAGCAGATAAAACCTCATGC
TCGGCTTTGACGATCGGCAGCCTGCCCACGTGGTCTGTAGCAGTAGCAGT
AGCAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.