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GrainGenes Sequence Report: AA007192

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Sequence
AA007192
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007192
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAAACATTGTCCAGGATGCTCCTTGCAAATTGCAGCAAATGCTGTTGGG
AGAATAGCGTAGGCTTTGCACTCTCTCGCCAGATTTCTCTTTCGTTCTCT
CCCTTTCTCGCTGTCACTCTCAATTCTCTCTCTTAAATCTCATCAACTTC
TCTCTCGTACTCTGCTACAAAACTTTTTTTTTACTCCCCCATCCATCCTG
TTTCTCCACCCGCTTCCCTGCTTCGCGGCACCTACTGCCCCCCATCCCCA
CCGCCGGCGATCTCTCCTCCCTTCGCGGAGATCGGGGTCACCGCCCCTGC
GCTCGATTGCGGGGTCCCCGGTTCACGCGCCATCGGAAGCGGCTGGGCCT
CGCCTCCGTGCTCCGTTCCCGTCTCCGGCGGACGTACGCAGGCAGGGCCA
GCGACGATGCGCGGCGGCGGCGGGACGCGCGGTTCGGTCCCGCGGCGGTT
CGCTTGGCGCTGCCGTAGATAGCAAGATCTTCTCCCCCTCCGGCTTCCTC
CGGCCGGCCGGCGACTTCGCTGCTCCGGCGGCGGCGGCGGGGAGATGCCG
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AATCTCCACAACAGTTCCTGTATGATAAAAAAGGAATCTTGATGTTGACT
CTCATCAATTCTGGCTGGAAACAGGAGGACTCTGGCCGTTGTCTCCGGCG
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CTTTGGTTAATAACAGAGGCGGCAAATTTATAATTTAACGGTGGATATAG
CAAGTTCGAAAATACACATTTAAATTTTTTTTTGCAAGTGCCACCTTGGC
ACAAAGTAATCTGATACACTTTTGATAAGTTGGTGCATAAATGTAACTTG
TGAGGTTTTACTGGCTCCAGTGTGCTCGTTTTAATTACCTTATGGGATTG
TCAGACCTAGTTAGTAGTTTGACTTAATTCATGTCGATGTTTTTATGCTG
CATGAAGAAGTGAACAGCTAGCTTTGAGTTCAAGCGTTGCATAAATAATT
ACGCCCACTTTTTCGATATGTGGACAAAACCAAGGACTTCTGTCACCGTC
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AGGTGAGCAAATTGATAGTTTCATGGTGTAGATATAGCAAGTTTGAAAAT
ACCCAATGTTGGTATTTTTGCAGTGCCACGTAAGCTGGTACAGTTTTGAT
ATGTTTAATTGGTGCTATTTGAAATGGCTAAGCTTACCTCTATGTTGTCC
ATCTAGTAAAATGGTGTACATGCTTTTATTTTGTACCTTGTCTAGAGGAT
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TGGATTTTAAAATGGCATTTGAACACGTGCAAAGTAATTAATGATCTAAA
ACATTACTCTTGGTGTTTTTTTCAGGTGCTGCGTACTGCTGTCGGGCATA
GATTAGCAAAAGTTCAAGGCTATTTGTTTAAAGCGGCATTTCTTCGGCGT
GTTCCAACCTTTACACGCCTAATTGTAGAGAATCTTATCTTATGCTTTCT
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TGCGCTTCAAGAAAATTTTAACGGACCTTGTCCATGCCGATTATTTTCAG
GTAACACCAGCTGATCAATTTTGATTATGTATTGGTTGCAGTATCTGTTC
CTTTCCCTTGCAGACATTTCACATTTGCGTTGGTTCCCCAGAATGTGTTA
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TGGGAGGATGATATCACACATTATAATAACAAGTGACTTTAATGTATTGA
CAATGCATCAAATATAACATCTGATGAAAGAAGAACAGTCATGTACTTTG
CTACTGGCTGTAGAGTATAAATTAAAAATATTAAACTTTAGAGTATAGGG
GATTAGTGGTCCAGTTCTCAGGCGCCAATACTTTTCAACTGATATGGCTC
TCCCATTTCTGTTAGTTAGCTGCAATAGTATTTGCTTGCTCATGAAAAAA
TCTGCTTACGGCTTCTAGTTGGCTTCAGCATTCTGTTTGCCTGTATTAGT
GTAGTGAATTTTTCTGTGCTAGTTGAATTTGCTTCCCTATTCATTTGTTA
TAATTTATTGAACATGCCAACTATTGTGTTGCCATGTTAGGTTCTAATTT
TTTCTGATTTGATTGATGTAAAGTAGCGGTCATATTGGTTCTCTTTTCAA
GTCTTATTATAAAAATACAGCAGATTTAAATGGTGCATGCGCTGATGTAC
TTTTAAAATTGAGGTTAACCAAGAGCTTAATTTTAGCTTGATGGTTTTAG
TTTTTGAAATACAGTTTAATAAGGTTTCTTCTTGCTTTGTTCTTCTTCTG
TATATCCAGAATATGGTTTACTACAAGATCTCACACGTGGATCATCGAAT
ATCAAACCCGGAGCAAAGGATTGCGAGTGATATTCCAAAGTTCTGTTCTG
AACTTAGTGAACTTGTACAGGATGATTTGGCTGCACTTGCAGAAGGGTTG
ATATATACCTGGCGTCTCTGTTCTTATGCTAGTCCAAAGTACATGCTTTG
GATTCTGGTAATTAATTGATAGAACATTTTCATTGCTGTCCTTCATCCAG
TAGTTTCTAATCTAAATGATAATACCCCTTCCATTGAGGAGCCATGCTCA
ATTTTGATACATTTTGCTTCCTTGGAGTTTCTGTAATGCTTTAATATGCA
AAATGCTTTCAGGCATATATACTAGTTGCTGGTGGAGCAATTAGAAATTT
CTCTCCTGCTTTTGGAAAGCTGAAATCAACGGAGCAGCACCTAGAAGGGG
AGTATCGTCAACTTCATTCACGCTTAAGAACTCATGCCGAGAGTGTGGCA
TTTTATGGTGGTGAGAAGAGAGAGGCATATCATATTATGCAGCGGTTCCA
GGCTCTTGTTGGTCACTTGAAGCATGTACTCCATGAAAACTGGTGGTTTG
GCATGATTCAAGATTTCTTTCTGAAGTACTTTGGTGCCACTGTAGCAGTT
GTCCTGATTATCGAACCATTCTTCTCTGGCGACCTTAGACCTGATTCGTC
TACCCTAGGAAGGGCTGATATGTTGAGTAATCTTCGGTACCACACAAGCG
TGATCATATCACTATTTCAGTCTCTAGGGACCCTCTCTATCAGCACTAGG
CGTTTAAATATCCTGAGGTAAATCCATTTATTGTGAAAACTATTGAGAAC
ACCCAATATATCCATTTCAGTCCTTTCACTGTAGACACGCTTTGCTTGCA
ATGTTCAGAAGTTAGTGGGTAGGTGATCCATGCCATCTATTTATATATGG
GCAGGGCTTGATTTTTGTATATGCATTTTACCATTTGATGCTTCTTGGGT
TATCATTTATTCCAAGCCATATTGACCACTAACCTTTTCCTGCATATTTG
ATGGAAGTCACCTTAGGGTTACCAGTCTATTTTTCATGAAGGAAAATCAT
TTTATTGGTTGTTCATGGTTTAATATCATACCGATCAAAACACATAATTT
GCAATTCTGTGTATTATTTTGATGGGTGGAAGGAAAATGTTTAACTTTCA
CTTGTGATAATGTGGAGCTATGTTTTTTTTGTCATTTATAAAATATTTGA
ATAGTTTATCTAAAACATGCAATTTACAGTAGCGTCCTGTTCAATCTAAT
CTGATGCATATTGTTAGGACTTAGGAACATTTTGTATCTTGTAGTATATG
TGAACTGGTGGACCATTAGAGTTTTTCAGCGGGACCTGTCGTATTTAGTA
TTGTTTAAATGGTTGCACTTCTTTATAGCTTGTAGATCTAAAGAACTGTT
GATTATAGGCAAAATATGCTACAGCTGTAGTTTTCCAGGGGTAAACCTTA
CTGTGGTACTGTGCCCCTACTATATCTCTGATGCCATTGCTGTTGTCTTT
GAGCTCTGATGTTTTTTGTGGTGACTGGCAATTGACTTACACTGTAATTT
TACAGTGGCTATGCAGACCGTATTCGTGAGTTACTAGATGTTTCACGTGA
GCTGTCTGGGGTCCGTGATAGATCGTTGAATCACAATTCTTCTGCTGGTA
ATTACATCAGTGAAGCAAACCATATAGAATTTTCAGGTGTTAAGGTAACA
TCATGCTTGGAGGGGCAGCTGCTTATCTGTTTAGATATATCCATGATTCC
TAATATCAAGTGATTGCAGGTGGTGACACCTGCTGGAAATGTTTTGGTTG
AAGATTTAACTCTCCGTGTAGAAACTGGCTCTAATCTCTTGATCACCGGT
AATCCTCTACTACCAAATTATTGCCACTTAACTAGTCCAATGCTTGTTGT
TGTGAACACACATCAGGAAGCTAGCAATGAAGAGACTATGTAGCCTGATG
TGCATTTTTCATTTACATGTTCTAGAACTTGCCTAAATCATCTCCAGTTA
TTGAACTGTGGTTATGAACTATGAAACATGATATGTCGTGACATAGAAGT
TGTTTCATGTTCCTCCCTGTTTCAATGAATTATATTCCATCCGTCCGGAG
TTAACTGACTCACATTTGTCTAGATTCACATGCATCTAGACGTGCTTTAG
TGTGTAGATACATGCGATCTAGACAAATGTGAGTCAGTTAATTCCGGACG
GAGGGAGTAGCATTTAAGAAATCTGTTAAAAAGAGAAGTTAACGAACATA
CAATGTACAAGGGAATAACAGTGTTTTGTGCTTCATCTTAGTAGCTTGAT
ACTTCTCTACTAACAAGTCACAATTGTAAATTGTTCCTCTAATCATTTAC
ATTGGCATTTTGTGTTTTCTATTTTATTTTGCATTTGATAGTCTACTACT
TGTACTACTATACGTCCTGAAGACCTAACTACAGTTAGGTTCTGTAGTAG
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TGAAAGCAGAGCAATCAGAATACTGATCATGCCAAAACATATAGCATTCA
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ATATAATGTTTAAACACACCTTCTTGAAGGACATGATTTAAACTTGATGC
TTATATTCTCGAATTATCTTGTACGTCTAGAACTCTCAGTGTCCATAGTT
CATATATGATCAAATGGAATGCCAGTTATGTAAATGTTGACACAGAGATT
TTACTCTTATTTCAGGCCCCAATGGTAGCGGTAAAAGCTCCCTTTTTCGG
GTCCTTGGTGGCCTATGGCCACTAGTATCTGGCCATATTGTCAAACCTGG
TGTTGGTTCAGATCTTAACAAAGAAATCTTCTATGTCCCACAAAGACCAT
ACACAGCTGTTGGCACACTTCGCGAACAGCTAATCTATCCTCTTACAGCA
GATCAAGAGATTGTACCACTAAGCTATGATGGCATGGTGGACCTTTTAAA
GAATGTAATAGTCTTCATATTAATATGATGTTTTTATTTGTATTACAGCT
TCTTGAATTACAACTCTTAGTACATGATGTGCTAGAATTTGTAATCATGC
TCCTTTTGCAGGTTGACCTGGAATACTTGTTAGAACGCTATCCTCTTGAC
AAGGAAGTTAACTGGGGTAATGAGTTATCCCTTGGTGAGCAACAAAGATT
AGGAATGGCCAGACTGTTCTACCATAAACCAAAGTTTGCCATTCTTGATG
AGTGTACTAGTGCTGTGACAATTGATATGGAAGAACGGTTTTGCAAAAAG
GTTCGAGCGATGGGAACGTCGTGCATAACAATATCTCATCGTCCAGCTTT
GGTTGCGTTTCATAATATTGTTTTGTCCTTGGACGGTGAAGGAGGGTGGG
ATGTTCAGCACAGAAGGTATATATATATATCAGTACTGAAATAATCCGCT
GCATGTTTATTGGTCCAAGATTAATTTACTGTAAGTTTATATTTCTCTCT
TGATTTTGTAGGGATGACTCATCCTTTTACACCGAAGAGTCTGAATTTAC
ATCATTGGAAACTGATCGTAAATCAGATGCCCTAACTGTTCAGAGGGCTT
TTATGAACAGGGCAAAGGTATAGAATTAAAAGATATGTCTATTCCATTAT
TACTGACTAATCTTATTGGTGTCACAGTTTTATGTGTTCTCCTTACTAGA
GCAATGCTTCATTAAGGTCCGAGGGACATTCCTACTCTACAAAGATTATA
GCAACTTCCCCCAAGTTGCAAAGAGATCAAACAGTACACAAACCTCTAGT
CCCACAGTTACAATGCTCCCCAAGGCCTCTGCCTGTGAGAGCAGCTGCAA
TGCTTAAAATATTGGTACGTTGTTTCCTCTGGTCTTTAGTTTTTCCCTCA
CTGAAGTCAATGTTGACTCGGATACTGTAGCTTGTTGCAGATGCTAGAAT
TTAAGATTTTGTATTGCCATTTGCTAGATTTTTAGAATTGTACTAACATA
CATATATCTGATGAAGCATATGAAATTATTTCAAGAAAGCTTATCTCTGA
TGTTAATATGTTATTACTACCAGATTCTAATGATCTCATCTTCTTGCTTC
CAGGTTCCTAAATTACTAGACAAACAAGGAGGGCAGTTGCTTGCTGTTGC
TCTTCTTATTTTCTCTCGCACTGTGATCTCAGACCGTATTGCTTCGTTGA
ATGGTTAGATTATTTCAGTACCTTCTTTTGTTTTAAGGGCTACACATAAA
ATTCTTCACTGATTCATCTCATCTTGTCAGGTACTACCGTGAAGTTTGTC
TTGGAGCAGGATAAAGCTGCCTTTGTTCGTTTGGTTGGTGTCAGTGTTCT
GCAAAGCGCTGCAAATTCTTTTGTCGCACCATCTCTGAGGTAACCTATTT
ACCTGCAGTTAATAAATTCTTTTAACATGGGATCGTGAATAATCATTTGG
TATTTTGGTTTTAATGATGCTTTCCACTTTTGTTCTTGTCGAAATCCTTC
TTCCGGGCATGCAAATTTAAGCTTGCTGGATTGGTTATTATTTCAGTGTA
TGTTTGGTTTCATGATTTTGATAATTCATATCCTCACAGAACCCTTACTG
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TATTATTTGAGAAGAAATGCATTCTACAAGGTATGTTAAAAGAATCATTA
ATATTAAGAGTGGATGGTCTCTAATGAGTTGGAGGAGTAAGCTGTTAGGC
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CTCTGGTGTGGAGGGATCCTTCCCCCGTTGGTCAACACTTCTTTTATGAG
GTTTGGACAGAGTTTCTGTCAGTTGATGTCTCTTGGAGTGCAGAGGATCT
TGGTTCAGAAATAAGATTGCATATTGAACAGATGTTGAGCTGTGGCATTT
AATTTTTGGCTGAAGCTAAGTTATTATAATATTTATTTTCAGGTATTCAA
TATGACAGGTAAAAGTATCGATGCAGACCAAAGACTAACACTTGATGTGG
ATAAGTTGACCACTGACCTTGCTGGATTGGTTACTGGAATGGTAAAACCA
CTAGTCGACATTCTTTGGTGAGTTATCCTTGGTATCAGCCCTGATATCTA
CTTTGTTTAATCTTTGGTTAGCATTTAAAATTCAGCGTAACAATGCCAAT
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GAGAGCTGTATCCCCTGACTTTGGTCATCTTGCAAGTGAAGAACAAGAAC
TTGAAGGAACATTCAGGTAATATTGCATTACTTGTTATGTCTTAGGTGCC
TTGGCAGATTATTGCTATAAGAATTTTCTAGTGTTAGTTAACCTGGTGAA
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TGCTTTCTTTGGTGGTGGTTCAAGAGAAAAAGCTGTGAGTATCTTCACAT
GAATGGCAAATGTTTATAGTGTATCTATACCCACTTATTGGTAGTACCTG
TCCGCTGTTTTTTTCTATCAACTGTTTTTGAATCATGAAATACGATGATC
TGTGAACTCTTAGAGTTGGATGCTAATTGCATAATATTTTAATTATTCTA
AATATGAACTAAGAATTCTCCCGTAGATACTTGATATATCTTCGAATAGT
ATGGAAGCGCCATCTTGTTTAGTAATCTGCATTCTTGATGCACCTTAAGC
AAAGGCTGTTCACATGTTCCCAGTTTGCTGTTTGTCTGTTGAACTTCTCT
GTGTTACAAGCATTATCAATTGTCGTTGCCTATTCCAACTTGTAATAACA
TATGTGCTTATTGTTTGCCCCTTTACATTCGTACAGATTGGAGATGTTAT
CACTGTTTTCAACAGCTTTTGCTGGCCTTATTTTAGTAGATGAGATTAAT
TATAGACTTCTTACAAATTGTTTTCTCTTGTAACAGATGGTTGAGGCTAA
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TTTATGGTATTGTTGATGATTTTGTGACAAAGCAACTTCCACACAATGTG
ACATGGGGTCTGAGTTTGTTGTATGCTCTGGAGCACAAGGGCGACAGAGC
TTTGACTTCAACACAAGGTTACTAATCATCAAAAACGCTTCAGTTGTCAG
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TTCCTTGAACTTTCTGGTGGGATTAACCGAATCTTTGAGCTCGAGGAGGT
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TTGCAAACTTAAGTGCGGTTCCATTAGTACTGTTGCAGGATATAACTAAT
CATGTTTTGTTTCAAACTGTGACAAATTATGGAACATCCTGTTTAGCATA
TATTATGATGGAACTTTGGCACATAATGACAGCATTCTCCATTTAACACT
GTTTGCCTTTTTGTTATGCCAAACATAATATAATGCTACATATTAGCATG
AGAAATGGTTACATGAATTTGATGTTTTGTCAATAGTTGCAAGTTTGTGT
TTTTGATAATTTATTGGTACTTTTAAACCATGGACTAGCTCTGGATAAAG
TTGCAAACTTGTACCATTGGGTTGTTTGGTATTTTTGTATTAATAATGTC
CTCAGTTAGCTAATGGGCATTTTGTAAGTTTTACAACAATGTCTTGCGCT
AATTAAGCATGCCTTTGTCTGTCAAAAAAAAATTAAGCATGCCTTTTGAA
TTGTTTCCCTAGATACTCCGGTGCCTTCCAGTGCCATTAGTGAAGCCTCA
GAAGAAATTATTTCATTCCATGAAGTGGATATTGTAACACCATCACAGAA
GCTATTGGCTAGCAAACTGTCATGCAATGTGGTACAAGGGAAAAGCCTTC
TTCTGACTGGTAAATCGTCGGTCTGCCTTCTGCAACCTTTGTTTATCTTA
TATAAGGCAGTGATTATGCTAACATGTTCCTTTTAAACCTTGATTTTTCT
GAAGGCCCCAATGGTACCGGGAAGAGCTCTGTTTTTAGGGTGCTCAGAGA
CTTATGGCCCGCCTTTTCTGGGAGAGTTACCAAGCCCTCTGAAGGGATGT
TTCATGTTCCTCAGAGTCCATATACCAGCTTGGGTACCCTGAGGGACCAG
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ATATAAAGCTGGTAGGTGCCAGTCACAATATAGGCCTATTAAATTACAAT
GATATCTGAACCGCATATCGTTCTATGTGCTATGAGTTTGGTTGTCAAAA
TGAAGTTATATGTTGCTTCTCCTGGTAACAAGAAATTCTGTGCTGATATG
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CTCTACTCCAAACTGGGAAGACGTCTTGTCGCTGGGAGAACAGCAGAGAC
TCGGGATGGTCAGTGTTAATTTCACTTCAAACTCTGCTAACCGCCAAAAA
TCACTCTTTTGCCTCTTTAATAACATCTTCTGATTGAACTGTTCTGTTCT
AGGCTCGTTTGTTCTTCCACCATCCTAAATTCGGTATCCTCGACGAGTGC
ACAAAGTATGCGCGACAACACTCTTTTGCCATTTCTGTTCTCATTTGCTG
ATGAATTTTACCGTGGGTTCTGAAATGTCGTACTTGATTTGCAGTGCTAC
GAGTGTCGATGTCGAAGAGCATTTATACAGGCTAGCAACTGACATGGGCA
TAACCGTGATCACTTCGTCACAAGTAAGTCTCTGATGAGACGACCATGTA
AAGCACGTGTCGTGATTGCCGTTTTAGTTCTTTGTCGAAACCTCTGTATT
TGAATTTTAAAATCGCTCTTCAATTTGGGGTATTTGATGAACCTTTATTT
TTCCTGTTTACAGAGGCCTGCTCTTATACCCTTCCATTCCGTGGAGTTAA
AGCTCATCGACGGCGAGGGAAACTGGGAGCTGTGTGAGATCCAACATTGA
TAGACGCCAGCAGTTAGATATTTTATCAGTTCAGTCATCTGTGCGATAGA
GGATATCCTGTTTCTACTGCCACTGCAGTAATTTGTTCATAGCGGGTCGC
CCTGACGAGGGTACAATCAAGAAGCAGCTCGAAAGAAAGAAAGGAGTTCC
TTGTCATGAATTTGATTTGGACAATGGCAATCTTTGGTCTAGTTATACAG
AGTTTAGTAATGATTGAATGCACAGGGGATGGCGGTAAACTGGTTAGGGT
CCGGAGGTGTTTTTTTGGGGGGAGTGAAGTAGGAGATCGAGTAGAGCAGC
AGTGTATACTTATCTAAAGCAGCTCTAATTCATCCAGCATATTATTGATT
GATTCCATACTAGAAATGCAGTACATATGGAATAAATTTGGCTGTTGCTG
CAATCATCGGCCTGCATAATGTGGTCTACTAGAATATTATTCGTGTAAAA
GCAGTGAATGGCAGAGTTGAAATAAGTATTCGATGTCGTCATCGTCAAAC
TACTACAGTAGACTGTATGTAGTCTTGAATGGCCTTGTGTATTGTGTACG
GTCACTGGCAATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.