Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046650

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046650
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046650
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GATCTCTTCACACCCGGCAGATCCGAACCCCGCGGCGCGAGGTCACGCCG
TCATCACCGACAGCCATGATCTCCTCGAGCAAGCTCAAGTCCGTCGACTT
CTACAGGTCTCATTCGCGCCCTTTCCGATCTCCGTACACTCATCCCTCCA
CTCTTCATTTCTCGATGCCTTTTCCGTCGGTGGCATCGTGGGGATTTTTG
TGTGTTCGGGAACTGGCCCGAATCTGCGCGAACCTGGGCGCGCGCAGAAA
CGGTGCTGGCTCCACTCGATTGTCGGTGGGATTGGATGAATGCGCGGTCG
TTTTCGTCTGTATTCGTCGGATTGCCTACGAATTTCTGTTTTGTTTTGAG
TTTGGATACTCGGCAATTCGGCATTAATGATTTACTTTGTCTATTTCTGG
AGAACTGTACATTATATGTTCGACGAAGGCGGTAATACCGATAAATGCAA
AATAGTATGGTGTAGCCGTGGGGTTTTAGACCCTTGCGCTAGCATTGTGC
AGTACTATGTTTGAGTTCCTACTGAAGTGGATATGTATTGATATTTTTTT
TGTGTGCGTTTGCTGTCTGCAGGAAAATTCCTAGGGATTTGACGGAGGCG
TCACTATCTGGCGCTGGATTATCCATCGTCGCGGCACTAGCAATGGTGTT
TCTGTTTGGAATGGTCTGCCCTTCTCCACCTCTGTAATGTTATCAGTTAT
ACTGTACCTCATCTTACTTGGTTTCAGTGTATGTAGCACGAAAACAAAGT
AGTATGGCTGTTTCCATGGTAGATTTGGTGCCTAGATTAATCTAAGGAAA
ACAACTGTAATGAGAAGGGCACCCTTCTTCTCTCTTTATGCCGATTAATT
TGTGTGCTACTATTCGGTCTGCTGTAGTACTTACATGCTACACCACATCA
ATATACATCTGAGCTTGTTTTGTTCAGTGGCCATAAACCTTTTCGAATGA
ACATTTTAGAATTGGCCATTAGATCATCAACATGGTGGACTAGATTTTGA
AAGCAACCTATGATCATGAGAACTTGAAGCTAACTTGGTGACCGAATTGT
TATGCGCAATACATGAATAGAAACTGGCAAGTTTACACCACATGGTCAAA
TATTCTAGTTACTCTGGAACATAACAGCACGGAACGACGCTGTGTCCCCT
GACCTAGGATCGATCAACCCCAATTGAGGGTCAGGGTCTACACAGGATCG
ATACATTCAGAGGTCGGTTTGAGCCCAGACGAGAACTGCAATCCAGGGCA
GTGGGGAGATACGTGGAAGAGAGGAGCAAAGAATGCATGTATGCCGTGGT
TACTTGCTGCGACCACCACCGTCGTTGTTGATTTACTCGATGCAGTCGGT
AAAAAAATCCGGCACCGCCTCAGTCATGGTTACTTGCTGCCACCACTGCG
TTGATTGTTTCTAGCTGCCGCCTACATTTTGTTTCTGCACGAGGGATATG
GGGAGGGAGAGAGAGGTGCCACGGCTAGGAGAGAAAAACAGTGGTAGGAA
GTAGAACTTGATTTGTTAGGGGTCTGTATCAGGCTGGGAGGTGGGCTAGC
GCTAGGTAGGAAAGACGAGATTTATGGGCTTGACTGGCTGGTATCATTGG
CTGAAGGCAAGGTTGGCATCAACCCATGCCATCCACCCAGATATATCAGG
GTCGTGAACCACGTCCTGAATTAGCATTCCAAAGAGGTATACTCCTCGTC
GCACCATGTTTGGGAGAGGTAGCGTCCAGCGTCCGTCGAGCCTGTTCCTC
GACCTGACTGACCCGGGTTAATGGCACTATGCTCTGGAACCGATGCACCA
CTTGGGTCCCCGTTTGTTAAGCATTTGAGTTCCTTTCTTGCTAGCAACTT
TGAATAATGTTTACTTGAGCTCTTATTCATGACCTTTAAATTTTGTAGTA
CTGCTTGATAAGGTTATTTTCCACTAAAGCTGTTGAGTTGTTGCAGGAGT
TGAGTAGTTACTTAGCGGTCAATACCACCACATCTGTTATTGTTGATAGG
AGTTCAGATGGGGAGTTCTTACGGATTGATTTTAACATGAGGTGAATTCA
ATAGCATTTCTCATGCATTACGCAATACATAGTTTATATCTGAGGCTTTA
TGGTTTCATCAATGACCTTATATGATTTATGCTTTCATCAAAATTTTCTT
TCCACCTAATCTCTGTCAGCTCTGCTAGAATCGATGACTTGCTATTGCTA
TTTATCTGTTACTGATATACGATTTATATATGCAGCACATGAGACATCAG
TACATGTTTCTCGATGTTCTTAGTCATTTTGAATCGTGTCAAAAAGAAGC
ATCTTATTTATACTTAGGTTAATAGTCATTTGCCATCAAGCTAGTGCTCC
ATATCCAACCATATTTATTGTGTTCACTGTTCACAGAATAGTAGGTAATC
CATTACTTATCTTATTTCCTCCTAGACCCCGTAGGCATCTGAGATCTGTT
GCTGGAACTGGCCCTCCAAGTTTCTTGGCAAATTTCAACTACTAGGCGGT
TGTTTGCTCTTTCACTTGCACAGCATGATTTGTACTTCTGTAGTAAGATT
TATTCACTTGCTTAGCTATCTGTGTAGAGTTTAGAACTTTAGATCAATGT
TTTTTATTTGATGACTTCATTAATGATAGGCGGCAAACACTTACTATGTT
CACTATTTGGTTCTGTATTTTGCAGCTTCCCTGCGCTTTCATGTGAATTT
GCTTCAGTTGATGTCAGTGATGTACTGGGAACAGTAAGATTCTATCTCTT
CCTGTGGTGCTTTATTTTTCTTCTAGCTTCTAAATGTGACATTATATAAC
GTGCACCATTCCTTTTGTAAGAATAACCTAAAGGGAGGAGGGGGCCATAT
GATAGGCATCTAACATATCTTGCACGCTTTGCTTAATTTTTTTTATTCAG
TAGGCTTGTTATCCTCCATGTTAAAAATCACTTTATGCTACTTTTTAAAT
ATAGGAAATTATTCATTTCGGTTTACTTTGCATCTCCCGGTTATGAAAAT
CATTGCAACTACAACCCTGTCTCCTAAGCCAAAGTCCACCGATTATTGGG
CCTACATGGCAGCTAGGTATAACGATGTGTCACTAGTCAGAAAAAAAAGA
TGAAGACAATGGAAGTCCCAACATGTGACCAAACACTATCGCCCTACTGA
AATCAGAGAAAACTGAAGTATGTCAAATCAAGCCACCATGAGACCGCTGA
GCTCATCATAGCCGTCATTGCTCGCACCAAGCCGCTACCACCGCATGCTG
CTCTTGGGAGACCATAGCTTCTTCAGCGTTTTCCTCGCACCCACCACGGT
GCTAACTACGCATAGCCTTCGTTGCTACGCTTGCCAGTCTCTGGCTTCTT
CCTGCCAAGCCATGATGCTGCCGATGCTATGCGTCCCTGCTCACTGACTG
TCCTGCCAAAGCCGGTGGAGATAGAGTGAGTTGGAGAAAAGAGCAAGAGA
TTTTAGAACAGCAGAAGAGACTAGCAGTGTATGTAAAGGGATCCTCGAGT
GGATCATCTGTATCAAGCCATCTCTTTGTCTTGAACGATTCCAGTGATAT
GCTTGCAGAACTTTGCAATGCCGTGGGTGTGATGGTAGAACAAAAATAGG
TGGAAGGAGTTATTTCCAGTGATTTCCTTAGGGGATGTAAAGTAAACGGT
ATTGAAGTGATGGGTGAAAATTAGACATCAGAGGGTAGCTGAGTGATCAG
AACAGGCGTTTCCCTGAAATGGAAGCTATATATATTTTATACATACATCA
ACCTTAAAATACGGAATACTCAAGCGCCTAACTTTTTGCCAAGTTAGTTT
TTCATATTGAAGCATTTCCTACTCTTTTATCTTGCTTTCTATTGTATGCA
TCTTTTCTTTTGACGTTGGTTTAACTTCAGTTTCCTGTTCAAACATTTGC
AGAACAGACTAAACATAACGAAAACTGTCCGCAAGTTTTCAATTGATCGG
AATTTAGTACCAACTGGATCTGAATTCCACCCAGGGCCTATACCCACTGT
TAACAAGCATGGAGATGATGTTGAAGAGTACCATGGTGATGGTTCAGTTG
CCTTATCCTCTCACAATTTCGATAGATATTCGCACCAGTAAGTATTCAAC
CATCTAGTTTAATATGAACCTACATTGTTGCACTTCAGGCATTGTCAGAG
ATATTTTAATCACAGGATAACCCCTATTCATGTGGGTATTTAGTCTTCTT
ATCGCTATAGCTCTAAGCCTCTAACTACTTTGCTCGAATACTATGTGATA
TGGCAATCATATTTATTCTTGCCAGCCTGAGATATATGTCCTTAATTTTG
TATTATCTTTTAGAAAAAGTTTAGTTGTTGGATCCTTATTATTGTTTCGA
TTGACGTTTATCATGGATTCTATACCTTTCCAGGTATCCCGTTTTGGTAG
TCAACTTTTATGCCCCCTGGTGTTACTGGAGCAATCGATTGGTTAGAATT
AGTTCCCTTGTTCCCTTCTGCTTGATCTATATATTGAAAAGTTGAAAAGG
TTCTGATGATTTAATATTTCTTCAGAAACCTTCATGGGAAAAGACTGCGA
ATATAATAAGAGAGAGGTCTGTACTGTTGCCCTTCTTTGTCTCTAAGATG
GCTCGAGGGTTCATGATCTTACATTTTCAATTGTCATCCTGATGTTTTTG
TTACATACAGGTATGACCCTGAAATGGATGGGAGAATTCTTCTCGGCAAG
GTTGACTGCACCGTGGAAGTTGAGCTGTGTAAGAGGTCTGTGTGTACAGT
ATACTAATTAACTGTGAAATTTCAATTCAACAAATATAGGATATGCCGCA
ATGTGGAACCCAAAATCCTCGTTTGTCTCTAAATCTTGTTTGTCATCTAT
CATGTGAAATTGATTAATCTGTTATAAATTCCTAATGAAGTTATATTATG
ATGCCACCATCTTTCACGAGTTGCCAGTGTGTGTCCTTGCATGCCACTTG
TGTGGGTGCTTATGCCTTCTGGAACTTATTTGACTGACTACAAGTTCAAG
CCTTCAAGGCATTTTTTTATCTTTCATATTGAATATATAGTGCCATACTT
ATCTACTTATCTCCTCTGTACATGAACATGAGTGTTTTTTGTGCCTCTTA
CCTATGTGTTTTCTGTGATGGTGCCACTAATGTAAAATTTATGTACACCA
GTTCTTCAAGTTGAATGAAAGCCTCATGTCTCTGCCCTTCTCACTCTTAG
TTTCACATATTGGCATGTGTATGTCCCAGTTGTGATTCTGTTAATTTCAT
GTGCTCCCATATGTTTCTTTATTGAGTTAACATGCTAATGTAATATATTT
TTCATGACTTCAATTCATTAAATACAGGCACCATATACAAGGTTACCCAT
CAATTCGCATTTTCCATAAAGGGAGTGATATGAAGTAAGAACAGTTACCC
TTGCAATTATCTCTTAGATATCTTATGGGTTATGTTGCTACTGAGACTGT
AAACCTTTATCTGCCATTACTTTGCCCTCAAGTGCAACAAATAACCAAAT
CAACTTCTATACAGAGAGAACCAGGGTCACCATGATCATGATTCATACTA
TGGGGAGCGTGATACTGAAAGCTTAGTCGCGGTATGTTGTGAATCTCTTA
GTTTCCAGTTCTGTTACTTAATATGTTAGTACAATAGTACTACCTCTGTT
CCACAATATAAGCCTTTTTAGGAAGCTGTTTTAGCTTGCTAAAAAGGCTT
ATATTATGGAACAGAGGGAGTATTTATCAGTTCATCCACATGATTTTTCT
TTACTATGACAAGATATCCTAAACTTCAGCCTACCCGAGCCAGTTTAGGA
ATAATTTTCTCTAGGACTAAAGCTAAAGCTTCTTTGCTTGTTGTGCTAAT
TATTGTTTCATAGACTACTCTTCTGTACTGTGTCCTTGATATATGTTTTG
AATCTTAGGCAATGGAAACTTATGTTGCAAATATTCCAAAAGATGCCCAT
ATGCTTGCTTTGGAAGACAAATCCAACAAGACTGTTGATCCTGCAAAGCG
TCCTGCTCCAATGACCAGCGGATGCAGAATAGAAGGTTTTGTGCGGGTCA
AAAAGGTAAGTGAACTTCCGAGCTAACTTGCAGGGTGCTAGCCTCTCCAG
TATTCTTTTATTTGTGGGGGAACTTACTGTAGTATTAATAGTTGCAGCAT
GGAGGAGGGGATTCATTGATGCTGTCTTTGATTAATATGTTCTCTTCATC
AGGTTCCTGGGAGTGTTGTAATATCAGCTCGATCTGGTTCACACTCATTT
GATCCATCTCAGATAAATGTTTCCCACTACGTGACACAGTTCTCATTTGG
CAAAAGGCTCTCAGCAAGGATGTTTAATGAACTGAAAAGACTATTTCCCT
ATGTTGGTGGACACCATGATAGATTAGCTGGTCAGTCTTACATTGTTAAG
CATGGTGATGTCAATGCAAATGTTACTGTAAGTCCCTAAATTTTGCTTAC
TTCTCTCGTTAAGTTTGCAAGGCATCTAAGCTTTTTCCAGTCCTAACACT
TATGGTTCCTTAGAAAATAACGTAGCATTTATTTCAATTATCCCATTCTA
GATTGAGCATTATCTACAAATCGTAAAGACAGAGCTGGTTACGCTGAGAG
CGTCGAAGGAGTTGAAAGTGCTTGAAGAATATGAATACACAGCGCACAGC
AGCTTGGTGCACAGCTTCTATGTTCCTGTCGTGAAGTTCCATTTTGAGCC
TTCTCCCATGCAGGTAGGTATCTTGTTATATTGTTTAATTGTACTTCTTT
GCTTGGTTCATTAAGATGTGAACAGTCCATCGAAACTGATTCTCATTTAT
CTTCAGGTCCTGGTGACTGAACTTCCCAAATCCTTCTCCCACTTTATCAC
AAATGTCTGTGCTATTGTTGGTGGAGTTTTCACGGTGGGAACATGATCCT
TGTTTATATTTTCATATTTCTGAATATGCATCAATTATTCATGGCTAATG
AATGGTAATCTGTAAATTCTAGGTTGCTGGAATACTTGACTCCATCTTGC
ACAACACCCTACGGTTGGTGAAGAAGGTTGAGCTAGGAAAGGACATTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.