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GrainGenes Sequence Report: AA041771

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Sequence
AA041771
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041771
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTATGCATTGCCACCGTCAATCACCGCCGTCCGCCGGGAAGCCACTGCC
TCCGCCGCGACGGCAACACTTGCTCAGCTTAAACACCACGCTAACCCACC
CGCTTGATAAATCTTTTACTACTCCGCAGCGAAATTCGAAATTCCAAACC
CTCTCTGCTGCCTCGGCTCGCCGCAGCGAAATCTCCCCGCCTGCGCCCTC
CGACCTCCCGCTCAGAACCCTAATCTCCGGCCGCCACCGACGGCATGGCG
GCGCCTCGCGAGCTAGACCTCTCCGACGAGGTAGAGGGCGAGCAAGACGG
CACCACCGACTTCGTCTTCCGTCTCGTCGGCGACCCCATCCCCGTCCTCC
CCACCGCCTCCACCCCGCTCCCCCTCTTCGACCTCCACTCCCCTCCCGCG
CGCCCGCTCGCCGTCTCCAACCGCCACGCCGCCGTCTTCCTAGCCCACCC
CAAAGGTAAGTCGCCGCGAATCACCAACCAGCCAAGCGCCTGCCTCAGCA
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GTGCCCCTCCCCGGTGTCTCTCTCCTAGCGCTCTCCCGTGACGAGTCGGT
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ACTTTATATGGATATATGGACAATAGATCATGCTCTAAGATACCTGTTTG
TTTGTTGTTTTCTTTAGAAAAACAACTGGATAGGTTTTAGTCATGTACTA
ATTTGTACATGTGTGTACTTATAGTATAAAGGACATCAATTAGTTCGTAG
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ATGCTCAGGGCGGTGCTTAGAAAAGTAAACCGGTTTTTCTTTAAGCACTG
GTGCTTATTTATACTAGGTAGATGCCTAACTAGGCACCTCTTCTATAGAA
ATAAGCACCAATGCTTAACAAAATGGTTGGTTTATTTTTATAAGCACTCT
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CACCAGCTCACTTCCGAGGCTGATGCGTGTGGTCCTTTAAAATTCTTACA
ATTTGCGAAGCCATTTCTTTCGGTGTGTAATTGAAGTTATTCATAAGTAT
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CTTATATGAGTGAGCAGCACACAGTTCGCTTATATGATCGCTTCAGGATG
AACAAAATGACGGAAAATGGTGTTTGTGAAGTGCACCACAGACTAAAATT
TGTACCATAGTCATCTTGTAGTAAAATTATATATTGAAGAACCATCAACA
ATGATGCAGAGTTCTAGGAAAATTATGAGATGATACTTGAAGACGATATA
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ATTCCGTGTTGATGTTATATTTTCTAATTTTCATCAGTGGACTCCATTGG
TTGGGTGCGCGATGATAGCATTGTTGTCGGTTGTGTTCGATTGGATGAAG
AAGGCAATGAAGAGGGCTATATGGTCCAAGTTATAAGGAGCGGAGGCGAT
ACATTTTTCGAGGTTAATTGTTCTTCTAGTTCTGCATCTCTTCTTTTGTT
TCACATTTCCTACTAGTATGATATTTCTTTGACAAATGTGTCATTTGCAA
AATGTTCTTTCTGGGAACATTCTTGACGAAAGCTACCTCAGTTTGGCATG
TATTTTTTTAAGCATATATATGTACACAAGACCAAGTGTTGGCAATAGTT
GTATTTGTTTCAGAGATGTAAATTAAATACCTCTTGTCCCAAATATAAGG
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CTGTTGTTGGATGGAATTCTTTGTATCAATATTGTGTCTGCACTCTGCAC
TATGTGGACATATTTTGCTGCCTGCTACCAAAGAGATCAGAGGCTTGTGA
GATGTGGCGATTTATCAATATTTTCATTGACCTTTAGATTATTCTTCATG
AAGACTAATCTTTCGAAGGAGTATATGTAACTTGTAACTCTTTGGGAGTA
GAGTCCATTAGTCAACTACTTGCAGTTATGCCTATCCAAAATTACTGAAC
TATTTGGCTTTGCATAAATTTATCATGAAAGGATGTAAGAACACCACATG
TATGACAAGATGTATACGCCTGTTAGGTTCTGATAAATGATAACATATGG
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AAAAATATTTACTAAGATGTTCTAGTTTGTCCCTCTTTGACTTTTAAATA
TCAGTACTTATTGGTTGAAGTTAATGCTGTTGCTTTCTTAATGCCTTATA
GAACTCAAGCAAGCCAGTTGTTTTTAGCTATGATTGTTTTGGAGGTATCA
TGGATGATATATTACCATCTGGAGTTGGACCAAATTTGCTATTAGGCTAT
CTACACCGCTGGTATGCAAAAGCGGACTTGACTTTCTTTATTTAATAATA
CTTCTCTATAATTATTTATCTTTTATCTTGTGGACTTTGTGTGTATGGTG
GTGTTGCGAAGAAATGTTGTTTTTGACATAAATACTGGGAGGGAAGCCTC
TATATCAGGAATAATTATATAACAGGATTATACCATACAGATAGATAAAC
AATATTTAAAAGAGGGTATTTGTATATGCATTCTGTCATTATCTTGTTAC
ACTTGCCATATCCAATATCTTTGTGTAACTTGACAGGGATCTCATGGTTT
TTTCAAATAAAAAGAGCACCGATGACCACATTTCACTTTTGAAATGGCCG
TCCATAACTGATGATGAAAGAACTGTGGTATACCTCGAAATATTGGAGGA
TAAATATAGTCCTAGGATTGATCTGCAAGGTATGACACAACTCAGTAAAC
CACAATAAATCACACTATTCCTTTTCTAATAGAACAATGTATATACTCCT
TTTGGCTTTCAGAGAATGGCGATGACAATGTCATATTGGGGTTTGGTGTG
GAGAATGTTTCGTTATTTCAAAAGATCACAGTACTGGTCGGACCTGAACA
GAAGGAGGTTGCCCCTCAACATCTTCTACTTTGTTTGACTAGTGAAGGGA
AAATAATTATTTATTATCTTGCCAGGTAGGCCTTCTATTGAAACATGGCA
CATAAACTGACTGTTTACTTTTTCTAATGCAGTTCATATATACTGACATT
TTGTCTTAAATATCTTTGCTTGTATTGACACTGTTCATGAATTTAGGATT
TCTGACCCTTCCGATTTACCTCAAACAAGTCCGTCTACCATTGAAGATAG
TAATGTGAATAAACAAATTTCTCATGCAACTGTCTCTGGAAAGGATTTGA
CTCCAAGTGTTACAAGCTCAATGGCCAAGAGTCTGCTCGCAGAACCTGAG
GCTGAGCCATCTAGTGCACACGCAGGTAAGAGATTGCTATTCAGGAGTTA
CTACTGTTTTTCAGTATTTCTCATGTGTGTTGGGAACTTAAAGAATTCTG
CTGTTTCTTGTATTCTTGCAGAGAGAAACCAGCATGGATCAAGAGGTTCA
GAGAGCATTTCTTCAGTTTCAAGAAACAAGGATGTAGCGGGCAGTTTGCT
GCCTATCTCTTCTGATAACAAGTCGCTGAATACCAAGCAAGTGAATGTGG
CTTCCCCATTTGCACCTCCCTCTAGCTCAGCAACTTCCCCATTTGCACCT
CCCTCTAGCTCAACACCTTCCCCATTTGCACCTCCCTCTAATTCAGCACC
TTCCCCATTTGCACCTCCCTCTAGCTCAGCACCAACAAGCAACACGAAAC
CTGGAATGCCATTCAGCTTCTCTACTGCTAATAATGCTGGTACGAATTCA
ACAGGAAGCAAGGGATCTAGTGAATTAATTTCTTCCTGGCAACCAAACAA
CAGCAGTAGTTTTGTAAACAGCCAATTTGGTAAAGGTGGCTTGGATTCAG
CCAAACCACTGGGAGCATTTGGAGGATCTCAGATCAGTACAAAAGCTGGT
GGTAGCCTTAGCTTTAAATCACCACTCTTCAGTTCTGATGGATCGGTTCC
AGTTAAGACTGCAGAAAGGAATGAGGCTACTGGTTTTGGAAGCAACCCTG
CACAAACCAGCTACACTGCTGGGAGGAATGTTCCTGGTTCCTCAGCTGGA
TTAAGTTCTGCGCCATCGTTGCCAATTTCTCCAAATAAACCAGTTGGATC
TTCTTCTGCCAGGTTTGGGGCAGGAAATCTCGAAGCACTTCCTATACCCC
GTGGATCACCCCTGCCACATCAAACCATTGGCACGTCACATAACAACCGG
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TACCGAGCAGGATCTATCTAAGAAGTTCTACAGTGTAAGATCAACAAAGT
TGTTTTAGTATAATGTTCACTATTATGCCTTGCTGTGGCCTGATTTTAAT
GGTTTTATCTTTTCTGACTCATCGTGCTATACAACATATCTATGGTAACT
TCATAAGTATCCTATCGATTGAGTTTCCTACATGTGTTCATCTTGTCTAA
CCTATCAGAAGTATCCTATTGATTTGTGTTCCTTGGATATGTTTACCTTG
CCCAACCTCTCCAGCATATTTTGTCCCCTTAAAATTAAACTAGATCATTA
TTTGTTCTTTTGCACCAGTCCAGATATCTGAACTTATTTTATTTTGTTTC
TACTCTAACATTGTATCATGCTAGGACCATATTCCTCCTGTAAGTTGATA
ATTGTAGCAAACATGTTATCCTCCAATGTATTAAATACTTAAAATATTGG
AATTTGGATCTACTTCACAGTTTGCTACCTCACTGAGCATCTAGCTACCA
ACTCATGTGTTTTGACCAATAAGTTCTTGCTGTCATTAAACAGATAAATG
ATATGACAGAGGAGTTGGACACCCTCCTGGCATACATAGAGAAAGATGGT
GGTTTCAGAGATGCTTGCATAACTTTTCAGCAGCGTCCTCTTTCAGTTCT
TGAGGGTGATCTGCAGAACTTATTGGAATTATTGCAGGTCTTCAAGGTAA
TAGAATTATTTTCATCCAGACCCTCAGTGCTGCCTGTTCAAAATTGTGAC
TTATCATGTTATATTTTGATCTCCAGAGCAAATTAGAGGAACAGTGTTCA
AAAGCTGATGATCTGCGAAATAAGATGTTCCAAGGTACTTTCTGTTTACA
CCTGGAAATAGAACAATACAAACACTTCACCTTAACCTAGAACAAAGGTA
CTGTCATTAATATTTACCAGGAAGAAATAATTTCATCATCATTCAAATCT
TTAGCTCGATAGGCTGTACACCAGCGCTAGTTTGTAATCAATAAATAGCT
GAAATACCATGCACTTGGTTTGGTGTAATTTTTTTATTGCAGAATAGTCA
CTGAATATGGTAACTTCTGTTTTTGGAACAAATGTTGATATACTGTATCT
CTCATCTACTGATGGTCCTAACTTTGCTTACTTCATACTCCCTCCGTCCC
AAGGCTTAGGGCGCTAATTTCTCAGCGTGATTATTTAGGCACGATCGGCA
GGTGAAAAAAAATCGGGAAGTTTCCCTTATTGCCCCTGCATGCACGGAGT
TAATTCCCTCAAATTTCTTTTGGCAGGATACGCTCGGTAGACTCGGTCCC
AGCATGCGGGAGTTAATTTCCCTTATTGCCGCCGCGATGGTTGACTCAGC
CCACTGCATGCACAGGAGTTAATACTGCCCCGCTGTTTTTAAGGACGAGG
GGAAACGGGAAGGAGGGGTAAAAATGGGAGTAGCGATGCAAATGATACCG
CGCCTTATGCCTTGAGTAAAAATCGGAATTTTTTTAACGCCCTAAGCCTT
GGGATGGAGGGAGTAGATTCCCTACCACCTGCCTACAGCACATTTTAGAA
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TTTCACTACACAACTAAACTATGGCAGTTAAACCAGGGAACAAACTAGGG
GCTCCTTATGTTGCATTTGTGCAGATATCTGATGCGTCTGCTAAAATAGA
TCTGCGAAGAGTTTACTAGAGGCTTTCTCATTGAGTCCCCTACACCATTA
TTTGAGCGCTGTGGGCCTGTCTGTGCTTTAACAAGATTCTGTTAACTTGA
ATTATTAACACTGTTGGCTGTTTATCAAAATATGGCATCACCAATTATCT
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TCCCAAGTAACTGCTGGTATTTTTGACAACCCCTTGACATGGAAGAGTAG
AGACTTGAGAGATATACAATTAATTCACTTACCTCCAAGCCTCTTTCTTG
TGAAAGGACAAATGTTGAAATACAAGCATTTGAATTGCACATTAATGACT
TTATTTTTTATCTCTCTGCAGTTTCTGCTAGGCAAGCTTATATGAAGGGG
ATTCTCAATCAGTCTTCAGATACTCAATACTGGGATATATGGAACCGCCA
GAAATTGAGTCCAGAATTTGAAGCGAAGAGGCAAAATATACTCAAAGCTA
ATCAGGTACTAAGGTCTGACTCAAGTGTTTTTGGAATACTAATGAACTAA
GATCGCCTTTTAAGGTCTGACTCAAGTGTTTTTGAAATACTAATGAACTA
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GCTGGAGAGGCACTTCAATAATCTGGAGATGAACAAATTTGGCGAAACAG
GAAGAGTTACTTCTAGTCGGACAGCTGTTTATTCTAACAAGTCACGGTCT
AGGTATTCTCCTACTATACCATCTCGATAGAATTGCCAATGCATATTGCC
GATAACATCAAATGGATGACAAACATGGAACAATATTCAAACATCTGTTC
TGGTGATTTTCTTTCAAAGAGAAATCAATCATTTTGCTAGTCTGCTCATT
CCCTGACCGGATTGATTCGTAAATCTCTCTTGACTTAAAATGGATGGTTT
CTTTGCTTGCACATTGACTGTATTAGCTTATTGACATTGCTTCTCATATT
AACACACCTCAAGTCACTTTGTTGGTTTTCTATGTGCCACGGTGGTAGAA
TTGTAGTGTAGTTAATTCAGAACATAATTTGCTAGTTTCTTTATTTGTTG
TGTTCTAACCATGCTTGTCTTTTGTTTCACCTTTTGTCTTCAGTTGTTTT
CAATTTTCATATATTTACTTGAGCTTATCTGATTTCCAGTATTTATTTGA
CAGCCAGACACAATTGTCCAGCGTGTACAATGCATTGAATTCACAATTAG
CAGCAGCCGAGCAACTATCTGAATGCCTTTCAAAGCAGATATCTGCACTA
AATATAAGTTCTCCTTCTAAGAAGCGAGGGGCAGTGACCAAAGAGTTATT
TGAGTCAATTGGTCTAGCCCATACGGCAGATGCAACAAAATCTTCAGGCG
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ATGGCCATGCTGGGACCTTCCAAAAGTGCCGAGCCTGAGACTGCACGAAG
GAGGAGAGAGTCGCTGGATAGGGTAAATTAATAATTATTGAACCCTGACC
AAATTTTGCATCTATATCTAATATGCACGTTGATTTGCAAAGAAGATGCT
CATCTTTTTTCCCAGTTCCCATTAACCCCCTCGTGTAAATGCCATTTATC
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AATGTTTGATTCTCAAATGGCTGCTATCTCCCAGGAAACTTTTAGTGGTA
GCCCCAGCTCATCCTTAGTAGAATCATATACTAGCAGGCTGCATTCTCCA
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AACGTTTTTATTTCAAGGATATCCTGGTTATAGACATTGTTAACATATGA
GTTTCTGCTTGTCTTTTACAGTGCTGGATGAGAAAAGAAAACCATCAGGA
CCCCAGCATAACTCTTTGTTCAAATGGGTAAATGAACCGGCTGGGCCATC
TCAAGGCTCGGAGCAAAAGCATCTTGAGTTACCAGGGCGAATGAGAAGTG
CTGATCAGTCTTCAAAGTTGGTGCCATCTTCACCAGCATCGTTCAGTTAC
ACACAGAAGGATACACGAGATAGGATCAGCTCACCCAGTGTTGCATCTTT
CGGAACAACTCATACTGTGCCTAAGTCAAATACACTTACCTTTAAAACCA
CTATGACTCCTAAAACTAATGCCAATACACGGCCAGATATGTCACCCTCA
GTGGCAAGCTCACCGCCTGTCAAAACTTTCTCTGGGGAATCTGCAGCTGG
ATCTACCTTGACTACAAAGAATAGACACAGTGACCAGGATGTACCATCTT
TTGGAAGCATGAAAGGGTTGGGCATTTCTCCACAGAATATGGGCATTAAT
AAACCTTCTTTGTCTTCGGAACCTTCTAAGCCTGCTGTGTTGCATGGGAA
GACTTTTCAACTTAGTGGAGTTAGTGATACTATCCAGAACTCGGCCAAAG
CTTCACCTCAGGTGGCACCACAACCTCATGCATTTTCACCAGCATCACAA
TCGTCTTCATTCTCTATCATGTCAGGTGCTTCCTCTTTAGCTGCATCACC
CTTATCAACCATGCAAGTATCAGCTGCAAAGACTTCAGATGTTTCATCTT
CGGTTTCTTCCATACCCCCACCACAGAAATCAATGTCAAAAATTTCCCCA
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TCTTAAGGAGTCGTCACCTGCCCTGAATAGAAATGTATCTAAATCTGAAG
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ACAGGCGTGTCTACAACTGAAAGCAAAACTGCATTGCTTCCAGTAACCAG
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AATCTCTCATCAGATGAAGATGAAATGGAAGAGGAGTCCCCTTCTGCAGG
TGCAGATCTCAACTTGGGAGCCCTTGGTGGGTTTGGTCTTGGGTCTGCAA
CTTCTTCAAGTCCTAAAAAGTCTAATCCTTTTGGGAGCACATTTGCTACA
TCTGACGGTAAATCTTCAGGTTCACCATTTACTTTGACCACCAACCCGGG
ACAGCTTTTCCGTCCAGCATCACTGAGCATTCCTTCATCTCAGCCAGCAC
AGCCATCTCAATCAACTAGTTCAAGTACATTTTCTAGTGCATTCTCAAGT
GGGCTTAGTGGATTTGGACAGCCTACGCAAGCTGGAGCAGGGCAACAGTT
GGGATTTGGACAGTCTGCACAGATTGGAGCTGGTCAGCAGGCAGGTTTTG
GGCAGCCCGCACAAATTCAGTCAGGGTTCGGTCAGCCAGCACAAATTGGA
TCTGCACAACAGTCAGGATTTGGGCAACCTGCACAGTTTGGTGCTCAGCA
GGCGCTTGGATCTGTTCTGGGTTCTTTTGGACAATCACGCCAGTTGGGAG
GCGGCTTTGGTGGATTTGCTAGTTCCTCCTCTTCTGGGGCTTTTACTTCT
GCACCTTCCAGTAATTCTGGATTTGCTGGTGCCACAGCAGGTGGGGGCTT
CTCTGCAGCTGGTTCTTCTGTTGGCGGAGGGTTTGCCGCCGCTGCTACTG
GTGGAGGGTTTGCTTCTCTTGCCTCCAAAAGTGGTGGTTTTGGTGCTGCA
GCTTCATCTGCTGGTGGTTTTGGAGGTGCAGCCCAGGGTGGTGGTTTTGG
AGGTGCAGCCCAGGGTGGTGGCTTCGGAGGTGGTGAGATTTCTAGATTTT
TGCTCTATTTCTGACATATTTATGCACTGTGTCCTATATCTATGTATCCA
TGATTAGCTGTGTTGGGTACATGTTTCCATGCCAATGTTTTGAGCAACAG
TTAGCATGGGGTCACCTACCCTTTCTGCTATGTGGCAAGCATCCTTTTTA
TGCACTTCAATTAATTCAAATCAAATCCAGACAATTAATTAGGTAATTTT
TATAGTATAAAACAAGCATCCCATACATTTTATGCACATAATGCAACTCC
CAGCAATAGCACACGGCATCAGCAAAACGGAGGAGATTTGACTGAACTAT
TGGTCATGTTTGATATTCCATTCTATTGGCTTTGTCAAAAAACACTCCCA
CCGTCCGAAAAAGGACGTCGCAATTTTTTCTAGATTCACATGTATCTAGA
TGTGTTTTAGTATATAGATACATGCGAATCTAGACAAATCCGCGGCATCC
TTTTCCGGACGGAGGGAGTATATTCTTACAATTAAACAGCAGCGGTAAAT
GTTTAGCATCCATTAAATTAAACTATATAAACGGCCCTTCCTATTGGTCT
AACCTTTAAATTTAGTTTAAAATCACTGTATACTTTGCCTTTACCTTGTT
ATTGGGCTTTTACGGGGTCGCAAATGGCCTCTATCTAGCACAGTGATCTG
AGGTTGTTAATTTATGGCAATTAAGTGTAGTAGATGTTTTATGTTTCTAT
GAGTTTCTGAAATGTACTAAATCTAACAGATATTTTTTAACTTATAAACT
GCTAACATACTGTTTGTTTCTTCTGGAAATAAAACATCAATATGTAATTG
TTTTGGCCTAGGACAAAATGTGGAGTTTGGTTTCTTTGTCAGGAACATCA
ACAATCAGGTTTTGATAAGGTTGATCAGTTGAGGTTGTGTTTAGAAGTGT
ACTCCCCAGCAAGTGCATCCTTTATTTTTGTTGATTTTCTTAGGTTTAGG
AGTACCCAGCTTATTTAAGATAATACTCCATATTTTTCTGCATAACCCTA
ATTGCTAAACTGAATAATTGATCAATGTCAGTATGTTAGTAATTACTTAA
TTATTGATCATTTTGCATAAAACATGTTTTCCAATCATTTACTATTTGAA
TATATTTGTAATTTAAAATGTAGGCTTGGTGTCCCACAAGATTAACATAA
GAGAAACAACTTATAAACAGTTTTCCTGGCAAAGAGAAAAACGTATAAAC
AGTTTGGCCTCTTGGAAGATTGTGACTAAAAATGATGAGTGTTATCTTAT
AGTTTGATCTTAAACCAACATTGAAGTTCGTCCACATATCACATATTTTG
TTGTCTTGCATGATTATCCTGTCTGCCAATTTTGAGAACTGACATAATTT
GGTTAATCTGGAAGGTGGTTTTGGAGCTTTTGGTGGTAATAGTCAAGGGG
CTACTGGTTTCCCGGCATTTGGTGCGAGTGCCGCTTCTGGGCCTGGAGGA
CCCCCAGCAGACTTTTTGACACAAATGAGAAAGTAGTGCAGTTTGCTTCG
AGGCACACCCAAGTTCGAAGCAGAAACGTTGGAATGGTCTGTGGCTCTTG
TCTATAAAGCAAAAATATGCTGGATGGCAACATTTGTGCAATAGCTGATG
TTGCTATGATGTATTCAATGTTTATGCAATATATCCGTGAGGCGTTTCAT
CAGTACATCATAGGTCATGAGTTCTAACGTGGAAGCATGGTCCTAACAAT
ATTTGATATACTCTACCACAGTACAAGGGCTTCAATTCCAAATTGTGACT
TCATTATCACTGGGCCCTGAGATGATATTTAACGTTGTTCATGGCTACAC
AAAGGAAGTGCATGATTTTAAATGTACCATGGTTACAGCTTACAGGGCTT
TAGGTGCAAGTTTGAAGCCAAAATAGTTGTTGTGCGACACGATGCTGTCG
TCTAGACCTTGTGGTTGCCGGATAGTTTCCTAGCAAGTTTAGGGCTTTTT
AGCAAAAAGCATATTGCGGGTGTAAAGGAGGAGCGTTATTCCAATTTTCA
GTGTATATCGCTCTTTTTTCTTGTACAACATCTTGGGTATCTGTGTGCCA
CGTCTTGGGCACTATTCCACATCATGTATCCCGTCTCGCTTTTTCAGAAT
GGGTCGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.