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GrainGenes Sequence Report: AA043958

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Sequence
AA043958
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043958
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCTGAGCTCGTGAGCCCTCCGGCCCCGGCGCTCGCGCTGTCCTCCGC
GGCTGCGCAGTCTCAAGCTGGACAAAACTTAAATGGAAAAAGGTTTCGGT
CGGTTTGAAAGAAAAAACATTTCACGTAGTGAGCCTAGCGGGAAAGAGAC
CAGGCCGTTTGCCCTTGTCCAACAGTTTTTTTTGGTGGATCGGCTCAACC
AAGTTTTTAAGGAATAATGCACCCCTTTCATCTCTTGAACCATACATGTC
GTAACTAACTAAAAACCTAGCTGACACTATCCTACTAAGGAAAAACAAGT
GAACCAAACACAACCTAATTATTTGACCAGACGTGTTAGCTTCTCGAGAG
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CCTCAATTGACTAAGAGCATTAATATTTCAGGTATGGCCCGATCTTTAGG
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AACTTTCACCTTGAAATCTGAACAAAAATTGTTTTTTACCATTAAGAAAA
CTGAATATGGTTAGACTAGGTTGAGATGTATATAAATGGTCACGTGATTG
GTCACATTTGACATAATTATTCCTTTATTGTCAGGGGCGGAAGAATGTGA
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AAGAGCGAGGACTTTCTCGATCTTCTAATTGATGATTCGAAGGAGGAGAA
GCATTTAATGAATGAGAATTTTGCCTTGGATTTGCTCTTTGTGTTGCTCT
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CTAACTGACAATCCCAAGGCCTTGCAAGAACTCACGGTAAGCAAGAGAAA
AGGCTAGTCCTGATTGGGTTGATGTAACTTCTGTGTGATTCCCAGTATTT
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TTGTTGACCATATGATTGAATCAGTCTCTTTGATGGTTGTAGGAGGAGCA
TGAGAACATCCGAAACAGAAGGACTGATCCCGATTCTGAAATAACATGGG
AGAAATACAAGTCCATGAAATTTACATCTCATGTACATATCTTGCTTCAC
CGCAACCACACACACTTCTAAATTTACATCTCATTTACATCTCTTTTAAT
CGGGAATGCGCACTTAACTATTACATTGTAGGTTATACATGAAGCACTAA
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GACATAAAAGGTACGTAAAACTATGTAAGAAAAACAAGACATGTAGGAGT
AACTACTCATATAGATGTAGGCCTATTTGGTTCATAGGAAAATGCAGGGA
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ATATAGAAGGTTAACTGACTATGTTAATATAGCAAGTTAACTAACTATGT
CTTAACTTATGTTAATATATGATTGTTGTTCATGTAGGTTACACTATCCC
AAAAGGATCAAAGATCATGATAAGTCCTTCTAGCGTGCATCTGGATCCTA
CAATTTACAAGGATCCCAATGCATTCAATCCATGGAGGTGGAAGGTTCGT
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GTCGACCCATATACAAACTTAAAAATACATGACATTATCCCATATGAATG
AAATTCTATATTGTTACTAGGGTTCATCCAAAAAGTTGTTCAAAGTTTCT
ATTATGACTACGGGAGAATGGGGATTAGCTCAATAGTGAGAATGAAAGGC
TAAAATATATAAATAATATTGAAGGCTAAGTGGATTTTTCTCATTAAAGA
CAAATATTACGTATGGAGGAGTACTGGACAGTGTAGCCCAAGAAAAATAT
ACGAGAACCGAAGTCTAGCTAACATCCTCAATTCTTTTCCCCTTACATTT
TATGTATTAGAGAACAAAAAAGGGATAATGTATCTAGATTCTTATATGAA
ACGGATAAATATTAGTTGCATTACAAAACCATGTCTTTCTAAAACCTAGT
TACTACAACCTTTATTTATAGGATACTGTTGAACCAGCTGGTGGTGCCTC
CAAGGAATTCATGGCCTTTGGAGGGGGGTTGCGATTATGTGTTGGTGCTG
ACTTTGCTAAGATGCAAATAGCTATCTTCCTTCATTTCTTAGTTACTAAA
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TTGCAACACTAAGGGGTCTTGCGTGCTTGTTTTCTTCTAGATTTCCTTTG
GCATAACGTCTTTCTAGCTGCCATGTCACAGTTAAATGTGGCCAAGTAAG
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AACTTTAGTGCTCCATTATAGGTTGGAAGACATGACTAAAATTATCCTAT
TTTAAAATTAAAAAACAAGGACTTGATCTCATTAATTTTATTTTTTTGCA
ACAAAGAAAGGTATGCAAGAAATGAAAAGATAATGAAATGTGTAGTAAAT
CCTAAACAACATCTTATTGTAGGAAAAACATGGGAATGTAGTAAAACTAT
GATCCGGACTCACTAGACGTAATGTATTACAGGTGCTCAACAGTAAAATG
TTGAAATATGATAGAACAACAATGAAAAATTAAGACTGAAAAATCACCTG
AATGCAAAGTAGGATTGTGTAGAACATATTTTTCAGGAACATCGTACATA
GGCTCATATTGTATATACAATTTAAACTTGTCTCTACTGCAGGTGGAAGG
CGATTAAGGGAGGAACTATGGTGCTTTCCCCTGGACTACAATTCCCCGAT
GGGTTTCACATCCAACTTCTCCCAAAAGCTTGATTTGTGGTTCTTGAACG
TGCATACATACAATATCTTTGTGATCAAAAGGGTATGTGACAATGTTGCT
TAATTACTTGTTATATGGCCATTGACTGAGACACGCAGGGGATATTGCTA
AATAAGAGCTTTACTGTGAGCATAAATTATTTGTATATTTATCCTTGTGT
GATATATAAATATATGATTTCGTCTCCTACACGTAAAAAGTGATGAGTGT
TCTACTATGTTGCTATATACTCCGTATGTGTCTTAATATAAGATGTTTAA
GCGATCCCTAGTCAAATTTTGTTGAGTTCTGAAATTTGGAGAGCTCCCGT
TTTTACCCCTCGATTTCGTCGCACAAGGTTGTGTTGCGCCACACACACCC
CACTCCTAGATCTCTCTTCCTCACTTCCTCCAGCTAGTACATCGCCTTTC
TCCCCACATGACATGTGTACACCGCCCCTGGCTCCCCCATGTTGTCGCCT
GCTGATAGCTCCAAATATAGACACTTTGTATCGAGGATTTCCATTGGTTT
TCACCGGGTTTCGTTGATTTTGATCTTTCAACTAAAGCTAATATTGCAAG
TTAGTGAAACATTGTTCTTTTGTAATGAATTTCTGGAGATGGACACTTTT
GGAAGATCCGAGAGCATTTATGGGCTAATCACACCTCAATGAACAAATCT
CCAATTGAAGACATTTCCATCCTCGCCGAGCCCTTAACGCCCTGCAGTAT
GGTCGGAGGCCGCCCATATGGTCCGCCTGCATGACCCTCCATCACCTCTG
CTATATCAATACAAGAACACAGCCGCAACACACCGTCCCAGAAGAGAGGA
GATCAGATATGAAGAAGGAGAAGAACTACACCTCATCCTTCAAAGATCCC
TAGCATCTTGATCATCAACTCTACCTTAATTCCCCACTTGTACTGTGTGT
GTGAGAGATTCATACTTGTAAGATTAGGGATTAGAGAGAGAGCGTCCTCG
TCGACGTCCCTAGGAGATTGCTCTGGTTCATATGTTTGTACAATGGGAGG
AGGCCAGCGCCGGTGGATCCCTGGAACGCATGGTGGTTGCGGTCGCGAAT
CTGATGGAGAAGAGGTCTACGCCTACTCCTTCTTCGGTGCCCAGCGCTGG
GTCGCTTGCAAGCATTCTGAGCTCGAGCCCCTCCCCGGGCTCTTCTGTGA
CTGGAATCAACGAGGGTGAGCAGACAAGAGGAGGGGCGTGGGGGTCCTGG
TGCCGGGTAGTGGGGATGCATGTGGAACTTGACTAAATGGAAAGAGGGAA
CTAGGGAACAAGCGAGTAGGGAGCGGACAGGGAGAAATTCCAGGGGACAC
ATGACCATGCCGGAGTGATGGGGAGGCGGGTGAGGTAGGCGACAAACCCC
ACCCGAGTGATTCTGAGGCAGTTGAGGGTGCGCAGAATGTCGTCGGAGTG
GTGTGGGACAGTGGAGGGGACCGAGAACTCTCTAGGGCAGTGAAGAGGAA
GATGAGGTGGAGCCAAACCTTGTCGCCAGCAGCTAGGATACATGGAGGTG
GACCGGGACATCACTGGGATGGTGGGTAGGCAAAGTGGAGTATGGGGCCG
GTTTATCTGATTTTGTGTGTGAGAGAGAGTTTGGTGTGAGTTTGTAAACT
CTTTGTTGGGGACCTTTGTGTAAGGTTTTGACCAGGTGTTCACACGCGTC
TACTTCAGGAAAACAAGGTGACGGTCGAATATATTAAATCATTTTTGTGC
ATCGCGTTTTTAACGGATGTTATTCATTTGGATCATGGACATGCTTTCAT
CGTTGGGGTTGGGTCACACGACTGTATTCTGACTCCATAGAGAAATGAGT
AGGATTTAAAAGACATATTCATATTATAAATTTATAAGAGGTGTTGCCAT
GTGCACACTTACTAGTAGTTTAAATAATGAACTAACTAATTCTATCTTAA
CATGCATCTCTAGATGATGAAACCTCTAGCTAGCTACTCGATCGGGTAAT
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TATATAGATTTTGGGTCAAAAAAAAAAGATTCTAACGTCTGAATACTTTT
TACTGTTTGCAAAATATTTGTAAAATTACTCTCAAACATTAGCCGAATTA
CCCTAACGCAAAATGAAAATTAAAATCTTGAAAACAATACAGATGACGTT
TCCCTGTACAAATACTAGGCAACTTTGCGCAGCAACACCCGCACCCTCGG
CATTAGCTCAGTTGTGTACATGGCTAGGTTCGACATCGACATGATTTTTG
GAAGTTGTATAAGAGAATTACTGTCAAAGAAAATATACACAATTAAGAAA
TGACGGGAAATTTAAAAATATTGTCGTACACGTAGGCTAACTAACTTCTG
AAAATTATGGCCTAAAAGGTGTGTGCAGAAAGAGTAGTTAAAAAGAAAGA
ACGTAAAGAATATCGTCTAGGTAACTTCCTGTCTGAGAAAAGTTGCGCCA
AAATTATCATCAAAGAGCCTACAAGGAGGAATAAAAAAACCAAAAAAAAG
GAAAAAAAATAACACTGCTGCATGGGACAGCATGGCGGGGCCTGAATTGG
ACCTTAAAGCAATCTAAAAAATAATGTCGTGTATACGTAGGTTAACTACC
TACTAAAATTATGGATAGAAAGGTGTGTCAAAAATTATCGCCGAGTAGAA
TATAAAAAATACCATCTAGATAATTTCTTGTTTTGAGAAATAGACGTAGT
TAACCACGTTTGAAAAAATTAGCCAAAAAGTTGCATCACAAAGTCTAAAG
AGAGGGGGAAAAGAAACAAAAGCCATTAGTAGTGCATGTCATTATACTGT
GCATGGCGGACCATGTGTTTAGTACCATTACTGTTCACTGTGCTGTTCGT
GCATGGCCATTTACTGTTAGCCGAAAAGTTAGGCCAAAAATTATAATCAA
AGAGCCTACAAAGAATTACCAGAAAACCAAAAAAGAAAAAAAATAACATA
ACACAGTAGCATAGGGCCCGTGGCGGAGACTGAATTGGACAAAAAAAGCA
ATCTTAAAAAATGACGTGGTACATTTGTTTCAAAAAAAAATGACGTGGTG
CAGGTAGCCTAACTCATCCCTCTGTTTAAAAATATAAGATATTTTAAATT
TATAAAGCTAATATATCTAAAAATCTTTTAGTGTGTAGATTCATTTTAAT
CTACACACTAGAAGGTGTCTATATATATTTATTTTATAAACCTAAACATC
TTATATTTTTAAAGAGAGGGAGTACCTTCTAAAAGTTATGGCCAGAAAGG
TGTGTCAAAAATTATCGTCGGAGTACTAGTTAATAAGAAAGAACGGAAAA
ATACATCATCCAGATAACTTCTTGTTTGAAAAATAAAGGTAGCCGAACAG
TCTAAAGAGAGGAACCAGAAAACGAAAAAAAAACATCGGGTTTGATGGAT
GATGGTACTGTACCTTGCACTGTTCGCCGTACGGTTGATGGATCATGTAT
TATTTTATAGTACCGTTACTGTTTATGGTGATGTTGTATGTATAGTTTAT
CTATGAGTAGTAAAGGAGTTAATAGCATAAAATTATTACTTTGTATGTTA
ATAGCATATAAAACTATCACATTGGATCTTGGTTGTCGCAAAAAGGATTG
ATCGCTGTCTAAACAAGAATTGACACGGTTTAAGATGGATGGGCCCACCT
GTCAGGCTGACAAGGCAGCGCGAGACGGCGTGCCGTCTGCCGTTTGCACG
CAGGTCCTCAAGTTTTAACAGAAAATTGCGCAGAAGTCCCTAACACTATT
AAAACCTTCATAACTTTTGAATACGAATTCAAATGGAAAAAGTTTAAATA
CGAAAAGTGCTCATAATTGTTTGAATACTTAAATATAAACTTTATTTATT
CTTTTAAATAATTAAAATATGCAAAAACATAAAAAATATTTTATTAATTA
TACAAAAGCTTTGGAAATTCATAACTTTAACTATATAACTCCAAATAATA
TAAATAATATGTCTAAATTTATTAAAAAATCCAAGGAATCCATTTCTTAT
ATTTATAATGCATGAATCATATCCGTTCCTCTCGGATATTTTGATTATGC
AAGTAGTCATAATAACAAATGTGTGCCATTTTATTTATTTTTTCATATTT
GTAGATGCACTAGAAATATGCAAGTAATCCACTAACTGATCGCAACACCT
AGCTACAATGTGGTAGTTTTATACGATTTTGAAGGCAATTGGTATGAATT
GGGAAATCGACATACAAAACGGTAAATTTTTACTATCAACTCGTAGTAAA
GGGGTCGTGGTTGGAAGGACCGCATCGGATTTGCAGCATATGCTAAAGAT
GCTTTTAACATCTTTCGCCGCGCGCCGTAGGTAAGTTTCACCATTCGTCG
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AGAACTATAGTAGAAGTGAAGAACACTATATTGGTGGTAGGCGCGCGGGT
GGTATTTTGCTCCTCACTTTTCTGATGTAGGCCATGTGATATGATGTCGT
GGACCCCTTACAATGTAGCTCCGGCCGGCCGTGTGCACAACGTGCGCTCC
CCGCGCGCGGGGGTTCTTTCTATATAACGGACCAAACAAACGCAGTGAGA
GAGATATCCACACCATTCGTTTGCCTCGCTCGTAGCAGCTAGAGAAACAC
GGACGTGCTGTGAAGTGAGTTGCTAGGATGTGGAGTAGTACCGTAGTCCT
ACTGCTGGCTGCAGCGTCTGCCATGCCTTGGCTTGCTGCCATGGCCGTAG
CGGCCTGCTTGGTACTGATAACGAGACGATGTTGGGTCTCACGCAGTGAC
CCGAGGCTGCCGCCGGGGTCGAGGGGGCTCCCCCTCATCGGCGAGTCGCT
CGAGTTCTTCACCGCCAGCCCGTCGCTCGAGCTCGTCCCCTTCTTGAAGC
GACGTCAAGAGAGGTACTGTAACTATAATGGGTATTATTGGTCCTGTGCG
TCGTCCTCGGCCCTCTAGTTAACTCCGACTTGTCATAATCATGCAACTCA
TCAACTACAGTAATGGTCTCTAGAAAAGAATCAATGGGTTCGCCAAATTT
AGTTGCACGTTTATTTTTGTATTTGCAAGAAGAGGACACGCACACAAGAA
TTTCCTAAGGAATTATCATTCTGAACGATCGATAATCTCCATACATGGGG
TAGCTAACTAATAAAAACTAGCTGCCACTATCCTACTAAGGAATAGCAAC
TGAACCAAACACAACCTACTTATTTGACCAAGTGTGTTAATTAGCTTCTC
CAGTGCACAAAAGAAACCCTAAGGATCACAAAAATTGTTGCCCTAGGCCC
TAGCACGATGTTTTCCTAAATTCACTAAGAGCATTAATATTTCAGGTATG
GCCCGATCTTCAGGACAAATTTAATCGGCGAAGACCTAATAGTGTCCATG
GATATAGAGCTGAACAACCTAGTGTTCCAACAAGAGGAGAAGTTGTTCCA
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CTCTTTGGCCCTGAAAATCTCAGGTTGGTACTACTCCACGATGTCCAGCG
AACTACCCAGGCCAGTCTGATCTCCTGGCTCAATCAGCACAGCATCGAAC
TCAAACAAGCAACCTCAAGTGTATGTAAAATTTTCAGCAGTATAGCATAC
ATGTTGTAGCACACAAGATCCTACGAGTAGTCATTAATTAAGTGTAGCTT
TGTCTTATCGTAGATGATATTCAGCGTCACAGCAAAGAGGTTAATCAACT
ATGATGAGTCCTCAAGCTCGGAGGGGAAGTTGTGGATGCAATTCGACGCA
TTCCTTCAGGGACTGCTAGCGTTTCCACTCTACATTCCTGGCTCGGCTTT
CTACAAATGTATGCAGGTAATTAAGAACTATATAAATACATATATTTTGA
AGGAAATAATTATAAGTAGTGGAGGGAACAGTTAGGATTCAGGTCTTGAA
CGACTGAAAATATGTTAATAGAAGACATAAATCAACAATCATAGATAGCT
AGGTGAAAATAAAAATTTATAATAAATCATAAAGTGAACATGGAATTAAC
CATTGAAATTATAACTTTCACCTTGAGATCTCAATAGAATTTGTATTTTA
CCATTAAGAAAGGTAAATATGGGTAGACTAGGTCGAGATGTATATAAACG
GTAATGTGATTAGTCAGATTTGACATAATTATTCCTTTATTACCAGGGGC
GAAAGAATGTCATGAAGATTTTGAGGAAATTGCTTGATGAGAGGAAGAAA
GCACCACATCAGAAGAGCGGTGACTTTCTTGATCTCCTAATTGACGATTT
GAAGGAGGAGAAACATTTAATGAACGAGAAATTTGCCTTGGATTTGCTCT
TCGCATTGCTCTTTGCCGGCTTTGAGACCACGTCATCTGGGATAACTGTC
GCACTCAGGTTCCTAACTGACAATCCCAAGGCCTTGCAAGAACTCACGGT
AAGCGAGAGCAAAAAACTAGTCCTGATTGGGTTGATGTAAGTTCTGTGTG
ATTCCCAGTATTTACCTCAATCTTATGCTAAATATAGAAGAATACACAAA
AATGTCTCTATGTAGTTGGGTAGATTGCATATATTGTGTTGACCATATGA
GTGAATCGGTCGCTTTGATGGTTGTAGGAGGAGCATGAGAACATCCGAAA
AAGAAGGACTGATCCCGATTCTGAAATAACATGGGAGGAATACAAGTCCA
TGAAATTTACATCTCATGTATATATCTTTCTTCACCACAACCACACACAC
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GGTTATACATGAAGCACTAAGGTTGGGCAACATTGCTCCTGTCATGTTTA
GAAAAGCCACAGCGGATGTTGACATAAAAGGTAAAAAACATGTAAGAAAA
ACAAGACATGTAGGAGTAACTACTCACATAGATATAGGCGTATTTAGTTC
ATAGGAAAAAATGGTGGGAAACTATAGTCAGTTTGGTACTTTGGTTCAAA
GGAATGGACCAAATAAAAAAAAATAGAGGAACTATATATACATTTCCTTG
AATCTTAATTTCCAAACATAAACATAAATTTTAGAGTCAGTTAGATCACT
TTTTAGAATTCCTATGTGGAACGTACGAGATCGAGATCTTTAGGGGCAAA
ACAATTTCGTAAATCCTAATTGTAGTTTCTTCGTGCACTTTAACTTTAAT
TTTACCATGTTTATTAGAATGTAAAGTGATTTTCGTGTTCCACTAAAACA
AAATTGCAAGTTTAAAAATTTCATGTGTTTTATACTATTTTGGTGCACAC
ATGCATTCCTATCATATTCTTGTGATTCTAAAAATCCTACAATTTTATGA
TTATGTGAACAAAGTAGACCCATATACATTGATACAATTACAGCTCTATA
TATAGCGAGTTAACTAACTATGTCTAAACTTGTGTTAATATATGATTGTT
ATTTATGTAGGTTACACTATCCCAAGAGGATCAAAGATCATGATAAGTCC
ATCTAGCGTGCATCTGAATCCTACAATTTACAAGGATCCCAATGCATTCA
ACCCATGGAGGTGGAAGGTTAGTCAACTTTATAGGGAAATGCCAAATGCA
GAGATTTTATAAAAATAAAGGAAGGTCGGGCCATATAAAAACTTCAAAAT
ACATGATATTATCACATATGAATGCAATTCTATATTATTATTAGGGTACA
TCCACAAAGTTATTCAAAGTTTCAATTATGACCGGGGGAGAACGGGGATT
AGCTCAATAGTGAGAATCAAAGGATAAAATTTTAAAAAAAGGCTAAGTGA
ACTTTACTCATTAAATACAAATATTACGCATGGAGGAGTACCGAACCGTG
TAACGGCAAGAAAAATATACGAGAACCGAAGTGTAGCTAACATCTTTATT
TCTTTTCCCCTTACAGTTTATGTACCAGAGAAAAAAAGGATAATGAATCT
AGATTCTCATATGCAAGGGTATAAATACTAGTTGTAGTACAAAATGTGTC
TCTAAAACCTAACTATTACTACCTATATTTGCAGGATACTATTGAACCGG
CTGGTGGTGCCTCCAAGGAATTCATGGCCTTTGGAGGGGGGCTCCGATTA
TGTGTTGGTGCCGACTTTGCTAAGATGCAAATAGCTATCTTCCTTCATTG
CTTAGTTACTAAATACAGGTGAAGTTCCTTTTTTGTATTTGAGATAGTAG
TAAATAGTTACAATAGCAACACCGAGGAGTGTTGTGTGCTTCTTCGCTTC
TAGATTTCCTTTGGCATACGAAAGACACCACTACGATGTAAAATTATCCG
ATCCTATTCTTGTGTTTGTGACCTAACATCTTTCTAGCTTCCATGCCACT
CTTAATATGGCCAAGTAAGACGGTGCATCAAAGATTTGTAATGCCTACAA
AAAATGGGATATGGCATGCAACTTTTGTTCTCCATTATATGTTGCAAGAC
ATGACTAAAATTAGCATGTTTTAAGATTAAAAACCAAGACCTTGATCTTG
TTTATTTGTTTTTTTGCAACAAAGAAAAGTATGCAAGAAATGAAAAGGTA
ATAAAACGTGTAGTAAATCCTAAAAAAACATCTGATTGTAGGAAATACAT
GGGAATGTAGCGAAGCTATGATCTTGACTCTCTAGACCTAATATTTGCAT
GTGCTCAATAGTAAAATGTCGAAATATGATAGAACAACAATGCAAAATTA
AGACCGAAAACACACATGAATGCAATGTAGGATTGTGCACACCGTAGTTT
TTCAGGAATATCGTACATAGGCTCATAATTTATAAAATTTAAACTTGTCT
CTTGTGTAGGTGGAAGGCGATAAAGGGAGGAACCATGGTGCTTTCCCCTG
GACTACAATTCCCCGATGGGTTTCACATCCAACTTCTCCCAAAATCATGA
TTTTTGGTTCTTGAATGTGCACACATATAACATCTCTTTGATCAAAGGGT
ATGCAACATTGTTGCTTACTTACTTGTTACATGGCCATTGACCGAGACAC
GAAAGGAATAATGCTAAATAAGAGCTTTACCATCAGCATAAATTATTTGT
ATATTTATCCTTGTGTGCTATATAAACAGATGATTTTGCCGCGTACACGT
AAAAAAGTTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.