Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA025335

[Submit comment/correction]

Sequence	AA025335
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA025335
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGTACTCTGCGCGGCGGCTAGACAACTCAAGTACTGTATGGATGCTAC TGACGCCGAACTGGCAGCGATTGAGGAAGGAATGGCGCTGGCCCTAAACT GGACAGACCTACCGTTCACGGTCGAGACAGACTGTGCTGAAGCCGTGGTG CTGATAAAGAGAGAGACGCCCAACACCTCAGTATACGCCGCGAGAATTCA GATTATTCGAGAGATAATACGGGAAAGAGGCATATCTGTTGCCAAGATTT ATCGTGAGGCAAACTGTGCGAGTCACGAGTTGGCAAAGCTAGGTAGATTA CAAGGTAGGACAATGACTTGGCTAAGACATCCTCCCCCTGAGATTGCCAC GATGCTGGCAGCTGATTGTAATCCTATTATTTAATCAATGTCTCTTTGTT GCAAAAAAAAAAGATTTGATGCTAGTAAAATATTGCCAATTTCTTCTGTT TTCTTTGGCAGTTTTTTGTTCGCGTTCGTATGCCAAAACTTCACCTCGTC ACCTGCTGTTCACGTCTCGCCTCCTCTAGCCGTCTAGCGGGTCCATGACG CGCCTTTGTCGGAGCTCCCACTGCCCACCCGAACCCACCACCGCCCCTCT CCTCTCTCCCCCGGCCAACCTCTCCCCTCACTCCTCCTGTAAACCCTAAA CCACTCGCGCACCCCCAACAACTTCCCCCACCTCCCCTCCCCTCCCTCCC CTATCCGGGCGGCGTATCCGGCGGCGGCGGCGCCGTCGCCATGGGGGCTC TCGCCGCGTCGACGTCGTCGGGGAACTGGCTCGTCGAGGACGATATCCTC CTCAAGAACGCCATCGAGGTAACCCCCTTCCCCCGGATCGCGACCGGAAT CGGCCAAAAGGTCCTCGTGTCGGTGCGTAGGTTAGGTCGGGATTCAGTCG AGGTGTCCAATTGCTGTTCTTGGGTTCTTTCTTGGCCGCTGGAGCGCGAC GGAGGCAGGGGTTTGGGGGGTTTACCAGCTAGTCAGAATGTTCAATTCCC CAGCCCTGAAAAATTCTTGCGCCCGTGACCACCACTGATCCATCACTTGC AAAATTCTTGGACTCCCCCGTTGTCTACAGCCAGCGTCCTTGATTTTCAT TCTATGTTTTATAAAGAATAGTGGGGCTCTGCAGTACACACTGAAGTTGA CTGACAGTATAGCGTAATCAGAAATTGTTGCTTCGCGTGGTTTACTCAAC ACCGTTTCCTTCTAGTCTGCACTATTAAGTTTAACATCCTGTGAAATTCC ATCCAGCAAATTTGTAAATTTTCCATTGATATATAGTTATATATAATTCT AGACAATTTGTAGCAGGCCAGCTTATTAACCTTGTATTAATCATCAAATA AGCTTGCGTAAAAAAGATTGCGTCAAGAGATAATCTTAGTAAGTATCCTT CTACATCATGGTACAAAAGTGGGGAACGCTGCTCCAGCAATTGTTTCAAA ATGTTATACGGAATTCTGAAATCTTAATATATGACTAGTTTCCTGTTATT CTATTGCTAATTGTTCAATAATATATCTGGTACTTGTAGAATGGCGCCTC GTTGCAGTCCCTAGCCAAAGGAGCTGTATGTTTTTCCCATAAATTCACTC TTCAAGAAATACAAGATCGTTGGACTTCTTTGCTGTATAATCCAGAGGTC TCGGCACAAGCTTCTGCTCGGATGGTTGAGTATGAGACTGAACTTTCCAT TTCCAACCCTGCCAAGGCACATAAACTGTTCAACTCGAAGGCAAGAGACG TTTCATTTCAGAAGCGGAAAGCGGAGAGTGTGAAGAATTTATATTATGCG ATGAGAAAGAGAATACGCAATGAGCCCTGTGACACCACCGACCTTGGTTT TCTTATTTCCCCCTGTTCTTGTATGGCGATTGGTGGGGAGTGTGTCTGTG GAGGCGCACTTAGATCTTCACAGGAGCCTCATGTGGTTCAAAATATTGAA CCAGGGATGAGTACAATGAGCTGTTATGGGCAAGCAGGTGCAAGCTACAG CGGTGCACAACAGACACATCATGAAATAAATGGCCATTCTTTCCATGCTC AGCATCCCGGGAGCATGATAAAAGATGAGGATGCCACCAATAACACACCA TTTGGCTATTCGGATGTAGTTCAAATGTATGAGCAACATGCCGAGATAAA TGAAGGGAACAATGTCTCTCTTAGAGGTATCACAGATTTTCAAGATTCTT TGCAGTTTCAGCAATTGGCCTCCAGCAATCAATGTGGCAATGAAGTGGCA GAATCAAAAGCATTGATGATTACTGATCAGGGTGGAGTTGAACATGCCCA TTTCGCTGCAAACAACAGCGGAGTGCCAGAACGTGGCTCACTACACTTGG TCCACCATTCTGAGGGTTCTCAAGCACCTTGTGGTGCAATCTGGAATGGG GTTGAGGAACCAGGCACACTCACTCTTGCTGATGATAAGAAAATAAAGGC AGACAATCAAGACCCTCTCACATCCCAAGCAAATTTAGATGATGGAATTT GCATGCCTGGTTTAGATCACACAGCAATGCCAGAAGGTGATTACATGGAT TTTCCCTTTTTCAGCAACAGTGACGAGTTTGAGCTTCTGAACGGTGAAAA TTTTCTGAATTCTCCACATGAGATTAATCAGGAAGAATTAGATGACCCTG ATCCCAACCTTGCATTAGGTGCAGGCTCCATCCTGCAAGATCTGTTGCAC CCGGATGTAGCCAACATTTGCTGTGATCAGATAGATTGTGACCATGTACA GCAGAATAATGCAGTGGATGTTTCTGATATGATGTTGGTTCCTACTTCAC CTGAAGTGTGTTATCCTGGCCGGTATGTTGAGTGCACATTAAACACGGAA GATCCTGAAATCCCTTGCAACGACGATGCTCTTACACATGCCGAGTTTTC TCCTCTGCACCCTTCTGCTTCTTCTGGACGGAACTCTGAGTACACCGTAT CTCCATTCCCCCCTGCAACTAGCCCTCAGTCAAAGGCTGAGCATTCCAAT GCGCTTGATTTGGCCCAGATAAAGAGAGGAGATATGGCAAGTGCCCAGTC TTCATCACAACCAATGAAGCTTAGCCCATCCACATCAGAACCAAGAGAAG ATTCAGTGGCACTTAATAAAGCTTGCATCCTAGGAGCTAAGCTGTCCGAA GGTCCTTCGACTTCTAGTATATTTACGCATGGTAACGTTGACACCAATGG TGAGAGCACATGCACGCTAGCTTTACCTGCTACCCATCCATCTGGATTTG GTGAAGGACAACCATGCAGTTCAGGACAACCGTGCAGTTCAGGACAGCAC GATTTATTTGATAGCTCTCAAAGTTTGACGTTGTACGATCCAGTTCAAGT GCCTGATCACATAAATTATAACTCACACGATAATCCACCAGAAGTACAAA ATGGGGCTGCTCTACAGAACTGTATGTCATCACATGCATTGCCAGACTTG GGTCTTCAAGACCCTATTGCAGTCGTGCCAACATCAGCTCCACCGGAAGA ATGCTCTGATCTTGAAAATGATGTTCCAAATTACTACGATCTAGAAGCTC TGGTATGGATCTCTTAACTTAGCTAATAGAACCTTTTCACCATGTTACTT CTGATTCACCCATTTTTGGTATTCATTGCAGATACTTGATCAGGATCTAA TACCATGGGATCAGGCTGATTCGGTTAACCCTGAAGGTAAATATCAACCA TCTATAATATCATAGCAAATGTGGTTAAGGATATGCTACATTAAACTGTG AAAGTCTTTTTCATAGAGATGCAGTTTTAAGGCTAGCATGAGTAACATTA TGATCACAGAGTTATCCAAAAGAATTATTGTGCTGAACTGTGAATCGTGT TGCTCTGAAATATAAAATATTGGTCCTGTTATTGTAATACTTTTTAACGT CAATGCTTATAGTCACTAAAAAAGAAAATGGGTTATCATATGGGTGCAGT ATGGTTGGCTGAGATGCTTAAGTGGCAGAGATTCTGTTCCAGCAGTAGTG TAACGTGTGTGTAGGTGTGAACACACTCTAACTGGATGTAAGCCCTTTCC CTCTTAGTGGTGACTTGACTGCAAACCACATACATGCCATAGAACAATAA AACCGACCAAGCTTGGTCCATGTACACGAAGAAATTGATTAAGTTTACTT TGCAACAATTTTCAATTTCAGGCACTTCGTACCTACTTTTTAAGCTACAG TTAGGCATTTTCCTACCACATACAAGGATTTTTTTTCTAATTATTATTAT TATTATTATTATCGATGTGTTTGCATTTCAGTGTCCAGATTTGATCGTCC AGAAAGCAGGATATCATTGATAAGGTTGGAGCAGGGTGCTCGGGCTTATT TGAACCGAGCTATCACGTCTCGAGGTGCTTTTGCAGTTGTCTATGGACTG CACTTAAAATACTACATAAAGGATCCTGAGGTAAATTCAACTGATGTTTT TCAGTTAATATGGTCTGTCGCATATAACATGATACAGCTCAACTGCTCCA CAGTATGGACAACTTCTTTCTATGTCTTGTGCTGTACAGTTGCATCGTTC AAATCTTGTGTTGTGAATATTCATAGTTAGAAACAATCCACAATTGTCAA TAGCAGTCTGAAGACTCATCCATCTTGTTTCTGTCTCATAGTTGAGTGCT GATTGAATTCTTCTAATTCAATTTCAAGCAGAAAGATGCAACTTAGGCTG GTTATTTTATGGCTTTGATTTTCATTTATTTTGTCACAATGATGTTTAAA CTTGTATGAAGTACACAATATTTTCACATTGTGATATATAGTGGCGCCGT TTTCTGAATTCTTTAGTTACATGTTTCTTACCTTTTCTCAGGTTATTCTT GGAAGAGAGACAGAAGACGTAAAAGTTGACATAGATTTGGGAAAAGAAGG GAGGGCAAATAAAATATCTCGCCGACAGGTATTTGCTTGAATGTTCTATT TTAAATTTGGAAATTTTAATTACAGCTTAGGGAATAGCTAATGGCCAAGA ATTGTGGACTTGAGTACTTGAGTTAAAAAATGATGAGAAACATCTATACC CTGTAGAACTGTCATATCTTCTTTTTTACTTTATTTGGTTCTTCTGTTTG AGTTTAGCTCCTTGAGTAAATGTATTTTCAGCTCATCTGGTGGTCTTAGT GTGATTGGCAGTCACAGAATGCCTATGCTGCCCTGACAGCAGTAAAAAGC TTTGCATATCATGCATTGTCCAAACACATTTTAACAAGCAGGATACATGT GTTTGGTTGAGCAGGTGAAGTGGTTGGCTTTGTCTAGTTGGCATTACTTG GGAGCAAAAGGCTGGTGGCGGATGAATTATGTTCATCTGGGCCTTTTGTT TTTCACTCAGGCTTATATATTTATCTTAACAAGTAGTATCATGGGTTTGT GTTAGCAGTTGATAAACTGTCAGTCTTAACACTCGTTTTCTTGACTTGTT TTGGATAATTTCAACATCTCCAGCTGTTGATGTTGACCACATGTATGTTA TAAAATTGTTGATCATGTAAGTTGAATGTAGTCTGACCATGCCATTCTCC ATAAACAAACACCATCTGTTTTAAGTAATTATAACAGTTAACACCAGCCC AAGGTCTTTAAGGTGGTAAGACGTTCTACTTCTACCCCCGCTCTGATGGC TAGGTGGTTGCCTAAGCGCCTAAAGCGGGCAAATTTCCAAGGCGCTGCCA GGGCACCTTACCGCCTAAGCGACGCCTTAAAAACCATGACCTCCCCCTTG TAGATGGGATCCAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCAAATTCGTGCCTTT TTGTGGTTGCCCCAAAACCTAGGGTTTCCCCTATTTATATAGACTTTTGC AATGCATCTTGGCAATGGGATTGATGCCCCTTCGATCCAAGTTCTCTTGG GCACCTCTAGATCTGTCATAGGCCTTCTGTCTGTCCCACGAGCCCTCTCC GTTTACATCTGACCACAGTGGTTGGTTCTATCCGACTTACCGGCCGTGTG TTCTCCTTCAAGTCGTGAGTTTGGTTATCAGTCTGGTACACTGCACTAAA AAACTGACACTATGTATTATGTTTTGCTAAATCAGTTCCTTATCTCATTG ATCTTTTTGTCTGTATATAAATACATGTTATGTTCTGACAATCAGGCGGT TATCAAAATGGATAAAGCTGGGTCTTTCCATATCAAGAACATTGGAAAGT GCTCAATCTTTGTTAATAGCATGGAAGTACCAAGCTGCAAAGGCATCAAC CTAAATTCTGATTCTTTAATTGAGGTACAGATATCTGTTTCATTTTTGTT CTATGACAAGCTTATCTCTCATGTCTCCATTAACAATTAGTTAGATGAGA AGAAAGGTTTGGTCTTAGTAATTATTCCTGTCGTCTCTTTGTTCTGAGTT CTAACACTGACTGCATGCGATGCTTCACTTCTATGCCATTTTCCAGTAGA GTCTTTGCAGAGTATCTCTGGTAATGCTTAACAAACTGCCTAGTGCTGCA TTTGGATCCGTTGAACAAGCATTATGATTGCGTGTGTCTAGAATTAGGAT GAATGATTCCAATAAATTAGTTTGGAACAAATCCTTGGCCATCAATGCAA ATACTAAGAAAAGCAGAGGTTTAACAAAAATCTTGAACATGCGCTGTTCA TTGTTAACATATCATGGAAACCTGGAGATCTTCCAGTGAAATTGGTTTCA CTGTCTTTTAAGATGAAATTTTCATTATAATCCTGAGAAGGATTGCCATT CTGGATGGACCTTCTCATGCCATATGCAAGGTCACCGCTAATATCAATGC TTTATTGAATTTGTTGAGTCTAGTACAGTACCAGAGCGTGTACCAGTTAG TGGCAGGTACCAGTGTAGTCGATATAAGAGGCTGTGTGGCCATTTTGGTG TCCTTTTTATTACGCCATCACGAGTATAGCACTTAAAATAATCCGCGCAG TTACTTTTCGTCGAGGTAACCGCAGATGTTATATATGTCAGTCACTTGTA CCTCGCAACCATCATGCTCGCCCTCATTTGGCTGTCAATTTCCTGTGCAG ATAAAGGACATGAGGCTAATTTTCCATGCCAACCAGGACGCTGTAGGGCA ATACCTCGCCCGCACACCACAGAGGCACAGCTCCTCCTTCCAGCCGGGTT TTTGAGTTGCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.